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_________________________________________________________________________________ Bioqumica

PROPRIEDADES
PROTENAS

CIDO-BASE

DE

AMINOCIDOS,

POLIPEPTDEOS

1.1. Responda s seguintes questes com verdadeiro ou falso.


a.

S a pH muito baixo ou muito alto que a forma no ionizada de um dado


aminocido predomina.

b.

A um valor de pH superior ao valor de pKa de um grupo ionizvel mais de 50%


desses grupos esto ionizados.

1.2. O grupo -carboxilo do cido glutmico tem um pKa = 4.3.


a. Que fraco destes grupos esto desprotonados (i.e. na forma COO) em soluo
diluda de cido glutmico a pH = 5.0?
b. E a pH = 3.6?
c. Calcule as cargas formais do cido glutmico para os valores de pH das alneas
anteriores.

1.3.

O grupo -amino da lisina tem pKa = 10.5.

a. Que fraco deste grupo est protonada (i.e. na forma NH3+) em soluo
diluda de lisina a pH = 9.5?
b. E a pH = 11.0?
c. Calcule as cargas formais da lisina para valores os de pH das alneas anteriores.

1.4 - Cada grupo ionizvel de um aminocido tem dois estados possveis de ionizao,
carregado e no carregado (ex: COO e COOH).
a. Represente os estados possveis de ionizao do resduo SERINA.
b. Indique qual a forma predominante e a carga formal aos valores de pH iguais a 1.0;
2.2; 4.0; 7.0; 9.2 e 10.4.

COO -

pKa1 = 2.2 (-carboxilo)

pKa2 = 9.2 (-amino)

CH2 OH

NH3

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1.5 - O aminocido HISTIDINA apresenta trs grupos ionizveis:

COO H

NH

CH2

pKa1 = 1.8 (-carboxilo)

pKa2 = 9.2 (-amino)

NH3 +

N
H

pKa3 = 6.0 (imidazol)

Esquematize uma curva de titulao (pH / equiv. de base adicionada) a partir da forma
totalmente protonada indicando as espcies presentes.
1.6 - A partir do colagnio isolado da cauda do canguru obteve-se uma prolina
substituda (aminoprolina) ainda no caracterizada. Os valores de pKa dos grupos
ionizveis foram obtidos a partir de curvas de titulao cido-base.

H
H3N C
H2C

pKa(-carboxilo) = 1.9
pKa(-amino) = 9.8
pKa(-amino) = 10.0

CH2
-

N
H2

HC CO2

Indique todas as formas ionizadas deste aminocido. Calcule o ponto isoelctrico deste
aminocido.
1.7 - Usando os valores de pKa indicados na tabela em anexo identificar os aminocidos
cujas curvas de titulao so mostradas nas figuras abaixo.
12
12
10
10
8
pH

pH

8
6

6
4

2
0

0
0

0.5

1.5
Moles de NaOH

2.5

0.5

1.5

2.5

Moles de NaOH

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1.8. - Os aminocidos podem ser usados como tampes. Uma soluo tampo uma
soluo que no varia apreciavelmente de pH quando se lhe adiciona cido ou base. A
zona na qual uma dada soluo um tampo efectivo designada por zona tampo e
geralmente definida por pKa 1.
a.

Indique a zona tampo da glicina, histidina, asprtico e lisina (sugesto: esboce as curvas

de titulao e observe).

b. Escolha um aminocido para tamponizar a pH = 4.0, 6.0, 9.0 e 12.0.

1.9. - Um polipeptdeo isolado do crebro tem a sequncia:


Glu-His-Trp-Ser-Tir-Gli-Leu-Arg-Gli
a. Escreva a estrutura primria do polipeptdeo; represente por Ri as cadeias laterais
(ex.: RSer, RHis) indicando os grupos ionizveis que existem.
b. Representando por LH z+
a forma completamente protonada do peptdeo, indique o
n
valor de n e de z desta forma.
c. Indique todas as formas ionizveis possveis do polipeptdeo e indique os pKa de cada
equilbrio.
d. Calcule a carga formal do peptdeo a pH= 3, 5.5, 8 e 11.
e. Calcule o pH correspondente ao ponto isoelctrico deste polipeptdeo.

1.10 - Considere o seguinte peptdeo:


Glu-Leu-Arg-Met-Glu-Trp-Arg-Ala-Trp-Glu
a. Suponha que vai titular na forma Ln- indique todos os equilbrios desde a forma
totalmente desprotonada at forma totalmente protonada referindo quais os grupos
envolvidos em cada passo e os respectivos valores de pKa.
b. Desenhe a curva de titulao. Justifique.
c. Calcule o pH do ponto isoelctrico.

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1.11- Na titulao de 0.01 moles de


um peptdeo na sua forma
completamente protonada
foram gastos 0.07 moles de
NaOH.
Na
figura
1
apresenta-se a curva de
titulao realizada.
A
composio
de
aminocidos
revelou
somente a presena de trs
tipos de aminocidos (Glu,
His, Arg).
a)

Atravs da curva de
titulao
observada
determine a composio de
aminocidos deste peptdeo.
Justifique.

b)

Escreva os equilbrios
postos em jogo ao longo da
titulao e respectivos valores de pKa.

c)

Calcule a carga total do peptdeo a pH 4.0 e a pH 6.0.

d)

Determine o pH do ponto isoelctrico deste peptdeo.

1.12. Duas protenas, A e B, contm os seguintes nmeros de resduos de aminocidos


ionizveis (resduos por mole) cujos pKa medidos na protena so:

cido asprtico ou glutmico


Histidina
Cistena
Tirosina
Lisina
Arginina
-COOH (C-terminal)
-NH2 (N-terminal)

pka

Protena A

Protena B

4.5
6.5
8.0
9.9
10.2
>12
3.8
8.0

16
2
2
4
14
10
2
2

11
9
--8
12
8
1
1

Indique a carga aproximada de cada um destes resduos a pH=5.5 e pH=8.0 (suponha


que tem 100% de uma forma se pH estiver a mais que uma unidade de diferena do
pkA.). Calcule depois a carga total de cada protena a estes dois valores de pH.

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Apndice
OS AMINOCIDOS COMUNS: ESTRUTURAS E VALORES DE PKA.

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