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PROTENAS
Dra. Fabiana Cornejo Maciel
Dept. Bioqumica Humana
Facultad de Medicina UBA
2016
KRISTINA GREMSKI
kristina gremski YouTube
PROTENAS
Macromolculas
Polmeros de aminocidos
Con variadas funciones
PROTENAS
biolgicas
ms
Regulacin de pH
CO
H3N C H
R
+
COLGENO
FSH
CITOCROMOS
hemo
ordenamiento tridimensional =
CONFORMACIN
PROTENAS
Macromolculas
Aminocidos = unidades estructurales
Desde unos pocos aminocidos hasta varios miles de residuos
CO
H3N C H
R
+
UNIN
PEPTDICA
Enlace
AMIDA
UNIN PEPTDICA
Carcter parcial de doble enlace
H
C N
+H
C N
C
- O
UNIN PEPTDICA
H2O
Dipptido
Tripptido
Tetrapptido
Unin
peptdica
Ionizacin de:
Gpo. N terminal
Gpo. C Terminal
Gpo. R de los aa
Oligopptido
Polipptido
ESTRUCTURA PRIMARIA
Secuencia de aminocidos
ESTRUCTURA PRIMARIA
La secuencia de aminocidos de
una protena est determinada
genticamente
estructura espacial
funcin
mutaciones
alteraciones genticas
ESTRUCTURA PRIMARIA
La carga y polaridad de
los aminocidos de una
protena tiene efecto sobre
sus propiedades fsicas y
qumicas
La estructura primaria de
una protena impone su
estructura tridimensional
ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL
Fuerzas de estabilizacin
Puente de hidrgeno
NO COVALENTES
Interacciones hidrofbicas
Atraccin electroesttica
COVALENTES
Puentes S-S
ESTRUCTURA SECUNDARIA
Plegamiento regular local entre residuos de
aminocidos cercanos
- hlice
Hoja - plegada
Turn (, , ) / Loop / Hairpin / Coil
ESTRUCTURA SECUNDARIA
Plegamiento regular local entre residuos de
aminocidos cercanos
HLICE
Est determinada por interacciones
puente de H entre el oxgeno del grupo
carbonilo de una amida y el hidrgeno de
la amida de otro aminocido alejado
cuatro residuos a lo largo de la misma
cadena.
ESTRUCTURA SECUNDARIA
HLICE
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ESTRUCTURA SECUNDARIA
Plegamiento regular local entre residuos de
aminocidos cercanos
HOJA -PLEGADA
Est determinada por interacciones
puente de H entre uniones peptdicas de
cadenas
vecinas
o
secuencias
separadas de una misma cadena.
ESTRUCTURA SECUNDARIA
HOJA -PLEGADA
Paralela
Antiparalela
ESTRUCTURA SECUNDARIA
HOJA -PLEGADA
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ESTRUCTURA SECUNDARIA
ESTRUCTURA TERCIARIA
Interacciones entre cadenas laterales de
aminocidos alejados unos de otros
Plegamiento de la cadena peptdica
ESTRUCTURA TERCIARIA
Plegamiento de la cadena peptdica
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ESTRUCTURA TERCIARIA
Plegamiento de la cadena peptdica
ESTRUCTURA TERCIARIA
Plegamiento de la cadena peptdica
Motivos Dedos de Zn
zinc inico coordinado por dos residuos de histidina y dos de cistena
una hlice y una hoja antiparalela.
protenas de unin al ADN: receptores de hormonas esteroides,
factores de transcripcin (Sp1)
ESTRUCTURA TERCIARIA
Plegamiento de la cadena peptdica
Motivos Cierre de leucina
dmero de dos hlices , cada una con un residuo de
leucina cada 7 aminocidos
protenas de unin al ADN: factores de transcripcin
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ESTRUCTURA TERCIARIA
Plegamiento de la cadena peptdica
Dominios
Unidades estructuralmente independientes
con caractersticas de protenas
globulares pequeas
Conectores
Funcin especfica
ESTRUCTURA TERCIARIA
Plegamiento de la cadena peptdica
Dominios
gliceraldehdo-3-fosfato deshidrogenasa
ESTRUCTURA CUATERNARIA
Interacciones entre cadenas de pptidos
Protmeros y oligmeros
Asociacin de cadenas polipeptdicas individuales
de forma especfica, geomtrica/simtrica y
estequiomtrica
Solo la alcanzan las protenas que poseen ms de
una cadena polipeptdica dmeros, trmeros, tetrmeros,
oligmeros; homo/hetero (protenas G heterotrimricas)
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ESTRUCTURA CUATERNARIA
Arreglo /
distribucin/ordenamiento
del esqueleto y las
cadenas laterales de la
protena en el espacio
Describe el ordenamiento
tridimensional de las
protenas
FUNCIONALIDAD
Sitio de unin a ligando
Flexibilidad / rigidez
Superficie hidroflica / core hidrofbico
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Hsp60
SNTESIS
PROTEICA
SNTESIS PROTEICA
PROTENA
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DISULFURO ISOMERASA
Cataliza la formacin y
eliminacin de enlaces
disulfuro de la conformacin
nativa
CONFORMACIN
TRANS
CONFORMACIN
CIS
MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
AMINOCIDOS MODIFICADOS
Grupos prostticos
Hemo
Glicosilacin O-Ser/ O-Tyr/N-Asn
hormonas protenas de secrecin protenas de membrana celular
(receptores, adenilato ciclasa) glucgeno/glucogenina
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MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
AMINOCIDOS MODIFICADOS
Palmitoilacin
Miristoilacin
MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
AMINOCIDOS MODIFICADOS
Hidroxilacin 4-hidroxiprolina/ -hidroxilisina
Carboxilacin carboxiglutamato
Colgeno
Protrombina
MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
AMINOCIDOS MODIFICADOS
Fosforilacin Fosfoserina/Fosfotreonina/Fosfotirosina
Acetilacin N-terminal/ Lys
ADP-ribosilacin
Protelisis
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MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES
AMINOCIDOS MODIFICADOS
Metilacin
Sulfatacin
N-metil-lisina
Miosina
entre especies
entre individuos
entre tejidos
entre estados del desarrollo
Cistenas conservadas
Modificados en insulina bovina y porcina
Humalog = Lys-Pro insulina absorcin rpida
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Insulina - procesamiento
RER
protelisis
protelisis
Golgi
heterodmero
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VARIACIONES DE LA ESTRUCTURA
TRIDIMENSIONAL DE UNA PROTENA
DESNATURALIZACIN
Prdida de la estructura nativa de la protena
Por ruptura de uniones que estabilizan
Conformacin abierta
Cambios en propiedades fsico-qumicas
Insoluble, precipita
VARIACIONES DE LA ESTRUCTURA
TRIDIMENSIONAL DE UNA PROTENA
DESNATURALIZACIN
AGENTES DESNATURALIZANTES in vivo
Cambios en la estructura primaria
Mutacin HbA anemia falciforme
Modificaciones no enzimticas glicosilacin
Advanced glycosylation end products (AGE)
Variaciones de pH - digestin
Calor - ?humano
Compuestos hidrofbicos cidos grasos cadena
larga/ protenas ligadoras
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VARIACIONES DE LA ESTRUCTURA
TRIDIMENSIONAL DE UNA PROTENA
DESNATURALIZACIN
AGENTES DESNATURALIZANTES in vitro
Calentamiento coccin huevo
cidos o bases fuertes
Solventes anfipticos/ Detergentes: se asocian
con los residuos no polares de las protenas
Agentes caotrpicos (in guanidinio y urea):
permiten el ingreso de molculas de agua,
desorganizando las interacciones hidrofbicas
Reductores : Mercaptoetanol
VARIACIONES DE LA ESTRUCTURA
TRIDIMENSIONAL DE UNA PROTENA
DESNATURALIZACIN RENATURALIZACIN
Renaturalizacin: retorno al
plegamiento o conformacin
nativa por restablecimiento de
condiciones normales
-Enfermedad de Alzheimer
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Complejos multimricos
resistentes a protelisis
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MODELOS DE PROTENAS
COLGENO
INMUNOGLOBULINAS
MIOGLOBINA
HEMOGLOBINA
PROTENAS FIBROSAS
COLGENO
Familia de protenas fibrosas, 28 tipos
Protena fibrosa ms abundante
Fibrillas (tipo I, II, III), redes (tipo IV), asociados
a fibrillas (IX), superficies (XIII),
Producidas por una variedad de tipos celulares,
principalmente fibroblastos, miocitos, clulas
epiteliales.
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PROTENAS FIBROSAS
COLGENO
Colgeno Tipo I:
Procolgeno Tipo I:
precursor de colgeno tipo I
triple hlice formada por 3 cadenas polipeptdicas enrolladas
NUMEROSAS modificaciones post-traduccionales
PROTENAS FIBROSAS
COLGENO
1000 aa
Puente H
PROTENAS FIBROSAS
COLGENO
1000 aa
Hidroxilacin Pro, Lys
Requiere vitamina C
Puente H
(OH-Pro, OH-Lys)
Entrecruzamiento
covalente (Lys-Lys)
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PROTENAS FIBROSAS
COLGENO
Gly-X-Pro / Gly-X-OH-Pro
PROTENAS FIBROSAS
COLGENO - SNTESIS
35% Gly
11% Ala
21% Pro e OH-Pro
0,6% OH-Lys
de H
PROTENAS FIBROSAS
DEFECTOS EN LA ESTRUCTURA DEL COLGENO
(matriz extracelular)
Infecciones bacterianas
Metstasis tumorales
Diabetes complicaciones microvasculares AGEs, ROS
Enfermedades del tejido conectivo - raras
Osteognesis imperfecta (enfermedad de los huesos
frgiles)
Escorbuto
Latirismo
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PROTENAS FIBROSAS
-queratina
PROTENAS FIBROSAS
-queratina - PELO
Clulas
muertas
empaquetadas
y
cementadas por una matriz proteica amorfa
con alto contenido de azufre
PROTENAS FIBROSAS
-queratina - PELO
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PROTENAS FIBROSAS
-queratina - PELO
INMUNOGLOBULINAS -GLOBULINAS
ANTICUERPOS
Protenas producidas por el sistema inmune
respuesta a la presencia de sustancias
reconocidas como propias (antgenos)
Sintetizadas por Linfocitos B, volcadas a
circulacin = protenas plasmticas
Funcionan por reconocimiento y unin
ligando = antgeno
en
no
la
al
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INMUNOGLOBULINAS -GLOBULINAS
ANTICUERPOS
Formadas por dos cadenas polipeptdicas
livianas (L) y dos cadenas pesadas (H), unidas
por puentes disulfuro
UNIN AL
ANTGENO
UNIN A CLULA
FAGOCTICA
INMUNOGLOBULINAS -GLOBULINAS
ANTICUERPOS
INMUNOGLOBULINAS -GLOBULINAS
ANTICUERPOS
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INMUNOGLOBULINAS -GLOBULINAS
ANTICUERPOS
5 tipos de inmunoglobulinas
IgG: altas concentraciones en plasma
IgA: presente en las secreciones y constituye
una barrera antignica para las mucosas
IgM: es el primer anticuerpo que se sintetiza tras
el ingreso del antignico, circula en plasma
IgD: es el receptor antignico de superficie de
los linfocitos B
IgE: circula en cantidades nfimas, participa en
los procesos de alergia
INMUNOGLOBULINAS -GLOBULINAS
ANTICUERPOS
PROTENAS FIJADORAS DE O2
MIOGLOBINA
1 subunidad
HEMOGLOBINA
4 subunidades; heterotetrmero
Hb fetal HbF 22
Hb adulto HbA 22
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PROTENAS FIJADORAS DE O2
MIOGLOBINA
PROTENAS FIJADORAS DE O2
MIOGLOBINA
PROTENAS FIJADORAS DE O2
HEMOGLOBINA
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PROTENAS FIJADORAS DE O2
HEMOGLOBINA
PROTENAS FIJADORAS DE O2
PROTENAS FIJADORAS DE O2
HEMOGLOBINA - CONFORMACIONES
Estado T: conformacin de la desoxihemoglobina
Estado R: conformacin de la oxihemoglobina
ESTADO
T
ESTADO
R
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PROTENAS FIJADORAS DE O2
HEMOGLOBINA - TRANSPORTE DE O2
4O2 + Hb
nH + + Hb(O2)4
ESTADO
T
ESTADO
R
PULMN
4O2 + Hb
TEJIDOS
4O2 + Hb
CO2 + Hb-NH2
H + + Hb-NH-COO
carbamino-Hb (15%)
PROTENAS FIJADORAS DE O2
CURVAS DE SATURACIN DE O2
ESTADO
R
ESTADO
T
PROTENAS FIJADORAS DE O2
HEMOGLOBINA - TRANSPORTE DE O2
Buffer de pH
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PROTENAS FIJADORAS DE O2
HEMOGLOBINA - TRANSPORTE DE O2
Ecuacin de Hill describe matemticamente la curva sigmoidea
Midiendo pO2 y pH puede calcularse la saturacin de la Hb forma parte del EAB
PROTENAS FIJADORAS DE O2
HEMOGLOBINA 2,3-DIFOSFOGLICERATO
(2,3DPG, 2,3BPG)
PROTENAS FIJADORAS DE O2
HEMOGLOBINA - REGULACIN
ESTADO R ESTADO T
(OxiHb)
(desoxiHb)
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PROTENAS FIJADORAS DE O2
HEMOGLOBINA ADAPTACIN A LA ALTURA
(baja pO2)
Aumento de Hb/eritrocito
Aumento del nmero de eritrocitos
Aumento de 2,3DPG/eritrocito
(estado T, desoxiHb)
Hiperventilacin:
disminuye pCO2 y aumenta pO2 alveolar
(estado R, oxiHb)
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