Enzimas

Nicolas Mora

Todas las enzimas son protenas

Las enzimas tienen funcin cataltica
Catalizadores:

Fsicos

Qumicos
Los catalizadores aceleran reacciones qumicas mediante la disminucin de la energa de
activacin

Para que un reactante se transforme a producto debe haber un aumento de energa.

Caractersticas de las enzimas

No afectan la Keq

Disminuyen la energa de activacin

Aumentan la velocidad de la reaccin 106 a 1014 veces

Son especficas
Algunas enzimas necesitan cofactores, este puede ser grupo prosttico o no. Es un grupo
prosttico cuando forma parte de la protena
Apoenzima: enzima sin su grupo prosttico
El cofactor puede ser orgnico o inorgnico. Ej: citocromo oxidasa no funciona sin Cu+2
Protena conjugada: Protenas que necesitan un grupo prosttico
Coenzima: cofactor orgnico
Vitaminas: molculas orgnicas vitales para la vida
Clasificacin de las enzimas segn su especificidad

Absolutamente especfica: solo reacciona con un nico sustrato

Grupo especfica: reacciona con molculas similares que poseen el mismo grupo funcional

Enlace especfica: cataliza una combinacin de enlaces

Estereo especfica: solo reaccionan con ismeros D y L

Clasificacin de las enzimas

Clase

Tipo de reaccin catalizada

Transferencia de electrones

Oxidoreductasas
Reacciones de transferencia de grupos
Transferasas
Reacciones de hidrlisis (H2O)
Hidrolasas

Liasas

Adicin de grupos o dobles enlaces o formacin de doble enlace por

reaccin de grupo
Intercambio de ismeros

Isomerasas
Formacin de enlaces covalentes
Ligasas

Sitio activo

Radicales de unin

Radicales catalticos

Aminocidos estructurales (da la forma a la cavidad)

El sitio activo no es complementario al sustrato. El sitio activo debe ser complementario al estado
de transicin.
La enzima lleva al sustrato al estado de transicin, a esto se le llama estabilizacin del estado de
transicin
Pasos de la actividad enzimtica

Incremento de la energa de activacin

Formacin del complejo

Llevarla al estado de transicin

Toda reaccin enzimtica se divide en etapas
Teora del anclaje inducido: el sitio activo se acomoda al sustrato
Mecanismos de disminucin de la energa de activacin

Disminucin de la entropa (S) mediante efectos de proximidad, orientacin e

inmovilizacin de los reactantes

Estabilizar el estado de transicin

Desestabilizar el complejo enzima sustrato

Incrementar el nmero de pasos de la reaccin, cada uno de ellos con una menor energa
de activacin que la reaccin no catalizada
Factores que afectan la actividad enzimtica


Temperatura

pH

Fuerza inica

Tiempo de incubacin

Concentracin de enzima

Concentracin de sustrato
GB = energa que utiliza la enzima para llevar a cabo la catlisis
pH citoplasmtico: 7.0 7.3
El pH de accin de las enzimas tiene relacin con el lugar en el que trabajan
Fuerza inica: concentracin de iones

Para determinar el efecto del pH en una enzima se realiza una curva de funcin enzimtica a
distintos pH
El rango de pH donde la enzima tiene su mayor actividad es su mejor forma inica ptima, la cual
est lejos del punto isoelctrico (PI)
La velocidad de la reaccin depende de la velocidad de formacin del complejo [ES]

Enzima total = E + [ES]

Fase estacionaria: [ES] es constante cuando las velocidades de formacin y degradacin se igualan
Cintica de Michaelis y Menten

Implica la formacin de una etapa intermedia. La formacin del complejo [ES]

La Km es una concentracin de sustrato con la cual se alcanza la mitad de la velocidad

mxima (Vmx)

El valor de Km es un ndice de afinidad

A mayor Km, menor afinidad
A menor Km, mayor afinidad
Cada enzima tiene una Km para un determinado sustrato
Velocidad mxima: Ya no hay enzima libre, todo es [ES]
Ecuacin de Michaelis-Menten

V=

V [S]
K + [S]

Esta cintica se cumple para enzimas con un solo sitio activo

Reaccin de orden 1: la velocidad depende de la concentracin de sustrato

Reaccin de orden 0: la velocidad no depende de la concentracin de sustrato
Cuando el 100% de enzima esta como [ES] se dice que la enzima est saturada
Concentracin saturante: concentracin de sustrato a la cual la velocidad es independiente del
sustrato.
Una concentracin 10 veces Km es saturante
Ejemplo para entender Km
Hexoquinasa:

Km (fructosa) = 1 mM

Km (glucosa) = 0,5 mM
La hexoquiansa es ms afn con glucosa ya que necesita menos contraccin de glucosa para
alcanzar Vmx

Ecuacin de Lineweaver Bruk

Esto es el inverso de la ecuacin de Michaellis-Menten

Inhibicin enzimtica
Inhibicin competitiva
Inhibicin no competitiva

El inhibidor por lo general se une al sitio activo

Inhibicin reversible
La Km aumenta en presencia del inhibidor
(disminuye la afinidad)

El inhibidor por lo general no se une al sitio activo

Inhibicin irreversible
La Vmx disminuye en presencia del inhibidor
No altera la afinidad de la enzima por el sustrato

Enzimas alostricas

Son enzimas polimricas

Poseen conformacin nativa de estructura cuaternaria

K05 es el Km de este tipo de enzimas

Poseen ms de un sitio activo

Presentan cintica sigmoidal

Poseen la capacidad de aumentar o disminuir su actividad en presencia de modificadores

alostricos

Las enzimas con un solo sitio activo se ajustan a la cintica de Michaellis Menten
Enzimas alostricas

En su conformacin nativa tienen estructura cuaternaria. Se ajustan a un modelo de efecto

cooperativo

Pueden unir otros compuestos a otros sitios distintos al sitio activo llamado efector
alosterico. Esto significa que pueden ser reguladas

Pueden aumentar o disminuir su actividad

Estn presentes en rutas metablicas

Efecto cooperativo
La cintica sigmoidal se puede modificar por el efecto de modificadores positivos y negativos
K05: mide la afinidad de la enzima por el sustrato
A mayor K05 menor afinidad
A menor K05 mayor afinidad
En el sitio alostrico no hay catlisis
La unin al sitio alostrico es reversible y especfica
Modelos del efecto cooperativo


Modelo concertado: subunidades adyacentes tienen la misma conformacin. Todas las
subunidades son R o todas son T en una protena

Modelo secuencial: pueden existir protenas hbridas. Subunidades adyacentes tienen

distintas conformaciones

Modelo reciente: a bajas concentraciones de sustrato las enzimas son T mientras que a
altas concentraciones de sustrato las enzimas son R

Velocidad (umol/min)

Vmax

K05

K05

K05

[S] (mM)
Complejo multienzimtico
Conjunto de actividades enzimticas y cofactores que en forma coordinada catalizan una reaccin
compleja. Todas estas enzimas se encuentran asociadas a una gran estructura proteica con un
elevado nmero de subunidades constituyentes