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Traduccin

Universalidad de la transferencia en la informacin

gen0ca
Es virtualmente idn0ca en todos los organismos

El cdigo gen0co es idn0co en todos los organismos

El aparato de traduccin es similar en todos los organismos

mRNA de transcripto de hemoglobina de conejo es traducida como

tal en ambientes diferentes como en ranas (huevos)

Excepciones

DNA mitocondrial, dos codones son traducidos diferencialmente

debido a tRNA mitocondriales
AUA ledo en bacterias como isoleucina en mitocondrias es ledo
como me0onina
UGA en mamferos es traducido como triptofano y normalmente
representa un codon de terminacin

Otros:

TGA representa Trp en Mycoplasma

TAA y TAG representan me0onina en Tetrahymena y Paramecium

The Waltz of the Polypep/des Mara G. Hasel0ne. Sculpture at CSHL.

Reconocimiento del codn es hecho por el RNA de

transferencia (RNAt)
Son adaptadores que reconocen los codones en el mRNA e
insertan apropiadamente su aminocido
An0codn
Si0o de adhesin del aminocido
Los otros brazos probablemente asisten al enlace del
tRNA al ribosoma
Cada uno 0ene una estructura tridimensional nica que
le permite su reconocimiento adecuado por la sintetasa
Se localizan su genes nuclearmente (tandem repeats)

Figure 10-26. The structure of transfer RNA. (a) The func0onal areas of a generalized tRNA molecule. (b) The specic sequence of yeast alanine tRNA. Arrows
indicate several kinds of rare modied bases. (c) Diagram of the actual three-dimensional structure of yeast phenylalanine tRNA. The abbrevia0ons y, mG,
m2G, mI, and DHU (or UH2) are abbrevia0ons for modied bases pseudouridine, methylguanosine, dimethylguanosine, methylinosine, and dihydrouridine,
respec0vely. (Part a from S. Arno_, "The Structure of Transfer RNA," Progress in Biophysics and Molecular Biology 22, 1971, 186; parts b and c from L. Stryer,
Biochemistry, 4th ed. Copyright 1995 by Lubert Stryer; part c based on a drawing by Sung-Hou Kim.)

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Ml7ples codones para un solo

aminocido

Degeneracin del cdigo gen0co:
1 para trp y 6 para Ser
Varias explicaciones
Ciertos aminocidos pueden
ser trados al ribosoma por
medio de diferentes tRNA con
diferentes an;codones
Ciertas 0pos de tRNA pueden
traer su aminocido especico
en respuesta a varios codones
no solamente uno, a travs de
u n a p a r e a m i e n t o n o
especco en el nal (3 en el
codn y 5 en el an0codn):
Bamboleo (Wobble)
Figure 10-28. In the third site (5 end) of the an0codon, G can take either of two wobble posi0ons, thus being
able to pair with either U or C. This ability means that a single tRNA species carrying an amino acid (in this case,
serine) can recognize two codons UCU and UCC in the mRNA.

La traduccin (sntesis de protena) se

lleva a cabo en los ribosomas
Los ribosomas son parmculas
ribonucleoprotenicas cuya masa est
proporcionada mayoritariamente por RNAr
Las protenas ribosmicas se conocen
como protenas r.
El ribosoma est formado por dos
subunidades que 0enen funciones
especcas en la sntesis de protenas

La traduccin (sntesis de protena) se

lleva a cabo en los ribosomas
Dos molculas de RNAt 0enen
ac0vidad durante la sntesis
protenica en todo momento

La elongacin del polipp0do
implica reacciones que suceden
en dos de los 10 codones que
abarca el ribosoma

El RNAm est asociado con la subunidad

pequea de tal forma que 30 bases del
RNAm estn comprome0das en un
momento dado

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La traduccin (sntesis de protena) se

lleva a cabo en los ribosomas

La forma de todos los ribosomas suele ser

similar, pero solo los de las bacterias
(70S) han sido caracterizados en detalle

La subunidad pequea (30S) es de forma
alargada y est conformada por un
cuerpo que con0ene aprox. 2/3 de la
masa dividida por una hendidura.

La subunidad grande (50S) es ms
esfrica con un pednculo prominente
en la parte derecha y una protuberancia
central.

Cada subunidad ribosomal con7ene un RNAr mayor nico, de

16S y 23S en las procari7cas y de 18S y 28S en el citosol
eucari7co.

El RNA ribosmico abarca ambas

subunidades ribosmicas
Cada RNAr 0ene muchos dominios dis0ntos
que se doblan de manera independiente
Virtualmente todas las protenas ribosmicas
estn en contacto con el RNAr
La mayor parte de los contactos entre las
subunidades ribosmicas se realiza entre los
RNAr 16S y 23S

A u n q u e l o s r i b o s o m a s
eucari0cos son ms grandes
debido a un mayor nmero de
componentes.
Los componentes y los pasos
en la sntesis de protenas son
similares. Esto indica que este
proceso se origino en un
ancestro comn de procariotas
y eucariotas.

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Esquema general de la sntesis protenica

el RNAm enlaza la subunidad pequena de los ribosomas.
El tRNA enlaza en tres si0os en el ribosoma
Si0o A (aminoacyl): Si0o de entrada del aminoacil-tRNA
Si0o P (Pep0dyl): que lleva el creciente polipep0do
Si0o E (Exit): tRNA deace0lado
Decoding center: En la subunidad pequea, se asegura que slo los
tRNAs con el an0codon correcto se aparen con el codon y sean
aceptados en el si0oA
Pep0dyl transferase center: en la 50S, el tRNA apropiado se asocia
donde se cataliza la formacin del enlace pep0dico.
Ambos centros estn formados de regiones de rRNA, son si0os
importantes de contactos de tRNA-rRNA
El enlace pep0dico puede ser catalizado por un si0o ac0vo en el rRNA y
solo asis0do por protenas ribosomales. As 50S puede funcionar como
una Ribozima
Etapas:
Iniciacin, elongacin y terminacin

Componentes fundamentales para la

sntesis protenica
RNAm
Ribosomas
Aminocidos
Enzimas para la reaccin (aminoacil RNAt
sintetasa une el aa corecto a cada RNAt)
RNAt

El ribosoma 7ene tres si7os de unin

al RNAt (E, P y A)

Un aminoacil-RNAt entra al si7o A

El pep7dil-RNAt est unido al si7o P
El RNAt desacilado sale a travs del si7o E

Los si7os P y A abarcan las dos subunidades ribosmicas

Al transferir el polipp7do del pep7dil-RNAt del si7o P al aminoacil-RNAt del
si7o A, se agrega un aminoacido a la cadena polipepSdica

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Etapas de la sntesis protenica

Iniciacin
Codn-an0codn,
bamboleo,RNAt
Elongacin
Factores de elongacin
(Tu), aminoacil t-RNA
Terminacin
Factores de liberacin

Iniciacin. En bacterias requiere de 30S y factores

accesorios

La 30S y 50S deben estar separadas

IF1, IF2, IF3 se unen a 30S
En procariotas un tRNA iniciador que incorpora
formilme0onina: tRNAfMET
Codones de iniciacin en procariotas: ATG (AUG), GTG
(GUG) y en raras ocasiones TTG (UUG)
Los ribosomas existen como subunidades libres en el
citosol hasta que se inicie la sntesis de protenas
Para formar un complejo de iniciacin, una subunidad 30S
que porta los factores de iniciacin se une a un si0o de
inicacin del RNAm
El IF3 debe ser liberado para permi0r que las subunidades
50S se unan a los complejos 30S-RNAm

Etapas de la sntesis protenica

Iniciacin
Reacciones que preceden a la formacin del enlace pepmdico
entre los primeros dos aa de la protena
Unin del ribosoma a un RNAm para formar un complejo de
iniciacin
Elongacin
Todas las reacciones que 0enen lugar desde la sntesis del
primer enlace pepmdico hasta la adicin del l0mo aa

Terminacin
Los pasos necesarios para liberar a la cadena polipepmdica
completa. Al mismo 0empo el ribosoma se disocia del RNAm

Las subunidades pequeas buscan
si7os de iniciacin en el RNAm
eucari7co
Las subunidades ribosmicas 40S se unen al
extremo 5 del RNAm y exploran al RNAm
hasta que llegan a un si0o de iniciacin
Un si0o de iniciacin eucari0co est formado
por una secuencia de 10 nucle0dos que
incluye un codn AUG
Las subunidades ribosmicas 60S se unen al
complejo en el si0o de iniciacin

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La iniciacin 7ene lugar en una secuencia especial

localizada en el RNAm denominada si7o de unin al
ribosoma

Iniciacin
La iniciacin implica
el apareamiento de
bases entre el RNAm
y el RNAr
Un si0o de inciacin
bacteriano est
formado por el codn
AUG precedido de un
espacio de 10 bases
que con0ene el
hexamero de
polipurina Shine-
Dalgarno

La sntesis protenica comienza con una

me0onina usualmente codicada por el
triplete AUG

Diferentes RNAt de me0onina estn
implicados en la iniciacin y elongacin

El RNAt iniciador 0ene caracters0cas
estructurales Eunicas que lo dis0nguen del
resto de los RNAt

El grupo amino de la me0onina unida al
RNAt iniciador bacteriano esta formilado

Este grupo amino formilado evita que el
iniciador par0cipe en la elongacin, pero
no afecta la capacidad de iniciar la sntesis
de una protena

Iniciacin

IF3 permite que las subunidades 30S se
unan al si7o de inicacin de RNAm

IF2 se une al RNAt iniciador especial y
controla su entrada al ribosoma. Tiene
ac7vidad GTPasa dependiente de
ribosomas. Fomenta hidrlisis de GTP en
presencia de ribosomas liberando energa.
Se une al fMet-RNAY iniciador y le permite
entrar al si7o P parcial de la subunidad 30S

IF1 Se une al si7o A y evita que entre al
aminoacilRNAt, tambien impide
temporalmente que 30S se una a 50S

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En las eucariotas, las subunidades

pequeas buscan si7os de inicacin
en el RNAm eucari7co
Las subunidades ribosmicas
40S se unen al extremo 5 del
RNAm y lo exploran hasta que
llegan a unsi0o de iniciacin
El si0o de inicacin eucari0co
est compuesto por una
secuencia de 10 nucleo0dos que
incluye un codon AUG
Las subunidades 60S se unen al
complejo en el si0o de
iniciacin.

La translocacin mueve al ribosoma

La translocacin ribosmica desplaza

al RNAm tres bases a lo largo del
ribosoma

La translocacin lleva al RNAt

desacilado al interior del si0o E y al
pep0dil-RNAt al interior del si0o P,
adems de vaciar el si0o A

El modelo del estado hbrido

propone que la translocacin ocurre
en dos etapas, en las cuales la
subunidad 50S se mueve respecto a
la subunidad 30S y posteriormente
esta se desplaza a lo largo del RNAm
para restaurar la conformacin
original

Elongacin: La cadena polipepSdica se

transere al aminoacil-RNAt
La subunidad 50S 0ene ac0vidad pep0dil transferasa
La cadena polipepmdica naciente se transere del
pep0dil-RNAt del si0o P al aminoacil RNAt del si0o A
La sntesis de enlaces pepmdicos genera RNAt
desacilado en el si0o P y pep0dil RNAt en el si0o A
La ac0vidad responsible de la sntesis del enlace
pepmdico se llama pep0dil transferasa y es una funcin
de la subunidad ribosmica grande (50S o 60S)
La reaccin se desencadena cuando el EF-Tu libera el
extremo aminoacilo de su RNAt.
La catlisis de est reaccin es una propiedad del RNA
ribosomico de la subunidad 50S (23S)

Terminacin
Solo 61 tripletes son asignados a aminocidos,
los otros tres son codones de terminacin
Los codones UAA (ocre), UAG (mbar) y UGA
terminan la sntesis protenica
En las bacterias se u0lizan muy a menudo con
frecuencia rela0va UAA>UGA>UAG

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Los codones de terminacin son

reconocidos por factores protenicos

La sntesis de protena termina con

tres codones

Los codones de terminacin son reconocidos por

factores de liberacin de protenas, no por
molculas de aminoacil-RNAt
Los factores de liberacin clase 1 responden a
codones de terminacin especcos e hidrolizan
el enlace polipp0do-RNAt
El mecanismo es similar en las bacterias (que
0enen dos 0pos de factores de liberacin clase 1)
y en las eucariotas (que 0enen solo un factor de
liberacin clase 1).

Los codones UAA (ocre), UAG (ambar), y UGA

terminan la sntesis protenica
La frecuencia de uso de estos codones en
bacterias a menudo es UAA>UGA>UAG

Los codones de terminacin son

reconocidos por factores protenicos
Los codones de terminacin son reconocidos por
factores de liberacin de protenas, no por molculas
de aminoacil-RNAt
Los factores de libaracin clase 1 son semejantes a las
de aminoacil-RNAt-EF-Tu y del EF-G
Los factores de liberacin clase 1 son asis0dos por los
factores de liberacin clase 2 que depended del GTP
El mecansimo es similar en la bacterias (que 0enen dos
0pos de factores de liberacin clase 1) y en las
eucariotas (que 0enen un solo factor de liberacin
clase 1).

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The Waltz of the Polypep/des Mara G. Hasel0ne. Sculpture at CSHL.