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as familias de genes y grupos de genes

Un gen elegido al azar es probable que muestran diversos grados


de similitud con una serie de otros genes dentro de la
genoma. Grupos de genes que muestran similitud con cada uno
otros se refieren como una familia de genes, lo que refleja la
suposicin de que todo surgi de un ancestro comn.
Del mismo modo, los grupos de familias de genes relacionadas comprenden
una
familia supergnico refleja nuevamente una comn (aunque
mucho ms antigua) antepasado de todos los miembros. Las familias de genes
son una
consecuencia directa del hecho de que esencialmente todos los nuevos genes
surgen por la duplicacin de genes, ya sea mediante la duplicacin por mayor
de los genes enteros o mediante la duplicacin y arrastrando los pies de los
exones
a partir de diferentes genes. Las familias de genes proporcionan informacin
sobre
cmo surgen nuevos genes y se diversifican. Son tambin de inters
en que su organizacin puede proporcionar pistas sobre cmo el
genes en ciertas familias estn regulados por el desarrollo.
Por ltimo, la presencia de mltiples copias de genes relacionados
genera nuevas fuerzas evolutivas que no se ve cuando
considerar que los genes individuales.
Las familias de genes muestran una enorme diversidad tanto en el
nmero de miembros y su organizacin genmica.
Muchas familias se componen de unos pocos genes muy similares,
mientras que otros requieren un gran nmero de ambos estrechamente
relacionada

y los genes ms distantes. Todava otros existen como cientos de


copias esencialmente idnticas. En cuanto a la organizacin genmica,
miembros de una familia de genes se pueden dispersar por separado
en todo el genoma o puede mostrar diferentes grados de
clustering, formando familia clusters.Agene gen puede consistir
de varios grupos de genes relacionados repartidos por todo el
genoma. El tipo ms extremo de la agrupacin es cuando el
Toda la familia se limita a una o unas pocas series en tndem
donde mltiples (y esencialmente idnticos) son copias
dispuestos en un patrn de repeticin en tndem (con
copias dispuestas de forma repetida de cabeza a cola). Ms
comnmente, los miembros de clster estn separados por regiones
de ADN no relacionada y los miembros de la familia muestran
diversos grados de divergencia, que a menudo refleja funcional
divergencia.
Mientras que la familia de genes trmino se aplica ms frecuentemente a
la codificacin de protenas y genes estructurales de ARN codificante, hay
son otros dos grandes clases de elementos repetidos se encuentran
dentro del genoma. elementos genticos mviles (o transposones)
son secuencias que se extienden por todo el genoma de
la duplicacin de s mismos. Un elemento gentico mvil tpica
se compone de un tramo ofDNAflanked por el cisacting apropiada
secuencias y quizs que contiene uno o unos pocos genes
requerido para la movilizacin. Los genomas de la mayora de organismos
estn llenas de numerosas familias de elementos activos y
los restos en descomposicin de otras familias que han perdido su

capacidad de movilizacin. La segunda clase amplia de repetirse


elementos son repeticiones en tndem de ADN no codificante. Estas
puede consistir en decenas de repeticiones de un par de bases de nucletidos
(Microsatlites) hasta miles de repeticiones mucho ms grandes
(ADN satlites). Se cree que estas matrices para ser generado
por errores durante la replicacin del ADN y / o recombinacin.
Una vez generado, un array puede persistir durante un modesto
evolucin en el tiempo antes de perderse. Los transposones y
arrays no codificantes se denominan generalmente como repetitivo
Los ADN. Mientras que vamos a discutir algunos de los evolutiva
caractersticas de tales repetitiveDNAshere, nuestra principal atencin se
centra en
familias que codifican para protenas y ARNs estructurales.
Paralogous frente genes ortlogos
Dos tipos fundamentalmente diferentes de las comparaciones pueden ser
realizado entre los miembros de la familia de genes de diferentes especies
- Las relacionadas con los mismos genes (comparaciones ortlogos)
y aquellos que involucran diferentes, pero relacionados, genes
(comparaciones parlogos). Supongamos que estamos comparando
miembros de la familia de genes A y B en dos especies, en la que A y
B surgi de una antigua duplicacin que ocurri antes de
el ancestro de las dos especies. Deje A1 y B1 denotan estos
genes de la primera especie, A2 y B2 los de la
segundo. Las comparaciones ortlogos son A1 frente a A2,
y B1 frente a B2.
pseudogenes
Pseudogenes son una caracterstica comn de las familias multignicas.

Estas son copias de genes que no pueden hacer un funcional


producto (como resultado de cualquier nmero de mutaciones interrumpir
de regulacin y / o regiones codificantes). Los pseudogenes caen en
dos clases distintas, normales y procesados. Normal
surgen pseudogenes travs de la duplicacin directa de un tramo de
ADN y son tpicamente ligada al gen de origen. Ah
hay restricciones en el tamao del gen duplicado y
por lo tanto, puede contener la regin de codificacin as como de
acompaamiento
secuencias (en la que la mayor parte de las regiones reguladoras residen).
Por el contrario, pseudogenes procesados se forman por reversetranscribing
un ARNm. Como tal, slo el abarcan
codificacin de las regiones, que carecen de cualquier secuencia reguladora
que
residir fuera del transcrito primario. Por lo general son
encontrado en diferentes cromosomas de su putativo
genes de origen. pseudogenes procesados tienen ms probabilidades
inactivo durante la creacin, a menos que sean muy afortunado
para insertarse junto al gen apropiado reguladora
secuencias. pseudogenes normales, por otra parte, a menudo
mostrar evidencia de estar activo durante un perodo razonable
de la evolucin en el tiempo antes de convertirse en inactivo

Gentica, epigentica, y el medio ambiente pueden afectar juntos


la susceptibilidad de padecer diabetes tipo 2 (DM2). Nuestra puntera
era para diseccionar los mecanismos moleculares T2D subyacente
mediante expresin de ADN y metilacin de datos de todo el genoma
en el tejido adiposo de los pares de gemelos monocigticos discordantes
para la diabetes tipo 2 y las cohortes de casos y controles independientes. en
adiposo
tejido de gemelos diabticos, se encontr disminucin de expresin
de los genes implicados en la fosforilacin oxidativa; carbohidrato,
amino cido, y el metabolismo de los lpidos; y el aumento de
expresin de genes implicados en la inflamacin y glicano
degradacin. Los genes ms expresados diferencialmente incluidos
ELOVL6, GYS2, FADS1, SPP1 (OPN), CCL18, y
IL1RN. Hemos replicado estos resultados en el tejido adiposo de
una cohorte de casos y controles independientes. varios candidatos
genes para la obesidad y T2D (por ejemplo, IRS1 y VEGFa) eran
diferencialmente expresado en gemelos discordantes. Encontramos

una contribucin hereditaria a la metilacin del ADN en todo el genoma


la variabilidad en los gemelos. Las diferencias en la metilacin entre
parejas de gemelos monocigticos discordantes para la diabetes tipo 2 eran
posteriormente modesto. Sin embargo, 15.627 sitios, lo que representa
7.046 genes, incluyendo PPARg, KCNQ1, TCF7L2, y IRS1,
mostr metilacin del ADN diferencial en el tejido adiposo
de temas no relacionados con DM2 en comparacin con el control
asignaturas. Un total de 1.410 de estos sitios tambin mostr diferencial
metilacin del ADN en los gemelos discordantes para la diabetes tipo 2.
Para los sitios diferencialmente metiladas, la estimacin de heredabilidad
fue 0,28. Tambin el nmero de copias identificado variantes
(CNV) en parejas de gemelos monocigticos discordantes para la diabetes tipo
2.
Tomados en conjunto, los sujetos con diabetes tipo 2 presentan mltiples
transcripcional
y los cambios epigenticos en el tejido adiposo relevante
para el desarrollo de la enfermedad.
La susceptibilidad de padecer diabetes tipo 2 (DM2) aumenta con
la edad, la inactividad fsica y la obesidad en sujetos con una enfermedad
gentica
predisposicin (1). Sin embargo, los mecanismos moleculares exactos
causante de la enfermedad an siguen siendo desconocidos.
El tejido adiposo tiene un papel central en la energa de todo el cuerpo
metabolismo como un almacn dinmico de los triglicridos, y como un
rgano endocrino que coordina la ingesta de energa y el uso
por otros tejidos (2). En las personas con diabetes tipo 2
a la insulina que resulta en niveles elevados de lpidos en

la circulacin y el almacenamiento en los tejidos alternativos, tales como el


hgado,
msculo y el pncreas (3).
Un vnculo entre el medio ambiente y la enfermedad es la epigentica
influir en la transcripcin de genes y, posteriormente, la funcin del rgano
(4). Hemos demostrado previamente que las modificaciones epigenticas
se puede acumular durante el envejecimiento (5,6), y que el ADN
metilacin en los seres humanos es influenciada por la dieta, el peso al nacer,
y el ejercicio (7-10), lo que sugiere que podra ser la epigentica
involucrados en las enfermedades relacionadas con el estilo relacionadas con
la edad y de la vida tales
como diabetes tipo 2. De hecho, los estudios de nuestro grupo y otros (11-17)
han determinado que las modificaciones epigenticas en pacientes con
DT2; por ejemplo, encontramos sutiles diferencias de metilacin no genticos
en el tejido adiposo de cinco monocigticos doble (MZ)
pares discordantes para la diabetes tipo 2 utilizando la matriz Infinium 27k
(13). Sin embargo, nuestro conocimiento sobre el papel de la epigentica
en la creciente incidencia de la diabetes tipo 2 sigue siendo limitada, y
el perfil de expresin de todo el genoma tiene, a nuestro entender,
No ha relacionado con el epigenoma en el tejido adiposo de
los pacientes diabticos. Por lo tanto, nuestro objetivo fue investigar
diferencias en el genoma de toda expresin y la metilacin del ADN
en el tejido adiposo de los pares MZ gemelos discordantes para la diabetes tipo
2.
Este diseo de estudio permite la eliminacin de los factores de confusin
tales como el genotipo, la edad y el sexo. Las causas de la incompleta
concordancia entre gemelos monocigticos se explican tradicionalmente por
factores ambientales no compartidos. Para investigar la importancia

de nuestros hallazgos en la poblacin general, la expresin


de los genes seleccionados fue validado en cohortes de casos y controles.
Por ltimo, la heredabilidad de la metilacin del ADN se estim en
el tejido adiposo de los gemelos no diabticos, y la genomewidec

Los mdicos dependen de la gravedad de la fibrosis heptica para segregar los


pacientes con wellcompensated
enfermedad de hgado graso no alcohlico (NAFLD) en subpoblaciones en alto
frente
bajo riesgo de morbilidad relacionada con el hgado eventual y la mortalidad.
Se compar heptica
los perfiles de expresin gnica en pacientes de alto y bajo riesgo NAFLD para
identificar los procesos que
distinguir los dos grupos y por lo tanto podra ser nuevos biomarcadores o los
objetivos de tratamiento.
Se utiliz el anlisis de microarrays para caracterizar la expresin de genes en
biopsias hepticas percutneas
de bajo riesgo, los pacientes con NAFLD "leves" (el estadio de fibrosis 0-1;
N540) y de alto riesgo,
pacientes con NAFLD "graves" (el estadio de fibrosis 3-4; N532). Los resultados
fueron validados en un segundo,
cohorte independiente y confirmado por reaccin en cadena de la polimerasa
en tiempo real y
inmunohistoqumica (IHC). Como grupo, los pacientes con riesgo de malos
resultados NAFLD
sufrido lesin heptica y fibrosis significativamente peor ms avanzado (hgado
graso no alcohlico grave) de
clnicamente los pacientes con NAFLD indistinguibles con un buen pronstico
(hgado graso no alcohlico leve). UN
perfil de 64 genes diferenciado reproducible hgado graso no alcohlico grave
de hgado graso no alcohlico suave y una

subconjunto 20-gen dentro de este perfil correlaciona con la gravedad de


hgado graso no alcohlico, independiente de otro
factores que influyen en la progresin del hgado graso no alcohlico. Mltiples
genes implicados con el tejido
reparacin / regeneracin y ciertos genes relacionados con el metabolismo
fueron inducidos en severa
Hgado graso no alcohlico. Ingenuity Pathway Analysis y IHC confirm la
desregulacin del metabolismo y
regenerativos en vas de hgado graso no alcohlico y la superposicin severa
puesto de manifiesto entre la expresin gnica
patrones de NAFLD grave, enfermedad cardiovascular y cncer. Conclusin: Al
demostrar
vas metablicas y reparacin especficos que se activan de forma diferente en
los hgados
con hgado graso no alcohlico grave, perfiles de genes identificado nuevas
dianas que pueden ser explotadas para
mejorar el diagnstico y el tratamiento de los pacientes que estn en mayor
riesgo de hgado graso no alcohlico relacionada
morbilidad y mortalidad