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TRANSCRIO PROCARIOTOS E EUCARIOTOS

Em 1960, Sidney Brenner a partir do conhecimento dos aminocidos


existentes identificou que o cdigo gentico estava organizado em trincas.
Conhecia o nmero de nucleotdeos (4) e o nmero de aminocidos (20).
Havendo quatro letras para especificar 20 aminocidos as palavras seriam de
no mximo 3 letras: 4=64.

Caractersticas do cdigo gentico


1. escrito de modo linear; (DNA RNA PROTENA)
2. Cada palavra em mRNA consiste em trs letras ribonucleotdicas, sendo
referida como um cdigo de trincas. Cada grupo de trs ribonucleotdeos
denominado cdon e especifica um aminocido, com exceo do stop
cdon (UAA, UGA e UAG);
3. O cdigo no tem ambiguidade, ou seja, cada trinca especifica um
aminocido;
4. O cdigo degenerado, ou seja, determinado aminocido pode ser
especificado por mais de um cdon. Exceto a metionina (AUG) e o
triptofano (UGG), que so especificados por um nico cdon;
5. O cdigo possui uma trinca de iniciao e trs cdons de terminao
(stop cdons)
AUG metionina; UAA, UAG e UAG stop cdons;
6. O cdigo desvirgulado, ou seja, a sua leitura ocorre interruptamente,
at que atinja um cdon de terminao;
7. O cdigo no tem sobreposio: depois que a traduo comea, cada
unidade ribonucleotdica s faz parte de uma nica trinca;
8. O cdigo semiuniversal, ou seja, quase todos os organismos (vrus,
procariontes e eucariontes) utilizam a mesma sequncia de cdons para
especificar um aminocido, exceto mitocndrias de mamferos,
leveduras;
Diferena entre transcrio e replicao
1. Os precursores so trifosfatos de ribonucleosdeos;
2. nica fita de DNA usada como molde para a sntese de RNA;
3. No necessrio iniciadores;
Transcrio em procariotos
A expresso da informao de um gene, ou seja, a transferncia da
informao do gene para a protena, normalmente envolve a produo de uma
molcula de RNA transcrita a partir de um molde de DNA (Transcrio).
Durante a transcrio o filamento de RNA produzido apresenta uma sequencia
de bases complementares a uma das fitas de DNA (fita molde). No citoplasma
de procariotos encontra-se seu material gentico, organizado em sua grande
maioria, em um nico cromossomo de formato circular que no envolvido por
membrana. Neles (procariotos) todas as classes de RNA so transcritas por
uma nica RNA polimerase, e pela ausncia de um ncleo, os RNA
procariticos que codificam protenas so traduzidos enquanto esto sendo

transcritos. Nos procariotos a transcrio dividida em trs estgios: iniciao,


alongamento e trmino.

Iniciao
A RNA polimerase encontra o ponto correto de incio para a transcrio se
ligando a uma sequncia especfica do DNA, chamada promotor. Um promotor
pode controlar a transcrio de vrios genes (mRNA policistrnico- carrega a
informao de vrios genes). A primeira base transcrita est sempre no mesmo
local, chamado de stio iniciador (+1). Existem em particular, duas regies
promotoras de grande similaridade que foram chamadas de -35 (TTGACA:
sequencia de reconhecimento identificada pela subunidade ) e -10 (Tata-box
= TATAAT: rica em A-T, e facilita a deselicoidizao localizada de DNA) porque
esto situadas a 35 e 10 pares de bases respectivamente antecedentes a
primeira base transcrita, ou o stio iniciador.
Uma haloenzima de RNA polimerase liga-se ao DNA nesse ponto, e ento,
desenrola a dupla hlice de DNA, comeando assim a sntese de uma molcula
de RNA. A deselicoidizao localizada dos dois filamentos de DNA pela RNA
polimerase fornece um molde livre para fazer bases com os nucleotdeos que
chegam. A parte codificante de protenas de um gene, geralmente comea com
uma sequncia ATG, mas o stio de iniciao, onde comea a transcrio,
geralmente est bem antecedente a essa sequencia. A parte intercalar
chamada de Regio no traduzida 5-UTR. A haloenzima RNA polimerase
quem procura no DNA uma sequncia promotora. Esse complexo composto
de 5 subunidades: 2 .
Subunidade 2: monta o complexo tetramrico;
Subunidade e : Stio cataltico de ligao (: reconhece o trifosfato de
ribonucleotdeo/ : liga-pareia as bases);
Subunidade : Regula o incio da transcrio (Reconhece os promotores do
DNA e liga a RNA polimerase aos mesmos, liberada aps o incio da
transcrio, no participa do alongamento, sendo este catalisado pelas
subunidades 2.)
A subunidade se liga s regies -10 e -35, posicionando assim a
haloenzima para iniciar corretamente a transcrio do ponto de incio. Aps o
cerne da enzima estar ligado, a transcrio comea e a subunidade dissociase do resto do complexo, dando incio a fase de alongamento.
Alongamento
catalisado pelo cerne da enzima RNA polimerase ( 2). A RNA
polimerase acoplada ao DNA, abre a fita dupla na regio a ser transcrita, e
desliza sobre a fita de DNA. medida que a RNA polimerase se move ao longo
do DNA, ele desenrolado a frente e reenrolado automaticamente aps a
passagem da RNA polimerase, o que mantm uma regio unifilamentar de DNA
na qual o filamento a ser transcrito exposto. Essa regio chamada bolha de
transcrio. A RNA polimerase ento vai deslizando sobre o filamento exposto

da fita molde e o RNA (pr mRNA), vai sendo transcrito no sentido 5-3 at que
o trecho a ser transcrito termine. Ao longo do processo a energia necessria
para que ele ocorra vem da diviso do trifosfato (ATP) presente na prpria
molcula de DNA.
Trmino
Em procariotos a dois mecanismos principais de trmino: intrnseco
(independente de R) e dependente de R. No mecanismo intrnseco , a
sequncia de trmino contm 40 pares de base que termina em uma regio
rica em GC, seguida de vrias A. A fita de RNA que esta sendo sintetizada
forma uma ala em grampo (retarda o movimento da RNA polimerase) devido
s interaes entre os vrios nucleotdeos G e C (3 pontes de hidrognio por
par) e haver uma cauda final com uracilas. A RNA polimerase faz uma pausa
aps a sntese das U, pois nesse momento o hbrido DNA-RNA estar fraco,
voltando para estabiliz-lo. Durante o retorno a polimerase encontra a ala em
grampo, esse bloqueio fsico gera a liberao das cadeias de mRNA e do molde
de DNA, finalizando a sntese. O segundo mecanismo de trmino requer o fator
R, uma protena que reconhece os sinais de trmino para a RNA polimerase. A
sequencias de trmino dependente de R tem de 50 a 90 pb e especificam
mRNA ricos em C e desprovidos de G. A protena R se liga cadeia crescente
de RNA, movendo-se no sentido 5-3 juntando-se RNA polimerase quando
esta para na sequncia de trmino. A protena R ento tira a cadeia nascente
de RNA da bolha de transcrio.
Transcrio em eucariotos
O mRNA de eucariticos chamado de monocistrnico, s carrega a
informao de um gene. Um gene esta sob o comando de um promotor. E
quando traduzido produz apenas uma protena.
Em eucariontes a transcrio e a traduo ocorrem em compartimentos
diferentes.: transcrio no ncleo e a traduo no citoplasma. Isso da tempo da
clula modificar o RNA antes de manda-lo para o citoplasma para a traduo.
Nos procariotos a transcrio dividida em quatro estgios: iniciao,
alongamento, trmino e edio.
Tipos de RNAs que atuam na transcrio de eucariotos
RNA polimerase I: sintetiza o RNA ribossmico;
RNA polimerase II: sintetiza o RNA mensageiro;
RNA polimerase III: sintetiza tRNA, pequenos sRNA nucleares, rRNA 5S;
RNA polimerase IV: RNA de interferncia;
RNA polimerase V: RNA antisense;
Iniciao
A RNA polimerase II a enzima que transcreve os genes eucariticos
originando o mRNA. Seu papel inicial encontrar as sequencias promotoras:
sequencias curtas conservadas anteriormente ao ponto inicial da transcrio
(TATA Box: posicionar o pontos inicial da transcrio -35; CAAT Box: perto da
posio -80; GC Box e Boxe octmero). Uma sequencia reforada tambm pode

estar envolvida (regio enhancer). Muitos compostos, conhecido como fatores


de transcrio, so requeridos para uma transcrio bem sucedida. Essas
protenas ativadoras se ligam s sequencias na fita de DNA, atraindo a RNA
polimerase II para o ponto de incio da transcrio. O 1 fator a interagir o
TFIID, o maior deles, o qual contm uma protena de ligao ao TATA Box
(funo de posicionar a maquinaria para incio da transcrio). Os fatores TFIIA
e TFIIB, ento se juntam ao complexo. O TFIIB serve de ponte entre a protena
do TFIID ligada ao TATAbox e a RNA polimerase. Outro fator (TFIIF) se associa a
RNA polimerase, e ento se liga ao complexo e desenrola localmente a dupla
hlice de DNA. Por fim o fator TFIIE se junta ao complexo de iniciao junto ao
DNA posterior ao ponto de incio, dando incio assim ao elongamento da cadeia
de RNA.
Elongamento
necessrio adicionar energia ao sistema para o comeo da transcrio.
Esta energia provida pela reduo do ATP em ADP e Pi. Posteriormente,
a
RNA polimerase juntamente com o complexo migra pelo DNA, inserindo
ribonucleotdeos na extremidade 3 da nova molcula de RNA, visto que esta
cresce no sentido 5-3. Esses ribonucleotdeos so ligados por ligao
fosfodister. A maioria dos fatores so liberados depois que a transcrio inicia.
Quando o mRNA tem 30 ribonucleotdeos, feito a adio do cap (7metilguanosina) na extremidade 5. Este protege o RNA da degradao por
nucleases, pode auxiliar na sada de RNA para o citoplasma e reconhecido
por fatores proteicos durante a traduo.
Trmino
A ponta 3 do mRNA produzida por clivagem endonucleotdica. O stio
de clivagem localiza-se de 10 a 35 ribonucleotdeos depois da sequencia
consenso AAUAA e antes da sequencia rica em G-U. Aps a clivagem a enzima
poli A polimerase adiciona a cauda polia A, com aproximadamente 250
resduos de cido adenlico. Essa cauda da ao RNA estabilidade e auxilia no
transporte para o citoplasma (local onde ocorre a traduo).
O genes de eucariotos no so contnuos, ou seja, possui trechos
chamados de xon e de ntrons. Os xons codifica protena, os ntrons no.
Quando uma clula eucaritica transcreve um gene, ela transcreve tanto os
trechos que so xons, como os trechos que so ntrons. Esse RNA contendo
xons e ntrons chamado de mRNA primrio. O que a clula faz o splicing,
na qual ela retira os trechos que so ntros e religa os xons, ento quem vai
para traduo so apenas os xons.
A clula eucaritica faz o processamento alternativo do DNA, ou seja, na
hora que ela retira os ntros ela pode religar os xons em sequencias
diferentes, dando-lhe a capacidade de produzir mais de uma protena com o
mesmo gene variando a sequencia de xons.
Edio
Mecanismo primitivo para alterar os padres de expresso gnica.
Edio por substituio: As identidades das bases so alteradas;

Edio por deleo: Nucleotdeos so adicionados ou subtrados do nmero


total de base;
Remoo dos ntrons
Recomposio autocataltica: ocorre em rRNA, tRNA e mRNA de mitocndrias
de cloroplastos. Durante esse mecanismo no h necessidade de componentes
adicionais, pois o prprio ntron a fonte da atividade enzimtica necessria
para remoo. Consiste em usar um nucleotdeo guanosina como co-fator da
reao, pois seu grupo 3OH (G-OH) transferido para o nucleotdeo adjacente
a extremidade 5 do ntron, enquanto o ntron removido e os xons so
ligados, levando ao RNA maduro.
Recomposio por spliceossomo: utilizao de pequenos sRNA nucleares +
pequenas ribonucleoprotenas nucleares. Os ntrons que so submetidos a esse
tipo de mecanismo possuem sequencias dinucleotdicas GU, na extremidade 5,
chamada sequencia doadora e terminam com um nucleotdeo AG, na
extremidade 3, chamado sequencia aceptora. Consiste na remoo de introns
contidos nesses RNAs de forma que a protena U1 se liga ao sitio GU e a U2 liga
se na ramificao central (centro do ntron) contendo resduos de A. O
encadeamento comea depois das outras protenas (U4, U5 e U6) serem
adicionadas. A extremidade 5 do ntron clivada (5-GU), unindo ao centro do
ntron formando um estrutura circular. A extremidade 3 clivada e libera o
ntron junto com os pequens sRNA nucleares, havendo a unio da extremidade
5 de um exn com a extremidade 3 do outro, formando o RNAm maduro,
estando este pronto para a traduo.
Nuclease e Ligase: um corte endonucleoltico feito em cada extremidade do
ntron. Essas sequencias so retiradas e as extremidades terminais dos exn
so ligadas pela DNA ligase.
Principais diferenas entre eucariotos e procariotos
1. Sequncia de promotores
Em procariotos as sequncias promotoras so relativamente mais simples que
em procariotos. Alm de possurem sequencias enhancer que vo auxiliar no
reconhecimento do stio de iniciao.
2. Presena de RNA polimerase
Na Transcrio em eucariotos necessria a presena de 5 RNA polimerase
diferente (I, II, III, IV e V), enquanto em procariotos uma nica RNA polimerase
suficiente para a realizao do processo;
3. Localizao
Em procariotos, pela ausncia de um ncleo, os RNA procariticos que
codificam protenas so traduzidos enquanto esto sendo transcritos. Este
processo realizado no citoplasma. J em eucariotos a transcrio e a traduo
ocorrem em compartimentos diferentes: transcrio no ncleo e a traduo no
citoplasma.

4. Processamento do mRNA
Em eucariotos h regies denominadas ntros (inexistente em procariotos), que
devem ser retiradas do mRNA por meio de processos como splicing. Alm
disso, em eucariotos h a adio do cap 5 (protege o RNA da degradao por
nucleases) e da cauda poli A (da ao RNA estabilidade e auxilia no transporte
para o citoplasma). Regies essas que inexistem em procariotos.