ESTRUCTURA MOLECULAR DEL GEN EUCARIOTA

Actualizada por Gabriela Pacheco, 2011.

Como se ver luego en esta gua, (Organizacin de la Informacin Gentica), el

genoma de los organismos eucariotas se organiza en unidades denominadas cromosomas,
que consisten cada una de ellas en una nica molcula de ADN de doble cadena. Es
importante recordar que qumicamente el ADN es un cido nucleico, que consiste en un
polmero lineal (no ramificado) de unidades conocidas como nuclotidos (monmero). En
todos los organismos celulares (incluso en algunos virus) el polmero forma una estructura
de doble cadena o doble hlice. Cada cadena tiene una polaridad definida (Ver Figura 1);
por convencin las secuencias de ADN (simple cadena) se escriben siempre en sentido
53. Esto significa que una cadena simple de ADN comienza con un nucletido en el
que el grupo fosfato del C 5 de la unidad
de ribosa se encuentra libre.
Donde se localiza el ADN en una
clula eucaritica?. Y en una


procaritica?

La doble cadena de ADN que compone

un cromosoma tiene una gran longitud
que puede expresarse en nmero de
nucletidos. Por ejemplo, el tamao del
cromosoma 22 del humano medido en
nmero de nucletidos es 48 x 106 (48
Figura 1. La forma en que los nucletidos se
millones). Si consideramos el largo total
alinean confiere al ADN una polaridad qumica.
del genoma haploide del humano, es decir
Puede pensarse como un bloque con un extremo
que tiene una llave (el fosfato 5) y el otro extremo
el largo de sus 23 cromosomas, el nmero
con un cerradura (el hidroxilo 3). As cada cadena
de nucletidos asciende a 3,2 x 109.
completa tendr todas sus subunidades alineadas en
Arabidopsis thaliana una especie vegetal
la misma orientacin. Adems los dos extremos de
modelo de estudio, posee un genoma de
la cadena sern fcilmente distinguibles, uno tendr
aproximadamente 1,35 x 108 nucletidos,
una llave (5) y el otro una cerradura (3). Esta
polaridad en el ADN se indica refirindose a un
valor obtenido sumando el largo de sus 5
extremo como 5 y al otro como 3.
cromosomas. El cromosoma 1 de esta
especie, el cual es el ms largo de todos,
posee aproximadamente 3,4 x 107 nucletidos. Estas largas secuencias de nucletidos
contienen la informacin hereditaria completa para el organismo que la porta.
Funcionalmente las secuencias que componen el genoma pueden ser divididas en genes
Figura 2.
Ncleo de la c
clula con su
Siguiendo con los ejemplos
dotaci
dotacin de cromosomas
anteriores podemos mencionar
que el tamao promedio de un
ADN
gen de Arabidopsis thaliana es
de 2 x 103 nucletidos y en
humanos es de 104- 1,5x104
nucletidos. Por lo tanto se
desprende fcilmente que cada
molcula discreta de ADN
Detalle de un
cromosoma
Segmento de ADN que
(cromosoma) podr contener
constituye un gen
una gran cantidad de genes.
Los genomas completos de
Figura 2. Detalle de una porcin de ADN del genoma que
diferentes organismos pueden
constituye un gen.

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tener tan pocos como <500 genes (algunas bacterias), hasta tantos como >40.000 como el
humano. Si bien las secuencias de ADN que conforman el genoma de un individuo se
dividen en genes, una porcin importante de este ADN representa secuencias no
codificantes (no rinden protenas). Esta organizacin de las secuencias del ADN se
estudiar en detalle en la Unidad 5 de esta Gua.
En un gran nmero de
procesos, un gen constituye
una secuencia de cido
nucleico que codifica para una
protena, as, el producto final
de la accin de los genes son
polipptidos los cuales se
sintetizan usando ARN (cido
ribonucleico) como molcula
intermediaria. El proceso que
tiene lugar en el ncleo, a
travs del cual se produce ARN
a partir de ADN se denomina
transcripcin y el proceso por
el cual se produce un
polipptido a partir de ARN
mensajero (ARNm) se llama
traduccin, y tiene lugar en el
citoplasma de la clula (ver
Figura 3). Considerando su
funcin, podemos entonces
definir al gen, a escala
molecular, como un fragmento
Figura 3. Representacin de una clula eucariota donde se
de ADN que codifica para un
observan los distintos ARN y sus funciones.
polipptido. Si bien la mayora
de los genes que se estudian en nuestro curso corresponden a esta definicin, debe
considerarse que hay otros tipos de genes cuyos productos finales son ARNs que forman
parte de la maquinaria de sntesis proteica de la clula. Un caso comn es de los genes que
codifican para ARNs ribosomales (ARNr) y ARNs de transferencia (ARNt). La
estructura y funcin de los genes mencionados en ltimo trmino es diferente de aquella
correspondiente a genes que codifican para polipptidos, a los que nos referiremos a
continuacin. En todos los casos los genes se localizan en una ubicacin particular del
cromosoma (locus).
La definicin simplista de gen: una secuencia de ADN codificante para una protena fue
vigente entre mediados de los 50 y los 80. Entre las pocas de Mendel y Watson y Crick
no se conoca cmo era el mecanismo mediante el cual el ADN poda codificar una
protena. Desde el descubrimiento de los intrones se quebr la idea de gen como unidad y
con continuidad transcripcional.
Podemos entonces definir al gen de la siguiente manera:
Definicin funcional de gen: Unidades hereditarias que se transmiten en un individuo de
una generacin a otra en forma uniforme y predecible, y que contienen informacin
decodificable sobre estructuras y funciones del organismo.
Definicin detallada de gen (combinacin de estructura y funcin): Unidad de
informacin la cual est fsicamente constituida por un cido nucleico (ADN) que puede
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estar interrumpido por secuencias (los intrones) y que es codificante para una unidad de
funcin (polipptido, ARN ribosomal o ARN de transferencia).
Son las propiedades del gen:
Capacidad de almacenamiento y reproduccin fidedigna de la informacin,
as como su decodificacin.
Capacidad de variar, es decir, pueden mutar y recombinar.
Dinmica poblacional dentro del contexto de especies biolgicas, lo que
significa que manifiestan un comportamiento frente a la seleccin natural o
artificial.
Cules son las propiedades del material que porta la informacin gentica?

En los genes que llevan instrucciones para codificar protenas pueden describirse:
Una regin estructural
Las regiones regulatorias
La Figura 5 esquematiza la estructura molecular de un gen eucariota, detallando las
secuencias de importancia.

ADN

Regin
regulatoria

Regin estructural

5
Regin
regulatoria

Otra secuencia
regulatoria fuera de la
secuencia del gen

Regin estructural

Otra secuencia
regulatoria fuera de la
secuencia del gen

Sitio de inicio de
la trascripcin
(nucleotido+1)

Regin estructural

Promotor
5UTR

Regin codificante

3UTR
Regin estructural:
intron
intron
exonde bases queexon
TATA la secuencia
Esta zonaCGcontiene
se traducir exon
luego en la secuencia de
aminocidos de una protena (regin codificante). Adems, hacia el extremo 5 se
Sitio de inicio de
la trascripcin
(nucleotido+1)
Primeras tres bases (ATG) que
codificarn para el codn de
iniciacin

Ultimas tres bases TGA TAA TAG que

codificarn para uno de los 3 posibles
codones de terminacin o STOP.

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Regin estructural
Esta zona contiene la secuencia de bases que se traducir luego en la secuencia de
aminocidos de una protena (regin codificante). Adems hacia el extremo 5 se
encuentra la una zona denominada 5TR, por 5 untraslated region, es decir 5 no
traducida. Si bien esta secuencia es parte de la regin estructural, no esta incluida en la
regin codificante ya que no ser parte de la protena. Sin embrago, es importante porque
ser parte del transcripto maduro. Hacia el extremo 3 se encuentra el 3 UTR por 3
untranslated region, es decir, regin 3 no traducida. Tampoco esta secuencia codifica
Regin
regulatoria

Corriente arriba (+)

Regin estructural

Corriente abajo (+)

Sitio de inicio de la trascripcin

(nucletido+1)

Figura 6. Ubicacin de zonas gnicas a partir del sitio de inicio de la transcripcin

(Nucleotido +1).

para aminocidos, pero contiene zonas de gran importancia. Una de ellas es la seal de
corte y poliadenilacin. Esto significa que esta secuencia ser la que define la terminacin
de la transcripto y determinar el sitio donde se adicionar en el extremo 3 del transcripto
la cola de poli-A.
En mamferos la seal de poliadenilacin es una secuencia conocida: AATAAA,
encontrndose entre 10 y 30 bases corriente arriba (Figura 6) del sitio de poliadenilacin.
Sin embargo en vegetales superiores no existe un consenso acerca de esta secuencia y se
han propuesto diferentes secuencias como posibles (algunas de ellas AATAAA, CAYTG,
YGTGTTYY y YAYTG) (Y= C o T). Esto indica que an siendo el procesamiento del
extremo 3 del mensajero una caracterstica eucaritica universal, no opera de la misma
manera en diferentes eucariotas.
La regin codificante
Antes de que fuera posible caracterizar a los genes eucariticos, se crea que estos tenan
la misma estructura que los genes procariticos. Hoy en da se conocen bien las
discrepancias entre la estructura del ADN y la de su correspondiente ARN mensajero.
El ARN mensajero siempre incluye una secuencia nucleotdica que se corresponde
exactamente con la protena que
De lo que se conoce como regin estructural,
codifica de acuerdo a las reglas del
exactamente cules secuencias del ADN se
cdigo gentico. Pero los genes (el
traducen a protena?


ADN)
eucariticos
incluyen
secuencias adicionales que se
encuentran dentro de la regin codificante, interrumpiendo la secuencia que representa la
protena.
La secuencia codificante contiene a
Adems de polipptidos, existe otro tipo de
los exones son las secuencias
molcula que pueda codificar un gen,?.
reprensentadas en el ARN maduro y


que
codificarn
para
los
aminocidos. Por definicin un gen empieza y termina con exones. El inicio de la regin
codificante tiene la secuencia ATG (codn de iniciacin de la traduccin) la cual dar el
aminocido metionina, primer aminocido de la protena. El ultimo triplete de nucletidos
de la regin codificante puede ser uno de los tres siguientes: TGA, TAA o TAG. Este

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triplete es el codn STOP o codn de finalizacin, el cual determina el fin de la

traduccin. Este codn no se traduce a aminocido.
Adems de las secuencias de los exones se encuentran los intrones, que son las secuencias
intervinientes entre exones, y que como se dijo arriba, interrumpen la secuencia que
codifica la protena. Los intrones son removidos cuando el transcripto primario es
procesado para generar el ARN maduro (a travs del proceso de corte y empalme o
splicing).
Regiones regulatorias
Estas secuencias son sumamente importantes ya que controlan a qu nivel, cundo y en
cules clulas ser producida la protena.
Existen distintas secuencias regulatorias parea un determinado gen. Entre ellas la regin
regulatoria ms importante es el PROMOTOR del gen, el cual posee secuencias que son
consideradas como sitios de unin al ADN, es decir, secuencias que permiten que las
protenas que actan en la transcripcin (factores de transcripcin), interaccionen con el
ADN. En los eucariotas muchos de los promotores conocidos, aunque no todos, poseen
una secuencia llamada TATA box (caja TATA), la cual constituye el ncleo del promotor
y es el sitio donde se une la ARN
polimerasa II (ARN pol II) antes de iniciar
Es cierto que los elementos que
regulan la expresin de un gen,
la transcripcin. Esta zona, como su nombre
desde el punto de vista qumico,
lo indica, posee la secuencia consenso 5estn constituidos exclusivamente
TATAAA-3 y est ubicada alrededor de 25
por ADN?


pb corriente arriba (-25) del punto de
iniciacin
de
transcripcin
(+1),
determinando el sitio de inicio de la transcripcin. No es la nica secuencia que sealiza el
inicio de la transcripcin en la mayora de los promotores donde acta la ARN pol II, pero
si la ms importante. Casi siempre est localizada en ese lugar y usualmente est rodeada
por secuencias GC. Hay otras dos secuencias corriente arriba del punto de iniciacin, que
tambin afectan la expresin gnica y estn presentes en muchos promotores eucariticos.
stas son la CAAT box y la GC box (las cuales constituyen secuencias proximales del
promotor). La caja CAAT recibe ese nombre por su secuencia de consenso
(GGCCAATCT) y est a menudo localizada a unas 80 pb corriente arriba del punto de
iniciacin de la transcripcin. Como ocurre con la TATA box, los cambios mutacionales
en la CAAT box afectan la actividad gnica corriente abajo o la transcripcin del ARN.
La GC box posee la secuencia de consenso GGGCGG y, con frecuencia, est repetida.
Estas cajas presentes en la regin promotora constituyen los elementos estructurales de
regulacin que actan en CIS, esto es, todas las secuencias presentes en la mlecula de
ADN misma, que sern reconocidas por la maquinaria transcripcional para la expresin de
un gen dado. Sin embargo, la expresin de un gen no solamente depende de estos factores
en CIS, sino tambin de la participacin de un grupo de protenas conocidas como
factores de transcripcin. Estos factores
Considera que TATA box es
proteicos de transcripcin (qumicamente son


sinnimo
de promotor?
protenas, codificadas a su vez por otro gen del
genoma del mismo organismo) asisten a la enzima ARN polimerasa a posicionarse en el
promotor, a abrir la doble hebra de ADN ayudando a que la transcripcin se inicie, y
finalmente colaboran en la liberacin de la enzima una vez que la transcripcin ha
finalizado. Una vez que la ARN polimerasa comienza a elongar la cadena de ARN, los
factores de transcripcin se liberan del ADN y se vuelven disponibles para iniciar otra
ronda de transcripcin. De estos factores que trabajan sobre la cadena de ADN pero no
pertenecen a ella se dice que actan en TRANS.

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Debe considerarse, sin embargo, que existen muchas variaciones a este esquema general
en diferentes genes; por ejemplo, algunos promotores no tiene TATA box (llamados por
ellos TATA-less) tambin algunos carecen de las CAAT o GC boxes mientras que otras
tienen mltiples copias de ellas.
Otras regiones regulatorias pueden modificar la expresin de un gen an estando situadas
muy lejos (en nmero de
Por qu resulta necesaria la existencia de

nucletidos) de la secuencia del
elementos regulatorios de la transcripcin?
mismo. stas son los enhancers
(aumentadores) y los silencers
(silenciadores) las cuales son tambin parte del ADN del mismo individuo (en la Figura 5
estaran como ejemplo posicionalmente representadas por Otra secuencia regulatoria
fuera de la secuencia de gen). Como su nombre lo indica, los primeros aumentan el nivel
de transcripcin del gen mientras que los segundos lo disminuyen hasta incluso lograr
silenciarlo por completo. En la prxima unidad podr observarse la disposicin espacial
que toma el ADN durante la transcripcin, mostrando como interactan a travs de
intermediarios, la secuencia del gen que se est transcribiendo con las secuencias de
silencers y de enhancers.
Cules son las secuencias
funcionales principales que definen la
estructura de un gen eucaritico?

Bibliografa
Libros recomendados (existen versiones resumidas de ediciones previas a las ms
modernas) pueden consultarse gratuitamente en:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=books):
Introduction to Genetic Analysis. Griffiths et al.
Molecular Biology of the Cell. Alberts et al.

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