HSV-1 genome.

HSV-1 possesses a linear, double-stranded DNA genome of 152 kb encoding

more than 80 genes. The genome is composed of unique long (UL) and unique short (US)
segments, which are flanked by inverted repeats. The inverted repeats are designated as follows:
TRL: terminal repeat of the long segment; IRL: internal repeat of the long segment; IRS: internal
repeat of the short segment; and TRS: terminal repeat of the short segment. The repeats
surrounding UL are designated ab and b'a', while the repeats surrounding US are designated a'c'
and ca. There are two different origins of replication, oriL in the long segment and oriS in the
short segment. OriS is duplicated, along with ICP4, because they are found in the verted repeats
surrounding the short segment. Similarly, 34.5, ICP0, and LAT are duplicated because they are
found in the inverted repeats surrounding the long segment. Approximately half of the genes are
essential for viral replication in cell culture and are labeled above the genome. The other half are
nonessential for replication and are labeled below the genome. The open reading frames are read
from left to right. Genes labeled in red represent nonessential genes that are mutated in several
of the replication-conditional viruses studied in brain tumor therapy and described in the text.
The genome contains three pac signals (shown in green) that assist in packaging the DNA into
virions

HSV-1 genom. HSV-1 memiliki linear, genom DNA untai ganda dari 152 kb encoding lebih
dari 80 gen. Genom terdiri dari unik panjang (UL) dan unik pendek (AS) segmen, yang diapit
oleh mengulangi terbalik. Mengulangi terbalik ditetapkan sebagai berikut: TRL: repeat
terminal segmen panjang; IRL: ulangi internal segmen panjang; IRS: ulangi internal segmen
pendek; dan TRS: ulangi terminal segmen pendek. Mengulangi sekitarnya UL ditujukan ab
dan B'A ', sementara mengulangi sekitar US ditujukan A'C' dan ca. Ada dua sumber yang
berbeda replikasi, oriL di segmen panjang dan Oris di segmen pendek. Oris diduplikasi,
bersama dengan ICP4, karena mereka ditemukan di mengulangi terbalik sekitar segmen
pendek. Demikian pula, gamma34.5 miring, ICP0, dan LAT yang diduplikasi karena mereka
ditemukan di mengulangi terbalik sekitar segmen panjang. Sekitar setengah dari gen yang
penting untuk replikasi virus dalam kultur sel dan diberi label atas genom. Sisi lain yang
tidak penting untuk replikasi dan diberi label di bawah genom. Frame baca terbuka dibaca
dari kiri ke kanan. Gen berlabel merah merupakan gen yang tidak penting yang bermutasi di
beberapa virus replikasi-kondisional dipelajari dalam terapi tumor otak dan dijelaskan dalam
teks. Genom berisi tiga sinyal pac (ditampilkan dalam warna hijau) yang membantu dalam
kemasan DNA menjadi virion