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Drogas antivirales:
AZT: lo que pasa con esta droga, es que se parece a una T, lo que la diferencia es que en el carbono 3 en vez de
tener OH tiene un triple nitrgeno, entonces la DNA polimerasa viral cuando empieza a sintetizar la cadena, la
confunde con una T, eso permite que cuando se le quiera agregar otra base mas, no podr ya que no tiene con
que unirse el enlace fosfodiester (falta OH). La clave del AZT, es que solo la polimerasa viral la confunde, la de
nuestro organismo no la confunde. Igual han aparecido organismos resistentes a esta droga.
DDI: tambin acta contra el sida, este se parece a G, en vez de tener un OH, en el carbono 3, solo tiene un H y
acta de la misma manera que AZT, impidiendo la formacin del enlace fosfodiester.
Hay otra droga que es un inhibidor de la proteasa del virus, completan el coctel, de la triterapia contra el sida.
CAN CER:
La base radica en la sntesis del DNA, la dos drogas mas
comunes son: Fluoruracilo: es un uracilo con un flor, y
la metotrexato, ambas se ocupan para la quimioterapia.
Que es lo que hacen?
Fluoruracilo: interfieren con la sntesis del timina,
inhibe al a enzima tinhidrato sintaza, donde un uracilo
se transforma en T.
Metotroxato: inhiben a esta enzima (imagen), que
tambin no permite que sintetice T, que ocurre cuando
una clula no sintetiza T? no puede sintetizar DNA, eso
es lo que queremos hacer, que la clula cancerosa no se
multiplique, Por qu busca atacar la sntesis de T?
porque es la base que se usa en la sntesis de solo DNA,
las otras no se pueden atacar, porque tambin se ocupan
en la sntesis de RNA, para la transcripcin, si
inhibiramos cualquier de las otras tres bases inhibiramos la
transcripcin de nuestros genes. Pero eso no quiere decir que
las drogas no sean toxicas para nuestro cuerpo, porque ataca a
las clulas que constantemente se estn reproduciendo, por
ejemplo, las clulas sanguneas, por eso las personas se quedan
sin sistemas inmune ( no hay linfocitos); y tambin que las
mucosas se llenan de heridas, (epitelio no se regenera, y al
detener la multiplicacin se pierde el moco). Por eso la
quimioterapia no se hace ms de 6 das.
La radioterapia es distinta, lo que busca es destruir el DNA a la
clula cancergena, los rayos se dirigen a la clula matando su
DNA.
Es muy comn encontrar en los libros las definiciones de gen, muchas veces leern, secuencia de DNA que
codifica una protena, eso es parcialmente falso. Porque hay genes que no codifican protenas, algunos genes si
codifican para protenas y estos son los que dan origen a RNAm. O sea del DNA pasa al RNAm y este codifica
una protena. Pero adems hay genes que no estn destinados a codificar protenas sino que por ejemplo el RNA
de transferencia (que llevan el aminocido para producir la protena), la funcin de este RNA trascrito no es
producir protena, sino que funcionar como RNA, y estn codificado en genes, genes que producen RNA. Estn
tambin los RNA ribosomales, q tambin solo funcionara como RNA y no codificara para una protena. Todos
estos codificados en genes, genes que no codifican para protena.
Adems hay un tercer tipo de RNA que no es muy conocido, que son los RNA nucleares pequeos, snRNA, son
RNA que estn en el ncleo y son pequeos (ja), y participan en el procesamiento de intrones, lo que conocemos
como splicing.
Los nicos RNA que codifican para protena son los RNAm, entonces una definicin mas correcta seria
secuencia de DNA que se transcribe y da origen a un RNA, lo que pase con el RNA es otra historia.
Las diferencias entre el DNA y el RNA son que el primero es doble hebra. Adems esta las azucares de las
bases, en el C2 donde esta el grupo H o OH y tercera diferencia son la timina y el uracilo (entre ambos solo se
diferencian en un grupo metilo).
Ahora vamos a hablar de la estructura de los genes, los genes tienen 3 partes, un codificador, un promotor y un
regulador. El codificador es la zona que se transcribe, la que forma el RNA es el codificador, aqu estn los
intrones y los exones, al comienzo de esta parte esta el sitio de unin de los ribosomas, etc. La segunda parte es
el promotor, el cual es una secuencia de DNA que no se transcribe, no produce RNA, pero ac es donde se une
el RNApolimeraza (la enzima que transcribe el DNA), esta reconoce al promotor y se une a el. El
RNApolimeraza se une en la secuencia TATA, llama caja TATA, y esta secuencia se encuentra e todo el
promotor y si la secuencia TATA no esta el promotor no funciona. Y otra secuencia que esta en el promotor es
la secuencia CAAT, todo esto esta en el promotor.
En el DNA hay unos nmeros ( 1, -1 , -25), los cuales marcan la posicin de DNA, es una nomenclatura. La
posicin +1, es donde comienza la trascripcin.
Hay genes que son muy largos, pueden llegar hasta 5000 bases que se transcriben. Y todo lo que este a la
izquierda de +1 es negativo, y la caja TATA esta en la posicin -25.
Esto siempre es as?
Esto es como un consenso, pero el promotor no da mucha flexibilidad. El promotor tiene que estar muy cerca de
donde se va a iniciar la transcripcin, porque aqu se va a unir la rna polimerasa y la rna polimerasa va a
comenzar a transcribir hacia ac, entonces yo no puedo poner el promotor muy lejos, la transcripcin comienza
inmediatamente donde est el promotor. En cambio el tercer elemento que es el regulador, puede estar a
distancias muy variables, por eso ah est interrumpida la lnea: exones como rectngulo e intrones como lnea
continua. Entonces ah est interrumpido y esto quiere decir que ac podemos tener distancias muy variables e
incluso podemos variar con ingeniera gentica, podemos tomar un regulador y lo muevo y lo dejo ms cerca e
= funciona.
El regulador es muy importante, porque es ac donde se unen los factores de transcripcin especficos, podemos
resumir esto diciendo que el promotor le indica a la clula, donde hay un gen o dicho de otra manera donde hay
que empezar a transcribir, recuerden que este gen est incluido en el genoma, que la clula tiene que identificar.
Entonces lo primero que hace la clula es identificar donde hay un promotor, aqu hay un gen entonces aqu
vamos a unir la rna polimerasa que va a transcribir lo que est hacia el otro lado. Entonces el promotor le seala
a la clula donde estn los genes y el regulador lo que hace es indicarle a la clula cuando un gen se tiene que
activar y dondeen qu tipo de clulas. (Explicacin de los 25 mil genes y que no todos se expresan). Como se
hace esto, con unas protenas llamadas factores de transcripcin especficos que se unen ac y le dicen a este
gen se active. Y tambin en una misma clula un gen que est activo no est siempre activo, esto es muy
dinmico el gen se activa, se silencia, etc., segn los requerimientos de protenas que tenga esa clula. Todo lo
anterior sucede gracias a reguladores y factores de transcripcin especficos.
La transcripcin es un proceso muy parecido a la replicacin
del DNA. La transcripcin cumple las mismas reglas que la
replicacin. Se sintetiza el rna la direccin 53 y la hebra
que se lee del DNA es de 35. Ahora hay una diferencia
entre estas dos, en la replicacin las dos hebras de DNA se
van separndose y en la transcripcin el DNA tambin se va
separando, pero como una especie de burbuja muy pequea,
por donde va avanzando la rna polimerasa, va leyendo el
DNA, donde momentneamente se han separado la dos
hebras y la polimerasa pasa por ah y seguir avanzando y el
DNA que est atrs volver a formarse doble hebra (abre y
se cierra).
Los genes estn codificado en UNA SLA HEBRA! Pero
eso slo ocurre en eucariotas, en virus no sucede lo mismo.
El rna que se produce es = a la otra hebra (por
complementariedad y explicacin de la presencia de uracilo en rna (U en vez de T)********que es un misterio
de la naturaleza).
La polimerasa reconoce el promotor se une y en el promotor se
empiezan a separar las cadenas de DNA, la polimerasa empieza a
avanzar y va leyendo de 3 a 5 y va produciendo el rna, va
avanzando y fjense que lo que va quedando atrs (******).
Avanza el rna cada vez mas largo y hasta que la polimerasa se
encuentra con una seal que le indica que tiene que parar de
transcribir. Aqu termina el gen, la polimerasa se despega y se
tiene rna sintetizado.
Secuencia: seal de trmino de transcripcin, pero la polimerasa no termina justo ah, cuando se encuentra con
esta secuencia avanza un poco ms y ah termina.
AUG inicio de la traduccin! No transcripcin
Tenemos distintos tipos de rna polimerasa, cada uno tiene una funcin distinta por ejemplo, la polimerasa 1
sintetiza los rna ribosomales, p2 sintetiza rna (******), p3 sintetiza rna transferencia. Todas hacen transcripcin
qu genes transcriben? Son distintos
Por qu la secuencia TATA del promotor es tan importante?: si una letra cambia, el promotor deja de funcionar y
el gen se inactiva. Y eso es por lo siguiente: aqu est el dna, aqu la secuencia del promotor y quiero explicarles
como empieza la transcripcin: lo primero que ocurre es que hay una protena que es TBP (tata binding protein)
y esa es la primera protena que llega al promotor reconoce la secuencia TATA y se une a ella. La unin de la
protena a la caja TATA produce un cambio en la estructura del dna (de alguna manera se dobla) y despus que
ocurre eso empiezan a llegar un montn de otras protenas que se van uniendo formando una cascada
secuencial, todas se llaman TF (transcription factor no hay que aprendrselas ni tampoco su orden de llegada).
Esta protena grandota que uds ven ac, es la rna polimerasa que llega tambin asociada a un factor de
transcripcin, se une y despus siguen llegando ms FT, formndose un complejo de muchas protenas y
llamamos a esto el complejo de iniciacin de la transcripcin (tiene que armarse este complejo para que la
transcripcin pueda empezar). Una vez que la transcripcin empieza, los ft se despegan de la polimerasa y la