Universidad de Aconcagua

BIOQUMICA
Segundo Semestre 2014

INTRODUCCIN A LA BIOQUMICA

Francisca Juregui Riquelme

Clase 1:
Unidad I: Introduccin a la Bioqumica
Definicin, objetivos e importancia de la bioqumica.
Equilibrio cido - base del agua: pH, tampones o
amortiguadores de pH
Ecuacin de Henderson-Hasselbach. Tampones fisiolgicos.

BIOQUMICA Y SU IMPORTANCIA
Ciencia que estudia la base qumica de las molculas que
componen las clulas y los tejidos, que catalizan las reacciones
qumicas del metabolismo celular.
Entender cmo la interaccin de diferentes molculas
inanimadas genera y mantiene la vida de un organismo.

TEMAS TRATADOS POR LA BIOQUMICA

Complejidad qumica y de estructuras de las molculas en los seres vivos.
Organizacin microscpica en los seres vivos.
Sistemas de extraccin, transporte y uso de energa del entrono.
Funciones definidas para cada componente de un organismo y la regulacin entre ellos.

Mecanismos para responder al entorno.

Capacidad de autorreplicacin y autoensamblaje de los organismos.
Evolucin y cambios a lo largo del tiempo.

PRINCIPALES AVANCES RECIENTES DE LA BIOQUMICA

1. Discusin de enfermedades asociadas al mal plegamiento de
protenas
2. Nuevos productos farmacuticos.
3. Descripcin de lpidos voltiles como sealizadores entre plantas.
4. Catabolismo de lpidos y PPAR
5. Epigentica
6. Funciones de RNA
7. Conceptos de genmica, transcriptmica y protemica.
8. Tratamiento de enfermedades cardiovasculares, diabetes,
infecciones bacterianas, obesidad, cncer.

LOS ORGANISMOS SE PUEDEN CLASIFICAR

La clasificacin nutricional bsica de los organismo se realiza segn tres criterios:

Fuente de energa: Se refiere al mtodo para producir ATP que se utilizar en la

biosntesis de otros compuestos.

Fuente del carbono: Se refiere a la fuente del carbono usada por el organismo para su
crecimiento y desarrollo.

Fuente reductora o donador de electrones: Se refiere a los compuestos donadores de

electrones que se utilizarn en la biosntesis de otros compuestos.

LOS ORGANISMOS SE PUEDEN CLASIFICAR

TEORA ENDOSIMBIONTE

LAS CLULAS CONSTRUYEN ESTRUCTURAS MACROMOLECULARES

SUBUNIDADES MONOMRICAS A PARTIR
DE LAS CUALES SE FORMAN LOS
COMPONENTES CELULARES

JERARQUA ESTRUCTURAL EN LA ORGANIZACIN MOLECULAR DE

LAS CLULAS

FUNDAMENTOS QUMICOS
VERSATILIDAD DE ENLACE DEL CARBONO

FUNDAMENTOS QUMICOS
GRUPOS FUNCIONALES
COMUNES DE LAS
BIOMOLCULAS

LOS ORGANISMOS OBTIENEN Y TRANSFORMAN ENERGA

En toda reaccin qumica existe un flujo de energa, dado por la sgte. ecuacin:

G = H - TS
G: Energa Libre
H: Entalpa (calor)
S: Entropa (desorden)
T: temperatura

Toda reaccin ser

espontnea si tiene un
G negativo.

Acoplamiento de reacciones

Reaccin endergnica con G positivo.

Reaccin exergnica con G negativo.

FUNCIN DE LOS CATALIZADORES

LOS ORGANISMOS
OBTIENEN Y
TRANSFORMAN ENERGA
PAPEL DEL ATP Y NAD(P)H
EN EL METABOLISMO

EL METABOLISMO EST REGULADO

EJEMPLO SNTESIS DE ISOLEUCINA

EL AGUA
Dipolo

ENLACE DE HIDRGENO
Atraccin intermolecular
debido a la estructura
electrnica de la molcula de
agua.

Equilibrio cido - base del agua: pH

El agua tambin es posible encontrarla ligeramente ionizada.

H+

H2 O

+ OH-

In
hidrgeno
(protn)

+
=
2

In
hidroxilo

En agua pura a 25C, la concentracin del agua es de 55,5 M (molar):

+
=
55,5

55,5 = + = [Kw]

Producto inico
del agua

Mediante conductividad elctrica del agua pura se ha determinado que Keq del agua a 25C
es 1,8 x 10-16:

55,5 1,8 1016 = +

1,0 1014 = +

Cuando las concentraciones de H+ y OH- son exactamente iguales, tal

como sucede en agua pura, se dice que la solucin est a pH neutro.

1,0 1014 = + =
1,0 1014 = + + = +

Despejando [H+] da:

+ =

1 1014

+ = = 107

1
= + = +

Para una solucin neutra a 25C:

1
=
= 7,0
7
1 10

El pH se mide con un electrodo de

vidrio que es sensible especficamente
a las concentraciones de H+ (pHmetro).
El pH afecta a la estructura de protenas
y la actividad cataltica de las enzimas.
pH de sangre y orina se usa para
diagnosticar algunas enfermedades
(diabetes genera pH de sangre inferior
a 7,4 conocido como acidosis, lo
contrario se llama alcalosis)

Constantes de disociacin para cidos dbiles (que en agua no estn

completamente ionizados y estn en equilibrio entre todas sus formas):

HAc

H+

+ Ac-

+
=
[]
1
=
= log

Buffer o amortiguador de pH
El buffering (o tamponamiento) es un fenmeno que ocurre contra cambios de pH.
Este fenmeno tambin ocurre en los procesos biolgicos
Los grupos amino y carboxilo de las enzimas poseen pKa caractersticos. As tambin
los grupos fosfato de los nucletidos. Todos estos funcionan como cidos dbiles.
Los cidos dbiles son aqullos cidos que se ionizan parcialmente y liberan un H+.
Y cuando estn en equilibrio disueltos en agua, se pueden encontrar cada una de
sus formas (HAc, H+ y Ac-)
Los buffers (o tampones) son sistemas acuosos que tienden a resistir cambios en su
pH cuando se aaden pequeas cantidades de cido (H+) o base (OH-).
Un sistema buffer consiste de un cido dbil (dador de protones) y su base
conjugada (aceptor de protones)

Buffer o amortiguador de pH

cido dbil
(dador de protones)

base conjugada
(aceptor de protones)

Buffer o amortiguador de pH
Un par cido-base conjugado (cido
actico y in acetato) tiende a
resistir un cambio en el pH cuando
se aaden pequeas cantidades de
cido o base.

La accin del buffer (o tamponamiento) es la consecuencia de dos reacciones

reversibles que tienen lugar simultneamente y que alcanzan sus puntos de
equilibrio segn las constantes de equilibrio (Kw y Ka).
Siempre que se aade H+ u OH- a un tampn, el resultado es un pequeo
cambio en el cociente de las concentraciones relativas del cido dbil y de su
base conjugada y, por lo tanto, un pequeo cambio en el pH.

Todo buffer posee una CURVA DE TITULACIN caracterstica

La curva se grafica como sigue:

1. Tengo en solucin el cido actico.
2. Agrego pequeas cantidades
consecutivas de NaOH.
3. Se mide el pH despus de cada adicin.
4. El pH se grafica en eje Y y la cantidad de
NaOH adicionada se grafica en el eje X (%).

REGIN DE TAMPONAMIENTO. Regin en donde el poder de tamponamiento es mximo.

pH 5,86-7,86
pH 3,76-5,76

pH 8,25-10,25

La curva de titulacin tiene la

misma forma para todos los
tampones.
Esta curva est expresada por la
ecuacin de Henderson-Hasselbach

Esta ecuacin es importante

para comprender la accin de
los tampones y el equilibrio
cido-base en la sangre y
tejidos de los vertebrados.

Para un cido dbil

sabemos que:

Despejando

[H+]:

Tomando el logaritmo negativo

en ambos lados de la igualdad:

+
=
[]

=
log

=

Ecuacin de Henderson-Hasselbach:

= +

Con esta ecuacin se entiende

por qu en el punto medio de la
titulacin el pH es igual al pKa:
En este punto, [HAc] = [Ac-], as:

= +

= + log 1 = + 0 =

EJERCICIO:
Calcular a 25C el pH de una disolucin obtenida al disolver 0,8 moles de CH3COOH y
0,8 moles de CH3COONa hasta obtener 1 L de solucin. (Ka CH3COOH = 1,79 x 10-5)

pH PTIMO DE LAS ENZIMAS

pH al cual las enzimas tienen su mxima actividad cataltica.

Pepsina: enzima digestiva

secretada en el jugo
gstrico.
Tripsina: enzima digestiva
que acta en el intestino
delgado.
Fosfatasa alcalina: enzima
hidroltica del tejido sea,
participara en la
mineralizacin del hueso.

TAMPONES FISIOLGICOS
Dos tampones biolgicos importantes son los sistemas del fosfato y del bicarbonato.
El tampn fosfato acta en el citoplasma.
Tiene su efectividad mx a pH cercano a su
pKa de 6,86. Resiste cambios entre 5,9 y 7,9.
El tampn bicarbonato acta en el
plasma. Posee tres Ka, una para cada
reaccin. Implica tres equilibrios.
Tiene su efectividad mx a pH cercano
a 7,4. El H2CO3 del plasma est en
equilibrio con la gran reserva de
CO2(g) en los pulmones dado por la
respiracin.
Ejemplo:
Al hacer ejercicio, se forma cido
lctico en los msculos. Este cido
aade H+, con lo cual finalmente
aumenta CO2, que se exhala.

2 4 + + 42

PROBLEMAS FISIOLGICOS POR CAMBIO DE pH

En individuos normales, el pH del plasma sanguneo va entre 7,35 y 7,45.
En individuos con Diabetes:
- Falta de insulina o insensibilidad a su presencia.
- No existe captacin de glucosa desde la sangre.
- Aumenta el uso de cidos grasos como fuente de energa.
- Acumulacin de dos cidos carboxlicos (cido -hidroxibutrico y cido acetoactico)
Niveles normales en plasma: <3 mg/100 ml
Niveles en diabticos: 90 mg/100ml
Excrecin urinaria normal: <125 mg/24hr
Excrecin en diabticos:5 g/24hr
- La disociacin de estos cidos disminuye el pH sanguneo a menos de 7,35.(ACIDOSIS)
- Genera dolor de cabeza, somnolencia, nuseas, vmitos y diarrea, seguidos de
aletargamiento, como y convulsiones (muy probable porque algunas enzimas
importantes dejan de funcionar).
El ayuno y la inanicin tambin generan acidosis (ya que fuerzan al uso de cidos grasos).
Falla renal disminuye capacidad de regular niveles de bicarbonato. Enfermedades
pulmonares (enfisema, neumona y asma) recuden capacidad de eliminar CO2. Y genera
acidosis por acumulacin de H2CO3.