Modelao Ambiental

Trabalho Prtico
Ano lectivo de 2010 2011

Contexto do Trabalho
Este o terceiro trabalho de modelao ambiental efectuado pelos alunos
de Ambiente. um trabalho integrador de conhecimento, que dar ao aluno
a percepo da modelao ambiental como ferramenta para estudo de
processos e para anlise de cenrios de gesto.
O primeiro trabalho efectuado pelos alunos (disciplina de Mecnica dos
Fluidos Ambiental) consistiu na resoluo numrica da equao de difuso
numa geometria unidimensional, com e sem decaimento. Nesse trabalho os
alunos aprenderam a formular um problema que descreve uma evoluo no
espao e no tempo e a usar uma folha EXCEL como interface de entrada de
dados e de processamento de resultados de um programa em VBA feito por
eles prprios.
O segundo trabalho foi efectuado na disciplina de Transferncia de Energia e
Massa e teve como objectivo estudar um problema de transporte de calor
por adveco/difuso/radiao num canal aberto, com trocas de calor
sensvel e de calor latente atravs da superfcie livre. Neste trabalho os
alunos

aprenderam

resolver

termo

advectivo

obtiveram

conhecimentos bsicos sobre mtodos de discretizao temporal e espacial

e as respectivas propriedades numricas (difuso numrica, estabilidade,
transportividade, positividade dos coeficientes).
O programa utilizado nos trabalhos de MFA e de TEM foi desenvolvido pelos
prprios alunos. Nos trabalhos da disciplina de Modelao Ambiental os
alunos utilizaro o modelo MOHID www.mohid.com. Este modelo foi
desenvolvido no IST (MARETEC) no mbito de uma trintena de projectos de
investigao nacionais e internacionais e tem algumas centenas de
utilizadores em vrios pases. Ao utilizarem este modelo os alunos tm
acesso ao conhecimento includo no modelo e que lhes permitir
implementar a generalidade dos problemas de modelao descritos nas
aulas tericas. Os alunos podero tambm se o pretenderem - testar
eventuais alteraes nas formulaes adoptadas, visto o cdigo FORTRAN
ser aberto (http://mohid.codeplex.com).
O modelo inclui ferramentas de pr e de ps processamento que facilitam a
sua utilizao, reduzindo o tempo necessrio produo de resultados. As

ferramentas convencionais podem ser descarregadas do site do modelo.

Uma verso beta da ferramenta mais recente pode ser descarregada de
http://www.actionmodulers.com/mohidstudio.html.

Objectivos a atingir
O trabalho tem trs grandes objectivos:
1. Implementao do modelo num esturio e simulao da sua
hidrodinmica e do transporte da pluma de uma descarga pontual,
2. Utilizao do modelo para estudar processos biogeoqumicos num
reactor uniforme,
3. Utilizao do modelo do esturio para simulao de processos de
qualidade da gua estudados em (2), num caso real.
Estes objectivos so sequenciais. O primeiro efectivamente a aplicao
directa dos conhecimentos adquiridos durante o curso intensivo de
utilizao do modelo MOHID. O segundo d corpo aos conhecimentos
ministrados nas aulas tericas de modelao ecolgica e o terceiro leva
integrao de todo o conhecimento de modelao adquirido nas disciplinas
anteriores e em Modelao Ambiental.

Tarefas
A cada um dos objectivos descritos acima corresponde uma tarefa com
vrias aces, que sero desenvolvidas ao longo do semestre. A tabela
abaixo apresenta uma lista de esturios para os quais esto disponveis no
MARETEC dados bsicos de batimetria e de mar. A recolha daquele tipo de
dados pode ser morosa e no contribui para a formao pretendida na
disciplina, pelo que foi decidido que a disciplina propor aos alunos a
realizao de trabalhos em esturios para os quais existem dados recolhidos
em projectos anteriores.
Lista de esturios para os quais existem dados:

Minho,
Lima,
Ave,
Douro,
Mondego,
Tejo,
Sado,

Mira,
Arade,
Guadiana.

Estas batimetrias usam passos espaciais relativamente grosseiros de modo

a reduzir o tempo de clculo e a probabilidade de ocorrncia de
instabilidades (porque se reduz o n de Courant e de Difuso).
Para a Ria Formosa, Ria de Aveiro e Lagoa de bidos esto tambm
disponveis dados. A complexidade dos sistemas recomenda no entanto que
no sejam casos de estudo no mbito de uma disciplina.

Tarefa 1: Implementao do modelo num esturio.

Os alunos escolhero um esturio e implementaro o modelo para esse
esturio em condies de caudal mdio.
Actividade 1.1:
Implementao do modelo e simulao de 1 ms de mar. Clculo da
circulao residual no esturio.
Produtos: (a) Um conjunto de figuras com campos de velocidades de 2 em
duas horas num ciclo de mar, (b) dois mapas com distribuies de
velocidade residual e fluxo residual por unidade de profundidade, (c) uma
srie temporal de nveis e de velocidades num ponto do esturio.
Actividade 1.2:
Simulao da temperatura e salinidade no esturio.
O perodo de simulao dever ser de 3 meses no mnimo, de modo a que a
soluo se torne independente das condies iniciais. Preferencialmente
deveria ser simulado um ano, para ter a evoluo sazonal da meteorologia e
do caudal do rio. O foramento atmosfrico deve ser simplificado admitindo
velocidade do vento uniforme sobre todo o esturio e uma srie temporal de
temperatura e humidade atmosfricas com valores mensais.
Se o computador utilizado pelos alunos no permitir a simulao de um ano,
o tempo de simulao dever ser reduzido ao possvel.
Produtos: Distribuies espaciais em preia-mar e em baixa-mar em situao
de vero e de inverno (se for possvel simular as duas) e uma srie temporal
num ponto.

Actividade 1.3:
Clculo

da

disperso

da

pluma

de

uma

fonte

de

contaminao

microbiolgica usando uma formulao lagrangiana. Caudal da fonte 500 l/s

e concentrao 106 UFC/100ml. A descarga ser num local escolhido pelos
alunos (e.g. junto margem). Os alunos devero considerar um tempo de
decaimento da ordem de T90=2 horas, mas podero tambm considerar
T90 varivel de acordo com a radiao solar instantnea para ganharem
sensibilidade para este parmetro. O perodo de simulao dever ser da
ordem dos 2 dias. A mortalidade bacteriana varivel calculada no modelo
de acordo com Canteras et al (19951)
Produtos: Figuras com distribuies de concentraes a cada duas horas,
comparando as duas formulaes testadas.
Tarefa 2
Implementao

do

modelo

num

esturio

zero

(volume

com

propriedades uniformes2) para estudo de cenrio numa formulao NPZ

(Nutrients, Phytoplankton, Zooplankton). Esta geometria permite fazer
testes muito rpidos de cenrios e por isso indicada para que o aluno
ganhe sensibilidade a parmetros. A combinao de testes ilimitada e por
isso os testes a efectuar devem ser escolhidos criteriosamente. Sugerem-se
testes a (1) taxa de mineralizao da matria orgnica, (b) Constante de
semi-saturao na equao de evoluo do fitoplncton (c) taxa de
desnitrificao (d) taxa de crescimento do zooplncton.
Actividade 2.1: Taxa de mineralizao
Fazer uma simulao comeando com nutrientes minerais em abundncia e
concentraes residuais de fito e de zoo e (a) uma taxa de mineralizao
tpica e (b) uma taxa de mineralizao nula.
Os resultados do cenrio (b) vo originar a morte do sistema ao fim de
algum tempo. Este cenrio assemelha-se ao que ocorre no oceano onde os
produtores primrios crescem superfcie originando material particulado
1 Ver manuais do MOHID.
2 Este caso est nos manuais do curso. Basta instal-lo no vosso prprio
computador.

que desce na coluna de gua e mineralizado abaixo da zona ftica.

Enquanto os nutrientes gerados nessa regio no voltam zona ftica, no
h produo primria.
Produtos: duas sries temporais comparando a evoluo de fito e nitrato
num cenrio normal e no cenrio de ausncia de mineralizao. A
comparao mostra que o ecossistema s se mantm com consumidores de
matria orgnica (mineralizadores).
Actividade 2.2: Variao da constante de semi-saturao para a
produtividade primria
Esta constante determinada pela probabilidade de uma clula de fito
conseguir usar uma molcula de nutrientes minerais. Quanto menor for essa
probabilidade, maior a concentrao requerida para haver crescimento.
Produtos: Duas curvas comparando a evoluo de fito e de nitrato nos dois
cenrios
Actividade 2.3: Variao da taxa de desnitrificao
Comparao de dois cenrios, um com uma taxa de desnitrificao nula e
outro com uma taxa de desnitrificao elevada. Os resultados vo mostrar o
papel da desnitrificao no controlo da produo primria. Na realidade essa
taxa cresce medida que a disponibilidade de O2 na gua baixa. No caso
dos solos o O2 tem que descer pelos poros e por isso, em solos saturados de
gua no existe O2 disponvel. Nessas zonas a taxa de desnitrificao
elevada sendo esse um dos grandes benefcios da manuteno de zonas
hmidas em zonas ricas em nutrientes.
Produtos: Sries temporais comparando fito e nitrato nos dois cenrios.
Actividade 2.4: Variao da taxa de predao pelo zoo
Variar a taxa de predao pelo zoo vai afectar o stock de fito e as
concentraes mximas obtidas. Este cenrio permite inferir sobre as
actividades antropognicas sobre algumas espcies (e.g. sobre peixes no
caso da pesca, mas tambm sobre algas no caso concreto das espcies de
macroalgas com grande valor econmico que nalguns casos desapareceram
por aco combinada da apanha pelo Homem e do consumo por algumas
espcies de peixes.

Produtos: Duas sries temporais de fito e de zoo para duas taxas de

predao contrastantes.

Tarefa 3: simulao da qualidade da gua no esturio em

condies tpicas (se os alunos tiverem disponibilidade
de tempo)
Esta tarefa o corolrio das anteriores. Neste caso o aluno dever simular
dois anos de qualidade da gua no esturio, utilizando um conjunto de
parmetros tpico ou escolhido por ele com base nos resultados da Tarefa 2.
No caso de ter escolhido um passo espacial muito fino, que conduza a
tempos de computao excessivos, o aluno dever limitar o tempo de
simulao ao possvel.
Produtos: Distribuies sazonais de nitrato e de fitoplncton. E sries
temporais em 3 pontos do esturio (jusante, montante e zona intermdia).

Relatrios
O trabalho dever ser entregue em duas etapas, uma referente Tarefa 1
(hidrodinmica) e outra referente s outras duas. O texto de cada uma das
partes dos relatrios no dever exceder uma dezena de pginas.
O relatrio sobre hidrodinmica deve incluir:
(a) Uma pequena introduo sobre o funcionamento de esturios e as
equaes resolvidas pelo modelo, incluindo uma descrio sucinta do
clculo dos fluxos superfcie e da tenso de corte no fundo.
(b) Dados usados para especificar condies de fronteira: uma figura
com a batimetria, a lista das amplitudes das componentes de mar
simuladas,
informao

informao
sobre

sobre

os

foramento

caudais

dos

atmosfrico,

rios

utilizados,

difusividade

coeficiente de atrito.
(c) Informao sobre condies iniciais (especialmente de temperatura e
salinidade)
(d) Descrio dos resultados utilizando os produtos da tarefa descritos
acima.
O relatrio sobre a qualidade da gua deve incluir:

(a) Uma descrio dos processos biogeoqumicos em esturios, as

principais equaes do modelo e uma descrio sucinta dos factores
limitantes da produo primria.
(b) Descries dos casos de teste da Tarefa 2, utilizando os resultados
para falar dos factores limitantes e da sua parametrizao.
(c) No caso de ter executado a Tarefa 3, uma pequena descrio dos
resultados.

Prazos de execuo
O modelo hidrodinmico deve ser implementado at ao final de ms de Abril
e a primeira verso do relatrio deve ser entregue at ao final da 1 semana
de Maio.
Os casos de teste da qualidade da gua devem ser feitos em paralelo com a
implementao do modelo hidrodinmico, de acordo com a sequncia de
apresentao das matrias nas aulas tericas.
No final do semestre os alunos apresentaro a verso final do relatrio da
hidrodinmica e o relatrio da qualidade da gua, beneficiando das aulas de
discusso do ms de Maio.