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PROTENAS
Molculas universales
constituidas por CADENAS
DE AMINOCIDOS
Las protenas son las molculas biolgicas por excelencia, ya que son los
constituyentes caractersticos de las estructuras celulares, y son tambin
las especies que llevan a cabo la totalidad de las funciones celulares. Se
trata de molculas enormemente activas, verstiles, altamente funcionales,
cuya actividad es el fundamento del modo de vida celular. Las protenas
son agentes muy especializados que llevan a cabo en forma muy
especfica tareas celulares especialmente complejas, y que dan cuenta de
las actividades de los seres vivos
Todos los seres vivos estn constituidos por los mismos patrones
moleculares proteicos. Una clula cualquiera dispone de un amplio juego
de protenas, muchos millares, con los que lleva a cabo sus funciones y
construye sus propias estructuras.
H R O-H
| | |
H-N-C-C=O
|
H
Grupo amino
Grupo cido
Esquema de un aminocido
Grupo cido
Grupo amino
Radical
LA MOLCULA DE AGUA
La molcula de agua tiene dos tomos de hidrgeno y uno
de oxgeno. Su carga neta es cero, no obstante existe una
cierta polaridad entre los tomos de oxgeno y hidrgeno,
ya que los electrones estn ms cerca del oxgeno que del
hidrgeno, de esta forma el oxgeno tiene una cierta carga
negativa y el hidrgeno una cierta carga positiva, formando
un dipolo permanente.
Esta polaridad del enlace entre el oxgeno y el
hidrgeno permite que se formen enlaces por
puentes de hidrgeno entre distintas molculas de
agua. El hidrgeno al tener densidad de carga
positiva es atrado por el oxgeno de otra molcula
de agua que presenta densidad de carga negativa.
Enlace covalente
0099 nm
Tisosina (Tyr, Y)
Fenilalanina (Phe, F)
Leucina (Leu, L)
Lisina (Lys, K)
Aspartato (Asp, D)
Serina (Ser, S)
Grupo amino
Grupo carboxilo
EL ENLACE PEPTDICO
Enlace peptdico
Enlace peptdico
Enlace peptdico
Los aminocidos se van enlazando entre s formando cadenas de longitud y secuencia variable. La
incorporacin de un mayor nmero de nuevos aminocidos da lugar a una cadena de protena, que posee
decenas o centenas de aminocidos unidos en cadena. Las posibilidades de rotacin de los enlaces fi y psi
dan lugar a un elevadsimo nmero de conformaciones tridimensionales en el espacio.
Aunque muchas cadenas estn plegadas de forma aparentemente al azar, existen conformaciones ms
estables que otras. El plegado depende de varios factores, uno de los ms importantes es la secuencia de
una protena. La secuencia contiene toda la informacin necesaria para que la protena sea nica y tenga
siempre tanto la misma estructura y funcin.
reaccin. As, cada una de las miles de transformaciones qumicas del metabolismo est "catalizada" por
una enzima diferente. El resultado de la actividad de las enzimas celulares actuando coordinadamente es
un gran conjunto de transformaciones qumicas relacionadas entre s: Este fenmeno se conoce como
metabolismo celular, fundamento de las funciones vitales de una clula.
Unas protenas son diferentes de otras gracias a que cada una tiene una SECUENCIA de aminocidos
diferente. La secuencia es el orden de colocacin en fila de los aminocidos de una protena. Diferentes
secuencias de aminocidos tomados al azar seran por ejemplo:
...VPRSNSASEGGQLPGKKCTTYIARLRNSKPGVPLISPPPHHDIYS...
...EDLAQLIFDLHQVNPMAKSFLPIVGNTCLYGATGGRLFVRGKAGE...
...RFAVWRNSLAEAIVEGTGDHCCEYMTGEEKQSVSRTKFSRSIVEG...
...TGDHCCEYMTGGCVVVLGKVGRNVAAGMTGGLAYLIDEDDTLIPK...
Eso no quiere decir que cualquier secuencia de aminocidos da lugar a una protena "funcional". Al
contrario, la unin al azar de aminocidos en cadena generara con toda seguridad una protena sin
capacidad para ninguna actividad concreta. Las protenas de las clulas tienen secuencias muy
determinadas, y no cualquier secuencia, que conducen en cada caso a una estructura muy detallada,
necesaria para llevar a cabo una funcin muy elaborada. As pues, la secuencia de aminocidos de una
protena determina su funcin. La clave de esta dependencia se basa en que la secuencia de aminocidos
de una protena determina su estructura tridimensional o conformacin, y sta determina su funcin.
..WWSYTAGLRWNP
ACTIVIDAD
ENZIMATICA
..GHPRNWTSWYW
ANTICUERPO
..THPNWGLRWASW
TRANSPORTADOR
DE MEMBRANA
Los aminocidos son diferentes entre s por el comportamiento qumico de su radical, el grupo especfico de
cada aminocido. Algunos son ms o menos polares, (tienen cargas elctricas parciales o totales, positivas
o negativas) lo que facilita su interaccin entre ellos y con el agua que es tambin bastante polar, mientras
que otros son apolares y por tanto se repelen respecto del agua. Como muchos de los enlaces de la cadena
de protena son autnticos ejes de giro, la protena tiene muchsimas posibilidades conformacionales, es
decir disposiciones tridimensionales en el espacio. Sin embargo, los radicales de los aminocidos,
dispuestos en una determinada secuencia, establecen una compleja serie de restricciones, multitud de
interacciones de repulsin o de atraccin entre los radicales y el agua circundante, y entre los radicales
entre s. Como resultado de todo ello finalmente son posibles un nmero muy pequeo de conformaciones,
y especialmente slo una de ellas es la ms favorable o estable: La estructura tridimensional directamente
responsable de la actividad especfica de esa protena.
Pero en qu forma la estructura de una protena determina su funcin, su tipo de actividad? Esa pregunta
necesita responderse para cada protena conocida. Se puede entender a las protenas de alguna manera
como las piezas de la maquinaria celular, en la que "encajan" de forma altamente especializada gracias a su
fina estructura, en una forma que recordara a como lo hacen las partes de una mquina. La secuencia de
una protena determina su estructura hasta el punto de que ligeras alteraciones de esa secuencia pueden
producir "deformaciones" en la conformacin final de la protena, que dejara de cumplir su funcin parcial o
totalmente. Por ejemplo, las enzimas poseen "sitios" en los que se "acoplan" exacta y especficamente otras
molculas. En cierto modo las funciones de las protenas (y por tanto de las clulas) se hallan "grabadas" en
mensajes informatizados (las secuencias de sus aminocidos). Estos mensajes (las secuencias) se hallan
en realidad almacenados en otra parte, en molculas de DNA.
-Ala-Ser-Ile-Gln-Trp-Cys-Ser-His-Trp-Glu-Met-Asp-Phe-Ser-Phe-Cys
ESTA SECUENCIA DETERMINA UNA DOBLE CAVIDAD
DONDE ENCAJAN DOS MOLCULAS ESPECFICAS
Gln-Cys-Ile-Phe-His-Asp-Ser-Ala-Trp-Glu-Phe-Cys-Ser-Met-Trp-Ser-
Lmina beta
Modelo tridimensional de la
enzima Nitrato reductasa