Aspectos bsicos en el manejo de OriginPro

Edgar JC, Dic 2014

OriginPro 9
Aspectos bsicos y anlisis de datos

Contenido
I.

ACERCA DE ORIGINLAB .......................................................................................................................... 2

II. GRAFICAS Y FORMATOS ......................................................................................................................... 3

1. Proyecto y carpetas............................................................................................................................... 3
2. Importar y graficar datos ....................................................................................................................... 3
3. Formato de grfica ................................................................................................................................ 3
4. Introducir 2 o ms curvas....................................................................................................................... 4
5. Traslado de curvas................................................................................................................................. 5
6. Combinacin de varias grficas. ............................................................................................................. 5
7. Exportacin de grficas.......................................................................................................................... 5
8. Escala Exponencial ................................................................................................................................ 5
9. Editar rango .......................................................................................................................................... 5
III. INSET, DOBLE ESCALA, GRFICA DE BARRAS ............................................................................................ 7
1. Inset..................................................................................................................................................... 7
2. Doble Escala.......................................................................................................................................... 7
3. Grfica de barras................................................................................................................................... 7
IV. NORMALIZACIN................................................................................................................................... 8
1. Normalizacin de datos. ........................................................................................................................ 8
2. Normalizacin de curvas ........................................................................................................................ 8
V. LNEA BASE Y ENCONTRAR PICOS ........................................................................................................... 9
1. Sustraer Lnea Base ............................................................................................................................... 9
2. Encontrar Picos. .................................................................................................................................... 9
VI. SUAVIZADO DE CURVAS ....................................................................................................................... 10
1. Suavizado de curvas ............................................................................................................................ 10
VII. INTEGRACIN Y DERIVACIN ............................................................................................................... 11
1. Integracin de picos. .......................................................................................................................... 11
2. Derivacin .......................................................................................................................................... 11
VIII. DECONVOLUCIN............................................................................................................................ 12

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I. ACERCA DE ORIGINLAB
Origin es un programa cientfico interactivo para grficos y anlisis de datos desarrollado por OriginLab
(corre en Windows).
Cuenta con una interfaz con multi-sheet workbooks soportan hasta 90 millones de filas y 65,527
columnas.
Los proyectos (Origin Project Files .OPJ) se pueden organizar en carpetas jerrquicas a travs de
Project Explorer.
Soporta grficas en 2D y 3D, grficas contour (isolnea), grficas polares, diagramas ternarios y de
Piper, etc. (http://www.originlab.com/www/products/graphgallery.aspx)
Puede realizar anlisis estadsticos, procesamiento de seales, ajuste de curvas y anlisis de picos.
Puede importar archivos de datos como ASCII, Excel, NI TDM, DIADem, NetCDF, SPC, etc.
Exporta grficos en varios formatos como JPEG, GIF, EPS, TIFF, etc.
Incluye dos lenguajes de programacin: Origin-C (basado en lenguaje compilado C), y LabTalk.
Origin es un COM Server y permite una comunicacin con aplicaciones como: MS Excel, MS Visual
Basic, MATLAB, LabVIEW.
Informacin sobre caractersticas, tutoriales/videos, etc.,
OriginLab: http://www.originlab.com/
Wikipedia: http://en.wikipedia.org/wiki/Origin_(software)
Software alternativo Mac/Windows: KaleidaGraph, Igor Pro, SigmaPlot, MatLab.
Comparacin: http://www.originlab.com/index.aspx?go=Products/Origin&pid=929
La versin sobre la cual se trabajar es la 9, Octubre 2012.
La versin ms actual Origin 2015 (9.2), Octubre 2014.

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II. GRAFICAS Y FORMATOS

1. PROYECTO Y CARPETAS

2. IMPORTAR Y GRAFICAR DATOS

2.1. Abrir un nuevo workbook.
2.2. Men: File>Import>Single ASCII.
2.3. Importar Uno.
2.4. Doble clic col:
Formato Workbook
A
B
Long Name
Nmero de onda - \g(w)
Transmitancia
Units
cm\+(-1)
u.a.
Comments
Espectro FTIR de Carbono uno
Uno
Diagonal invertida \ para caracteres especiales. Sintaxis \x(text)
Cdigo
Funcin
g
Letras griegas
+
Superndice
Subndice
b
Negritas
i
Itlicas
u
Subrayar
2.5. Seleccionar las columnas A(X) y B(Y).
2.6. Graficar tipo Line Graph: Plot>Line>Line.
-Nota: Puedes cambiar el nombre de cada grfica o libro con clic derecho Properties
3. FORMATO DE GRFICA
(Tipos de Mens: Clic derecho en la zona de la grfica, doble cli c.)
3.1. Para dar formato a los ejes, dar doble clic sobre los nmeros de cualquiera de los 2 ejes para desplegar
el siguiente cuadro de dilogo.

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3.2. Seleccionar en Scale, eje Horizontal de 4000-400, eje Vertical de 0.5-1.025.

Puede introducirse un break en la grfica cuando existe una regin sin inters que no desea mostrarse.
3.3.
3.4.
3.5.
3.6.
3.7.

Doble clic en algn eje y seleccionar la pestaa break.

Activar show break.
From: 3000, To 2000.
La seccin de corte o break puede moverse manualmente con el mouse.
Tambin pueden modificarse las graduaciones antes y despus del break.

4. INTRODUCIR 2 O MS CURVAS
4.1. Importar los datos de la segunda grfica.
4.2. Seleccionar el cuadro de la grfica con una clic (no la curva).
4.3. Dar clic derecho y seleccionar Plot Setup
4.4. Desplegar mediante las flechas azules todos los cuadros de la ventana.
4.5. Seleccionar en la parte superior el workbook, en el segundo cuadro indicar las columnas X y Y y
aadir la grfica (Add). Ok.
4.6. Para dar formato:
i. Dar clic derecho sobre la grfica deseleccionada y escoger Update Legend.
ii. Seleccionar modo Update y Short name. Ok.
iii. Doble clic sobre la grfica y desplegar Layer.
iv. Seleccionar cada curva y dar el formato de color y tipo de lnea en la ventana derecha.

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5. TRASLADO DE CURVAS .
5.1. Men: Analysis>Data Manipulation>Vertical Translate.
5.2. Mover la lnea base a la posicin deseada.
5.3. Para mover la otra curva, dar clic derecho sobre la misma y seleccionar Set as Active y seguir los
puntos 5.1-2.
6. COMBINACIN DE VARIAS GRFICAS .
6.1. Men: Graph>Merge Graph Windows.
6.2. En la ventana Merge escoger opcin para la seleccin de grficas.
6.3. Escoger las opciones de formato deseadas.
7. EXPORTACIN DE GRFICAS .
Origin permite exportar grficas en varios formatos adems de ajustar las propiedades de exportacin. Uno de
los formatos ms comunes que conserva buenas propiedades de calidad y poco peso es TIFF o TIF (Tagged
Image File Format). Tambin es posible exportar las grficas en PowerPoint, o copiarlas en Word.
7.1. Men: File>Export Graphs.
Image Type: *.tif.
Export: Specified. Seleccionar grfica 4.
Path: Seleccionar ubicacin de destino.
-Image Settings:
DPI = 300.
Color Space: CMYK.
Compression: LZW (Lempel-Ziv-Welch), sistema de compresin sin prdida de calidad.
-Nota: Puede omitirse la compresin de la imagen. El formato y propiedades de salida dependern de
los requerimientos solicitados, ya que en el caso de revistas, cada una tiene condiciones especficas.
7.2. PorwerPoint: Clic derecho sobre la carpeta Graficar, seleccionar Send Graphs to PowerPoint.
7.3. Seleccionar la opcin de insercin de grfica:
Picture: Cada grfica se inserta como una imagen.
Embedded object: Las grficas guardan su relacin de datos con Origin.
7.4. Word: Clic derecho sobre la pgina de la grfica y seleccionar Copy Page.
7.5. Pegar en Word.
Al dar doble clic sobre la grfica pegada en Word, se abre una ventana de Origin.
Entrar a Plot Details Plot Properties (doble clic sobre la grfica), y hacer clic sobre Workbook
para ver la tabla de datos.
8. ESCALA EXPONENCIAL
8.1. Importar y graficar Cinco.
8.2. Doble clic eje X. Seleccionar en Display>Scientific: 10^3.
8.3. Doble clic eje X. Cuadro Divide by Factor: 1000000.
9. EDITAR RANGO
9.1. Graficar Uno.
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9.2. Clic Herramienta Reader

y ubicar puntos en la grfica (1580, 1060, aprox.). (Puedes usar la
herramienta zoom in).
9.3. Clic izq. Sobre la grfica>clic derecho>Edit Range.
9.4. Des-seleccionar los cuadros Auto e introducir nmeros de rango deseado (1060-1580).
9.5. Clic derecho eje X>Rescale.
10. COPIAR FORMATO.
Es posible copiar el formato de una grfica o la grfica completa para homogeneizar la manera de presentar los
resultados:
10.1. (Estando seleccionada una grfica) Men: Window>Duplicate. Esta herramienta duplica por completo
el archivo seleccionado, para usarse como plantilla.
10.2. Clic derecho sobre una grfica,
Copy Format>All.
Crear nueva grfica, New Graph .
Clic derecho sobre la nueva grfica, Paste Fromat.
11. IMPORTAR ARCHIVOS DE EXCEL.

11.1. En nuevo Workbook: Men>File>Import>Excel. Importar el archive Excel.

File Info>Excel.xls>File Sheet, seleccionar raw data.
Column Headers>Index of Rows for Long Name: 7.
Index Row for Unit: 6.
Index of Rows for Comments From: 1 To 5.

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III. INSET, DOBLE ESCALA, GRFICA DE BARRAS

1. INSET
1.1. Crear nuevo Folder Inset, doble escala, barras.
1.2. Men: File>Import>Multiple ASCII.
1.3. Carpeta 02 Inset importar archivos.
1.4. Graficar Inset.
1.5. Men: Graph>New Layer(Axes)>Inset With Data.
1.6. Escala en X: 150-180.
2. DOBLE ESCALA
2.1. Graficar Doble Escala:AvsB
2.2. Men: Graph>New Layer(Axes)>Righ-Y
2.3. Plot Setup>Inset>X=cola Y=colB, agregar a RightY, seleccionar Rescale.
2.4. Men: Graph>New Layer(Axes)>Inset (Linked Dimension).
2.5. Plot Setup Inset.
2.6. Agregar a Inset AvsC.
3. GRFICA DE BARRAS
3.1. Graficar Barras 01. Seleccionar las 4 columnas.
3.2. Men: Plot>Column/Bar/Pie>Column.
3.3. Escala en X, seleccionar Major Ticks From Database>Barras!ATiempo. Apply.
3.4. Graficar Barras 02, Pasos 3.1-3.3.
3.5. Plot Details Plot Properties (doble clicl).
3.6. Desplegar Layer 1. Clic Primera grupo de barras>Spacing>Gap:60%.
Nota: Es posible arreglar manualmente el espacio entre barras e introducir un cuadro de texto para
nombrar los grupos.

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IV. NORMALIZACIN
En algunos casos se requiere de la normalizacin de los datos de las curvas ya que las alturas o intensidades
de las mismas no son cuantitativas, como es el caso del tiempo de adquisici n en espectroscopa Raman.
Existen dos formas de normalizacin: a partir de los datos en la hoja de trabajo o a partir de una grfica.
1. NORMALIZACIN DE DATOS.
3. Crear un nuevo Folder Normalizacin.
4. Abrir un nuevo workbook.
5. Men: File>Import>Multiple ASCII.
6. Aadir archivos. Ok.
7. Libro Uno, seleccionar la columna Y y dar clic derecho Normalize
(Analysis>Mathematics>Normalize Columns)
Recalculate: None.
Normalize Methods: [0,1] (valor ms bajo en cero y ms alto en uno).
Output: <new>.
8. Graficar X vs Normalize.
2. NORMALIZACIN DE CURVAS
2.1. Grafica las 3 curvas en una sola grfica.
2.2. Men: Analysis>Mathematics>Normalize Curves.
Recalculate: None.
Input: [Graph5]1!(1"Uno",2"Tres",3"Dos").
Normalize Methods: [0,1] (valor ms bajo en cero y ms alto en uno).
Output: (<input>,<new>). Ok.
Desactivar las curvas sin normalizar.
Modificar la escala en Y [0,2].
Mover curvas.
Origin tiene 5 opciones para el anlisis de picos:

Integrar Picos.
Crear lnea base.
Sustraer lnea base.
Encontrar picos.
Ajuste de picos (pro).

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V. LNEA BASE Y ENCONTRAR PICOS

En Origin es posible crear o sustraer una lnea base de una curva.
1. SUSTRAER LNEA BASE
1.1. Importar y graficar libro Uno.
1.2. Men: Analysis>Peaks and Baseline>Peak Analyzer.
1.3. En Goal seleccionar Subtract Baseline. Next
Baseline Mode: Existen diversas opciones dependiendo del tipo de datos y lnea base a realizar.
Seleccionar User Defined. Next.
Create Baseline: Pueden modificarse los puntos que aparecen por default en la curva o agregar ms
puntos.
-Nota: Es recomendable ampliar la grfica antes de agregar o modificar los puntos. Esto puede hacerse
en View>Zoom In/Out.
Subtract Baseline: Al seleccionar Subtract permite ver de manera previa la curva con la sustraccin
de la lnea base.
-Nota: Es posible regresarse y modificar los parmetros seleccionados. En la opcin Goal>Create
Baseline nicamente se crear la misma lnea base pero no se har la sustraccin de la misma.
2. ENCONTRAR PICOS .
2.1. Importar y graficar libro Dos.
2.2. Men: Analysis>Peaks and Baseline>Peak Analyzer.
2.3. En Goal seleccionar Find Peaks.
Baseline Mode.
-En caso de haber hecho el tratamiento de Subtract Baseline puede seleccionarse Constant y la
posicin ms adecuada de la lnea.
-En caso contrario, pueden seguirse los pasos para la creacin de la lnea base en el modo User
Defined como se describi en el apartado anterior. Next
Baseline Treatment: Puede seleccionarse o no la opcin de Subtract Now. Next
Find Peaks:
Enable Auto Find: Deseleccionar la casilla para modificar los picos encontrados. En esta seccin
pueden encontrarse automticamente los picos (Find), manualmente (Add), modificar o eliminarlos
(Modify/Del) o eliminar todos (Clear All).
-Peak Findind Settings: En Direction seleccionar la orientacin de los picos. Positive en este caso.
-Method: Este va a depender del tipo de seal que se analice. Local Maximum en este caso.
Clic en Find. Clic en Modify/Del y eliminar los picos no deseados. Finish
-Nota: Repetir el procedimiento con el archivo Tres (FTIR) usando los parmetros adecuados.

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VI. SUAVIZADO DE CURVAS

1. SUAVIZADO DE CURVAS
1.1. Importar y graficar libro Uno.
1.2. Men: Analysis>Signal Processing> Smooth.
Recalculate: La opcin de recalculado permite ajustar la grfica de manera automtica, manual o no
hacerlo, despus de modificar los datos de origen. Sin embargo, cuando estn seleccionados las
opciones Manual y Auto, Origin no permite hacer algunas modificaciones.
Method: Savitzky-Golay. Es un mtodo muy empleado que preserva la forma de los picos, haciendo
una regresin polinomial local alrededor de cada punto, creando un nuevo valor suavizado para cada
punto.
Point of Window: Estos nos permiten aumentar el grado de suavizado incrementando el nmero de
puntos utilizados para la regresin. 20 para este caso.
Polinomial Order: Es el orden polinomial de regresin. 2 para este caso.
Auto Preview: Permite una vista previa del lado derecho como una curva roja suavizada.
-Nota: Es importante estudiar el tipo de suavizado ms adecuado para cada tipo de seal analizada. En
Men:Help>Origin, en la barra de bsqueda escribir Smoothing para ms informacin.

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VII. INTEGRACIN Y DERIVACIN

1. INTEGRACIN DE PICOS .
1.1. Importar y graficar el libro Uno.
1.2. Men: Analysis>Peaks and Baseline>Peak Analyzer.
1.3. Goal > Integrate. Next.
Baseline Mode: Realizar los mismos pasos que en la secci n ENCONTRAR PICOS . Next.
Baseline Treatment: Puede seleccionarse o no la opcin de Subtract Now. Next
Find Peaks: Realizar los mismos pasos que en la seccin ENCONTRAR PICOS . Next.
Integrate Peaks:
-Integration Window Width: Adjust on Preview Graph.
-Sobre la grfica dar clic en las secciones amarillas y mover los rombos verdes para ajustar l os lmites.
Finish.
1.4. En el libro Uno en la pestaa Integration_Results1 se encuentran los siguientes valores.
Area: Como valor numrico.
AreaIntP(%): Valor porcentual del rea.
Posiciones de inicio y final en X.
FWHM: Full Width at Half Maximum, Ancho a la altura media.
Centre: Centro.
Height: Altura.
2. DERIVACIN
2.1. Importar y graficar libro Dos
2.2. Men: Analysis>Mathematics>Differentiate.
Recalculate: Seleccionar opcin deseada.
Derivative order: Primera derivada muestra los mximos y mnimos como cruces por cero, y los
puntos de inflexin como mximos o mnimos locales. La segunda derivada muestra los puntos de
inflexin como cruces por cero.
Smooth: Puede activarse el mtodo S-G para suavizar la curva de la derivada.
Plot Derivative Curve: Activar.
-Nota: en caso de desear graficar la curva junto con su derivada, es conveniente hacer una normalizacin
de ambas.

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VIII. DECONVOLUCIN
1.
2.
3.
4.

Importar y graficar libro XPS Narrow en el rango en X de 280-295.

Para este caso en particular, es conveniente trasladar la curva de modo que la parte inicial de la curva
est situada sobre el eje X.
Men: Analysis>Peaks and Baseline>Peak Analyzer.
Goal > Fit Peaks (Pro). Next.
Baseline Mode: La lnea base debe ser tratada previamente como se describi en casos anteriores.
Para este caso en particular se manejar una lnea tipo XPS. Next.
XPS Baseline: Shirley.
Baseline Treatment: No hacer subtract Next.
Find Peaks: Hacer el mismo tratamiento que en casos anteriores.
-Dado que algunos de los picos a encontrar pueden verse como hombros, en Peak Finding
Settings>Method puede ser til amplear 2nd Derivative.
-De forma alterna, deseleccionando el cuadro de Enable Auto Find puede usarse la opcin Add y
colocar 4 picos en las siguientes posiciones: 284.5, 285.9, 287.6 y 288.9.
Fit Peaks: En la grfica, la lnea roja muestra la sumatoria y ajuste de los picos deconvolucionados.
-Clic en Modify/Del. En esta opcin puede moverse la posicin de los picos. Co mo primer paso,
todos los picos se movern nicamente en sus alturas, disminuyendo las mismas de modo que la
curva roja no sobrepase la curva negra.
-Como segundo paso se mover la posicin de las curvas hacia los siguientes valores respectivos:
284.54, 286.24, 287.72, 289.07. De ser necesario pueden ajustarse las alturas nuevamente
observando que la curva roja ajuste lo ms posible a la curva original. Done.
-Clic en Fit Control: En la siguiente ventana se muestra un cuadro superior con los datos del ajuste
Gausiano de cada curva, y en la ventana inferior los datos de ajuste como nmero de iteracin y la
R2 de la regresin. Los botones para el proceso iterativo de ajuste son los siguientes:

Fijar lnea base, centro y ancho respectivamente, en el proceso de iteracin. El smbolo verde
indica que el valor est fijo, de modo que no se modificar en el proceso de ajuste.
El segundo y tercer corresponden a 1 iteracin y ajuste hasta converger respectivamente. El
primer botn reinicia los parmetros originales.
-Sin fijar la posicin y el ancho, dar clic 2 veces sobre el botn de 1 iteracin. Se observa que la
R2=0.998, mientras que en la grfica la curva roja se ajusta a la negra. Este ajuste es adecuado. Ok.
(Pueden reiniciarse los parmetros y dar clic sobre el botn de convergencia; la R 2 =0.9991 en 72 iteraciones,
sin embargo, es preferente requerir de pocas iteraciones adems de que en la grfica, las curvas individuales
pueden deformarse de manera inadecuada.)

-El ajuste puede realizarse fijando la posicin o el ancho de los picos en caso de que alguno de estos
valores no deba ser modificado.
-Clic en Finish. En caso de que se salga una ventana de dilogo preguntando por la generacin de
un reporte, escoger Yes.
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5.

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En el workbook se encuentran la informacin del proceso de deconvolucin llevado a cabo. Tambin se

genera un grfico como reporte con los picos y los datos ms importantes del proceso realizado.

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IX. OTROS
1. BARRAS DE ERROR - SIMPLE ROW STATISTICS
1.1. Start with an empty worksheet, select File: Import: Single ASCII... to open the Import Single ASCII
dialog, browse to the \Samples\Curve Fitting subfolder of the Origin program folder, and import the file
Dose Response - No Inhibitor.dat.
1.2. Highlight columns 2 through 4 and select Statistics: Descriptive Statistics: Statistics on Rows. Make sure
to check the Mean and Standard Deviation check boxes on Quantities to Compute > Moments branch
to output these results.
1.3. After you click the OK button, two new columns, Mean(Y) and SD(yErr) are added to the source
worksheet. Here, yErr means that this is an error column and the data in this column can be used to
plot error bars.
1.4. Highlight the Mean(Y) and SD(yEr-) columns and select Plot: Line+Symbol: Line+Symbol to create the
plot.
1.5. To change the X scale to Log, double-click on the X axis to bring up the X Axis dialog. On the Scale tab,
change the axis Type to Log10.
1.6. Select Graph: Rescale to Show All from the menu, which will rescale the X and Y axes of the graph.
1.7. To edit the curve, double-click on any plot symbol to bring up the Plot Details dialog. Alternatively,
right-click inside the graph and choose Plot Details from the context menu. On the Line tab of right
panel, select B-Spline as connect line to get a smoother curve.

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