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Generalidades
1
Qu es?
La Qumica Bioinorgnica es una rama de la
qumica que estudia la funcin de los iones
metlicos y sus compuestos en sistemas
vivos.
Qumica de Qumica
Bioinorgnica Bioqumica
Coordinacin
2
Qu estudia?
El ambiente de coordinacin en
metaloprotenas, cidos nuclicos,
carbohidratos.
5
Tcnicas utilizadas|
Resonancia Magntica Nuclear
Resonancia Paramagntica Electrnica
Dicrosmo Circular
Espectroscopa de Rayos X
Espectroscopa electrnica
Espectroscopa vibracional
Espectroscopa de Mssbauer
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Principios generales
Los organismos vivos almacenan y transportan metales
de transicin, con el objeto de proveer las concentraciones
adecuadas de ellos para usarse en las metaloprotenas o
cofactores y para protegerse de los efectos txicos de los
excesos de metales.
1. Muy txicos
a. Metales esenciales
b. Metales no esenciales
8
Na, K : iones libres
Zn: CO2 HCO3-..
La dosis determina la toxicidad Factores de
transcripcin
Elementos esenciales Cu: y Fe:
C, H, N, O, P, S Transporte O2
Cl, I, Na, K, Mg, Ca Redox
Mo: Activacin de
Fe, Zn, Mn, Co, Cu, Mo
N2
Co: Vitamina B12
Benficos
B, V, Cr, Ni, Sn, Si, Se, Br, F, W, Sr W: ciclo del C
Ni, V, Cr : vestigiales
Txicos Pb: Saturnismo
Hg, Cd, Tl, Pb, Sb
Hg: Hidragismo
Farmacuticos Au: Artritis
Bi: lceras
Li, Ag, Pt, Tc, Au, Bi
Pt: Antitumorales
Tc: Imagenologa
Abundantes Li: Bipolaridad
Poco comunes
Raros
9
10
Tabla Peridica de los
Bioelementos
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Los Metales y su Papel Natural en la
Naturaleza
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Metales menos abundantes
manganeso
vanadio
cobalto
nquel
molibdeno
Casos raros
cromo
selenio
tungsteno
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Qumica bioinorgnica
El papel no-natural de los elementos
en la medicina
1. Prevencin de enfermedades
2. Diagnstico de enfermedades
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Qumica bioinorgnica
El papel no-natural de los elementos
en la medicina
6. Enfermedades por ingestin excesiva de metales
naturales
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Funciones de los Metales
Transporte : electrones, dioxgeno, metales
Chaperones
16
Metales en Biologa
Estructurales (Ca; Zn; dedos de Zn)
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cidos y bases duros y blandos
La serie de Irving-Williams (1953) mostr
que para un ligante dado la estabilidad de los
complejos de iones metlicos dipositivos
aumenta de acuerdo a:
Ba2+ < Sr2+ < Ca2+ < Mg2+ < Mn2+ < Fe2+ <
Co2+ < Ni2+ < Cu2+ < Zn2+
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cidos y bases duros y blandos
20
cidos y bases duros y blandos
Los cationes metlicos Tipo A incluyen:
Cationes alcalinos: Li+ to Cs+
Cationes alcalinotrreos: Be2+ to Ba2+
Cationes metlicos de transicin ms ligeros
en altos estados de oxidacin: Ti4+, Cr3+, Fe3+,
Co3+ , H+
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cidos y bases duros y blandos
Tendencia a formar Tendencia a formar
complejos con metales complejos con metales
Tipo A Tipo B
N >> P > As > Sb > Bi N << P > As > Sb > Bi
O >> S > Se > Te O << S ~ Se ~ Te
F >> Cl > Br > I F < Cl < Br << I
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cidos y bases duros y blandos
cidos duros : pequeos, iones altamente cargados (+)
baja polarizabilidad, pocos e, ejemplos. Fe3+ Co3+ Cr3+
Bases duras: pequeas, alta de los tomos donadores,
baja polarizabilidad, ejemplos: donadores F, N- and O-
cidos blandos: grandes, menos iones (+), alta
polarizabilidad, ms e, ejemplo: Pt2+ Ag+ Au+
Bases Blandas: grandes, tomos donadores de menor ,
alta polarizabilidad, ejemplo: I, C- P- and S- donors
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cidos y bases duros y blandos
Anlisis de gran importancia, ya que los metales se
encuentran en la naturaleza como minerales de S:
PbS, CdS, NiS, etc., otros como carbonatos: MgCO3
and CaCO3 y otros como xidos: Fe2O3 and TiO2.
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Artculos de la teora de cidos y bases duros y blandos:
28
Qu tienen de especial los metales?
1. Preferencias por una geometra
29
Qu tienen de especial los metales?
5. Patrones de reactividad
a) Propiedades redox
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Otras funciones de los iones
metlicos
Efectos dainos como un metal txico, o como parte de
un frmaco. Ejemplos:
- Compuestos tiolados de oro que se emplean para
tratamiento de artritis
- Sales de bismuto en el tratamiento de lceras
- Compuestos amnicos de platino como frmacos
antitumorales
- Tcnicas radiofarmacuticas de imageneologa con
compuestos de coordinacin de tecnecio
- Anticuerpos marcados con metales
31
Algunas otras aplicaciones de
compuestos inorgnicos en el cuidado
de la salud
Perborato de sodio como antisptico
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Algunas otras aplicaciones de
compuestos inorgnicos en el cuidado
de la salud
Sales de gadolinio como agentes para imgenes en
(Alzheimer)??
antimicrobianos (shampoo)
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Metaloproteinas y metaloenzimas
Proteinas: Transporte, almacenaje (metales, electrones)
mioglobina, azurina, citocromos, ferritina
Enzimas: Reacciones catalizadas
P-450, ascorbato oxidasa, catalasa
Co-enzima: Agente que activa una enzima
Apo-enzima: Enzima sin un metal (generalmente
inactiva)
Pro-enzima: Enzima inactiva, carece de activador
Sinzima: Producto biomimtico que se asemeja a la
enzima (estructura, actividad)
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Definiciones y descripciones:
(bio-)Catalizador: un compuesto (o sistema) que
permite que una reaccin especfica se lleve a cabo
repetida, selectiva y eficientemente.
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Subdivisin de la Qumica
Bioinorgnica
Estudio detallado del ambiente de coordinacin en
metaloprotenas, cidos nuclicos, carbohidratos
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Subdivisin de la Qumica
Bioinorgnica
Frmacos que contienen metales para prevenir o curar
enfermedades (sntesis de nuevos compuestos,
mecanismo de accin)
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Definiciones y descripciones:
Catlisis:
Proceso en el cual una reaccin especfica se lleva a cabo
para cierto(s) compuesto(s) (grupo de), seleccionado(s)
selectivamente, de acuerdo a un mecanismo en el que se
emplea un sitio nico. Este sitio se puede utilizar
repetitivamente.
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Papel del ion metlico en catlisis
a) Como un cido de Lewis (aceptor)
b) Como una base (donador)
c) Como una fuente redox
Las acciones son:
Estabilizacin de un intermediario reactivo
Activacin de un sustrato inerte
Efecto de templado para unir a los reactivos en la
geometra ptima
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Para un trabajo difcil la
naturaleza usa iones metlicos!
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Reacciones importantes en
biologa con molculas pequeas
1. Fotosntesis H2O O2
2. Citocromo oxidasa O2 H2O
3. Nitrogenasa N2 2 NH3
4. Superxido dismutasa 2 O2 - H2O2 + O2
5. Catalasa 2 H2O2 2 H2O + O2
6. Metano monooxigenasa CH4 CH3OH
Todas estas enzimas usan iones metlicos y a
menudo ms de uno!
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Reacciones biocatalticas rpidas y
especficas
Catalasa (hemo que contiene Fe)
H2O2 O2 + H2O [2x106/s]
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Superxido Dismutasa (contiene Cu)
O 2 - H2O2 + O2 [2x109/sec]
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Comentarios por elemento de
transicin
V: raro; Cr: muy raro; Mn: comn;
Fe: muy comn, el ms abundante
Co: raro; Ni: raro;
Cu: muy comn
Zn: muy comn; NO redox
Mo: comn; W: raro
Se: no muy comn
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Cu, S y Mo en vacas: antagonismo
Mo-Cu
La ingesta:
Sulfato
S-amino cidos
minerales de Mo
y iones Cu
Formacin de [MoOxS4-x]2-
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Algunas observaciones del
antagonismo del molibdeno
46
Papel de un ion metlico en la
organizacin estructural
47
Papel de un ion metlico en la
organizacin estructural
48
Dedos de Zinc
49
Transporte y almacenaje de iones
metlicos por biomacromolculas
50
Una interaccin supramolecular no es:
Covalente
inica (como en la red del NaCl)
de coordinacin como tal (an cuando no sea covalente)
Quelatacin como en M(edta)
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El papel de las formas de los complejos (metal)
Ejemplos:
Enlace de dedos de zinc a cidos nuclicos
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Principio de enlace multifuncional
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Ligantes presentes en Biologa
Los metales pueden coordinarse a una variedad de
biomolculas:
1) proteinas, y en particular a sus cadenas laterales
(tomos N,O,S);
2) cidos nuclicos, tanto a los fosfatos como a la base a
travs de los tomos donadores de N;
3) carbohidratos, lpidos (C=O; P=O);
4) slidos (huesos, dientes, depsitos tales como clculos
renales, magnetita).
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Ligantes en sistemas biolgicos
grupos laterales de proteinas, como imidazol, tiolato,
carboxilatos; en algunos casos ocurre la desprotonacin
cuando se enlaza a un ion metlico, an a pH=7;
grupos prostticos, como tetrapirroles y co-factores,
como FAD (a menudo estos co-factores estn unidos
covalentemente a la protena, y forman parte del biopolmero);
iones pequeos, tales como OH-, O2-, S22-, OOH-, CO32- y
Molculas pequeas (como O2, H2O);
bases de los cidos nuclicos como guanina y adenina
fosfatos y grupos diol en los cidos nuclicos
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Histidina Metionina
Glutamina Serina
Cistena Ac.
Asprtico
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Macrociclos
Porfirina
Corrina
57
Clorofila y vitamina B12
58
59
60
Aminocidos
N O
O
N O
O
N
N N N
N
[Asn]
[Ala] [Arg]
O
O O O
O
O O
O N
S
O N N N
N
[Glu]
[Asp] [Cys]
[Gln]
O
O O
O
N
N
N N N
[Gly]
N
[His] [Leu]
[Ile]
61
Aminocidos
O
O
N O O
S
N
N
N N
[Pro]
[Lys]
[Met] [Phe]
O
O O O O
O N
N N N N
O
[Trp]
[Ser] [Tyr]
[Thr]
N
[Val]
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Reactividad y reacciones de
intercambio de ligantes
Cintica versus Termodinmica
La cintica y la termodinmica estn determinadas por:
a) Ion metlico (propiedad intrnseca)
b) Ligante (fuerza, covalencia, tamao)
c) (macro-) efecto quelato
d) Asistencia del disolvente
Discriminaciones mecansticas (asociativo, disociativo,
intercambio).
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Reacciones de intercambio de ligantes
La cintica est determinada por el ion metlico
(clase, carga)
La velocidad determinada por los ligantes
(quelatos)
Diferencia de aproximadamente 15 rdenes de magnitud
Uso en la sntesis de ciertos ismeros
Cintica vs termodinmica
mecanismos: D, A o I!
El efecto trans
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Mecanismos de intercambio de ligantes
Se detecta un intermediario? Si no, entonces: Se trata de
un mecanismo I (intercambio)
Si? Mayor o menor nmero de coordinacin?
Disociativo:
MLn ML(n-1) (+ L') ML'L(n-1)
Asociativo:
MLn +L' ML'Ln (- L) ML'L(n-1)
Intercambio:
MLn +L' ML'L(n-1) + L
(como una reaccin SN2, no se detecta intermediario)
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67
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Reacciones importantes
Fotosntesis H2O O2
Citocromo oxidasa O2 H2O
Nitrogenasa N2 2 NH3
Superxido dismutasa 2 O2 - H2O2 +
O2
Catalasa 2 H2O2 2 H2O + O2
Metano monooxigenasa CH4 CH3OH
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El ciclo del dioxgeno y las
metaloenzimas
Respiracin: O2 + 4H+ + 4 e- 2 H2O
(con Cyt oxidasa: Fe, Cu, Zn, Mg)
Ruptura de agua: 2 H2O O2 + 4H+ + 4 e-
(con PS-II: Mn, Ca)
Oxidaciones con Fe, Cu, Mn, etc.
Fotosntesis
Duysens L, Amesz J and Kamp B, Nature 190, 510-511 (1961).
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Oxidacin del agua a dioxgeno
molecular
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Hierro y enlace reversible de
dioxgeno
a) Mioglobina b) Hemoglobina c) Hemeritrina
Mioglobina: Almacenamiento de dioxgeno
* Cadena peptdica con 153 aminocidos; Fe coordinado por
His + porfirina; 6to ligante: dioxgeno
* Fe(II) en estado de reposo: se mueve dentro y fuera del
plano de la porfirina
* El dioxgeno se une como ion superxido(1-)
Hemoglobina: Transporte; cooperativa; 4 subunidades
Hemeritrina: Transporte; cooperativa; 8 subunidades;
no hemo!
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Algunas protenas famosas
Protena Funcin
Mioglobina Almacenamiento de O2
Hemoglobina Transporte de O2
Transferrina Transporte de Fe
Ferritina Almacenamiento de Fe
Citocromo c Transporte de electrones
Citocromo c oxidasa Transformacin de O2 a H2O
Citocromo P-450 Activacin e incorporacin de O2
Protenas Fe-S Transporte de electrones
Ribonucletido Reductasa Transferencia de ARN a ADN
Catalasa Metabolismo de H2O2
Peroxidasa Metabolismo de H2O2
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Estructura de las protenas
Estructura Primaria : Es el esqueleto covalente de la
cadena polipeptdica, y establece la secuencia de
aminocidos.
Rige el orden de encadenamiento por medio del enlace
polipeptdico.
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Estructura de las protenas
Estructura Terciaria : Forma en la cual la cadena
polipeptdica se curva o se pliega para formar estructuras
estrechamente plegadas y compactas como la de las
protenas globulares.
Rige el arreglo tridimensional en el cual participan las
atracciones intermoleculares. (Fuerzas de Van der Walls,
Puentes de Hidrgeno, Puentes disulfuro, etc)
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Enlace de dioxgeno al
hierro-hemo
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Clasificacin de las enzimas en seis
grupos principales
Oxidorreductasas (catalizan las reacciones de oxido-
reduccin);
deshidrogenasas (todo el dioxgeno o perxido de
hidrgeno usado se convierte en agua),
oxigenasas (uno de los oxgenos se introduce en el
sustrato) y
dioxigenasas (se incluyen dos oxgenos en el sustrato);
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Clasificacin de las enzimas en seis
grupos principales
Hidrolasas (ruptura hidroltica de enlaces C-O or C-N);
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Biomimtica
Diseo y sntesis
Estructura y caracterizacin
Pruebas y aplicaciones
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Biomimtica
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Por qu el inters en biomimtica?
1. Mejor entendimiento
a) especulativo (estructura de la protena desconocida)
b) corroborativa (cuando se conoce la estructura de la
proteina)
2. Aplicaciones
a) Transporte de metales (in vivo; agua de desecho)
b) Catlisis de metales
Metodologa:
1. Diseo y sntesis
2. Estructura y caracterizacin
3. Pruebas y aplicaciones
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