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Enzimas
Introduccin a Catlisis
Un catalizador es una sustancia que afecta la velocidad de una reaccin, permaneciendo sin cambio alguno al
final del proceso. Generalmente, el catalizador modifica la velocidad promoviendo una ruta molecular distinta
para la reaccin, es decir, con el uso del catalizador la reaccin ocurre a travs de otro mecanismo.
Sabemos que para que una reaccin tenga lugar se deben romper algunos enlaces qumicos en los reactantes
permitiendo la formacin de productos. La mnima energa requerida para iniciar una reaccin qumica es la
energa de activacin Ea.
Reacciones enzimticas
Reversibilidad de las reacciones enzimticas
Las reacciones catalizadas por enzimas son reversibles:
E + S ES E + P
Durante el transcurso de la reaccin la enzima debe unirse al sustrato para lograr su accin cataltica. Se unen
para formar un complejo activado, el cual luego se disociar en enzima y producto. Al final de la reaccin, la
enzima se separa del producto permaneciendo inalterada. Generalmente la reaccin inversa es catalizada por la
misma enzima. La unin de la enzima al sustrato tiene lugar por interacciones inicas, puentes de Hidrgeno o
fuerzas de van der Waals.
La irreversibilidad de una reaccin significa que existe un equilibrio desfavorable, es decir, que uno de los
componentes de la reaccin reversible desaparece, ya sea por ser voltil o por formar una sustancia ms estable
como lo es un complejo. El grado de reversibilidad depende del cambio de energa libre de la reaccin, y es
independiente de las propiedades catalticas de la enzima.
La escisin de molculas orgnicas de estructuras complejas por la actividad enzimtica viene acompaada con
liberacin de energa. Comparando sobre una base molecular, las enzimas son mucho ms efectivas que otros
catalizadores, ya que el aumento en la velocidad de reaccin que provocan es mucho mayor.
El concepto general ms importante es entonces que la molcula de enzima forma un complejo inestable con
una o ms molculas de sustrato, el complejo se rompe en distintos fragmentos, uno de los cuales es el enzima
libre y el otro es el producto.
Sitio activo
El sustrato se une o se fija en un lugar definido de la molcula de la enzima. Esta regin de la enzima se llama
comnmente sitio activo, centro activo o sitio cataltico, responsable de la accin cataltica.
El sustrato posee un sitio de unin y sitio cataltico. Para que esta unin y la accin catalizadora tengan lugar,
es indispensable una conformacin tridimensional altamente especfica a nivel del sitio activo, con la presencia
de grupos funcionales definidos, aportados por las cadenas laterales de restos aminoacdicos.
Tipos de enzimas
Endoenzimas y exoenzimas
Aquellas enzimas que se encuentran ligadas al protoplasma celular son llamadas endoenzimas, y actan en la
reaccin de descomposicin de mono y disacridos. Por otro lado, encontramos enzimas que son secretadas al
medio exterior de la clula, llamadas exoenzimas, que actan en la asimilacin de macromolculas como
polisacridos y protenas.
2) Tambin puede denominarse por el tipo de reaccin que catalizan. Por ejemplo:
Dehidrogenasas: sustraccin de H+.
Descarboxilasas: eliminacin de grupos carboxlicos (-COOH) del sustrato.
Figura n4: Distribucin de todas las enzimas conocidas de acuerdo al nmero de su clase principal (1 oxidorreductasas, 2
transferasas, 3 hidrolasas, 4 liasas, 5 isomerasas, 6 ligasas).
1. Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de xido reduccin. La mayora de estas enzimas son generalmente deshidrogenasas,
aunque tambin hay reductasas, oxidasas y peroxidasas entre otras.
Un ejemplo de una oxidorreductasa es la lactato dehidrogenasa. Esta enzima cataliza la oxidacin reversible del
L-lactato a piruvato, reaccin acoplada a la reduccin de la coenzima NAD+ (nicotinamida adenina
dinucletido).
Figura n5: Conversin reversible de L-lactato a piruvato por accin de la enzima lactato deshidrogenasa
Para este ejemplo, el nombre sistemtico de la enzima es L-lactato: NAD xidorreductasa. El nombre comn o
trivial recomendado es lactato-dehidrogenasa, su nmero de cdigo1.1.1.27:
2. Transferasas
Catalizan transferencias de un grupo de tomos desde un sustrato a otro. Por ejemplo, las aminotransferasas y
las acetiltransfereasas catalizan el paso del grupo amino y acetilo respectivamente. A continuacin vemos la
transferencia de un grupo amino de la alanina para la formacin de piruvato y L-glutamato, catalizada por la
alanina transaminasa:
Figura n6: Transferencia de un grupo amino de la alanina para formar piruvato y L-glutamato por accin de la enzima alanina
transaminasa
El nombre sistemtico de esta enzima es L-alanina:2-oxiglutarato aminotransferasa, el nombre trivial
recomendado es alanina transaminasa, y su nmero de cdigo 2.6.1.2.
3. Hidrolasas
Catalizan la hidrlisis del sustrato. Son un grupo especial de transferasas donde el agua participa como aceptor
del grupo transferido. Pertenecen a este grupo acetilcolinoestereasa y la ribonucleasa, que hidrolizan la unin
ster entre acetato y la colina de la acetilcolina y las uniones entre nucletidos en el ARN respectivamente. Un
ejemplo sencillo de hidrolasa es la pirofosfatasa, que cataliza la conversin de un pirofosfato a dos grupos
fosfatos:
Figura n7: Conversin de pirofosfatos a grupos fosfato por accin cataltica de la enzima pirofosfatasa
Su nombre sistemtico es difosfato fosfohidrolasa, su nombre trivial pirofosfatasa, y su nmero de cdigo
3.6.1.1
4. Liasas
Catalizan la ruptura de molculas de sustrato por mtodos distintos que la hidrlisis, al generar un doble enlace.
Son reacciones de eliminacin, no hidrolticas y no oxidantes.
fructosa-bifosfato
aldolasa
Figura n8: Conversin de la fructosa-1,6-bifosfato en dos triosas fosfato por catlisis de una aldolasa
El nombre sistemtico de la enzima es fructosa-1,6-bifosfato:D-gliceraldedo-3-fosfato liasa, el nombre trivial
recomendado fructosa-bifosfato aldolasa, y su nmero de cdigo 4.1.2.13.
5. Isomerasas
Catalizan cambios estructurales dentro de la misma molcula, catalizan la interconversin de ismeros tanto
pticos, como geomtricos y de posicin. Como estas reacciones slo tienen un reactivo y un producto, son del
tipo de reaccin enzimtica ms simple.
Por ejemplo encontramos a la fosfoglucosa isomerasa que realiza la interconversin de glucosa-6-fosfato y
fructuosa-6-fosfato a fosfotriosa isomerasa. Otro ejemplo comn es la alanina racemasa que cataliza la
interconversin de L-alanina y D-alanina.
Figura n9: Interconversin de L-alanina y D-alanina por accin cataltica de la alanina racemasa
Su nombre sistemtico es en este caso igual a su nombre trivial, alanina racemasa, y su nmero de cdigo es
5.1.1.1.
6. Ligasas
Catalizan la unin de dos sustratos para formar un tercer compuesto ms complejo. En estas reacciones la
energa necesaria es provista por la hidrlisis de ATP. Por ejemplo, la glutamina sintetasa cataliza la unin de
cido glutmico y amonaco para la obtencin de glutamina:
Se puede acceder al nomenclador de enzimas de la IUBMB siguiendo este link, ingresando nmero de cdigo o
nombre de la enzima (en ingls), y obtener la reaccin que cataliza, nombres aceptados, nombre comn y otras
referencias: http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/
a) Concentracin de enzima
Si imaginamos una reaccin enzimtica simple en la cual un sustrato se convierte en producto por accin de
una enzima que cataliza la reaccin, la actividad enzimtica ser mayor cuanto mayor sea la cantidad de
enzima presente en el medio de reaccin. En una muestra, si queremos determinar la concentracin de enzima,
se utiliza un saturacin de sustrato, es decir que para cada enzima hay disponible sustrato con el cual formar el
complejo ES, y se mantienen constantes temperatura y pH. Las condiciones son medir la velocidad inicial, y no
consumir ms del 5% del sustrato.
La ecuacin de Michaelis-Menten
Las reacciones catalizadas por enzimas pueden describirse en forma matemtica como ecuaciones de
velocidad. Estas reacciones exhiben cintica de saturacin, ya que a bajas concentraciones de sustratos, la
velocidad de la reaccin es proporcional a la concentracin de sustrato y luego, la reaccin es de primer orden
con respecto al sustrato. A medida que la concentracin de sustrato aumenta, la velocidad de la reaccin ya no
es proporcional a la concentracin de sustrato, sino que la reaccin es de orden mixto. A concentraciones an
ms altas la velocidad de la reaccin es constante e independiente de la concentracin de sustrato, la reaccin
es de orden cero y la velocidad es mxima.
Estos factores llevaron a Michaelis y Menten a proponer una teora general de cinticas enzimticas. Esta teora
se basa en tres suposiciones:
1) que la concentracin de enzima es mucho ms baja que la concentracin de sustrato, de modo que el cambio
en la concentracin de sustrato durante la reaccin es insignificante.
2) que la concentracin de producto es cero, lo cual significa que la cantidad de P formado durante el perodo
de medicin de la velocidad es poco significativo y demasiado pequeo para que ocurra la reaccin inversa.
3) que la liberacin de S a partir del complejo ES es mucho ms rpida que la liberacin de los productos y, en
consecuencia, que E y S pueden considerarse en equilibrio.
Deduccin de la ecuacin de Michaelis- Menten
Agrupamos de un lado de la igualdad los trminos [A] y del otro los trminos con [E]:
k1 [E] [S] + k4 [E] [P] = k2 [A] + k3 [A]
[ A] k [ S ] k 4 [ P] k1[ S ] k [ P]
1 4 (2)
[E] k 2 k3 k 2 k3 k 2 k3
La velocidad mxima es proporcional a [Et]: Vmx k3 [ Et ] . La velocidad mxima es una constante para
cada enzima.
La velocidad real v es proporcional a [A]: v k3 [ A] .
Haciendo el cociente entre Vmx y v:
Vmx [ Et ] Km Km [ S ]
1
v [ A] [ S ] [S ]
Si despejamos v, obtenemos la ecuacin de Michaelis-Menten que describe el comportamiento hiperblico
observado en la curva:
Vmx[ S ]
v
Km [ S ]
Km es la concentracin de sustrato para la cual la velocidad de reaccin alcanza un valor igual a la mitad de la
velocidad mxima, en condiciones definidas del medio de pH, temperatura. Km tiene un valor fijo para cada
enzima y cada sustrato, y permite caracterizarla.
Cuando la concentracin de sustrato est por debajo de Km la velocidad de reaccin depende de la
concentracin de sustrato. Cuando [S] es muy superior al valor de Km la curva es de orden cero.
Si consideramos luego, [S] = Km y lo reemplazamos en la ecuacin de Michaelis-Menten se demuestra que
cuando la concentracin de sustrato [S] = Km, la velocidad de la reaccin es igual a la mitad de la Vmx:
Vmx[ S ] Vmx[ S ] Vmx[ S ] Vmx
v
Km [ S ] [ S ] [ S ] 2[ S ] 2
Significado de Km
En la mayora de las enzimas el valor de Km guarda una relacin inversa a la afinidad de la enzima por el
sustrato. A mayor afinidad de la enzima por un sustrato, menor es su valor de Km.
Cuando una enzima acta sobre varios sustratos Km es diferente para cada uno de ellos. El sustrato con Km
menor es considerado el sustrato natural o fisiolgico de la enzima.
Representacin de Lineweaver-Burk
Es la representacin usada con ms frecuencia, la ecuacin de Michaelis-Menten se transforma en las inversas
recprocas obtenindose una lnea recta.
1 Km [ S ] Km [S ]
v Vmx[ S ] Vmx[ S ] Vmx[ S ]
1 Km 1 1
v Vmx [ S ] Vmx
Se obtuvo una recta del tipo y=ax+b. Vemos que una grfica de 1/v contra 1/[S] produce una recta con
pendiente Km/Vmx, ordenada al origen 1/Vmx y abscisa al origen 1/Km.
Km
Pendiente =
Vmx
1
Ordenada al origen =
Vmx
1
Abscisa al origen =
Km
Representacin de Eadie-Hofstee
Aunque es menos utilizada que la de Lineweaver-Burk, esta representacin de los datos cinticos se obtiene
multiplicando ambos miembros de la ecuacin de Lineweaver-Burk por Vmx y reordenando:
v
v Km Vmx
[S ]
c) Efecto de la temperatura
Conforme aumenta la temperatura tambin lo hace la velocidad de la reaccin enzimtica, pero slo hasta
alcanzar un mximo a partir del cual la actividad enzimtica disminuye aunque la temperatura siga en aumento.
Esto se debe a la naturaleza proteica de las enzimas, por la cual con el aumento de temperatura la enzima puede
desplegarse y/o desnaturalizarse perdiendo su actividad cataltica.
Existe una temperatura ptima que es aquella para la cual la velocidad de la reaccin es mxima, y que se
encuentra en un intervalo de unos pocos grados centgrados. Si se supera esa temperatura la velocidad
comienza a disminuir, hasta que cesa la reaccin entre 70 y 100 C, zona de desnaturalizacin irreversible de
las protenas.
La mxima actividad de una enzima est muchas veces disimulada por ciertos factores concurrentes, que
impiden la determinacin de esta temperatura ptima. Los de mayor influencia son el grado de pureza de
enzima y sustrato y la presencia de activadores o inhibidores.
d) pH
A semejanza de lo que ocurre con la temperatura el concepto de pH ptimo tienen un valor poco real, pues un
conjunto de variables lo afectan: temperatura, tipo de solucin buffer presente, concentracin de sustrato,
presencia o no de activadores, tipo de sustrato.
La relacin de la actividad enzimtica con respecto al pH est expresada en la mayora de los casos, por una
curva en forma de campana como indica la figura siguiente para distintas enzimas.
e) Inhibidores enzimticos
Los inhibidores son especies que interactan con las enzimas de forma tal que stas resultan ineficaces para
catalizar una reaccin, son agentes qumicos que inhiben su accin cataltica.
Inhibicin irreversible
Son inhibidores irreversibles aquellas sustancias que se unen covalentemente a la enzima produciendo un
cambio permanente en ella, dando lugar a un deterioro definitivo de su actividad cataltica.
Por ejemplo, venenos organofosforados muy utilizados como insecticidas producen la inhibicin irreversible de
la Acetilcolinesterasa, enzima muy importante para el funcionamiento del sistema nervioso.
Inhibicin reversible
Los inhibidores reversibles pueden ser de tres tipos: competitivos, no competitivos y anticompetitivos. El
mecanismo de accin de un inhibidor puede ser estudiado experimentalmente realizando determinaciones de
actividad enzimtica a varias concentraciones de sustrato en ausencia y en presencia de una concentracin fija
de inhibidor.
Inhibidores competitivos
En este tipo de inhibicin, el inhibidor slo puede unirse a molculas de enzima libre que no estn unidas a
sustrato alguno. Cuando este inhibidor se une a la enzima ya ninguna molcula de sustrato podr unirse a ella.
Por lo tanto, vemos que inhibidor I y sustrato S compiten por unirse a la enzima.
Inhibidores no competitivos
Son compuestos que se unen a la enzima en un lugar distinto al sitio activo y producen una disminucin de
Vmx sin modificar Km, ya que el sustrato puede unirse igualmente a la enzima.
El inhibidor se une con la enzima libre o con el complejo ES. Una vez formado IES, la enzima se inactiva.
El valor de Km no se modifica pues el sustrato reacciona con la enzima lo mismo que en ausencia del
inhibidor. Pero la cantidad de ES con posibilidad de liberar producto se reduce y el resultado final es semejante
al que se obtendra con menos enzima en el medio, la Vmx disminuye.
Vemos a continuacin las expresiones de la cintica para la inhibicin no competitiva, donde K I es la constante
de inhibicin:
Vmx[ S ]
v
Km [S ]1 [ I ]
KI
Y reordenando se obtiene la expresin linealizada:
1 1 Km [ I ] 1 [I ]
1 1
v [ S ] Vmx K I Vmx K I
Pertenecen a esta categora ciertos reactivos que se unen reversiblemente a grupos sulfidrilos (-SH) de restos
de cistenas indispensables para la actividad de algunas enzimas. Ciertos iones metlicos como el Cu, Hg, Ag,
inhiben enzimas combinndose con grupos (-SH). La unin del in metlico provocara cambios
conformacionales que inactivan a la enzima.
Otros inhibidores se unen a metales de la molcula de enzima y produce inhibicin. Este es el mecanismo de
accin del CN- que al unirse al Fe de la citocromoxidasa, catalasa y peroxidasa, bloquea su actividad.
Otro ejemplo son el ion CN- y el CO que se combinan con el Fe de la citocromoxidasa y de la hemoglobina,
respectivamente.
El tetraacetato de etilendiamina EDTA es un agente quelante que se une en forma reversible a cationes
bivalentes e inhibe a enzimas que requieren esos iones para su actividad.
El in arseniato puede sustituir al PO32-, bloqueando su actividad.
Inhibidores acompetitivos
El inhibidor y el sustrato se fijan a diferentes sitios de la enzima, pero la unin de uno de ellos impide la del
otro, probablemente porque induce cambios conformacionales en la enzima. El inhibidor se une al complejo ES
para dar el complejo IES incapaz de transformarse en productos.
1 1 Km 1 [I ]
1
v [ S ] Vmx Vmx K I
a) Origen microbiano
Provenientes generalmente de bacterias y hongos. Entre ellas destacamos las enzimas del siguiente cuadro,
donde se indica el microorganismo del cual se obtienen.
Las clulas microbianas son la fue ms empleada, ya que ofrecen mayor variedad debido a que puede inducirse
variaciones genticas. Esto permite obtener enzimas con mayor cantidad de parmetros deseables y una gran
velocidad de reproduccin.
De las clulas microbianas se obtienen endoenzimas producidas dentro del protoplasma celular, que catalizan
reacciones de sntesis, y exoenzimas son secretadas al medio exterior y participan en reacciones de hidrlisis o
degradacin.
b) Vegetal
Como ejemplos podemos nombrar las -amilasa que se obtiene del grano de la cebada,la peroxidasa de la raz
del rbano. La papana proveniente del ltex del rbol de papaya se utiliza para ablandar carnes y en la
clarificacin de la cerveza, y la ureasa que se obtiene de la soja.
c) Animal
Enzimas provenientes del bazo, hgado, pncreas o alguna seccin del tracto intestinal de bovinos o porcinos.
Por ejemplo la -amilasa, lipasa, pepsina y renina (para la manufactura de quesos) entre otras.
Las plantas y los rganos animales como fuentes de obtencin son muchos ms caros que las clulas
microbianas, por los largos perodos de crecimiento y la mayor dificultad para aislar las enzimas.
Vemos que para varias enzimas existen fuentes de obtencin microbiana, vegetal y tambin animal. Por
ejemplo:
Amilasas
Fuente microbiana: levadura de pan
Vegetal: malta de cebada
Animal: varios
Lipasas
Degradan grasas por hidrlisis, se usan en las industrias de curtiembres, la industria alimenticia.
Ureasa
Urea + agua 2 NH3 + CO2
2) Aislamiento y purificacin
1- Obtencin del extracto bruto de la enzima (polvo de pncreas, levadura desecada).
2- Purificacin
a) Dilisis a travs de membranas semipermeables (derivado celulsico, colgeno).
b) Ultrafiltracin: bajo presin a travs de membranas.
3- Precipitacin fraccionada en fro con un disolvente orgnico (acetona, etanol, isopropanol) o SO4(NH4)2.
4- Concentracin
a) al vaco
b) refrigeracin
c) smosis inversa
5- Desecado
a) al vaco
b) rodillo
c) atomizacin
Inmovilizacin de enzimas
Cualquier proceso biotecnolgico si usa organismos completos, extractos o enzimas purificadas debe competir
con la fermentacin o con la sntesis qumica.
Las enzimas a menudo son lbiles y no son fcilmente reutilizables, de modo que el concepto de enzimas
inmovilizadas en cuanto a los catalizadores reusables estabilizados tiene un gran atractivo en la intensificacin
del proceso, y por lo tanto afecta la economa de ste. La misma idea tambin se aplica a clulas completas.
Inmovilizar una enzima significa circunscribir su accin en un espacio definido y limitado en lugar de estar
dispersa (soluble) en todo el sustrato. La enzima as inmovilizada es ms estable que en solucin, fcilmente
recuperable al final de la reaccin y permite su re-uso. De esta manera se abren nuevas perspectivas para su
uso, especialmente para aplicaciones industriales puesto que representa una reduccin apreciable de costos.
En la siguiente figura se esquematiza el uso de las enzimas o clulas inmovilizadas para realizar ciertas
reacciones.
Para el estudio de la cintica de las enzimas as inmovilizadas se hacen consideraciones similares a la cintica
de la catlisis heterogneas, analizando en cada caso, segn la enzima est unida a una superficie porosa o no
porosa.
En caso de que la enzima sea soluble, el nico tipo de reactor posible es el tanque agitado en proceso batch
(catlisis homognea).
Estando la enzima insolubilizada (catlisis heterognea), permite el uso de reactores diversos: tanque agitado
en proceso continuo o semicontinuo, columna rellena, reactor tubular en capa delgada y reactor de lecho fluido.
4) Desarrollo de los dispositivos apropiados para llevar a cabo los procesos tcnicos.
5) Comprobacin de ventajas: tcnicas o econmicas, frente a un proceso qumico.