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Caracterizacin de rizobacterias nativas nemato-

patgenas de Vitis vinifera L. mediante metagenmica


dirigida al gen ADNr 16S

Br. Savina A. Gutirrez Calle.

Las plantas al igual que el hombre son afectadas por microorganismos


patgenos que alteran su desarrollo; modificando caractersticas agronmicas
de inters econmico, etc. Sin embargo, existen microorganismos asociados
que tienen un papel importante, como: mejorar la calidad del suelo; promover
el crecimiento, productividad y el bienestar de la planta (Gilbert, et. al. 2014),
denominada microbiota benfica. Las asociaciones planta-microorganismos
viene siendo estudiada a partir de 3 dcadas atrs, siendo de gran inters la
bsqueda de agentes de biocontrol a stress bitico y microorganismos que
ayuden a tolerar o enfrentar el stress abitico.

La microbiota es una comunidad presente en la semilla, races, tallo, hojas,


flores y frutos. Esta comunidad vara segn el ambiente en el que se desarrolla
el tejido. Los microorganismos benficos que se encuentran asociados a las
races, pertenecen a la rizsfera; debido a ello los microorganismos de mayor
abundancia son las bacterias, muchas de ellas pertenecen al gnero Pasteuria,
Pseudomonas and Bacillus (Meyer, 2003), los cuales han demostrado la
cualidad de ser controladores biolgicos a nematodos (Tian, et. al. 07). Las
bacterias nemato- patgenas pueden actuar de manera: parsita, daos
mediante toxinas, o enzimas; interfiriendo en el reconocimiento nematodo-
planta hospedera, evitando la competencia por nutrientes, permitiendo la
activacin de mecanismos de resistencia y evitando la susceptibilidad a estos
patgenos (Siddiqui & Mahmood, 1999).

Una de las plagas fitopatgenas de importancia en el pas es Meloidogyne


incognita, endoparsitos obligados que se incorporan en la raz formando
ndulos los cuales impiden la absorcin de nutrientes , provocando menor
desarrollo de las plantas , clorosis, provocando baja productividad. Este
parasito obligado es la principal plaga de Vitis vinfera L. Una de las formas
comerciales para controlar a este nematodo es mediante qumicos siendo las
pequeas trazas de estos compuestos perjudiciales al hombre y al ambiente; el
cual conllev a buscar microorganismos presentes en la rizsfera para el
control de este patgeno.

Las tcnicas actuales permiten desarrollar la caracterizacin molecular de todo


un pool de microorganismos denominado Metagenmica, el cual se basa en la
secuenciacin de una cantidad indeterminada de DNA, que no haya sido
aislado previamente (en el caso de bacterias u hongos); pudiendo identificar
grupos de microorganismos presentes en un microbioma. Trabajos realizados
en V. vinifera, indican que la microbiota relacionada a una determinada rea
geogrfica es propia, haciendo que las experiencias reportadas en la
identificacin de los microorganismos perteneciente a la rizsfera del mismo
cultivo, solo sea referencial (Bokulich, et. al. 2013).

En Chile han desarrollado investigaciones para encontrar microrganismos


propios de la rizosfera, de los viedos, antagonistas al nematodo Xiphinema
index , que es considerado el nematodo ms agresivo que afecta a Vitis
vinifera, seguido de Meilodogyne ethiopica. En diferentes trabajos realizados
por Aballay, et. al. (2011); Aballay, et. al. (2012), revelan que asociaciones de
Bacillus megaterium, B. brevis, Pseudomonas corrugata, P. savastanoi,
Stenotrophomonas maltophilia y Serratia plymuthica reducen daos en plantas
provenientes de cultivo in vitro enfrentadas atacada por X. index.

REFERENCIA BIBLIOGRAFICA

Aballay, E., Mrtensson, A. & Persson, P. 2011. Screening of rhizosphere


bacteria from grapevine for their suppressive effect on Xiphinema index Thorne
& Allen on in vitro grape plants. Plant and Soil 347, 313-325.

Aballay, E., Prodan, S., Mrtensson, A. & Persson, P. 2012. Assessment of


rhizobacteria from grapevine for their suppressive effect on the parasitic
nematode Xiphinema index. Crop Protection (in press).

Gilbert,J.; b,1, Lelie, D.; Zarraonaindia, I. 2014. Microbial terroir for wine grapes.
PNAS, vol. 111-1

Meyer, S. 2003. United States Department of Agriculture Agricultural Research


Service research programs on microbes for management of plant-parasitic
nematodes. Pest Manag Sci 59: 665670

Nicholas A. Bokulich, M.; Thorngate, J.; Richardson, P.; Mills, D. 2013. Microbial
biogeography of wine grapes is conditioned by cultivar, vintage, and climate.
PNAS, E139E148

Siddiqui, Z.; Mahmood, I. 1999. Role of bacteria in the management of plant


parasitic nematodes: a review. Bioresource Technol 69: 167179.

Tian, B.; Yang, J.; Zhang, K. 2007. Bacteria used in the biological control of
plant-parasitic nematodes: populations, mechanisms of action, and future
prospects. FEMS Microbiol Ecol 61: 197213
MICROBIOLOGY SEE

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