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Pg.
Bioelementos y Biomolculas 6
Bioelementos 6
Clasificacin de los bioelementos 7
Biomolculas 8
Los compuestos orgnicos y los seres vivos 8
El agua 9
Propiedades Fsicas 10
Estructura 10
Solubilidad 12
Ionizacin y valor de pH del agua 14
Soluciones amortiguadoras (Buffers) 20
cidos poliprticos 21
Ejercicios para calcular el pH en soluciones acuosas 23
Carbohidratos = Glcidos= Hidratos de carbono = Azcares 28
Funciones 30
Provisin y almacenamiento de energa 30
Estructurales y de soporte 31
Reconocimiento celular 31
Detoxificacin 31
Clasificacin 32
Monosacridos simples 32
Isomera de los monosacridos 33
Estereoismeros: enantimeros y diastermeros 33
Anmeros 37
Ismeros conformacionales 40
Monosacridos de mayor importancia biolgica 41
Monosacridos modificados 42
Alditoles 42
Derivados cidos de azcares 43
Derivados fosfatados 43
Desoxiazcares 44
Aminoazcares 44
Glucsidos o glicsidos 45
Oligosacridos 46
Disacridos 47
Otros oligosacridos 48
Polisacridos 49
Polisacridos simples 49
Polisacridos derivados 49
Polisacridos de reserva 49
Almidn 49
Glucgeno o glicgeno 51
Polisacridos estructurales 51
Celulosa 51
Quitina 52
Glucosaminoglicanos 53
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Lpidos 55
cidos grasos 55
Propiedades de los cidos grasos 58
Lpidos complejos o lpidos saponificables 58
Acilglicridos o Acilgliceroles 58
Reaccin de saponificacin 60
Fosfolpidos 60
Esfingolpidos 61
Ceras 63
Lpidos simples 63
Terpenos y terpenoides 65
Esteroides 66
Eicosanoides 67
Aminocidos y Protenas 70
Clasificacin de aminocidos 70
Comportamiento cido-base de los aminocidos libres en solucin 72
El enlace peptdico 75
Breve semblanza de la biosntesis y Catabolismo de aminocidos 76
Aminocidos: Las unidades bsicas para la construccin de las protenas 79
Estructura primaria. Secuencia de aminocidos 79
Estructura secundaria. Interacciones a entre aminocidos situados a corta 81
distancia
Conformacin al azar 81
Conformacin -hlice 81
Hojas o lminas plegadas- 82
Giros (bucles) 83
Estructuras Supersecundarias 84
Estructura terciaria. Interacciones entre aminocidos situados a larga distancia 85
Estructura cuaternaria. Varias subunidades proteicas (oligmeros) 86
Estructura Quinaria. Asociaciones supramoleculares 87
Propiedades de las protenas 87
Especificidad 87
Desnaturalizacin 87
Solubilidad 87
Capacidad amortiguadora 87
Clasificacin de las protenas 88
Enzimas y Cintica Enzimtica 89
Propiedades de las enzimas 89
Estructura de las enzimas 90
Clasificacin y nomenclatura de las enzimas 92
Catlisis molecular 94
Rutas bioqumicas 96
Mecanismo Cataltico 97
Catlisis cido-base 97
Catlisis covalente 99
Zimgenos o Proenzimas 100
cidos Nucleicos 101
Estructura y Funcin 101
La estructura del DNA 103
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La mitocondria 145
Ciclo de Krebs 146
Reaccin 1. Condensacin del oxalacetato con la Acetil-CoA 148
Reaccin 2. La isomerizacin del citrato a isocitrato 149
Reaccin 3: oxidacin y descarboxilacin del isocitrato 149
Reaccin 4. Oxidacin de a-Cetoglutarato a Succinil-CoA y CO2. 149
Reaccin 5.Oxidacin de Succinil-CoA a Succinato 150
Reaccin 6. Oxidacin de Succinato a Fumarato 150
Reaccin 7. Hidratacin de Fumarato a Malato 151
Reaccin 8. Oxidacin (deshidrogenacin) del malato para formar oxalacetato 152
Transporte de electrones y fosforilacin oxidativa 152
Fosforilacin oxidativa 158
Ciclo de Cori 160
Fotosntesis. Fijacin autotrfica del CO2 161
Qu es la fotosntesis? 161
Estructura de la hoja 162
Fase Luminosa 163
Naturaleza de la luz 163
Clorofila y pigmentos accesorios 164
Los electrones excitados pueden presentar fluorescencia 165
La estructura de la clorofila explica sus funciones 165
La clorofila no es el nico pigmento fotosinttico 166
Organizacin de los Pigmentos fotosintticos 167
Fase oscura o reacciones del carbono en la fotosntesis 171
Regulacin del ciclo de Calvin 175
Sntesis y transporte de carbohidratos 178
Fotorrespiracin y el ciclo fotosinttico C2 de oxidacin del carbono 180
Otras Vas de Fijacin del CO2 182
Ruta de Hatch-Slack o Metabolismo fotosinttico de las plantas C4 182
Metabolismo cido de las Crasulceas o CAM 184
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Bioelementos y Biomolculas
Bioelementos
De los ms de 100 elementos encontrados en la Tabla peridica, la materia viva est
constituida por unos 70 elementos y solo alrededor de 21, son esenciales para el desarrollo y
conservacin de la vida. Estos elementos se llaman bioelementos o elementos biognicos.
Bioelementos Primarios
Estn formados por: C, H, O, N, P y S, los cuales constituyen alrededor
del 96.2% de la materia viva en base seca. Son los componentes
fundamentales de las biomolculas. Son iimprescindibles para formar:
carbohidratos, lpidos, protenas y cidos nucleicos.
Bioelementos Secundarios
Clasificacin de Grupo comprendido por los iones: Na+, K+, Ca2+, Mg2+, Cl-. Estos
los bioelementos elementos aunque se encuentran en menor proporcin que los
primarios, tambin son indispensables para los seres vivos. En medio
acuoso (solvente presente en clulas tejidos y rganos), siempre se
encuentran ionizados.
Oligoelementos
Son aquellos bioelementos que se encuentran en los seres vivos en un
porcentaje menor del 0.1%. Algunos, los indispensables, se encuentran
en todos los seres vivos, mientras que otros, variables, solamente los
necesitan algunos organismos. En este grupo se encuentran: Fe, Cu,
Zn, Mn, I, Ni y Co (que aparecen en la mayora de los organismos) y Si,
F, Cr, Li, B, Mo y Al (slo estn presentes en grupos concretos).
Constituyen menos del 0.1% y son esenciales para desempear
procesos bioqumicos y fisiolgicos.
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Bioelementos Oligoelementos
Primarios Secundarios Indispensables Variables
C Na+ Mn B
H K+ Fe Al
O Mg2+ Co V
N Ca2+ Cu Mo
P Cl- Zn I
S Si
El hecho de que los bioelementos primarios sean tan abundantes en los seres vivos se debe a
que presentan ciertas caractersticas que los hacen idneos para formar las biomolculas que
constituirn las estructuras biolgicas y llevarn a cabo las funciones vitales.
El C y el N presentan la misma afinidad para unirse al oxgeno o al hidrgeno, por lo que pasan
con la misma facilidad del estado oxidado al reducido. Esto es de gran importancia, pues los
procesos de oxidacin-reduccin son la base de muchos procesos qumicos muy importantes y
en particular de los relacionados con la obtencin de energa como la fotosntesis y la
respiracin celular.
Pueden incorporarse a los seres vivos desde el medio externo (en forma de: CO2, H2O, NO3, N2,
etc).
El tomo de carbono es la base de la qumica orgnica y por lo tanto de la qumica de los seres
vivos. Sus propiedades son nicas ya que tiene la capacidad de unirse con otros tomos de
carbono a travs de enlaces sencillos, dobles y/o triples, formando estructuras lineales,
ramificadas y cclicas.
Biomolculas
Los elementos biognicos se unen por enlaces qumicos para formar las molculas
constituyentes de los organismos vivos, que se denominan biomolculas.
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El agua
El agua es el componente ms abundante en los seres vivos. Existe tanto en forma intracelular
como fuera de las clulas. En general Se dice que los seres vivos contienen un promedio un
70% de agua. Aunque no todos tienen la misma cantidad. En general los vegetales tienen ms
agua que los animales. Hay tejidos que tienen ms agua que otros por ejemplo, el tejido
adiposo se estima que contiene alrededor de 15%, mientras que tejido nervioso, contiene
aproximadamente el 90%. El contenido tambin vara con la edad del tejido, por ejemplo en la
carne de becerros es ms tierna que la de las vacas, por tener mayor cantidad de de agua.
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Propiedades Fsicas
Estructura
Como es del conocimiento general, la molcula de agua est formada por dos tomos de H,
unidos covalentemente a un tomo de O. En la figura de abajo se muestran las distancias de las
variables estructurales de la molcula, medidas en Amstrongs (1 m = 10 000 000 000 de ).
En la siguiente figura se puede observar que los orbitales sp3 forman una estructura tetradrica
(parecida al tomo de carbono en la molcula de metano), de tal forma que quedan dos
orbitales con un par de electrones cada uno. Esta geometra angular de la molcula de agua
tiene enormes implicaciones biolgicas en los seres vivos, tales como la polaridad y la
capacidad para formar puentes de hidrgeno.
Como consecuencia de su geometra, en cada molcula de agua los enlaces covalentes entre
el oxgeno y los dos tomos de hidrgeno forman un ngulo de 104.5. Adems debido a que el
tomo de O es ms electronegativo que el H, atrae ms hacia su ncleo al par de electrones
compartidos y dado que cuenta con sus dos orbitales electrnicos no apareados, en total queda
con una carga parcial negativa de -0.66 e, mientras que cada tomo de H una de +0.33, donde
e es la carga de un electrn. Esta condicin hace que se puedan dar atracciones electrostticas
entre las molcula de agua, as como entre el agua y otras molculas polares o cargadas.
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Al ser las molculas de agua dipolos elctricos, pueden formar entre s, las interacciones
llamadas puentes de Hidrgeno que se dan entre el tomo de oxigeno de una molcula y los
tomos de hidrogeno de las molculas vecinas. Estos puentes de hidrogeno se forman y se
rompen a gran velocidad, y su estabilidad disminuye al elevarse la temperatura.
La cohesividad y por lo tanto las interacciones por puentes de H son responsables del elevado
calor especfico del agua (definido como la cantidad de calor necesaria para elevar la
temperatura de una unidad de masa, en un grado). El calor especfico del agua, le permite
ganar o liberar una gran cantidad de calor por cada grado en que vare su temperatura que al
calentarse o al enfriarse.; lo que permite que el agua acte como amortiguador trmico,
evitando bruscas alteraciones de la temperatura y evitando de esta forma que, por ejemplo,
algunas molculas como las protenas, muy sensibles a los cambios trmicos, se alteren.
Por otro lado el agua necesita una gran cantidad de calor para su evaporacin (539 cal/g), lo
cual depende tambin de la cohesividad, pues para pasar del estado lquido al gaseoso es
necesario romper los puentes de H entre las molculas de agua. Esta propiedad tambin es de
gran importancia para la regulacin de la temperatura corporal en muchos seres vivos (por
ejemplo por medio de la sudoracin).
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Solubilidad
Debido a su alta polaridad, el agua es un buen disolvente para los compuestos polares e
inicos. Como se puede ver en la siguiente figura, en el estado cristalino los iones de NaCl
permanecen altamente ordenados, mientras que en solucin, las molculas de agua se
disponen alrededor de los iones positivos (Na+) con la parte negativa de su molcula hacia
ellos; por su parte, los iones negativos (Cl-) enfrentan la carga parcial positiva del agua.
La esfera de molculas de agua que rodea a cada in se llama esfera de solvatacin y con
frecuencia contiene varias capas de agua de solvatacin. A las molculas que se pueden
disociar y formar iones en solucin acuosa, se les llama electrolitos. La ionizacin ocurre porque
uno de los tomos gana uno o ms electrones y mientras que el otro se los cede. Los
electrolitos no son las nicas sustancias hidroflicas que son solubles en agua. Toda molcula
polar, tambin tendr tendencia a solvatarse por
molculas de agua. Adems la solubilidad de
muchas sustancias orgnicas aumenta por la
capacidad que tengan sus grupos funcionales
para formar puentes de H con las molculas de
agua.
Algunas sustancias tienen una parte de su molcula que es soluble en agua (hidrfila) y otra
parte insoluble (hidrfoba). Estas sustancias se dice que son anfipticas. Este es un hecho
comn en el caso de molculas de cadenas hidrocarbonadas con un extremo cargado, como
fosfolpidos y esfingolpidos. Cuando las molculas de un compuesto anfiptico estn presentes
en un medio acuoso, se ordenan y orientan para dar lugar a la formacin de micelas o bicapas,
tal y como ocurre en las membranas celulares y en las vesculas, o simplemente en monocapas
al estar presentes en la superficie acuosa.
Las molculas de gran tamao como los polisacridos y las protenas, cuando son solubles en
agua, forman un tipo especial de disoluciones denominadas coloides. Las disoluciones
coloidales pueden existir en los estados: sol y gel. En el estado de sol predomina la fase
dispersante, el agua, por ejemplo, sobre la fase dispersa y la solucin es ms fluida. En estado
de gel predomina la fase dispersa, por ejemplo: la protena, sobre la fase dispersante, y la
solucin es ms viscosa.
El paso de un estado a otro es reversible y diversos factores fsicos y qumicos pueden hacer
que una solucin pase de un estado a otro sin necesidad de variar la concentracin de soluto.
Estos factores pueden ser: el pH, la temperatura o una alteracin en la concentracin de
determinados iones presentes en el medio. Las soluciones coloidales pueden separarse por
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dilisis por medio de membranas cuyos poros slo permiten pasar las molculas de pequeo
tamao y no las partculas coloidales.
Como puede verse en la figura de abajo, en el sentido inverso de la reaccin, los iones hidronio
pueden actuar como cidos (donadores de protones) cediendo su protn hacia el in hidroxilo
formando nuevamente dos molculas de agua (H2O). En este caso el in hidroxilo acta como
base (ganando protones).
La doble flecha de la reaccin de ionizacin del agua indica que ambas reacciones se llevan a
cabo continuamente, es decir se trata de una reaccin reversible. Continuamente molculas de
agua estn formando iones a la vez que esos iones estn regenerndose en molculas de
agua, hasta alcanzar un estado de equilibrio, estado en el cual la concentracin molar de iones
hidronio e hidroxilo, as como la de las molculas de agua sern constantes. Como puede
observarse sin embargo la flecha de reaccin en sentido hacia la ionizacin es menor que la
flecha en sentido inverso hacia la regeneracin de las molculas de agua. Esto indica que en el
equilibrio tendremos una concentracin mayor de molculas de agua que la concentracin de
los iones.
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O bien:
Si se sabe que la densidad del agua es de 1000 g/L y su peso molecular es de 18 g/mol, es
posible calcular la molaridad del agua, sabiendo que:
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Ese valor se conoce como producto inico del agua y como es constante ms precisamente se
la llama constante de producto inico del agua. Como en el agua pura al ionizarse se producen
cantidades estequiomtricamente iguales de H+ y OH-:
Y tambin:
Dado lo anterior, se dice que el agua pura es neutra porque existe igual nmero de cargas
positivas (H+) y negativas (OH-).
Existen varios procesos bioqumicos que estn controlados por la concentracin de H+ (ms
exactamente sera por la de H3O+), entre ellos podemos citar: el transporte de O2 en la sangre,
la fotosntesis, la respiracin y la catlisis enzimtica.
Entonces se concluye que las soluciones neutras tienen un valor de pH igual a 7.0. Las
soluciones cidas, dado que tienen un soluto donador de H+ al medio acuoso, tienen valores de
pH por debajo de 7.0. As por ejemplo una solucin de HCl a 0.01 M (igual a 1 x10 -2 M) como es
un cido fuerte se ioniza completamente por lo que la concentracin de iones H+ en la
solucin ser tambin de 1 x10-7 M y el valor del pH es 2.0. As mientras mayor sea la
concentracin de H+ en la solucin, el valor del pH ser ms bajo.
Las soluciones acuosas tambin pueden tener concentraciones de H+ menores que la del agua.
Esto ocurre cuando se agrega al agua un compuesto bsico (que gana protones), por ejemplo
NaOH. El NaOH es una base fuerte que se ioniza completamente en solucin acuosa, en este
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caso los iones OH- de la base se combinarn con los H+ del agua y formarn nuevas molculas
de agua. Por ejemplo si se tiene una solucin de NaOH a 0.01 M (1 x10-2). En este caso la
concentracin de H+ se modifica de la siguiente manera:
En la figura de ms abajo se
muestran los valores de pH
para diferentes lquidos
cidos y alcalinos.
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Por lo poco prctico de manejar los valores de Ka, al igual que en el caso del pH, se prefiere
manejar su valor logartmico negativo.
En la tabla de enseguida se pueden observar los valores de las constantes de disociacin (Ka)
de algunos cidos dbiles y sus respectivos valores de pKa, al ionizarse parcialmente en
solucin acuosa.
En los cidos dbiles Ka es < 1, mientras que en los cidos fuertes Ka es >>1.
El pH de una solucin est determinado por las concentraciones relativas de cidos bases. La
relacin de pH de una solucin y la concentracin de un cido y su base conjugada se calcula
fcilmente mediante la ecuacin de Ka:
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Despejando [H+]:
Y como:
Entonces:
Y como:
Entonces:
Cuando las concentraciones de ambas especies qumicas sean iguales, el valor de pH ser
exactamente igual al valor de pKa. La figura de la pgina siguiente muestra la curva de
titulacin del cido actico (CH3COOH) en solucin acuosa, con una base (OH-) tambin en
solucin acuosa.
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Para comprender como se amortiguan los cambios de pH en un sistema biolgico, hay que
considerar lo que ocurre durante la titulacin de un cido dbil con una base fuerte. En la figura
de enseguida se puede observar como varan los valores de pH de soluciones de cido actico,
In H2PO4- y amonio (NH4+) a medida que se les agrega NaOH (iones OH-).
Cuando los iones de OH- reaccionan con las molculas de HA, los productos son A- y H2O:
1.- Las curvas de titulacin de las soluciones de la figura anterior tienen formas similares pero
corridas verticalmente a lo largo del eje de pH, es decir cada una de ellas tiene valores de pK a
diferentes. .
2.- El valor del pH en el punto medio de cada titulacin es igual numricamente al valor de pKa
dado que en dicho punto, la concentracin molar del la molcula sin disociar es igual a la
concentracin molar del in hidrgeno:
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3.- Las pendientes de cada curva de titulacin son mucho menores cerca de su punto
medio que en loes extremos; es decir cuando [HA] [A-], el pH de la solucin es relativamente
estable al estar agregando una base fuerte. Igualmente ocurre si se agrega un cido fuerte.
Estas soluciones se conocen como amortiguadoras o buffers cido-base, debido a que resisten
los cambios de pH al aadir pequeas cantidades de cido o base fuerte, debido a que los
iones H+ y OH- reaccionan con A- y HA respectivamente, sin modificar en gran medida la
relacin:
Por lo tanto:
cidos poliprticos
Algunas sustancias tienen la
particularidad de poder perder o ceder ms
de un protn, se conocen como cidos
poliprticos; tal es el caso del cido fosfrico
(H3PO4) y del cido carbnico (H2CO3). Un
cido poliprtico tiene varios valores de pKa,
uno para cada paso de ionizacin.
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Muchas molculas biolgicas actan como cidos poliprticos pudiendo ceder 2 o ms iones
hidrgeno al medio (por ejemplo los aminocidos) y por lo tanto tambin pueden tener efecto
amortiguador del pH.
El plasma sanguneo de los mamferos es un ejemplo de una solucin con una excelente
capacidad amortiguadora del pH a nivel biolgico, ya que su pH ( 7.4) se mantiene constante
en diversas circunstancias fisiolgicas. La tabla de abajo indica la capacidad de
amortiguamiento del pH del plasma sanguneo con respecto al agua o a un suero fisiolgico que
contiene 0.15 M de NaCl.
El pH de la sangre se
regula principalmente por
el sistema amortiguador:
Dixido de carbono/cido
carbnico/Bicarbonato.
En la grfica de al lado se
observan los porcentajes
relativos de cido
carbnico y sus bases
conjugadas en funcin del
pH. Ntese que a pH 7.4
las concentraciones de
cido carbnico (H2CO3) y
bicarbonato (HCO3-) son apreciables, mientras que la de in carbonato (CO3-2) son
prcticamente nulas.
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Ya en el interior de las clulas, las protenas, pptidos, aminocidos libres y las especies
qumicas de fosfatos inorgnicos son los que realizan el amortiguamiento del pH. Como se dijo
antes, las especies H2PO4- y HPO4-2 porque su pKa es de 7.2.
cidos fuertes.
1.- Cul es el pH de una solucin acuosa que contiene 10-4 moles de HCl por litro?
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Esto es porque:
cidos dbiles.
Primero se debe calcular la concentracin molar del cido actico y del acetato en la
solucin, usando la frmula:
Despejando:
Entonces:
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A partir de la tabla de Ka y pKa, se sabe que la constante de disociacin del cido actico
es 1.74 x10-5 M.
Como el cido actico se disocia en el agua para formar los iones acetato e hidrgeno,
para encontrar el pH de la solucin se requiere determinar la concentracin molar de
iones hidrgeno ([H+]). Si representamos a la concentracin molar desconocida de
hidrgeno con el valor x y si sabemos que en el equilibrio la concentracin molar de
ambos iones es igual, tendramos:
Despejando y multiplicando:
Reordenando:
-bb2 -4ac
x=
2a
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Sustituyendo:
Resolviendo:
Como:
Por lo que:
Resolviendo:
Calculando el pH:
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4.- Calcular los volmenes de cido actico 0.1 M y de acetato de sodio 0.1 M que se
requieren para preparar un litro de solucin amortiguadora a un pH de 5.8.
Esta ltima relacin indica que la concentracin molar del acetato en la solucin debe ser 10
veces mayor que la del cido actico. En este caso, como se est partiendo de iguales
soluciones iniciales de igual concentracin para ambas especies qumicas (0.1 M, en cada
caso), la relacin de concentraciones puede transformarse directamente a una relacin de
volmenes, por lo que para formar un litro de solucin buffer se requieren un volumen de
acetato y diez volmenes de cido actico:
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La actual teora geoqumica sugiere que la concentracin de oxgeno molecular en los inicios de
la vida en la tierra, era muy baja. Por lo que los carbohidratos eran desdoblados nicamente a
travs del proceso anaerbico de gliclisis (fermentacin) para obtener energa en la forma de
trifosfato de adenosina ATP, un derivado de la ribosa fosforilada y sustituido con una purina.
Debido a que utilizando la gliclisis, las clulas solo se obtenan una pequea cantidad de
energa (2 molculas de ATP por cada molcula de carbohidrato), las formas de vida
permanecieron simples y primitivas. Sin embargo, conforme la concentracin de oxgeno
molecular en la atmsfera se increment, como resultado de la fotosntesis microbiana, los
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La oxidacin completa de los carbohidratos a nivel biolgico se realiza a travs del proceso
conocido como respiracin. En esta reaccin el carbohidrato se combina con oxgeno
molecular para formar dixido de carbono y agua, produciendose adems una mayor cantidad
de energa (hasta 32 ATP por molcula de de carbohidrato). Este incremento en la energa
disponible dio origen a una explosin en el nmero, diversidad y complejidad de organismos.
Los carbohidratos son un importante constituyente de la dieta humana y proveen una alta
proporcin de las caloras (50 a 60%) consumidas.
Debido a que algunos son de sabor dulce, sobretodo los de bajo peso molecular, se les ha
llamado glcidos (del griego glykys que significa dulce). Por la misma razn se les ha llamado
sacridos (del latin skkaros que significa azcar o dulzura).
En el siglo XIX se encontr que los carbohidratos en general tenan la formula Cn(H2O)n, por lo
que se pens que eran hidratos de carbono y entonces se les llam carbohidratos. Este trmino
se aplic originalmente a los monosacridos que son los que tienen la proporcin de hidrgeno
y oxgeno, como en la molcula de agua, por cada tomo de carbono. Pero poco despus el
nombre se generaliz y se aplic adems a oligosacridos, polisacridos e incluso derivados de
los monosacridos. Esto significa que hoy en da, la palabra carbohidrato es muy general y
aplicable a un gran nmero de materiales que abarcan una amplia gama de estructuras
qumicas y funciones biolgicas.
De acuerdo con lo anterior, se agrupan en: a) monosacridos (los azcares simples o unidades
monomricas que ya no pueden hidrolizarse para dar origen a otros carbohidratos), b)
oligosacridos (molculas de pocas unidades monomricas unidas) y c) polisacridos
(molculas con muchas, hasta miles, unidades monomricas enlazadas covalentemente).
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Los monosacridos o azcares simples son molculas relativamente sencillas que se unen
entre s, para formar molculas ms grandes, como por ejemplo la glucosa que se polimeriza
para formar almidn. El almidn es una molcula que le sirve de reserva de energa a las
plantas. Pero tambin es la fuente de energa primaria en algunos alimentos, como los cereales
(trigo, maz y arroz) y sus derivados (pan, pastas y tortillas), por mencionar algunos.
Un aspecto importante de los carbohidratos es que pueden estar unidos covalentemente a otro
tipo de molculas, por ejemplo pueden formar glicolpidos (cuando se unen a ciertos lpidos),
glicoprotenas (cuando el componente proteico es mayoritario), proteoglicanos (cuando el
carbohidrato es la parte mayoritaria) o bien peptidoglicanos (cuando el componente peptdico es
de menor tamao que el de una protena).
Funciones
a) Provisin y almacenamiento de energa
Los azcares simples son los productos en los
que se fija carbono (en forma de CO2) y
molculas de agua a travs de la fotosntesis.
En este sentido se dice que son los
fotosintatos primarios. Por esta razn una de
las principales funciones de los carbohidratos
simples en los seres vivos, es su
metabolizacin a nivel celular para producir
energa de uso inmediato. Se ha estimado que
el catabolismo de 1g de un monosacrido
produce alrededor de 4 Kcal.
b) Estructurales y de soporte
Algunas molculas de carbohidratos en forma de polisacridos forman estructuras de soporte
que le imparten una cierta resistencia mecnica a clulas, tejidos, rganos y organismos.
Las paredes celulares de plantas, hongos y bacterias estn constituidas por hidratos de carbono
o derivados de los mismos. As, se estima que la celulosa, que forma parte de la pared celular
de las clulas vegetales, es la molcula orgnica ms abundante de la Biosfera.
c) Reconocimiento celular
Como ya se mencion anteriormente algunos carbohidratos pueden unirse covalentemente a
lpidos o a protenas. La finalidad de principal de estas asociaciones es formar estructuras de
reconocimiento en la superficie de las clulas. As existen glicoprotenas y glicolpidos en la
superficie externa celular que sirven como seales de reconocimiento para hormonas,
anticuerpos, bacterias, virus u otras clulas.
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Algunos oligosacridos unidos a esfingolpidos son tambin los responsables antignicos para
definir los grupos sanguneos en humanos.
Las cadenas de oligosacridos realizan algunas diferentes funciones sobre las protenas a las
que van unidos, por ejemplo:
Les ayudan a su plegamiento correcto
Les sirven directores para conducirlas a su destino dentro o fuera de la clula
Protegen a la protena contra la accin de proteasasAumentan la solubilidad de
las protenas, evitando su agregacin y precipitacin.
d) Detoxificacin
Las sustancias txicas poco solubles en agua, procedentes del metabolismo animal (por
ejemplo hormonas esteroidales, bilirrubina, etc.) o de origen exgeno (como antibiticos,
drogas, aditivos alimenticios, etc.) tienden a acumularse en tejidos con alto contenido lipdico,
tales como el cerebro o el tejido adiposo. Es fundamental para un organismo contar con
mecanismos de excrecin de dichas sustancias. Una de las maneras de hacerlo es a travs de
la orina o el sudor. El cido glucurnico es un derivado de la glucosa que cumple muchas de
estas funciones, ya que puede formar glicsidos con estas molculas, incrementando su
solubilidad en agua.
Clasificacin
Atendiendo al nmero de unidades monomricas y grupos funcionales que las modifican, los
carbohidratos se pueden clasificar de la siguiente manera:
Aldosas
Simples
Cetosas
Monosacridos
Derivados
Disacridos
Oligosacridos Trisacridos
Lineales
Simples
Ramificados
Polisacridos
Lineales
Derivados
Ramificados
Monosacridos simples
Los monosacridos simples son las unidades bsicas de los carbohidratos Son
polihidroxialdehdos o polihidroxicetonas de al menos tomos de 3 carbono, que ya no pueden
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Bajo ciertas condiciones algunos monosacridos son sintetizados a partir del proceso conocido
como la gluconeognesis (proceso por el cual se obtiene glucosa a partir de molculas que no
son carbohidratos por ejemplo: cido lctico, cido pirvico o de ciertos aminocidos), pero la
gran mayora (y finalmente como casi todas las molculas biolgicas) son productos de la
fotosntesis.
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Como coincidi que el ismero del gliceraldehdo, cuya estructura tena el OH hacia la derecha
en el segundo carbono (que es el nico quiral), tambin rotaba el plano de la luz polarizada
hacia la derecha, a este ismero se le design como D (de dextrgiro). En caso la estructura
que tiene el OH del segundo carbono a la izquierda coincidi que rotaba el plano de luz
polarizada a la izquierda y se le design como L (de levgiro).
Posteriormente se comprob que esta coincidencia no se cumpla totalmente para las dems
molculas de monosacridos, pero se mantuvo la designacin D y L para las molculas que
presentan el OH del carbono quiral ms alejado del grupo carbonilo, hacia la derecha o hacia la
izquierda respectivamente. Mientras que la designacin del signo (+) para indicar si la molcula
ocasiona la rotacin del plano de luz polarizada hacia la derecha y el signo (-) si la rotacin es a
la izquierda.
Como cada centro quiral puede dar dos configuraciones en el espacio, en el caso de molculas
con n tomos de carbonos asimtricos, se aplica la frmula 2n para dar el total de posibles
estereoismeros. Del total de estereoismeros dos van a ser enantimeros (si sus molculas
son imagen de espejo entre s), los dems van a ser diastermeros con respecto a ese par de
enantimeros (para comprender un poco ms hay que revisar las series de aldosas y cetosas
que se presentan ms delante).
La numeracin de los tomos de carbono el caso de los monosacridos es siguiendo las reglas
de la IUPAC para aldehdos y cetonas. De acuerdo con esto, el caso de las aldosas siempre le
corresponder el nmero 1 al carbono del grupo aldehdo, mientras que en las cetosas el
carbono cetnico tendr el numero 2. Analicemos el de la estructura de la D-glucosa:
La molcula tiene 4 tomos de carbono quiral (2, 3, 4 y 5), por lo tanto si se aplica la frmula 2 4,
dara como resultado 16 estereoismeros. Uno ser su imagen de espejo, la L-glucosa, los
otros 14 sern diastermeros con respecto a D-glucosa y L-glucosa.
Un par de molculas sern enantimeros entre s, si los sustituyentes de todos sus tomos de
carbono quiral estn opuestos.
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Cuando dos molculas de azcar tienen distinta configuracin solo en unos de varios carbonos
quirales, se dice que son epmeros entre s. Por ejemplo la glucosa es epmero de la manosa
porque nada mas varan en el carbono 2 y tambin de la galactosa porque varan entre s solo
en el carbono 4. Pero la manosa no es epmero de la galactosa porque varan en dos de sus
carbonos quirales (el 2 y el 4). Una analoga similar se puede hacer para la serie de las cetosas.
Si consideramos que provienen de la dihidroxiacetona:
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La configuracin del carbono 3 es el que distingue a los miembros de cada par de cetosas. Las
encerradas en un recuadro son las de mayor importancia biolgica. Tambin hay que recordar
que para cada configuracin en D existe una imagen de espejo en L., as por ejemplo la
fructosa que tiene 3 centros quirales va a tener 23 = 8 estereoismeros posibles, de los cuales
la D-fructosa y la L-fructosa sern enantimeros y el resto sern diastermeros con respecto a
ellas.
Anmeros
Los grupos funcionales aldehdo y cetona de los monosacridos reaccionan con grupos OH de
loa alcoholes para hemiacetales y hemicetales respectivamente:
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De la misma forma una cetosa, por ejemplo la fructosa en cadena abierta puede realizar la
formacin de un enlace hemicetal, uniendo al carbono 1 con el oxigeno del OH del carbono 5.
Este enlace dar lugar a la formacin de un anillo de 5 elementos llamado furano y la molcula
resultante ser una furanosa (fructofuranosa).
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En solucin acuosa, las aldosas y las cetosas que forman anillos estn en equilibrio entre sus
diferentes formas cclicas anomricas y su estructura abierta. Por ejemplo a 31 C la -D-
glucosa existe como una mezcla en equilibrio de aproximadamente 64% de -D-glucopiranosa y
36% de -D-glucopiranosa, con cantidades traza de la forma abierta. Los anmeros pueden
convertirse uno a otro mediante el proceso conocido como mutarrotacin.
La D-ribosa, que
puede formar anillos de
furano y pirano, en solucin
acuosa, se encuentra en una
proporcin aproximada de
58.5% de -D-ribopiranosa,
21.5% de -D-ribopiranosa,
13.5% -D-ribofuranosa y
6.5% de -D-ribofuranosa
con niveles traza de la forma
lineal. En la figura de abajo
se observan detalles del
ataque nucleoflico de los
electrones del oxgeno
hidroxlico, sobre el carbono
carbonlico, en el cual el H
del OH del carbono 5 o del
4 pasa a formar el OH del
carbono anomrico.
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Ismeros conformacionales
Las proyecciones de Fisher y Haworth muestran la posicin de los tomos en un solo plano,
pero como ya sabemos los tomos de carbono tienen una geometra tetradrica (con ngulos
de enlace cercanos a 110 C) debido a la hibridacin sp3 de sus 4 electrones de valencia, por lo
tanto presentan diferentes conformaciones debido al acomodo de los tomos en la molcula.
En el caso de los anillos furansicos, los ngulos de enlace, que en el pentgono regular seran
de 108 resultan muy prximos a los 109,5 que presentan las valencias del carbono tetradrico
no distorsionado. Por ello, las tensiones del anillo son muy pequeas y en consecuencia, la
estructura tridimensional se aproxima mucho a la frmula plana, solo con torsiones
relativamente pequeas.
En el caso de los anillos de las piranosas, por su similitud con el ciclohexano, se mantienen los
ngulos de enlace del carbono tetradrico, y como consecuencia, al igual que en el ciclohexano,
se produce un anillo sin tensin que puede adoptar las conformaciones de silla o bote. En
dichas conformaciones, los tomos de carbono no son planares con respecto al anillo, y debido
a que no hay dobles enlaces, existe libre rotacin entre los enlaces. La conformacin en silla es
la ms estable, porque todos los carbonos (tomados dos a dos) estn en conformacin
alternada y se acomodan mejor en el espacio debido a que tienen menor impedimento estrico
entre los sustituyentes. An as ambas conformaciones pueden coexistir en soluciones en
equilibrio.
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Sin embargo, en las aldohexosas, las dos conformaciones en silla no son equivalentes. La
presencia de sustituyentes de mayor tamao (OH y CH2OH) en el anillo favorecer la
conformacin de silla en la cual se presente el mximo de sustituyentes en disposicin
ecuatorial. Se ha establecido que la posicin ecuatorial favorece la formacin de puentes de H
entre los sustituyentes OH y las molculas de agua y se dice que esta es la razn, desde el
punto de vista estructural, del porque la D-glucosa ha sido favorecida evolutivamente con
respecto a los otros 15 ismeros de las hexosas.
Triosas.
Los fosfosteres de las dos triosas, el D-gliceraldehdo y la dihidroxiacetona son dos
importantes intermediarios en la degradacin anaerbica de la glucosa (gliclisis).
Tetrosas.
Las tetrosas (D-eritrosa, D-treosa y D-eritrulosa) aparecen solo en ciertas etapas especiales del
metabolismo.
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Pentosas.
De este grupo, sin duda los monosacridos ms importantes son la D-ribosa y su derivado 2-D-
desoxirribosa, ya que son constituyentes indispensables de los cidos nucleicos. Aunque
tambin puede encontrarse de manera natural D-xilosa, L-xilosa, D-arabinosa y L-arabinosa,
formando parte de algunos polisacridos estructurales.
Hexosas.
Como se mencion anteriormente, la D-glucosa ha sido favorecida a travs del proceso de
evolucin, por lo tanto es el monosacrido ms abundante en la naturaleza. Se puede encontrar
de manera libre, pero tambin formando parte de los polisacridos, tanto de reserva como
estructurales, y constituye la base del metabolismo energtico, ya que todos los seres vivos son
capaces de metabolizar la glucosa. Otras dos aldohexosas abundantes en los sistemas
biolgicos son los epmeros de la D-glucosa: la D-Manosa y la D-galactosa, as como sus
derivados. Estas molculas forman parte oligosacridos, asociados a lpidos o protenas, con
funciones especficas de reconocimiento de la superficie celular. Adems la D-galactosa es de
gran importancia para los mamferos ya que forma parte del disacrido lactosa, que es el
principal carbohidrato de la leche.
Monosacridos modificados
Alditoles
La reduccin del oxgeno en el carbono carbonilo de las cadenas abiertas de los monosacridos
da como resultado la formacin de un nuevo sustituyente OH. Estas molculas con estructura
de polialcoholes se denominan: alditoles. Hay diferentes alditoles de importancia biolgica, los
cuales toman el nombre a partir del monosacrido del cual provienen. As el glucitol es derivado
de la glucosa (tambin se le llama sorbitol), el manitol es derivado de la manosa y el ribitol,
proviene de la ribosa. El ribitol es componente de la vitamina B12 (riboflavina) y sus coenzimas.
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Por su parte los cidos aldurnicos al ciclarse formarn anillos de pirano similares a las
aldohexosas, pero con el carbono 6 en forma de carboxilo.
Derivados fosfatados
Son compuestos que presentan cidos ortofosfricos o los polifosfricos formando enlaces
ster con los grupos OH de un monosacrido. El grupo fosfato se ioniza y forma una carga
negativa en una molcula que normalmente no posee carga elctrica. Esta carga le permite
interaccionar con otro tipo de molculas polares, por ejemplo enzimas. Estas interacciones son
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las que facilitan el metabolismo de los monosacridos. Por ejemplo la glucosa es metabolizada
en forma de glucosa-6-fosfato.
Desoxiazcares
Tambin llamados deoxiazcares, son monosacridos en los que ocurre una sustitucin de un
grupo OH por un tomo de H. Entre los ms importantes podemos destacar a la 2-D-
desoxirribosa que forma parte del cido desoxirribonucleico (DNA). En mucho menor grado pero
tambin importantes son la 6-desoxi-L-manosa (ramnosa) y la 6-desoxi-L-galactosa (fucosa),
que son de azcares (en este caso derivados) en configuracin L que forman parte de algunos
polisacridos.
Aminoazcares
En este grupo caen los monosacridos en los cuales uno de los grupos OH ha sido sustituido
por un grupo amino (NH2) o un amino modificado (generalmente acetilado). En la mayora de
las aldosas la sustitucin se da en el carbono 2. Son de especial inters la N-acetil-D-
glucosamina y la N-acetil-D-galactosamina, que aparecen en oligosacridos complejos de la
superficie celular, as como en los polisacridos de los tejidos conectivos.
funciones de reconocimiento celular, por ejemplo forma de los receptores de virus o bacterias.
Otro ejemplo es el cido murmico que es una hexosa aminada que contiene un residuo de
cido lctico unido al carbono 3 mediante un enlace ter. Este compuesto forma parte del
peptidoglicano de las paredes celulares bacterianas.
Glucsidos o glicsidos
Son derivados de monosacridos en los que mediante una reaccin de condensacin, el
carbono anomrico del azcar queda unido al oxgeno de de un compuesto hidroxilado, se
elimina una molcula de agua y se forma un enlace glucosdico o glicosdico. Muchas molculas
biolgicamente activas que son no polares o de baja polaridad, se unen con azcares para
movilizarse e interaccionar en el agua.
Existen tambin los enlaces N-glucosdicos, por ejemplo los que se forman entre el carbono
anomrico de la D-ribosa o la Deoxi-D-ribosa y las bases nitrogenadas (purinas y pirimidinas)
en los cidos nucleicos.
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En la figura de abajo se muestran los proncipales monosacaridos y sus derivados que forman
parte de las paredes celulares de las plantas. Como puede observarse todos provienen de la
glucosa y las modificaciones con respecto a ella se muestran en rojo. Entre parntesis se dan
las abreviaciones de cada azcar de acuerdo a la convencin de la IUPAC.
Oligosacridos
La mayora de los oligosacridos son polmeros de 2 a 20 unidades de monosacridos.
Aunque se dice que algunos oligosacridos, por ejemplo la inulina, pueden tener hasta cerca de
100 unidades unidas mediante enlaces glucosdicos, la mayora de los autores consideran que
los oligosacridos de ms de 20 unidades caen dentro del grupo de los polisacridos.
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Disacridos
Los oligosacridos ms abundantes son los disacridos, los cuales estn formados por dos
unidades de monosacridos, que pueden iguales o de distinto tipo. En la sntesis de otros
oligosacridos y polisacridos, los disacridos pueden seguir unindose a otros monosacridos
por medio de enlaces glucosdicos.
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Otros oligosacridos
La rafinosa, la estaquiosa y la verbascosa son tres de los
principales oligoacridos presentes en muchos vegetales,
principalmente encerrados en las vacuolas de las clulas.
Estos tres oligosacridos estn relacionados
estructuralmente con la sacarosa, con una, dos o tres
galactosas, respectivamente, unidas al resto de glucosa.
Por ejemplo la rafinosa es un trisacrido formado por
galactosa, fructosa y glucosa. Su nombre sistemtico es -
D-fructofuranosil--D-galactopiranosil- (16)- -D-gluco
piransido o, en forma resumida:
Gal(16)Glc(12)Fru.
Polisacridos
En general se consideran como polisacridos a aquellos que estn formados por la unin de
ms de 20 unidades de monosacridos.
Polisacridos simples
Son aquellos que estn formados por un solo tipo de monosacrido simple. Pueden ser lineales
o ramificados.
Polisacridos derivados
Son polmeros de ms de 20 monosacridos derivados. Forman un grupo bastante heterogneo
de polmeros. Pueden ser lineales o ramificados. Pueden ser homopolisacridos si estn
conformados por un solo tipo de derivado de azcar (por ejemplo la quitina y la pectina) o
heteropolisacridos si se constituyen por dos o ms tipos de unidades de azcares simples o
derivados de azcar, en secuencia alternante, ramificados o de estructura compleja. Ejemplos:
condroitina, cido hialurnico, etc.
Polisacridos de reserva
Almidn
Es la principal forma de almacenamiento de energa en los vegetales; ya que acumula unidades
de glucosa que pueden ser fcilmente metabolizables en los procesos de gliclisis y respiracin
para la obtencin de energa, cuando sea requerida. Se almacena en forma de grnulos, y
puede llegar a constituir hasta el 70% en peso seco en cereales como el maz y el trigo o de
tubrculos como la papa o el camote.
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Por su parte la amilopectina es una molcula mucho mayor que la amilosa, pudiendo estar
conformada, en ocasiones, hasta por varios miles de monmeros de -D-glucopiranosa. A
diferencia de la amolosa, la amilopectina es un polmero ramificado, en el que las cadenas
principales estn formadas por monmeros unidos mediante enlaces glicosdicos (14) y
donde cada rama se une a la cadena principal mediante enlaces glicosdicos (16). Estas
ramificaciones estn regularmente espaciadas (cada 25-30 unidades de glucosa) y cada rama
contiene nicamente uniones (14).
Tanto la amilosa como la amilopectina pueden ser desdobladas a unidades de glucosa por
enzimas llamadas amilasas (en el caso de los animales generalmente presentes en la saliva o
secretadas por el pncreas). La -amilasa presente en animales y plantas, es una enzima
endoglicosidasa, es decir que acta sobre enlaces glicosdicos internos, catalizando la hidrlisis
aleatoria de los enlaces (14) de ambos polisacridos. Otro tipo de hidrolasa, la -amilasa
que se encuentra en las semillas y tubrculos de algunas plantas, es una exoglicosidasa,
porque acta sobre enlaces glicosdicos terminales.
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Glucgeno o glicgeno
Es el polisacrido de reserva de energa en
animales. Millones de molculas de glucosa son
almacenadas y potencialmente disponibles para
cuando sean requeridas. Se encuentra en casi
todas las clulas, pero las mayores
concentraciones estn en los hepatocitos (clulas
del hgado donde puede llegara a representar el
10% en peso seco) y en las clulas musculares
(hasta el 2% de su peso seco). Su estructura es
muy similar a la de la amilopeptina, pero con
ramificaciones ms frecuentes (cada 8-12
unidades de glucosa) y mayor peso molecular (de
hasta varios millones de daltones), en ocasiones
hasta 50,000 unidades de glucosa. La enzima
encargada del desdoblamiento del glucgeno es
la glucgeno fosforilasa. Esta enzima empieza a
degradar el glucgeno a partir de sus extremos no
reductores, atacando las uniones (14).
Polisacridos estructurales
Celulosa
A diferencia de las clulas de origen animal, las clulas
vegetales, adems de la membrana celular, tienen una
pared celular rgida que les da la capacidad de soportar
diferencias de presin osmtica entre el interior y
exterior de la clula hasta por ms de 20 atm. En las
plantas leosas, las paredes celulares tambin tienen
funciones de sostn. A la derecha se presenta una
microfotografa de 3 clulas vegetales separadas
mediante sus respectivas paredes celulares.
Los animales no podemos utilizar la celulosa como fuente de energa, ya que no poseemos las
enzimas llamadas celulasas, necesarias para desdoblar los enlaces -1,4-glucosdicos. A pesar
de ello, la celulosa es importante en la dieta humana (fibra diettica) porque al llegar indigerida
al intestino grueso facilita el desalojo de las heces y ayuda a evitar el estreimiento.
Los rumiantes, ciertos herbvoros y las termitas, pueden disponer de la celulosa como fuente de
energa, ya que cuentan con microorganismos en su aparato digestivo, muchos de ellos
metangenicos, que s poseen la celulasas y logran romper los enlaces -1,4-glucosdicos,
dejando las unidades de glucosa libres para ser metabolizadas. Existen algunos
microorganismos (bacterias y hongos celulolticos) que viven libres y que tambin son capaces
de hidrolizar la celulosa.
Quitina
Es el segundo polisacrido ms abundante de la biosfera.
La quitina es un homoglicano formado por unas 120
unidades de N-acetilglucosamina unidas mediante enlaces
enlaces (14). Por el hecho de presentar este tipo de
enlaces, su funcin, al igual que en el caso de la celulosa,
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Glucosaminoglicanos
En el caso de los tejidos conectivos de los animales (cartlagos, piel, tendones y paredes de los
vasos sanguneos) existen espacios intercelulares que contienen colgeno y otras protenas en
una matriz en forma de gel, la cual est constituida a base de glucosaminoglicanos. Estos
polisacridos presentan unidades de un cido urnico y una hexosamina alternados. stas
molculas en solucin tienen una lata elasticidad y viscosidad.
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La heparina es una molcula con propiedades de anticoagulante, ya que su unin con ciertas
protenas impide la polimerizacin del fibringeno y por lo tanto la formacin de trombos. El
queratn sulfato es un glucosaminoglicano que suele estar presente en tejidos vasculares o de
difcil oxigenacin como la crnea o los discos vertebrales. Se une a protenas dando lugar a
proteoglicanos con la configuracin de tipo muy grande. En las articulaciones, estas molculas
grandes y muy hidratadas actan a modo de amortiguadores que absorben el shock mecnico.
El dermatan sulfato Se encuentra en la piel, en el cartlago de las articulaciones, los vasos
sanguneos y vlvulas del corazn. Por su parte las condroitinas sulfato Constituyen alrededor
del 80% de los glicosaminoglicanos presentes en el cartlago de las articulaciones. Se suelen
administrar por va oral junto con la N-acetil-glucosamina para aliviar el dolor de las
articulaciones y reducir el ritmo de degeneracin de los cartlagos.
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Lpidos
Los lpidos agrupan a un conjunto de muy heterogneo de molculas orgnicas cuya
particularidad es que son insolubles o muy poco solubles en agua y muy solubles en
compuestos orgnicos no polares. Son las biomolculas ms hidrofbicas y con mayor poder
energtico a nivel celular. Precisamente la hidrofobicidad es una de sus propiedades ms
importantes. Son un grupo qumicamente diverso y por tanto, desempean funciones biolgicas
muy variadas. Algunos almacenan gran cantidad de energa qumica, como los triacilglicridos;
otros como los fosfolpidos y los esfingolpidos constituyen los principales componentes
estructurales de las membranas biolgicas; algunos desempean funciones de proteccin al
ambiente (como las ceras) y existen otros que desempean funciones especiales muy
importantes, actuando como: vitaminas, pigmentos, hormonas y mensajeros intracelulares, los
cuales a pesar de estar presentes en cantidades relativamente pequeas en los organismos
enteros, tienen una potente actividad biolgica.
Lpidos insaponificables: no contienen cidos grasos, por ello, no pueden formar jabones, por
ejemplo los terpenos, esteroides y los eicosanoides.
cidos grasos
Son molculas que presentan un nico grupo carboxlico unido a
una cadena hidrocarbonada (cola no polar), en la cual el nmero
de tomos de C es 3. Los cidos grasos difieren entre s en la
longitud de la cadena y en la presencia, nmero y posicin de
dobles enlaces.
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A un cido graso C18 con un doble enlace se le llama cido octadecanoico; con dos dobles
enlaces cido octadecadienoico, y con tres dobles enlaces cido octadecatrienoico.
Los dobles enlaces de casi todos los cidos grasos naturales estn en la conformacin cis. Los
cidos grasos trans se producen durante la fermentacin en el rumen de los animales
productores de lcteos y de carne. Tambin se forman durante la hidrogenacin de aceites de
pescado y vegetales. Dado que las dietas ricas en cidos grasos trans estn correlacionadas
con niveles elevados de LDL (colesterol malo) y bajos de HDL (colesterol bueno), se
recomienda evitar la ingestin de grandes cantidades de estos cidos grasos.
A temperatura ambiente, los cidos grasos saturados tienen una consistencia cerosa (slidos
blandos), mientras que los insaturados son lquidos viscosos.
Los cidos grasos insaturados tienen un punto de fusin ms bajo que los saturados de igual
longitud de cadena, y a mayor nmero de insaturaciones ms bajo es su punto de ebullicin.
As, el punto de fusin del cido esterico es de 69.6 C, mientras que el del cido oleico es de
13.4 C y el cido linolico es de 5 C y el linolnico es de -11 C.
Acilglicridos o Acilgliceroles
Los acilglicridos son steres constituidos por el alcohol glicerol y cidos grasos (tanto
saturados como insaturados), y se forman mediante una reaccin de condensacin denominada
esterificacin. Una molcula de glicerol (o glicerina, son equivalentes en la nomenclatura) puede
reaccionar con hasta tres molculas de cidos grasos, puesto que tiene tres grupos hidroxilo.
Segn el nmero de cidos grasos que aparezcan esterificados, los acilglicridos pueden ser de
tres tipos:
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Monoacilglicridos (monoglicridos) : cuando el glicerol slo se esterifica en un grupo
alcohol con un cido graso. Se libera una molcula de agua:
Triacilglicridos (triglicridos): steres de glicerol con tres cidos grasos. Se liberan tres
molculas de agua.
Los triacilglicridos son simples si los tres cidos grasos son iguales, y se denominan segn el
cido graso. Por ejemplo: tripalmitina (16:0), triestearina (18:0), triolena (18:1). Son mixtos si
contienen dos o ms cidos grasos diferentes. Por ejemplo: 1-estearoil-2-oleil-3-palmitoil
glicerol. La figura de abajo es el 1-estearoil-2-linoleil-3-esteroil glicerol.
Los triacilglicridos funcionan como almacn de energa en las clulas y contienen ms energa
que los hidratos de carbono. Las grasas y los aceites que se encuentran en plantas y animales
son en gran medida mezclas de diferentes triacilglicridos.
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La esterificacin con glicerol reduce considerablemente el carcter hidroflico de los grupos de
cabeza de los cidos grasos. Como consecuencia de ello, los triacilglicridos son muy
insolubles en agua. Las grasas acumuladas en las clulas vegetales y animales forman
pequeas gotas oleosas en el citoplasma. En los adipocitos, que son las clulas animales
especializadas en el almacenamiento de las grasas, casi todo el volumen de una clula est
ocupado por una gota de grasa. Estas clulas constituyen la mayor parte del tejido adiposo de
los animales.
El contenido medio de grasa en los seres humanos (21% para los hombres, 26% para las
mujeres) les permitira sobrevivir a la inanicin durante 2 3 meses. Por el contrario, la
proporcin de glucgeno del cuerpo, que funciona como una reserva de energa de corto plazo,
puede abastecer las necesidades de energa del cuerpo durante menos de un da. Adems, la
capa de grasa subcutnea proporciona aislamiento trmico, lo que es especialmente importante
para los animales acuticos de sangre caliente, como las ballenas, las focas o los pinginos,
que estn expuestos a bajas temperaturas.
Reaccin de saponificacin
La saponificacin es una reaccin qumica entre un cido graso o un lpido saponificable, y una
base, en la que se obtiene como principal producto la sal correspondiente. As, los jabones son
sales de cidos grasos y metales alcalinos que se obtienen mediante este proceso.
Como ejemplo, si un triacilglicridos se hidroliza con potasa (KOH), se obtiene una mezcla de
sales potsicas (jabones) de los cidos grasos y glicerol:
Fosfolpidos
Los tambin llamados fosfoglicridos, fosfoacilglicridos o glicerofosfolpidos estn constituidos
por dos cidos grasos esterificados al primer y segundo -OH del glicerol. El tercer grupo -OH
est unido por un enlace fosfodister a un grupo de cabeza muy polar o cargado (X).
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Todos los fosfoglicridos poseen dos colas no polares aportadas por los dos cidos grasos de
cadena larga, generalmente uno saturado (C16 o C18 en la posicin C-1 del fosfoglicrido) y
otro insaturado (de C16 a C20, en la posicin C-2 del fosfoglicrido).
Los fosfoglicridos son lpidos estructurales de las membranas biolgicas. Estas membranas
estn formadas por una doble capa lipdica que constituye una barrera al paso de molculas
polares e iones. Los lpidos de las membranas son anfipticos; es decir, un extremo de la
molcula es hidrofbico y el otro hidroflico. Sus interacciones, hidrofbicas entre ellos, e
hidroflicas con el agua, dirigen su empaquetamiento hacia la formacin de bicapas. En los
fosfoglicridos, las regiones hidrofbicas estn compuestas por los dos cidos grasos unidos al
glicerol. La parte hidroflica de estos compuestos anfipticos est constituida por el grupo
fosfato y la cabeza polar.
Esfingolpidos
Una segunda clase importante de componentes de la membrana es la de los esfingolpidos.
Tambin tienen una cabeza polar y dos colas apolares pero, a diferencia de los fosfoglicridos,
no contienen glicerol. Estn formados por el aminoalcohol de cadena larga la esfingosina, una
molcula de un cido graso de cadena larga y un grupo polar en la cabeza, que puede ser un
alcohol o un azcar.
Cuando se une un cido graso por un enlace amida al -NH2 del C-2 de la esfingosina y un
tomo de H en el O del C-3, se obtiene una ceramida. La ceramida es la unidad estructural fun-
damental comn de todos los esfingolpidos.
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Existen varias clases de esfingolpidos, todos ellos derivados de la ceramida, pero que difieren
en sus grupos de cabeza:
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Los ganglisidos son los esfingolpidos ms complejos. Contienen grupos de cabeza polares
formados por oligosacridos y uno o varios residuos terminales de cido n-acetilneuramnico
(cido silico). El cido silico aporta a los ganglisidos una carga negativa a pH = 7. Los
ganglisidos se concentran en la superficie exterior de las clulas. Sus complejas cabezas de
hidratos de carbono actan como receptores especficos para funciones fisiolgicas
importantes. Tambin son receptores para determinadas toxinas proteicas de origen bacteriano,
como la toxina colrica.
Ceras
Qumicamente se definen como steres de cidos grasos de cadena larga unidos mediante un
enlace ster a un alcohol de cadena larga. Su funcin principal es de proteccin ya que es
repelente del agua (ya que generalmente son slidas e insolubles en agua), pero tambin
puede metabolizarse y ser fuente de energa. El ejemplo ms representativo del grupo es la
cera de abeja:
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Otros ejemplos:
Lpidos simples
Se llaman lpidos simples a los lpidos que son insaponificables, debido a que no contienen
cidos grasos esterificados en su molcula. En este grupo se incluyen molculas formadas a
partir de la unin de dos o ms unidades de isopreno como los terpenoides y terpenos o
derivados de ellos como los esteroides. Tambin se incluyen al grupo de los eicosanoides, que
son derivados del cido eicosatetraenico (comnmente conocido como cido araquidnico).
Tambin existen otros compuestos por ejemplos los hidrocarburos y los llamados lpidos
pirrlicos que caen en la categora de insaponificables.
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Terpenos y terpenoides
Los terpenoides y los terpenos son compuestos aromticos que se encuentran en miles de
especies de plantas, y son responsables de los diferentes sabores y aromas del cannabis.
Hemos sabido de su presencia en el cannabis desde hace dcadas, pero solo recientemente ha
comenzado a ampliarse el conocimiento de sus potenciales propiedades teraputicas. Los
terpenos son una amplia clase de compuestos orgnicos de origen natural; tambin se conocen
como isoprenoides, ya que su estructura se basa en la repeticin de unidades de isopreno
(CH). Los terpenos son los principales componentes de la resina de las plantas y de los
aceites esenciales extrados de dichas plantas.
Sin embargo, es comn que el trmino terpeno incluya tambin a los terpenoides. Los
terpenoides, ya que tambin son isoprenoides. Terpenos y terpenoides son el mayor grupo de
compuestos orgnicos encontrados hasta el momento, comprende al menos 20.000 molculas
diferentes.
a) Hemiterpenos. Que son los terpenos ms pequeos, con una sola unidad de isopreno. El
hemiterpeno ms conocido es el isopreno mismo, un producto voltil que se desprende de los
tejidos fotosintticamente activos.
e) Triterpenos. Terpenos de 30 carbonos. Son por lo general generados por la unin cabeza-
cabeza de dos cadenas de 15 carbonos, cada una de ellas formada por unidades de isopreno
unidas cabeza-cola. Esta gran clase de molculas incluye a los brassinoesteroides,
componentes de la membrana que son fitoesteroles, algunas fitoalexinas, varias toxinas y
componentes de las ceras de la superficie de las plantas, como el cido oleanlico de las uvas.
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g) Politerpenos. Los politerpenos, que contienen ms de 8 unidades de isopreno, incluyen a
los transportadores de electrones que son quinonas preniladas como la plastoquinona y la
ubiquinona, tambin poliprenoles de cadena larga relacionados con las reacciones de
transferencia de azcares (por ejemplo el dolicol), y tambin a enormemente largos polmeros
como el caucho o goma natural, usualmente encontrado en el ltex.
Esteroides
Son lpidos derivados de un hidrocarburo tetracclico saturado, llamado ciclopentanoperhidrofe-
nantreno o esterano. Los esteroides se forman por la aparicin en distintas posiciones de este
hidrocarburo de dobles enlaces, y grupos sustituyentes (OH, cadenas carbonadas, etc.).
El ms abundante de todos es el
colesterol. Este se encuentra en las
membranas de las clulas animales
e influye en su fluidez.
Es necesario para las clulas, pero en exceso es perjudicial ya que se puede depositar en las
paredes internas de las arterias, endurecindolas y reduciendo la luz arterial, dando lugar a una
enfermedad llamada arterioesclerosis.
cidos biliares: Se forman en el hgado a partir del colesterol. Las sales de estos cidos
forman parte de la bilis y su funcin es la de emulsionar a las grasas en el intestino
favoreciendo su digestin y posterior absorcin.
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Vitamina D: Regulan el metabolismo del Ca y del P y su absorcin intestinal, su falta ocasiona
raquitismo en nios y osteomalacia en adultos. Existen varios tipos de vitaminas D. a) Vitamina
D2: se forma a partir del ergosterol (esterol de origen vegetal) que acta como provitamina, en
el organismo por irradiacin de los rayos ultravioleta se transforma en vitamina, b) Vitamina D3:
se forma a partir del colesterol, que acta como provitamina, mediante los rayos ultravioleta se
transforma en vitamina.
Hormonas esteroidales: Derivan del colesterol, dentro de ellas hay que destacar:
Hormonas sexuales: producidas por los rganos sexuales. Regulan el funcionamiento de los
mismos y la aparicin de los caracteres sexuales secundarios. Aqu se incluyen: la testosterona
en el hombre y los estrgenos y progesterona en las mujeres. El estradiol es una hormona
femenina que promueve la diferenciacin de los caracteres sexuales secundarios femeninos
Eicosanoides
Se llama as a los grupos de compuestos llamados prostaglandinas, leucotrienos y tromoxanos.
Los cuales derivan de de cidos grasos esenciales de 20 carbonos que contienen 3, 4 5
dobles ligaduras: cido eicosa-8,11,14-trienico (cido dihomolinolnico); cido eicosa-5,
8,11,14 -tetraenico (cido araquidnico) y cido eicosa-5,8,11,14,17-pentaenico. En
humanos el cido araquidnico es el precursor ms abundante. El cido araquidnico se puede
obtener de la dieta o se sintetiza a partir del cido linolico (18:2) que est presente en los
aceites vegetales. Se absorbe en el intestino y circula unido a la albmina. En la membrana
celular se encuentra esterificado a glicerol formando parte de los fosfolpidos.
Los eicosanoides, lo mismo que las hormonas, ejercen efectos fisiolgicos importantes
actuando en concentraciones extremadamente bajas. Por ejemplo, median: la respuesta
inflamatoria, sobre todo cuando afecta a las articulaciones (artritis reumatoide), a la piel
(psoriasis) y a los ojos. Actan en la reaccin anafilctica lenta, la produccin de dolor y fiebre.
Como reguladores de la presin sangunea y la induccin de la coagulacin de la sangre.
Adems en el control de varias funciones reproductoras tales como la induccin del parto; as
como en la regulacin del ciclo sueo/vigilia.
Los tromboxanos. Son molculas heterocclicas con un anillo formado por 5 carbonos con 1
oxgeno (oxano). Tienen estructuras parecidas a las prostaglandinas y siguen la misma
nomenclatura. Constan de un anillo y dos colas. Son formados "in vivo" a partir de
endoperxidos de prostaglandina.
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En los siguientes diagramas se ofrece una visin general y algunas consideraciones acerca de
la sntesis de eicosanoides:
Efectos Fisiolgicos
Sistema Cardiovascular
PGE2 y PGI2: Vasodilatacin.
TXs y LTs: Vasoconstriccin
PGI2: Antiagregante plaquetario.
TXA2 Agregante plaquetario.
Sistema Nervioso
PGE2 y PGI2: Vasodilatacin cerebral.
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PGE2: Termorregulacin, fiebre.
PGE2, LTB4: Mediadores del dolor, sensibilizan terminaciones
nociceptivas.
Sistema Endcrino y reproductor
PGE1 Provoca vasodilatacin cuerpos cavernosos y ereccin.
PGE2 y PGE2 Aceleran el transporte de semen.
PGE2, PGE2 Dismenorrea y menorragia en el tero ingrvido.
PGE2, PGE2 Induccin fisiolgica del parto.
PGE2 Mantiene abierto el conducto arterioso durante la vida intrauterina.
Aparato Digestivo
PGF2, TXAw, LTs: Contraccin muscular. Provocan nuseas, vmitos,
diarrea.
PGE2, PGI2: Citoproteccin gstrica.
PGE2, PGI2: Regulan flujo sanguneo y acidez gstrica.
Aparato Respiratorio
LTC4, LTD4, LTE4: Broncoconstriccin, produccin de moco y deterioro
de la funcin pulmonar.
Sistema Renal
PGE2, PGD2, PGI2: Vasodilatacin.
TXs, LTs: Vasoconstriccin.
PGE2, PGD2, PGI2: Aumenta el flujo renal (diuresis y saluresis).
PGE2, PGD2, PGI2: Aumentan la sntesis de Renina.
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Aminocidos y Protenas
Un aminocido es una pequea molcula orgnica
que contiene, al menos, un grupo amino (-NH2), de
naturaleza bsica, y un grupo carboxilo (-COOH),
de carcter cido. Aunque los seres vivos sintetizan
para distintos propsitos diversos tipos de
aminocidos, sin duda los ms importantes son los
que forman parte de las protenas, todos los cuales
pertenecen al grupo de los -aminocidos.
Como los cuatro sustituyentes del carbono son distintos y al adoptar una disposicin
tetradrica en torno a l, los -aminocidos presentan isomera ptica (enantimeros), en forma
de imagen de espejo (configuraciones D y L).
Clasificacin de aminocidos
Los aminocidos se pueden clasificar de acuerdo a diferentes consideraciones, una de las ms
aceptadas es de acuerdo a la conformacin de su cadena lateral, as se clasifican en:
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Otra clasificacin suele ser en base a la polaridad de su cadena lateral y la capacidad de
interaccionar con las molculas de agua, en ese sentido se dividen en: Hidrofbicos, Hidroflicos
y de Polaridad intermedia.
Cuando los aminocidos estn doblemente ionizados, aparece una forma dipolar inica llamada
zwitterin, donde su carga neta es cero. Esto permite definir el concepto de punto isoelctrico
(pI) de un aminocido, como el valor de pH en el cual se encuentra la mxima concentracin de
zwitterin. El punto isoelctrico, se calcula como la media de los valores de pKa de las etapas
que forma y descompone el zwitterin.
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En la figura anterior se muestra el efecto que tienen tanto el grupo carboxilo como el amino
sobre de sus respectivos valores de pKa.
Al solubilizarse un aminocido (in hbrido) en agua (por ejemplo la alanina), puede actuar
como cido (donador de protones) o como Base (aceptor de protones) dependiendo del pH:
En medio bsico (pH > 11) actan como cidos (donan H+):
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El conocimiento de las propiedades cido-base de los aminocidos es de mucha importancia
para la comprensin y el anlisis de las protenas. Por otra parte, las tcnicas de separacin,
identificacin y cuantificacin de los aminocidos presentes en una protena y el orden en que
estn colocados (secuencia) se basan tambin en su comportamiento cido-base. A
continuacin se presentan las curvas de titulacin cido-base de la glicina, el cido asprtico y
la histidina.
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El enlace peptdico
Los aminocidos se pueden unir para formar diferentes tipos de pptido (polipptidos y
protenas). Los pptidos estn formados por la unin de aminocidos mediante un enlace
covalente que se establece entre el grupo -carboxilo de un primer aminocido y el grupo -
amino del siguiente, dando lugar al desprendimiento de una molcula de agua. Este es el
denominado enlace peptdico. Al unirse dos o ms aminocidos, siempre queda un extremo
amino terminal y un grupo carboxilo terminal, independientemente de la longitud de la cadena.
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A continuacin se presenta la formacin del enlace peptdico de los aminocidos glicina y
alanina, para formar el dipptido glicilalanina.
Los aminocidos que los mamferos no pueden sintetizar son llamados aminocidos esenciales,
y deben ser incorporados en la dieta. Estos son, histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina,
fenialanina, treonina, triptfano y valina; y en las fases tempranas del desarrollo la arginina.
Todos los aminocidos son sintetizados a partir de intermediarios de la gluclisis, del ciclo de
Krebs y de la ruta de las pentosas-fosfato. Adems, la hidrlisis de protenas deja aminocidos
disponibles, los cuales son reutilizados por la clula, principalmente por la escasa disponibilidad
de nitrgeno orgnico.
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Estructura primaria.
Secuencia de aminocidos
Es la secuencia de aminocidos
de la protena. Nos indica qu
aminocidos componen la
cadena polipeptdica y el orden
en que dichos aminocidos se
encuentran. Esta estructura es
importante tanto gentica, como
estructuralmente.
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La secuencia de aminocidos est determinada por la secuencia de nucletidos del ARN
mensajero, el cual a su vez ha sido codificado de la secuencia de nucletidos del ADN, que
representa el gen de esa protena. Estructuralmente, las configuraciones siguientes, estructuras
secundaria, terciaria y cuaternaria, estn definidas por la estructura primaria, la cual especifica
el plegamiento y enrollamiento de la cadena polipeptdica, y en algunos casos la interaccin con
otros polipptidos. Por lo tanto, determina tambin la funcin de una protena. Las posibilidades
de estructuracin a nivel primario son prcticamente ilimitadas. Independientemente de la
longitud de la cadena polipeptdica, siempre hay un extremo amino terminal y un extremo
carboxilo terminal que permanecen intactos. Por convencin, la secuencia de una protena se
lee siempre a partir de su extremo amino.
Como consecuencia del establecimiento de enlaces peptdicos entre los distintos aminocidos
que forman la protena se origina una cadena principal o "esqueleto" a partir del cual emergen
las cadenas laterales de cada aminocido.
Los tomos que componen la cadena principal de la protena son el N del grupo amino
(condensado con el aminocido precedente), el C (a partir del cual emerge la cadena lateral) y
el C del grupo carboxilo (que se
condensa con el aminocido
siguiente). Por lo tanto, la unidad
repetitiva bsica que aparece en la
cadena principal de una protena es:
(-NH-C-CO-).
La comparacin de la estructura
primaria de una misma protena en
especies diversas tiene un enorme
inters desde el punto de vista
funcional y filogentico. Cuanto ms
alejadas estn las especies
analizadas en el rbol filogentico,
ms diferencias se podrn observar
en la estructura primaria de protenas
anlogas.
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A menudo se encuentra que ciertos aminocidos aparecen siempre en idntica posicin en
todas las especies estudiadas. Estos aminocidos reciben el nombre de invariantes o
conservados, y suelen ser indispensables para la funcin y estructura correcta de la protena.
Cualquier mutacin en estas posiciones puede ser letal para el organismo.
Conformacin al azar
En algunas protenas, o en ciertas regiones de la misma, no existen interacciones de suficiente
consideracin como para que se pueda distinguir un nivel de organizacin superior a la
estructura primaria. En estos casos se habla de conformacin al azar. Por ejemplo el complejo
estructural denominado dedo de zinc, muy comn en protenas que interaccionan con el DNA.
Conformacin -hlice
En la dcada de 1930, Linus Pauling propuso que el H de un grupo NH en un aminocido y el O
de un grupo C=O de otro aminocido podan interactuar para formar un puente de hidrgeno.
Esta interaccin puede formar la estructura polipeptdica denominada Hlice alfa. En una hlice
, el grupo CO del aminocido n est unido mediante puente de hidrgeno al grupo NH del
aminocido (n+4).
Las cadenas laterales de los aminocidos se sitan en la parte externa de la hlice, lo que evita
problemas de impedimentos estricos.
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Por esta razn, esta estructura puede albergar a cualquier aminocido, a excepcin de la
prolina, cuyo C no tiene libertad de giro, por estar integrado en una estructura cclica. Por este
motivo, la prolina suele determinar una interrupcin en la conformacin en hlice . Los
aminocidos muy polares, tambin desestabilizan la hlice porque los puentes de hidrgeno
pierden importancia frente a las interacciones electrostticas de atraccin o repulsin de las
cadenas cargadas. Por este motivo la estructura en hlice es la que predomina a valores de
pH en los que los grupos ionizables de las cadenas laterales, no estn cargados o ionizados. En
caso contrario, adoptan la conformacin al azar.
Cuando la cadena principal de un polipptido se estira al mximo que permiten sus enlaces
covalentes, se adopta una configuracin espacial denominada estructura , que suele
representarse como una flecha. Las estructuras de distintas cadenas polipeptdicas o bien las
estructuras de distintas zonas de una misma cadena polipeptdica pueden interaccionar entre
s mediante puentes de hidrgeno, dando lugar a estructuras laminares llamadas por su forma:
Hojas plegadas . En esta estructura las cadenas laterales de los aminocidos se sitan de
forma alternada a la derecha y a la izquierda del esqueleto de la cadena polipeptdica. Cuando
las estructuras tienen el mismo sentido NH3+ COO- la hoja resultante es paralela, y si las
estructuras tienen sentidos opuestos, la hoja plegada resultante es antiparalela.
Hojas . Las lneas punteadas indican Puentes de hidrgeno entre las hebras. Las cadenas
laterales se omiten para mayor claridad. (a) Una hoja antiparalela, (b) una hoja paralela.
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Apariencia plisada de una hoja . Las lneas punteadas indican enlaces de hidrgenos. Los
grupos R (violeta) alternados en cada cadena polipeptdica se extiende hacia lados opuestos de
la hoja y estn inscritos en cadenas adyacentes.
Giros (bucles)
Secuencias de la cadena polipeptdica con estructura o a
menudo estn conectadas entre s por medio de los llamados
giros-. Son secuencias cortas, con una conformacin
caracterstica que impone un brusco giro de 180o a la cadena
principal de un polipptido.
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Estructuras Supersecundarias
Tambin llamadas Motivos, son combinaciones de las tres estructuras secundarias anteriores
en mismo segmento de la cadena polipeptdica.
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Estructura terciaria. Interacciones entre aminocidos situados a larga distancia
La estructura terciaria es el plegamiento que la cadena polipeptdica adopta gracias a la
formacin de puentes de hidrgeno entre los tomos que forman el enlace peptdico y otras
interacciones en las cadenas laterales de aminocidos situados a larga distancia.
Para las protenas que constan de una sola cadena polipeptdica (carecen de estructura
cuaternaria), la estructura terciaria es la mxima informacin estructural que se puede obtener.
La estructura terciaria es una disposicin precisa y nica en el espacio, y surge a medida que
se sintetiza la protena. En otras palabras, la estructura terciaria est determinada por la
secuencia de aminocidos (estructura primaria).
A. Protenas con estructura terciaria de Tipo Fibroso. En este caso, los elementos de estructura
secundaria (hlices u hojas ) pueden mantener su ordenamiento sin recurrir a grandes
modificaciones, tan slo introduciendo ligeras torsiones longitudinales, como en las hebras de
una cuerda. Ejemplos el colgeno, la queratina del cabello o la fibrona de la seda.
B. Protenas con estructura terciaria de Tipo Globular. Son ms frecuentes, no existe una
dimensin que predomine sobre las dems, y su forma es aproximadamente esfrica. En este
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tipo de estructuras se suceden regiones con estructuras al azar, hlice , hoja , bucles y
estructuras supersecundarias.
Existen regiones diferenciadas dentro de la estructura terciaria de las protenas que actan
como unidades autnomas de plegamiento y/o desnaturalizacin de las protenas, denominadas
Dominios. Estas regiones constituyen un nivel estructural intermedio entre las estructuras
secundaria y terciaria. Los dominios se pliegan por separado a medida que se sintetiza la
cadena polipeptdica, es la asociacin de los distintos dominios la que origina la estructura
terciaria.
Las fuerzas que mantienen unidas las distintas cadenas polipeptdicas son las mismas que
estabilizan la estructura terciaria. Las ms abundantes son las interacciones dbiles
(hidrofbicas, polares, electrostticas y puentes de hidrgeno), aunque en algunos casos, como
en las inmunoglobulinas, la estructura cuaternaria se mantiene mediante puentes disulfuro.
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Estructura Quinaria. Asociaciones supramoleculares
En muchos casos, las protenas se agrupan entre s o con otros grupos de biomolculas para
formar estructuras supramoleculares, o sea de orden superior y que tienen un carcter
permanente.
Este nivel de asociacin recibe el nombre de estructura quinaria, la cual puede ser de dos tipos:
asociaciones entre protenas y asociaciones de protenas con otras biomolculas.
Desnaturalizacin
Consiste en la prdida de la estructura tridimensional o conformacin nativa por romperse los
enlaces de la estructura cuaternaria, terciaria o secundaria, afectando la funcin biolgica de la
protena. Este proceso recibe el nombre de desnaturalizacin. Todas las protenas
desnaturalizadas tienen la misma conformacin, muy abierta y con una interaccin mxima con
el disolvente, por lo que una protena soluble en agua cuando se desnaturaliza se hace
insoluble en agua y precipita. La desnaturalizacin se puede producir por factores como
cambios de temperatura (huevo cocido o frito) y presin, variaciones del pH, alta salinidad, etc.
Solubilidad
Normalmente, las protenas globulares son solubles es agua, mientras que las protenas con
estructura terciaria fibrilar, al ser alargadas son insolubles. La solubilidad se debe a las
caractersticas de los radicales R, muchos de los aminocidos apolares se sitan en el interior
de la estructura, y los polares, que pueden establecer puentes hidrgeno con las molculas de
agua, se localizan en la periferia donde quedan solvatados. Esta capa de agua impide la unin
entre protenas. Si se pierde la capa de solvatacin, las protenas se unen entre s y forman un
agregado insoluble que precipita.
Capacidad amortiguadora
Al igual que los aminocidos, las protenas tienen un comportamiento anftero, debido a la
existencia de grupos ionizables en las cadenas laterales y de grupos COOH y NH2
terminales. Esto permite que sean capaces de neutralizar las variaciones de pH del medio, ya
que pueden comportarse como un cido (donando e-) o una base (aceptando e-) del medio
donde se encuentran. Habr un pH donde la carga neta de la protena sea nula, ese valor es el
punto isoelctrico, el cual es caracterstico de cada protena.
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Clasificacin de las protenas
Desde el punto de vista qumico, las protenas se clasifican en dos grupos, holoprotenas,
formadas solamente por aminocidos, y heteroprotenas, que estn formadas por una fraccin
proteica y un componente no proteico que se denomina grupo prosttico, el cual puede ser un
azcar, un lpido, un cido nucleico, un grupo heme o simplemente un in inorgnico. En
ausencia del grupo prosttico, la protena no es funcional y se llama apoprotena.
Por su funcin pueden ser estructurales, las cuales dan apoyo estructural a las clulas y tejidos
(como las glicoprotenas que forman parte de las membranas, o las histonas que forman parte
de los cromosomas); de transporte (como las que realizan transporte transmembranal en ambos
sentidos); de defensa, que protegen al organismo contra posibles ataques de agentes extraos
(como las protenas relacionadas con la patognesis); hormonales; enzimticas, que de hecho
son las ms numerosas y especializadas, las cuales aumentan la velocidad de las reacciones
qumicas, y de reserva (como la Ovoalbmina de la clara de huevo, la Gliadina del grano de
trigo, y la Lactoalbmina de la leche).
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Todas las reacciones qumicas del metabolismo celular se realizan gracias a la accin de
ciertas molculas de origen proteico llamadas: Enzimas. Entonces, con excepcin de cierto tipo
de ARN (ARN cataltico, llamado ribozimas), las enzimas son biocatalizadores de naturaleza
proteica, capaces de funcionar fuera de la clula u organismo que las produce.
Las enzimas se encargan de acelerar las reacciones bioqumicas del metabolismo sin alterar el
estado de equilibrio ni el balance energtico de de dichas reacciones. La sustancia sobre la que
acta una enzima se denomina sustrato.
Un Poco de Historia: Pasteur descubri que la fermentacin del azcar mediante levaduras, con
su conversin en alcohol etlico y anhdrido carbnico era catalizada por fermentos.
En 1897 Buchner logr extraer de las clulas de levadura las enzimas que catalizan la
fermentacin alcohlica
1. Especificidad. Debido a su naturaleza proteica las enzimas son molculas muy especficas.
En general presentan dos tipos de especificidad:
2. Eficacia. Son eficaces en pequeas cantidades. Tienen un nmero de recambio alto, que
vara entre 100 y 36 millones. El nmero de recambio o actividad molar, se define como la
cantidad de substrato transformado en la unidad de tiempo por una cantidad dada de enzima.
Por ej. la catalasa hidroliza 5.6x106 molculas de H2O2 por molcula de enzima por minuto.
Las enzimas tienen pesos moleculares que oscilan entre 12.000 y un milln de Daltons.
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Estructura de las enzimas
En cada enzima existe una regin, denominada centro activo, este es una pequea regin de la
enzima que constituye una hendidura o depresin en su superficie, a la que se unen
el sustrato (reaccionante) y los cofactores (si los hay) y donde transcurre la reaccin de manera
acelerada (catlisis), es decir, donde el sustrato se transforma en producto.
a) Enzimas simples: las que estn constituidas por una o varias cadenas
protenicas.
b) Holoenzimas: las que estn formadas por una parte proteica llamada apoenzima
y otra no proteica denominada cofactor.
El cofactor puede ser una molcula inorgnica (iones metlicos como Fe, Cu, Zn, Mn, Mg, etc.)
o puede ser una molcula orgnica. En este caso, si la unin al apoenzima es covalente se
denomina grupo prosttico y si no es covalente coenzima.
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Las enzimas que requieren de iones metlicos como cofactores se llaman metaloenzimas. En
estas enzimas los iones metlicos pueden actuar como:
a) como el centro cataltico primario
b) como grupo puente para unir al sustrato y la enzima y
c) como agente estabilizante de la conformacin de la enzima en su forma
catalticamente activa.
Esto resalta la importancia de los minerales para el buen funcionamiento y crecimiento de los
seres vivos. Aunque la mayora de los minerales no se requieren en grandes cantidades.
Las coenzimas generalmente son vitaminas derivados de vitaminas. Las vitaminas se definen
como compuestos orgnicos que en concentraciones muy bajas (trazas) son vitales para el
funcionamiento adecuado de las clulas, por lo que en el caso de los organismos hetertrofos,
es necesario consumirlas en la dieta. Enseguida se presentan algunas de las principales
vitaminas que actan como coenzimas.
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3. Hidrolasas: son las que aceleran reacciones de hidrlisis en las que se rompe
una molcula por introduccin de una molcula de agua disociada en sus
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componentes: OH- y H+. Por ejemplo las estearasas, las peptidasas y las
glucosidasas.
6. Ligasas: las aceleran reacciones en las que dos o ms molculas se unen para
dar otra ms compleja. Catalizan la formacin de enlaces y precisan energa que
procede del ATP.
Enseguida se presentan las clases y algunas de las subclases correspondientes a cada clase.
La nomenclatura de la IUB comienza con las siglas EC (que significa Enzyme Commission)
seguida por el numero de la clase, luego la subclase, la sub subclase y el cuarto nmero, es el
nmero de serie de la enzima asignado arbitrariamente en la sub-subclase. Por ejemplo, en la
enzima EC 3.4.17.1.
El nmero 3 ndica que la enzima pertenece a la clase de las hidrolasas, el 4 ndica que acta
sobre el enlace peptdico (C-N), el nmero 17 designa la sub-subclase metalo-
carboxipeptidasas. El cuarto nmero (1) es el nmero de serie. La enzima en cuestin es la
carboxipeptidasa A, la cual tiene un ion Zn2+ como cofactor que es esencial para su actividad
cataltica.
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Catlisis molecular
Un catalizador modifica la velocidad de una reaccin qumica sin ser utilizado o aparecer como
uno de los productos de la reaccin. En una reaccin bioqumica en la que un substrato (S) se
transforma en un producto (P), utilizando una enzima (E):
Esta reaccin puede ocurrir siempre y cuando en un momento dado, cierta fraccin de
molculas de S, posea mucho ms energa que el resto de ellas, la suficiente para que
alcancen un estado activado, llamado Estado de transicin, en el que la energa es tal que
puede formarse o romperse un enlace qumico, para generar el producto (P). El estado de
transicin est en el lmite del valor de energa que separa a los reactivos de los productos. En
el estado de transicin La velocidad de reaccin es proporcional a la concentracin de cada una
de las especies qumicas (reactivos o productos).
Segn la Teora de Michaelis-Menten la enzima (E), se combina con el substrato (S) formando
el complejo de transicin, enzima-substrato (E-S), mediante una reaccin reversible, cuya
energa de activacin es menor que la de la reaccin no catalizada. Cuando se forma el
producto de la reaccin (P), se regenera de nuevo la enzima (E) de forma libre, la que puede
combinarse de nuevo con otra molcula de substrato (S).
La velocidad de las reacciones catalizadas por las enzimas, se debe principalmente a dos
factores descritos por Svante August Arrhenius, un fisicoqumico sueco (1859-1927). En primer
lugar, las enzimas disminuyen considerablemente la energa de activacin, necesaria para que
las molculas reaccionen, como se detalla en la grfica siguiente:
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En segundo lugar las enzimas poseen un sitio cataltico o sitio activo, donde el sustrato y los
cofactores necesarios, se encuentran con la estreo especificidad adecuada para que
interaccionen correctamente, a diferencia de lo que ocurre en la reaccin no catalizada, en que
las molculas chocan al azar en cualquier posicin.
Las enzimas presentan dentro de su estructura proteica 2 regiones o sitios importantes para la
realizacin de su actividad cataltica. Existe el llamado sitio de reconocimiento, que reconoce y
liga al sustrato y el sitio cataltico, el cual una vez unido el sustrato, cataliza la reaccin. Estos 2
sitios estn adyacentes uno al otro en la forma activa de la enzima e incluso, en ocasiones, el
sitio cataltico es parte del sitio de reconocimiento. Estas 2 regiones en conjunto reciben el
nombre de Centro activo de la enzima.
La hiptesis de la llave y cerradura, sugiere que el sitio de unin con el sustrato, es un sitio
preformado que existe en la estructura de la enzima an sin que el sustrato est unido. Por su
parte, la hiptesis del acoplamiento inducido, sugiere que la molcula de sustrato induce un
cambio conformacional en el sitio activo de la enzima de tal forma que quedan perfectamente
acoplados. El cambio de forma de la enzima facilita la interaccin enzima-sustrato y la reaccin.
Los estudios por rayos-X han revelado que los sitios de unin del sustrato de la mayor parte de
las enzimas se hallan preformados (llave y cerradura), sin embargo la mayor parte de dichos
sitios exhiben cierto grado de acoplamiento inducido al unirse al sustrato. Por lo que ambas
hiptesis con complementarias. Despus que la reaccin ocurre y se libera el producto, el sitio
activo recupera su forma libre y la enzima vuelve a la conformacin inicial para fijar una nueva
molcula de sustrato.
Rutas bioqumicas
Los organismos contienen diferentes
clases de enzimas que catalizan una
gran variedad de diferentes reacciones.
Cuando una ruta bioqumica est funcionando, el sustrato inicial est siendo continuamente
convertido hasta el producto final a travs de una serie de pasos.
Mecanismo Cataltico
A pesar de una intensa dedicacin al estudio de la catlisis enzimtica, solo se ha podido
obtener informacin detallada acerca de los mecanismos de accin de un escaso nmero de
enzimas.
Se ha demostrado que las enzimas utilizan los mismos mecanismos catalticos que los
catalizadores no enzimticos. Sin embargo, las enzimas tienen un efecto cataltico
significativamente superior porque la conformacin de su sitio activo est especficamente
orientada para promover la reaccin. Adicionalmente los efectos de proximidad y deformacin
molecular, los tipos de catlisis cido base y covalente, y la estabilizacin del estado de
transicin (disminucin de la energa de activacin necesaria), contribuyen en gran medida a la
catlisis enzimtica.
Se puede aprender sobre los mecanismos de reaccin enzimtica al analizar ciertas reacciones
en compuestos modelo. En este tipo de modelos los desplazamientos o reordenamientos de
electrones se representan con flechas curvas al ir transformando los reactivos en productos. El
desplazamiento de electrones se da de tomos ricos en electrones hacia tomos que son
deficitarios y los atraen. Por ejemplo consideremos una reaccin entre una amina y un grupo
carbonilo (aldehdo o ceto):
Catlisis cido-base
Si consideramos la tautomerizacin de un compuesto con grupo funcional ceto a un grupo enol,
se podr observar que la velocidad de reaccin es sumamente lenta, debido a la elevada
cantidad de energa libre que se requiere para alcanzar el estado de transicin (en este caso un
carbanin).
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Las cadenas laterales de los aminocidos asprtico, glutmico, histidina, cistena, tirosina y
lisina tienen valores de pK dentro del rango de pH fisiolgico, o cercano a l, lo que les permite
participar en las catlisis cido-base. Esto hace que la catlisis cido-base concertada, sea un
mecanismo de catlisis enzimtica muy comn. La figura siguiente representa el mecanismo de
la RNAasa A (una enzima digestiva secretada por el pncreas de bovinos, capaz de catalizar el
desdoblamiento del RNA a sus nucletidos correspondientes.
Se ha logrado establecer que la RNAasa A tiene dos residuos de histidina que actuan en forma
concertada como catalizadores generales base y cido. En el primer paso, la histidina 12 acta
como base y extrae el protn del grupo OH del carbono 2 de un determinado nucletido de la
cadena de RNA; esto hace que se promueva el ataque nucleoflico del oxgeno al fsforo
adyacente. Enseguida la histidina 119 actuando como cido cede un protn al grupo que se
elimina a la vez que el nucletido terminal del RNA forma un intermediario cclico.
En el segundo paso, ingresa una molcula de agua al sitio activo de la enzima. Ahora la
histidina 119 actuar como base al ganar un protn del agua y la histidina 12 actuar como
cido cediendo un protn para deshacer el anillo del grupo fosfato en los carbonos 2y 3 y
liberar as al RNA restante.
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Catlisis covalente
Otra alternativa para acelerar las reacciones bioqumicas es la formacin inestable de un enlace
covalente transitorio entre la enzima y el sustrato. En este caso la enzima utiliza uno de sus
grupos funcionales para reaccionar covalentemente con el sustrato. Por lo general el enlace
covalente se forma mediante el ataque de un grupo nucleoflico de la enzima sobre un grupo
electroflico del sustrato, por lo que con frecuencia, este tipo de catlisis se llama tambin
catlisis nucleoflica.
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Las Isozimas y aloenzimas pueden tener diferentes parmetros cinticos (por ejemplo
diferentes valores de KM), o propiedades de regulacin diferentes.
Zimgenos o Proenzimas
Son precursores inactivos de las enzimas. Un zimgeno es una molcula que necesita ser
activada para convertirse en una enzima activa, por lo que es ms exacto decir que los
zimgenos son precursores de enzimas, que decir que son enzimas inactivas.
Las enzimas digestivas, algunos factores de la coagulacin y otras protenas son sintetizadas
como zimgenos. La sntesis de enzimas en forma de zimgenos es uno de los mecanismos
de seguridad con que cuenta el organismo para su supervivencia. Por ejemplo, la sntesis de
enzimas digestivas en forma inactiva es un mecanismo de seguridad para las clulas que
sintetizan esas enzimas, ya que las enzimas proteolticas sintetizadas como zimgenos no son
activadas hasta que abandonan la clula y son secretadas al tracto gastrointestinal.
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cidos Nucleicos
Estructura y Funcin
Las purinas son: adenina y guanina y ambas pueden formar parte tanto del DNA como del RNA.
Las pirimidinas son: citocina, timina y uracilo. La citocina tambin puede formar parte de ambos
cidos nucleicos. Pero la timina solo puede formar DNA y mientras que el uracilo solo est
presente en el RNA.
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DNA RNA
Peso molecular Mayor Menor
Azcar Tiene desoxirribosa Tiene ribosa
Base nitrogenada Presenta timina Contiene uracilo
Configuracin espacial Doble hlice con Generalmente una sola cadena que
complementariedad de bases ocasionalmente puede presentar
apareamientos intracatenarios
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Hoy sabemos que las molculas de DNA son biopolmeros formados por la unin de miles o
millones de 4 desoxirribonucletidos fosfatados en el carbono 5. Que solo hay un tipo de
enlace que mantiene unidos a los nucletidos: el enlace fosfodister. Que dicho enlace
nicamente se da entre el grupo hidroxilo del carbono 3 de la desoxirribosa de un nucletido y
el grupo fosfato presente en el carbono 5 de la desoxirribosa del siguiente nucletido. Sabemos
tambin que estos 4 desoxirribonucletidos monofosfato, difieren entre s exclusivamente en el
tipo de base nitrogenada que contiene. Dichas bases son la adenina (A), la guanina (G), la
timina (T) y la citosina (C). Que estas bases siempre se aparean de siguiendo un patrn nico:
la A se aparea con la T mediante dos puentes de H y la G se aparea solo con la C mediante
tres puentes de H.
Es tambin conocido que con excepcin de algunos virus, el DNA siempre se presenta tambin
como una doble cadena de nucletidos conformados en una espiral altamente ordenada.
Durante la dcada de 1920, la mayora de los trabajos sobre la estructura qumica del DNA
fueron desarrollados por Phoebus A. Levene. Levene identific a la ribosa como uno de los
azcares de los cidos nucleicos. A los cidos nucleicos que posean ribosa los llamaron cido
ribonucleico o ARN (RNA). Posteriormente, en 1929, Levene demostr que el DNA contena
otro azcar de cinco carbonos, la desoxirribosa, que difera levemente de la ribosa. De esta
manera, este cido nucleico se llam DNA (cido desoxirribonucleico). Levene tambin
demostr que el DNA est formado por desoxirribosa, un grupo fosfato y cuatro bases
nitrogenadas: adenina y guanina (purinas) y timina y citosina (pirimidinas).
Determinar que el DNA es el material hereditario llev muchos aos de estudio. En el siglo XIX
se saba que el ncleo celular contena una sustancia, llamada nuclena, la cual estaba formada
por una parte cida (DNA) y una parte bsica (protena). Hasta la dcada de1940, an se crea
que la informacin gentica (los genes) estaba contenida en las protenas. Antes de esa poca,
los cidos nucleicos se consideraban demasiado simples, formados tan solo por 4 clases de
monmeros y se deca que simplemente eran una sustancia estructural del ncleo. Se pensaba
que era ms probable que los genes estuvieran formados por protenas, que eran molculas
mucho ms complejas.
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Un primer trabajo que a futuro permitira dilucidar que el DNA era el material gentico fue
desarrollado por Frederick Griffith en 1928.
El experimento de Griffith consisti en inocular ratones con clulas (S) patgenas que moran y
clulas (R) no patgenas que permitan que el ratn permaneciera vivo. Si las bacterias
patgenas (S) se sometan a calentamiento perdan su virulencia y al inyectarse a ratones,
estos seguan vivos.
Sin embargo, Al inyectar a un ratn con una mezcla de clulas de la estirpe R vivas y clulas
de la estirpe S muertas con calor, el ratn muere de neumona (y se recuperan clulas S vivas
del cadver). Conclusin: clulas de la estirpe R se transformaron en clulas de la estirpe S
(convirtindose en clulas "virulentas"), por la accin de un "agente transformante" presente en
las clulas S muertas. Este fenmeno se conoci como "transformacin" y lo que causaba la
conversin se llam "factor transformador".
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Posteriormente Oswald Avery, Colin MacLeod y Maclyn McCarty se interesaron en los trabajos
de Griffith y en 1944 publicaron que al fraccionar un extracto obtenido a partir de las clulas S,
eliminando las protenas, los lpidos, los polisacridos, y el RNA no se observaba disminucin
de la capacidad de transformacin en ningn caso. Sin embargo, al purificar el DNA, observaron
que por s misma esta molcula, mostr una elevada capacidad de transformacin, convirtiendo
las clulas R en S. Avery y sus colegas concluyeron que el DNA extrado de la estirpe virulenta
portaba el mensaje hereditario de la virulencia. No obstante, algunos cientficos mantenan que
las protenas presentes en el DNA como impurezas podran ser responsables de este cambio
gentico. Esta posibilidad fue eliminada al encontrar que el tratamiento del DNA con enzimas
proteolticas no limitaba las propiedades transformadoras del DNA, mientras que el tratamiento
con nucleasas si lo haca.
En primer lugar, infectaron bacterias de E. coli que crecan en un medio normal con los fagos T4
marcados en su DNA con P32 e inmediatamente despus de la infeccin agitaron violentamente
la mezcla en una batidora, de esta manera trataban de separar las bacterias de los fagos.
Posteriormente centrifugaban de forma que las bacterias al ser ms grandes y pesadas se
depositaban en el fondo del tubo, mientras que las cpsides de los virus ms pequeas
quedaban en solucin. Despus de centrifugar observaron que el marcaje correspondiente al
P32 apareca en el fondo del tubo donde estaban las bacterias, mientras que en la solucin,
donde estaban las cpsides de los fagos, no apareca marcaje debido al P32. Los virus
descendientes de las clulas infectadas tenan marcado su DNA con P32.
El segundo experimento consisti en infectar bacterias que crecan en un medio normal con
fagos marcados en sus protenas con S35. En este caso, la mayor parte del marcaje (80%)
correspondiente al S35 estaba en la solucin, donde se encontraban las cpsides; mientras que
en el fondo del tubo, lugar en el que estaban las bacterias, haba muy poco marcaje debido al
S35 de las protenas. Los virus descendientes de esta infeccin no tenan marcadas sus
cpsides con S35. Los resultados obtenidos, Hershey y Chase concluyeron que el material
gentico viral era el DNA y no la protena, lo cual reforz las observaciones realizadas
anteriormente por Avery.
En 1949, el bioqumico Erwin Chargaff analiz el contenido molar de las bases nitrogenadas en
el DNA procedente de diversos organismos y descubri que en todos los casos, la
concentracin molar de Adenina es igual a la concentracin de Timina y la de Guanina es igual
a la de Citosina:
[A] = [T] y [G] = [C]
O lo que es lo mismo,
[A+G] = [T+C]
[Purinas] = [Pirimidinas]
Estableciendo as uno de los principios bsicos para elucidar la estructura y funcin del DNA, la
llamada ley de Chargaff.
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Los primeros trabajos acerca de la configuracin espacial de la molcula de DNA se realizaron
durante los primeros aos de la dcada de la dcada de los 50s. Dichos trabajos estuvieron a
cargo de Maurice Wilkins y Rosalind Franklin quienes realizaron los primeros estudios
mediante la tcnica de difraccin de rayos X.
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se va formando al enlazar los fosfatos del carbono C5de un nucletido al C3' de otro
nucletido. As cada hebra tiene un extremo 5 y un extremo 3.
4.- Las bases de una hebra estn enfrentadas con las de la otra, formando los llamados pares
de bases (PB) colocadas en forma perpendicular al eje de la hlice.
5.- Los pares de bases estn formados siempre por una purina y una pirimidina, de forma que
ambas cadenas estn siempre equidistantes, a 10.85 una de la otra.
La Forma B fue la propuesta por Watson y Crick. Es una hlice dextrgira, con las bases
complementarias situadas en planos horizontales, de manera que el eje de la molcula
atraviesa dichos planos por su centro. Es la forma ms comn en la que existe el DNA en
dispersin acuosa (92% agua).
Estructura primaria
Es la secuencia de desoxirribonucletidos de una de las
cadenas. La informacin gentica est contenida en el
orden exacto de los nucletidos de Adenina, Guanina,
Citosina y Timina. Los nucletidos se unen entre s
mediante el grupo fosfato del segundo nucletido, que
sirve de puente de unin entre el carbono 5' del primer
nucletido y el carbono 3' de siguiente nucletido. Como
el primer nucletido tiene libre el carbono 5' y el
siguiente nucletido tiene libre el carbono 3', se dice que
la secuencia de nucletidos se ordena desde 5' a 3' (5'
3').
Estructura secundaria
Es la estructura en doble hlice de Watson y Crick que
permiti explicar el almacenamiento de la informacin
gentica y el mecanismo de duplicacin del DNA.
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Estructura terciaria o primer nivel de empaquetamiento
El DNA de procariontes presenta una estructura terciaria, que se halla retorcida sobre s misma,
formando una especie de super-hlice. Esta disposicin se denomina DNA superenrollado. Este
enrollamiento da estabilidad a la molcula y reduce su longitud. Vara segn se trate de
organismos procariontes o eucariontes. En procariontes se pliega como una super-hlice en
forma, generalmente, circular y asociada a una pequea cantidad de protenas. Lo mismo
ocurre con el DNA circular de las mitocondrias y los cloroplastos.
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cromatosoma. En conjunto de la estructura la fibra de cromatina laxa mide 100 de dimetro y
tiene un aspecto repetitivo en forma de collar de perlas, donde las perlas seran los
nucleosomas, unidos por los linker.
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Niveles superiores de empaquetamiento.
La fibra de 300 se compacta mas formando una
serie de bucles que posiblemente estabilizan
ciertas protenas del eje del cromosoma. Algunos
autores consideran que en el cromosoma existe
un eje de protena no histnico, el llamado
armazn central o andamio, sobre el que se
anclan los bucles.
Seis bucles formaran una roseta, y treinta rosetas seguidas, dispuestas en espiral formaran un
rodillo o vuelta en espiral, que constituye el cuarto nivel de empaquetamiento. El quinto y ltimo
nivel, el cromosoma, estara formado por la sucesin de rodillos.
En los cromosomas se la longitud de la molcula de DNA se reduce unas 10000 veces, debido
a su alto grado de empaquetamiento (bucles, rosetas y rodillos).
Tipos de DNA
a) DNA lineal bicatenario. Esta es la forma en que las molculas de DNA aparecen formando la
cromatina del ncleo de las clulas eucariotas. Pudiendo pasar por los diferentes grados de
empaquetamiento hasta formar los cromosomas.
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b) DNA circular bicatenario. Es la forma del DNA genmico de los procariontes. El cromosoma
bacteriano es circular y aparece desnudo (no asociado a protenas). Tambin es la forma del
DNA en cloroplastos, mitocondrias y plsmidos.
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Permite realizar estudios de similitud gentica entre dos cidos nucleicos de especies o grupos
taxonmicos distintos. Tambin permite detectar fragmentos de DNA complementarios a
fragmentos monocatenarios de secuencia conocida (sondas).
Cuando Watson y Crick propusieron el modelo de estructura en doble hlice del DNA, sugirieron
tambin un posible mecanismo para la replicacin de esta molcula. Debido a la
complementariedad de las cadenas, cada una de
ellas podra servir de molde para la sntesis de
una nueva cadena complementaria.
El experimento de Matthew Meselson y Franklin Stahl (1958) demostr que la replicacin del
DNA ocurre segn el modelo semiconservativo. Para determinar la manera de replicarse el DNA
disearon el siguiente experimento: cultivaron bacterias Escherichia coli en un medio de cultivo
que contena el istopo pesado del nitrgeno, 15N. Despus de crecer en este medio durante
varias generaciones, el DNA de E. coli era ms denso.
La densidad de las molculas de DNA se puede determinar usando una tcnica conocida como
centrifugacin en gradiente de densidad. Para obtener el gradiente de densidad sometieron una
solucin de cloruro de cesio (Cs Cl) a una ultracentrifugacin durante varias horas. Se alcanza
as un equilibrio entre la difusin y la fuerza centrfuga de manera que se establece un gradiente
de densidad en el tubo con una concentracin creciente de CsCl desde la boca hasta el fondo
del tubo. Si se aade DNA se concentrar y formar una banda en el punto del tubo donde su
densidad sea igual a la del CsCl en ese punto. Si hay varios DNA con densidades distintas,
formarn varias bandas.
Las bandas se pueden detectar observando los tubos con luz ultravioleta de longitud de onda
de 260 nm, que es absorbida fuertemente por los cidos nucleicos.
Meselson y Stahl transfirieron las bacterias con DNA pesado a un medio con 14N (istopo
normal) y observaron la densidad del DNA de las bacterias al cabo de distintas generaciones.
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primera generacin (una de DNA pesado y otra de DNA ligero) y si la replicacin fuese
dispersiva no obtendran una banda de DNA ligero en la segunda generacin.
La replicacin del DNA es un proceso muy complejo, en el que participan muchas enzimas y
protenas distintas, cada una con una funcin especfica. El conjunto de enzimas y protenas
actuando coordinadamente sobre una molcula de DNA duplicndose se conoce como
Replisoma.
En procariotas hay un solo origen pero en eucariotas hay mltiples puntos de origen. Una vez
reconocido el origen se produce la separacin de las dos cadenas en ese punto, formndose
as una burbuja cuyos extremos se denominan horquillas de replicacin. La replicacin es un
proceso bidireccional, por tanto, las horquillas avanzan en sentidos opuestos, como dos
cremalleras que se abren a partir del mismo punto inicial. En las bacterias, al ser circular el
cromosoma, la replicacin termina cuando se encuentran las dos horquillas. En los cromosomas
eucariotas la replicacin se inicia simultneamente en millares de orgenes y termina cuando
confluyen los millares de burbujas de replicacin.
Las helicasas son las enzimas encargadas de abrir la doble hlice, rompiendo los puentes de
hidrgeno. Para ello utilizan la energa del ATP. Su actuacin crea una horquilla de replicacin.
Como consecuencia, se genera un superenrollamiento por delante de la horquilla y, por tanto,
una tensin que ser aliviada por las topoisomerasas. Las protenas SSB (single-stranded DNA
binding proteins o protenas de unin a cadena sencilla de DNA) son protenas encargadas de
la estabilizacin del DNA monocatenario generado por la accin de las helicasas, impidiendo
as que el DNA se renaturalice o forme estructuras secundarias, de manera que ste pueda
servir de molde para la replicacin de la doble hlice.
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A medida que la enzima helicasa abre la doble hlice, las enzimas topoisomerasas van
disminuyendo la tensin torsional acumulada por el superenrollamiento en el sector no replicado
de la doble hlice. Lo hacen cortando una o las dos hebras por delante de la horquilla de
replicacin, dejando que giren y volviendo a unir.
Las enzimas que desempean el papel principal en la sntesis de las nuevas cadenas de DNA
son las DNA-polimerasas. Hay 3 tipos de DNA polimerasas.
La DNA polimerasa III sintetiza las nuevas hebras en sentido 5-3, ya que la lectura se hace en
el sentido 3-5. La DNA polimerasa I se encarga de la sntesis primers de RNA y de su
posterior remocin. Las DNA polimerasas I y III, se encargan de la correccin de errores
durante la replicacin. Por su parte la DNA polimerasa II, corrige daos causados por agentes
fsicos.
Finalmente es una enzima ligasa la que cataliza la formacin de los enlaces entre los
fragmentos resultantes. Si durante la replicacin la DNA-pol III inserta un nucletido errneo,
puede reconocer su incapacidad para enlazarse al nucletido complementario de la hebra
molde. Entonces retrocede y elimina por hidrlisis el nucletido errneo, gracias a su actividad
exonucleasa 3-5. A continuacin introduce el nucletido correcto. La adicin de cada
nucletido es comprobada a medida que la horquilla se desplaza a lo largo de la cadena molde,
lo que garantiza la fidelidad de la replicacin, que transcurre con un error no superior a 1 por
cada 109 o 1010 nucletidos.
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La duplicacin en Eucariontes es similar a la de los procariontes,
es decir, semiconservativa y bidireccional.
Es el AN ms abundante en la clula. Una clula tpica contiene 10 veces ms RNA que DNA.
El azcar presente en el RNA es la ribosa. Esto indica que en la posicin 2' del anillo del
azcar hay un grupo hidroxilo (OH) libre. Por este
motivo, el RNA es qumicamente inestable, de forma que
en una disolucin acuosa se hidroliza fcilmente.
Es un RNA de alto peso molecular, tambin conocido como transcrito primario del RNA, ya que
es el RNA recin sintetizado por alguna de las RNA polimerasas en el proceso de transcripcin.
En clulas procariotas, el transcrito primario acta directamente como molde para la sntesis de
protenas. Mientras que en el ncleo de las clulas eucariotas acta como precursor de los
dems tipos de RNA que se encuentran en el citoplasma.
La transformacin o fragmentacin del RNAhn para formar otros tipos de RNA constituye la
maduracin o procesamiento del RNA.
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RNA mensajero
Es una molcula corta y lineal de hasta 5000 nucletidos (A, U, G y C), de vida corta y
estructura primaria. Se origina a partir del ARN heterogneo nuclear, que es sintetizado por la
RNA polimerasa II.
El ARN heterogneo nuclear (ARNhn) tiene unos segmentos con informacin llamados exones
y otros sin informacin llamados intrones. Tras un proceso de maduracin, elimina los intrones y
forma ARNm, que tiene en su inicio una caperuza, que constituye la seal de inicio de la
sntesis proteica, y al final una cola de poli A (muchas adeninas), que tiene funcin
estabilizadora. Se forma en el ncleo y viaja hasta el citoplasma.
Est formado por molculas pequeas. Tiene forma de hoja de trbol, con 4 brazos con
estructura primaria y secundaria. Tres de los brazos tienen
un asa o bucle, son los brazos D, T y uno llamado
anticodn. El cuarto es un brazo aceptor de aminocidos,
con un extremo (3) ms largo que otro que termina
siempre en el triplete CCA y es por la A por la que se unir
a un aminocido.
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Los ribosomas se diferencian por su velocidad de sedimentacin, que se mide en Svedberg
(1S = 10-13 s) s = segundos. En clulas procariotas los ribosomas son 70S, formados por dos
subunidades, 30S y 50S. En clulas eucariotas son 80S ( 40 S subunidad pequea y 60 S la
subunidad grande).
La informacin contenida en la secuencia de nucletidos del DNA podra generar protenas; sin
embargo el ADN est en el ncleo y las protenas se sintetizan en los ribosomas, los cuales
estn situados en el citoplasma. El intermediario result ser un RNAm
Transcripcin
Cada vez que la clula necesita de alguna sustancia qumica orgnica, se recurre al proceso de
transcripcin. En este, la informacin gentica (un gen) que contiene el DNA del organismo
usada para la construccin de una molcula de RNA.
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Todo este proceso es realizado por las enzimas RNA polimerasas. La RNA polimerasa I se
encarga de formar RNA ribosomal, La RNA polimerasa III se encarga de la sntesis de los RNA
de transferencia y la RNA polimerasa II de la construccin de RNA mensajero.
En el caso de la sntesis de RNA mensajero todo el proceso lo realiza la RNA pol II. Cuando va
a iniciar la transcripcin, la polimerasa se une al DNA en una secuencia especfica (consenso)
denominada secuencia promotora o promotor; abre la doble hlice en una pequea regin y, as
se forma una burbuja de transcripcin, quedando expuestos los nucletidos de una secuencia
corta de DNA. En la tabla siguiente se anotan algunos promotores.
Luego en una secuencia especfica se tiene una seal de inicio de la transcripcin, all la
polimerasa inicia y va aadiendo ribonucletidos, movindose a lo largo de la cadena molde,
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desenrollando la hlice y exponiendo as nuevas regiones con las que se aparearn los
ribonucletidos complementarios.
Iniciacin
Comienza por el triplete iniciador del ARNm (AUG), que est prximo a la caperuza 5'. Este
triplete va precedido de la secuencia AGGAGG (secuencia de Shine-Dalgarno ) que es la zona
de unin con el ribosoma.
El cdigo de iniciacin es el AUG que codifica para el aminocido metionina (Met).
La traduccin no ocurre si no est el codn AUG, por lo
tanto la metionina (en realidad la formil-metionina, f-Met ) es
siempre el primer aminocido de la cadena polipeptdica, y
frecuentemente se elimina al final del proceso.
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Introduccin a la Bioenergtica
Conceptos
La bioenergtica comprende todos los intercambios (transducciones) de energa que ocurren
en el metabolismo. Estos cambios siguen las mismas leyes y principios fsicos que cualquier
otro proceso natural. En otras palabras y de manera general, podemos establecer que la
bioenergtica es la aplicacin de la termodinmica a los sistemas biolgicos, incluyendo todas
las transformaciones de energa que se producen en los seres vivos.
El equilibrio qumico no debe considerarse como aquel estado en el que cesa todo movimiento
molecular; sino que por el contrario es un estado dinmico en el cual la concentracin de las
sustancias reaccionantes no se modifica porque la velocidad de reaccin entre los reactivos
para la formacin de productos, es exactamente igual a la velocidad de restablecimiento de
reactivos a partir de los productos.
La ley de accin de las masas de Guldberg y Waage establece que: La velocidad de una
reaccin qumica es proporcional al producto de las concentraciones molares de las sustancias
reaccionantes, cada una elevada a una potencia igual al nmero de molculas que aparecen en
la ecuacin balanceada
De acuerdo con esta ley, consideremos la reaccin de los compuestos A y B para formar los
productos C y D, segn la siguiente ecuacin:
aA + bB cC + dD
Luego, como en el equilibrio ambas velocidades son iguales: - kD [A]a [B]b = - kI [C]c [D]d
- kD [C]c [D]d
Reagrupando trminos: = = K
- kI [A]a [B]b
El cociente de las dos constantes de velocidad da como resultado otra constante, que denomina
constante de equilibrio (K). Por esta razn la constante de equilibrio se calcula en base a la
multiplicacin de la concentracin de cada producto en el equilibrio, elevada su coeficiente
estequiomtrico respectivo, dividida entre el producto de las concentraciones de los reactivos en
equilibrio tambin elevada sus respectivos coeficientes estequiomtricos.
A travs de los aos, ante la necesidad de explicarse el hecho de que ciertos procesos ocurran
en forma espontnea, mientras que otros requeran de la aplicacin de ciertas condiciones para
ser inducidos, se crearon diferentes criterios de espontaneidad.
Por ejemplo, al disolver hidrxido de sodio en agua, el proceso ocurre de manera natural y la
mezcla se siente ms caliente, sntoma indiscutible de que la reaccin est liberando calor
hacia el ambiente.
No obstante de que hay muchas reacciones exotrmicas que suceden de manera espontnea,
pronto esta idea como nico criterio de espontaneidad fue rechazada, dado que se observ que
tambin haba procesos endotrmicos, H (+), que ocurran en forma natural, por ejemplo:
No obstante se observ que bajo ciertas condiciones existen procesos espontneos que
ocurren con disminucin de entropa S (-), especialmente en procesos enxotrmicos, por
ejemplo en la solidificacin del agua a 0C:
Entonces ni la entropa ni la entalpa valen como criterio nico para definir la espontaneidad de
una reaccin, solo indican que hay una mayor probabilidad de espontaneidad. Esto condujo a
hacer un contraste entre los dos criterios de espontaneidad, tomando en consideracin la
temperatura del proceso:
Casos posibles:
H (-) y S (+) Procesos espontneos:
H (+) y S (-) Procesos no espontneos
H (+) y S (+) Probablemente procesos espontneos dependiendo de la
temperatura
H (-) y S (-) Probablemente procesos espontneos dependiendo de la
temperatura
Este contraste dio origen a una nueva variable termodinmica, que result infalible para la
prediccin de la espontaneidad de cualquier proceso:
La energa libre de Gibbs se define como el trabajo til, o bien como la energa disponible para
poder realizar un cambio.
Las reacciones que ocurre con G(-) se denominan exergnicas y las que suceden con G(+)
se llaman endergnicas.
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Relaciones energticas del metabolismo
Los mismos conceptos de estas variables termodinmicas son aplicables a las reacciones
metablicas.
El metabolismo se define como el conjunto de reacciones qumicas que tienen lugar dentro de
las clulas de los organismos vivos, las cuales les permiten transformar energa, conservar su
identidad, supervivencia y reproduccin.
Supongamos una reaccin anablica mediante la cual se forma un enlace qumico entre A y B;
esquemticamente:
A + B A-B G > 0
La reaccin no puede tener lugar espontneamente. Cmo puede entonces tener lugar en el
metabolismo?
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Dando lugar a una reaccin global: A + B + X-Y + H2O A-B + X + Y G Total < 0
El tipo de reaccin: X-Y + H2O X + Y G2 < 0, que tiene lugar en los seres vivos
para acoplarse a procesos endergnicos es, en la mayora de los casos, la hidrlisis de esteres,
y particularmente, la hidrlisis de polifosfatos:
Los dos enlaces anhdridos del polifosfato del ATP son configuraciones de alta energa de
hidrlisis. De esta manera, los procesos catablicos productores de energa generan ATP, que
se emplear en todas aquellas reacciones endergnicas en las que sea requerido.
En general, como se ver en los temas posteriores, el ATP se produce de dos maneras:
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1. Por fosforilacin a nivel de substrato (procesos anaerbicos, fermentativos), por ejemplo en
la Glicolisis.
2. Por fosforilacin oxidativa (procesos aerbicos, oxidativos), por ejemplo en el Ciclo de Krebs,
-oxidacin, etc.
La de energa libre estndar liberada en la hidrlisis del ATP puede ser de - 25 a - 40 kJ mol-1.
El valor exacto depende del pH, la temperatura y los cationes metlicos presentes. Uno de los
sistemas mejor estudiados es el complejo Mg-ATP, el cual, a pH = 7 y T = 310 K, tiene valor de
G = -30.5 kJmol-1, valor que se usa como referencia en los clculos de balance energtico
del metabolismo.
Los valores de la energa libre de Gibbs disponible en las reacciones de hidrlisis del ATP y su
congneres, pH = 7 y T = 310 K, se muestra en las reacciones de enseguida:
Como puede observarse en los valores de G, est claro que nicamente el ATP, ADP y
Pirofosfato tienen alta energa de hidrlisis de sus enlaces anhidro de fosfato.
La pregunta que cabe hacerse es: De dnde proviene la energa libre liberada en la hidrlisis
de los enlaces anhidro del ATP?. Algunos de razonamientos se explican a continuacin.
Energa estrica.
Los grupos fosfato del ATP son radicales de gran tamao, que se mantienen unidos al resto de
la molcula mediante enlaces anhidro, pero que por su tamao, estos grupos tienen gran
impedimento estrico entre ellos (se estorban), y tambin con los otros componentes de la
molcula. Esto aumenta la energa estrica de la molcula y disminuye la libertad
conformacional. De esta manera, cuando se hidroliza un enlace anhidro y alguno de los grupos
grandes se separa, se libera parte de la energa estrica liberando la energa libre al aumentar
la libertad conformacional. Tambin se incrementa por lo tanto el desorden molecular y por
consecuencia la entropa del sistema, lo que tambin aumenta la energa libre disponible.
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Metabolismo
Las clulas individuales o agrupadas en algn tejido, nunca estn aisladas, continuamente
estn intercambiando materia y energa con su alrededor o entorno. La materia y la energa
que entran o que salen de la clula son o han sido transformadas en su interior, con el propsito
de crear y mantener sus propias estructuras y proporcionar la energa necesaria para sus
actividades vitales.
4) Formar y/o degradar las biomolculas necesarias para las funciones especializadas de
las clulas (hormonas, neurotransmisores, etc.)....
Las distintas reacciones qumicas del metabolismo que se agrupan con una determinada
funcin se denominan vas o rutas metablicas y las molculas que en ellas intervienen se
llaman metabolitos.
Todas las reacciones del metabolismo estn reguladas por enzimas, que son especficas para
cada compuesto llamado sustrato y para cada tipo de transformacin. Las sustancias finales de
una va metablica se denominan productos. Tipos de metabolismo
Segn la fuente de carbono que utilicen las clulas u organismos poseern un metabolismo
auttrofo y se llamarn clulas u organismos auttrofos, o bien, un metabolismo hetertrofo y se
denominarn seres hetertrofos.
Segn la fuente de energa que utilicen, las clulas y los organismos auttrofos pueden ser: a)
Quimiosintticos si la fuente de energa qumica (ATP) procede de la energa que se desprende
en reacciones qumicas inorgnicas (ejemplo las bacterias quimiosintticas) y b) Fotosintticos
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si utilizan la energa luminosa y la transforman mediante fotosntesis la transforman en energa
qumica (ejemplos: bacterias fotosintticas, cianofceas, algas verdes y las clulas vegetales
fotosintticas de las hojas). Por su parte las clulas y organismos hetertrofos se nutren
bsicamente de materia orgnica que toman del medio (proveniente de los auttrofos) y su
fuente de energa es el ATP obtenido a travs de sus reacciones catablicas. Es propia de
(ejemplos las clulas de los animales, la mayora de las bacterias, hongos y clulas vegetales
no fotosintticas).
Las clulas auttrofas tienen dos tipos de anabolismo: uno auttrofo y otro hetertrofo. En el
primero se parte de sustancias inorgnicas (CO2 y H2O) para obtener sustancias orgnicas
sencillas (por ejemplo, glucosa) utilizando la energa libre (luminosa o producida en reacciones
qumicas), En el segundo, se parte ya de sustancias orgnicas sencillas, como la glucosa, para
obtener otras ms complejas como el almidn.
Las clulas hetertrofas slo tienen un anabolismo hetertrofo, similar al de las auttrofas, con
la diferencia de que incorporan las molculas orgnicas del exterior (alimentos).
En general existen algunas diferencias bsicas que entre el anabolismo y el catabolismo, la fase
anablica implica procesos de sntesis de compuestos, involucran principalmente reacciones de
reduccin que consumen energa y a partir de unos cuantos sustratos se pueden formar una
gran variedad de compuestos. Hay divergencia en los productos. Por su parte la fase catablica
implica procesos de degradacin de compuestos, involucran principalmente reacciones de
oxidacin acompaadas de liberacin de energa y a partir de una gran variedad de compuestos
se generan casi siempre los mismos productos. Hay convergencia en los productos (CO2,
piruvato, alcohol etlico, agua y unos pocos mas).
Catabolismo
Se define al catabolismo como el conjunto de reacciones metablicas que tienen por objeto
obtener energa a partir de compuestos orgnicos complejos que se transforman en otros ms
sencillos. La respiracin celular aerobia y las fermentaciones alcohlica y lctica son las
principales vas catablicas para la obtencin de la energa contenida en las sustancias
orgnicas.
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aerobios. Si una clula u organismo microbiano utiliza una molcula diferente al O 2, por ejemplo
H2, S2 o N2, como aceptor final de electrones, se llama anaerobio.
Catabolismo de Carbohidratos
Los carbohidratos son la fuente esencial de energa para los seres vivos. Adems de ser los
productos iniciales para la sntesis de grasas y aminocidos no esenciales.
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Fase I o Fase inicial o preparatoria del catabolismo. La Digestin y absorcin de
carbohidratos en organismos hetertrofos
La digestin es un proceso de hidrlisis en la que las molculas complejas presentes en los
alimentos son desdobladas en molculas ms sencillas a fin de que sean absorbidas y
posteriormente asimiladas por las clulas. El proceso de la digestin de los alimentos inicia con
la masticacin, accin mecnica que pone a disposicin de las enzimas las macromolculas del
alimento.
En la dieta para la alimentacin de animal las fuentes principales de carbohidratos son almidn,
sacarosa y lactosa. Existen otros carbohidratos que se ingieren en menores proporciones como
el glucgeno o derivados como el cido lctico y pirvico de origen animal; adems de las
llamadas fibras como las pectinas, celulosa y hemicelulosa, importantes para la nutricin de
rumiantes.
Las clulas que se encuentran en las vellocidades del intestino delgado, llamadas enterocitos,
secretan 5 enzimas -dextrinasa, isomaltasa, maltasa, sacarasa y lactasa, cuya funcin es
desdoblar los oligosacaridos hasta sus monosacridos constituyentes, los cuales son
hidrosolubles y asimilables. Las dextrinas se desdoblan unidades de glucosa e isomaltosa, la
lactosa a glucosa y galactosa y la sacarosa a glucosa y fructosa.
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La glucosa es el monosacrido que se absorbe
en mayor abundancia, en animales puede llegar
a representar hasta el 80% de las caloras
procedentes de los carbohidratos. A mitad de la
digestin la concentracin de glucosa en el
intestino ser mayor que dentro del enterocito,
por lo tanto ser posible el paso de glucosa a
travs de la mebrana luminal mediante un
sistema proteico de transporte pasivo (GLUT=
glucosa transporter).
Una vez que la glucosa ya est dentro del enterocito, esta se puede metabolizar para que dicha
clula obtenga su propia energa (exclusivamente anaerbicamente por glucolisis) y la mayor
parte se enva al plasma a travs de los sistemas de transporte pasivos transmembranales
(GLUT). El cido lctico producido en la gluclisis tambin pasa al plasma a travs de dichos
transportadores. El paso de la glucosa al plasma siempre es pasivo (transportadores GLUT) por
diferencia de concentraciones.
Una vez en el plasma el hgado recoge la glucosa rpidamente. El hgado la recibe (tambin
recibe la mayor parte de fructosa, galactosa, cido lctico y los convierte en mas molculas de
glucosa. Ya en el hgado, dependiendo de las necesidades del organismo, la glucosa puede
tener tres destinos:
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c) Se enva al plasma (torrente sanguneo) para que llegue al resto de los tejidos.
Dependiendo del tipo de tejido, existen tres mecanismos mediante los cuales las clulas
ingresan las molculas de glucosa a su interior:
En el caso de los rumiantes, existen diversos microorganismos en la cavidad ruminal que les
permiten obtener energa a partir de los carbohidratos fibrosos (celulosa y hemicelulosa) que
estn ligados a la lignina en las paredes de las clulas de plantas. La fibra da volumen al
alimento permitiendo que se retenga en el rumen, donde la celulosa y la hemicelulosa
fermentan lentamente. Adicionalmente, la presencia de material fibroso es necesaria para
estimular la rumia. La rumia aumenta la separacin y posibilita una mayor fermentacin de la
fibra, estimula las contracciones del rumen y aumenta el flujo de saliva hacia el rumen. La saliva
contiene bicarbonato de sodio y fosfatos que ayudan a mantener la acidez (pH) del contenido
del rumen en un pH aproximadamente neutro.
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El cido propinico es transferido, casi completamente, por la vena porta hacia el hgado. All el
propionato sirve como substrato para la gluconeognesis, que es una ruta crtica para los
rumiantes, ya que la glucosa no suele alcanzar el intestino delgado para su absorcin. La
gluconeognesis genera las molculas de glucosa que a travs del torrente sanguneo llegarn
a los tejidos para la respiracin celular.
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El cido butrico, en su mayor parte sale del rumen como cetonas, las cuales se oxidan en
muchos tejidos para la produccin de energa.
El desdoblamiento fosforoltico del almidn se realiza por medio de la enzima fosforilasa (con
actividad fosforoltica). Esta enzima utiliza cido fosfrico para ir acortando la cadena de los
polisacridos del almidn desde el extremo no reductor y cada vez se origina una molcula de
glucosa, el resto fosfrico del cido pasa entonces a la glucosa liberada y el hidrgeno es
transferido a la unidad de glucosa de la cadena que ocupa la posicin terminal. El corte sigue
en esa misma direccin generndose mltiples unidades de glucosa-1-fosfato.
Las enzimas responsables del desdoblamiento hidroltico son las amilasas, un grupo de
enzimas que pertenecen a la categora de las hidrolasas. Debido a su modo de accin se
dividen en -amilasa y -amilasa. La primera desdobla las macromolculas de la amilosa y la
amilopectina, de las cuales se compone el almidn, en unidades de 6-7 molculas de Glucosa.
Incluso, con ms tiempo de exposicin esa enzima logra desdoblar a estos oligosacridos
llevndolos a maltosa. La cual es desdoblada a glucosas por medio de la enzima maltasa.
La -amilasa puede desdoblar las molculas de amilosa y amilopectina pero solo a partir de los
extremos no reductores de estas molculas. Cada vez son cortadas a dos unidades de glucosa
en forma de maltosa, para ser desdobladas enseguida por la maltasa. Las molculas de
amilasa son desdobladas de esta forma pero las de amilopectina son solo desdobladas en un
50% ya que la enzima no puede desdoblar los enlaces (1-6) presentes en los puntos de las
ramificaciones propias de esta macromolcula. El desdoblamiento total de la amilopectina
ocurre por complemento con la accin -amilasa.
Gliclisis
Ya en las clulas, el proceso para la obtencin de energa es la glucolisis o glicolisis. La
gluclisis, tambin llamada ruta de Embdem-Meyerhof-Parnas, es la ruta ms primitiva de
produccin de energa, es un conjunto de reacciones anaerobias que tienen lugar en el
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hialoplasma celular, en ellas la glucosa (proveniente del almidn o del glicgeno), se degrada
transformndose en dos molculas de cido pirvico o piruvato (3 C).
Su nombre deriva de los vocablos griegos glykys que significa dulce y lysis que se traduce
como separacin o rompimiento. La gluclisis es utilizada por casi todas las clulas como medio
para obtener energa a partir de los azucares simples. Cualquiera que sea la fuente de glucosa
utilizada, el resultado final ser la obtencin de 2 molculas de cido pirvico (piruvato), 2 ATP
y 2 NADH + 2 H+. El glicerol de los glicridos y algunos aminocidos de las protenas tambin
pueden entrar a esta va catablica
Etapas de la gluclisis
Las 10 reacciones de la ruta entre la glucosa y el piruvato pueden dividirse en dos fases
distintas:
Las estructuras del acarreador de electrones Nicotinamida adenina dinucletido (oxidada NAD +
y reducida NADH) se pueden estudiar en la figura siguiente:
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Haciendo un balance global de la gliclisis se puede decir que por cada molcula de glucosa
que ingresa en esta va se obtiene: 2 molculas de cido pirvico, 2 molculas de NADH + 2H+
y 2 molculas de ATP.
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tanto ya no tienen posibilidades de generar ms energa, debido a que transfieren los
electrones y los tomos de hidrgeno obtenidos en la glicolisis, desde el NADH hasta
compuestos aceptores de electrones diferentes del oxgeno, en este caso, de nuevo hasta el
piruvato, formando productos tales como: lactato y etanol. A continuacin se detallan dichas
reacciones.
En presencia de oxgeno, las clulas aerbicas oxidan totalmente al piruvato hasta CO 2 y H2O
con la finalidad de generar ms energa qumica en forma de molculas de ATP. En el proceso
conocido como respiracin que implica el ciclo de Krebs, el transporte de electrones y la
fosforilacin oxidativa.
Previo a la respiracin y dentro de la fase preparativa del catabolismo, el piruvato sufre una
primera descarboxilacin para formar Acetil coenzima A.
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La descarboxilacin del piruvato al igual que las reacciones de oxido reduccin propias del ciclo
de Krebs, la cadena de transporte de electrones y la fosforilacin oxidativa se realizan en las
mitocondrias.
La mitocondria
Es el orgnulo u organelo de forma
ovoide donde se lleva a cabo la
respiracin celular (el catabolismo
aerobio), en la mayora de los
organismos eucariotas (con ncleo
verdadero). Una clula eucariota
tpica contiene ms de 2000
mitocondrias, lo que ocupa
alrededor de la quinta parte del
volumen celular. Esta cantidad es
necesaria porque este organelo es
la central energtica de la clula.
La presencia de las dos membranas hace que se formen dos compartimientos la matriz
englobada por la membrana interna y el espacio intermembranal o intermembranoso, situado
entre ambas membranas.
La membrana interna contiene sistemas de transporte para el ingreso del NADH producido por
la gluclisis (necesario para la oxidacin aerbica en la cadena de transporte de electrones),
entrada de oxaloacetato, Acetil-CoA, cidos grasos, ADP y grupos fosfato, entre otros. Tambin
tiene protenas transportadoras de ATP y otros metabolitos hacia el citoplasma.
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Las enzimas respiratorias, forman parte tanto
de la membrana interna, como de la matriz
gelatinosa (50% H2O). La membrana interna
est compuesta por aproximadamente un 75%
de protenas y 25% lpidos. Es permeable
solamente a O2, CO2 y H2O. As que adems
de las protenas de la cadena de transporte de
electrones, contiene numerosas protenas de
transporte, que controlan el paso de ATP,
ADP, piruvato, Calcio y fosfato. Esta
impermeabilidad controlada permite la
generacin de gradientes, lo cual le da una
funcionalidad adicional.
Cabe destacar que el ADN mitocondrial es similar al ADN de los procariotas. Esto es, est
formado por una doble cadena de ADN circular asociada a protenas diferentes de las que se
encuentran en los eucariotas. Las mitocondrias, igual que los cloroplastos, tienen una estructura
similar a los organismos procariotas Segn la teora endosimbitica las mitocondrias y los
cloroplastos eran organismos procariotas que establecieron una simbiosis con las clulas
eucariotas a las que proporcionaran energa a partir de sustancias orgnicas.
Ciclo de Krebs
Una vez formada la acetil coenzima A, el grupo acetilo proveniente del piruvato ya ha sido
activado y est listo para ingresar al ciclo de Krebs, tambin llamado ciclo del cido ctrico o
ciclo de los cidos tricarboxlicos.
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Fase II. Reacciones 5-8. Definida como el grupo de reacciones para la regeneracin del
oxaloacetato.
A partir del citrato, se despliega una serie de reacciones irreversibles, que culminan con la
generacin de otra molcula de oxaloacetato. Para ello tienen que ocurrir dos reacciones de
descarboxilacin sucesivas, primero la descarboxilacin del isocitrato por la enzima isocitrato
deshidrogenasa para formar -cetoglutarato y despus la transformacin de este en succinil-
CoA, reaccin catalizada por un complejo enzimtico denominado complejo del -cetoglutarato
deshidrogenasa. En ambos casos se liberan molculas de NADH y CO2. En la 5a reaccin se
libera se rompe el enlace tioster de la separndose la molcula de Succinil-CoA en succinato y
CoA, el rompimiento de este enlace genera energa libre para realizar la fosforilacin de una
molcula de Guanidina difosfato (GDP) convirtindola en Guanidina trifosfato (GTP) que es
equivalente energticamente a ATP. Enseguida el Succinato se deshidrogena y convierte en
Fumarato, los electrones y los tomos de H liberados en esta reaccin son atrapados por FAD
el cual se reduce a FADH2. Despus el Fumarato se satura con molcula de agua y se
convierte en Malato, el cual se vuelve a deshidrogenar para regenerar el oxaloacetato inicial.
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A continuacin se ilustran las reacciones del ciclo de Krebs
.
Reaccin 1. Condensacin del oxalacetato con la Acetil-CoA
La enzima citrato sintasa condensa a la acetil-CoA (de 2C) con el oxalacetato (de 4C) para dar
una molcula de citrato (6C). Como consecuencia de esta condensacin se libera la coenzima
A. La reaccin es fuertemente exergnica e irreversible. En la reaccin intervienen las cadenas
laterales del cido asprtico en la posicin 375 y las histidinas de las posiciones 274 y 320. El
anlisis de la reaccin a demostrado que la acetil-CoA se une mediante un puente de hidrgeno
con la histidina 274. Enseguida el grupo carboxilo ionizado del cido asprtico 375 gana un
protn del grupo metilo de acetil ocasionando una deslocalizacin electrnica que da como
resultado un enolato Acetil-CoA altamente inestable, este compuesto inmediatamente realiza un
ataque nucleoflico sobre el carbono del grupo ceto del oxalato, quedado enlazados los tomos
de carbono antes mencionados para formar Citril-CoA. Enseguida la enzima hidroliza la Citril-
CoA, formando el citrato y liberando la coenzima A.
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Reaccin 2. La isomerizacin del citrato a isocitrato
El citrato es convertido en isocitrato por medio de la enzima aconitasa (aconitato hidratasa). La
reaccin tiene lugar en dos pasos: deshidratacin hasta cis-aconitato (el cual permanece unido
a la enzima) y rehidratacin hasta isocitrato.
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Reaccin 5. Oxidacin de Succinil-CoA a Succinato
El Succinato y la coenzima A estn unidos mediante un enlace tioster de alta energa. Cuando
este enlace se rompe la energa liberada se utiliza para generar un enlace fosfoanhidro entre un
fosfato y un GDP para dar una molcula de GTP. En la reaccin se libera la HS-CoA. La
reaccin ocurre en tres pasos:
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Las estructuras oxidada y reducida del cofactor Flavina adenina dinucletido (FAD y FADH2) se
presentan a continuacin. Obsrvese que el centro cataltico est en los electrones de los
dobles enlaces formados por los tomos de nitrgeno en las posiciones 1 y 5 del triple anillo de
Isoaloxacina.
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Reaccin 8. Oxidacin (deshidrogenacin) del malato para formar oxalacetato
Cada mol de cofactor reducido de NADH tiene energa potencial suficiente para sintetizar 2.5
moles de ATP en los procesos siguientes: el transporte de electrones y la fosforilacin oxidativa.
Anlogamente cada mol de FAD2 puede generar 1.5 moles de ATP. Entonces cada molcula de
piruvato que entra al ciclo del cido ctrico tiene una capacidad potencial de generar 10
molculas de ATP en total.
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Adicionalmente, mediante el proceso de gluconeognesis en el hgado, partir del cido
propinico se puede generar glucosa, la cual puede iniciar todo el proceso catablico desde la
glicolisis.
Las molculas de NADH y de FADH2 liberados en el ciclo de Krebs, adems de las liberadas en
la glicolisis y la descarboxilacin del piruvato son reoxidadas por el sistema enzimtico de
transporte de electrones, el flujo de electrones establecido se dirige hacia el O2 como aceptor
final. Los productos de este proceso son molculas de agua y una gran cantidad de energa
elctrica liberada en forma de protones (H+), energa que es utilizada para sintetizar ATP en el
proceso final de la cadena respiratoria, conocido como fosforilacin oxidativa.
La cadena respiratoria est formada por una serie de transportadores localizados en las crestas
de la membrana interna de las mitocondrias. En ellas se realizan los procesos de transporte
electrnico y la fosforilacin oxidativa. El transporte se inicia cuando una coenzima reducida
(NADH + H+ o FADH2) se oxida al ceder los dos hidrgenos a un transportador de la cadena.
Estos transportadores se agrupan en 3 complejos. Cada uno de ellos tiene mayor afinidad que
el anterior por lo que los electrones viajan en cascada a niveles cada vez menores hasta llegar
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finalmente al oxgeno molecular para formar H2O. Entonces el transporte se realiza a travs de
una serie de reacciones de oxidacin-reduccin.
Los electrones y los tomos de hidrgeno son arrancados de las molculas de NADH + H+ por
el complejo enzimtico I (llamado NADH deshidrogenasa) y este se los pasa a la coenzima Q.
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A continuacin se indican las reacciones de oxido-reduccin en la molcula de flavina
mononucleotido dentro del complejo enzimtico I.
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El complejo enzimtico II
presenta otro tipo de
actividades, una de ellas es
glicerol-3-fosfato
deshidrogenasa, que consiste
en tomar el NADH que viene
del citoplasma (de la gliclisis)
en el espacio intermembranal,
antes de que ingrese a la
matriz de la mitocondria y al
mandar los electrones, a
travs de FADH2, a la
Ubiquinona, entonces la
energa potencial liberada
solo tendr capacidad para
sintetizar 3 molculas de ATP
por cada 2 molculas de NADH , en lugar de las 5 que produciran estas 2 molculas de NADH
si fueran tomadas por el complejo enzimtico I (NADH-deshidrogenasa).
La cada molcula de ubiquinona reducida al reoxidarse, cede dos protones a la matriz (2 H+) a
la matriz y dos electrones al complejo III (citocromo c-reductasa).
Por cada 2 molculas de ubiquinona reducida que recibe el complejo enzimtico II bombea 4
protones al espacio intermembranal y lleva los electrones hasta el citocromo c. El citocromo c
consta de una pequea simple protena unida a una conformacin de anillos llamado grupo
heme, a travs de molculas de cistena. El grupo heme contiene un centro de fierro que es la
parte que realiza el transporte de electrones. El citocromo c acepta electrones del complejo III y
los impulsa hasta el complejo IV. Hay otros tipos de citocromos pero estos estn presentes
como cofactores en los complejos enzimticos III y IV. La figura siguiente presenta las
estructuras de algunos de citocromos presentes en la cadena respiratoria.
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Tambin se puede observar en las figuras, que durante el transporte de electrones los
complejos I, III y IV realizan una translocacin de protones (H+) desde la matriz hacia el espacio
intermembranal. Esto provoca la aparicin de un gradiente electroqumico, debido a que el
espacio intermembranal se vuelve ms cido que la matriz.
El retorno de protones a la matriz se realiza a travs del complejo enzimtico V, conocido como
ATP-sintasa, el cual aprovecha la energa del gradiente para transformar ADP en ATP, y a este
proceso se le llama fosforilacin oxidativa. Todo el mecanismo del transporte de electrones y la
fosforilacin oxidadiva se muestra en la siguiente figura:
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Fosforilacin oxidativa
El complejo ATP sintasa es una enzima situada en
la cara interna de la membrana interna de las
mitocondrias y en la membrana de los tilacoides de
los cloroplastos, es la encargada de sintetizar ATP
a partir de ADP y un grupo fosfato, utilizando la
energa proporcionada por un flujo de protones (H+).
La sntesis de ATP por accin de esta enzima se
denomina fosforilacin oxidativa (mitocondrias) y
fotofosforilacin (cloroplastos).
Esta enzima est formada por dos complejos principales. Uno anclado a la membrana
mitocondrial interna mitocondrial llamado F0, (o anclado a la membrana interna del tilacoide.
llamado CF0. El otro sobresale por la cara interna de la estructura es llamado F1 (CF1 en caso
de los tilacoides).
El componente F0 es el motor impulsado por protones. Est formada por las subunidades a, b2 y
c. Las subunidades c forman el anillo c, que rota en sentido de las manecillas del reloj en
respuesta al flujo de protones por el complejo. Las dos protenas b inmovilizan el segundo
complejo F1, que est orientado hacia la matriz mitocondrial. Las protenas b estn asociadas a
F1 a Fo, mediante interacciones electrostticas.
F1 est formada por las subunidades 3, 3, , y . La parte principal del complejo F1 est
formado por tres subunidades de y tres de , formando un hexmero. La actividad cataltica
de este hexmero se da a travs de las subunidades .
Las subunidades y estn unidas al anillo c, y giran con l. Cada rotacin de 640 de la
subunidad induce la aparicin de cambios de conformacin en los centros catalticos de las
unidades , de los dmeros -, provocando la alteracin de los centros de fijacin de los
nucletidos situado en . El hexmero 3 y 3 finalmente libera el ATP.
Las tres subunidades interaccionan de tal modo que, cuando una adopta la conformacin
abierta, otra ha de adoptar la conformacin libre y la otra una conformacin ajustada.
La sntesis de ATP se inicia en el estado libre con la toma de ADP y Pi. El siguiente estado es la
conformacin ajustada que sigue la condensacin del ADP y Pi a ATP con la formacin de un
enlace fosfodister. Finalmente, el estado abierto deja libre el producto ATP, y vuelve
nuevamente al estado L iniciando nuevamente la siguiente ronda de sntesis.
Por lo tanto, una rotacin completa de la subunidad provoca que cada subunidad se cicle a
travs de sus tres conformaciones posibles y en cada rotacin se sintetizan y se liberan de la
superficie del enzima tres molculas de ATP. Este proceso direccional y cclico conducido por
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protones, donde se est pasando entre los tres estados conformacionales, permite una
produccin continua de ATP.
Ciclo de Cori
Bajo condiciones de baja concentracin de oxgeno (hipoxia) o de ausencia total de oxgeno
(anoxia), se inhibe parcial o totalmente el proceso de respiracin celular en los tejidos de los
organismos superiores, a pesar de contar con clulas aerobias.
En el caso de los vegetales esta condiciones se presentan por ejemplo en suelos inundados, en
los que la concentracin de oxgeno es muy baja, dificultando su difusin a las races, que
entonces operan desviando NADH hacia la formacin de cido lctico o alcohol etlico.
En el caso de los tejidos animales la hipoxia ocurre cuando se dan contracciones vigorosas por
algn esfuerzo fsico intenso, con la respectiva acumulacin de cido lctico en el tejido
muscular. El torrente sanguneo recoge el cido lctico y lo lleva hasta el hgado donde,
mediante el proceso de gluconeognesis, se convierte de nuevo en glucosa. La glucosa regresa
del hgado pasa de nuevo al tejido muscular a travs de la sangre, estableciendo una especie
de ciclo, que se conoce con el nombre del ciclo de Cori. Las reacciones del ciclo de Cori se
ilustran en la figura siguiente.
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Qu es la fotosntesis?
Que se lee: seis molculas de agua ms seis molculas de dixido de carbono producen una
molcula de azcar ms seis molculas de oxgeno. La luz es la fuerza motriz que hace que la
fotosntesis pueda ocurrir.
Todos los organismos fotosintticos, excepto las bacterias, utilizan el H2O como dador de
electrones y de tomos de hidrgeno para reducir a varios aceptores electrnicos
desprendiendo oxgeno molecular, como consecuencia del proceso.
Las reacciones fotosintticas que requieren luz se producen dentro de la membrana interna de
los tilacoides, en el interior de los cloroplastos de las clulas fotosintticas, presentes en las
hojas de las plantas principalmente.
b) Fase oscura o Ciclo de Calvin. En la que la energa qumica y el poder reductor obtenidos
en la fase luminosa, se utilizan para transformar la materia inorgnica (CO 2 y H2O) en orgnica
(carbohidratos). Ocurre en el estroma de los tilacoides.
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La fotosntesis se realiza en los
cloroplastos, los cuales son
orgnulos muy variables en cuanto a
nmero, forma y tamao. Los
cloroplastos se encuentran en clulas
vegetales y en organismos simples,
como algas y protozoos. Los
cloroplastos contienen la clorofila.
En el interior se ven unas estructuras alargadas formadas por membranas llamadas lminas o
lamelas. Las lamelas conectan a los grana. Los grana se asemejan a una pila de monedas y
cada una de esas monedas es un tilacoide. Las granas estn rodeadas de una sustancia
gelatinosa llamada estroma. En el estroma hay ADN similar al de las clulas procariotas (ADN
de cloroplasto), ribosomas y vacuolas que acumulan almidn, protenas y lpidos.
Fase Luminosa
Naturaleza de la luz
La luz blanca se divide en los diferentes colores (definidos por la longitud de onda) al pasar a
travs de un prisma. Longitud de onda
se define como la distancia de pico a
pico (o valle a valle).
La energa es inversamente
proporcional a la longitud de onda:
longitudes de onda ms largas tienen
menos energa que las ms cortas. El
orden de los colores est
determinado por la longitud de onda. Longitud de onda y otros aspectos de la
naturaleza ondulatoria de la luz.
Cuanto ms larga sea la longitud de onda de la luz visible, ms rojo el color. Del mismo modo
las longitudes de onda ms cortas son hacia el lado violeta del espectro.
Las longitudes de onda ms largas que el rojo se conocen como infrarrojos, mientras que las
ms cortas que el violeta son ultravioleta. La luz visible es una pequea parte del espectro
electromagntico.
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La luz se comporta tanto como una onda y una partcula. Las propiedades de onda de la luz
incluyen la curvatura de la trayectoria de la onda al pasar de un material (medio) en otro (es
decir, el prisma, arco iris, lpiz en un vaso de agua, etc.). Las propiedades de las partculas se
ponen de manifiesto por el efecto fotoelctrico.
El zinc expuesto a la luz ultravioleta se carga positivamente, porque la energa de luz obliga a
salir a los electrones del zinc. Estos electrones pueden crear una corriente elctrica. El sodio,
potasio y selenio tienen longitudes de onda crticas en el rango de la luz visible. La longitud de
onda crtica es la longitud de onda mxima de la luz (visible o invisible) que crea un efecto
fotoelctrico.
La clorofila, el pigmento verde comn en todas las clulas fotosintticas y que juega un papel
central en la fotosntesis, se ve de color verde porque absorbe la luz azul y roja a la vez que
refleja el color verde, cuando es iluminada por todas las longitudes de onda de la luz solar.
La clorofila es una molcula compleja. Existen varias modificaciones de la clorofila entre las
plantas y otros organismos fotosintticos. Todos los organismos fotosintticos (plantas, ciertos
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protistas, proclorobacterias, y cianobacterias) tienen clorofila a. Existen pigmentos accesorios
que absorben energa que la clorofila a no absorbe. Los pigmentos accesorios incluyen clorofila
b (tambin c, d, y e, en algas y protistas), xantofilas y carotenoides. La clorofila a absorbe su
energa de las longitudes de onda de color naranja-rojo azul-violeta y rojizo, y pequeas
cantidades de las longitudes de onda intermedias (verde-amarillo-naranja).
Hay que tener en cuenta que en un cloroplasto intacto, la energa rara vez se vuelve a emitir, en
su lugar la energa y el electrn excitado se eliminan de la clorofila.
La estructura de la clorofila
explica sus funciones
La estructura de la clorofila
revela su mecanismo de
absorcin de la luz, la
excitacin de sus electrones, y
su capacidad de dar
electrones fuera a un sistema
de transferencia de
electrones.
Este sistema presenta una serie de dobles enlaces conjugados que expanden la nube de
electrones por resonancia de los enlaces conjugados.
Una diferencia en un solo anillo del sistema tetrapirrol permite distinguir entre clorofila a (el
pigmento centro de reaccin) y clorofila b (un
pigmento antena).
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Debido a que la luz azul es de mayor energa que la luz roja, y los pigmentos antena absorben
la energa de la luz en longitudes de onda ms cortas que 680 o 700 nm, tiene sentido que
estos pigmentos puedan transferir energa a las versiones de clorofila a, P680 y P700 que
absorben luz de menor energa.
La energa absorbida es transferida de un pigmento antena a otro por resonancia de los dobles
enlaces conjugados, hasta llegar a una molcula de clorofila b, que tiene un pequeo pico de
absorcin en las longitudes de onda de color amarillo (P650). Los pigmentos de antena tienen
estar fsicamente cerca uno del otro y del centro de reaccin de la clorofila a, con el fin de lograr
estas transferencias de energa. La energa absorbida por la clorofila b se transfiere entonces a
los pigmentos de antena de la clorofila a, que tienen un pico de absorcin en las longitudes de
onda a 680 nanmetros en la zona de color rojo intenso (P680). De esta forma, la energa llega
hasta el centro de reaccin de una molcula de clorofila a.
Como se mencion antes, en cada una de las transferencias, se pierde energa en forma de
calor, pero la cantidad de energa realmente transferida al centro de reaccin, es suficiente para
realizar la fotosntesis, expulsando electrones hacia el sistema de transporte de electrones. La
capacidad de un compuesto para absorber luz depende de la disposicin de electrones
alrededor del ncleo atmico. Por cada fotn que se absorbe un electrn pasa a un nivel
energtico superior. Si la excitacin es muy alta el electrn sale del orbital atmico externo y
escapa, quedando el ncleo ionizado, es decir cargado positivamente y con tendencia a ganar
electrones. En el caso de los centros de reaccin (clorofila a, P680 y P700), la energa entrante
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hace que se continuamente se estn perdiendo electrones, los cuales son cedidos a partir del
tomo de Mg. Este se conoce como proceso de fotoexcitacin y se produce primero en el PSII y
posteriormente en el PSI.
Por su parte, el dficit de electrones de cada molcula de clorofila a excitada (P680*) del
fotosistema II, es momentneo, ya que inmediatamente acta un complejo de manganeso
(MnC), llamado complejo productor de oxgeno, el cual realiza la fotlisis de 2 molculas de
agua para formar oxgeno molecular, 4 protones (H+) y 4 electrones (e-) los cuales llenan el
hueco (dficit) producido en 4 molculas de clorofila P680* excitada. Los H+ quedarn en el
interior del tilacoide y servirn para crear el gradiente electroqumico imprescindible para la
fotofosforilacin (sntesis de ATP), mientras que el O2 es expulsado como producto de desecho.
Por su parte, la energa luminosa que llega a la clorofila P700 del fotosistema II hace que esta
molcula tambin alcance un estado excitado P700* en el que cede electrones para la sntesis
de poder reductor en forma de molculas de NADPH, como ya se mencion antes, este dficit
electrnico en la molcula P700, es cubierto con los electrones provenientes del P680*, los
cuales a su vez estn siendo suministrados de la fotlisis del agua.
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La feofitina (Ph), que es una molcula estructuralmente similar a la clorofila, excepto porque
carece del tomo de magnesio caracterstico. Est directamente asociada a las molculas de
clorofila PS580*, de las que recibe los electrones.
La plastocianina es una protena pequea y mvil, que cede los electrones al fotosistema I
En el caso del fotosistema I, la energa luminosa de cada fotn absorbido es transferida por las
molculas del complejo antena hasta su centro de reaccin lo cual provoca la activacin y
posterior prdida de un electrn en una molcula de clorofila a P700. Esta molcula queda
entonces en un estado inestable, con un hueco electrnico que ser rellenado por un
electrn procedente del FS II.
El electrn perdido por el P700 tambin pasa a una cadena de transportadores que se van
reduciendo (al aceptar el electrn) y oxidando (al transferirlo) sucesivamente, con un nivel
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energtico menor en cada paso. Luego de varios compuestos intermedios poco conocidos (A0,
A1, muchos de ellos ferrosulfoprotenas sin grupo heme: FX, FB/FA), el electrn llega a la
ferredoxina (Fd) que lo cede por ltimo a la enzima ferredoxina-NADP+ oxidorreductasa (FNR),
que cataliza la reduccin del NADP+ (forma oxidada del NADPH), segn la siguiente reaccin:
NADP+ + 2 e- + H+ NADPH + H+
En este mecanismo en el que los dos fotosistemas pueden actuar conjuntamente (conocido
como esquema en Z), mientras la luz llega a los fotosistemas, se mantiene un flujo de
electrones desde el agua al fotosistema II, de ste al fotosistema I, hasta llegar el NADP+ que
los recoge; sta pequea corriente elctrica es la que mantiene el ciclo de la vida. El balance
final es que por cada 8 fotones de energa se utilizan dos molculas de agua y se forman una
molcula de oxgeno, dos NADPH + H+ y se genera un potencial elctrico para la sntesis de 3.2
molculas de ATP.
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NADPH, porque los electrones no llegan a la enzima ferredoxina-NADP+ oxidorreductasa
(FNR), sino que son atrapados por un sistema de citocromo b6f acoplado a plastocianina que
los regresan rellenado nuevamente los huecos en las molculas de clorofila P700. No
obstante, el citocromo b6f mantiene su capacidad de bombear protones al lumen tilacoidal,
generando el gradiente electroqumico utilizado por la ATP sintasa para la produccin de ATP.
Durante mucho tiempo se crey que las reacciones llevadas a cabo en el estroma eran
independientes de la luz, por tal motivo se les llam reacciones de la fase oscura de la
fotosntesis. Hoy en da es ms correcto referirse a ellas como reacciones del carbono en la
fotosntesis.El proceso de reduccin del carbono es cclico y se conoce como Ciclo de Calvin,
en honor de su descubridor Melvin Calvin. Este ciclo fue descrito en primera instancia para las
plantas C3 y se conoce tambin como ciclo de reduccin de las pentosas fosfato.
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convierte en Gliceraldehdo-3-fosfato (GAP), que puede irse a la sntesis de azcares o a la
Fase siguiente (regeneracin).
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cuales al romperse darn doce molculas de 3-PG. Hasta aqu se habrn invertido 6 molculas
de ATP.
De esas doce molculas de GAP, dos van a ser utilizadas para formar glucosa y las diez
restantes para regenerar las seis de Ru5P que se usaron al principio para fijar el CO2. Para la
regeneracin de la Ru1,5-diP, 5 molculas de GAP se convierten a 5 molculas de
dihidroxiacetona fosfato (DHAP) por medio de la enzima triosa fosfato isomerasa (reaccin 5).
Las 2 molculas de E4P se combinan con las 2 molculas restantes de DHAP y se convierte en
dos molculas de sedoheptulosa-1, 7-difosfato (SBP) de 7 carbonos, por la actividad de una
aldolasa (reaccin 9).
En la reaccin 11, las dos molculas de S7P, ceden 2 carbonos a dos molculas de GAP
formando de molculas de xilulosa-5-fosfato (Xu5P) y dos de ribosa-5-fosfato (R5P) con los 5
carbonos restantes de las 2 molculas de S7P.
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La estequiometra del ciclo de Calvin indica que cuando la fotosntesis alcanza el estado
estacionario, 10 molculas de las 12 triosas fosfato formadas se destinan a la regeneracin de
la ribulosa-1,5-bisfosfato y dos son exportadas para la sntesis de los monosacridos que
formarn la sacarosa, el almidn u otros metabolitos celulares.
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La regulacin a corto plazo del ciclo de Calvin se consigue con una gran variedad de
mecanismos que optimizan las concentraciones de los intermediarios.
Dos mecanismos generales pueden cambiar las propiedades cinticas de las enzimas:
Cinco de las enzimas que actan en el ciclo de Calvin estn regulados por la luz:
RuBisCo
NADP:gliceraldhedo-3-fosfato deshidrogenasa
Fructosa-1,6-bifosfasa
Sedoheptulosa-1,7-bifosfasa
Ribulosa-5-fosfato quinasa
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Las cuatro ltimas enzimas contienen uno o ms puentes disulfuro (-S-S-). La luz controla la
actividad de estas enzimas a travs del sistema ferredoxina-tiorredoxina, un mecanismo basado
en la oxidacin-reduccin de un grupo tiol covalente. En oscuridad estos residuos se encuentran
en la forma oxidada (-S-S-), siendo los enzimas inactivos o subactivos. En presencia de luz
estos residuos son reducidos a su forma de sulfidrilos (-SH HS-) que es el estado activado de la
enzima.
La inactivacin de las enzimas diana en oscuridad parece producirse por la ruta inversa de
reduccin. Es decir, el oxgeno hace pasar a la tiorredoxina y a la enzima diana del estado
reducido al estado oxidado, provocando la inactivacin del enzima.
Las cuatro ltimas enzimas (2-5) estn reguladas directamente por la tiorredoxina; La primera,
la RuBisCo, est regulada indirectamente por una enzima accesoria a la tiorredoxina, la
RuBisCo activasa.
Entonces, la actividad de la RuBisCo est tambin regulada por la luz, aunque el enzima por s
mismo no responde a la tiorredoxina reductasa.
La RuBisCo se activa cuando el CO2 activador reacciona lentamente con un grupo -NH2 no
cargado de la lisina en el sitio activo del enzima. El carbamato resultante se une rpidamente
con Mg2+ para formar el complejo ternario activado (RuBisCo-CO2- Mg2+).
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En el estado activo, la RuBisCo une otra molcula de CO2 que reacciona con la forma 2,3-
enediol de la ribulosa-1,5-bifosfato, formando 2-carboxi-3-cetoarabinitol-1,5-bisfosfato. La
extremada inestabilidad de este ltimo intermediario conduce a la ruptura del enlace que une los
carbonos 2 y 3 de la ribulosa-1,5-bisfofato y, como secuencia, la RuBisCo libera molculas de 3-
fosfoglicerato (reaccin 2 del ciclo de Calvin).
La luz tambin induce cambios inicos reversibles en el estroma que modulan la actividad de la
RuBisCo y otras enzimas del cloroplasto. Bajo iluminacin, los protones son bombeados desde
el estroma al lumen de los tilacoides el flujo de protones esta acoplado a la incorporacin de
Mg2+ al estroma. Este flujo inico disminuye la concentracin de H+ del estroma (pH = 7 pH =
8) y aumenta la concentracin de Mg2+.
Estos cambios en la
composicin inica del
estroma se invierten en
oscuridad. Varias enzimas
del ciclo de Calvin son ms
activas a pH 8 que a pH7, y
necesitan Mg2+ como
cofactor para la catlisis.
La velocidad de transporte
de CO2 dependiente de la
luz, desde el cloroplasto a
travs de la membrana,
tambin juega un papel muy
importante en la regulacin
del ciclo de Calvin. El
carbono es exportado como
triosas fosfato e
intercambiado con
ortofosfato a travs de un
transportador de fosfato de
la membrana interna del
cloroplasto. Para asegurar un funcionamiento continuado del ciclo de Calvin, al menos cinco
sextos de las triosas fosfato se deben reciclar. As, como mucho una sexta parte puede ser
exportadas para la sntesis de sacarosa en citosol o ser derivada para la sntesis de almidn en
el cloroplasto.
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Ya en el citosol, las triosas-fosfato dan lugar a la sntesis de sacarosa, a travs de una serie de
reacciones en las que se forman fosfatos de fructosa y de glucosa.
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desdoblamiento del almidn. El manitol es otra forma de transporte de un derivado de
monosacrido.
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El ciclo fotosinttico C2 de oxidacin del carbono acta como un sistema de limpieza para
recuperar el carbono fijado durante la fotorrespiracin por la reaccin de oxigenacin de la
RuBisCo. El glicolato abandona el cloroplasto a travs de un transportador proteico especfico
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en la membrana, y difunde al peroxisoma. All es oxidado a glioxilato y perxido de hidrogeno
(H2O2) por la flavina mononucleotido oxidasa:glicolato oxidasa. La gran cantidad de H2O2
liberada en el peroxisoma es destruida por accin de la catalasa, mientras el glioxilato sufre una
transminacin. El donador del grupo amino en esta transminacin es, probablemente, el
glutamato, y el producto es el aminocido glicina. La glicina abandona el peroxisoma y entra en
la mitocondria. All, el complejo multienzimtico glicina descarboxilasa convierte dos molculas
de glicina y una de NAD+ en una molcula de serina, NADH, NH4+ y CO2. El aminocido
formado de la oxidacin de la glicina difunde rpidamente desde la matriz de la mitocondria a
los cloroplastos, donde la glutamina sintetasa la combina con esqueletos carbonados para
formar aminocidos.
En algunas plantas, cerca del 50% del carbono fijado en la fotosntesis puede ser reoxidado a
CO2 durante la fotorrespiracin.
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desarrollado un proceso diferente para captar el CO2.
En estas plantas se presentan dos variedades de cloroplastos: unos que se hallan en la clulas
internas, contiguos a los vasos conductores de las hojas, y otros que estn en las clulas del
parnquima cloroflico perifrico, lo que se llama el mesfilo de la hoja. Es en este ltimo tipo de
cloroplasto es en el que se produce la fijacin del CO2.
Dado que la unin del cido fosfoenolpirvico y el CO2 produce el cido oxalactico (u
oxaloacetato, OAA), constituido por 4 tomos de carbono, esta ruta metablica se conoce como
C4 y a los vegetales que la poseen se les denomina plantas C4.
El OAA se transforma en cido mlico (o malato), y este pasa a los cloroplastos propios de las
clulas internas, travs de los plasmodesmos. Ya este segundo tipo de cloroplastos, se libera el
dixido de carbono, que ser apto para proseguir el ciclo de Calvin. Como resultado de ello, en
las plantas C4 no se produce ningn tipo de alteracin a consecuencia de la fotorrespiracin.
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La mayora de las plantas existentes son C3, sin embargo las plantas C4 y las CAM tambin
estn presentes en la mayora de los ecosistemas, aunque ms bien las plantas CAM estn
adaptadas a las condiciones desrticas de temperatura y sequa extremas. Adems de las
crasulceas, las cactceas, las bromeliceas y las orqudeas tambin son plantas con CAM.
Al igual que en las plantas C4, en las plantas CAM tambin dos reacciones de carboxilacin,
aunque existen dos diferencias entre ambos tipos de plantas, en las CAM ambas reacciones
ocurren en la misma clula y separadas en tiempo. As, durante la noche, cuando los estomas
estn abiertos porque la temperatura desciende y la prdida de agua por evapotranspiracin es
menor, el CO2 ingresa a la planta y por accin de la enzima PEP-carboxilasa, la cual fija el CO2
en el PEP para formar OAA. Posteriormente durante el da, en presencia de molculas de ATP
y NADPH + H+ (generados en la fase luminosa), ocurre la fijacin de CO2 por la RuBisCo a
travs del ciclo de Calvin (comn a todos los modelos fotosintticos).
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