(15 Octubre)

Transcripcin.

La Transcripcin es: Sntesis de una molcula de RNA, a partir de un molde de

DNA. Si la Replicacin era la sntesis de una molcula de DNA a partir de un molde de DNA,
la Transcripcin es la sntesis de RNA a partir de un molde de DNA.

Aqu tenemos el DNA. La Replicacin era a partir de una hebra de DNA, de un

molde de DNA, sintetizo una nueva hebra de DNA. Pero la Transcripcin es: a partir de un
molde de DNA, sintetizo una molcula de RNA.

Y la clase siguiente vamos a ver lo que es la Traduccin: a partir de un molde de

RNA, sintetizo una protena.

Todos los RNA que existen, que son muchsimos, se sintetizan por Transcripcin,
todos. Los ms conocidos, y de los que nosotros vamos a hablar: RNA mensajero, RNA
ribosomal, RNA de transferencia, y RNAs pequeos. Hay ms: s, hay muchos ms RNAs,
que tienen funciones biolgicas que los conocemos hoy da, pero nosotros no los vamos a
hablar en este curso. Pero todos los RNA se sintetizan por Transcripcin, todos, sin
excepcin.

Dijimos que la Transcripcin es: a partir de un molde de DNA sintetizo una

molcula de RNA, y que la Traduccin era que a partir de ese molde de RNA se sintetiza
una protena. La verdad es que lo que transcribo, generalmente, no siempre, pero en lo
que nosotros nos vamos a dedicar, para nosotros va a ser siempre, lo que transcribimos
son genes. Los genes, ya los vimos, estn contenidos dentro de los cromosomas, que es
una molcula de DNA, ah voy a encontrar los genes. La Transcripcin puede ocurrir a
diferentes velocidades: puede ocurrir rpidamente, o puede ocurrir ms lento, se llama a
diferente tasa, lo que significa que la tasa de Transcripcin es variable.

Si transcribo rpidamente, a una alta tasa, voy a producir muchas molculas de

RNA, y esas muchas molculas de RNA finalmente se van a traducir en muchas molculas
de protenas; pero si partimos de una tasa ms lenta, voy a producir menos protenas.
Pero rpido o lento, la Transcripcin va a producir siempre RNA, y dependiendo de la tasa,
si es que este RNA es un RNA mensajero que se va a traducir, porque solo el mensajero se
traduce, el resto de los RNA no se traducen, voy a producir, finalmente, protenas. A esto,
este concepto, se llama eficiencia de la Transcripcin: hay veces que la transcripcin es
ms eficiente, a una tasa ms alta, pero a veces la transcripcin es menos eficiente, a tasa
ms baja, y eso se traduce en el producto final, en la aparicin del producto final, que es la
protena, porque este es un paso intermedio para la sntesis de la protena.

La Transcripcin qu produce: una molcula de RNA, a partir de un molde de DNA,

y ese molde lo vamos a encontrar, en el caso de los eucariontes, en nuestros cromosomas;
en el caso de los procariontes tambin.

1. Transcripcin.
 Cules son las diferencias, y ustedes ya lo saben, cules son las diferencias entre el
RNA y el DNA: el azcar, ya que el DNA tiene la Desoxirribosa y el RNA tiene la Ribosa. La
Ribosa tiene 5 grupos Hidroxilo, versus la Desoxirribosa que tiene solo 4 grupos Hidroxilo.
Y la otra diferencia que tienen las molculas de DNA son las bases nitrogenadas que vamos
a encontrar en ellas: en el caso del DNA vamos a encontrar la Timina, la pirimidina que se
llama la Timina, y en el caso del RNA no vamos a encontrar nunca la Timina, pero en lugar
de ella, para la complementariedad de base, tiene el Uracilo, que van a ser
complementarios a la Adenina.

El Uracilo, como no hay Timina, en el DNA la Timina interacciona con la Adenina,

en el caso del RNA si es que hay Adenina en el DNA, en el RNA lo que voy a tener como
base complementaria si es que formo molculas que se puedan aparear con el DNA, voy a
tener como base complementaria de la Adenina al Uracilo.

La otra caracterstica del RNA a diferencia del DNA es que la mayora, no todos,
pero la mayora de nuestros RNA los vamos a encontrar como hebra simple en la
naturaleza, una sola hebra, en cambio el DNA lo encontramos como hebra doble.

Los RNA puede plegarse y formar este tipo de estructuras, esta estructura que
tenemos ac, que es terciaria, si es que lo comparramos con las protenas. Estructuras
especficas cuando se pliegan estas molculas de RNA, como vemos aqu, y estos
plegamientos estabilizan las interacciones por puentes de hidrgeno de bases
complementarias, no todas, pero en algunos sectores estas bases, por complementariedad
de bases, interaccionan y podemos formar entonces estas estructuras especficas, que en
este caso, si no me equivoco, lo que tenemos aqu es un RNA de transferencia.

Dijimos que tenemos muchos tipos de RNA diferentes, pero nosotros de esos RNA
solo vamos a hablar de 4 de ellos, y corresponden a RNA mensajero, que le llamamos el
mRNA, el RNA ribosomal, o rRNA, el tRNA, que es el RNA de transferencia, y estos RNA
pequeos. Cada uno de ellos tiene funciones distintas:

- El RNA mensajero: Codifica para las protenas, es el mensaje, por eso se llama
mensajero, el mensaje que viene para la codificacin de una protena.
- El RNA ribosomal: Forma parte de los Ribosomas. Los Ribosomas no son slo
RNA, dijimos que son protenas que tienen porciones de RNA, y que los
Ribosomas requieren de este RNA para poder sintetizar protenas. Los RNA
ribosomales catalizan la sntesis proteica, esa es su funcin.
- El RNA de transferencia: La funcin que tienen es decodificar el mensaje.
Dijimos que los RNA mensajeros codifican protenas, dimos un mensaje para
una protena. Quin decodifica el mensaje: los RNA de transferencia. Sin los
RNA de transferencia no podramos decodificar el mensaje, pero no slo
decodifican el mensaje, sino que participan en la sntesis de la protena, junto
con los Ribosomas.

2. Transcripcin.
 - RNAs pequeos: Tambin se conocen como SNRP, SNURP, y la funcin que
tienen es participar en la maduracin del RNA mensajero. Especficamente en
los eucariontes.
- Hay ms, pero nosotros no los vamos a ver.

La sntesis de la molcula de RNA lo hace una RNA polimerasa, as como la sntesis

de una molcula de DNA la haca una DNA polimerasa, la sntesis de la molcula de RNA, a
partir del molde de DNA, la hace una enzima, la cataliza una enzima, que se llama la RNA
polimerasa. Y esta RNA polimerasa qu necesita como sustrato para sintetizar la hebra de
RNA: necesita el molde de DNA, y necesita los nucletidos trifosfatados, el ATP, el GTP, el
CTP y el UTP, y por qu trifosfatados: porque igual que la DNA polimerasa, la hidrlisis del
grupo fosfato, el tirofosfato(?) que se obtiene es lo que le da la energa para que el
proceso ocurra. En el caso de los procariontes existe una sola RNA polimerasa, que cumple
esta funcin, y en el caso de los eucariontes existen ms, pero vamos a ver, igual que en el
caso anterior, el modelo ms simple, para lograr entender lo que ocurre.

Aqu tenemos representada nuestra RNA polimerasa, aqu tenemos representada

nuestra doble hebra de DNA, que obviamente voy a tener que abrir para poder sintetizar
la hebra complementaria, pero ahora de RNA. Abro entonces mi hebra de DNA y voy a
sintetizar mi hebra de RNA, agregando mis nuevos nucletidos y alargando este RNA. Y al
igual que en el caso de la polimerasa, lo que era la horquilla de replicacin, aqu se llama la
burbuja de transcripcin, se va a ir movilizando, abriendo el DNA para copiar la hebra
complementaria, en este caso, de RNA.

La transcripcin la podemos ver a la microscopa, y parecen dos hojas, pero lo que

vemos es la transcripcin. La hebra es el DNA, y las hebras que salen a los lados son todas
hebras de RNA independientes entre s. Si este es un gen que se est transcribiendo, no
hay una RNA polimerasa que est sintetizando RNA, pensemos que es el mensajero, a
partir de esta hebra de DNA templado, sino que son muchas hebras de RNA, y cada una de
ellas est siendo sintetizada por una RNA polimerasa. La RNA polimerasa se mueve sobre
el DNA desde donde se ve ms delgado hacia donde se ve ms grueso, es decir, desde
donde las hebras de RNA se ven ms cortas hasta donde se ven ms largas. Donde se ven
ms cortas se est recin sintetizando, y a medida que va avanzando se va alargando la
hebra de RNA, hasta que se libera. En estas hojas podemos ver que esto est ocurriendo
en eucariontes, y no en procariontes, porque hay un indicio que me lo dice, que son todas
esas pelotas que hay en los extremos del RNA, que se llaman los esplaisosomas, que es
el lugar donde ocurre el splicing, cosa que los procariontes no hacen, por lo tanto, la
transcripcin en procariontes no las tiene.

Tenemos entonces nuestro gen, dijimos que lo que se transcribe son los genes, y
se transcriben los genes de rRNA, tRNA y mRNA, pero lo que se transcriben son los genes,
no se transcribe cualquier parte dentro de nuestros cromosomas. Aqu vamos a volver
nuevamente al modelo de los procariontes, vamos a hacer una mezcla, porque el modelo

3. Transcripcin.
de los procariontes es ms simple, aunque tambin vamos a ver, creo, de los eucariontes,
pero el modelo de los procariontes es ms simple.

Lo primero que hay que preguntarse es cmo la RNA polimerasa sabe que hay un
gen, porque acurdense que las hebras de DNA son largusimas, y dijimos que dentro del
DNA, el 5% codifica a genes, el 95%: la mitad secuencias nicas, la otra mitad secuencias
repetitivas; dentro de las secuencias nicas estn los genes, y es un 5% la fraccin de DNA
que codifica, o que contiene genes. Cmo sabe la polimerasa donde hay un gen: el DNA, o
el gen, tiene que tener, y obviamente tambin es una secuencia, todo en el DNA es
secuencia, tiene que tener una secuencia que digaaqu parte un gen, y esa secuencia
obviamente tiene que ser reconocida por nuestro sistema de transcripcin, y cuando
reconoce una secuencia que dice aqu parte un gen, ese gen tambin debe tener una
secuencia que diga aqu termina el gen, as que ya el mensaje est completo, o el RNA
est completo. Esa secuencia que dice aqu parte un gen se llama la secuencia
promotora, o el promotor: donde hay un promotor es porque hay un gen, y si hay un gen
que no tiene promotor, no se transcribe. Si se produce, imagnense que se produzca una
mutacin a nivel del promotor, el gen no se transcribe, no se va a transcribir ese gen, y si
ese gen es para una protena importante, no se va a producir la protena. Entonces, dnde
parte un gen: es una secuencia dentro del gen, que forma parte del gen, que se llama la
secuencia promotora, todos los genes eucariontes deben tener secuencias promotoras, si
no, no se van a transcribir. Y tenemos una secuencia tambin que dice aqu se termina el
gen, que se llama secuencia de trmino de la transcripcin.

En el caso de los procariontes, esa secuencia promotora es reconocida por una

protena pequea, que se llama la Subunidad-, y es una interaccin no covalente entre la
protena y la secuencia de nucletidos especfica, que se llama el promotor. Interacciona
con la secuencia promotora, y eso permite que venga la RNA polimerasa y se forme un
complejo entre el DNA- y la RNA polimerasa. Esto permite la separacin de la doble
hebra, a nivel del promotor, y que se puede iniciar la transcripcin, que una de las dos
hebras de DNA sirva de molde para la sntesis de la hebra complementaria de RNA. Se
inicia la transcripcin, empezada la transcripcin sale del complejo, es solamente un
complejo iniciador de la transcripcin, y despus la polimerasa sintetiza la hebra
complementaria, a una de las dos, ella va a tener que escoger dnde est el gen, a una de
las dos hebras, sintetiza la hebra de RNA complementaria hasta que llega a la secuencia de
trmino, y cuando pasa por aqu, el complejo DNA-RNA-Polimerasa, se disocia, se separa, y
se termin la transcripcin.

Aqu tenemos el promotor, que es una secuencia. Es una secuencia, pero en

realidad la secuencia que se repite en los promotores, y la que es reconocida por en el
caso de los procariontes, son estas secuencias especficas, que es una secuencia TATA, que
se conoce como el TATA box del promotor, aunque el TATA box es de los eucariontes,
porque en los procariontes recibe otro nombre, nosotros les vamos a decir a todos,

4. Transcripcin.
indistintamente, el TATA box. La secuencia de reconocimiento, para el inicio de la
transcripcin, presente en el promotor.

Y si me voy a la secuencia de trmino, y miro esta secuencia, cul es la

caracterstica de la secuencia de trmino: esta secuencia, si yo la doy vuelta, es
complementaria a la secuencia de inicio, y qu es lo que ocurre cuando la RNA polimerasa
pasa por aqu, sintetiza la hebra complementaria, porque va a sintetizar la
complementaria a la secuencia de DNA, entonces pasa por aqu, sintetiza esta hebra, y
cuando llega aqu, a todos estos TTT, en realidad esta Citosina que est interaccionando,
formando puentes de hidrgeno con esta, entonces tengo la C con la G, que son
complementarias entre ellas, y lo que hace es que este RNA que se est sintetizando, de
repente forma una cola, y se escapa de la burbuja, y el slo hecho de que el RNA salga de
la burbuja implica que la burbuja se desarma, la RNA polimerasa deja de interaccionar con
el DNA, y todos quedan libres, cada uno por su lado.

El promotor, estudiados los promotores, y aqu tenemos el promotor, dijimos que

todo gen debe tener una secuencia promotora, en el caso de los eucariontes es la
secuencia que reconoce . Estudiados los promotores, aqu tenemos diferentes
promotores, diferentes genes en un procarionte, la secuencia estamos hablando, nos
encontramos con que tenemos las dos zonas que se repiten, son secuencias altamente
repetidas, independiente del promotor. Si estudiamos el promotor completo claro, no hay
secuencias muy parecidas, pero las secuencias repetidas, en el caso de los procariontes, se
encuentran 10 nucletidos antes de que parta la secuencia que codifica para la protena,
cuando es un RNA mensajero, 10 nucletidos antes, esto se llama ro arriba -10, o 35
nucletidos antes, entre el -10 y el -35, encontramos estas secuencias que son secuencias
consenso, y que son las secuencias que reconoce, en el caso de los procariontes, la
subunidad- . En el caso de los eucariontes vamos a ver quines los reconocen, y son
factores especiales, porque los eucariontes tambin tienen estas secuencias consenso,
estas TATA, aqu est el TATA box, la caja TATA. La diferencia con los eucariontes es que,
en vez de estar entre el -10 y el -35, en el caso de los eucariontes est entre el -25 y el -75
ro arriba, antes de que empiece la secuencia que codifica para la protena.

(20 Octubre).

Estbamos hablando de la Transcripcin, la transcripcin de qu: de un gen; los

genes se transcriben. Y los genes son DNA, estn dentro de los cromosomas, y para poder
transcribir un gen, la transcripcin produce RNA, para poder transcribir un gen, y producir
RNA, y los genes pueden ser para protenas, para rRNA, para tRNA, cualquiera de ellos est
codificado en los genes, necesito un sitio promotor, algo que diga aqu, de aqu en
adelante hay un gen, y ese de aqu en adelante hay un gen es una secuencia, que se
llama la secuencia promotora, o el promotor, tambin se le conoce como el TATA box, la
caja TATA, y es la zona donde la RNA polimerasa, que es la que produce la transcripcin
reconoce como inicio de un gen, y ah se inicia la transcripcin. Y dentro de la secuencia

5. Transcripcin.
del gen, adems del sitio promotor, tenemos una zona que indica aqu se termina el gen,
para que la RNA polimerasa no est sintetizando una hebra infinita, que no tiene sentido,
porque la seccin que codifica, en el caso de una protena, termina ah, no necesito seguir
transcribiendo, o sintetizando, una hebra ms larga de RNA, y eso tambin es una
secuencia, que se llama secuencia de trmino de la transcripcin, que es, si es que yo doy
vuelta esta hebra de DNA, son hebras complementarias. Y qu es lo que ocurre realmente,
cuando va pasando la RNA polimerasa, y se parte sintetizando esto, estos parten
interaccionando entre ellos, se forma una doble hebra parcial de RNA, libera al RNA de la
polimerasa, y termina la transcripcin.

Entonces, dijimos que hay secuencias de nucletidos especficas, el promotor, la

secuencia de trmino, que dicen dnde empieza y dnde termina un gen, para la RNA
polimerasa. La secuencia promotora, existen promotores tanto en los genes procariontes
como en lo eucariontes. Tienen algunas diferencias, el procarionte con el eucarionte, pero
en principio son similares: es una zona de reconocimiento, en el caso de los procariontes
para factor , y en el caso de los eucariontes para un factor que se llama iniciador de la
transcripcin, tienen nombres distintos, pero es lo mismo, y reconozco una zona en cada
una de estas secuencias, que si yo estudio diferentes sitios promotores, esta es la E. Coli,
diferentes genes y sus sitios promotores, me doy cuenta que hay, alrededor del
-10, desde que parte la codificacin de la protena, -10 nucletidos antes, por eso le
decimos -10, hay una zona que se parece en todos los promotores, y la otra zona est en el
-35, en los procariontes, que tambin es una zona que se parece. Son estas las zonas, se
llaman secuencias consenso, son estas las zonas especficas que reconocen los factores de
iniciacin en el caso de los eucariontes, y factor en el caso de los procariontes. En el caso
de los procariontes no est entre el -10 y el -35 esta secuencia consenso, sino que est
entre el -25 y el -75, est un poco ms distanciada, pero en principio es lo mismo, y se le
conoce como el TATA box, porque si yo miro la secuencia consenso, la secuencia es
TATATA, por eso se le llam la TATA box. El sitio promotor es todo, y dentro de l tengo las
secuencias consenso, sitios especficos o puntos especficos, con los que reacciona, en este
caso, el factor de inicio, o para el caso de los procariontes, que son lo mismo, no son
iguales, porque son protenas distintas (son las dos protenas), pero conceptualmente es lo
mismo, es un sitio, una secuencia, con la que realmente interacta. Yo puedo tener, y de
hecho vamos a tener, yo puedo tener, por ejemplo, un gen eucarionte, como los nuestros,
yo puedo tener mutaciones aqu, en la secuencia, pero no me afectan en la transcripcin,
sin embargo, hay veces que, si tengo mutaciones en las cajas TATA, en las secuencias
consenso, puede ser que ese gen no se transcriba nunca. Hay enfermedades en que yo
tengo una protena que no se expresa, que no est nunca, y yo estudio el gen, y el gen est
completo, y no tiene ni una mutacin ni nada, entonces me tengo que ir a la zona del
promotor, porque puede ser que el promotor est mutado, y si est alterado el promotor,
ese RNA nunca se va a producir.

6. Transcripcin.
 La regin promotora, el promotor, que dijimos que es toda esa secuencia, es
asimtrica, lo que significa que si viene y encuentra un promotor, lo va a encontrar,
primero que todo va a distinguir entre las dos cadenas, el promotor no es promotor para
ambas cadenas, distingue entre las dos cadenas, dnde est la secuencia que reconozco.
La RNA polimerasa siempre lee y sintetiza slo en un sentido, entonces es asimtrica la
regin promotora, y cuando reconoce esa secuencia consenso, ya sea por un lado de la
hebra o por el otro, la transcripcin va a ser para un lado o para el otro, y no hay otra
opcin. Puedo encontrar genes en donde el sitio promotor est en una de las hebras, y
puedo encontrar genes en donde el sitio promotor est en la otra hebra, por lo tanto, la
regin promotora es asimtrica, y determina cul de las hebras va a servir de molde para
la transcripcin. En una ocasin podr ser una, y en la otra ocasin, en otro gen, podr ser
la otra, no siempre es una de las dos la que me sirve de hebra molde, sino que va a
depender dnde est localizado el promotor.

Etapas de la Transcripcin.

La Transcripcin, para estudio, la separamos en 3 grandes etapas.

1. Inicio: aqu tiene que ver el promotor y tiene que ver el factor , en el caso de
los procariontes.
2. Elongacin: tambin conocida como polimerizacin, que es la etapa de agregar
uno a uno los nucletidos para formar la molcula de RNA.
3. Trmino: tiene que ver con esta secuencia especfica, que se llama secuencia
de trmino de la transcripcin.

Para la iniciacin, para esta primera etapa, necesito el promotor, que exista un
promotor, para que los factores de inicio de la transcripcin, ya sea , en el caso de los
procariontes, u otros, en el caso de los eucariontes, puedan reconocer esa secuencia.
Vimos que reconoca la secuencia, y eso permita que llegara la RNA polimerasa y se
formara la burbuja de transcripcin. Una vez que se inicia la transcripcin, se copia, en el
fondo se produce, una hebra complementaria, pero ahora de RNA, a partir del molde de
DNA, y eso es la transcripcin, hasta que llego a la secuencia de trmino, y la secuencia de
trmino, esta secuencia de RNA que se va a sintetizar, complementaria a la hebra molde,
determina que el RNA se separe de la polimerasa, RNA polimerasa, y se termine entonces
la transcripcin. La RNA polimerasa sintetiza el RNA en el mismo sentido que lo haca la
DNA polimerasa. Sintetiza del 5 al 3, y lee, o avanza, sobre el DNA, de 3 a 5.

Otra caracterstica de la RNA polimerasa es que no tiene capacidad

auto-correctora, ella no corrige como la DNA polimerasa, sencillamente va, lee, no tiene
edicin, proof riding, por lo tanto ella sintetiza y no es auto-correctora, no se corrige, se
pueden producir errores, y de hecho, se van a producir un montn de errores, pero la
verdad es que esos errores no van a ser nunca permanentes, porque ese RNA se va a
degradar, y a lo ms voy a tener que sintetizar uno nuevo, para despus mandarlo a
traducir en el citosol.
7. Transcripcin.
Modelo de la Burbuja de Transcripcin.

Se inici la transcripcin, estamos en el proceso de polimerizacin, sali ,

factores, todo lo que tiene que ver con el promotor, ya estoy transcribiendo, y esto que
est aqu es el modelo de la burbuja de transcripcin, donde esto que est en rosado es la
RNA polimerasa, esto que tengo aqu es la doble hebra, que est abierta, porque solo una
de ellas es la que me sirve como molde para la sntesis del RNA, y cul de ella: la que haya
reconocido inicialmente, que tena el promotor, la secuencia promotora. Una de ellas solo
sirve de molde, la otra queda aqu, en este sentido, y ac voy a partir sintetizando desde el
5 al 3, es decir, aqu part, y aqu voy a ir agregando en el extremo 3, los nucletidos
complementarios a la hebra molde de DNA para sintetizar esta molcula, que es RNA.

Hoy da sabemos que a nivel de la burbuja de transcripcin, vamos a encontrar

esto, que es una doble hebra hbrida de DNA-RNA, pero que se va, a medida que la
polimerasa va sintetizando la hebra de RNA, esta doble hebra parcial de DNA-RNA se va
separando, hasta que llego a la secuencia de trmino y se separa completamente.
Participan otros factores, que no les vamos a conocer los nombres, que relajan aqu,
porque al igual que en la replicacin yo abro y produzco sobre-enrollamiento, entonces
hay factores que relajan, son muchas las molculas que participan en esto, nosotros slo
estamos viendo lo ms importante.

De estas dos hebras, de las dos hebras que tenemos aqu, slo una me sirve de
molde para la sntesis de la cadena de RNA complementaria a la hebra molde. Esa cadena
que me sirve de molde se llama la cadena molde, o la cadena templado, y la otra, esta que
est aqu, le decimos la cadena codificante, y por qu codificante: porque si yo despus
miro mi RNA, el producto de la transcripcin, y lo comparo con esta que no se transcribi,
que no sirvi como molde, las comparo las dos y sorpresa, son iguales, salvo que una tiene
Timina, la de DNA, y la otra va a tener Uracilo en vez de la Timina. Entonces le llamamos la
codificante a la hebra de DNA que no se transcribe, o hebra con sentido, y a la otra, la que
s se transcribe, le llamamos hebra templado, o anti sentido. Cuando yo voy a buscar un
gen a las bases de datos de genes, que estn todos, busco la secuencia de un gen, lo que
voy a encontrar en esas bases de datos es la cadena codificante, es decir, la similar al RNA
mensajero que se va a producir a partir de ese gen.

Estas transcripciones de genes eucariontes es un proceso un poco ms complejo.

La RNA polimerasa de procariontes era una, sin embargo en los eucariontes tenemos 3,
eso ya marca una diferencia. En el caso de los eucariontes no tenemos el factor , sino que
los factores que ayudan a la transcripcin se llaman factores generales de la transcripcin.
Adems de los factores generales de la transcripcin existen protenas reguladoras, que
regulan la transcripcin, ya sea la activan o la inhiben, que en los procariontes tambin
existen, y se llaman represores, aquellos que reprimen, que inhiben la transcripcin, y
activadores a aquellos que activan la transcripcin. Y una caracterstica que no tienen los
procariontes son las regiones reguladoras. Si bien tengo el promotor, que es el que

8. Transcripcin.
permite el inicio de la transcripcin, los genes en su mayora tienen regiones reguladoras
de esa transcripcin. No solo el promotor es necesario, es decir, es esencial, sino que para
que se transcriba un gen, generalmente, esos genes estn regulados, y son secuencias en
el mismo DNA, que no estn cerca del promotor, muchas veces estn bastante lejos del
promotor, los que regulan la transcripcin de un gen, y los vamos a ver en las diapositivas
que siguen. Y esto para compararlo con los procariontes, en los procariontes las regiones
reguladoras, generalmente, est al lado del promotor; en los eucariontes estn lejos del
promotor. Y por otro lado, tienen que tomar en cuenta que la transcripcin tambin est
regulada por el empaquetamiento del DNA, y aqu entran las metilaciones, fosforilaciones
y acetilaciones. Se fosforilan las histonas, se pueden presentar las regiones promotoras; se
metilan las histonas, el DNA se enrolla y las regiones promotoras quedan ocultas; por lo
tanto, para que se transcriba un gen, eucarionte, no slo est relacionada la transcripcin
con protenas reguladoras, sino que tambin con las modificaciones covalentes que
pueden sufrir las histonas.

Aqu tenemos las 3 RNA polimerasas de los eucariontes, y la verdad es que estn
especializadas, pero no necesito saber en qu. Slo necesito saber que hay 3, y que cada
una est especializada en el tipo de RNA que sintetiza. Dijimos que hay muchos tipos de
RNA, pero las RNA polimerasas, nada ms para decirles que las RNA polimerasa, las 3
eucariontes estn especializadas dependiendo del tipo de RNA que sintetizan. Hay una que
sintetiza el rRNA, otra el mRNA, otra el tRNA, otras los RNA pequeos, los SNURPS, y otras
los otros genes de RNA que nosotros no vamos a ver en este curso.

- La I: rRNA.
- La II: mRNA, aquellos que codifican para protena.
- La III: tRNA, principalmente.

Transcripcin en Eucariontes.

Lo mismo, el mismo principio de arriba: si no hay un TATA box, nada se transcribe,

y si ese TATA box est mutado, o hay alguna secuencia que est alterada, y est en esa
zona consenso, lo ms probable es que ese gen no se va a transcribir, o que va a perder su
regulacin y se va a transcribir mucho.

Entonces, necesito el TATA box para que se pueda iniciar la transcripcin. All
arriba tenemos entonces nuestro TATA box, y ese TATA box es reconocido por factores
generales de la transcripcin. Por qu decimos factores generales de la transcripcin:
porque si ustedes ven, son muchos los factores, y no tengo que aprenderme los nombres,
no vale la pena para este curso, son factores generales de la transcripcin, y son muchos,
los cuales se asocian al TATA box, y esta asociacin a la caja TATA, al promotor, permite
que llegue la RNA polimerasa, y la RNA polimerasa cuando llega y reconoce todos estos
factores que se asociaron aqu, a la regin promotora, no slo tiene que asociarse a los
factores generales y partir, esto no es la burbuja de transcripcin an, porque estos
factores se van a perder, no slo tiene que asociarse a los factores, sino que tambin debe
9. Transcripcin.
activarse por fosforilacin. Ah estn todos los factores asociados, pero si se fosforilan,
como en este caso, recin la RNA polimerasa est activa. Cuando se fosforila y est activa,
est lista para iniciar la transcripcin, es decir, sintetizar una hebra de RNA a partir del
molde de DNA, y estos factores generales de la transcripcin, se disocian.

Aqu tenemos ms o menos cmo se ven todos estos factores generales de la

transcripcin, ms las protenas reguladoras, porque como vimos, para que se transcriba
una hebra de DNA en RNA en los eucariontes, no solo necesitbamos de los factores
generales de la transcripcin, todos estos que estn aqu, donde tenemos la que reconoce
al TATA, se asocian varios factores, llega la RNA polimerasa, y aqu tenemos ms protenas,
y aqu tenemos protenas reguladoras de la transcripcin. Se tienen que conglomerar
todas ellas, obviamente no tienen que estar metiladas las histonas donde se encuentra ese
gen, para que se pueda iniciar la transcripcin.

Estas protenas reguladoras, dijimos las protenas que regulan positivamente la

transcripcin, se llaman activadores, y las que regulan negativamente la transcripcin se
llaman represores. Los activadores y los represores reconocen sitios, zonas, secuencias
especficas, presentes en ese DNA. Esa secuencia, porque es una secuencia que reconoce
el activador, generalmente las protenas activadoras reconocen la secuencia, y se asocian
con los factores generales, para poder iniciar la transcripcin. Esta secuencia que
reconocen los activadores, se llaman los enhancer, y los represores tambin reconocen
secuencias de DNA, y las secuencias que reconocen los represores se llaman los silencer.
Entonces, para que se pueda transcribir este gen eucarionte, necesito el sitio promotor,
los factores generales, estas protenas transcripcionales, y adems las protenas
reguladoras, ya sean activadores o represores. La secuencia, el enhancer, o los enhancers,
porque vemos que este gen est regulado por tres protenas, por tres, y cada una
reconociendo su sitio especfico, su enhancer, y qu es lo que es un enhancer, es una
secuencia reguladora de DNA, que puede ser reconocida por estas secuencias reguladoras.
En muchas ocasiones estos enhancer no estn cerca del gen, sino que estn a grandes
distancias de l, incluso pueden haber genes entre medio, pero como el DNA, esta doble
hebra, puede enrollarse, acercarse, la zona de los enhancer queda en la zona donde se
est produciendo la burbuja de transcripcin.

Si yo estiro mi DNA en un sitio especfico, para que se inicie la transcripcin, pero

si yo lo estiro como lo estoy estirando arriba, tengo ah el TATA box, aqu parte la
secuencia codificante, esta transcripcin es para RNA mensajero, y la secuencia reguladora
enhancer est lejos, y aqu est la protena reguladora, que reconoce por una parte el
enhancer, y por otro lado, este activador, reconoce aqu el sitio de la burbuja de
transcripcin. Estos son los factores generales, y aqu tenemos otras molculas
reguladoras, estas protenas reguladoras de aqu, que despus vamos a ver qu es lo que
podran ser.

10. Transcripcin.
 As vemos, ah tenemos los nucleosomas, as vemos nuestro DNA eucarionte,
dijimos que como nucleosoma, y tambin como solenoides, cuando estos nucleosomas
estn enrollados los vamos a ver ms o menos as. Por qu se parte transcribiendo un gen,
por qu se inicia la transcripcin de un gen: porque llega, generalmente, una protena
activadora, un activador, y ese activador reconoce la zona reguladora, un enhancer, o una
zona especfica que, aqu en este caso una protena activadora, que reconoce una
secuencia especfica en el DNA, que generalmente queda expuesta, y ese reconocimiento,
en el caso de los eucariontes, puede atraer diferentes molculas presentes en el Ncleo.
En este caso puede atraer, por ejemplo, una acetilasa, que acetilan las histonas, e histonas
acetiladas, de acuerdo al cdigo de histonas, era traduccin de genes. Se acetilan las
histonas, y las acetilaciones qu es lo que hacen: descondensar el DNA rpidamente,
entonces se descondensa el DNA y se puede formar la burbuja de transcripcin, porque
queda expuesto el promotor, ah est el promotor, escondido, no lo ve nadie, pero si se
acetilan, se separan, promotor expuesto, y puedo iniciar la transcripcin. O, hoy da
sabemos tambin, que existe un complejo que se llama remodelador de la cromatina, y en
este caso, esta protena activadora, ese activador de ah, que reconoci una secuencia,
puede atraer el complejo remodelador, y el complejo remodelador su funcin es
descondensar el DNA. Podra ser cualquiera de las dos opciones, y si descondenso el DNA y
el sitio promotor queda expuesto, entonces puedo iniciar la transcripcin, vienen factores
generales, reconocen, y viene generalmente la RNA polimerasa, y se inicia la transcripcin.

Estos sitios, estas zonas que son reconocidas por activadores o represores, en el
fondo las protenas lo que reconocen aqu, estas protenas reguladoras, es una secuencia
en el DNA, y una secuencia que voy a encontrar dnde, y por eso que hablamos de los
surcos, y lo vamos a retomar nuevamente en la clase de regulacin, reconocen qu:
reconocen, en el fondo, la zona del surco con una secuencia especfica de DNA, no
cualquier surco, y se unen, se forma una interaccin, esta es una protena reguladora, esta
es la zona del surco mayor, interaccionan por fuerzas no covalentes, las protenas
reguladoras, con una secuencia especfica en el surco mayor del DNA, y esta interaccin
desencadena, finalmente, las diferentes acciones que llevan a que ese gen, o un gen
determinado, se pueda transcribir. Entonces, si yo me devuelvo, esta interaccin de aqu,
en realidad eso que est ocurriendo ah, es esto, una protena interaccionando por fuerzas
no covalentes con el DNA, en este caso aqu la doble hebra de DNA va a ser
complementaria, interaccionando aqu, a esta zona, y desencadenando entonces que se
inicie la transcripcin.

En muchas ocasiones no es una la protena que regula la transcripcin, sino que en

muchas ocasiones son muchas las protenas. Aqu tenemos muchas protenas que tienen
que estar presentes para que se pueda iniciar la transcripcin, entonces no es una, en el
caso de los genes eucariontes, sino que muchas las protenas que regulan la transcripcin,
y los sitios reguladores, los enhancer, generalmente estn lejos de la zona donde se
encuentra el promotor. Pueden estar cerca, como en este caso, pero en muchos casos

11. Transcripcin.
estn lejos de la zona promotora. Todos estos factores tienen que ponerse de acuerdo, y
estar en el momento, para que se inicie la transcripcin.

Se inici la transcripcin, ya nos sacamos todos los factores, todas las protenas,
todos los activadores, etc., por lo tanto se logr formar la burbuja de transcripcin; y esta
burbuja de transcripcin, en el caso de la transcripcin en eucariontes, tiene, adems de la
RNA polimerasa, otras protenas, que les llamamos factores, que lo que van a hacer es
modificar, a medida que el RNA se est sintetizando, van a ir modificando, especialmente
el RNA mensajero, van a ir produciendo modificaciones a ese RNA que se est
transcribiendo, y a esas modificaciones, aqu tenemos el RNA que se est transcribiendo,
complementario a la hebra molde, templado, de DNA, y a medida que se va sintetizando
este RNA, estos factores asociados a la polimerasa, le van a ir produciendo modificaciones
a ese RNA, en este caso mensajero. Esas modificaciones se llaman procesamiento del RNA.
El RNA tiene que ser procesado antes de convertirse en lo que conocemos con el nombre
de RNA maduro. En el caso de los RNA mensajeros que codifican para protena, el RNA se
sintetiza, y en el Ncleo, a medida que se va sintetizando, se va modificando, procesando,
tambin se dice madurando, el RNA debe madurar antes de salir del Ncleo. Si no madura,
si no se procesa, si no sufre estos cambios, no sale nunca del Ncleo; y si es un RNA
mensajero, no me sirve de nada para siempre en el Ncleo, porque tengo que mandarlo al
citosol para que contine, y sea utilizado para la sntesis de las protenas.

Aqu tenemos un RNA que ha sido procesado en el Ncleo, que ha madurado. En

qu consiste este proceso de maduracin en el Ncleo: consiste en agregar una caperuza
en el extremo 5, en la zona inicial del RNA, le agrego una caperuza, que en ingls a ese
proceso se le llama caping, le agrego una caperuza; en el extremo final, una vez que el
extremo final se liber, tengo enzimas que le agregan muchas Adeninas, muchos
nucletidos Adenina, el RNA por el extremo 3 OH se le agrega una cola poli-A, se adenila
el RNA mensajero, el segundo de los procesos de maduracin; y en el caso de los RNA
eucarionte, los genes de los DNA eucarionte tienen secuencias que codifican para la
protena, que se llaman exones, y tienen secuencias no codificantes para protenas, que se
llaman intrones. En el Ncleo, antes de que ese RNA mensajero salga hacia el citosol para
sea traducido, debo eliminar las secuencias no codificantes, es decir, los intrones, y a ese
proceso se le llama splicing en ingls, corte y empalme en castellano. Para qu debo
modificar el transcrito primario, as le llamamos al RNA inicial, o al RNA que se producira,
porque hoy da sabemos que a medida que se va sintetizando lo vamos procesando, pero
transcrito primario se llama si es que se copia la hebra complementaria completamente.
Para qu se modifica, para qu se procesa ese RNA mensajero: 1. Para darle mayor
estabilidad; 2. Para ayudarlo a exportarse fuera del Ncleo. Por qu: porque las protenas,
los receptores de exporte nuclear, reconocen caperuza y cola; slo van a sacar los RNA que
tengan caperuza y cola, que estn modificados; y por otro lado es una forma de mostrar
que ese RNA mensajero tiene el mensaje completo, que no se parti degradando en el
Ncleo, la cola poli-A por ejemplo, se puede partir degradando, o que se pueda degradar

12. Transcripcin.
por la mitad y quedarme con caperuza y sin cola, y el otro pedazo con cola y sin caperuza,
me dice adems que el mensaje est completo, tiene caperuza y tiene cola, por lo tanto es
digno de ser exportado del Ncleo para que en el citosol pueda ser utilizado para la
Traduccin.

Caperuza.

La caperuza se le agrega en el extremo 5 Fosfato. Aqu tenemos la cadena de RNA,

y dijimos que la cadena de RNA va a tener un extremo 5, y un extremo 3. Aqu se le
agrega una molcula, que es la 7-metil-guanosina, es otro nucletido, aqu tenemos el
azcar, los fosfatos, y en este caso la Guanina, es una guanosina, es un nucletido, pero
que se agrega al revs, se forma un enlace fosfato, es un enlace bien especial, y se forma
esto que es lo que se llama la caperuza, que es lo que en el fondo evita que este RNA se
parta degradando desde este lado. La caperuza que se adhiere, entonces es una molcula
que se llama la 7-metil-guanosina.

El segundo de los procesamientos: los genes eucariontes tienen secuencias

codificantes, que se llaman exones, y no codificantes, que se llaman intrones. Se transcribe
el gen completo, en la transcripcin la RNA polimerasa no hace distincin entre intrones y
exones y lo copia todo, y a medida que esto se va produciendo, despus que se ha
sintetizado la hebra de RNA, entonces sufre este proceso que se llama splicing, que no es
ms que tomar las secuencias no codificantes, sacarlas, unir las codificantes, y quedar
entonces con un RNA mensajero que solo tenga secuencias codificantes. Esto no ocurre en
los procariontes, porque los procariontes solo tienen secuencias codificantes, los
procariontes no tienen intrones, los genes procariontes.

Este proceso de splicing es un proceso enzimtico, hay enzimas que producen, que
cortan y empalman, cortan el intrn y empalman los exones. Son enzimas, y esas enzimas
son sper especiales, porque son Ribosimas, es decir, son enzimas de RNA, y cmo se
llaman esas enzimas de RNA: se llaman, o les decimos, los SNURPS, tambin las partculas
SNRNP. Y qu son: son Ribosimas, son partculas grandes, pero la actividad cataltica la
tienen los RNA, y cules son esos RNA que tienen actividad cataltica: los RNA pequeos,
esos SNRNA, o tambin conocidos como RNAs pequeos, porque ese SN viene de Small
Nucleolar. Entonces, qu hacen estas Ribosimas, estos SNURPS: estos SNURPS reconocen
secuencias especficas en este RNA, en este transcrito primario, y son las secuencias
intrn-exn, y las secuencias intrnicas y exnicas, son zonas especficas dentro del intrn,
y creo que es ac, en esta parte, esto no es para este curso, pero creo que es en esta zona
tambin donde reconoce, y qu es lo que hacen los SNURPS, ms de uno: uno reconoce
uno, el otro reconoce el otro, y lo que hacen es pescar la hebra completa y la juntan en la
zona. La teora del corte de los intrones se llama la teora del lazo, porque un SNURP
reconoce ah, el otro en la otra zona, y qu es lo que hacen: se acercan, y forman este
verdadero lazo; ellas mismas, adems, cortan ah, zonas especficas, secuencias
especficas, y cortan y despus empalman, es decir, cortan la zona del intrn, cortan,

13. Transcripcin.
forman este lazo, y finalmente empalman. Y a todo ese proceso se le conoce como splicing
en ingls, o como corte y empalme en espaol.

Y le agrego la caperuza, ocurre el splicing, para qu: para sacar las secuencias no
codificantes, por quin: por los SNURPS, o los SNRNP, y finalmente le agrego una cola poli-
A, y esas son las tres modificaciones que debe sufrir un RNA, un transcrito primario, para
transformarse en un RNA maduro, y slo los RNA maduros van a salir del Ncleo.

Va apareciendo la hebra de RNA, 5 Fosfato, caperuza. Sigue, y los SNURPS van

haciendo splicing, y cuando termina de sintetizarse agrega la cola poli-A, en ese orden.
Hoy da sabemos que todo eso va ocurriendo a medida que se va sintetizando la hebra de
RNA, y lo vemos a la microfotografa electrnica.

Qu tenemos aqu: la misma foto, la misma hoja que vimos la clase pasada, y yo
les dije que esto es eucarionte, porque estaban estas cosas grandes al final, y qu es lo que
es eso: el lugar donde est ocurriendo el splicing, donde estn todos los SNURPS, y estn
armando en el fondo, o procesando este transcrito primario para que se transforme en un
RNA mensajero maduro. Y se ve como hoja porque se ve que hasta un punto se va
alargando la hoja, pero de repente se va acortando, y eso es por el splicing, entonces por
eso se ve como hoja, porque si no tendra que verla cada vez ms grande, pero se ve como
hoja, porque se van cortando las regiones no codificantes. Esto a la microfotografa, para
los microscopistas, se llama los esplaisosomas, donde est ocurriendo el splicing.

Proyecto Genoma Humano.

Es obtener la secuenciacin de todo el DNA humano, y se demoraron mucho

menos de lo que esperaban, y sorpresa, cuntos genes tenemos los humanos, cuntas
protenas tenemos ms o menos, cul es la estimacin que hemos hecho ms o menos de
las protenas que tenemos los humanos: 100 mil a 120 mil protenas diferentes.

Lo que deca el dogma de la biologa molecular era: Un gen, una protena,

entonces, debamos tener de 100 a 120 mil genes. Sin embargo, el proyecto genoma
humano encontr aproximadamente 35 mil genes. Cmo puedo producir 100 mil o 120 mil
protenas distintas, a partir de 35 mil genes: la respuesta, en los eucariontes, en los
humanos, en nosotros, la dieron los SNURPS, la dio el Splicing. El splicing fue la respuesta
para que nosotros, a partir de 35 mil genes, pudisemos producir 100 mil protenas
diferentes, y ah nace el concepto de splicing alternativo.

Aqu tenemos un gen, la -tropo-miosina, que la encontramos en los filamentos

delgados de la clula muscular, pero no solo la encontramos ah, aqu tenemos el gen de la
-tropo-miosina, y ese gen tiene exones e intrones, generalmente los intrones son mucho
ms largos que los exones. Este gen, a partir de este gen, si este gen se expresa en la clula
del msculo estriado, los exones, a partir de ese gen, son estos en celeste, y estos de aqu
son la zona de los intrones. Pero si ese mismo gen se expresa en el msculo liso, los

14. Transcripcin.
exones ahora son un poco distintos, este es el mismo, pero aqu hay un exn que aqu no
haba, estos son iguales, etc. Y por qu proceso el mismo gen, la clula muscular lisa de la
clula muscular estriada: porque puede procesar diferente, hacer diferentes splicing, a
partir del mismo transcrito primario, una clula o la otra, porque expresan diferentes
SNURPS. No hay un SNURP, hay muchos SNURPS, y los SNURPS van a reconocer secuencias
especficas en el DNA. Uno va a decir aqu hay un intrn, voy a sacar ac, en cambio que
otro va a decir que esto no era intrn, sino que era exn, y eso se llama splicing
alternativo. Y el splicing alternativo, como vemos aqu, a partir del mismo gen, msculo
liso, msculo estriado, fibroblasto, o clula cerebral, procesan distinto el mismo transcrito
primario, y van a producir diferentes protenas al final. Entonces, yo aqu a partir de un
gen, como en este caso, puedo producir 4 protenas diferentes. 35 mil x 4 = 140 mil, me
sobran protenas, no todas se procesan, por supuesto, con splicing alternativo, el cual
viene a explicarnos por qu con 35 mil genes, puedo producir 100 mil protenas diferentes.

Resumen.

En los procariontes, a partir del DNA, se transcribe el DNA a un RNA mensajero,

todo ocurre en el mismo lugar, en el citosol de la clula procarionte, y en el mismo citosol
tambin se traduce un RNA mensajero; cuando la transcripcin es a RNA mensajero, se
traduce a protena.

En los eucariontes tenemos: en el Ncleo tenemos en el DNA, en el Ncleo se

produce la transcripcin, la transcripcin produce un transcrito, que se llama el transcrito
primario. Ese transcrito primario debe sufrir procesamiento, y el procesamiento, o
maduracin, consiste en agregar una caperuza en el extremo
5 Fosfato, sufrir splicing, ese transcrito primario, y agregar una cola poli-A. Slo si ha
sufrido este proceso de maduracin se va a formar el RNA que conocemos como RNA
maduro, con caperuza y con cola; y slo RNA maduro, que tenga la caperuza y la cola,
puede ser exportado desde el ncleo, porque las protenas de exporte nuclear, las que
exportan molculas del ncleo, reconocen caperuza y cola, y lo sacan. Si no tiene alguna
de las dos, se queda adentro y se degrada, sale el RNA maduro desde el ncleo hacia el
citosol, y en el citosol, cuando es RNA mensajero, se traduce a protena.

15. Transcripcin.