Protenas

Definiciones, Aminocidos y Pptidos

 Definiciones
Macromolculas formadas por aminocidos.
Son las biomolculas ms abundantes en los
vertebrados (50% del peso seco de los tejidos)
Son estructurales y funcionales:
Enzimas
Hormonas
Molculas de transporte: hemoglobina
Molculas estructurales: colgeno, elastina, queratina
Receptores celulares
 Composicin de las protenas
Las protena se componen de: Carbono, Nitrgeno,
Oxgeno, Hidrgeno y casi todas tambin de Azufre.

El contenido porcentual promedio de Nitrgeno de las

protenas de origen animal es de aproximadamente
16%; lo que emite una relacin por cada gramos de
Nitrgeno determinado en un amuestra un contenido
proteico de aproximadamente 6,25g.

Las protenas son heteropolmeros de aminocidos

unidos por enlaces amidas, denominados como enlaces
peptdicos
 -Aminocidos
Son las unidades estructurales de las protenas
 Familias L D de -Aminocidos
Todos los compuestos de
configuracin
comparable a la del L-
Gliceraldehdo, son
denominados L an
cuando no sean
levgiros
Todos los compuestos
con la configuracin
espacial del D-
Gliceraldehdo son
llamados D aunque no
sean dextrgiros.
Nmina de aminocidos
 Nomenclatura de Aminocidos
Aminocido Abreviatura Smbolo Aminocido Abreviatura Smbolo
Glicina Gly G Cistena Cys C
Alanina Ala A Metionina Met M
Valina Val V c. Asprtico Asp D
Leucina Leu L c. Glutmico Glu E
Isoleucina Ile I Asparagina Asn N
Serina Ser S Glutamina Gln Q
Treonina Thr T Lisina Lys K
Fenilalanina Phe F Arginina Arg R
Tirosina Tyr Y Histidina His H
Triptfano Trp W Prolina Pro P
Clasificacin de los Aminocidos
R-Polar no
ionizable
Alifticos
R-No polar
Neutros Aromticos

Azufrados

cidos
Aminocidos
No Neutros
Bsicos
Prolina

Otros
Aminocidos Alifticos Neutros con
cadena no polar
Aminocidos Alifticos Neutros con
cadena polar no ionizable
Aminocidos Neutros Aromticos
Aminocidos Azufrados
Aminocidos cidos (Dicarboxlicos)
Aminocidos Bsicos
Prolina e hidroxiprolina
Otros aminocidos
 Propiedades de aminocidos
El comportamiento del aminocido radica en las
propiedades de su cadena R.

Aminocidos Polares: Glicina, Serina, Treonina, Cistena,

Tirosina, cido Asprtico, cido Glutmico, Asparragina,
Glutamina, Lisina, Histitidina y Arginina.
Aminocidos No Polares: Alanina, Valina, Leucina,
Isoleucina, Metionina, Fenilalanina, Triptfano y Prolina.
Propiedades cido-Base de los
Aminocidos
Propiedades cido-Base de los
Aminocidos
 Curva de titulacin de Aminocidos
Para el carboxilo:

Para el amino:
 Pptidos

La Unin Peptdica
El Enlace Peptdico
Pptidos de importancia biolgica
 Algunas Hormonas Peptdicas
Nombre N de aminocidos constituyentes Funcin

Angiotensina II 8 Hipertensora

Vasopresina 9 Regulacin del balance hdrico

Oxitocina 9 Estimula contraccin uterina

Bradicinina 9 Hipotensora

Calidina 10 Hipotensora

Gastrina I 17 Estimula la secrecin de HCl en el estmago

Melanocito estimulante 18 Incrementa depsito de melanina

Secretina 27 Estimula secrecin de jugo pancretico

Glucagn 29 Hiperglucemiante

Calcitonina 32 Disminuye nivel de Ca en sangre

Colecistoquinina-pancreozimina 33 Estimula la contraccin de vescula biliar y secrecin de

enzimas pancreticas
Adrenocorticotrofina 39 Estimula corteza suprarrenal
 Nomenclatura de los Pptidos
Se nombran siguiendo el orden de los aminocidos integrantes a partir del que posee
el grupo -amina libre, indicndolos con la raz de su nombre seguido por el sufijo -il.

El ltimo aminocido, con el grupo carboxilo libre, se menciona con su nombre

completo.

Por ejemplo: Hexapptido seril-aspartil-tirosil-lisil-alanil-cistena

 Reacciones sobre el enlace peptdico
Reaccin del Biuret:

Prtido + catin Cu2+ + Alcalino coloracin azul violceo

 Protenas

Niveles estructurales y Funcionalidad

 Protenas

Propiedades Generales:

Propiedades cido-Base
Electroforesis
Masa Molecular
Solubilidad
Dilisis - Ultrafiltracin
 Propiedades cido-base de las
protenas
Los restos -amina y carboxilos implicados en el enlace
peptdico no son ionizables

Los restos -amina y carboxilo terminales son ionizables.

La carga neta de una protena depende de los restos -

amino y carboxilos de las cadenas R
Lis, Arg e His otorgan carcter bsico
Asp y Glu otorgan carcter cido
Tyr y Cys otorgan carcter levemente cido
 Propiedades cido-base de las
protenas
Propiedades Buffer
A pH francamente cidos:
Los restos -amino libres captan protones -NH3+
Los restos carboxilos libres estn no disociados -COOH
La protena presentar carga neta positiva

A pH francamente Alcalino:
Los restos -amino libres estn no disociados -NH2
Los restos carboxilos libres se encuentras disociados -COO-
La protena presentar carga neta negativa

A pH fisiolgico:
6,0 a 8,0; slo His presenta propiedades buffer (pKa=6,0)
 Propiedades cido-base de las
protenas
Titulacin cido-base de protenas netamente cidas
con un lcali diluido:

Los grupos cidos libres comenzarn a liberar sus protones

volvindose progresivamente ms electronegativa pero
sigue manteniendo una carga neta electropositiva.

Situacin de pHi o pI; la protena presenta carga positivas y

negativas en la misma cantidad, su carga neta es cero.

Si el pH sigue aumentando; comienzan a ionizarse los

grupos menos cidos (-SH, fenol, NH3+), hasta que la
protena se torna netamente electropositiva.
 Propiedades cido-base de las
protenas
Dos protenas con diferente cantidad de grupos cidos
y bsicos tendrn diferente carga neta a un mismo pH.

La carga neta de una protena es proporcional a la

diferencia entre el pH del medio y su pHi.

Ser ms electropositiva cuanto ms bajo sea el pH con

respecto a su pHi.

Ser ms electronegativa cuanto ms alto sea el pH con

respecto a su pHi
 Electroforesis
Definicin:
Movimiento de solutos
cargados en respuesta a un
campo elctrico; se utiliza con
frecuencia para separar
mezclas de iones, protenas o
cidos nuclicos.

En gel de poliacrilamida:
Suelen utilizarse geles de
poliacrilamida, que actan
como una criba molecular que
retrasa la migracin de las
protenas en un campo
elctrico
 Electroforesis de protenas
En gel de poliacrilamida
con dodecil sulfato de
sodio (SDS):
Comnmente se utiliza para
estimar la pureza y masa
molecular, su funcin es
intensificar la carga neta
negativa de la protena,
adems de modificar la
estructura proteica
llevndolas a todas a una
misma forma molecular.
 Electroforesis de protenas
Isoelectroenfoque:
Permite determinar el pHi de una
protena haciendo uso de un
soporte que presenta un
gradiente de pH (haciendo uso de
una mezcla de cidos y bases
orgnicos de bajo peso
molecular)
Electroforesis de protenas
Electroforesis bidimensional:
Consiste en realizar una segunda
electroforesis en gel de
poliacrilamida en corrida
perpendicular a una primera (que
puede ser cualquiera de las dos
anteriores).
Esta electroforesis permite separa
protenas de similar masa molecular
pero que difieren en su pHi o
viceversa.
 Masa molecular
Las ms pequeas: 6.000Da
Las ms grandes: varios 1.000.000Da
Estimacin del nmero de aminocidos
PM [Da] / 120 [Da] = N de AA
Mtodos de determinacin:
Ultracentrifugacin (500.000g)
Cromatografa de filtracin por geles.
Electroforesis en geles.
Centrifugacin en gradientes de densidad.
 Solubilidad
La mayora de las protenas generan
dispersiones coloidales estables en solucin
acuosa.
Factores de estabilidad:
Solvatacin, hidratacin
Efecto de la temperatura
Efecto del pH
Efecto salino
Efecto de solventes poco polares
 Solubilidad de las protenas
Solvatacin Hidratacin:
Solventes polares.
Elevada constante dielctrica del
agua.
Impedimento de agregacin
molecular.
Grupos atractivos en las
protenas: -NH3+, -COO-, -OH, -SH,
=NH.
 Solubilidad de las protenas
Efecto del pH:
Determina la magnitud de la carga neta de la protena.
A menor carga en la protena, menor solubilidad; suelen
precipitar a su pHi. (separacin isoelctrica).
 Solubilidad de las protenas
Efecto salino:
En bajas concentraciones las sales neutras facilitan
la disolucin de las protenas.
En altas concentraciones las sales neutras
aumentan la precipitacin de las protenas.
Fraccionamiento salino:
Sulfato de amonio
Sulfato de magnesio
Sulfato de sodio
Hiposulfito de sodio (Tiosulfato de sodio)
 Solubilidad de las protenas
Efecto de solventes poco polares:
Disminuyen la capa de hidratacin.
Provocan precipitacin con desnaturalizacin.
Agregado de acetona, alcohol.
Fraccionamiento alcohlico.
 Dilisis -Ultrafiltracin
Eliminacin de molculas pequeas de una solucin de
una macromolcula permitindoles que difundan a
travs de una membrana semipermeable al agua.
Forma y estructura molecular
 Forma Molecular
Segn cul sea la forma molecular al estado natural.
Protenas Globulares:
La protena se pliega sobre s misma para formar un conjunto
compacto similar a un esteroide u ovoide con sus tres ejes de
similar longitud. Son principalmente protenas funcionales y
generalmente solubles en agua.
Enzimas, anticuerpos, hormonas, hemoglobina, inmunoglobulinas,
etc.
Protenas Fibrilares:
Las cadenas polipeptdicas se ordenan paralelamente formando
fibras o lminas extendidas, en las que el eje longitudinal
predomina sobre los otros; generalmente son poco solubles en
agua.
Colgeno, queratina, elastina, etc.
 Estructura molecular
Estructura Primaria
Se refiere al nmero, identidad y ordenamiento de los AA que
constituyen la cadena proteica. Se constituyen en cadenas lineales
sin ramificaciones.
Estructura Secundaria
Es la disposicin espacial regular, repetitiva, que adopta la cadena
polipeptdica.
Estructura Terciaria
Arquitectura tridimensional completa de la protena.
Estructura Cuaternaria
Se aplica solo a protenas constituidas por ms de una cadena
polipetdica y refiere a la disposicin espacial y a los enlaces que se
establecen entre ellas.
Estructura Molecular de las protenas
Patologas asociadas a las protenas del organismo
 Estructura primaria de las protenas
Se refiere a la secuencia de aminocidos que
componen la cadena proteica.
La determinacin de esta estructura es fundamental
en el estudio de las molculas protenicas.
Esta estructura es la principal determinante de su
conformacin, propiedades y caractersticas
funcionales.
Estructura Secundaria de las protenas
Se refiere a la posicin espacial que adopta la cadena
polipeptdica.
Depende de la orientacin de los enlaces entre los tomos C-
N-C- que se suceden en la cadena polipeptdica.
Se debe a la rigidez y flexibilidad existentes en los enlaces y
coexistentes en el enlace peptdico.
Estructura secundaria de las protenas
Estructura de -hlice
Estructura tubular, que presenta enrollamiento en sentido dextrgiro
con 3,6 restos AA por cada giro, cada giro de hlice cubre una distancia
de 0,54nm. Cada AA abarca una altura de 0,15nm y un ngulo de 100
alrededor del eje.
Se estabiliza por enlaces puente hidrgeno entre los AA de una misma
cadena. La presencia de: prolina, arginina, lisina, glutamato, impiden
esta organizacin estructural.
Estructura de hoja plegada o lmina-
Estructura laminar con plegamiento en zigzag, en la que cada AA cubre
un espacio de 0,35nm
Se estabiliza por enlaces puente hidrgeno entre AA de diferentes
cadenas. Las cadenas pueden sufrir apareamiento paralelo o
antiparalelo. Pueden participar varias cadenas o nicamente una
haciendo uso de una horquilla.
Disposicin al azar
Estructura en -hlice
Estructura en lmina-
Estructura terciaria de las protenas
Es la conformacin tridimensional caracterstica para cada
protena.
Determina la clasificacin en protenas globulares o fibrilares.
Fibrilares: toda la molcula puede disponerse en -hlice o en lmina-
; franco predominio del eje longitudinal sobre los dems.
Globulares: gran cantidad de fragmentos al azar que pueden
combinarse con fragmentos en -hlice o en lmina-.
Fuerzas de estabilizacin de la estructura terciaria.
Fuerzas de atraccin o repulsin electrosttica.
Enlaces de hidrgeno.
Presencia de cadenas hidrofbicas o hidroflicas.
Puentes disulfuro.
Fuerzas de estabilizacin de la
estructura terciaria
Representacin de la estructura
terciaria de las protenas
Algunos ejemplos:
Estructura cuaternaria de las protenas
Se presenta en las protenas oligomricas:
Insulina (dos subunidades).
Hemoglobina (cuatro subunidades).
Creatinafosfoquinasa (dos subunidades).

Se refiere a la disposicin espacial de las subunidades.

Fuerzas de estabilizacin:
Uniones puente hidrgeno.
Atracciones electrostticas.
Interacciones hidrofbicas e hidroflicas.
Uniones puente disulfuro.
Algunos ejemplos:
 Complejos multimoleculares
Asociacin de diferentes protenas que interactan
entre s y con otras molculas:
Complejos enzimticos de la membrana mitocondrial
interna.
Ribosomas
Proteosomas
Complejo ATP sintasa
 Algunas consideraciones sobre la
estructura cuaternaria de las protenas

La estructura primaria es la determinante de la

conformacin de una protena.

Las fuerzas e interacciones que mantienen las

estructuras 2, 3 y 4 resultan de los R de los AA
de la estructura 1.

Estructura 1 y evolucin de especie

 Desnaturalizacin de protenas
Comprende la prdida de las estructuras cuaternarias, terciarias y
secundarias.

Hay pedida de la configuracin normal.

Generalmente la protena precipita de la solucin.

Agentes Desnaturalizantes:
Calor
Radiaciones
Congelamientos repetidos
Cambios de pH
Sales inicas
Solventes poco polares
Solucin de urea
 Clasificacin de las protenas
Clasificacin de las Protenas

Protenas Protenas
Simples Conjugadas

Albminas Nucleoprote
nas

Globulinas Cromoprote
nas

Histonas Glicoproten
as

Protaminas Fosfoproten
as
Queratina
Gliadinas y Lipoprotena
Glutelinas s
Colgeno

Escleroprote Metaloprote
nas Elastinas nas
Aminocidos esenciales en la nutricin
Fenilalanina
Isoleucina
Leucina
Lisina
Metionina
Treonina
Triptofano
Valina

Arginina e Histidina (indispensables pero no son esenciales)