Escolar Documentos
Profissional Documentos
Cultura Documentos
eucariotas
Los procariotas carecen de compartimentos internos extensos. Se distinguen dos grupos:
Los estudios sugieren que la molcula de DNA de E. coli no tiene libertad de rotacin ilimitada
una vez que se produce una rotura. La explicacin ms probable es que el DNA bacteriano est
unido a protenas que restringen su capacidad de relajacin, de modo que la rotacin en un sitio
de rotura determina la prdida del superenrollamiento de solo un pequeo segmento de la
molcula. Las protenas restringen la relajacin
La vasta mayora de los cromosomas de bacterias y arqueobacterias que se han estudiado son
una sola molcula circular de DNA, pero se est descubriendo un nmero cada vez mayor de
versiones lineales. Por ejemplo, Borrelium o Agrobacterium
La mayora de las bacterias tienen genomas circulares, pero hay algunas con genoma lineal como
por ejemplo Borrelia o Agrobacterium. Las molculas lineales tienen extremos libres que
requieren de estructuras terminalessimilares a los telomeros. Algunos tambin tienen el
genoma en diferentes partes, lo que hace difcil distinguirlo de los plsmidos. En estos genomas
multipartitos, genomas que estn divididos en dos o mas molculas de DNA, suele ser un
problema distinguir una parte genuina del genoma de un plasmido. Un plasmido es un pqueo
fragmento de DNA, a menudo circular, que coexiste con el cromosoma principal. Los plsmidos
contienen genes que no suelen estar opresentes en el cromosoma principal, pero que, en
muchos casos, no son esenciales para la bacteria y codifican caractersticas, como la resistencia
a antibiticos (a productos de hongos), que la bacteria no necesita si las condiciones ambientales
son favorables. Adems, muchos plsmidos se pueden transferair de una clula a otra, incluso
entre especies diferentes. Para que se mantenga, es necesario un alto nmero de copias por
clula.
Los plsmidos son pequeas molculas de DNA
circular, que se encuentran dentro de algunas
clulas procariotas.
Una bacteria como E. coli K12 tiene un cromosoma de 4.6 Mb puede albergar diversas
combinaciones plsmidos, ninguno de los cuales mide ms que unas pocas Kb y todos son
prescindibles. En algunos procariotas no es tan fcil distinguir el genoma principal de los
plsmidos. Por ejemplo, con la bacteria causante la peste negra no fue posible encontrar el
origen de la patogenicidad ante la imposible diferenciacin entre plsmidos y genoma principal
(paper).
2. Caractersticas genticas de los genomas procariotas
La localizacin de los genes en procariotas es mucho ms fcil que en eucariotas; en la mayora
de los genomas procariotas que han sido secuenciados, se cuenta con estimaciones
razonablemente exactas de la cantidad de genes y listas bastante completas de sus funciones.
La figura muestra un segmento de 50 kb. Cuando se compara este segmento con una parte
caracterstica del genoma humano, es evidente, de inmediato, que en el segmento de E. coli hay
ms genes y mucho menos espacio entre ellos, con el 85,9% del segmento ocupado por 43
genes.
Algunos genes casi no tienen espacio entre s. Estos genes representan un ejemplo de opern,
un grupo de genes involucrados en una sola via bioqumica y que se expresan en conjunto. Los
genes procariotas suelen ser mas cortos que los eucariotas y la longitud promedio de un gen
bacteriano es de alrededor de dos tercios respecto de la de un gen eucariontE.
De la figura es posible deducir otras dos caracteriscticas de los genomas procariotas:
- No hay intrones en los fenes de este segmento del genoma de E. coli. De hecho, no tiene
ningn gen discontinuo y se suele consiferar que los genes discontinuos estn casi
ausentes en procariotas, con escasas excepciones (correspondientes sobre todo a
arqueas)
- Las secuencias repetitivas son muy infrecuentes. La mayora de los genomas procariotas
no presentan nada equivalente a las familias de repeticiones en todo el genoma con alto
numero de copias observadas en los genomas eucariontes. En cambio, tienen ciertas
secuencias que podran estar repetidas en otra parte del genoma; por ejemplo, las
secuencias de insercin. Hay ejemplos de elementos transponibles, secuencias con
capacidad de moverse por el genoma y, en el caso de los elementos de insercin,
transferirse de un organismo a otro, incluso a veces, entre dos especies diferentes. La
mayora de los procariotas tienen muy pocas secuencias repetidas.
En conjunto, hay casi600 opernes en el genoma de E. coli K12, cada uno de los cuales contiene
dos o mas genes. En la mayora de los casos, los genes de un opern guardan relacin funcional
y codifican diversas protenas que participan en una sola actividad bioqumica. La simplicad de
este sistema mediante el cual una bacteria puede controlar sus diversas actividades bioqumicas
regulando la expresin de grupos de genes relacionados agrupados en opernes. En algunas
especies los genes de un opern individual rara vez presentan alguna relacin bioqumica. Por
ejemplo, los opernes en Aquifex aeolicus. los genes que forman el opern no tienen funciones
relacionadas. La sntesis coordinada de enzimas requerida para una via determinada no se
cumplE.
Opern tpico del genoma de Aquifex aeolicus. Los genes del mismo opern
codifican las siguientes protenas: una subunidad que participa en la sntesis
proteica, una protena de recombinacin, una protena de movilidad torsional, una
molcula requerida para la sntesis de nucleotidso de citidina, una enzima que
participa en la biosntesis de lpidos y una endonucleasa.
2.2. Cuntos genes hay y cules son sus funciones? De media unos 950
genes por 1 Mb
Hay cierta superposicin de tamao entre los genomas proactiotas mas grandes y los eucariotas
mas pequeos pero, en conjunto, los genomas procariotas sonmucho mas pequeos.
La mayora de los genomas estn organizados de manera similar a E. coli, lo que significa que su
tamao es proporcional al numero de genes, con un promedio de alrededor de 950 genes por
1Mb de DNA. Por lo tanto, la cantidad de genes varia en un amplio ranfo y estas cifras reflejan
el carcter de los nichos ecolgicos dentro de los que viven diferentes especies procariotas. Los
genomas mas grandes tiendena pertenecer a especies de vida libre que se encuentran en el
suelo. En el otro extremo de la escala, muchos de los genomas mas pequeos pertenecen a
especies que son parasitos estrictos, como Mycoplasma genitalium, que tiene solo 470 genes.
La limitada capacidad de codificacin de estos genomas implica que estas especies no pueden
sintetizar muchos nutrientes y, por lo tanto, deben obtenerlos de sus huspedes.
En la imagen se muestra la relacin entre el tamao del genoma y el numero de genes que
codifican protenas en 623 genomas completos de arqueas y bacterias. La lnea de puntos
establece a I. hospitalis como el organismo con el genoma mas pequeo capaz de replicarse de
forma independientE. Los genomas de parasitos o simbiontes obligados estna representados
por crculos grises. La regin sombreada corresponde a la transicin entre simbiontes/parasitos
obligados y organismos independientes. Los eucariotas surgen evolutivamente porque el DNA
ya no puede crecer ms, el organismo ya no puede soportar un genoma tan grandE. La cadena
circular de DNA no soporta mutaciones al ser un genoma nico.
Estas comparaciones han llevado a especular acerca de la cantidad minima de genes requerida
para especificar una clula de vida librE. Al principio, consideraciones tericas instaron a sugerir
que 256 genes era el numero minimo necesario, pero experimentos con genes de Mycoplasma
indican que se necesitan entre 265 y 300 genes.
Preguntas:
- Cuntos genes se necesitan para hacer las funciones ceulares minimas de la vida?
- Cul es el tamao minimo de un genioma que permite a un organismo ser viable y
autonomo?
- Puede ser menor que el de Mycoplasma genitalium (467 genes)?
Frecuencia de mutacin en humanos por divisin mittica: 10-8
2(3x109)10-8= 60
"The goal is to fundamentally understand the components of the most basic living cell."
J. Craig Venter, founder of Celera Genomics, IBEA and several other gene tech company
La secuenciacin del genoma ha destacado las dificultades para aplicar el concepto de especie
a procariotas. Se ha esclarecido que diferentes cepas de una sola especie pueden tener
secuencias genmicas muy distintas e, incluso, pueden tener conjuntos individuales de genes
especficos de cepa. La variacin es mucho mas sustancial de la que suele ser tolerada por el
concepto de especie aplicado a organismos superiores y es dificl reconciliarla con cualquier
definicin de especie elaborada hasta ahora para microorganismos.
Dada la facilidad con que los genes pueden fluir entre distintas especies de procariotas, se
anticipaba que, se hallaran los mismos genes en diferentes especies, pero el grado de
transferencia lateral de genes revelado por la secuenciacin ha sido sorprendentE. La matorida
de los genomas contienen algunos cientos de kilobases de DNA adquiridos directamente de una
especie diferente, y en algunos casos, la cifra es mas alta. Ha habido tambin transferencia entre
especies muy diferentes. Esto indica que los procariotas que viven en nichos ecolgicos similares
intercambian genes entre si para aumentar su aptitud individual de supervivencia en su
ambiente particular.