UNIVERSIDAD DE LAS FUERZAS ARMADAS - ESPE

DEPARTAMENTO DE CIENCIAS DE LA VIDA Y LA

AGRICULTURA
INGENIERA EN BIOTECNOLOGA

Integrantes: Carlos Aguirre

Jennifer Muoz
Carolina Panchana
NRC: 2429
Fecha: 10-07-2017
Tema: VNTR

Objetivos

Conocer que tcnicas se usan para la identificacin de VNTR

Presentar las aplicaciones del VNTR por medio de un ejemplo.

Introduccin
En Gentica molecular, el nmero variable de repeticiones en tndem (del ingls
Variable Number of Tandem Repeats y ms conocidas por el acrnimo VNTR) o
minisatlites, son repeticiones de secuencias de 9 a 100 pares de bases que se
utilizan como marcador molecular. El nmero de repeticiones es variable pero en
general es menor a 1000.

Clasificacin

VNTR minisatlites y VNTR-microsatlites o STR (del ingls, short tandem repeats). En

ambos casos presentan un nmero variable de repeticiones en tndem (VNTR del ingls,
variable number of tandem repeats). Los minisatlites son loci que corresponden a
secuencias de ADN de unas pocas decenas de nucletidos repetidas en tndem. El
nmero de dichas repeticiones vara de cromosoma a cromosoma, de forma que en un
cromosoma el nmero de repeticiones en tndem puede ser de 10, en otro de 15, en
otro de 22, etc. L a singularidad ms especial de este tipo de polimorfismos est en que
cada loci puede presentar muchos alelos distintos (tantos como repeticiones), sin
embargo, presentan el inconveniente de que no estn distribuidos por todo el genoma y
slo pueden ser utilizados en el diagnstico de un nmero muy reducido de
enfermedades (Sherry,2006).

Los VNTR-minisatlites han encontrado su mxima aplicacin en la determinacin de la

paternidad y en los protocolos de identificacin gentica en el mbito judicial. Cuando se
habla de huellas dactilares del ADN se est hablando de este tipo de polimorfismo.

Los VNTR-microsatlites son por excelencia los polimorfismos annimos utilizados en el

diagnstico gentico. Corresponden a la repeticin en tndem de secuencias de entre 2
y 5 nucle- tidos. Los microsatlites presentan dos caractersticas que los hacen ideales
para su uso. En primer lugar, estn distribuidos de forma casi homog- nea por todo el
genoma y en segundo, presentan un nmero elevado de alelos con frecuencias similares
entre s, de forma que la probabilidad de que un individuo sea heterocigoto es muy
elevada (presentan una alta heterocigosis) (Sherry,2006).

Deteccin de VNTRs
Para la deteccin del nmero variable de repeticiones en tndem se usa tcnicas de
hibridacin y de PCR. En esta primera se da con el uso de enzimas de restriccin que
cercan a las repeticiones, cuando cortan dichas secuencias la longitud estas sern
variables debido al nmero de repeticiones de los VNTRs, luego se realiza una
electroforesis y se transfiere a una membrana (Picca, Helguera, Salomn, & Carrera,
2004). Despus se realiza la deteccin con sondas que estn constituidas por secuencias
homlogas a las secuencias repetidas de los minisatlites, lo que permite detectar locus
hipervariables de manera simultnea. En tanto en la tcnica de PCR, consiste en
amplificar un segmento del genoma, usan primers o iniciadores que flanquean las
secuencias de los VNTRs, despus se realiza una electroforesis; el uso de PCR es ms
frecuente debido al avance de los diseos de primers (Checa, 2007).
Conclusiones
Para la identificacin de VNTR se conoce las tcnicas de PCR y de hibridacin.

Paper

Evolution of variable number tandem repeats and its relationship with genomic diversity
in Salmonella Typhimurium

Objetivo

Analizar las mutaciones ocurridas en cepas de Salmonella Typhimurium por medio de

MLVA y determinar si estas influyen o no en la presencia contnua de este
microorganismo en infecciones.

Resumen

Todos los genomas bacterianos tienen ADN repetitivo en mltiples loci (VNTR), los
mismos son usados en los estudios epidemiolgicos. Multilocus VNTR anlisis (MLVA)
ha sido establecido como un potencial epidiemologico en contra de microorganismo
patgenos como Salmonella entrica serovar Typhirium, Escherichia coli 0157 y han
sido utilzados para rastrear el origen de la infeccin. Salmonella Typhirium es la
causante de la mayora de las infecciones en Australia de Salmonella.

El esquema mltiple loci VNTR anlisis es: STTR9-STTR5-STTR6-STTR10-STTR3 es

utilizada de forma rutinaria para infecciones con Salmonella Typhirium. Pero los tipos
endmicos de MLVA presentan problemas en estos anlisis presentan dificultades
causadas por la relacin muy estrecha que existe entre una cepa causante de una
infeccin y una que no lo sea provocando la posible malinterpretacin.
Los VNTR pueden mutar rpidamente. Los cambios pueden ocurrir en el mismo locus
del MLVA con no ancestros comunes. Los MLVA con una repeticin diferente se
consideran como los ms estrechamente relaciones aunque a menudo no reflejen la
verdadera filogentica relacionada a los aislamientos. Existe una necesidad por el mejor
entendimiento de las dinmicas de evolucin en los cambios de repeticiones en VNTR.

Un total de 12112 muestras de Salmonella Typhirium fueron obtenidas de New South

Wales donde se realizo MLVA desde 2007 a 2014. S
Conclusiones

Se encontr que la rangos medios de unidades repetidas de 8-14 en VNTR locus

STRR5, 6-13 en STRR6, y 9-12 en STRR10 son siempre predominantes en la
poblacin.
La prevalencia de infecciones causada por S. Typhimutium es influenciada por la
mutabilidad de VNTR
El modelo de variacin de MLVA y SNP estimo que el rango de mutacion de
VNRP y SNP con un radio de 1 cambio de VNTR por 6.9 cambios SNP. Estos
cambios no presentan ninguna relacin.
La existencia de S. Typhimurium con diferencia de repeticin en un VNTR de
tres muy variables loci debera incrementar la vifilancia de los laboratorios
pblicos de brotes de S. Typhimurium.

Bibliografa

Checa, M. (2007). Polimorfismos genticos: Importancia y aplicaciones. Revista

del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias, 213-221.

Picca, A., Helguera, M., Salomn, S., & Carrera, A. (2004). Biblioteca.org.
Obtenido de Marcadores Moleculares: Moleculares. Tomado de:
http://www.biblioteca.org.ar/libros/150407.pdf

Sherry ST, Ward MH, Kholodov M, et al. dbSNP: the NCBI database of genetic
variation. Nucleic Acids Res 2001;29:308-311.