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CURSO DE ODONTOLOGIA
Prticas de Bioqumica
Conceitos Gerais
Elaborao:
Profa. Dra. Yara Maria Lucisano Valim (Coordenao)
Profa. Dra. Ana Isabel de Assis Pandochi
Prof. Dr. Augusto Csar C. Spadaro
Profa. Dra. Carem Gledes Vargas Rechia
Prof. Dr. Carlos Curti
Dra. Luciana Mariko Kabeya
Dra. Daniela Trinca Bertazzi
2008
2
UNIVERSIDADE DE SO PAULO
FACULDADE DE CINCIAS FARMACUTICAS DE
RIBEIRO PRETO
Reitora:
Profa. Dra. Suely Vilela
Vice-Reitor:
Prof. Dr. Franco Maria Lajolo
Diretor:
Prof. Dr. Augusto Csar C. Spadaro
Vice-Diretor:
Prof. Dr. Jairo Kenupp Bastos
Endereo:
Faculdade de Cincias Farmacuticas de Ribeiro Preto USP
Departamento de Fsica e Qumica Disciplina de Bioqumica
Via do Caf, S/N
14.040-903 - Ribeiro Preto - S.P. - Brasil
Fone: (16) 3602-4179
Fax: (16) 3602-4880
3
SUMRIO
5
INTRODUO AO LABORATRIO ..........................................................
I. Recomendaes gerais ...............................................................
5
II. Antes do experimento ...............................................................
6
III. Durante o experimento ..............................................................
6
III.A. manuseio dos reagentes ......................................................
6
III.B. preparo de solues .........................................................
6
III.C. medida do volume de lquidos ................................ 7
III.D. aquecimento de lquidos em tubo de ensaio e chama de bico
Bunsen ................................................................
7
IV. Depois do experimento ..............................................................
7
V. Acidentes mais comuns em laboratrio e primeiros socorros ..........................
8
VI. Principais vidrarias e materiais utilizados nas aulas prticas .....................
9
TITULAO ..........................................................................
21
I. Definio de termos ................................................................
21
II. Preparo do titulante ...............................................................
21
III. Titulao cido-base ...............................................................
22
38
PROTENAS ..........................................................................
I. Introduo ................................................................
38
II. Reaes para aminocidos ...........................................................
39
III. Reaes para identificao de protenas ................................
39
IV. Separao de protenas por precipitao ................................
40
IV.A. Precipitao pelos reagentes de alcalides ................................
40
IV.B. Precipitao fracionada por solues salinas concentradas ....................
41
GLICDEOS ..........................................................................
42
I. Introduo ................................................................
42
II. Parte experimental ................................................................
44
II.A.Preparao da soluo de amido ................................ 44
II.B.Pesquisa de amido na soluo preparada ................................
44
II.C.Obteno de glicose a partir da soluo de amido preparada ....................
45
II.D. Caracterizao qumica dos glicdeos ................................
45
II.D.1.Reao com alfa-naftol (teste de Molisch) ...............................
45
II.D.2.Pesquisa de sacardeos redutores (reao de Benedict) ...................
46
LIPDEOS ...........................................................................
48
I. Introduo ................................................................
48
II. cidos graxos ................................................................
48
III. Propriedades gerais ................................................................
50
III.A. Solubilidade ................................................................
50
III.B. Saponificao ...............................................................
50
III.C. Propriedade dos sabes ......................................................
50
SALIVA .............................................................................
52
I. Introduo ................................................................
52
II. Estudo da atividade da amilase salivar ................................
53
II.A.Fatores que influenciam na atividade enzimtica ...............................
53
II.A.1.pH ................................................................
54
II.A.2.Temperatura .............................................................
54
II.A.3.Concentrao de substrato ................................54
II.A.4.Concentrao de enzima ..................................................
55
II.A.5.Presena dos cofatores e/ou coenzimas ................................
55
5
INTRODUO AO LABORATRIO
I. RECOMENDAES GERAIS
Recomendada No recomendada
Avental longo (at os joelhos) Bermuda ou short
Cala comprida Calado aberto (sandlia, chinelo)
Sapato fechado Uso de lente de contato
culos de segurana Uso de braceletes, correntes ou
Luvas de material adequado outros adereos
Cabelo comprido preso Cabelo comprido solto
6. No permitido no Laboratrio:
Fumar, comer e beber
Sentar no cho, sentar ou debruar na bancada
Correr
7. No deixar livros, blusas, etc., jogados nas bancadas; coloque-os
longe do local do experimento.
8. Quando houver quebra ou danos nos materiais ou aparelhos, comunique
aos professores.
9. Certifique-se da localizao dos itens de emergncia, principalmente:
chuveiro de emergncia, lava-olhos, extintores de incndio, sadas de
emergncia.
6
CORTES
- Lavar o ferimento em gua corrente abundante e em seguida comprimir
com ajuda de algodo/gaze.
- Sempre que possvel, elevar a parte ferida acima do nvel do corpo.
QUEIMADURAS
PREPARO DE SOLUES
I. INTRODUO
II.A. Molaridade
Molaridade (M) o nmero de moles do soluto (n) dissolvido por
litro de soluo. Ela calculada tomando-se a relao do nmero de moles
do soluto pelo volume da soluo em litros, e expressa em mol/L.
Exemplo 1:
Um aluno dissolveu 8,70 g de NaCl (M.M. = 58 g/mol, pureza = 100%)
em gua destilada suficiente para preparar 100 mL de soluo. Qual
a molaridade da soluo?
c. Calcular a molaridade.
M = n = 0,15 moles = 1,5 mol/L
V 0,1 L
Exemplos:
- soluo de dextrose a 5%(m/v) contm 5 g de dextrose em cada 100
mL de soluo.
- concentrao do soro fisiolgico: NaCl 0,9% ou NaCl 0,9%(m/v) [cada 100
mL de soluo contm 0,9 g de NaCl]
1 g ___ 1000000 g
0,0021g ___ w
W = 2100 g
Portanto, a concentrao da soluo de NaF 2100 g/mL ou 2100 ppm.
1 g ___ 1000000 g
0,00095g ___ w
W = 950 g
Portanto, a concentrao de F na soluo de 950 g/mL ou 950 ppm.
NaCl
impurezas
Exemplo 3:
Suponha que o reagente NaCl utilizado pelo aluno, no exemplo 1, era
de pureza igual a 80%. Qual a molaridade da soluo preparada?
d. Calcular a molaridade
M = n = 0,12 mols = 1,2 mol/L
V 0,1 L
15
III.B. Densidade
Uma das propriedades que servem para caracterizar uma substncia
a sua densidade. Ela expressa a quantidade de matria contida em uma dada
unidade de volume.
Empregando unidades mtricas, as densidades dos slidos so
comumente expressas em unidades de gramas por centmetro cbico (g/cm3),
as dos gases em gramas por litro (g/L), e as dos lquidos em gramas por
mililitro (g/mL) ou quilogramas por litro (Kg/L).
Para os reagentes lquidos, a densidade indica a razo entre a
massa da soluo e o seu volume.
d = m
V
Exemplo 4:
Preparar 1 L de soluo de cido actico a 0,1 mol/L.
(d = 1,058 g/mL; M.M. = 60,05; pureza = 90%).
C1 x V1 = C2 x V2
C1 x V1 = C2 x V2
18 mol/L x V1 = 0,15 mol/L x 500 mL
V1 = 0,15 x 500
18
V1 = 4,2 mL
* Diluio A:B
- Pegar um volume A e adicionar o solvente para obter o volume final B
- Volume final = B
* Mistura A:B
- Pegar um volume A e adicionar um volume B
- Volume final = A + B
Exemplo 6:
Uma aluna est no laboratrio preparando solues para avaliar a
atividade de enzimas salivares. Ela precisa de soluo aquosa de
NaCl na concentrao de 0,9%. Entretanto, ela no dispe do sal na
forma slida, apenas de solues de NaCl mais concentradas. Os
rtulos dos frascos contm informaes para diluio. Qual o
procedimento de obteno da soluo a 0,9%?
17
Soluo A:
Concentrao: NaCl 3,6 %(m/v)
Instruo do rtulo: diluir 1:4 com gua para obter NaCl 0,9%
Procedimento para diluio:
- Pipetar 1 mL da soluo de NaCl 3,6%
- Transferir para uma proveta ou balo volumtrico
- Adicionar gua destilada at obter o volume de 4 mL
- Volume final: 4 mL
Soluo B:
Concentrao: NaCl 4,5 %(m/v)
Instruo do rtulo: misturar com gua na proporo 1:4 para
obter NaCl 0,9%
Procedimento para diluio:
- Pipetar 1 mL da soluo de NaCl 4,5%
- Transferir para uma proveta
- Adicionar 4 mL de gua destilada
- Volume final: 5 mL
Exemplo 7:
Considerando o exemplo 6: A aluna estava distrada, e inverteu os
procedimentos para preparar as solues. Quais as concentraes
finais das solues preparadas?
soluo A: NaCl 3,6 %(m/v) - ao invs de diluir 1:4 com gua, Maria
misturou com gua na proporo 1:4
CA x VA = CB x VB
3,6% x 1 mL = CB x 5 mL
CB = 0,72%
Exemplo 8:
O volume de soluo preparado pela aluna no exemplo 6 foi
insuficiente para o ensaio. Ela precisa preparar mais 100 mL de
NaCl 0,9%, partindo das solues A e B. Como ela deve proceder?
Soluo A:
Concentrao: NaCl 3,6 %(m/v)
Instruo do rtulo: diluir 1:4 com gua para obter NaCl 0,9%
Resoluo 1
C1 x V1 = C2 x V2
3,6% x V1 = 0,9% x 100 mL
V1 = 25 mL
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Resoluo 2
Diluir 1:4 ___ 1 mL NaCl __ 4 mL soluo
x __ 100 mL soluo
x = 25 mL NaCl
Soluo B:
Concentrao: NaCl 4,5 %(m/v)
Instruo do rtulo: misturar com gua na proporo 1:4 para
obter NaCl 0,9%
Resoluo 1
C1 x V1 = C2 x V2
4,5% x V1 = 0,9% x 100 mL
V1 = 20 mL
Resoluo 2
Misturar na proporo 1:4 ___ 1 mL NaCl __ 5 mL soluo
x __ 100 mL soluo
x = 20 mL NaCl
Para um reagente Y
% de pureza do reagente Y
(slido ou lquido): massa em g do composto Y em cada 100 g de reagente
densidade (lquido): massa em g do composto Y / volume em mL
Diluio de solues
frmula geral: C1 x V1 = C2 x V2
(C1 e V1: valores iniciais; C2 e V2: valores finais)
diluio (A:B) : V1 = A ; V2 = B
mistura na proporo (A:B) : V1 = A ; V2 = A + B
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TITULAO
I. DEFINIO DE TERMOS
bureta
titulante
garra
(soluo padronizada)
suporte
titulado universal
(amostra)
+ erlenmeyer
indicador
NaOH
soluo do cido
+
fenolftalena
Figura 2. Titulao de um cido com uma base, empregando fenolftalena como indicador.
EXEMPLO:
Suponha que voc queira determinar a concentrao de cido actico
numa amostra de vinagre atravs de titulao. O procedimento experimental
geral o seguinte:
1. Enchemos uma bureta com uma soluo de base de concentrao
conhecida, digamos NaOH 0,5 mol/L. A bureta nos permite dispensar
precisamente volumes variveis de soluo.
2. Em um erlenmeyer, colocamos um volume medido de vinagre, por exemplo:
10 mL, e adicionamos algumas gotas de soluo de um indicador de pH
apropriado,tal como fenolftalena.
25
Resoluo 1:
a. Inicialmente, calculamos o nmero de mols de NaOH contidos em
17,1 mL.
NaOH 0,5 mol/L __ 0,5 mol de NaOH ____ 1000 mL de soluo
x ____ 17,1 mL de soluo
x = 0,00855 mol de NaOH
Resoluo 2:
a. Como a reao envolve nmeros iguais de moles de cido e
base, podemos tambm obter a concentrao do cido actico no
vinagre de modo direto, utilizando a relao:
CA x VA = CB x VB
sendo:
CA e VA - concentrao e volume do cido
CB e VB - concentrao e volume da base
CA x VA = CB x VB
CA x 10 mL = 0,5 mol/L x 17,1 mL
CA = 0,855 mol/L
CAPACIDADE TAMPONANTE
I.DISSOCIAO DA GUA
H2 O H+ + OH-
ou como: H2O + H2O H3 O+ + OH-
ou como: [H3O+].[OH-] = K
[H2O]2
Exemplo 1:
Suponha que voc tem uma soluo de HCl 0,01 mol/L, que est
completamente dissociado em H+ e Cl-. Determinar a concentrao de
H+ e OH- na soluo.
HCl H+ + Cl-
[H+].[OH-] = 1 x 10-14
1 x 10-2+.[OH-] = 1 x 10-14
[OH-] = 1 x 10-12 mol/L
27
Exemplo 2:
Para uma soluo de NaOH 0,0001 mol/L, que est completamente
dissociado, qual a concentrao de H+ e OH- na soluo?
[H+].[OH-] = 1 x 10-14
[H ].1 x 10-4 = 1 x 10-14
+
Pode-se observar que existe uma relao inversa entre [H+] e [OH-]
em solues. Quando uma delas aumenta, a outra diminui. Geralmente,
expressa-se o valor de [H+], e no de [OH-].
A concentrao total do on hidrognio em uma soluo, ou [H+],
expresso pelo valor do pH. Matematicamente, o pH definido como o valor
negativo do logaritmo (log) da concentrao do on hidrognio:
Tomando-se o logaritmo
negativo da equao: [H+][OH-] = Kw = 1 x 10-14
HCN H+ + CN-
cido base conjugada
(fraco) (forte)
HCl H+ + Cl-
cido base conjugada
(forte) (fraca)
29
H2 O H+ + OH-
H2O + H+ H3 O+
Exemplo 3:
Considere as solues de CH3COOH 0,2 mol/L (1% dissociado) e de HCl
0,2 mol/L. Calcular o pH de cada uma delas.
HCl H+ + Cl-
0,2 mol/L 0,2 mol/L
HA H+ + A-
30
V. SOLUO TAMPO
V.A.Aspectos gerais
O pH da gua pura (uma soluo neutra) 7,0. Se um cido
adicionado gua, o seu pH diminui; se uma base adicionada gua, o
pH aumenta para mais que 7,0. O quanto o pH se afastar de 7,0, em cada
caso, depender da quantidade de cido ou de base adicionados e de suas
foras.
Contudo, quando pequenas quantidades de cido ou base so
adicionadas a uma soluo tampo, o seu pH no varia apreciavelmente. Uma
soluo tampo definida como uma soluo que resiste s variaes de
pH, quando ocorre a adio de pequenas quantidades tanto de cidos como
de bases.
As solues tampo usualmente so constitudas de:
Um cido fraco (HA) e um sal correspondente a esse cido (A-).
ex: cido actico e acetato de sdio
CH3COOH CH3COO- + H+
CH3COONa CH3COO- + Na+
Kw = [H+] [OH-]
OH- H2O
VII. RESUMO
HA H+ + A-
Ka = [H+][A-]
[HA]
[H+] = 10-pH
pH + pOH = pKw = 14
0,192 mol ____ 1000 mL tampo 0,608 mol ____ 1000 mL tampo
x ____ 500 mL tampo x ____ 500 mL tampo
x = 0,096 mol x = 0,304 mol
d. Preparo da soluo:
- Pesar os sais de acordo com as quantidades calculadas
- Dissolver em bquer, com aproximadamente 400 mL de gua destilada
- Medir o pH
- Ajustar o pH se necessrio
- Transferir a soluo para um frasco volumtrico
- Completar o volume para 500 mL com gua destilada
38
PROTENAS
I. INTRODUO
Figura 3. Exemplo de
peptdeo, formado por
cinco aminocidos.
39
aminocido
ninidrina
Prpura de Ruhemann
SALTING-IN
Em concentraes reduzidas, os sais aumentam a solubilidade de
muitas protenas, um fenmeno denominado solubilizao por salificao ou
"salting-in".
Os sais de ons divalentes, tais como MgCl2 e o (NH4)2SO4, so mais
eficientes na solubilizao por salificao do que os sais de ons
monovalentes como NaCl e KCl.
Os efeitos da salificao na solubilidade so ocasionados por
alteraes na tendncia ionizao dos grupos R (cadeias laterais dos
aminocidos) dissociveis da protena.
SALTING-OUT
Por outro lado, medida que a concentrao do sal aumentada, a
solubilidade da protena se reduz gradativamente. Em foras inicas
suficientemente elevadas, uma protena pode ser quase completamente
precipitada de sua soluo, um efeito denominado precipitao por
salificao ou salting out.
Um dos fatores que a concentrao elevada de sais pode remover a
gua de hidratao das molculas de protena, reduzindo, dessa maneira,
sua solubilidade; porm outros fatores podem estar envolvidos.
Os precipitados proticos resultantes da precipitao por
salificao mantm sua conformao nativa e podem ser dissolvidos
novamente, em geral sem haver desnaturao. Conseqentemente, a funo da
protena pode ser recuperada aps o trmino do processo e remoo do sal.
2- globulinas 46
- globulinas 40
- globulinas 33
Fibrinognio 20
42
GLICDEOS
I.INTRODUO
D-glucose D-frutose
carbono
carbonlico
D -glucose
carbono
anomrico
-D -glucopiranose carbono
-D -glucopiranose
anomrico
hemiacetal
lcool
hidrlise condensao
acetal hemiacetal
-D
D-glucopiranosil-(1 4)--D
4) D-glucopiranose
D
AQUECER RESFRIAR
I3
LUGOL
I
I 33
- I
I 33
-
I3
I3
H+
Calor
Amido n nglucose
Glicose
+ O
OH CHO H
HOH2C
OH HOH2C O O
C HOH2C
H C CH - 3H2O O - 2 H2O C
HO CH HC OH + H2SO4 + H2SO4
+ -naftol
HEXOSE HIDROXIMETILFURFURAL
HO3S SO3H
OH
COMPOSTO COLORIDO
46
glucose lactose
frutose sacarose
H+
amido glucose
calor
REAO DE BENEDICT
OH-
Cu++ + acar redutor Cu2O + acar oxidado
48
LIPDEOS
I.INTRODUO
Grupo carboxlico
(cabea polar)
Cadeia
insaturao hidrocarbonada
(cauda apolar)
O
CH 2 O C R1
O
CH O C R2
O Figura 2. Frmula
CH2 O C R3 estrutural e representao
simplificada da estrutura
de um triacilglicerol.
O I O
R CH2 CH CH CH 2 C + I2 R CH 2 CH CH CH 2 C
OH OH
I
III.A. Solubilidade
Os glicerdeos de cidos graxos inferiores (menores), como o cido
butrico, so ligeiramente solveis em gua, enquanto os de cidos graxos
superiores so insolveis. Todos so solveis em ter, clorofrmio e
benzeno. So pouco solveis em etanol a frio, mas a solubilidade aumenta
muito em etanol quente.
Os lipdeos, por definio, so molculas de baixa polaridade,
portanto praticamente insolveis em solventes polares, como a gua. Desse
modo, a ordem de solubilidade esperada para o leo vegetal : ter>
lcool > gua.
III.B. Saponificao
Os cidos graxos complexos so tambm denominados lipdeos
saponificveis, uma vez que produzem sabes, sais de cidos graxos, sob
hidrlise alcalina.
Os triglicerdeos, cidos graxos esterificados com glicerol,
decompem-se facilmente em glicerol e sais de cido graxo (sabes) por
ebulio em bases fortes como NaOH ou KOH. Como os lipdeos so
insolveis em gua, o processo facilitado adicionando-se soluo
alcolica da base.
Ao acidificar o meio de reao, o sal de cido graxo, que solvel
em gua, convertido em cido graxo. Este, por sua vez, no solvel em
gua, e separa-se do meio de reao. Alm disso, o cido graxo fica na
superfcie da soluo, pois menos denso que a gua, e o glicerol
permanece dissolvido na fase aquosa, devido sua natureza polar.
O cido graxo separado pode novamente ser convertido em sabo, pela
adio de uma base forte e sob aquecimento. Por esta razo, ao se agitar
o tubo contendo gua quente, soluo de NaOH 1 mol/L e o cido graxo
(insolvel), ocorre formao de espuma, que indicativa da presena do
sabo.
KOH
O
CH2 OH + -
K O C R1
O SAPONIFICAO
CH OH + + -
K O C R2
O
CH2 OH + -
K O C R3
GLICEROL SABO
(sais de cidos graxos)
HCl
O
CH2 OH
HO C R1
SEPARAO DOS
KCl + CH OH + O
CIDOS GRAXOS
HO C R2
CH2 OH O
HO C R3
GLICEROL CIDOS GRAXOS
(solvel em gua) (insolveis em gua)
NaOH
O
+ - REDISSOLUO DOS
Na O C R1
O CIDOS GRAXOS
+ -
Na O C R2
O
+ -
Na O C R3
SABO
(sais de cidos graxos)
52
SALIVA
I.INTRODUO
I3 +
amilase
maltose glucose
glicose
amido
LUGOL
Estrutura do amido:
monossacardeos unidos
I3 por ligaes -1,4
pontos de ramificao
(ligaes -1,6)
II.A.1. pH
A maioria das enzimas apresenta um pH caracterstico em que a sua
atividade mxima, denominado pH timo, Acima ou abaixo desse pH, a
atividade se reduz. Ainda que os perfis de atividade em funo do pH de
muitas enzimas tenham a forma em sino, eles podem variar
consideravelmente em forma.
A inter-relao da atividade enzimtica com o pH para qualquer
enzima depende do comportamento cido-bsico da enzima e do substrato,
bem como de outros fatores que so difceis de analisar
quantitativamente. Sabe-se que o pH afeta o estado de ionizao dos
resduos de aminocidos das protenas, levando a alteraes na
distribuio de cargas eltricas e grupamentos qumicos da molcula da
enzima, em especial do stio cataltico e tambm na conformao
tridimensional da protena. Essas alteraes podem prejudicar a interao
entre o stio ativo e o substrato, diminuindo a velocidade de atuao da
enzima. Em valores extremos de pH, h ainda a possibilidade de ocorrer
desnaturao da enzima.
O pH timo de uma enzima no necessariamente idntico ao pH de
seu meio intracelular normal, que pode estar situado na parte ascendente
ou descendente do seu perfil de atividade em funo do pH. Isso sugere
que a inter-relao pH-atividade enzimtica pode ser um fator de controle
intracelular da atividade enzimtica.
II.A.2. Temperatura
Tal como ocorre para a maioria das reaes qumicas, a velocidade
das reaes catalisadas por enzimas aumenta geralmente com a temperatura,
dentro de certa faixa de temperatura na qual a enzima estvel e mantm
atividade integral, at que se atinja a temperatura tima. A partir dessa
temperatura, a atividade enzimtica diminui medida que a temperatura
elevada, uma vez que as enzimas so desnaturadas pelo calor. Entretanto,
uma vez que a desnaturao um processo dependente do tempo, o formato
do grfico de atividade enzimtica X temperatura depender da quantidade
de tempo que a enzima foi mantida em determinada temperatura.
Atividade Enzimtica
Atividade Enzimtica
A B C
Relativa
Relativa
Relativa
0 2 4 6 8 10 0 10 20 30 40 50 60 70
Concentrao de Substrato
pH temperatura (C)
Atividade Enzimtica
Atividade Enzimtica
D E
Relativa
Com NaCl
Relativa
Sem NaCl
BIBLIOGRAFIA
EDGAR, W.M.; OMULLANE, D.M. Saliva and dental health. British Dental
Association, 1a edio, Londres, 1990.