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Secuenciacin y exomas
- Mtodo de Sanger
Mtodo de Maxam Gilbert
Mtodo de Sanger
Ms utilizado en secuenciacin
Elementos de la reaccin del mtodo de Sanger:
- Molde de DNA
- Cebadores:
1. Universales
2. Especficos
- dNTPs
- ddNTPs
- Polimerasa
1. Fragmento Klenow (=250 pb)
2. Sequenasa (=750 pb)
Lecturas cortas
Elevado nmero de
secuencias repetidas
Secuenciacin jerrquica
Cmo se determinan los clones contiguos?
2. Clone Fingerprinting
3. Intersperced repeat element PCR (IRE PCR)
- PCR en emulsin
- Pirosecuenciacin
- Secuenciacin por ligacin
- PCR en fase slida (Bridge PCR)
PIROSECUENCIACIN
a)
b)
c)
Pirosecuenciacin
Pirosecuenciacin
SECUENCIACIN POR LIGACIN
SECUENCIACIN POR PCR EN FASE SLIDA
5.5. Exomas
Constituido por exones.
Secuenciacin de exoma:
- Tcnica para secuenciar todos los genes codificadores
- Representa 1% del genoma
- Contiene 85% de mutaciones causantes de enfermedad
- til en diagnstico gentico
Bibliografa
- GRIFFITHS, A.J.F. (et al). An Introduction to Genetic Analysis. 11th ed. W. H. Freeman, 2015
- MENEELY, P. Genetic Analysis: Genes, Genomas, and Networks in Eukaryotes. 2nd edition. Oxford: Oxford
University Press, 2009
MUCHAS GRACIAS POR SU ATENCIN
email: wmorales8991@gmail.com