UNIVERSIDADEFEDERALDOABC

EN2809TPICOSCOMPUTACIONAISEMMATERIAISLABORATRIO
DINMICAMOLECULARII

INTRODUO

Umadasreasmaisimportantesdacinciaeengenhariademateriaisoestudodastransformaesde
fasedeummaterial.Oconhecimentodestastransformaes,tantodopontodevistatermodinmicoquanto
cintico, permitem controlar a microestrutura de um material e portanto suas propriedades. Nesta rea
podemosencontrar diversos exemplosde aplicaesde tcnicas computacionais para o estudo destas
transformaes.Nestaaulatrataremosespecificamentedafuso(queumexemplodetransiode1
ordemoutransiodescontnua)deumslidopormeiodadinmicamolecular.

Uma maneira, no muito precisa, de determinarmos a temperatura de fuso de um slido consiste em

monitorar como a energia de um sistema varia em funo da temperatura a partir de simulaes em
diferentes condies termodinmicas. Quando um material passa do estado slido (ordenado) para o
estado lquido (desordenado) ocorre uma liberao de energia, o chamado calor latente de fuso, e a
temperaturanaqualestaliberaoocorrepodeserutilizadacomoumaestimativadatemperaturadefuso
doslido.

ATIVIDADE01:obterecompilarosprogramascrystal
md1
e

Oscdigosfontedosprogramasutilizadosnestaaulaestoagrupadosnoarquivolab02.tar.gzeforam
desenvolvidosporFurioErcolessiealteradosparaestaaula.Osprogramasoriginaispodemserobtidos
livrementenoendereo:

http://www.fisica.uniud.it/~ercolessi/md/f90/

Faaodownloaddoarquivolab02.tar.gzeemseguidaabraumajaneladeterminal.Noterminaldigite
osseguintescomandos:

cdDownloads
tarxzvflab02.tar.gz

Paracompilaroprogramacrystaldigitenoterminal:

gfortranocrystalcrystal.f90

Paracompilaroprogramamd1digitenoterminal:

gfortranomd1md1.f90

Senohouveproblemacomacompilaovocdeverterdoisarquivosexecutveiscrystalemd1.Para
verificarseoscdigosforamcompiladosdigitenoterminal:

ls

osarquivoscrystalemd1deveroserlistadosnatela.

ATIVIDADE02:criarumslidodeLennardJones(CFC)comoprogramacrystal

Aindanoterminaldigite:

./crystal

Oprograma crystal umprogramainterativoquepedequeousurioforneaalgumasinformaes.

Nesteexerccioutilizaremosumslidocomdensidade0,9(emunidadesreduzidas).Utilize07clulasem
cadaumadasdireesx,yezedeslocamentomximode0.001.Oparmetroderededoslidoaser
fornecidoaoprogramacrystaldevesercalculadodemodoqueadensidadedoslidosejaigual
0,9.Salveoarquivocomasposiesdostomos(p.ex.coord.crys).Estearquivoserutilizadoem
todasassimulaesdestaaula.

ATIVIDADE03:simulaes

Executesimulaescomoprograma md1 apartirdoarquivogeradonatarefaanteriorparaasseguintes

condiestermodinmicas:

densidade =0,9(constanteemtodososcasos)
temperatura =de0,7a1,20(constanteemcadasimulao)
passodeintegrao =0,0025
nmerodepassos =40.000(mnimo)

Paraexecutaroprograma crystal necessriocriarumarquivodeentradacomascondiesacima

(observequecadacondioindicadaacimacorrespondeaumasimulao).Utilizeoexemploabaixopara
criaroarquivodeentrada.

T*=0.7rho*=0.9 (linhadecomentrio)
coord.crys (nomedoarquivoquecontmasposiesatmicas)
rho09T07.md1 (nomedoarquivodesada)
40000 (nmerodepassosdeintegraoN)
0.0025 (comprimentodopassodeintegraodt)
0 (valordadensidade,r*;valor0indicadensidadecte.)
0.7 (valordatemperatura,T*)

Paraexecutaroprogramamd1digitenoterminal:

./md1<input>output

onde input onomedoarquivoquecontmparmetrosdesimulao(arquivocomextenso .in)e

outputonomedoarquivoondeosdadosdetemperatura,energiaetc.serogravados.

QUESTES

1. Analiseosresultadosdeenergiaemfunodonmerodepassos(oudotempo)paratodasas
condiesacima.Discutaosresultadosobtidos.

2. A partir dos resultados obtidos nas simulaes realizadas apresente uma estimativa para a
temperaturadefusodoslido.Justifiquesuaresposta.

3. Procurenaliteraturaosvaloresdatemperaturadefusodecristaisdegasesnobres(Ne,Ar,Kr,
Xe)bemcomoosparmetrosseedopotencialdeLennardJonesparaesteselementos.Compare
ediscutaosresultadosobtidosnasimulaoemunidadesunidadesreduzidaseemunidadesdo
sistemaSI.

4. Faaasdevidascorreesdeseusresultadosparaincluirasinteraesdelongoalcance.Voc
observa uma melhor aderncia dos seus resultados aos resultados da literatura aps esta
correo?Discuta.

5. Vocutilizariaomtodoapresentadonestaaulaparaumadeterminaoprecisadatemperaturade
fusodeumslido?Porqu?