Tema 1.

Biologa Molecular
1.1 Molculas para el metabolismoDP/PAU
Germn Tenorio
Biologa NS-Diploma BI

Idea Fundamental: Los organismos

vivos controlan su composicin mediante
una compleja red de reacciones qumicas.
 Biologa molecularDP
El descubrimiento de la estructura del ADN en 1953 fue el inicio de la
revolucin sufrida por la Biologa, transformando nuestro entendimiento
de los seres vivos.

IMAGEN: georbi.es.tl

IMAGEN: georbi.es.tl

Muchas molculas son importantes para

los seres vivos, desde las ms simples
como el agua, hasta las ms complejas IMAGEN: quantum-mind.co.uk

como los cidos nucleicos y protenas. Actividad conocimientos previos

 Biologa molecularDP
La aproximacin de la biologa molecular es reduccionista, es decir,
investiga por separado los distintos componentes de los procesos
bioqumicos. Es decir, la biologa molecular explica los procesos
vivos aludiendo a las sustancias qumicas implicadas.

Aunque esta aproximacin

reduccionista del estudio
de los componentes por
separado ha sido muy
productiva, tiene varios
detractores que
mantienen que cuando los
componentes se combinan
IMAGEN: georbi.es.tl

aparecen propiedades
emergentes que solo
pueden ser investigadas
cuando se estudia el al
sistema en su conjunto.
IMAGEN: thwink.org
Video1
 MetabolismoDP/PAU
Metabolismo: Conjunto de todas las reacciones qumicas catalizadas por
enzimas que tienen lugar en una clula u organismo.
Consta de dos tipos de reacciones, las
cuales no ocurren ni de forma simultnea
ni en el mismo lugar de la clula, pero
que estn acoplados.
Catabolismo o fase
degradativa: Conjunto de
reacciones metablicas en las que
las molculas orgnicas complejas
y reducidas son descompuestas
(degradadas) a molculas ms
simples y oxidadas (incluida la
hidrlisis de macromolculas en
monmeros) para la obtencin de
energa y poder reductor.
El catabolismo incluye los procesos de respiracin celular aerobia,
fermentacin, y digestin de molculas complejas del alimento.
 MetabolismoDP/PAU
Anabolismo o fase constructora: Conjunto de reacciones bioqumicas
mediante las cuales las clulas sintetizan molculas complejas y
reducidas, mediante el consumo de energa y poder reductor, a partir de
molculas sencillas y oxidadas (incluida la formacin de macromolculas
a partir de monmeros, por reacciones de condensacin).

Web1

El anabolismo incluye los procesos de sintesis de protenas, sntesis de

ADN (replicacin), sntesis de polisacridos complejos como el almidn,
glucgeno o celulosa, y la sntesis de glucosa (fotosntesis).
 Elementos qumicos de la vida: BioelementosPAU
La materia constituyente de los seres vivos est compuesta por
biomolculas, que estn a su vez formadas por la unin de ciertos
elementos qumicos. A los elementos qumicos presentes en los seres
vivos se les llama bioelementos.
Estos elementos qumicos fueron seleccionados para la vida por ser
capaces de construir estructuras y realizar funciones capaces de aumentar
la supervivencia de las clulas que los incorporaron.
Puesto que la vida parece que surgi en
el seno de los mares primitivos,
muchos de los elementos esenciales

IMAGEN: /recursos.cnice.mec.es
para la vida fueron seleccionados por
dos parmetros:
1) Su comportamiento en el medio
acuoso. Es decir, si son insolubles o
solubles y, en este caso, el nmero de
cargas que tienen en forma inica.
2) La reactividad de los tomos y los
tipos de enlaces que pueden formar
para construir molculas orgnicas.
 Elementos qumicos de la vida: BioelementosPAU
Existen unos 70 bioelementos y, al igual que el resto de elementos que
forman la materia general del Universo, todos ellos estn presentes en la
tabla peridica.
 Elementos qumicos de la vida: BioelementosPAU
Sin embargo, al comparar la composicin qumica de los seres vivos con la
de la corteza terrestre (inerte), los bioelementos mayoritarios no
coinciden, salvo el oxgeno, con los elementos ms abundantes en la
corteza.

Se puede observar que los elementos qumicos ms frecuentes en los

seres vivos son solo cuatro: carbono, hidrgeno, oxgeno y nitrgeno.
 Principales bioelementosPAU
Los bioelementos se clasifican en dos grupos, en funcin de su presencia
y abundancia:
1) Biolementos mayoritarios. Estn en todos los seres vivos y forman
ms del 98% del total de la materia viva. Los primarios son C,H,O,N,P y
S y constituyen los ladrillos con los que se fabrican las biomolculas o
principios inmediatos. Los secundarios son Na, K, Cl, Mg y Ca, y
desempean funciones de vital importancia en la fisiologa celular.

2) Oligoelementos. Se encuentran presentes en pequesimas

cantidades y se distinguen a su vez esenciales para todos los seres
vivos, que son solo 5 (Fe, Mn, Cu, Zn y Co), y no esenciales, no
presentes en todos los seres vivos pero que cumplen funciones
importantes en el metabolismo, como Al y Li.
 Elementos qumicos de la vida: bioelementosPAU
Los bioelementos secundarios y los oligoelementos, como los de la tabla,
son necesarios para los organismos vivos.

Video2
 Los compuestos de carbonoDP/PAU
Aunque el carbono es solamente el dcimoquinto elemento ms
abundante en la Tierra, puede usarse para fabricar una amplia variedad
de molculas diferentes, lo que hace que la compocisin qumica de los
seres vivos sea casi ilimitada.
La vida contiene carbono
en grandes cantidades. Es
interesante destacar que,
siendo el C y el Si del
mismo grupo del sistema
peridico y por tanto
tener propiedades fsico-
qumicas muy
semejantes, y adems
siendo el Si casi 150
veces ms abundante en
la corteza terrestre, ha
sido el carbono el
seleccionado.
 Propiedades fsico-qumicas del CarbonoDP/PAU
Las propiedades del carbono que le dan su gran idoneidad y a las que se
debe la diversidad de compuestos de carbono existentes, son:
1) Puede formar 4 enlaces covalentes. Al poseer 6 protones su
configuracin electrnica es 1s2 2s2 2p2. En lugar de disponer de dos electrones
desapareados, el carbono desaparea en electrn del orbital 2s2, por lo que
posee 4 electrones desapareados (valencia IV) que ocupan los orbitales 2s1
2p1x 2p1y 2p1z, formando cuatro orbitales hbridos orientados hacia los cuatro
vrtices de un tetahedro que le permite formar cuatro enlaces covalentes
simples al aceptar electrones para compartir sus cuatro orbitales enlazantes
con otros tomos, permitiendo as la existencia de toda una serie de
compuestos estables.
 Propiedades fsico-qumicas del CarbonoDP/PAU
2) Formacin de largas cadenas. Los enlaces entre los tomos de carbono
pueden ser simples (C-C), dobles (C=C) o triples y permiten construir
cadenas ms o menos largas, lineales o ramificadas, anillos, etc. Adems, se
pueden construir molculas tridimensionales muy diferentes, propiedad de
vital importancia en la funcin biolgica (unin enzima-sustrato o antgeno-
anticuerpo).
 Propiedades fsico-qumicas del CarbonoDP/PAU
3) Formacin de grupos funcionales. Las distintas combinaciones del
carbono con otros elementos, permiten la formacin de gran cantidad de
grupos que comunican a las molculas que los portan unas propiedades
caractersticas, como aldehdos, cetonas, aminas, alcoholes o hidrocarburos.
 Propiedades fsico-qumicas del CarbonoDP/PAU
4) El dixido de carbono, compuesto
de gran importancia biolgica, es
anormalmente estable, soluble en agua
y permanece en estado gaseoso,
indispensable para ser utilizado en la
fotosntesis.

Los inconvenientes del silicio, que lo hacen menos idneo, son:

- Los enlaces Si-Si son ms dbiles e inestables que los de las cadenas
carbonadas.
- Las cadenas Si-O-Si-O- existen, pero su reactividad es casi nula
(siliconas).
- El anlogo al CO2, el SiO2
es slido, insoluble en
agua y, por tanto, difcil de
captar por los seres vivos.
 Clasificando los compuestos de carbonoDP/PAU
La vida se basa en los compuestos de carbono, entre ellos
glcidos, lpidos, protenas y cidos nucleicos, que al tener
diferentes propiedades pueden usarse para propsitos diferentes.
Los glcidos estn compuestos de carbono, hidrgeno y oxgeno, con un
ratio hidrgeno:oxgeno de 2:1, por lo que se les denomina carbohidratos.
Los monosacridos son los ms simples, y constituyen los monmeros
para la formacin de los ms complejos.
IMAGEN: http://s.hswstatic.com

Los lpidos son un grupo heterogneo de molculas

caracterizadas por su insolubilidad en agua y que
estn compuestos de carbono, hidrgeno y oxgeno, y
en menor proporcin nitrgeno y fsforo. IMAGEN: madsci.org
 Clasificando los compuestos de carbonoDP/PAU
Las protenas son compuestos de carbono, hidrgeno, oxgeno y
nitrgeno, siendo los aminocidos sus monmeros constituyentes.

IMAGEN: madsci.org IMAGEN: cahsbiology.weebly.com

Los cidos nucleicos estn compuestos de carbono, hidrgeno, oxgeno,

nitrgeno y fsforo, siendo los nucletidos sus monmeros
constituyentes.
HABILIDAD: Identificacin de compuestos bioqumicosDP/PAU
Las molculas de carbohidratos, lpidos, protenas y cidos nucleicos son
diferentes unas de otras, por lo que pueden distinguirse fcilmente.
Las protenas y los cidos nucleicos contienen
nitrgeno, a diferencia de los glcidos y los
lpidos.
Muchas protenas contienen azufre, pero no as
los glcidos, los lpidos y los cidos nucleicos.
Algunos lpidos y los cidos nucleicos contienen
fsforo, a diferencia de los glcidos y las
protenas.
HABILIDAD: Dibujos de diagramas molecularesDP/PAU
Hay que saber realizar un diagrama molecular de:
- los monosacridos alfa-D-glucosa, beta-D-glucosa, D-ribosa y fructosa.
- un cido graso saturado.
- un aminocido.
- un desoxirribonucletido.

Los distintos diagramas se irn realizando a

medida que se expliquen las respectivas
unidades.
Por otro lado, hay que saber reconocer
diagramas moleculares de la molcula de
agua, monosacridos, disacridos, cidos
grasos, triglicridos, fosfolpidos, esteroides,
aminocidos, dipptidos, pptidos (protenas),
nucletidos y cidos nucleicos.
 Compuestos orgnicos e inorgnicosDP
La materia constituyente de los seres vivos est compuesta, adems de
por molculas inorgnicas, por biomolculas orgnicas.

Se consideran orgnicos
aquellos compuestos de los
organismos vivos que
contienen carbono excepto
los:
- hidrogenocarbonatos o
bicarbonatos (NaHCO3);
- carbonatos (CaCO3);
- xidos de carbono (CO/CO2).
 APLICACIN: La ureaDP
Si bien se consideran orgnicos aquellos compuestos de carbono
fabricados por los seres vivos, existen exepciones, como la urea.
La urea es un compuesto nitrogenado de estructura
relativamente simple que forma parte de la orina, donde
se descubri por primera vez.
La urea se produce
cuando hay un exceso de
aminocidos en el
cuerpo, como forma de
excretar el exceso de
nitrgeno debido a los IMAGEN: andromeda.rutgers.edu
mismos.
La urea se produce en el
hgado mediante un ciclo
de reacciones catalizadas La urea producida es
enzimticamente. transportada por la sangre
IMAGEN: easynotecards.com a los riones, donde se
Web2 filtra y pasa a la orina.
 APLICACIN: La ureaDP
Sin embargo, la urea tambin puede sintetizarse artificialmente, aunque
mediante un conjunto de reacciones qumicas diferentes a las que
ocurren en el hgado que no estn catalizadas por enzimas.

Cerca de 100 millones de toneladas son producidas

anualmente, en su mayora para ser utilizados como
fertilizantes nitrogenados para las cosechas de cereales.

Por tanto, qu implica el

que los compuestos
orgnicos, caractersticos
de los seres vivos,
puedan ser obtenidos
artificialmente?
IMAGEN: pixgood.org
IMAGEN: edalatsowda.com
NATURALEZA CIENCIAS: Refutacin de teorasDP
La urea fue descubierta en la orina a comienzos del siglo XVIII,
asumindose que era producida por los riones. Por aquel entonces se
crea, en base a la teora del vitalismo, que los compuestos orgnicos
de las plantas y los animales, solo podan fabricarse con ayuda de un
Principio vital, diferente de fuerzas puramente qumicas o fsicas.
Un siglo ms tarde (en 1828), el qumico alemn
Friedrich Whler sintetiz urea artificialmente
a partir de cianato de amonio, siendo as el
primer compuesto orgnico en ser sintetizado.
IMAGEN: scienceprogress.org

IMAGEN: openlibrary.org
NATURALEZA CIENCIAS: Refutacin de teorasDP
Dado que Whler no us ningn principio vital, la sntesis artificial de
la urea ayud a refutar el vitalismo.
Aunque actualmente est
totalmente aceptado que
los procesos en los seres
vivos estn gobernados
por las mismas fuerzas
fsicas y qumicas que en la
materia inerte, sigue
habiendo algunos
compuestos orgnicos que
no han podio ser
sintetizados artificialmente.
As, protenas complejas
como la hemoglobina no
pueden sintetizarse sin los
ribosomas y otros
componentes celulares. Video3 IMAGEN: angelfire.com
 Enlaces qumicos que unen las biomolculasPAU
Las biomolculas orgnicas, atendiendo a la longitud y complejidad de su
cadena, se pueden clasificar como monmeros o polmeros.
Los monmeros son molculas pequeas (aminocidos o
nucletidos), unidades moleculares que forman parte de una molcula
mayor, y estn formados por la combinacin de bioelementos unidos
entre s mediante enlaces qumicos.
Los polmeros son agrupaciones de monmeros (protenas o cidos
nucleicos), iguales o distintos, unidos entre s mediante otros enlaces
qumicos para formar una molcula de mayor tamao.

IMAGEN: ciencia.cl
 Enlaces qumicos que unen las biomolculasPAU
Los enlaces qumicos tienen por tanto una gran importancia en
biologa, distinguindose diversos enlaces qumicos en funcin de su
dureza o estabilidad.
El enlace covalente es el enlace qumico por excelencia, y hace posible
la enorme diversidad molecular que integra la materia viva. Este enlace
tiene lugar por la comparticin de electrones entre dos tomos. Las
molculas as formadas no pierden estabilidad en el ambiente acuoso
propio de toda clula.
Los enlaces C-C o los enlaces entre el
C y el O, H y N son covalentes, as
como los que unen el O y el H en la
molcula de agua. Igualmente, los
enlaces O-glucosdicos y peptdicos
que unen los monosacridos,
aminocidos y nucletidos son
covalentes.
Web5 IMAGEN: juntaandalucia.es
 Enlaces qumicos que unen las biomolculasPAU
El enlace inico se forma entre tomos que exhiben carga positiva por
haber perdido electrones (cationes) y tomos que exhiben carga negativa
porque los han ganado (aniones). Los tomos se mantienen unidos
debido a las fuerzas de atraccin electrosttica entre cargas opuestas.

Este tipo de unin no se

encuentra entre los tomos
que predominan en la
composicin de los seres
vivos (CHONPS), pero son
muy importantes desde el
punto de vista biolgico,
dado que posibilitan que las
protenas adquieran su
estructura o el grado de
compactacin de la
cromatina.

IMAGEN: cahsbiology.weebly.com
 Enlaces qumicos que unen las biomolculasPAU
Entre los enlaces dbiles, destaca el
enlace o puente de hidrgeno,
que a pesar de su debilidad es de
extraordinaria importancia en la
estructura qumica de la materia viva.
Este enlace se forma cuando el H se
une covalentemente a un tomo muy
electronegativo, de manera que el
par de electrones compartidos se
sitan lejos del H, quedando ste con
una carga parcial positiva y el otro
tomo con una parcial negativa.
IMAGEN: cahsbiology.weebly.com

La carga positiva del H es atrada por la negativa de otra molcula, de

manera que el H queda formando un puente entre dos molculas.
Esta atraccin es muy dbil, pero si son muchas las regiones de las dos
molculas atradas, pueden quedar establemente unidas; es el caso de la
doble hlice de ADN, protenas o las molculas de agua.
 Enlaces qumicos que unen las biomolculasPAU
Las fuerzas de Van der Waals, son atracciones elctricas dbiles
entre diferentes tomos, resultado de las fuerzas atractivas y repulsivas
que se establecen al acercarse los tomos, de manera que existe una
distancia en que la atraccin es mxima.
Estas fuerzas se deben a que cada
tomo posee una nube electrnica
que puede fluctuar, creando de
esta manera dipolos temporales.
Estos dipolos transitorios provocan
una atraccin electrosttica dbil:
las fuerzas de Van der Waals.
Estas atracciones de Van der
Waals, aunque transitorias y
dbiles son un componente
importante en la estructura de las
protenas porque su nmero es
importante.
 Enlaces qumicos que unen las biomolculasPAU
Las interacciones hidrofbicas se dan entre las regiones no polares de
molculas, que suelen disponerse en el interior de la misma evitando de
esta manera las interacciones con el agua.
Este tipo de fuerzas hidrofbicas
intervienen en el correcto
plegamiento de las protenas,
donde las uniones hidrofbicas
suelen darse en el interior,
corazn hidrofbico de la
protena, donde la mayora de
cadenas laterales puede
asociarse estrechamente y se
encuentran protegidas de las
interacciones con el disolvente.