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02/11/2017

Metabolismo
Microbiano

Sumrio
Metabolismo microbiano introduo
A obteno de energia pelas clulas
Processos para a sntese de ATP pelas clulas microbianas
Fermentaes
Respirao aerbia em procariotas
Processos respiratrios anaerbios
Oxidaes litotrficas
Metabolismo fototrfico em procariotas
Biossntese
Regulao do metabolismo

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Metabolismo microbiano
Metabolismo somatrio de todas as
reaces qumicas que tm lugar na clula

Catabolismo: reaces de degradao que libertam energia


ao quebrar molculas complexas, de grandes dimenses, em
molculas menores
Frequentemente implicam hidrlise
Anabolismo: Reaces de biossntese, que constroem
molculas de grandes dimenses a partir doutras menores
Necessitam de energia
Frequentemente implicam reaces de sntese por
desidratao

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Reaco de oxidao acoplada a uma reaco de reduo no


decorrer da via fermentativa de Embden-Meyerhof.

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Estrutura do NAD e
do NADP.

OBTENO DE ENERGIA PELAS


CLULAS MICROBIANAS

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Os dois mecanismos para a sntese de ATP:


fosforilao oxidativa e fosforilao
ao nvel do substrato

Membrana citoplasmtica da
E. coli. A seco da
membrana revela diversos
sistemas transportadores,
o aparelho motriz dum
flagelo (anis S e M), o
sistema transportador de
electres da cadeia
respiratria e a ATPase
ligada membrana.

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Fig. 6..

Modelo duma fermentao.

Vias para a obteno do


intermedirio oxidado:
1. A via glicoltica (EMP)

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Destinos do piruvato
proveniente da via glicoltica
Fermentaes - resumo

Vias para a obteno do


intermedirio oxidado:
2. Via das pentoses-fosfato
ou via da fosfocetolase
papel na fermentao
heteroltica

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Vias para a obteno do


intermedirio oxidado:
3. Via fermentativa de
Entner-Doudoroff papel
na fermentao alcolica
das Zymomonas

Tabela 1. Vias oxidativas glicolticas utilizadas por vrias


bactrias.

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Tabela 2. Produtos finais das fermentaes microbianas.

Papel das fermentaes


na Natureza
Papel fundamental
Havendo matria orgnica, as bactrias crescem e
removem o oxignio por respirao, criando
condies para passar a haver fermentao
Nas culturas laboratoriais, as bactrias comeam
por fazer metabolismo respiratrio e s depois de
consumirem todo o oxignio passam a fermentar
Protozorios e fungos tambm fermentam
Tecidos animais podem temporariamente tambm
fermentar para suprir carncias energticas

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Que substncias podem ser


fermentadas?
Tm que ter potencial redox (Eh)
intermdio
Tem que ser possvel a sua converso num
produto passvel de sofrer fosforilao ao
nvel do substrato
Muitos acares
Alguns aminocidos (clostrdios, p. ex.,
obtm energia oxidando um aminocido e
reduzindo simultaneamente outro)

Reao de Stickland

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Os clostrdios e a gangrena
gasosa

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Exemplos de fermentaes
com impacto na vida humana
Fermentao alcolica
Produo de bebidas alcolicas (cerveja, vinho,
etc.) fermentao alcolica por leveduras
Produo de po
Fermentao lctica (homo- e hetero-)
Produo de lacticnios
Produo de certos enchidos
Produo de certos tipos de po (juntamente
com a fermentao alcolica)
Conservao de forragens: ensilagem

Testes laboratoriais
Fermentaes

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Exemplo prtico:
identificao das enterobactrias

Respirao aerbia
Tem como resultado a oxidao completa do
substrato por um receptor externo de electres
o mais eficiente dos processos catablicos

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Respirao aerbia
Pode ser entendida como uma reaco redox

C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O + ATP


Glucose oxignio oxidada reduzido

Requisitos da respirao:
Possuir uma via glicoltica funcional
Ser capaz de levar a cabo o CAT
indispensvel para oxidar completamente o
substrato, produzindo CO2
Possuir uma membrana intacta com sistema
transportador de electres na respirao
h produo de ATP por fosforilao
oxidativa

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Requisitos da respirao:

Receptor externo de electres:


O2 na respirao aerbia
Outros nas respiraes anaerbias:
SO4, S0, nitrato, nitrito, etc.
ATPase transmembranar

Etapas da respirao
aerbia

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Primeira etapa: gliclise


A glucose (6C) quebrada e oxidada a duas
molculas de piruvato (3C)
A maioria dos organismos levam a cabo este
processo
No necessita de oxignio
Rendimento energtico lquido por molcula
de glucose:
2 ATP (fosforilao ao nvel do substrato)
2 NADH

Durante a gliclise, a glucose


degradada a duas molculas de
piruvato

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O piruvato convertido a acetil


CoA antes de se iniciar o CAT

Ciclo dos cido


tricarboxlicos.

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Segunda etapa: o CAT


Ciclo de 8 reaces de oxidao-reduo que
transferem energia para molculas
transportadoras de electres (coenzimas NAD+
e FAD)
Perdem-se 2 molculas de carbono por ciclo
O composto inicial do ciclo (c. oxaloactico)
regenerado na etapa final
Rendimento energtico lquido por molcula de
glucose:
2 ATP (fosforilao ao nvel do substrato)
8 NADH
2 FADH2

Ciclo dos cidos tricarboxlicos:


entram dois carbonos, saem dois
carbonos

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Cadeia de transporte de electres: na


respirao aerbia, o oxignio o
receptor final

Terceira etapa: cadeia de


transporte de electres e
quimiosmose
O NADH e o FADH2 cedem os seus
electres cadeia transportadora
Os transportadores de electres
encontram-se situados na membrana
celular das bactrias ou na membrana
mitocondrial interna dos eucariotas
O receptor final o oxignio

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Terceira etapa: cadeia de


transporte de electres e
quimiosmose
Gera-se um gradiente de protes atravs
da membrana medida que os electres
fluem pela cadeia transportadora
A ATPase produz ATP medida que os
protes refluem no sentido do gradiente
(quimiosmose)
Rendimento energtico lquido:
2 FADH2 geram 2 ATP cada: 4 ATP
10 NADH geram 3 ATP cada: 30
ATP

Quimiosmose na respirao aerbia: a


produo de ATP requer membranas
intactas

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Rendimento total da respirao


aerbia de 1 molcula de glucose: 36
38 molculas de ATP
Nos procariotas:
C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O + 38 ATP
Nos eucariotas:
C6H12O6 + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O + 36 ATP

Nos eucariotas o rendimento mais baixo porque


o transporte do cido pirvico para o interior
das mitocndrias requer energia

Respirao aerbia dos


procariotas: resumo

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Tarefa para estudo:

Comparar fermentao e respirao

Tabela 3. Receptores de electres para a respirao e


metanognese dos procariotas.

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Respirao anaerbia
O receptor final de electres no o
oxignio
antes uma outra molcula inorgnica:
Nitrato (NO3-): Pseudomonas e Bacillus.
Reduzem nitrato a nitrito, xido nitroso
ou azoto gasoso
Sulfato (SO42-): Desulfovibrio. Reduzido
a H2 S
Carbonato (CO32-): reduzido a metano

Respirao anaerbia
Ineficiente (2 ATP por molcula de
glucose)
Na ausncia de O2, o CAT s
parcialmente funcional
Nem todos os transportadores de
electres da cadeia participam neste
processo
Os anaerbios tm tendncia para
crescerem mais lentamente do que os
aerbios

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Importncia dos processos


respiratrios anaerbios
Metanognese:
fonte das reservas de metano (gs natural)
No verdadeiramente uma respirao
Metanognicos (arqueobactrias)
Desnitrificao:
Importante do ponto de vista agrcola
Perda de nitratos pelo solo
Processo alternativo respirao aerbia; se tiverem
oxignio, as bactrias preferem fazer respirao aerbia
Motivo para fazer mobilizaes do solo torn-lo aerbio
A E. coli e a maior parte das Enterobacteriaceae faz
desnitrificao teste dos nitratos

Importncia dos processos


respiratrios anaerbios
Reduo de sulfatos
Processo de natureza obrigatria
Exclusivo de ambientes anaerbios
Redutores de sulfatos e metanotrficos podem
partilhar o mesmo ambiente (ex.: sedimentos de
lagos eutrofizados)
Processos respiratrios anarebios
Papel muito importante nos ciclos
biogeoqumicos dos elementos (C, S, N)
Em geral, reduzem as formas oxidadas destes
elementos

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Catabolismo de diversas
molculas nutrientes orgnicas

Metabolismo litotrfico
Utilizao dum composto inorgnico como
fonte de energia
A maioria dos processos litotrficos so do
tipo respiratrio (respirao anaerbia), s
que a fonte de energia inorgnica e no
orgnica
Presente em eubactrias e arqueobactrias
Litotrficos dividem-se em grupos
fisiolgicos consoante o subtrato que
utilizam para a obteno de energia

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Tabela 4. Grupos fisiolgicos de litotrficos.

Bactrias do hidrognio
Oxidam H2 como fonte de energia
So litotrficos facultativos
Muito versteis do ponto de vista das
fontes de energia que conseguem
utilizar
Ex.: Pseudomonas

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Metanognicos
Tambm oxidam H2, passando os
electres deste para o CO2, que
reduzido a metano
Metabolismo exclusivo
Coenzimas e sistemas nicos de
transporte de electres
Processo de fixao de CO2 muito raro

Carboxidobactrias
Oxidam CO (monxido de carbono) a
CO2
Processo facultativo algumas so
tambm bactrias do hidrognio ou
fototrficas

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Bactrias nitrificantes
Quase todas litoautrotrficas obrigatrias
(algumas estirpes de Nitrobacter tambm
podem utilizar acetato)
Parte essencial do ciclo do azoto nas guas
e solos
Ambientes ricos em amnia, onde haja
protelise intensa
Nitrobacter e Nitrosomonas

Bactrias litotrficas que


oxidam enxofre
Eubactrias (Thiobacillus) e arqueobactrias
(Sulfolobus)
Nem todos so litoautotrficos obrigatrios
Ambientes ricos em H2S
Fontes termais vulcnicas
Fumarolas, ec.
Papel fundamental como produtores primrios em
ambientes desprovidos de luz solar
Produzem cido sulfrico tendem a acidificar o
meio
Ambientes extremos:
Algumas acidfilas
Algumas hipertermfilas

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Bactrias do ferro

Oxidam ferro ferroso a frrico


Ex.: Gallionella (caulobactria,
objectos submersos, Thiobacillus
ferrooxidans

As oxidaes litotrficas tm baixo rendimento energtico

Nitrificao: oxidao do NH3 Nitrificao: oxidao de nitrito a


nitrato

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As oxidaes litotrficas tm baixo rendimento energtico.


Exemplo: oxidaes litotrficas implicadas na nitrificao

Nitrificao: oxidao do NH3 Nitrificao: oxidao de nitrito a


nitrato

Metabolismo fototrfico
Luz a fonte de energia
Cianobactrias fotossntese parecida com
a dos vegetais fotossntese oxignica
Bactrias verdes e bact. prpura
fotossntese anoxignica
Arqueobactrias halfilas extremas
(halobactrias) fotofosforilao no
fotossinttica mediada pela
bacteriorodopsina

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Metabolismo fototrfico:
fotossntese
Converso da energia luminosa em energia
qumica
Utilizao da energia luminosa para
construo de material celular a partir do
CO2
Tem um componente catablico (reaces
dependentes da luz) e um componente
anablico (reaces independentes da luz)

Reaces dependentes da luz


Requerem a presena de pigmentos colectores de
luz
Pigmentos
Clorofilas
Clorofila a cianobactrias
Bacterioclorofilas bactrias verdes e prpuras
Carotenides
Captao de luz na zona azul-verde do espectro
transferem a energia absorvida para a clorofila com uma
eficincia prxima dos 100%
Aco antioxidante proteco das clulas contra o oxignio
singleto produzido por reaco entre clorofila e oxignio
So tambm produzidos por bactrias no-fotossintticas,
ex. S. aureus, para se protegerem das oxidaes no interior
dos fagcitos
Ficobiliprotenas (ficobilissomas)

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Constituintes funcionais
do sistema fotoqumico
Sistema transportador de electres
Muito semelhante ao da respirao
Diferena: possui um receptor de
electres de baixo potencial redox (ex.
ferredoxina) no topo da cadeia o
primeiro a ser reduzido pelo electro que
a luz desloca da clorofila

Constituintes funcionais
do sistema fotoqumico
Fotofosforilao
Cclica bactrias fotossintticas um
s fotossistema
Acclica cianobactrias, algas, plantas
dois fotossistemas

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Fotofosforilao cclica (bactrias)

Fluxo cclico de electres


durante a fotossntese
bacteriana (anoxignica).

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Fotofosforilao acclica

Fluxo de electres durante a fotossntese das plantas


superiores (oxignica)

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Tabela 5. Diferenas entre a fotossntese bacteriana e a


dos vegetais superiores.

BIOSSNTESE
- nos autotrficos
- nos heterotrficos

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Fototrficos podem ser autotrficos fixao de CO2

Ligao entre as reaces dependentes da luz e independentes


da luz na fotossntese.

Fixao de CO2
A maioria dos procariotas
fototrficos so tambm autotrficos
obrigatrios ou facultativos fixam
CO2 parte anablica do seu
metabolismo

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Ciclo de Calvin e a sua relao com a sntese de material celular.

Reverso do ciclo dos cido tricarboxlicos e as reaces


mediadas pela ferredoxina para a fixao de CO2 pelas
bactrias verdes.

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Via da CODH ou da acetil CoA para a fixao de CO2 pelos


metanognicos (arqueobactrias).

Principais vias
biossintticas nos
procariotas
heterotrficos e
nalguns autotrficos

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Precursores
dos principais materiais celulares
Peptidoglicano monmeros derivam da
glucose fosfato
Nucletidos ribose fosfato
Glicerol trioses fosfato
cidos gordos acetil coenzima A
Aminocidos piruvato, alfa-cetoglutararo
e oxaloacetato
ATP e NAD metabolismo da purina
Vitaminas e nucletidos vias especficas,
no inseridas no metabolismo central

Fixao biolgica de azoto

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Fixao biolgica de azoto


simbitica:
Rhizobium e leguminosas
Azolla - Anabaena
Em vida livre:
Clostridium
Azotobacter

Enzima central do processo


Nitrogenase
Desnaturada pelo oxignio
Estratgias de proteco da
nitrogenase:
Clostridium: anaerobiose
Azotobacter: taxa de respirao muito
rpida
Rhizobium: leg-hemoglobina
Anabaena: heterocistos

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REGULAO DO
METABOLISMO

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Regulao do metabolismo:
Permite a adaptao do organismo s
condies ambientais prevalecentes em
cada situao
Controlo da actividade das enzimas que
conduzem as diversas reaces
metablicas:
Actuando directamente sobre as enzimas
Indirectamente, actuando a nel dos genes e
controlando assim a sntese de enzimas pela
clula

Controlo directo
da actividade enzimtica
Retro-inibio:
O produto final duma via metablica
actua como inibidor duma das enzimas
que catalizam um dos passos iniciais do
processo (geralmente o primeiro)
Quando a concentrao do produto final
volta a decrescer abaixo da
concentrao inibitria, a via metablica
volta a entrar em actividade

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Controlo indirecto da
actividade enzimtica
Controlando que enzimas vo ser
sintetizadas e a que taxa iro ser
produzidas
Ao nvel do ADN
Dois mecanismos:
Induo (ligando os genes responsveis pela
biossntese de determinadas enzimas)
Represso (desligando os genes responsveis
pela biossntese de determinadas enzimas)

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