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Revista de Ciencias Biolgicas y de la Salud Universidad de Sonora

El saber de mis hijos har


http://biotecnia.unison.mx mi grandeza

ANLISIS MULTIDIMENSIONAL DE UNA BASE DE DATOS


DE MUJERES PIMA
MULTIDIMENSIONAL ANALYSIS FROM A DATABASE OF PIMA WOMEN

Mara Cristina Tarrs1,2,3, Nora Moscoloni3, Hugo Navone3, Alberto Enrique DOttavio1,2
1
Facultad de Ciencias Mdicas, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Santa Fe, Argentina.
2
Consejo de Investigaciones Cientficas y Tcnicas, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Santa Fe, Argentina.
3
Programa Interdisciplinario de Anlisis de Datos, Universidad Nacional de Rosario, Rosario, Santa Fe, Argentina.

RESUMEN insulinemia and skin fold thickness below the overall aver-
Se presenta una tipologa multidimensional de mu- age. Greater family history in risk groups, relevance of over-
jeres estadounidenses Pima con datos de la Pima Indians weight and the spatial configuration of subjects revealing
Diabetes Database, analizada mediante Componentes possible developmental phases towards diabetes in these
Principalesy posterior clasificacin. Fueron construidos tres women have to be outlined. The usefulness of clusterizacin
clusters individuales con: (1) 64% de positividad para dia- in biological disturbances is finally remarked.
betes, glucemia acorde con tolerancia alteradaa la glucosa, Keywords: Diabetes, obesity, U.S. women, Pima Indians,
hiperinsulinemia, obesidad segn ndice de masa corporal, multidimensional analysis
grosor delpliegue de la piel del trceps superior al promedio
general y presin diastlica cercana a prehipertensin;(2) 50 INTRODUCCIN
% de positividad para diabetes, glucemia cercana al lmite En el continente americano han sucedido serias trans-
inferior de tolerancia alterada a la glucosa, ndice de masa formaciones socioculturales cuyos efectos ms conspicuos
corporal correspondiente a obesidad y grosor del pliegue de fueron modificaciones en el perfil epidemiolgico, en los
la piel del trceps,presin diastlica, edadynmero de em- estilos de vida, en los patrones de consumo alimentario y
barazos mayores a la media general; (3) 16% de positividad en las tasas de morbi-mortalidad. Entre ellas, se destaca un
para diabetes, ndice de masa corporal indicando sobrepeso incremento de las enfermedades crnico-degenerativas no
y nmero de embarazos, funcin de pedigr de diabetes, transmisibles, como la obesidad y la diabetes (Pea y Baca-
edad, glucemia, insulinemia y grosor del pliegue de la piel llao, 2000; Ceballos Jurez et al., 2012).
del trceps menoresal promedio general. Resulta destacable Haciendo foco en el grupo tnico akimel oodham o
el mayor grado de antecedentes familiaresen el grupo de Pima, asentado actualmente en el sudoeste estadounidense
riesgo y la relevancia del sobrepeso as como la configura- (Estado de Arizona) y en el noroeste mexicano (Estados de
cin espacial de los individuos revelando posibles fases en el Sonora y Chihuahua), corresponde sealar que, excediendo
desarrollo diabtico de estas mujeres. Finalmente, se subraya su predisposicin gentica a la diabetes y a la obesidad
la utilidad de la clusterizacin en problemas biolgicos. (Knowler et al., 1983; Hanson y Ehm, 1998; Narayan, 2016),
Palabras clave: Diabetes, obesidad, mujeres EEUU, indios no evidenciaba estas enfermedades mientras sus integrantes
Pima, anlisis multidimensional vivieron de la pesca y de la agricultura. Empero, hacia fines
del siglo XIX, interrumpieron sus prcticas agrcolas habitua-
ABSTRACT les debido a la escasez de agua derivada de la migracin de
A multidimensional typology of U.S. Pima women is colonos desde el Este. Como consecuencia de ello, el grupo
presented with data obtained from Pima Indians Diabetes que resida primordialmente en los EEUU occidentaliz sus
Database, and analyzed employing Principal Components hbitos y adopt, despus de un breve lapso, costumbres
and subsequent classification. Three individual clusters were modernas ajenas. En ese marco, su alimentacin se modifi-
obtained: (1) 64% of positivity for diabetes, glycemia com- c de manera radical hasta llegar a ser en la actualidad muy
patible with abnormal glucose tolerance, hyperinsulinemia, similar a la del promedio de la poblacin estadounidense
body mass index corresponding to obesity, triceps skin fold (Gonzlez Barranco, 2004). Tal relevante cambio dietario,
thickness above the general average and diastolic pressure junto con una significativa reduccin en el gasto energtico,
near to prehypertension; (2) 50% of positivity for diabetes, indujo un notorio incremento en la frecuencia de diabetes y
glycemia near the lower level of abnormal glucose tolerance, obesidad (Knowler et al., 1990; Knowler et al.; 1991, Knowler
body mass index corresponding to obesity and skin fold et al., 1993; Krakoff et al., 2001; Schulz et al., 2001; Martorell,
thickness, diastolic pressure, age and number of pregnancies 2005).
above the overall average; (3) 16% of positivity for diabetes, En ese sentido, fue reportado recientemente que los
body mass index corresponding to overweight and number indios Pima mexicanos, en comparacin con los estadouni-
of pregnancies, diabetes pedigree function, age, glycemia, denses, mostraban menor prevalencia de diabetes tipo 2 y

Volumen XVIII, Nmero 3 *Autor para correspondencia: Alberto Enrique DOttavioCorreo


14 electrnico: aedottavio@hotmail.com
Recibido: 03 de agosto de 2016
Aceptado: 24 de noviembre de 2016
Tarrs et al: Anlisis multidimensional de una base de datos / XVIII (3): 14-19 (2016)

obesidad junto a un disminuido consumo de grasa y mayor para resumir un conjunto de variables continuas en un n-
nivel de actividad fsica, corroborando as el papel del estilo mero pequeo de variables sintticas (Escofier y Pags, 1995;
de vida en poblaciones genticamente predispuestas a estas Aluja y Morineau, 1999).
afecciones (Urquidez-Romero et al., 2015). Este mtodo transforma el conjunto original en uno
Todo lo antes referido habla acerca de la persistencia ms pequeo de combinaciones lineales de las variables de
de facetas susceptibles y dignas de ser indagadas en esta origen, las que representan la mayor parte de la variancia del
poblacin. conjunto original. El objetivo es determinar factores o com-
Tomando en cuenta que uno de los abordajes de esta ponentes principales que expliquen la mayor variacin po-
problemtica se sustenta en el anlisis de bases de datos sible de los datos con la menor cantidad de dichos factores.
efectuado, desde distintas perspectivas, a fin de disear algo- El enfoque de la escuela francesa de anlisis de datos
ritmos clasificadores o diagnsticos, asignando individuos a posibilita la eleccin de variables activas e ilustrativas (o
grupos previamente definidos (Khashei et al., 2012, Gu et al., suplementarias). Las primeras se incluyen en los clculos de
2014), y debido a que en la literatura especializada no fuera diagonalizacin de la matriz mientras que las segundas se
constatada la construccin de tipologas, el presente trabajo proyectan a posteriori en el espacio factorial construido con
emplea la Pima Indians Diabetes Database (PIDD, EEUU) e las variables activas.
intenta, mediante anlisis exploratorio multidimensional, Como activas fueron consideradas las variables conti-
una categorizacin multivariada que permita identificar nuas: Concentracin de glucosa plasmtica (G120mg/dl) y de
agrupamientos de individuos con mayor riesgo de desarro- insulina srica (I120mU/ml), ambas a las 2hs de una prueba
llar diabetes. de tolerancia oral a la glucosa, Presin arterial diastlica (PAD
mmHg), Grosor del pliegue de la piel del trceps (GPPTmm),
ndice de masa corporal (IMC) y Antecedentes Familiares o
MATERIALES Y MTODOS funcin de pedigr de diabetes (FPD).
Se utiliz la Pima Indians Diabetes Database (PIDD), Como ilustrativas lo fueron el N de embarazos (nE), la
cuya propiedad original pertenece al National Institute of edad (E aos) y la variable clasificatoria nominal (test positivo
Diabetes and Digestive and Kidney Diseases, y los datos fue- o negativo para diabetes) (D).
ron obtenidos del UCI Machine Learning Repository - Pima
Indians Diabetes Data Set (2016). Las unidades de anlisis Construccin de una tipologa de individuos
consistieron en 768 mujeres residentes cerca de Phoenix, Este mtodo alude a la formacin de clases o clusters
Arizona, EEUU, pertenecientes a la etnia Pima y con al menos con caractersticas semejantes, permite la observacin de las
21 aos de edad. En ellas fueron registradas 9 variables: 8 variables que se encuentran asociadas (Lebart et al., 1995) y
numricas y una clasificatoria, detalladas a continuacin: persigue reagrupar los individuos en un nmero restringido
1. Concentracin de glucosa plasmtica a las 2hs de una de clases homogneas y separadas entre s.
prueba de tolerancia oral a la glucosa (G120 mg/dl) Para la construccin de la tipologa fueron tenidas en
2. Concentracin de insulina srica a las 2hs de una prueba cuenta las coordenadas de los mismos en los dos primeros
de tolerancia oral a la glucosa (I120 mU/ml) ejes factoriales considerando este subespacio como el ms
3. Presin arterial diastlica (PAD mmHg.) significativo, dada la relevancia del efecto tamao para los
4. Grosor del pliegue de la piel del trceps (GPPT mm) objetivos de este trabajo, y se aplic la estrategia de clasifi-
5. ndice de masa corporal (IMC= peso /altura al cuadrado= cacin mixta de extendida aplicacin en muestras grandes
kg/m) (Moscoloni, 2005).
6. Antecedentes Familiares o funcin de pedigr de diabetes Con posterioridad, fue efectuada una clasificacin
(FPD) ascendente jerrquica cuyos elementos terminales del rbol
7. N de embarazos (nE) fueron las clases de la particin anterior, construido segn el
8. Edad (E aos) criterio de Ward. La particin final fue definida por corte del
9. Variable clasificatoria (D: 0 1, donde 1 rbol correspondiente y la homogeneidad de las clases obte-
es interpretado como test positivo para nidas, optimizada por reasignaciones realizadas nuevamente
diabetes). El diagnstico estuvo basado en el criterio de con el procedimiento de agregacin alrededor de centros
la OMS (i.e.: G120 200 mg/dl en cualquier examen o mviles.
evaluacin de rutina mdica). Finalmente, se hizo una descripcin del contenido
de las clases a partir de las variables activas e ilustrativas. El
ANLISIS ESTADSTICO procedimiento permite la interpretacin de las clases forma-
Anlisis de Componentes Principales das en trminos de las variables originales, utilizndose un
El enfoque multivariado incluye una serie de tcnicas criterio para jerarquizar las modalidades ms caractersticas
estadsticas que permiten considerar de manera simultnea basado en el clculo de valores tests en el entorno de una
un conjunto de variables medidas en un conjunto de indi- distribucin Normal (0.1). Para ello se realiz una compara-
viduos (Carrasco y Hernn, 1993). Entre ellas, el anlisis de cin de medias, respondiendo a la idea de considerar una
componentes principales es una tcnica factorial empleada variable continua como ms caracterstica de un grupo si su

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promedio es significativamente diferente del general, que tambin la ubicacin de las modalidades de la variable ilus-
corresponde al del conjunto total de individuos. Para la varia- trativa clasificatoria test positivo o negativo de diabetes (D).
ble clasificatoria fueron comparados porcentajes siguiendo
la idea de considerar una modalidad como ms caracterstica
de un grupo si su frecuencia relativa es significativamente
mayor en una clase y, al mismo tiempo, menor en las otras
(Morineau, 1984).
El procesamiento estadstico se llev a cabo con el
software SPAD (Lbart et al., 2000).

RESULTADOS
La descripcin simultnea de la estructura de los da-
tos efectuada a travs del anlisis de componentes principa-
les, puede visualizarse mediante una representacin grfica
en ejes factoriales. Sobre un plano dividido en cuadrantes,
se ubican las variables activas de acuerdo al valor de las
correlaciones obtenidas, observndose en la Figura 1 que,
con referencia al primer factor, todas las variables estn en el
mismo lado respecto del origen de coordenadas. Tal disposi-
cin evidencia el efecto tamao caracterstico de los datos
biomtricos, traduciendo el hecho de que la mayora estn
positivamente correlacionadas entre s por lo que el primer Figura 2. Proyecciones de los individuos segn su clase y las modalidades
eje factorial separa los individuos segn los valores de G120, de la variable clasificatoria.
PAD, GPPT, I120, IMC, FPD, nE y E y el segundo eje factorial Figure 2. Projections of the subjects in accordance with their class and the
opone G120, I120 y FPD a PAD, GPPT e IMC. modality of the classificatory variable.

La configuracin de los clusters a travs de las varia-


bles activas y de la ilustrativa clasificatoria as como las com-
paraciones entre los promedios o porcentajes de las clases
respecto del general son observables en la Tabla 1.

En la Tabla se percibe que las variables activas se ha-


llan ubicadas en orden decreciente; esto es, mayores valores
en las primeras clases y menores en la ltima. Las variables
ilustrativas nmero de embarazos, antecedentes familiares
y resultados del test de diabetes acompaaron este ordena-
miento.

DISCUSIN
Las aplicaciones biomdicas del anlisis de bases de
datos han despertado gran inters en el desarrollo de algo-
Figura 1. Representacin grfica de las variables activas e ilustrativas en los
ejes factoriales
ritmos de clasificacin basados en lgica difusa y en otras
Figure 1. Graphic representation of active and illustrative variables in tcnicas de inteligencia artificial, como redes neuronales
factorial axes artificiales.
Pima Indians Diabetes Database (PIDD) es un conjunto
Se realiz, luego, un anlisis en clusters para agrupar los de datos que ha sido ampliamente estudiado mediante dife-
individuos segn sus afinidades con las variables estudiadas, rentes procedimientos y resultados, persiguiendo fundamen-
aplicando las tcnicas de clasificacin sobre las coordenadas talmente obtener algoritmos susceptibles de ser empleados
de los individuos en los ejes factoriales. A partir del rbol je- como clasificadores o diagnsticos. Entre ellos, el proyecto
rrquico (o dendrograma) construido mediante el algoritmo de Smith et al (1988) es considerado uno de los primeros
ascendente, a cuyo travs las clases se van reagrupando a cuyo travs, trabajando redes neuronales para predecir
progresivamente, fue definida una particin en tres clases. la aparicin de la diabetes en la etnia Pima, se obtuvo un
Los individuos fueron proyectados en el grfico facto- porcentaje de prediccin de un 76%. Carpenter y Markuzon
rial e identificados por su nmero de clase, obtenindose los (1998) lograron un acierto del 81%, y Breault et al. (2002), de
agrupamientos mostrados en la Figura 2. En ella se observa un 83%. Con el desarrollo de clasificacin difusa aplicada al

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Tabla 1. Configuracin de los clusters a travs de las variables activas e ilustrativas continuas (promedio desvo estndar) y de los porcenta-
jes de la ilustrativa clasificatoria. Se incluye la probabilidad asociada al valor test que compara el valor de la clase con el general.
Table 1. Configuration of clusters through continuous active and classificatory variables (mean standard deviation) and the percentages of
the classificatory illustrative one. The probability associated to the test value by comparing class with general values is included.

GENERAL CLASE 1 CLASE 2 CLASE 3


VARIABLES n=357 n=44 n=367
x SD
x DE p x DE p x DE p

121.69 131.43 0.000 164.55 0.000 107.07 0.000


30.5 29.6 21.32 22.66
G120 mg/dL

155.55 --- --- 415.21 0.000 105.42 0.000


I120 mU/mL
118.63 134.35 59.46
72.41 78.49 0,000 --- --- 66.37 0.000
12.37 11.77 9.96
PAD mmHg

29.15 35.91 0.000 33.52 0.002 22.04 0.001


GPPT mm 10.47 10.47 8.55 6.95

32.46 36.79 0.000 36.17 0.000 27.71 0.000


IMC kg/m 6.92 6.04 5.70 4.28

0.47 --- --- 0.61 0.003 0.43 0.000


FPD
0.33 0.46 0.29
3.85 4.29 0.000 --- --- 3.40 0.000
N de embarazos
3.37 3.70 2.96
(nE)

33.24 35.78 0.000 --- --- 30.59 0.000


EDAD (aos) 11.75 11.88 10.93

TEST DIABETES + : 34.90 % +: 50.42% 0.000 +: 63.64% 0.000 +: 16.35% 0.000


: 65.10 % : 49.58% 0.000 :36.36% 0.000 : 83.65% 0.000

campo del diagnstico de diabetes, Contreras et al. (2010), de los datos en grupos que no haban sido predefinidos
utilizando la PIDD, alcanzaron un 83% de positividad en el (Moscoloni, 2005).
diagnstico, uno de los mejores porcentajes encontrados As, se obtuvo un cluster, que podra considerarse
hasta ahora; Lekkas y Mikhilov (2010) consiguieron 79% de como el ms comprometido, formado por unidades de
acierto y, recientemente, Gu et al. (2014) desarrollaron un anlisis que presentaron 64% de positividad para diabetes,
nuevo algoritmo que recomiendan para el anlisis de bases glucemia promedio compatible con tolerancia alterada a
con problemas de desbalance, ruido y presencia de outliers. la glucosa (140 < G120 < 199 mg/dl) (American Diabetes
Cabe destacar que Khashei et al. (2012), con el objetivo de Association, 2014), hiperinsulinemia, IMC correspondiente
lograr una aplicacin que colabore a planear procedimientos a sujetos obesos ( 30 kg/m2) (Schulz et al., 2006); GPPT
de prevencin, diagnstico o tratamiento, postulan una com- superior al promedio general y PAD cercana al lmite inferior
binacin de varias tcnicas de clasificacin con resultados de la categora de prehipertensin (80 mmHg) (Moser, 2004).
que los llevan a proponer al modelo obtenido como superior Un segundo grupo, que podra ser catalogado igualmente
a todos los alternativos. en situacin de riesgo, estuvo constituido por individuos
Desde otra perspectiva, en el presente trabajo fue con un 50 % test positivo para diabetes, IMC semejante
utilizada la PIDD para construir una tipologa multidimen- al de obesos ( 30 kg/m2) y GPPT, PAD, edad y nmero de
sional de las mujeres Pima estadounidenses a travs de los embarazos superiores a la media general. A su vez, la G120,
valores de las variables continuas y la clasificatoria diagns- se revel cercana al lmite inferior de tolerancia alterada a la
tica, mediante anlisis de Componentes Principales (Aluja glucosa. El tercer y ltimo cluster se integr con personas en
y Morineau, 1999) y posterior clusterizacin. De tal modo, situacin menos desventajosa, con 16% de test positivo para
la base fue dividida en grupos subconjuntos diferentes con diabetes y nmero de embarazos, FPD, edad, G120, I120 y
miembros similares entre s por medio de la segmentacin GPPT menores al promedio general. Su MC fue indicador de

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sobrepeso (25 kg/m2 BMI < 30 kg/m2). Dada la reconocida leading to type 2 (non-insulin-dependent) diabetes mellitus
influencia de factores genticos en el desarrollo de diabetes in the rhesus monkey. Diabetologia 29 (10): 713-719.
y obesidad dentro de la etnia Pima (Knowler et al., 1983, Han- Hanson, R.L., y Ehm, M.G. 1998. An autosomal genomic scan for
son y Ehm, 1998), resulta de inters sealar el mayor grado de loci linked to type II diabetes mellitus and body-mass index
in Pima Indians. Am J Hum Genet 63 (4): 1130-1138.
antecedentes familiares en el grupo de riesgo,
Khashei, M., Eftekhari, S., y Parvizian, J. 2012. Diagnosing
En la obtenida configuracin espacial de los indi-
Diabetes Type II Using a Soft Intelligent Binary Classification
viduos, detectora de diferencias multivariadas que bien Model. Review of Bioinformatics and Biometrics (RBB) 1:
podran interpretarse como fases (Hansen y Bodkin, 1986) en 9-23.
el desarrollo de la diabetes de las mujeres Pima estadouni- Knowler, W.C., Pettit, D.J., Bennett, P.H., y Williams, R.C. 1983.
denses, se percibe la relevancia del sobrepeso. Considerando Diabetes mellitus in the Pima Indians: genetic and
que la magnitud y rpido crecimiento de la prevalencia de evolutionary considerations. Am J Physiol Anthropol 62:107-
obesidad en determinadas poblaciones ocurre en personas 114.
cada vez ms jvenes (Violante Ortiz, 2001), lo antedicho Knowler, W.C., Pettit, D.J., Saad, F., y Bennett, P.H. 1990.Diabetes
habilita, por ende, a la identificacin temprana de individuos mellitus in the Pima-Indians: incidence, risk factors, and
en riesgo a efectos de aplicar oportunas medidas preventivas pathogenesis. Diabetes Metab Rev 6 (1):1-27.
Knowler, W.C., Pettit, D.J., Saad, F., Charles, M.A., Nelson, R.G.,
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Concluyendo, la aplicacin del anlisis multidimensio-
Pima-Indians: its magnitude and relationship with diabetes.
nal a la PIDD no slo posibilit concretar un perfil de mujeres Am J Clin Nutr 53 (6 Suppl.): 1453S-1551S.
de la etnia Pima estadounidense a partir de la consideracin Knowler, W.C., Saad, F., Pettit, D.J., Nelson, R.G., y Bennett, P.H.
conjunta de variables sino que, a la par, confirma la utilidad 1993. Determinants of diabetes mellitus in the Pima Indians.
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Consulta 30 junio 2016

Volumen XVIII, Nmero 3


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