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ESTRUTURA DO DNA

Histone acethyltransferase faz a transferncia de um grupo


HAT acetil do Ac-Coa para a lisina na acetilao ativador de
transcrio
HDAC Histone deayltransferase transfere o acetil da lisina para a CoA
inibidor da transcrio (acetilao)
PRMT Aginine methyltransferase adiciona um grupo metil arginina
(metilao)
HMT Hisyone methyltransferase adiciona um grupo metil lisina na
metilao
HGM High mobility group facilita a descompactao da cromatina

REPLICAO DE DNA
Helicase Separa as duas cadeias de DNA complementares (fecho do
casaso), usando ATP
DNA ligase Liga os fragmentos de Okazaki
RNAse H (Procariotas) nucleases que removem primers de RNA
RNA polimerases
Forma um primer de RNA complementar com a cadeia molde
Primase de DNA
RNA polimerase III Sntese de snRNA
DNA polimerase Permitem a adio continua de dNTPs
E.coli
DNA polimerase I limpeza e reparo devido ao exonuclesica 5-3 (as outras
tm todas as contrrio) que remove o primer de RNA da primase
que depois elongado
DNA polimerase II Reparao de DNA (E.coli)
DNA polimerase III cola/polimeriza as duas cadeias de DNA complementares
(E.coli)
(procariotas)
Uma subunidade tem a funo de primase mas apenas para os
DNA polimerase fragmentos de Okazaki e a outra atividade de polimerizao.
No possui proofreading 3-5). Tambm atua nos telmeros
DNA polimerase Reparao de DNA
DNA polimerase Proofreading (semelhante DNA polimerase II)
Topoisomerases
Topoisomerase I Alivia a tenso provocada pelo desenrolamento da dupla hlice
SSB Single stranded DNA binding proteins estabilizam as cadeias
simples (E.coli)
Enzima com capacidade de transcriptase reversa modificada
Telomerase que adiciona RNA extremidade 3 para o cromossoma no
encurtar a cada replicao.
TRANSCRIO DO DNA
RNA polimerase
I Ncleo, sintetiza rRNA 28S, 18S e 5,8S
II Sintetiza percursores do mRNA, snRNA e miRNA
III Sintetiza tRNA e rRNA
TATA Box Sequncia de DNA onde se ligam os GTFs
Fator de transcrio presente na regio prxima do
Sp1 promotor que recruta protenas para o processo de pr--
-iniciao PIC-complexo de pr iniciao
CE Capping Enzyme, tem duas atividades
RTP RNA 5 trifosfatase, desfosforila o pr-mRNA que passa
de pppN para ppN
GT Guanil transferase, adiciona GMP (guanil monofosfato)
extremidade bifosfatada do pr-mRNA
MT Metiltransferase, adiciona CH3 ao GMP na posio 7
Associada RNA polimerase mas dissocia-se quando
reconhece a sequncia AAUAAA (antes do local de
CPSF clivagem) e cliva o percursor do mRNA funcional.
constitudo por 4 protenas.
Uma das proteinas que constituem a CPSF.
CPSF-73 Liga-se diretamente ao local de clivagem
Dependente de zinco
Liga-se a uma regio rica em GU abaixo do local de
CstF ligao da CPSF.
Necessria clivagem
CF1 e CF2 Estabilizam o complexo da poliadenilao e ajudam na
ligao
PAP PolyA polymerase catalisa a poliadenilao adicionando
adenosina
PABII Liga-se nova cadeia polyA e aumenta a afinidade
PAP
Small nuclear RNA constituinte do spliceossoma (tem 5
snRNA U1,U2,U3,U4 e U5).
Quando associados a ribonucleoprotenas formam o
complexo RNA-protena-snRNA
Ribozima Produzida por intres do grupo I e II (estruturalmente
anlogos aos snRNAs)
Splicing silencers Locais onde as protenas repressoras de splicing se
(SS) ligam, diminuindo a probabilidade daquele local ser
usado como local de clivagem.
Splicing enhancers Locais onde as protenas ativadoras se ligam.
(SE) A maior parte so SR protenas
ISS Intron splicing silencers (SS localizados no intro)
ESS Exon splicing silencers (SS num exo vizinho)
hnRNP Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins (a maior parte
dos SS)
ISE SE no intro
ESE SE num exo vizinho
RNAse P Remove o terminal 5 do tRNA
CCA Sequncia junto extremidade 3 do tRNA, qual se liga
o aminocido
NTS Nontranscribed spacer separam as unidades de
transcrio que codificam para o rRNA
snoRNA Small nucleolar RNA que guiam as endo e exonucleases
essenciais ao processamento de rRNA
DGCR8 Protena nuclear que reconhece a dupla cadeia de pr---
miRNA
Drosha Enzima associada DGCR8 que cliva o miRNA
formando um microprocessor complex
Dicer Enzima que cliva o pr-miRNA formando RNA maduro

BIOQUMICA DA SNTESE PROTEICA


TRADUO
Aminoacil-tRNA Aminocido + CCA
Aminoacil-tRNA Enzima que medeia a formao do aminoacil-tRNA
sintetase
Aminoacil-AMP Aminocido + AMP (a.a ativado pela aminoacil-tRNA
sintetase)
Peptidil transferase Enzima da subunidade maior do ribossoma que medeia
a transferncia do a.a do tRNA para a cadeia
polipptidica
Complexo Cap- Complexo que se liga extremidade 5 do mRNA de
binding forma a adapt-lo para os pasos seguintes da iniciao
da traduo
EF-T1 Fator de elongao que participa na formao do
complexo ternrio
EF-2 EF que se liga ao local A e desloca o tRNA para a posio
P do ribossoma
(procariotas)
Sequncia de Local de ligao do mRNA subunidade 30S do
Shine-Dalgarno ribossoma, fica localizado acima do codo de iniciao
Fenilmetionina Aminocido de iniciao
EF-tu EF que participa na formao do complexo ternrio
EF-G EF que se liga ao local A e desloca o tRNA para a
posio P do ribossoma
miRNA
ssmiRNA Single stranded miRNA
Drosha Transforma o pri-miRNA em pr-miRNA juntamente com
a DGCR58
Exportin-5 Transporta o pr-miRNA do ncleo para o citoplasma
Enzima que cliva o pr-miRNA formando miRNA de
Dicer cadeia dupla juntamente com outras protenas -
argonautes
miRISC miRNA-induced silecing complex o complexo que atua
no mRNA
UTR Unstranslated region
siRNA Small interference RNA
iRNA RNA interference
Anti-miRNA Impede a ao excessiva do miRNA
miRNA mask Atua como protector mascarando o sitio de ligao do
miRNA bloqueando a sua funo
miRNA sponges Cria vrios stios de ligao artificiais de miRNA
miRNA mimics Introduo de double stranded miRNA mimetics,
equivalente ao Dicer endgeno e anlogo
estruturalmente ao siRNA

Direcionamento e degradao de protenas

Furina Endonuclease que atua em precursores de protenas, por


exemplo, de proalbumina a albumina
Endoproteases que atuam em protenas reguladoras
PC2 e PC3 destinadas secreo, por exemplo, de pr-insulina a
insulina
Carbopeptidase Remove sequncias de dois aminocidos bsicos
consecutivos no C-terminal de um polipptido
Dogma de Sequncia de aminocidos que codifica para o estado
Anfinsen nativo de uma protena
Protenas que medeiam o processo de folding impedindo
Chaperones que a protena se torne disfuncional.
Tambm so chamados heat shock proteins por
resistirem a elevadas temperaturas
Endopeptidase Enzimas que quebram qualquer ligao peptdica
Exopeptidase Enzimas que quebram ligaes peptdicas no C-terminal
ou no N-terminal do pptido
E1 Enzima ativadora de ubiquitina
Enzima conjugadora de ubiquitina, existem 10 isoformas
E2 que apresentam especificidade em relao funo da
ubiquitinao
E3 Ubiquitina protena ligase, catalisa uma ligao entre a
lisina da protena alvo e o C-terminal da ubiquitina
RP Protena reguladora que se associa a protenas
poliubiquinadas e unidades proteossmicas especficas
DUB Deubiquintinylating enzymes reciclam a ubiquitina
CP Core particule proteassome, onde ocorre clivagem da
protena defeituosa
Ornitina Quando preoteolisada e associada antienzima do seu
descarboxilase inibidor no precisa de estar ubiquinada para ser
reconhecida pelo proteossoma
Complexo 20 pan Equivalente nos procariontes ao proteossoma 26S
c-fos e c-Myc Exemplos de protenas que so degradadas pela via da
ubiquitina-proteossoma
Regulador da transcrio que ativado quando a
protena inibidora Ik.
Pode ser ativada por sinais extracelulares que ativam o
complexo I-kb quinase que fosforila dois resduos serina
NF-kb no N-terminal. Quando Ik-b est fosforilada
ubiquitinada e degradada pelo proteossoma. Quando
esta removida revela locais de ligao ao ncleos nas
subunidadades p50 e p60 da Nk-kb que entra no ncleo,
liga-se a sequncias especificas de DNA e regula a
transcrio

ORGANIZAO E FUNCIONAMENTO CELULAR


Sinalizao Celular
GRB2 Protena adaptadora que se liga fosfotirosina especifica
(recetores RTK e MAPK) pelo seu domnio SH2
SH3 Domnio pelo qual a GRB2 se liga protena SOS
SOS Protena que atua como fator de troca de nucletidos de
guanina
Rodopsina Foto recetor dos bastonetes constituda por 11-cis-retinal
e opsina.
Meta rodopsina II Ou rodopsina ativada aps absoro de luz que
transforma cis-retinal neste intermdio
All trans retinal Componente final, aps dissociao, da meta rodopsina
II
Transducina Protena envolvida na viso
Arrestina Em casos de intensa luminosidade liga-se opsina
fosforilada e impede a ativao da transducina
Morte Celular
DISC Death inducing signalling complex envolvido na via
extrnseca da apoptose
ICAD Inibidores de apoptose
PARP Desregulao da atividade da protena
Bcl-2
BH1 e BH2 Formao de canais inicos
BH3 Regula a morte celular
BH4 Confere a atividade anti-apopttica

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