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Captulo 2: A QUMICA DA VIDA

2.1 Propriedades e funes das biomolculas

Todo organismo vivo precisa sintetizar os compostos qumicos necessrios para


operar, manter e reproduzir as clulas de que est constitudo. Nesta unidade sero
estudadas as quatro principais classes de macromolculas predominantes nas clulas:
lipdios, carboidratos, cidos nucleicos e protenas. Conhecer suas propriedades
fsico-qumicas, bem como suas funes e utilidades de crucial importncia para
entender o complexo funcionamento das clulas e para projetar racionalmente
processos em que participam clulas vivas como agentes de transformao qumica. A
participao de outros 20 elementos qumicos normalmente presentes em menores
quantidades nas clulas tambm ser abordada.

2.2 De simples precursores a polmeros complexos

At o sculo XIX acreditava-se que os animais continham uma Fora Vital animus.
Uma fora intimamente ligada ao corpo fsico, com a propriedade de transmitir vida
matria inerte.

Hoje sabe-se que os seres vivos so totalmente controlados pelas leis da qumica e da
fsica. A qumica da vida , de fato, muito particular segundo quatro principais
aspectos:

1) Ela baseada principalmente em compostos de carbono, cujo estudo conhecido


como qumica orgnica.

2) Ela depende quase que exclusivamente das reaes qumicas que ocorrem em
solues aquosas dentro de uma faixa de temperatura relativamente estreita, qual a
Terra submetida.

3) Ela normalmente complexa, mesmo os mais simples organismos tm uma


qumica muito mais complexa que qualquer outro sistema reacional feito pelo homem.

4) Ela dominada e coordenada por macromolculas, formadas por subunidades de


compostos qumicos ligados entre si, com propriedades especficas que permitem o
desenvolvimento, reproduo e manifestao de todos os comportamentos
caractersticos da vida.
As clulas vivas so constitudas por molculas de alto peso molecular, assim como,
lipdeos, polissacardeos, cidos nucleicos e protenas que constituem a maior poro
dos elementos estruturais de uma clula viva. Por exemplo, uma tpica parede celular
bacteriana composta por polissacardeos, protenas e lipdeos, enquanto o
citoplasma contm protenas, principalmente, na forma de enzimas. Organismos
eucariotos possuem ncleo que ocupado predominantemente por cidos nucleicos,
sobretudo na forma de DNA. Alm destas macromolculas, as clulas contm outros
metablitos na forma de sais inorgnicos (Ex. NH4+, PO4-3, K+, Ca+2, Na+, SO4-2),
metablitos intermedirios (piruvato, acetato, entre outros) e vitaminas. A composio
elementar de uma clula tpica bacteriana apresentada na Figura 2.1.

3% 1% 4% Carbono 50%
8%
Oxignio 20%
Nitrognio 14%
14% 50% Hidrognio 8%
Fsforo 3%
Enxofre 1%
20%
demais 4%

Figura 2.1 Composio qumica bacteriana.

A interao entre as macromolculas bem complexa. Cada macromolcula


desempenha funes diferentes dentro do seu microambiente exclusivo. A
transferncia de informao de uma organela para outra, por exemplo, do ncleo para
o ribossomo, mediada por molculas especiais no caso, pelo RNA mensageiro.

A maioria das enzimas e metablitos intermedirios est dispersa no citoplasma das


clulas. Contudo, essas substncias podem estar presentes em algumas organelas,
como por exemplo, na mitocndria. As clulas vivas podem ser visualizadas como um
reator complexo em que ocorrem mais de 2.000 reaes. Essas reaes (vias
metablicas) so inter-relacionadas e controladas de forma complexa, formando
redes. Apesar de toda a complexidade dos sistemas biolgicos, a compreenso de tais
sistemas pode ser simplificada a partir da anlise em diversos nveis diferentes: nvel
molecular (biologia molecular e bioqumica), nvel celular (biologia celular e
microbiologia), nvel populacional (microbiologia e ecologia) e em nvel de produo
(Engenharia Bioqumica). A seguinte sesso principalmente dedicada
compreenso das estruturas e funes das molculas biolgicas.
2.3 Lipdios, Gorduras e Esteroides

Lipdios so compostos biolgicos apolares, hidrofbicos, ou seja, insolveis em gua,


mas solveis em compostos no polares como benzeno, clorofrmio e ter.
Geralmente esto presentes em fases biolgicas no aquosas, como nas membranas
plasmticas das clulas. Gorduras so lipdios que servem como reserva biolgica de
energia. Lipoprotenas e lipopolissacardeos so outros tipos de lipdeos, que
aparecem nas membranas celulares. As clulas podem alterar sua composio de
lipdeos das membranas para compensar (ao menos em parte) as mudanas na
temperatura, ou para aumentar sua tolerncia a agentes qumicos como etanol.

Alguns dos lipdios mais abundantes so os cidos graxos, que so formados por
hidrocarbonetos de cadeia longa (hidrofbicos), com um grupo carboxila no final
(hidroflico). Um cido graxo tpico pode ser representado por:

CH3 - (CH2)n COOH

O valor de n geralmente entre 12 e 20. cidos graxos podem ser classificados como
saturados ou insaturados. Os saturados so aqueles isentos de duplas ligaes em
sua estrutura, j os insaturados contm duplas ligaes em sua composio, como o
cido oleico representado abaixo:

cido oleico: CH3 (CH2)7 HC = CH (CH2)7 - COOH

A lista com os cidos graxos mais comuns mostrada na Tabela 2.1. A cadeia de
hidrocarbonetos de um cido graxo hidrofbica (insolvel em gua), mas o grupo
carboxila hidroflico (solvel em gua). Gorduras so steres de cidos graxos com
glicerol. A formao de uma molcula de gordura pode ser representada segundo a
reao representada na Figura 2.2.

As membranas biolgicas so compostas basicamente por fosfolipdios. H duas


classes de fosfolipdios: os fosfoglicerdeos (constitudos por glicerol) e os
esfingofosfolipdios (constitudos por esfingosina). Os fosfoglicerdeos tm uma
estrutura semelhante das gorduras, com uma nica diferena, o cido fosfrico
substitui o cido graxo e esterificado a glicerol. Os esfingolipdios contm ceramida,
que uma molcula formada pela unio de dois cidos graxos com uma serina.

Outra classe de lipdios que tem uma grande importncia tecnolgica so os


Tabela 2.1 Exemplos de cidos graxos mais comuns

poliidroxialcanos. O polmero poliidroxibutirato (PHB), por exemplo, hoje sendo


produzido em larga escala pela indstria de acar de cana no Brasil, pode ser usado
para formar uma folha polimrica limpa e biodegradvel, utilizada na gerao industrial
de novas fibras txteis sintticas. Em algumas clulas o PHB est relacionado com a
reserva energtica.

Figura 2.2. Equao para a formao de uma molcula de gordura.


Existe atualmente grande interesse na obteno de vitaminas mediante processos
microbianos, entre as quais se encontram as protenas lipdicas A, E, D e K, todas
consideradas essenciais para crianas e adultos.

Esteroides tambm podem ser classificados como lipdios. Esteroides ocorrem


naturalmente como alguns hormnios, que so importantes reguladores do
desenvolvimento animal e do metabolismo quando em concentraes muito baixas
(por exemplo, 10-8 M). Um esteroide muito conhecido o colesterol, e est inserido
entre os fosfolipdios nas membranas de tecidos animais. A Figura 2.3 mostra a
estrutura de alguns esteroides importantes. A cortisona um anti-inflamatrio usado
para tratar artrite reumatoide e algumas doenas da pele. Derivados do estrgeno e
progesterona so utilizados como contraceptivos. A produo comercial de esteroides
muito importante e depende da utilizao de processos microbianos. Devido ao
grande nmero de centros assimtricos (carbonos quirais), a sntese completa de um
esteroide difcil. As plantas so uma fonte abundante de lipdios precursores destes
esteroides, mas no capazes de converter estes precursores em compostos similares
queles produzidos na glndula adrenal nos animais. Isto no pode ser realizado
facilmente por vias qumicas e produzido comercialmente utilizando-se
microrganismos que contm enzimas mediando reaes especficas de hidroxilao
ou desidrogenao.

Figura 2.3 Exemplo de esterides importantes produzidos atravs de bioprocessos


microbianos. A numerao bsica dos tomos de carbono tambm so mostradas.
2.4 Carboidratos: Mono e Polissacardeos

Os carboidratos so as biomolculas mais abundantes na natureza e desempenham


uma funo-chave no interior da clula: fornecimento de energia e formao de
componentes estruturais. Eles tambm tm um papel crtico na regulao da
sinalizao qumica em plantas e animais. Os carboidratos so formados por carbonos
hidratados, ou seja, carbonos ligados a hidrognios, de onde vem o nome
carboidratos. So representados pela frmula geral (CH2O)n, onde n 3, e
sintetizados por meio da fotossntese (Figura 2.4). Os animais no so capazes de
sintetizar carboidratos, por isso, precisam alimentar-se de vegetais para a obteno
desses compostos.

Figura 2.4 Sntese de carboidratos a partir do processo de fotossntese.

Pelo processo da fotossntese, o gs CO2 e a H2O so convertidos em acares na


presena da luz solar e so, ento, polimerizados para a produo de polissacardeos
com funo estrutural (celulose) e de armazenamento (amido). Nestes polissacardeos
so acumulados 1018 kcal por ano, correspondente a 0,1 % da energia solar anual
incidente sobre a terra. Finalmente, a maior parte dessa energia qumica liberada na
respirao celular para atender a demanda energtica dos organismos vivos aerbios.

Monossacardeos so os menores carboidratos existentes, compostos por trs (triose)


a nove (nanose) tomos de carbono. A D-glicose, o ismero tico que rota a luz
polarizada na direo +, um monossacardeo com seis tomos de carbono (hexose),
como vrios outros acares simples frequentemente encontrados em sistemas
biolgicos (vide Tabela 2.2). Monossacardeos so classificados como aldedos
(aldoses) ou cetonas (cetoses). A D-glicose, por exemplo, uma aldohexose.
A D-glicose pode ser encontrada na forma estrutural linear ou anelar. Em soluo
aquosa, normalmente, predominam as formas anmericas e da D-glicose, estando
a forma linear presente em pequenas quantidades (vide Figura 2.5). O ismero tico L-
glicose pouco encontrado na natureza e, portanto, desempenha um papel de menor
importncia dentro dos sistemas biolgicos.
Figura 2.5. Estruturas linear e anelada da glicose. Note que a posio do grupo OH no
carbono 1 define se a ligao tipo ou . A nomenclatura mostrada nesta figura
obedece uma conveno internacional.

Um grupo particularmente importante dos monossacardeos so as riboses e


desoxirriboses (Figura 2.6). Estas so molculas formadas por cinco carbonos em
estrutura anelar e componentes essenciais na estruturao do DNA e do RNA.

Dissacardeos so formados pela condensao (unio) de dois monossacardeos. Por


exemplo, a maltose, formada pela unio de duas molculas de glicose via ligao
glicosdica, realizada entre dois carboidratos (Figura 2.7).

Figura 2.6 Estruturas dos acares ribose e desoxirribose.

Figura 2.7 Formao da maltose pela unio de duas molculas de glicose por uma
ligao glicosdica -1,4.
A sacarose, por sua vez, um dissacardeo formado pela juno de uma molcula de
D-glicose com uma D-frutose e a lactose, resultado da ligao de uma D-glicose com
uma D-galactose. A Figura 2.8 mostra as caractersticas estruturais dessas duas
molculas.

Figura 2.8 Estrutura dos dissacardeos sacarose com ligao glicosdica -1,4 e
lactose com ligao glicosdica -1,4.

A lactose pode ser encontrada no leite, enquanto a sacarose o principal acar


encontrado em plantas. A procura de uma soluo para o descarte do soro como
rejeito das indstrias de laticnios continua sendo um importante desafio biotecnolgico
para evitar que se transforme num agente poluidor e que possa ser utilizado na
gerao de produtos qumicos com maior valor agregado. A sacarose e os produtos de
sua hidrlise enzimtica, mais conhecidos como acar invertido, formam uma
mistura equimolar de glicose e frutose, sendo conhecidos como um dos carboidratos
mais consumidos pelo ser humano no mundo inteiro. Alm disso, diversas fontes
destes carboidratos na indstria de acar so utilizadas como matria primas para a
produo de etanol pela via fermentativa.

Polissacardeos so formados pela condensao de mais de dois monossacardeos


tambm por meio de ligaes glicosdicas. O processamento industrial dos
polissacardeos promove o extensivo uso de processos enzimticos.

A amilose formada por uma longa cadeia de molculas de glicose unidas por
ligaes glicosdicas -1,4 (vide Figura 2.9). O peso molecular (MM) da amilose fica
entre vrios milhares e meio milho de daltons. A amilose caracterizada por ser
insolvel em gua e constitui cerca de 20% de uma molcula de amido, considerado o
material alimento reserva nas plantas.
Figura 2.9 Estrutura qumica da amilose.

A amilopectina uma cadeia ramificada de molculas de D-glicose como mostra a


Figura 2.10. A ramificao acontece entre o grupo OH glicosdico de uma das
cadeias e o carbono 6 de outra cadeia, formando a ligao glicosdica -1,6.

Figura 2.10 Estrutura qumica da amilopectina.

A molcula de amilopectina muito maior que a amilose, com MM variando de um a


dois milhes de daltons. A amilopectina uma molcula hidrossolvel. Com a hidrlise
parcial do amido (cida ou enzimtica) tem-se a separao de molculas de glicose,
maltose e dextrinas, as quais so pores das ramificaes da amilopectina.
Dextrinas, misturas de polissacardeos de baixa MM, so utilizadas na indstria como
agentes espessantes.

O Glicognio, o reservatrio de glicose nos animais, composto por cadeias


ramificadas de molculas de glicose, assemelhando-se a amilopectina. A molcula de
glicognio altamente ramificada e contm cerca de doze unidades de glicose
dispostas em segmentos de cadeias retas. A MM tpica de uma molcula de glicognio
menor que 5x106 Da.

A celulose, o maior componente estrutural das plantas, uma molcula longa,


formada por cadeias no-ramificadas de D-glicose e possui MM entre 50.000 e um
milho de daltons (vide Figura 2.11). o composto orgnico mais abundante na terra.
Algodo e madeira so dois exemplos de materiais ricos em celulose. As ligaes em
cadeia entre os monmeros de glicose so chamadas de ligaes glicosdicas -1,4.

Figura 2.11. Estrutura qumica da celulose.

A ligao glicosdica -1,4 resistente hidrlise enzimtica. Apenas alguns


microrganismos so capazes de hidrolisarem este tipo de ligao existente na
celulose. A ligao glicosdica -1,4 encontrada na molcula de amido ou glicognio
relativamente fcil de ser quebrada pela ao enzimtica ou cida. A grande
dificuldade que a celulose apresenta para a degradao se deve mais a sua estrutura
cristalina e ao grau de empacotamento de suas fibras do que dificuldade de romper
as ligaes glicosdicas -1,4. A eficiente hidrlise da celulose continua sendo um dos
maiores problemas tecnolgicos nas tentativas de converter os abundantes resduos
de celulose em biocombustveis ou produtos qumicos.

2.5 cidos Nuclicos

cidos nuclicos participam de forma fundamental na replicao e manuteno das


clulas. cidos desoxirribonuclicos (DNA) armazenam e preservam a informao
gentica de um indivduo. J os cidos ribonuclicos (RNA) participam da sntese de
protenas. Ambos, DNA e RNA, so grandes polmeros formados a partir de seus
monmeros (nucleotdeos) correspondentes.

Nucleotdeos so os blocos que constroem o DNA e o RNA e ainda servem como


molculas de reserva energtica, em casos de extrema escassez de carbono e
agentes redutores (Ex. NAD). Os nucleotdeos so compostos basicamente por: um
grupo fosfato, uma pentose (ribose ou desoxirribose), e uma base nitrogenada (purina
ou pirimidina). A Figura 2.12 mostra a estrutura dos nucleotdeos e as bases purinas e
pirimidinas. Existem dois tipos de purinas presentes nos nucleotdeos a adenina (A) e
guanina (G), e as trs principais pirimidinas so timina (T), citosina (C) e uracila (U).
cidos desoxirribonuclicos (DNA) contm as bases A, T, G e C, e cidos
ribonuclicos (RNA) contm as bases A, U, G e C. O conjunto destas bases forma a
sequncia do DNA, representado na Figura 2.15, que carrega a informao gentica
necessria para a sntese de protenas a partir da formao do RNA.

(a)

(b)

Figura 2.12 (a) Estruturas de ribonucleotdeos e desoxirribonicleotdeos. (b) Cinco


bases nitrogenadas encontradas no DNA e RNA.

Na unidade seguinte iremos discutir mais detalhadamente a via dos nucleotdeos na


energtica celular. Os trifosfatos de adenosina, e com uma menor extenso os da
guanosina, so as principais moedas energticas de uma clula. As pontes de fosfato
no ATP (adenosina trifosfato) e GTP (guanosina trifosfato) so ligaes de alta energia
(vide Figura 2.13). A formao dessas ligaes de fosfato ou sua hidrlise (quebra) o
primeiro meio pelo qual a energia celular armazenada ou liberada, respectivamente.
Por exemplo, a sntese de um composto que termodinamicamente desfavorvel
pode ser acoplada a hidrlise do ATP ADP (adenosina difosfato) ou AMP (adenosina
monofosfato). Em reaes que liberam energia (por exemplo, oxidao de um acar),
a energia capturada e armazenada para a formao de uma ligao de fosfato em
uma reao acoplada onde o ADP convertido a ATP. Estes conceitos sero mais
detalhados na Unidade 4.

Figura 2.13 Estrutura qumica do ATP, ADP e AMP.

Alm disso, para utilizar o ATP no armazenamento de energia, a clula retm e libera
tomos de hidrognio, resultado das reaes biolgicas de oxidao-reduo, que
utiliza derivados de nucleotdeos. Um dos agentes redutores transportadores de
eltrons mais comuns a coenzima (a frao orgnica de uma molcula de enzima)
nicotinamida adenina dinucleotdeo (NAD), cuja estrutura mostrada na Figura 2.14.
Figura 2.14 Estrutura qumica do nucleotdeo NAD, uma das coenzimas mais
importantes como carregadora de eltrons no metabolismo celular.

Alm de ser uma via importante na energtica celular, os nucleotdeos so importantes


monmeros. Os polinucleotdeos (DNA e RNA) so formados pela condensao
(unio) de nucleotdeos. Os nucleotdeos so unidos pelos carbonos 3 e 5 dos anis
de aucares sucessivos por uma ligao fosfodister. As estruturas do DNA e RNA
so mostradas na Figura 2.15.

Figura 2.15 Estrutura da cadeia de DNA e RNA. Ligaes fosfodister so formadas


entre os tomos de carbono 3 de um nucleotdeo e o carbono 5 do nucleotdeo
seguinte.

2.5.1 DNA

O DNA uma macromolcula filamentosa (peso molecular, 2x109 Da em E.coli) e tem


uma estrutura tridimensional em dupla hlice. A sequncia das bases (purinas e
pirimidinas) no DNA carrega a informao gentica, enquanto que o acar e os
grupos fosfato tm um papel estrutural. A sequncia das bases do DNA escrita na
direo 5 3. A estrutura em dupla hlice do DNA retratada na Figura 2.16. Nesta
estrutura, as duas cadeias de polinucleotdeos helicoidais so enroladas em torno de
um eixo comum para formar o DNA dupla hlice, e as cadeias caminham em direes
opostas, 5 3 e 3 5.
As ligaes de H formadas entre os pares de bases das duas fitas do DNA provm a
estabilidade molecular. A formao do DNA a partir de outro segmento de DNA
original conhecida como replicao. Quando segmentos de DNA so replicados,
ocorre a abertura da dupla fita de DNA permitindo que duas fitas novas
complementares a estas se formem. Portanto, a replicao do DNA
semiconservativa, como demonstrado na Figura 2.16.

Figura 2.16 Replicao semiconservativa do DNA

Algumas clulas bacterianas contm segmentos de DNA circular no citoplasma que


so chamados de plasmdeos. Plasmdeos so segmentos de DNAs no-
cromossomais, autnomos e auto-replicativos, ocorrem naturalmente podem e
codificar fatores que protegem a clula contra antibiticos ou compostos qumicos
txicos. Os plasmdeos so facilmente retirados de sua clula original e
posteriormente introduzidos em novas clulas. Devido a esta caracterstica so
frequentemente utilizados para engenharia gentica.

2.5.2 RNA

A principal funo do DNA carregar a informao gentica nas sequncias das


bases. A informao gentica do DNA precisa ser transcrita para molculas de RNA a
fim de serem traduzidas na sntese proteica. Os moldes para sntese do RNA so
molculas de DNA, e as molculas de RNA so moldes para a sntese de protenas. A
formao de molculas de RNA a partir do DNA conhecida como transcrio, e a
formao de peptdeos e protenas a partir do RNA chamada de traduo.

Certas molculas de RNA tem a funo de intermedirios no transporte da informao


gentica durante a sntese proteica (RNA mensageiro, m-RNA), visto que outras
molculas de RNA [transportador (t-RNA) e ribossonal (r-RNA)] fazem parte da
maquinaria de sntese proteica. Ao contrrio das molculas de DNA, que ficam no
ncleo das clulas eucariontes, a maior parte do RNA est localizada no citoplasma
(m-RNA e t-RNA). O RNA ribossomal (r-RNA) est localizado nos ribossomos que so
pequenas partculas feitas de protena e RNA (descritos com mais detalhes na
Unidade 1).

RNA uma macromolcula longa, no ramificada, que consiste de nucleotdeos


ligados por ligao fosfodister no sentido 3 5. Uma molcula de RNA pode conter
de 70 a alguns milhares de nucleotdeos. Molculas de RNA geralmente so de fita
simples, exceto alguns RNAs virais. Contudo, certas molculas de RNA contm
regies de hlice dupla, como voltas de grampo (hairpin loops). A Figura 2.17
descreve a estrutura em forma de trevo do t-RNA (RNA transportador). A formao
complementar nos seguimentos de RNA ocorre de maneira um pouco diferente da
ocorrida no DNA. Desse modo a base nitrogenada A pareia com U e G pareia com C.
A quantidade de RNA na clula geralmente de duas a seis vezes maiores do que a
quantidade DNA.

Existem vrios tipos de RNA numa clula como se descreve a seguir.

a) RNA mensageiro (m-RNA) sintetizado no ncleo e carrega a informao


gentica do cromossomo para a sntese de certa protena at os ribossomos
Figura 2.17 Estrutura do RNA transportador.

que esto no citoplasma. O m-RNA uma grande molcula com uma meia-
vida curta.
b) RNA transportador (t-RNA) uma molcula relativamente pequena e estvel
que transporta aminocidos especficos do citoplasma para o stio de sntese
proteica nos ribossomos. O t-RNA contm de 70 a 90 nucleotdeos e tem seu
peso molecular em torno de 23 a 28 kDa. Cada um dos 20 aminocidos tem
pelo menos um t-RNA correspondente.
c) RNA ribossomal (r-RNA) o principal componente dos ribossomos,
constituindo aproximadamente 65% do ribossomo. O restante composto de
protenas ribossomais.

Todo o complexo sistema de transmisso e traduo de informao que se originou na


molcula de DNA conduz um resultado final que consiste numa molcula de
protena, cujas caractersticas e funes sero estudadas a seguir.

2.6 Aminocidos e Protenas


As protenas so as molculas orgnicas mais abundantes dentro de uma clula viva,
compreendendo cerca de 40 a 70% da massa seca total da clula. Protenas so
polmeros feitos a partir de monmeros, os aminocidos. Tipicamente, elas possuem
massa molecular maior que 6.000 Da, podendo chegar a um milho de Da. Os
aminocidos so como blocos para a construo das protenas. Eles so compostos
de pelo menos um grupo carboxila (-COOH), de caracterstica cida, um grupo amina
(-NH2), de caracterstica bsica, e um grupo R ou cadeia lateral, composto por carbono
e hidrognio, que o que difere de um aminocido para o outro (vide Figura 2.18).

Figura 2.18 Estrutura geral de um aminocido.

De acordo com as funes biolgicas exercidas, as protenas podem ser classificadas


dentro de cinco principais categorias:

1. Protenas Estruturais: glicoprotenas, colgeno, queratina.

2. Protenas Catalticas: enzimas.

3. Protenas Transportadoras: hemoglobina, albumina de soro.

4. Protenas Regulatrias: alguns hormnios, insulina e fatores de crescimento

5. Protenas Protetoras: anticorpos, trombina.

Uma forma simples de classificar as protenas baseada na sua configurao


espacial, podendo ser fibrosas ou globulares, como mostra as Figuras 2.19 e 2.20.
Figura 2.19 Protenas fibrosas

Figura 2.20 Protenas globulares

Como dito anteriormente os blocos de construo das protenas so os aminocidos.


Eles podem ser classificados em no essenciais, ou seja, aqueles que so produzidos
pelo prprio organismo, e essenciais, aqueles que o organismo no capaz de
sintetizar e que, portanto necessitam ser ingeridos. Existem 22 tipos de aminocidos
diferentes, porm 20 deles so encontrados mais comumente. Os aminocidos so
diferenciados com base nas cadeias laterais (grupo R), ou seja, o grupo que est
ligado ao carbono-, ou carbono quiral (Figura 2.21). O carbono- definido como
aquele associado a quatro substituintes (ligantes) diferentes, dispostos segundo os
vrtices de um tetraedro, formando, assim um centro quiral.
Figura 2.21 Representao do centro quiral de um aminocido.

O carbono- encontrado em todos os aminocidos, com exceo da glicina. Os


aminocidos mais comumente encontrados nas protenas esto listados na Tabela
2.3. Os aminocidos so opticamente ativos e ocorrem em duas formas isomricas, L
(levogiro desvio da luz polarizada incidente para a esquerda) ou D (dextrogiro
desvio da luz polarizada incidente para a direita) (Figura 2.22). Substncias D e L
encontram-se em rotaes espaciais diferentes, mas apresentam propriedades
qumicas e fsicas idnticas. So denominadas estereoismeros.

Tabela 2.3 Lista dos vinte aminocidos encontrados nas protenas

Apenas os L-aminocidos so encontrados nas protenas, os D-aminocidos so


muito raros na natureza, podendo ser encontrados apenas na parede celular de alguns
microrganismos e em alguns antibiticos.
Figura 2.22 Aminocidos com centro quiral so opticamente ativos.

Os grupos cidos (-COOH) e bsicos (-NH2) de aminocidos podem se ionizar em


soluo aquosa. O aminocido carregado positivamente (ction) a baixo pH e
negativamente carregado (anion) a pH alto. Num pH intermedirio o aminocido
funciona como um on dipolar ou zwitterion, com carga total neutra. Molculas
dipolares (vide Figura 2.23) so chamadas de dipolo.

Figura 2.23 Dipolo num aminocido

O valor do pH em que o aminocido possui carga neutra chamado de ponto


isoeltrico (pI), e varia de acordo com o grupo-R do aminocido. Em seu ponto
isoeltrico, um aminocido incapaz de migrar sob influncia de um campo eltrico e
sua solubilidade mnima. Estas propriedades dos aminocidos permitem a utilizao
de tcnicas para sua separao e purificao como: troca inica, eletrodilise
eletroforese.

2.6.1 Estrutura das Protenas

Como j foi visto, as protenas desempenham mltiplas funes nos organismos vivos.
Isto se deve em grande parte diversidade de formas que essas molculas podem
adotar. A reao de condensao entre dois aminocidos resulta na formao de um
peptdeo por meio de uma ligao peptdica. A Figura 2.24 mostra um exemplo de
uma ligao peptdica.
Figura 2.24 A ligao peptdica ocorre com a unio de dois aminocidos e a liberao
de uma molcula de gua.

A ligao peptdica uma ligao plana. Os polipeptdios so formados por dois ou


mais aminocidos ligados. Os polipeptdios so compostos por no mximo 50
aminocidos, sequncias maiores que 50 so denominados protenas. Muitas
protenas possuem, alm de aminocidos, componentes orgnicos e inorgnicos.
Estes componentes so conhecidos como grupos prostticos e as protenas que
apresentam tais grupos so nomeadas como protenas conjugadas. A estrutura
tridimensional geral de uma protena pode ser descrita sob quatro diferentes nveis
como demonstrado na Figura 2.25.

Figura 2.25 Diferentes nveis da estrutura tridimensional de uma protena.


1. Estrutura Primria: formada por uma sequncia linear de aminocidos. Cada
protena tem uma composio definida de aminocidos com uma sequncia nica. A
sequncia de aminocidos tem profundo efeito na formao da estrutura tridimensional
e consequentemente na funo exercida pela protena em questo.

2. Estrutura Secundria: se refere forma em que se estende a cadeia


polipeptdica no espao como resultado de pontes de hidrognio entre os resduos
(aminocidos) mais prximos entre si na sequncia linear. Os dois principais tipos de
estruturas secundrias so -hlice e folha-. Em uma estrutura em -hlice, as
ligaes de hidrognio ocorrem entre o grupo -carboxila de um resduo e o grupo-NH
do aminocido vizinho, como mostrado na Figura 2.26.

A estrutura em tripla hlice presente no colgeno consiste em trs -hlices


entrelaadas em uma super-hlice, o que confere ao colgeno uma estrutura rgida e
resistente ao tensionamento (estiramento). A estrutura -helicoidal facilmente
rompida devido fraqueza das ligaes de hidrognio. Contudo, a estrutura em folhas-
como as da protena da seda mais estvel. As ligaes de H entre as cadeias
paralelas estabilizam as estruturas em folhas e promovem a flexibilidade e
resistncia tenso (Figura 2.27) como na protena da seda. Uma transformao de
-hlice para folha acontece quando a protena da l tratada com vapor e
tensionamento na indstria txtil. O mesmo acontece quando a protena da soja
texturizada ou torcida atravs do processo de extruso na indstria de alimentos
para se assemelhar protena da carne.

Figura 2.26 Estrutura -hlice de uma protena fibrosa.


Figura 2.27 Representao de uma folha- pregueada antiparalela. As linhas
pontilhadas indicam as ligaes de H entre os vrtices.

3. Estrutura terciria: resultado das interaes entre os gruposR largamente


separados ao longo da cadeia. As flexes ou dobraduras da cadeia de aminocidos
(estrutura secundria) induzidas pela interao dos gruposR determinam a estrutura
terciria das protenas. Os gruposR podem interagir por ligaes covalentes
dissulfeto, ou de hidrognio. Interaes hidrofbicas e hidroflicas tambm podem
estar presentes entre os gruposR. As ligaes covalentes dissulfeto podem conectar
duas cadeias polipeptdicas (Ex: insulina) sendo tambm importantes para a flexo
adequada da cadeia. A estrutura terciria de uma protena possui profundo efeito em
sua funo. Mudanas de pH, tenso inicas, forcas fsicas e adio de compostos
orgnicos afeta o ambiente que rodeia uma protena e modifica sua estrutura terciria.

Outra questo importante na arquitetura conformacional das protenas so as pontes


covalentes de enxofre que frequentemente se formam entre dois resduos de cistena
presentes na macromolcula. Um caso simples que ilustra bem a importncia e funo
desse tipo de ligao o da insulina Este hormnio est constitudo por uma cadeia
de 21 peptdeos ligada a outra de 30 peptdeos atravs duas pontes de enxofre. A
cadeia menor tambm possui uma ponte de enxofre Estas ligaes funcionam como
grampos que mantm fortemente ligadas as duas cadeias conferindo a estabilidade e
funcionalidade que o hormnio tanto precisa num organismo vivo.
A estabilidade de uma molcula de protena pode ser alterada se a mesma for exposta
a condies suficientemente diferentes as de seu ambiente natural. A consequncia
disto uma mudana na estrutura dessa molcula conhecida como desnaturao, o
que pode causar uma perda de sua atividade ou funo. Pequenas mudanas de
temperatura, pH ou tenso inica, por exemplo, podem causar desnaturao da
protena. Em alguns casos o restabelecimento da condio modificadora inicial pode
fazer com que a protena recupere sua estrutura e funo normal. Esta reversibilidade
do processo chamada de renaturao.

4. Estrutura quaternria: Apenas as protenas com mais de uma cadeia


polipeptdica possuem estrutura quaternria. As interaes entre as cadeias
polipeptdicas determinam a estrutura quaternria. A hemoglobina, por exemplo,
constituda por quatro subunidades ou monmeros, e as interaes entre as
subunidades o que determina a estrutura quaternria da molcula. As foras
geradas pela ligao entre as cadeias polipeptdicas podem provir das ligaes
dissulfeto ou de vrias ligaes fracas. A subunidade (monmero) de uma enzima tem
um papel importante no controle de sua atividade enzimtica. A hemoglobina um
exemplo de protena conjugada e possui quatro grupos-heme, que so complexos de
ferro organometlicos (Figura 2.28).

Figura 2.28 Estrutura da protena hemoglobina composta por quatro subunidades e


quatro grupos-heme.

Fazendo uma anlise global da relao entre estrutura e funo de uma protena vista
nos ltimos pargrafos importante destacar que, do ponto de vista de processos
bioqumicos, o engenheiro pode operar processos enzimticos e celulares apenas
num intervalo bastante estreito de pH, temperatura e ambiente inico. Isto tambm
vale para os processos de biosseparao, purificao envolvendo molculas de
natureza proteica.

2.6.2 Enzimas
As enzimas representam a maior classe de protenas existentes, com mais de 8.000
tipos diferentes. As enzimas so molculas altamente especficas em suas funes e
possuem um extraordinrio poder cataltico (capaz de promover a acelerao das
reaes qumicas). Cada molcula enzimtica contm um stio ativo onde substratos
especficos permanecem ligados durante o processo de catlise. As enzimas podem
ser agrupadas em classes de acordo com sua funo catalisadora, ou seja, por
catalisar reaes semelhantes (ver unidade 3). Cada tipo de enzima altamente
especfica, catalisando apenas um nico tipo de reao.

2.6.3 Anticorpos

Anticorpos so protenas produzidas pelo sistema imunolgico em respostas s


molculas estranhas que entram no organismo. So capazes de ligar-se de maneira
extremamente forte s partculas moleculares ou parcelas de molculas maiores
(macromolculas) com alto grau de especificidade. Anticorpos (Ac) aparecem no soro
sanguneo e em certas clulas de defesa de organismos vertebrados em respostas a
macromolculas estranhas. A macromolcula estranha chamada de Antgeno (Ag).
Molculas especficas de anticorpos so combinadas com antgenos para a formao
de um complexo antgeno-anticorpo (Ag-Ac). Este complexo Ag-Ac o que chamamos
de resposta imune. Alm de sua importncia clnica, os anticorpos tambm so
importantes para a produo de produtos industriais, em tcnicas de diagnstico,
separao e purificao de protenas. Tambm podem se tornar um elemento chave
na distribuio de algumas drogas anticncer. Os anticorpos tm emergido como um
dos mais importantes produtos da biotecnologia.

As molculas de anticorpos possuem stios de ligao especficos e complementares


parte estrutural fundamental do antgeno. As molculas de anticorpos geralmente
possuem dois stios de ligao e capaz de formar um entrelaado tridimensional de
antgenos e anticorpos distribudos de maneira alternada. Este complexo chamado
precipitina, nome derivado de seu mtodo de obteno, j que resulta da precipitao
do soro, gerando um precipitado visvel. Anticorpos so altamente especficos s
protenas estranhas, que induzem sua formao.

As imunoglobulinas constituem uma categoria de anticorpos. As cinco principais


classes de imunoglobulinas presentes no plasma sanguneo humano so: IgG, IgA,
IgD, IgM e IgE, das quais as globulinas IgG so as mais abundantes e melhor
compreendidas atualmente. As imunoglobulinas tm peso molecular equivalente a 150
kilodaltons (kDa), exceto a IgM, a qual pesa cerca de 900 kDa,

Estudos e aplicaes com o desenvolvimento de clulas para a produo de


anticorpos esto sendo objeto de interesse no mundo todo. Pesquisas recentes
levaram tambm a introspeco sobre a forma de transmitir a atividade cataltica de
anticorpos. A unio entre novas pesquisas dentro da engenharia de protenas e os
anticorpos promete o desenvolvimento de agentes catalticos extremamente
especficos.

2.7 Nutrientes celulares

A composio qumica do interior de uma clula difere grandemente do seu ambiente


externo. A clula deve seletivamente remover compostos desejveis do ambiente
extracelular e conservar outros compostos consigo mesma. A membrana
semipermevel a chave para esta seletividade. Para que a composio da clula
seja bem diferente do seu ambiente externo, a clula gasta energia de forma a manter-
se longe do equilbrio termodinmico. O equilbrio termodinmico equivalente
morte para a clula.

Todos os organismos, exceto os vrus, contm grandes quantidades de gua (cerca de


80%). Aproximadamente 50% do peso seco das clulas so protenas, e grande parte
das protenas so enzimas (protenas que agem como catalisadores vide Unidade
3). A quantidade de cidos nuclicos da clula varia entre 10% a 20% do seu peso
seco. Entretanto, os vrus podem conter mais de 50% de seu peso seco em cidos
nuclicos. Tipicamente, a quantidade de lipdeos na maioria das clulas varia entre 5%
a 15% do peso seco. Contudo, algumas clulas acumulam o polmero PHB
(poliidroxibutirato) em at 90% da massa total sobre certas condies de cultivo. Em
geral, a composio das clulas varia de acordo com o tipo e idade das mesmas, e a
composio dos nutrientes do meio. As composies tpicas para a maioria dos grupos
de organismos esto resumidas na Tabela 2.4.

Tabela 2.4 Anlises qumicas, peso seco e populao de diferentes microrganismos


obtidos em cultura.
A maioria dos produtos formados por organismos produzida como resultado de sua
resposta s condies ambientais, como nutrientes, hormnios de crescimento e ons.
As necessidades nutricionais qualitativas e quantitativas das clulas contribuem para
otimizar o crescimento celular e a formao de produtos. Os nutrientes requeridos
pelas clulas podem ser classificados em duas categorias:

1. Macronutrientes so necessrios em concentraes maiores que 10-4M. Carbono,


nitrognio, oxignio, hidrognio, enxofre, fsforo, Mg2+, e K+ so os principais
macronutrientes.

2. Micronutrientes so necessrios em concentraes menores que 10-4M. Elementos


trao, aqueles requeridos em baixssimas concentraes, como Mo2+, Zn2+, Cu2+, Mn2+,
Fe2+, Ca2+, Na+, vitaminas, hormnios de crescimento, e precursores metablicos so
os principais micronutrientes.

2.7.1 Macronutrientes

Compostos de carbono so a maior fonte de energia celular, as mais comuns em


fermentaes industriais so melao (sacarose), amido (glicose, dextrana), xarope de
milho e licor de resduos de sulfito (glicose). Em fermentaes laboratoriais, glicose,
sacarose, e frutose so as fontes de carbono mais comuns. Metanol, etanol e metano
tambm constituem fontes de carbono baratas para algumas fermentaes. Em
fermentaes aerbicas, cerca de 50% do substrato de carbono incorporado nas
clulas e cerca de 50% utilizado como fonte de energia. Em fermentaes
anaerbicas, uma grande parte do substrato de carbono convertido em produtos e
uma pequena parte convertido em massa celular.

O nitrognio constitui aproximadamente 10% a 14% da massa seca celular. As fontes


de nitrognio mais utilizadas so amnia e sais de amnio [NH4Cl, (NH4)2SO4,
NH4NO3], aminocidos, peptdeos e protenas. O nitrognio incorporado massa
celular na forma de protenas e cidos nucleicos. Alguns organismos como
Azotobacter sp. e cianobactrias fixam o nitrognio da atmosfera para formar amnio.
A ureia tambm pode ser utilizada como fonte de nitrognio por alguns organismos.
Fontes de nitrognio orgnico como extrato de levedura e peptona so caros
comparados aos sais de amnio. Algumas fontes de carbono e nitrognio utilizados na
fermentao industrial so resumidas na Tabela 2.5.

Tabela 2.5 Fontes de carbono e nitrognio utilizadas na fermentao industrial.

O oxignio est presente em todos os componentes celulares orgnicos e na gua


celular. Seus constituintes contribuem com cerca de 20% do peso seco das clulas. O
oxignio molecular utilizado como receptor final de eltrons no metabolismo aerbico
de compostos de carbono (vide Unidade 5).

O hidrognio constitui cerca de 8% do peso seco celular, e derivado primeiramente


dos compostos de carbono, como os carboidratos. Algumas bactrias, como as
metanognicas conseguem utilizar o hidrognio (proveniente do metano) como fonte
de energia.

O fsforo constitui aproximadamente 3% do peso seco das clulas, e est presente


nos cidos nuclicos e tambm em cidos teicicos da parede celular de algumas
bactrias gram-positivas. Sais de fosfato inorgnico como KH2PO4 e K2HPO4 so os
mais comuns. Glicerolfosfatos podem tambm ser utilizados como fonte orgnica de
fosfato. O fsforo um elemento chave na regulao do metabolismo celular. Os
nveis de fosfato no meio podem ser menores que 1mM para a formao de vrios
metablitos secundrios, como os antibiticos.

O enxofre constitui cerca de 1% do peso seco celular e est presente em protenas e


algumas enzimas. Sais de sulfato como o (NH4)2SO4 so as fontes de enxofre mais
comuns. Aminocidos que contm enxofre podem tambm ser utilizados como fonte.
Certos organismos auttrofos utilizam S2- e S0 como fonte de energia.
Potssio um cofator (composto orgnico ou inorgnico que acopla a enzima para
ativ-la) de algumas enzimas e utilizado no metabolismo de carboidratos. Clulas
tendem a captar K+ e Mg2+ e expulsar Na+ e Ca2+. Os sais de potssio mais comuns
so K2HPO4, KH2PO4 e K3PO4.

Magnsio tambm um cofator para algumas enzimas e est presente na parede


celular e membranas. Ribossomos requerem ons Mg2+. O magnsio usualmente
suprido como MgSO4 ou MgCl2.

A Tabela 2.6 lista os oito maiores macronutrientes e sua funo fisiolgica.

Tabela 2.7. Oito elementos macronutrientes e funes fisiolgicas no cultivo de


clulas.

2.7.2 Micronutrientes

Elementos trao so essenciais nutrio seres vivos. A carncia de elementos trao


aumenta a fase lag (o tempo entre a inoculao e a replicao ativa da clula, em
culturas in vitro) e pode diminuir a taxa de crescimento especfico e o rendimento. As
trs maiores categorias de micronutrientes so discutidas a seguir.

1. Os elementos trao mais amplamente requeridos so Fe, Zn e Mn. O ferro (Fe) est
presente na ferredoxina e no citocromo e um importante cofator. Ferro ainda age em
vias regulatrias de alguns processos fermentativos (e.g. deficincia de ferro
necessria para a excreo da riboflavina pela Ashbya gosypii e a concentrao de
ferro regula a produo de penicilina pelo Penicillium chysogenum). O Zinco (Zn) um
cofator para algumas enzimas e tambm regula algumas fermentaes como a da
penicilina. O mangans (Mn) tambm um cofator para algumas enzimas e faz a
regulao do metabolismo e a excreo de metablitos.
2. Os elementos trao necessrios sob condies especficas de crescimento so Cu,
Co, Mo, Ca, Na, Cl, Ni e Se. Cobre (Cu) est presente em certos componentes da
cadeia respiratria e enzimas. A deficincia de cobre estimula a produo de penicilina
e cido ctrico. Cobalto (Co) est presente em compostos como a vitamina B12.
Bactrias propinicas (utilizam cido propinico como fonte de energia) e algumas
metanognicas necessitam de cobalto. Molibdnio (Mo) um cofator das enzimas
nitrato redutase e nitrogenase e necessrio para o crescimento em que NO3- e N2
so as nicas fontes de nitrognio. Clcio (Ca) um cofator para as enzimas amilases
e algumas proteases, e ainda est presente em esporos bacterianos e na parede
celular de algumas clulas, como as clulas de plantas. O Sdio (Na) necessrio em
quantidades trao por algumas bactrias, especialmente pelas metanognicas, para o
balano inico. O sdio importante no transporte de espcies carregadas em
membranas citoplasmticas eucariticas. O Cloreto (Cl-) juntamente com o Na+, so
necessrios em algumas halobactrias (utilizam halognios como fonte de energia) e
microrganismos marinhos. O nquel (Ni) requerido por algumas metanognicas como
cofator e o selnio (Se) requerido no metabolismo do formiato de alguns organismos.

3. Elementos trao que so raramente requeridos so B, Al, Si, Cr, V, Sn, Be, F, Ti,
Ga, Ge, Br, Zr, W, Li e I. Estes elementos so necessrios em concentraes menores
que 10-6M e txicos a altas concentraes, como 10-4M.

Alguns ons como Mg2+, Fe3+, e PO43- podem precipitar no meio nutritivo de culturas in
vitro e se tornarem indisponveis para a clula. Agentes quelantes so usados para
formar compostos solveis com ons precipitantes. Agentes quelantes contm certos
grupos denominados ligantes que se ligam a ons metlicos para formar complexos
solveis. Os principais ligantes so grupos carboxila (-COOH), amina (-NH2), e
mercapto (-SH). O cido ctrico, EDTA (cido etilenodiaminotetraactico), polifosfatos,
histidina, tirosina e cistena so os agentes quelantes mais comuns. Na2EDTA o
agente quelante mais empregado. O EDTA pode remover alguns componentes de
ons metlicos da parede celular, como Ca2+, Mg2+ e Zn2+ e pode causar a
desintegrao da parede celular.

Fatores de crescimento estimulam o crescimento e a sntese de alguns metablitos.


Vitaminas, aminocidos, cidos graxos e hormnios e so os principais fatores de
crescimento. Vitaminas usualmente tm a funo de coenzimas. Algumas vitaminas
mais comumente requeridas so tiamina (B1), riboflavina (B2), piroxidina (B6), biotina,
cianocobalamina (B12), cido flico, cido lipico, cido p-amino benzoico, e vitamina
K. As vitaminas so necessrias a concentraes que variam de 10-6 M a 10-12 M.
Dependendo do organismo, alguns, ou todos os aminocidos tem a necessidade de
serem adquiridos externamente em concentraes de 10-6 M a 10-13 M. Alguns cidos
graxos, como cido oleico e esteris, so tambm necessrios em concentraes
baixas por alguns organismos. Clulas animais e de plantas necessitam de hormnios
para regular seu metabolismo. Insulina o hormnio mais comum para clulas
animais, e a auxina e citoquininas so hormnios de crescimento das plantas.

2.7.3 Meios de Crescimento

Para cultivos microbiolgicos in vitro se faz necessrio um minucioso estudo para a


escolha de meios de cultura apropriados no crescimento celular.Os dois principais
tipos de meio de crescimento so os definidos e os meios complexos.

Meios definidos contm quantidades especficas de compostos qumicos puros e sua


composio qumica conhecida. Um meio contendo somente glicose, (NH4)2SO4,
KH2PO4 e MgCl2 um meio definido. Meios complexos contm compostos naturais
que a composio qumica no exatamente conhecida. Um meio contendo extrato
de levedura, peptona, melao, xarope de milho um meio complexo. O meio
complexo normalmente pode prover os fatores de crescimento necessrios, vitaminas,
hormnios, e elementos trao, resultando em altos rendimentos celulares, comparado
a um meio definido. Frequentemente meios complexos so mais baratos do que os
definidos. A maior vantagem de meios definidos que os resultados so mais
reprodutveis e o operador tem um melhor controle da cultura de modo, a saber,
exatamente quais compostos so consumidos ou produzidos pela clula.

2.8 Consideraes finais

Nesta unidade foi possvel conhecer as macromolculas presentes nas clulas:


lipdios, , RNA e DNA, carboidratos e protenas. Como foi descrito as protenas so os
polmeros mais abundantes nas clulas e sintetizados a partir de 20 aminocidos.
Estes polmeros formam estruturas moleculares com vrios nveis de complexidade e
funes associadas diversas. DNA e RNA so polmeros de nucleotdeos e, juntos,
so responsveis pelo armazenamento e transmisso da informao gentica da
clula para a traduo protenas com funes vitais diversificadas.

Os carboidratos e lipdeos tambm desempenham papeis importantes nas clulas.


Ambos podem servir como fonte de energia disponvel e armazenvel,
respectivamente e como componentes mediadores da atividade biolgica, tais como
hormnios e fatores de crescimento.

Finalmente, podemos definir os compostos consumidos pelas clulas em grandes


quantidades (macronutrientes) e em pequenas quantidades (micronutrientes), ambos
essenciais para a manuteno da integridade celular.

2.9 Exerccios Resolvidos

1) O doce sabor de milho recm colhido devido ao elevado nvel de acar nos
gros. Aps alguns dias aps a colheita, o milho no to doce, cerca de 50% do
acar livre convertido em amido aps um dia de colheita. Para preservar a doura
do milho, os gros podem ser imersos em gua fervente durante alguns minutos, e em
seguida, colocados em gua fria. O milho processado desta maneira e armazenado
num congelador mantm a sua doura. Qual a base bioqumica para este
procedimento?

R: Com o aumento da temperatura, a enzima que converte o acar em amido


desnaturada, ou seja, perde sua atividade. A gua fria faz com que a desnaturao
seja interrompida, preservando a doura do gro.

2) A massa molecular de uma molcula de DNA da Escherichia coli muito


grande, cerca de 2,5x109 Daltons. A massa molecular mdia de um par de
nucleotdeos de 660 Daltons e cada par de nucleotdeos contribui com 0,34 nm para
o comprimento do DNA.

a) Calcule o comprimento de uma molcula de DNA da E. coli. Compare o


comprimento da molcula de DNA com as dimenses da clula (E.coli tem
aproximadamente 2 m comprimento por 1 m de dimetro). Como essa
macromolcula de DNA se ajusta ou se distribui no interior da clula?

R:
Nota-se que a molcula de DNA bem mais comprida que a clula, sendo assim, s
pode existir densamente enovelada ou enrolada no citoplasma da bactria.

b) Sabendo que uma clula est constituda por milhares de tipos de protenas e
supondo que a protena mdia da E. coli consista de uma cadeia mdia de 400
aminocidos. Qual o nmero mximo de protenas que poderiam ser codificadas por
uma molcula de DNA nessa clula.

R: Sabendo que 3 nucleotdeos de uma fita simples definem um aminocido da


protena obedecendo o cdigo gentico, ento o nmero de protenas que podem ser
codificadas pela molcula de DNA ser:

3) As hastes de bambu podem crescer a uma taxa espetacular de 0,3 m/dia em


condies ideais. As hastes so compostas quase inteiramente de fibras de celulose.
Calcular o nmero de resduos de acar por segundo que devem ser adicionados
enzimaticamente nas cadeias de celulose para explicar a taxa de crescimento. Cada
unidade de glicose contribui com aproximadamente 0,5 nm para o comprimento de
uma molcula de celulose.

R:

1 glicose --- 0,5 nm ---- 0,5x109m

x glicose ----------------- 0,3 m

1 dia ----- 86400 segundos ----- 6x108 glicose

1 segundo -------------- y glicose


4) Diga qual das seguintes afirmaes verdadeira ou falsa e justifique sua resposta.

a) Um organismo que cresce consumindo oxignio como agente oxidante e que pode
tambm crescer e metabolizar na ausncia de oxignio chamado de facultativo.

R: Verdadeira. So organismos que podem crescer tanto na presena como na


ausncia e oxignio dissolvido na gua. O metabolismo celular em cada uma dessas
condies bastante diferente. Isto se reveste de grande importncia em engenharia
ambiental j que existem tecnologias que envolvem os dois tipos de processos em
tratamento biolgico de resduos.

b) Tanto os cidos graxos como os polissacardeos podem constituir reservas de


energia importantes para as clulas.

R: Verdadeira. A degradao desses dois tipos de molculas serve para a liberao de


energia qumica para ser utilizada em vrias funes da clula e tambm na formao
de material estrutural da prpria clula. Os mecanismos bioqumicos para
aproveitamento dessas molculas como fonte de energia ser estudada com maior
profundidade mais adiante. Esta uma informao muito importante para o
engenheiro ambiental que pretende resolver problemas prticos envolvendo
organismos vivos.

c) Quando voc suplementa um meio de cultivo com aminocidos para fazer crescer
clulas nele, voc deve usar D-aminocidos.

R: Falsa. Somente L-aminocidos so encontrados nas protenas. D-aminocidos so


muito raros na natureza. Portanto, as protenas vo precisar de L-aminocidos no
meio de cultivo para poder tornar possvel sua sntese.

2.10 Estudos complementares

Para leitura adicional, consultar:


Alberts, B.; Bray, D.; Hopkin, K.; Johnson, A.; Lewis, J.;
Raf, M.; Roberts, K.; Walter, P. Fundamentos de biologia celular. 2a ed., Artmed,
Porto Alegre, 2006.

Bailey, J. E. e Ollis, D. F., Biochemical Engineering Fundamentals, 2a ed., McGraw-


Hill, New York, 1986.

Shuler, M. L. e Kargi, F. Bioprocess Engineering, Prentice Hall, Englewood Cliffs,


1992.

Para exerccios didticos e visualizao de imagens:


http://www.biology.arizona.edu/cell_bio/cell_bio.html.