ENZIMAS

1. DEFINICION:

Las enzimas son proteínas complejas que producen un cambio químico

específico en otras sustancias, sin que exista un cambio en ellas

mismas. Por ejemplo, las enzimas pueden convertir los almidones, las

proteínas y los azúcares en sustancias que el cuerpo pueda utilizar. La

coagulación de la sangre es otro ejemplo del trabajo de las enzimas.

En estas reacciones, las enzimas actúan sobre unas moléculas

denominadas sustratos, las cuales se convierten en moléculas diferentes

denominadas productos. Casi todos los procesos en las células

necesitan enzimas para que ocurran a unas tasas significativas. A las

reacciones mediadas por enzimas se las denomina reacciones

enzimáticas.

Las enzimas son esenciales para todas las funciones corporales y se

encuentran en la boca (saliva), el estómago (jugo gástrico), los

intestinos (jugo pancreático, jugo y mucosa intestinal), la sangre y en

cada órgano y célula del cuerpo.

2. PARTES DEL SISTEMA ENZIMÁTICO:

 1. Sustrato; cualquier compuesto químico.

 Sustancia, compuesto químico que sufre la reacción

química.

 Aquellas sustancias en las que actúa la enzima.

 Cualquier origen químico.

2. La enzima; siempre actúa sobre un sustrato para producir

una catálisis y su resultado es un producto.

3. Coenzimas; provienen de las vitaminas (forma activa de las

vitaminas), tienen peso molecular bajo. Biomoleculas no

proteicas que favorece y/o potencial izan la acción de una

enzima.

4. Sustancias activadoras: temperatura, electrolitos y pH.

3. NOMENCLATURA :

3.1. HISTORIA:

Cien años atrás solo se conocían enzimas, muchas de estas,

catalizaban la hidrólisis de enlaces covalentes. Algunas enzimas, de

manera especial las que fueron descubiertas en un principio, recibieron

nombres ligados a su sitio de procedencia anatómica que no siguen

ninguna regla ni sistema; tal es el caso de la:

 « Ptialina de la saliva: ataca al almidón de la pepsina del

estómago

« Tripsina del páncreas: atacan proteínas

« Renina: que coagula la leche

« Papaina, enzima proteolítica que se encuentra en la papaya.

« Proteasas: se encuentran en las células.

Las enzimas relacionadas con la cuagulación de la sangre, como

son la trombina, la plasmina, el plasminógeno, etc. reciben también

nombres sistematizados.

Al descrubir nuevas enzimas y proceder a su caracterización estricta

se aplicaron reglas de nomenclatura basadas en el nombre del sustrato

atacado, o en el tipo general de sustrato, o en la reacción catalizada y

se ha añadido convencionalmente, la terminación -asa.

Por ejemplo:

« Las lipasas (hidrolizan lípidos o grasas)

« Las amilasas (hidrolizan almidón)

« Las proteasas (hidrolizan proteínas)

« Las esterasas (basado en la unión general de tipo éster

presentes en muchas sustancias) Colesterol estrerasa (si la

esterasa es específica de los esteres de colesterol) y acetilcolina

esterasa (si la esterasa de la acetilcolina).

Otros ejemplos:

« Las fosfatasas son enzimas que atacan las uniones éster, pero

en este caso, toman su nombre del grupo vecino a la unión que

van a atacar, de manera que se denominan fosfatasas (cuando

quitan una molécula de monofosfato), pirofosfatasas (cuando

quitan el ácido fosfórico como esteres dobles (pirofosfatos), o

triples, etc.)

« Las carbohidrasas se denominan así genéricamente, pero

pueden comprender enzimas con nombres proveniente del

sustrato particular sobre el que actúan como la amilasa que ataca

al almidón y la celulasa que actúa sobre la celulosa y, en otras

ocasiones, se denominan de acuerdo con la unión atacada, como

la b -glucosidasa que actúa sobre las uniones b -glucosídicas.

Los ejemplos se pueden extender a todos los terrenos de la actividad

enzimática, como en las enzimas proteolíticas, las fosforilasas, las

nucleasas, etc.

Esta manera de llamarlas, se demostró que era inadecuada porque al

descubrirse varias enzimas, notaron que varias enzimas catalizaban

reacciones diferentes del mismo sustrato, por ejemplo, oxidación o

reducción de la función alcohol de un azúcar.

Aunque el sufijo –asa continúa en uso; actualmente, al nombrar a las

enzimas, se enfatiza el tipo de reacción catalizada. Por ejemplo: las

hidrogenasas catalizan la eliminación de hidrogeno y las transferasas,

reacciones de transferencia de grupo. Con el descubrimiento de mas y

mas enzimas, surgieron ambigüedades y con frecuencia no estaba claro

cual era la enzima que un investigador deseaba estudiar.

Para remediar esta deficiencia, la Comisión para el estudio de las

enzimas, que constituye con respecto a los sistemas anteriores un

punto de vista más uniforme, preciso y descriptivo; esta formada por la

Unión Internacional de Bioquímica (IUB) adoptó, en 1964, un sistema

complejo pero inequívoco de la nomeclatura enzimática basado en el

mecanismo de reacción.

El sistema se basa en la reacción química catalizada que es la

propiedad específica que caracteriza a cada enzima las cuales se

agrupan en clases, porque catalizan procesos semejantes, y en

subclases que especifican con mayor exactitud la reacción particular

considerada.

En general, las enzimas reciben un nombre de acuerdo con el sustrato

o los sustratos que participan en la reacción seguido por el tipo de

reacción catalizada y, por fin, la terminación -asa. A menudo los

nombres así obtenidos resultan largos y complejos, por lo que es muy

difícil que en la práctica se pueda excluir el uso de los nombres

triviales, consagrados por la costumbre.

Sin embargo, con fines de sistematización, se reconoce la necesidad de

aceptar el nuevo sistema.

Aunque su claridad y carencia de ambigüedad recomiendan al sistema

de nomeclatura IUB para trabajos de investigación, nombres más

ambiguos, pero bastante más cortos persisten en libros de texto y en el

laboratorio clínico. Por esta razón, a continuación solo se presenta

principios generales del sistema IUB:

1. Las reacciones y las enzimas que las catalizan se dividen en 6

clases principales, cada una con 4 a 13 subclases.

2. El nombre de la enzima tiene 2 partes: la primera es el nombre

del o los sustratos; la segunda, con terminación –asa, indica el

tipo de reacción catalizada.

3. Información adicional, si es necesario aclarar la reacción, puede

seguir el paréntesis. Por ejemplo: la enzima que cataliza L-malato

+ NAD
=
= piruvato + CO2 NADH + H , se denomina como
=

1.1.1.37 L-malato:NAD oxidorreductasa (descarboxilante).

+

4. Cada enzima tiene un numero clave (E.C.) que caracteriza al tipo

de reacción según la clase (primer digito), subclase (segundo

 digito) y subclase (tercer digito). El cuarto digito es para la

enzima específica. Así, E.C. 2.7.1.1 denota la clase 2 (una

transferasa), subclase 7 (transferencia de fosfato), sub-clase 1

(una función alcohol como aceptor de fosfato). El último digito

denota a la enzima hexocinasa o ATP: D-hexosa-6-

fosforotransferasa, enzima que cataliza la transferencia de fosfato

desde el ATP al grupo hidroxilo de carbono 6 de la glucosa.

Al final de sus y trabajos, clasifico las enzimas en seis grupos

principales, correspondientes por sus términos a las reacciones que

cada enzima ejerce sobre el sustrato. Estos grupos se subdividen en

otro, según el tipo de sustrato y los átomos concretos que son

sensibles a sus acciones. Estos seis grupos son los siguientes y se

analizarán más adelante:

1. Oxidoreductasas

2. Transferasas

3. Hidrolasas

4. Isomerasa

5. Liasas

3.2. NOMENCLATURA ACTUAL:

La nomenclatura enzimática está basada en 3 parámetros:

 « Todas las enzimas deben de llevar el nombre del sustrato

Sustrato: parte del sistema enzimático, sustancia o compuesto

químico sobre la cual va actuar la enzima es la sustancia o

compuesto químico que sufre la reacción química.

« Las enzimas deben de llevar el nombre de la reacción

química catalizada

Oxidación oxidasa
Reducción reductasa
Hidrólisis hidrolasa
Isomerización isomeraza
Transferencia transferasa
Síntesis ligasa
Catálisis liasa

Ejemplo: Glucosa oxidasa.

Las enzimas se identifican por 4 dígitos:

« El primer digito se refiere a la clasificación general, va del

uno
 « El segundo dígito se refiere a la clase de enzima.

« El tercer dígito es la subclase, se refiere a la reacción

química específica que cataliza la enzima

« El cuatro dígito se refiere al número progresivo de orden

de acuerdo a su identificación.

4. CLASIFICACIÓN:

4.1. CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS DE ACUERDO A SU

COMPLEJIDAD:

De acuerdo a su complejidad las enzimas se clasifican como:

En las proteínas conjugadas podemos distinguir dos partes:

 Apoenzima: Es la parte polipeptídica de la enzima.

 Cofactor: Es la parte no proteica de la enzima.

La combinación de la apoenzima y el cofactor forman la holoenzima.

Los cofactores pueden ser:

 Iones metálicos: Favorecen la actividad catalítica general de la

enzima, si no están presentes, la enzima no actúa. Estos iones

metálicos se denominan activadores. Ejemplos: Fe2+, Mg2+, Cu2+,

K+, Na+ y Zn2+

 La mayoría de los otros cofactores son coenzimas las cuales

generalmente son compuestos orgánicos de bajo peso molecular, por

ejemplo, las vitaminas del complejo “B” son coenzimas que se

requieren para una respiración celular adecuada.

4.2. CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS SEGÚN SU

ACTIVIDAD:

1. OXIDO-REDUCTASAS:

 Son las enzimas relacionadas con las oxidaciones y las reducciones

biológicas que intervienen de modo fundamental en los procesos de

respiración y fermentación.

 Son importantes a nivel de algunas cadenas metabólicas, como la

escisión enzimática de la glucosa, fabricando también el ATP,

verdadero almacén de energía. Extrayendo dos átomos de hidrógeno,

catalizan las oxidaciones de muchas moléculas orgánicas presentes

en el protoplasma; los átomos de hidrógeno tomados del sustrato

son cedidos a algún captor.

 2. LAS TRANSFERASAS:

Estas enzimas catalizan la transferencia de una parte de la molécula

(dadora) a otra (aceptora). Su clasificación se basa en la naturaleza

química del sustrato atacado y en la del aceptor. También este grupo

de enzimas actúan sobre los sustratos mas diversos, transfiriendo

grupos metilo, aldehído, glucosilo, amina, sulfató, sulfúrico, etc.

3. LAS HIDROLASAS:

 Esta clase de enzimas actúan normalmente sobre las grandes

moléculas del protoplasma, como son la de glicógeno, las grasas y

las proteínas.

 La acción catalítica se expresa en la escisión de los enlaces entre

átomos de carbono y nitrógeno (C-N) o carbono oxigeno (C-O);

Simultáneamente se obtiene la hidrólisis (reacción de un compuesto

con el agua) de una molécula de agua. El hidrógeno y el oxidrilo

resultantes de la hidrólisis se unen respectivamente a las dos

moléculas obtenidas por la ruptura de los mencionados enlaces.

 A este grupo pertenecen proteínas muy conocidas: la pepsina,

presente en el jugo gástrico, y la tripsina y la quimiotripsina,

segregada por el páncreas. Desempeñan un papel esencial en los

procesos digestivos, puesto que hidrolizan enlaces pépticos, estéricos

y glucosídicos.
 4. LAS ISOMERASAS:

Transforman ciertas sustancias en otras isómeras, es decir, de

idéntica formula empírica pero con distinto desarrollo.

 Son las enzimas que catalizan diversos tipos de isomerización, sea

óptica, geométrica, funcional, de posición, etc.

 Se dividen en varias subclases.

 Las racemasas y las epimerasas:

Actúan en la racemización de los aminoácidos y en la epimerización

de los azúcares. Las primeras son en realidad pares de enzimas

específicas para los dos isómeros y que producen un solo producto

común.

 Las isomerasas cis – trans:

Modifican la configuración geométrica a nivel de un doble ligadura.

Las óxido – reductasas intramoleculares catalizan la interconversión

de aldosas y cetosas, oxidando un grupo CHO y reduciendo al

mismo tiempo al C = O vecino, como en el caso de la triosa fosfato

isomerasa, presente en el proceso de la glucólisis ; en otros casos

cambian de lugar dobles ligaduras, como en la (tabla) isopentenil

fosfato isomerasa, indispensable en el cambio biosinético del

escualeno y el colesterol. Por fin las transferasas intramoleculares (o

mutasas) pueden facilitar el traspaso de grupos acilo, o fosforilo de

 una parte a otra de la molécula, como la lisolecitina acil mutasa que

transforma la 2 – lisolecitina en 3 – lisolecitina, etc.

 Algunas isomerasas actúan realizando inversiones muy complejas,

como transformar compuestos aldehídos en compuestos cetona, o

viceversa. Estas ultimas desarrollan una oxidorreducción dentro de la

propia molécula (oxido reductasa intramoleculares) sobre la que

actúan, quitando hidrógeno, a algunos grupos y reduciendo otros;

actúan ampliamente sobre los aminoácidos, los hidroxácidos, hidratos

de carbono y sus derivados.

5. LAS LIASAS:

Estas enzimas escinden (raramente construyen) enlaces entre átomos

de carbono, o bien entre carbono y oxigeno, carbono y nitrógeno, y

carbono y azufre. Los grupos separados de las moléculas que de

sustrato son casi el agua, el anhídrido carbónico, y el amoniaco.

Algunas liasa actúan sobre compuestos orgánicos fosforados muy

tóxicos, escindiéndolos; otros separan el carbono de numerosos

sustratos.

6. LAS LIGASAS:

 Realizan la degradación o síntesis de los enlaces fuertes mediante el

acoplamiento a sustancias ricas en energía como los nucleosidos del

 ATP. Algunos ejemplos de estas son las Carboxilasas y las

Peptidosintetasas.

 Son enzimas que catalizan la unión de dos moléculas acoplada a la

hidrólisis de un grupo pirofosforilo en el ATP o un trifosfato

nucleosilo similar.

 Son enzimas que catalizan la formación de un enlace entre dos

moléculas de sustrato. La energía para estas reacciones la aporta

siempre la hidrólisis de ATP. Los nombres de muchas ligasas

incluyen el término sintetasa. Otras ligasas se denominan

carboxilasas.

Ejemplo:

Enzima Piruvato caboxilasa

4.3. ACTIVIDAD ENZIMÁTICA:

La sustancia sobre la cual actúa una enzima se llama sustrato.

Los sustratos son específicos para cada enzima:

La sacarosa es el sustrato de la sacarasa que actúa rompiéndola en

sus componentes.
Las enzimas actúan de acuerdo con la siguiente secuencia: La enzima

(E) y el sustrato (S) se combinan para formar un complejo intermedio

enzima sustrato (E-S), el cual se descompone formando un producto y

regenerando la enzima.

El grado de especificidad de las enzimas es muy alto, pueden distinguir

incluso entre diferentes tipos de isómeros. Se cree que la especificidad

de la enzima es debido a la forma particular de una pequeña parte

conocida como sitio activo, la cual se fija a la contraparte

complementaria en el sustrato.

5. COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO

Algunas proteínas tienen la capacidad de modificar los ligandos a los

cuales son unidos, es decir, actúan como catalizadores moleculares. Su

función es acelerar en varios órdenes de magnitud el ajuste de un

equilibrio de reacción químico, que en un proceso sin ellas podrían

tardar una eternidad. Estas proteínas son las denominadas enzimas.

Para realizar esta aceleración del proceso lo que consigue la enzima es

lograr la disminución de la energía de activación de la reacción.

Las enzimas dirigen las transformaciones químicas y energéticas que

tienen lugar en cada célula. Pero para realizar estas funciones básicas

y vitales para nuestra vida deben tener una capacidad de interaccionar

de forma específica y reversible con ligandos, que viene dada por su

conformación espacial en el lugar de unión. Para que la enzima

modifique el ligando (sustrato a partir de este momento) este debe

“encajar” en el lugar de unión de la enzima. Por esto decimos que hay

complementariedad geométrica entre enzima y sustrato.

Los lugares de unión acostumbran a estar en unas hendiduras de la

superficie de la enzima, formando como un “bolsillo” en el cual entra el

sustrato. De esta manera la superficie de interacción entre sustrato y

enzima es mayor, y las posibilidades de conferir especificidad a la

unión con el sustrato aumenta. La especificidad de la unión es tan alta

que la enzima es capaz de distinguir entre sustratos esteroisómeros,

por lo tanto decimos que las enzimas presentan esteroespecificidad. La

esteroespecificidad puede servir en casos concretos para separar rutas

de formación y degradación de productos, que se realizan de forma

simultánea. Este hecho se debe a que las enzimas son moléculas

asimétricas.

La unión se mantiene gracias a las fuerzas de enlaces no covalentes

entre átomos del sustrato y la enzima, como enlaces de Van der

Waals, enlace por puente de hidrógeno o puentes salinos, durante la

catálisis, pero la unión es temporal, por tanto cuando la reacción

enzimática finaliza se separan la enzima y el producto (ya no hablamos

de sustrato después de la catálisis, ya que tiene una conformación

modificada por la enzima).

6. PROPIEDADES:
Las enzimas son proteínas que incrementan la velocidad de una

reacción química y no se consumen durante la misma (algunos tipos de

ARN pueden actuar como enzimas, usualmente rompen y sintetizan

enlaces fosfodiester; a estas moléculas se les denomina “ribozimas” y

se encuentran en muy baja proporción en la naturaleza).

6.1. SITIO ACTIVO:

Las moléculas de enzimas contienen hendiduras o cavidades

denominadas sitio activo. El sitio activo está formado por las cadenas

laterales de residuos específicos, lo que ocasiona que tenga un arreglo

tridimensional particular, diferente al resto de la proteína. Este sitio es

afín por la estructura tridimensional del sustrato:

ENZIMA

SUSTRATO

SITIO ACTIVO SITIO ACTIVO

VACIO OCUPADO
 El sitio activo la enzima (E) une al substrato (S) formando un

complejo enzima-substrato (ES). En el complejo ES, E transforma a S

en él o los productos, formando el complejo enzima-producto (EP),

finalmente la enzima libera del sitio activo a P, regenerándose.

6.2. EFICIENCIA CATALÍTICA:

La mayoría de las reacciones catalizadas por enzimas son muy

eficientes y transcurren desde 10 hasta 10

6 14
veces más rápido que la

misma reacción no catalizada. Típicamente, cada molécula de enzima

es capaz de transformar cada segundo de 100 a 1000 moléculas de

substrato en producto. El número de estas moléculas transformadas a

producto por molécula de enzima en cada segundo, se conoce como el

número de recambio.

VELOCIDAD EN VELOCIDAD DE

ENZIMA AUSENCIA DE REACCIÓN RENDIMIENTO

ENZIMA CATALIZADA
Anhidrasa carbónica 1.3 X 10
–1
1.0 X 10
6
7.7 X 10
6

Corismato mutasa 2.6 X 10

–5
50 1.9 X 10
6

Triosafosfato 4.3 X 10
–6
4300 1.0 X 10
9

isomerasa 3.0 X 10
–9
578 1.9X 10
11
 Carboxipeptidasa A
1.0 X 10
–11
60 6.0 X 10
12

AMP nucleosidasa
1.7 X 10
-13
95 5.6 X 10
14

Nucleasa estafilococal

6.3. ESPECIFICIDAD:

Las enzimas son muy específicas por el substrato de la reacción que

catalizan. Interactúan con una o muy pocas moléculas y catalizan

únicamente un tipo de reacción, por lo que las moléculas con las que

interactúan deben ser muy parecidas, tanto en composición, como en

estructura tridimensional. Por ejemplo, en la siguiente figura, en el panel

A,

se muestra la reacción catalizada por la enzima triosafosfato isomerasa

(enzima que cataliza el paso 5 de la glucólisis), en el panel B se

muestran inhibidores de la catálisis:

Nótese el parecido con la estructura de los sustratos y del intermediario

6.4. COFACTORES:

ENFERMEDAD
FUENTE
COENZIMA REACCIÓN HUMANA POR
VITAMINICA
DEFICIENCIA
Biocitina Carboxilación Biotina *
Transferencia
Coenzima A Pantotenato *
de acilos
 Coenzimas de Cobalamina anemia
Alquilación
Cobalamima (B12) perniciosa
Coenzimas de Oxidación-
Riboflavina (B2) *
flavina reducción
Transferencia
Acido lipóico - *
de acilos
Coenzimas de Oxidación- Nicotinamida
Pelagra
nicotinamida reducción (niacina)
Fosfato de Transferencia
Piridoxina (B6) *
piridoxal de grupo amino
Transferencia
anemia
Tetrahidrofolato de un grupo de Acido fólico
megaloblástica
1 Carbono
Tiemina Transferencia
Tiamina (B1) beriberi
pirofosfato de aldehído
Algunas enzimas se asocian con moléculas de carácter no proteíco que

son necesarias para el funcionamiento de la enzima, estas moléculas

se denominan cofactores. Comúnmente, los factores encontrados en las

enzimas incluyen iones metálicos como el Zn

2+
o el Fe , también
2+

pueden ser moléculas orgánicas que se denomina coenzimas como el

NAD , FAD, la conezima A y la C, generalmente las coenzimas son

+

derivados de las vitaminas. A la enzima en ausencia de su cofactor

(cuando lo tiene), se le denomina apoenzima, en presencia de su

cofactor (cuando lo tiene), se le denomina holoenzima. La apoenzima

generalmente carece de actividad biológica. La diferencia entre un

cofactor y un grupo prostético, como el grupo hemo, es que este último

está unido de manera covalente a la enzima, mientras que el cofactor

puede ser removido de la misma con relativa facilidad.

* no tiene un nombre específico, su aparición es muy rara.

6.5. REGULACION:

La actividad enzimática puede ser regulada, esto quiere decir que

dependiendo de los requerimientos metabólicos, las enzimas son

activadas o inhibidas, para acelerar o disminuir la velocidad con la que

catalizan la reacción, respondiendo así a las diferentes necesidades de

sus productos en la célula. La regulación más común es modificando la

concentración de su(s) substrato(s).

6.6. LOCALIZACION EN LA CELULA:

En los eucariontes, muchas enzimas se localizan en organelos

específicos en la célula. Esta compartamentalización ayuda a aislar los

substratos de la reacción o productos de la misma, de tal forma que no

hay competencia de reacciones, de esta manera se provee un medio

favorable para la reacción, de tal forma que es posible localizar

diferentes partes del metabolismo en diferentes organelos, haciendo a la

célula una entidad organizada en donde simultáneamente funcionan

miles de enzimas.