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𝑎𝑐𝑡𝑖𝑣𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙
𝐴𝑐𝑡𝑖𝑣𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑒𝑠𝑝𝑒𝑐í𝑓𝑖𝑐𝑎 =
𝑝𝑟𝑜𝑡𝑒í𝑛𝑎 𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙
2460
𝐴𝑐𝑡𝑖𝑣𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑒𝑠𝑝𝑒𝑐í𝑓𝑖𝑐𝑎 = = 0,66
3780
𝑎𝑐𝑡𝑖𝑣𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑒𝑠𝑝𝑒𝑐í𝑓𝑖𝑐𝑎 𝑓𝑖𝑛𝑎𝑙
𝑃𝑢𝑟𝑖𝑓𝑖𝑐𝑎𝑐𝑖ó𝑛 =
𝑎𝑐𝑡𝑖𝑣𝑖𝑑𝑎𝑑 𝑒𝑠𝑝𝑒𝑐í𝑓𝑖𝑐𝑎 𝑖𝑛𝑖𝑐𝑖𝑎𝑙
105
𝑃𝑢𝑟𝑖𝑓𝑖𝑐𝑎𝑐𝑖ó𝑛 = = 161,5
0,65
1
Técnicas de centrifugación
2
Tipos de centrífugas: Existen características comunes a todas las centrífugas, el
principal es el motor central que gira un rotor que contiene las muestras que van a ser
separadas. Las partículas de interés bioquímico son suspendidas en una solución buffer,
que es colocado en tubos específicos en compartimientos localizados en rotores
específicos. El medio del buffer es elegido para cada centrifugación y generalmente es
diferente, en cuanto a pH, la salinidad, etc. Se establece este medio con el objetivo de
preservar las funciones biológicas. Las diferencias que se pueden establecer entre
centrífugas son:
La velocidad máxima a la que se someten las muestras para la sedimentación.
La presencia o ausencia de vacío.
El potencial de refrigeración o la manipulación general de la T durante la
centrifugación.
El volumen máximo de muestras y la capacidad de tubos individuales para la
centrifugación.
De esta forma se pueden dividir las centrífugas en:
a) Microcentrífugas: las cuales centrifugan pequeños volúmenes de muestra en tubos
Eppendorf (Ej. células de la sangre). Proveen campos de centrifugación de
aproximadamente 10000 g y la sedimentación de muestras biológicas en minutos.
También son utilizadas para la concentración de muestras de proteínas.
b) Centrífugas de larga capacidad: poseen un máximo de campo de centrifugación
entre 3000 a 7000 g. Pueden ser utilizadas con varios tipos de contenedores (5 a
250 cm³). Se utiliza para la precipitación de las células enteras
c) Centrífugas de alta velocidad de refrigeración: son esenciales para la precipitación
de proteínas, organelas (núcleos, mitocondrias o cloroplastos), desechos celulares
derivados de la homogenización de tejidos y microorganismos. Crean campos de
centrifugación de 100000 g.
d) Ultracentrífugas: crean campos de 900000 g. Es utilizado para la determinación de
la masa molecular de macromoléculas aisladas o las propiedades termodinámicas
de una proteína u otras biomoléculas.
Tipos de rotores: los rotores de baja velocidad están hechos de acero o latón, mientras
los rotores de alta velocidad están hechos con aluminio, titanio o compuestos reforzados
con fibra. El exterior de rotores específicos puede estar pintado con pinturas protectoras.
Se dividen en:
a) Rotores de ángulo fijo: son una herramienta para la granulación durante la
separación diferencial de partículas en las cuales sus grados de sedimentación
difieren significativamente. Ej. núcleo, mitocondria y microsomas. Los tubos de
centrifugación son colocados en un ángulo entre 14º y 20º. Las partículas se
mueven radialmente hacia afuera en el ángulo del campo, sólo deben viajar una
corta distancia hasta que llegan a su posición isopícnica (utilizando una técnica
isopícnica) o hasta que se chocan con la pared del tubo (si se utiliza un método de
centrifugación diferencial).
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b) Rotores verticales: se pueden dividir entre verdaderos rotores verticales o rotores
casi verticales. Los tubos son colocados paralelamente al eje de rotación y son
restringidos a las cavidades de los rotores por tornillos. Los rotores casi verticales
poseen un ángulo de 7º o 10º y también utilizan tubos de rápido sellado. Esta última
es utilizada para la centrifugación de elementos biológicos que no participan
adecuadamente en los gradientes convencionales.
c) Rotores swinging-bucket: son utilizados pasadores de bisagras o travesaños para
colocar los cubos de los rotores. Los tubos son posicionados de forma vertical y
durante la fase de aceleración inicial, los cubos oscilan hasta una posición
horizontal y ellos solos se posicionan en el soporte del rotor.
Centrifugaciones preparativas
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c) Fracción subcelular: El proceso consiste en repetidas centrifugaciones a
velocidades cada vez más altas y más duraderas para poder separar los diferentes
componentes del homogenato. Los valores típicos para los diferentes pasos de la
centrifugación son:
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Precipitación fraccionada
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Ej. de gráfico de precipitación fraccionada con sal
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Electroforesis
Medios de soporte
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Tipos de electroforesis
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b) Gradiente de gel: se utiliza un sistema de gel de poliacrilamida que no posee un tamaño
de poro uniforme, se establece un gradiente en la concentración de la acrilamida que
varía entre el 5% hasta el 25% desde la parte superior hasta la parte inferior del gel. En
la parte superior del gel van a haber poros grandes pero a medida que la muestra se
mueve a través del gel la concentración de la acrilamida va aumentando paulatinamente
y en consecuencia el tamaño del poro va decreciendo. El gradiente de gel es corrido con
un stacking gel como con el SDS gel. La primera ventaja de este método es que se
pueden separar un rango mucho mayor de proteínas según su masa. La segunda ventaja
es que las proteínas con masas similares pueden ser separadas, ya que a medida que la
proteína va recorriendo el gel el poro va disminuyendo hasta encontrarse con su poro
límite. Esta proteína se queda en ese punto y forma una banda. Una proteína con masa
similar pero más pequeña va a poder ser capaz de viajar más hasta alcanzar su poro
límite y ahí va a formar su respectiva banda.
c) Gel de foco isoeléctrico (IEF): el método es utilizado para la separación de sustancias
anfipáticas (proteínas) ya que se basa en la separación de moléculas según su punto pI.
Es muy utilizado para el estudio de la heterogeneidad de una proteína. Posee una gran
resolución, proteínas que difieren en un 0,01 unidad de pH pueden ser separadas. Se
utilizan geles horizontales. La separación se realiza mediante la aplicación de una
diferencia de potencial a través de un gel que contiene un gradiente de pH. El gradiente
de pH es formado por la introducción de anfolitos (mezclas de ácidos
poliaminopolicarboxilicos sintéticos) en el gel. Se utilizan generalemnte geles de
poliacrilamida (4%) o gel de agarosa.
Para preparar un gel (IEF) se mezclan carrier anfolitos (de un rango de pH) y
riboflavina con una solución de acrilamida y se coloca en una placa de vidrio. La
segunda placa es colocada por encima de la primera y el gel es polimerizado mediante
la fotopolimerización (colocar el gel enfrente de una luz brillante). Los electrodos están
recubiertos de pedazos de papel del filtro mojado y son colocados en cada extremo del
gel y la diferencia de potencial es aplicada. Luego, la corriente se apaga y se coloca
sobre el gel pequeños cuadrados de filtro de gel con la muestra. Dependiendo del punto
de pH en donde se colocaron las muestras, las proteínas que tengan un pH por debajo de
su pI van a estar cargadas positivamente y van a migrar hacía el cátodo. La carga
positiva va a ir decreciendo de acuerdo con su llegada al punto en donde su pH es igual
a su pI. En ese momento se va a convertir en un zwitterion (no posee carga neta) y su
movimiento va a cesar. Por otro lado, las proteínas que tengan su pH por arriba de su pI
van a estar cargadas negativamente y van a migrar al ánodo hasta que su pI se convierta
en estacionario.
El gel debe estar teñido para detectar las proteínas, se lo tiñe con Coomassie Brilliant
Blue y luego se lo decolora.
El pI de una proteína puede ser determinado corriendo una mezcla de proteínas que se
sabe su pI en el mismo gel. Se establece una curva de calibración producto de la
relación entre la banda producida por las proteínas en las cuales sabíamos su pI en
función de su pI.
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d) Electroforesis de dos dimensiones de gel de poliacrilamida: esta técnica combina las
técnicas de IEF (primera dimensión) que separa a las proteínas según su carga (pI) y la
otra técnica de SDS-PAGE (segunda dimensión) que separa a las proteínas según su
tamaño. El gel de la primera dimensión contiene anfolitos (que conforman el gradiente
de pH), urea 8M y un detergente no iónico, estos últimos poseen la característica de
desnaturalizar proteínas y mantener la solubilidad de estas. Las proteínas
desnaturalizadas se separan en el gel según su punto isoeléctrico. Las tiras de IFE son
incubadas en un buffer que contiene SDS y luego son colocadas entre dos placas de
vidrio y en la parte superior un 10% gel de SDS-PAGE. Comienza la electroforesis y las
proteínas corren a través del gel y se separan según su tamaño.
e) Electroforesis con acetato de celulosa: es utilizado para el análisis de muestras de suero.
Esta técnica posee las características de que tiene un medio homogéneo, un tamaño de
poro uniforme y una resolución buena. El acetato de celulosa es mojado en un buffer de
electroforesis y la muestra es colocada en forma de una banda ancha de 1 cm
aproximadamente a un tercio del camino de la tira de acetato de celulosa. El final de la
tira hace contacto con el buffer de electroforesis por medio de una mecha de papel de
filtro que se superpone en el final de la tira de acetato de celulosa y se realiza la
electroforesis. Luego de la misma la tira es teñida y después decolorada para visualizar
las bandas.
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Técnicas inmunológicas
Vocabulario
Introducción
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Anticuerpos
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Producción de anticuerpos
La respuesta inmune
Es posible producir anticuerpos que se unan a todo tipo de moléculas: hidratos, ácidos
nucleícos, proteínas, etc. pero en consecuencia estos tienen poca y nada especificidad y
por ende son poco usados en técnicas inmunes. La mayoría de estas técnicas requieren
de anticuerpos que puedan reconocer proteínas y péptidos.
Los animales producen una respuesta humoral ante una proteína extraña; igualmente, la
magnitud del anticuerpo producido depende de varias cosas:
Tamaño de la proteína/péptido extraño.
Distancia filogenética con el antígeno; cuanta mayor sea esta distancia con el
animal productor, más efectivo será el anticuerpo producido.
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Para seleccionar qué animal usar en un procedimiento inmunoquímico se debe tener en
cuenta la cantidad de antígeno que tengo, la cantidad de suero que quiero y la calidad
del suero que quiero producir. Sin embargo lo más importante sigue siendo la diferencia
entre la secuencia aminoacídica entre el anticuerpo animal (inmunógeno) y el antígeno
equivalente a dicho anticuerpo. Cuanta mayor diferencia, más fuerte será el anticuerpo.
Cuando se inmuniza un animal por primera vez el suero que se extrae del mismo, aún si
contiene anticuerpos, es subóptimo ya que los anticuerpos son poco ávidos por el
antígeno (poca avaricia); por lo que luego de una primera inmunización se tiende a
hacer otras posteriores, dando origen a un animal hiperinmune que tiene una alta
concentración de anticuerpos ávidos y específicos por el antígeno inyectado en su
sangre. Este “suero hiperinmune” es lo que se usa de fuente para anticuerpos
policlonales (animales más grandes necesitan más inmunizaciones pero producen más
suero). Para obtener los anticuerpos se utiliza la sangre del animal hiperinmune que dará
origen al suero.
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En 1975 Kohler y Milstein inventaron el procedimiento para generar células híbridas
que secreten anticuerpos y perduren en el tiempo. Esto se logró por la fusión de
linfocitos del sistema inmune de un ratón con células cancerosas (mielomas). A estas se
las llamaron hibridomas (o híbridas) y tienen la capacidad heredada del padre linfocito
de secretar anticuerpos pero a su vez la capacidad de sobrevivir constantemente gracias
al padre mieloma. Este procedimiento requiere que se mezclen los linfocitos y los
mielomas, en una solución de alta densidad y luego tratados con un agente fusionador
(glicol); en dichas condiciones las células híbridas son obtenidas pero los linfocitos y
mielomas no fusionados predominan; los mielomas además pueden sobrecrecer y
sobrepasar a los hibridomas si no se remueven; para esto se utiliza un medio en el que
los mielomas no pueden vivir, pero los híbridos sobreviven. Las células normales
(linfocitos) sobreviven en este medio pero mueren poco despues. Entonces: cuando se
fusionan en un medio denso mielomas y linfocitos, luego se agrega un medio HAT en el
cual los mielomas mueren y los linfocitos morirán luego de un corto período de tiempo
dejando a los hibridomas solos; los hibridomas se pueden clonar de 3 formas para
hacerlos más puros:
Dilución clonadora limitada: una suspensión de hibridomas se diluye y dispensa
en wells en los que quedarán un solo hibridoma por well. Este procedimiento se
repite y se obtiene una familia del mismo monoclonal.
Clonación en agar suave: una suspensión de hibridomas se diluye en agar
diluido, en este medio crecen los clones.
Clonación con fluorescencia: se marca con fluorescencia el hibridoma de mi
interés y luego estos se aíslan con citometría de flujo.
Todos los métodos de clonación están designados para producir culturas de hibridomas
monoclonales pero no lo aseguran. La repetición de técnicas de clonación mejora la
probabilidad de que los hibridomas sean monoclonales, por lo que se obtienen
subclones de los clones originales que serán más específicos por el epitope que yo
quiero. Si el hibridoma original es verdaderamente monoclonal, todo subclon tendría
que serlo, si un “monoclonal” reconoce más de un epitope, o yo hice algo mal y el padre
no era monoclonal, o el anticuerpo que uso no es estable. En la vida real los
monoclonales pueden obtenerse in vitro, donde yo coloco mi medio, mis mielomas y
mis linfocitos y obtendré un sobrenadante rico en hibridomas monoclonales; también se
puede utilizar la cavidad peritoneal de un ratón u otro animal para producir líquido
ascítico con altas concentraciones de hibridomas. Los hibridomas se pueden conservar
en frío.
En conclusión decimos que los anticuerpos policlonales se obtienen de suero inmune
derivado de la sangre de un animal y los monoclonales del sobrenadante de mi cultivo
in vitro o del líquido ascítico de un animal.
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Purificación y fragmentación de inmunoglobulinas
Técnicas de precipitación
Gel filtration
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Inmunoprecipitación
Se utilizan geles de agar y la agarosa con poros grandes que permite que los anticuerpos
difundan a través de él. Si el anticuerpo que está viajando a través del gel se encuentra
con un antígeno, se forma un precipitado insoluble. El precipitado generalmente se
observa como una línea opaca en el gel (banda de precipitación). Si la precipitación es
débil se una Coomasie Brilliant Blue para teñir.
Doble inmunodifusión (Ouchterlony): el antígeno-anticuerpo migra a través del
gel por difusión. En esta técnica se realizan pequeñas perforaciones en forma de
círculo concéntricas a una en el centro que se llenan con antígenos menos la del
centro que se coloca el anticuerpo. Ambos difunden dentro y a través del agar
formando un gradiente de concentración, en donde se forma una línea de
precipitación en el punto de equivalencia. Es cualitativa.
Inmunodifusión radial (SRID), se cargan antígenos en los Wells cortados en el
gel de agar que contienen concentraciones de anticuerpos conocidas. Un anillo
de precipitado se forma alrededor del well, denominado halo. El diámetro del
anillo está relacionado con la concentración de antígeno. Se determinaron dos
relaciones:
a. El cuadrado del diámetro del anillo es proporcional a la concentración del
antígeno.
b. El diámetro del anillo es proporcional al log de la concentración del
antígeno. Midiendo el diámetro del anillo producido por el calibrador de
las muestras con inmunoglobulinas conocidas, una curva estándar puede
ser construida. Esta sería el diámetro del anillo en función de la
concentración.
Inmunoelectroforesis: combinación de técnicas de inmunoprecipitación y de
electroforesis. Se utiliza una placa de agar de inmunodifusión en la cual se
realizan dos perforaciones al costado (se coloca la muestra) de un surco (en
donde se coloca el anticuerpo) y se realiza una electroforesis. El anticuerpo
luego difunde a través del gel en donde se forman las bandas de precipitina
donde el anticuerpo se encuentra con el antígeno.
Una desventaja de esta técnica es la mala resolución de las mezclas de antígeno
usando agar en la electroforesis, aunque es útil para la detección de anticuerpos
precipitando.
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Marcando anticuerpos
Marcación
a) Radiolabelling (radioisótopos): Se utiliza un isotopo que emite radiación
gamma, que es fácilmente detectable con el gamma-counter.
b) Fluorocromos: Los fluorocromos emiten luz fluorescente bajo iluminación UV
(no necesariamente). Es muy utilizado en la inmunohisto/citoquímica donde la
unión de los anticuerpos marcados a los tejidos o células son visualizados a
microscopio con ópticos fluorescentes.
c) Enzimas: son usadas para los inmunoensayos (ej. ELISA), inmunoblotting e
inmunohisto/citoquímica. La unión de la enzima-anticuerpo con el antígeno es
visualizada con la reacción de la enzima con un sustrato incoloro que se
convierta a uno con color. El producto debe ser soluble para su cuantificación
salvo en inmunoblotting e inmunohisto.
d) Biotina: los anticuerpos son fácilmente conjugados con biotina. Esta reacciona
con los grupos amina primarios, y otros con los grupos diol o los residuos de la
inmunoglobulina.
Inmunoblotting
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Variante Dot Blot
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Inmunohisto/citoquímica
Inmunofluorecencia
La fluorescencia en ciertas técnicas permite que con una fuente de luz láser se analice
imágenes en distintas profundidades de la sección del tejido o célula para formar una
imagen tridimensional. Con una única aplicación de anticuerpos marcados con
fluorocromos alcanza por que los diferentes fluorocromos emiten distintas ondas de luz
UV, y con el uso de filtros apropiados en microscopios de fluorescencia permite que en
el mismo sector del tejido o célula sea inmunomarcada con 2,3 o 4 anticuerpos distintos
en el que cada uno es usado con conjunto con un distinto fluorocromo. Para un marcaje
doble o triple se necesitará conjugarlos con anticuerpos primarios.
Las ventajas son que los anticuerpos marcados con fluorocromo son rápidos y fáciles de
usar, y ofrecen buena sensibilidad. Las desventajas son que el requerimiento de un
microscopio equipado con ópticos fluorecentes.
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Técnicas cromatográficas
El creador de la técnica, fue un ruso llamado Mikhail Tswett, en 1903, presentó una
exitosa separación de distintos tipos de pigmentos de una planta, usando una columna
de carbonato de calcio. Donde descubrió por primera vez que la clorofila no
representaba un solo componente químico.
El fundamento de la cromatografía es el coeficiente de partición (Kd), que describe la
distribución de un componente entre dos fases inmiscibles (que no se mezcla), la fase
fija y la fase móvil. El coeficiente entre estas dos fases es constante.
Kd: Se define como la cantidad total, no de concentración, sino de sustancias presentes
en una fase dividida por la cantidad presente en la otra fase. De hecho el coeficiente de
distribución es multiplicado por la proporción de los volúmenes de las dos fases. Si
[A]/[B]=Kd=1, pero la distribución de compuestos es A= 10 cm3 y B=1 cm3; la
concentración en las dos fases va a ser la misma, pero la cantidad total de compuestos
en fase A va a ser 10 veces del total en fase B.
Todas las cromatografías consisten en una fase fija, que puede ser: solida, gel, liquida
(inmiscibles); y una fase móvil que puede ser: liquida o gaseosa. El mecanismo consiste
en que la fase móvil fluya sobre la fase fija, y separe los compuestos por afinidad, hasta
que encuentre un equilibrio entre las dos fases.
Adsorción: un equilibrio de adsorción entre una fase fija solida y una fase móvil
liquida.
Partición: equilibrio entre fase fije liquida y fase móvil liquida o gaseosa.
Intercambio iónico: equilibrio entre fase fija solida “ion exchanger” y una fase
móvil electrolítica
Tamizaje molecular: equilibrio entre fase móvil liquida atrapada en los poros de
una fase fija porosa.
Afinidad: equilibrio en fase fija con ligando inmovilizado y fase móvil liquida.
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En capa delgada (TLC): en donde la fase fija, puesta en un papel, plástico o
vidrio fino, levemente inmersa en una matriz adecuada. La misma consiste en un
solvente orgánico volátil y un solvente de desarrollo. donde la fase móvil
asciende por capilaridad y arrastra los compuestos. Luego se revela con un
reactivo químico específico de color para ver lo que ascendió. A su vez se corre
un patrón y se hace un corrido de frente (cociente entre la distancia recorrida
por la partícula con respecto de la distancia recorrida del solvente). Este tipo de
cromatografía tiene la ventaja de poder hacer varios estudios al simultáneo.
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Para hacer un análisis cualitativo con solo observar los “picos” podemos distinguir qué
muestras hay. El Vo, volumen de exclusión representa el “tiempo muerto” es decir lo
que tarda la muestra en acomodarse en la fase móvil, en este momento nada va a pasar a
ser parte de la elución. Es el tiempo en que tardan en aparecen las primeras moléculas.
Para hacer un análisis cuantitativo de debe calcular el área bajo la curva. Estos “picos”
para ser considerados eficaces para el estudio de la muestra tienen que tener un
resolución entre 1,5 y 1, que le da la característica de estar separados y ser simétricos,
dándole así un valor de 97% de exactitud. Por último se realiza una curva de
calibración.
2 (𝑑𝑥 − 𝑑𝑦)
𝑅𝑒𝑠𝑜𝑙𝑢𝑐𝑖ó𝑛 =
(𝑊𝑥 + 𝑊𝑦)
Ancho de columnas
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Igualmente puede haber desviaciones como el:
a) Fronting: dada por una sobresaturación de la columna (fase fija) y salen
moléculas antes de lo que deberían salir, se observa así:
a) Tailing, dada por una sobre interacción del analito con la fase fija y sale después
de lo que debería salir.
Cromatografía de adsorción
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Cromatografía de partición
Tiene una fase fija liquida generalmente hechas de celulosa, almidón o sílice, cuando se
usa sílice se lo hace reaccionar con organoclorosilanos, para producir una fase fija más
estable. Dependiendo de la polaridad de lo que se quiera usar se pueden usar dos tipos
de particiones:
FE fase fija
FM fase móvil
Principio
Este tipo de cromatografía depende de la atracción entre la fase fija (conocida como
intercambiador iónico) y el analito, con cargas opuestas. Es elegida frecuentemente para
la separación y purificación de proteínas, péptidos, ácidos nucleícos, polinucleótidos y
otras moléculas cargadas, principalmente por su poder de alta resolución y gran
capacidad.
Hay dos tipos de intercambiadores iónicos: aniónicos y catiónicos. Los
intercambiadores catiónicos (también llamados intercambiadores ácidos) poseen grupos
cargados negativamente y estos atraerán cationes. Los intercambiadores aniónicos (o
intercambiadores básicos) tienen grupos cargados positivamente que atraerán aniones.
Materiales y aplicaciones
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Elección del intercambiador
PH del eluyente
El pH del buffer elegido como eluyente tiene que ser al menos una unidad de pH por
arriba o por abajo del punto isotónico de los analitos. En general, los buffers catiónicos
como el Tris, la piridina y las alquilaminas son usadas en conjunto con intercambiadores
aniónicos, mientras que buffers aniónicos como el acetato, barbitúrico y fosfato son
usados con intercambiadores catiónicos.
El valor preciso de pH del buffer y la fuerza iónica iniciales deben ser tales que solo
permitan la unión de los analitos al intercambiador. Igualmente, un buffer con la fuerza
iónica más baja que afecta la elución, debe ser usado inicialmente para la elución
subsecuente de los analitos. Esto asegura que inicialmente la mínima cantidad de
impurezas se unan al intercambiador y subsecuentemente la máxima cantidad de estas
impurezas permanezcan en la columna. Sin embargo, si se usara una elución en
gradiente, las condiciones iniciales elegidas serian tales que el intercambiador se una al
analito en la parte superior de la columna.
Elución
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Cromatografía de exclusión molecular (tamizaje molecular)
Principio
Aplicaciones
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Cromatografía de afinidad
Principio
Materiales y aplicaciones
Matriz: una matriz ideal para la cromatografía de afinidad debe tener las siguientes
características: poseer suficientes y adecuados grupos químicos a los cuales el ligando
pueda unirse covalentemente y ser estable bajo las condiciones de la unión; ser estable
durante la unión de las macromoléculas y la subsecuente elución; interactuar solo
débilmente con otras macromoléculas para minimizar la adsorción no especifica; exhibir
buenas propiedades de flujo. En la práctica se utilizan partículas que son uniformes,
esféricas y rígidas. Las más comunes son los dextranos y agarosas reticulados,
polisacárido, polimetacrilato, poliestireno, celulosa y vidrio y silica porosos.
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Ligando
La naturaleza química del ligando está determinada por la especificidad biológica del
compuesto a purificar. En la práctica a veces es posible seleccionar un ligando que
presente una especificidad absoluta y se una exclusivamente a un compuesto particular.
Más comúnmente, es posible seleccionar un ligando que presente selectividad por un
grupo y se una a un grupo de compuestos estrechamente relacionados que posea una
especificidad química similar.
Procedimiento práctico
Aplicaciones
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Técnicas espectroscópicas
Tipos de Espectroscopía
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La espectroscopia de infrarrojo permite saber la funcionalidad de la molécula, mientras
más proteína se encuentra en una muestra más longitud de onda hay. Los únicos
aminoácidos que son capaces de absorber el infrarrojo son los aromáticos, como la
tirosina, triptófano y fenilalanina.
Región Aplicación
Fenómeno Aplicación analítica
espectro clínica
Cámara gamma
Rayos Relacionados con las (T99),
Radioinmunoensayo
gamma transiciones nucleares destrucción de
tumores
Relacionado con la energía Radiografías,
Cristalografía (difracción de
Rayos X que salta entre los niveles tomografía
moléculas cristalinas)
atómicos internos computada
Relacionado con las
Rayos UV - -
transiciones de ionización
Transiciones de energía de
Rayos UV
valencia (visible 700 a 400 Espectrofotometría -
visibles
nm)
Relacionados con las
Rayos Espectroscopía (análisis
transiciones de vibración -
infrarrojos estructural orgánico)
molecular
Relacionado con las
Rayos de
transiciones de rotación y Resonancia magnética de
microondas Diagnóstico por
spin de electrones proteínas (análisis estructural
imagen
Ondas de Relacionados con el spin orgánico, se observa el protón)
radio nuclear
Espectrofotometría
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Fluorescencia
Es una técnica asociada a moléculas orgánicas con doble enlaces conjugados, ya que
son más reactivas. Cuando se utilizan no se debe medir el espectro de absorción, sino, el
de emisión, ya que al absorber y volver a emitir la energía, lo hace a una longitud de
onda diferente. Es un tipo de espectroscopia de emisión.
Las sustancias que poseen estas características son fluoroforos (fluorocromos), se
utilizan como etiquetas en técnicas citoquímica/histoquímicas. En la aparatología se
utiliza un fluorímetro.
Espectrometría de masa
33
Titulaciones
pH pH pH
34
Solubilidad
pH
Los siguientes compuestos ven afectados su solubilidad cuando hay cambios en el pH:
Hidróxidos: la solubilidad aumenta a medida que aumentan los OH (pH básicos)
por la formación de complejos, y aumenta en pH ácidos. Sin embargo,
disminuye en pH neutros.
pH
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Complejos
Son compuestos formados metales de transición oxidados y metales del grupo 2, unidos
a ciertos ligandos orgánicos o inorgánicos (los cuales deben poseer pares de electrones
no compartidos).
Los ligandos pueden ser:
Monovalentes: poseen 1 par de electrones no compartidos. Se dividen en:
o Sin carga: H₂O, CO⁻, NH₃, entre otros.
Valencia = 1
o Con carga: OH⁻, F⁻, Cl⁻, Br⁻, I⁻, entre otros.
Divalentes: poseen 2 pares de electrones no compartidos. Se dividen en:
o Sin carga: dietilamina.
o Con carga: etilamina. Valencia = 2
Polivalentes: poseen más de 2 pares de electrones no compartidos. Ej. EDTA,
EGTA, etc. Valencia = 6
[𝐶𝑜𝑚𝑝𝑙𝑒𝑗𝑜𝑠]
𝐾𝑓 =
[𝑙𝑖𝑔𝑎𝑛𝑑𝑜]𝑛 [𝑚𝑒𝑡𝑎𝑙]
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Redox
Es una reacción espontánea que implica una oxidación (aumento de NO, pérdida de
electrones, disminución de H) y una reducción (disminución del NO, aumento de
electrones y aumento de H). Siempre van de a pares, si hay una oxidación hay una
reducción y viceversa. Los alcalinos son los compuestos que menos se reducen y el F,
es el que más se reduce.
El potencial estándar de reducción (E°) indica el potencial que tiene un compuesto, en
una hemirreacción, a reducirse (más E° más reducción). Las condiciones normales en
química inorgánica para E° son: 25° C, 1 atm y 1 M). En el caso de ser un compuesto
orgánico son: 25° C, 1 atm, pH 7, 1 M (salvo H que es M= 10⁻⁷). En el caso de ser
compuestos inorgánicos suelen ser valores altos, mientras que en compuestos orgánicos,
son bajos.
Se establece una relación entre el ΔE° y el ΔG°:
ΔE° > 0 y ΔG° < 0 la reacción es espontánea. Cuando se cambia el ° por ‘
ΔE° = 0 y ΔG° = 0 la reacción está en equilibrio. indica que el pH es = a 7.
ΔE° < 0 y ΔG° > 0 la reacción es no espontánea.
𝑅𝑇 [𝑃𝑟𝑜𝑑𝑢𝑐𝑡𝑜𝑠]𝑐𝑜𝑒𝑓 𝑧𝐹ΔE
ΔE = ΔE° − ln Q Q=
𝑍𝐹
[𝑅𝑒𝑎𝑐𝑡𝑖𝑣𝑜𝑠]𝑐𝑜𝑒𝑓 Keq = 𝑒 𝑅𝑇
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Extracción con solvente
[] []
H H
pH 38 pH
pKa pKa
+ soluble - soluble - soluble + soluble
Radioinmunoensayo (RIA)
Técnica cuantitativa desarrollada en los años 60’, superada en la actualidad por técnicas
de fluorescencia. La misma puede compararse o puede ser elaborada.
Se basa en el uso de un isótopo radioactivo y el uso de un anticuerpo.
Ventajas:
o Alta sensibilidad, detección de concentraciones pequeñas desde pocos
moles hasta femto-moles (dado por el uso de isótopos).
o Alta especificidad, por el uso de anticuerpo.
Desventajas:
o Contaminación por el uso de compuestos radioactivos y radiaciones.
o Uso de equipamiento específico caro (centelleo δ y β).
Se fundamenta en la unión antígeno anticuerpo. Se necesita lo siguiente para poder
realizarse:
Molécula no marcada (M).
Molécula marcada radioactivamente o trazador (M*).
Anticuerpo (anti-molécula) que posee igual afinidad por la M* y M.
La reacción necesita un tiempo de incubación determinado, en donde, luego, se va a
comparar la radiación de un tubo con anticuerpo marcado (curva de calibración) con la
molécula marcada. Se debe tener en cuenta que haya una cantidad suficiente de
anticuerpo y de M*.
Marcación
Se utilizan tritón (H³), que posee una VM ≈ 10,5 años, y ¹⁴C, que posee una VM ≈ 4500
años. [VM = tiempo que tarda en caer a la mitad]. Lo ideal es marcarlo con estos dos
para que la afinidad de los compuestos sea igual entre anticuerpo y la molécula sin
marcar.
Para péptidos y proteínas se marca con iodo radioactivo (I ¹²⁵/ I¹³¹), que posee una VM ≈
60 días.
Ventajas: es económico y rápido.
Desventajas:
I. No hay certeza de un cambio conformacional en la proteína en donde
puede haber una pérdida de afinidad entre esta y el anticuerpo.
II. VM del isótopo corta.
III. Radiólisis: descomposición de la molécula a una velocidad rápida.
IV. En cuanto a centello se utiliza el δ, que penetra en todo menos en el
plomo, lo que puede producir contaminación.
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Construcción de experimento
M M M
B Ac Ac
M* M* M* M*
logit 𝐵
𝐵 <1
𝐵𝑜
𝑙𝑜𝑔𝑖𝑡 = ln ( 𝐵𝑜 )
𝐵
1 − 𝐵𝑜
La pegada disminuye
log M
La variabilidad entre días es alta, por eso todas las muestras a comparar deben realizarse
el mismos día, para que tenga igual pendiente y ordenada al origen.
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Método de separación 𝑀 + 𝐴𝑐 ↔ 𝑀 − 𝐴𝑐
= afinidad
𝑀 ∗ + 𝐴𝑐 ↔ 𝑀 ∗ −𝐴𝑐
Se establece el siguiente equilibrio:
en donde, luego de la incubación, se separa lo que se unió de lo que no se unió (se
separa lo unido de lo libre). Para eso se utilizan las siguientes técnicas:
Generales: son las más utilizadas y se dividen en:
o Técnicas inespecíficas de precipitación de proteínas: se debe tener en
cuenta que la muestra que queremos analizar no debe ser una proteína,
pues precipitaría junto con lo que queremos separar. Se utiliza alcohol +
albúmina como carrier, junto con una solución saturada de sulfato de
amonio (NH₄)₂SO₄, el cual posee una solubilidad alto por lo que se
pueden alcanzar concentraciones altas y por acción del salting out las
proteínas precipitan. Se precipita el Ac + el producto de las reacciones,
pero sólo interese M*.
o Carbono dextrano: es utilizado con moléculas pequeñas y no proteicas
(hormonas, esteroides, neurotransmisores), ya que posee una gran
adsorción por estas. La diferencia con los otros métodos es que mide la
M libre, no la que se encuentra con el anticuerpo.
Específicas: en donde se agrega un segundo anticuerpo anti-anticuerpo primario
formándose una red. Se precipita el Ac + el producto de las reacciones, pero sólo
interese M*.
Control de calidad
Una pendiente ideal es de -2,3 y de 45°, porque si tengo una pendiente muy
chica, una variación en el ln me da como resultado un cambio muy grande.
La variación de la curva de M puede ser desde 1 hasta 1000 pg (3 órdenes de
diferencia).
Es un método que se basa en las cpm.
La variabilidad interensayo debe ser más chica que el 5%, y la variabilidad
intraensayo debe ser menor al 1%.
En el blanco o pegada inespecífica hay un % de radioactividad producido por
varios motivos y por lo tanto, se debe restar ese % a la totalidad de los tubos.
La pegada máxima debe oscilar entre un 20% y 30%.
Resultados
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Cuantificación de drogas en muestras por HPLC
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Un cromatograma mide el analito de la HPLC graficados como “picos”. Cabe destacar
las siguientes características:
o Mientras más altos o con una mayor área, indican mayor cantidad de analito.
o Mientras más agudo el pico hay una mayor resolución con un menor error. +
especificidad, + selectividad y + efectividad.
o La sensibilidad es la menor concentración de un compuesto que puede ser
detectado en una muestra. A ese valor se lo denomina “limite de cuantificación”
(LOQ).
o El frente de solvente es la cantidad de eluyente en el que se encuentra el analito
de la muestra que no se une a la FF.
Existen métodos para mejorar el cromatograma:
Programación de solvente: se programa la cantidad de volumen de solvente
dispensado para acortar los tiempos muertos en la HPLC.
Gradiente de elución: se cambia la composición de la FM (a baja y alta P), para
separar los picos.
Columnas
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Fase móvil
La misma debe ser pura con baja viscosidad, sin ninguna reacción con el
empaquetamiento de la columna (pH compatible con esta) y compatible con el detector
(concentración del solvente compatible). Además debe disolver la muestra y permitir su
recuperación siendo libre de burbujas. Se debe tener en cuenta estos aspectos:
Eficiencia: capacidad de elución con el mínimo de dispersión del analito.
Selectividad: habilidad del sistema para separar los picos.
Detectores
Matriz biológica
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3. Concentración del extracto para incrementar la señal.
4. Cuantificación del analito con metodología válida.
Existen los siguientes métodos de purificación:
Precipitación proteica: desnaturalización y precipitación de las proteínas
(plasmáticas) con la consecuente liberación de la droga unida a proteínas. Tiene
las desventajas de ser: poco selectiva y se diluye la muestra (alto LOQ).
Extracción líquido-líquido: se requiere que los dos líquidos que se ponen en
contacto sean inmiscibles (FA y FO). La preparación de la muestra se realiza:
(1) Elección del solvente adecuado.
(2) Fuerza iónica/pH.
(3) Re-extracción.
Tiene la ventaja de que hay una concentración de la muestra.
Tiene como desventajas que:
o Formación de emulsiones.
o La recuperación puede ser baja.
o Se necesita de un laboratorio apropiado.
o Laborioso.
o Reproductibilidad.
Extracción liquido-sólido (SPE): es el equilibrio del analito entre dos fases, FM
líquida (muestra), FF (sólida). Tiene los siguientes pasos:
(1) Acondicionamiento de la FF.
(2) Retención del analito en la FF.
(3) Lavado de componentes no deseados.
(4) Elución del analito.
(5) Evaporación/concentración.
Su principal desventaja es que es caro y laborioso.
Exacto y Preciso y no
preciso exacto
No exacto y Exacto y
no preciso no preciso
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Los parámetros de validación son:
1. Selectividad/Especificidad: Es la capacidad del método para diferenciar y
cuantificar el analito de interés respecto de otras sustancias que puedan estar
presentes en la muestra (metabolitos, sustancias endógenas).
2. Sensibilidad o límite de cuantificación (LQ): es la capacidad del método para
detectar y cuantificar el analito de interés. Se determina el límite de
cuantificación que es la menor concentración del analito en estudio que puede
cuantificarse con precisión y exactitud.
3. Exactitud: describe la proximidad de los resultados obtenidos a partir del
método analítico respecto del valor verdadero. Se determina para cada nivel de
concentración y se mide con:
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