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Los ácidos nucleicos fueron descubiertos por Freidrich Miescher (foto de la izquierda) en 1869. Este
enlace te lleva a una excelente animación (la número 15) de cómo fueron descubiertos.
Hay 2 tipos de ácidos nucleicos (AN): el ácido desoxirribonucleico (DNA) y el ácido
ribonucleico (RNA), y están presentes en todas las células. Su función biológica
no quedó plenamente demostrada hasta que Avery y sus
colaboradoresdemostraron en 1944 que el DNA era la molécula portadora de la
información genética.
Los AN son polímeros lineales en los que la unidad repetitiva,
llamada nucleótido (Figura de la derecha), está constituída por: (1) una pentosa
(la ribosa o la desoxirribosa), (2) ácido fosfórico y (3) una base nitrogenada (purina
o pirimidina). La unión de la pentosa con una base constituye un nucleósido (zona
sombreada de la figura). La unión mediante un enlace éster entre el nucleósido y
el ácido fosfórico da lugar al nucleótido.
RNA
LAS PENTOSAS
Las bases púricas tienen la estructura fundamental del heterociclo purina. Las bases púricas que se
encuentran en los ácidos nucleicos (tanto DNA como RNA) son la adenina y la guanina.
Purina bases púricas (DNA y RNA)
Las bases pirimidínicas derivan del anillo de pirimidina. Las bases pirimidínicas que aparecen en el RNA
son uracilo y citosina, mientras que en el DNA encontramos timina y citosina (Ver tabla).
bases pirimidínicas
Pirimidina
Sólo en el DNA En DNA y RNA Sólo en el RNA
Las bases nitrogenadas tienen poco interés bioquímico como sustancias libres, salvo en las vías
biosintéticas y degradativas de los ácidos nucleicos. El ácido úrico (Figura de la derecha) es un derivado
púrico que constituye el producto final de la degradación de purinas. Normalmente se elimina por la orina,
pero en circunstancias patológicas puede cristalizar originando cálculos renales o la gota.
NUCLEÓSIDOS
Los nucleósidos tienen poco interés bioquímico como sustancias libres, salvo en las vías
biosintéticas y degradativas de los AN. Una excepción importante es la S-adenosilmetionina (SAM). La
SAM se forma por condensación de adenosina y metionina. Es un agente metilante muy enérgico. La
figura de la derecha representa la molécula de SAM sin los átomos de hidrógeno. El carbono del grupo
metilo que es transferido por SAM está representado como una bola de color verde.
NUCLEÓTIDOS
Los nucleótidos son ésteres fosfóricos de nucleósidos. El ortofosfato se encuentra esterificado
normalmente a los hidroxilos en posición 3' y 5', aunque excepcionalmente también pueden hacerlo en 2'.
Es precisamente este grupo fosfato el que confiere carácter ácido a la molécula. Los nucleótidos se
representan con la letra mayúscula correspondiente al nucleósido del que derivan más la letra
pminúscula, que repesenta al grupo fosfato. La letra p se antepone a la letra mayúscula de la base si el
fosfato está esterificado en posición 5', y se pone detrás si el fosfato está esterificado en posición 3'. Por
tanto, el símbolo pA denota la adenosina-5'-fosfato, y el símbolo Ap a la adenosina-3'-fosfato.
A veces, los nucleótidos contienen más de un grupo fosfato, unidos entre sí mediante un enlace
anhidro. En este caso, cada grupo fosfato se representa por una letra p. De esta forma, pAp representa a
la 5', 3'-adenosina difosfato, ppA representa a la adenosina-5'-difosfato (ADP) y pppA a la adenosina -5'-
trifosfato (ATP) (Figura de la derecha). Cuando los nucleótidos contienen más de una molécula de ácido
fosfórico, como en el caso de la adenosina-5'-trifosfato (ATP, pppA), las 3 moléculas de ácido fosfóricos
se distinguen mediante los prefijos a, b y g (Figura de la derecha). Para que un nucleótido se pueda
incorporar a una cadena naciente de polinucleótido, éste debe estar en forma trifosfato.
Los nucleótidos, además de integrar las cadenas de AN también desempeñan importantes funciones
biológicas en estado libre.
Naibelyn
POLINUCLEÓTIDOS
RNA
Es el AN más abundante en la célula, y puede purificarse fácilmente. Una célula
típica contiene 10 veces más RNA que DNA. El azúcar presente en el RNA es la ribosa.
Esto indica que en la posición 2' del anillo del azúcar hay un grupo hidroxilo (OH) libre. Por
este motivo, el RNA es químicamente inestable, de forma que en una disolución acuosa
se hidroliza fácilmente. En el RNA la base que se aparea con la A es U, a diferencia del
DNA, en el cual la A se aparea con T. En la mayor parte de los casos es un polímero
monocatenario, pero en ciertos casos puede presentar zonas en su secuencia
con apareamientos intracatenarios (Figura animada de la derecha). Según las
modernas teorías sobre el origen de la vida, parece bastante probable que el RNA fuese el primer
biopolímero que apareció en la corteza terrestre durante el transcurso de la evolución.
Se distinguen varios tipos de RNA en función, sobre todo, de sus pesos moleculares:
RNA
RNA heterogéneo nuclear (RNAhn) RNA pequeño nuclear (RNAsn)
transferente (RNAt)
En células procariotas, el transcrito primario actúa directamente como molde para la síntesis de
proteínas. En el núcleo de las células eucariotas actúa como precursor de los demás tipos de RNA que
se encuentran en el citoplasma. La fragmentación del RNAhn para formar otros tipos de RNA constituye la
maduración o procesamiento del RNA (figura inferior).
RNA PEQUEÑO NUCLEAR (RNAsn)
Las moléculas de RNA transferente (RNAt) tienen entre 75 y 90 nucleótidos, y su peso molecular es
de unos 25000 dalton. Se conocen unos 60 RNAt distintos, y se encuentran en todas las células.
Intervienen en la síntesis de proteínas, ya que van unidos a un aminoácido. Pueden
presentar nucleótidos poco usuales (ácido pseudouridílico, ácido inosílico) e incluso bases
características del DNA como la timina. Su estructura secundaria presenta un plegamiento complejo en
donde alternan zonas apareadas y zonas no apareadas, y en donde se pueden distinguir zonas críticas,
como la zona de unión a aminoácidos y la zona que reconoce los codones del RNAm (Figura inferior
izquierda).
Estructura
Estructura secundaria del RNAt
terciaria del RNAt
Crisbal
RNA RIBOSÓMICO (RNAr)
En eucariotas, el RNAm maduro presenta unas características especiales, ya que además de los
codones de iniciación (AUG) y de terminación (UAG) presenta en su extremo 5' una estructura compleja
llamada "capucha" (cap), y en su extremo 3' una cadena de poliA de longitud variable. Estas
modificaciones tienen por objeto aumentar la vida media de estas moléculas en el citoplasma.
El RNA vírico (RNAv) es el que consituye el patrimonio genético de ciertos virus como el bacteriófago
MS2, el virus del mosaico del tabaco, el poliovirus, el virus de la rabia, el virus de la gripe o el virus del
SIDA. Los virus cuyo patrimonio genético es una molécula de RNA se llaman retrovirus, y su hallazgo
supuso replantearse el dogma central de la biología:
estudios físicos con el DNA mediante la técnica de difracción de rayos X y concluyeron que (1) la molécula de DNA
das con los planos separados por una distancia de 3,4 Å.
nº 51" obtenida por Rosalind Franklin (1920-1958) y las conclusiones que se pudieron extraer de ella.
uímicos y
n en la
mérito de
ento para
rtículos (pincha en los iconos pdf para ver los artículos originales):
n, en el que se interpretaban los patrones de difracción de Rayos-X. Maurice Wilkinks (1916-2004) compartió con
Los pares de bases están formados siempre por una purina y una pirimidina, de forma que ambas
cadenas están siempre equidistantes, a unos 11 Å una de la otra. Los PB adoptan una disposición
helicoidal en el núcleo central de la molécula, ya que presentan una rotación de 36º con respecto al par
adyacente, de forma que hay 10 PB por cada vuelta de la hélice. La A se empareja siempre con la T
mediante dos puentes de hidrógeno (En verde en la Figura de la izquierda), mientras que la C se
empareja siempre con la G por medio de 3 puentes de hidrógeno (En verde en la Figura de la
derecha).
El apareamiento de bases es una de las características más importantes de la estructura del DNA
porque significa que las secuencias de bases de ambas hebras son complementarias (Figura inferior).
Este hecho tiene implicaciones muy profundas con respecto al mecanismo de replicación del DNA, porque
de esta forma la réplica de cada una de las hebras obtiene la secuencia de bases de la hebra
complementaria.
En cada extremo de una doble hélice lineal de DNA, el extremo 3'-OH de una de las hebras es
adyacente al extremo 5'-P (fosfato) de la otra. En otras palabras, las dos hebras son
antiparalelas(Figura superior), es decir, tienen una orientación diferente. Por convención, la secuencia
de bases de una hebra sencilla se escribe con el extremo 5'-P a la izquierda.
La doble hélice es dextrógira. Esto quiere decir que si alguien mira al
eje de la hélice hacia abajo, en cualquier dirección, cada una de las hebras
sigue una trayectoria en el sentido de las agujas del reloj al alejarse del
observador. La hélice presenta dos tipos de surcos helicoidales externos,
unos son anchos y profundos (surcos mayores) y otros son estrechos y poco
profundos (surcos menores). Los dos tipos de surcos son lo suficientemente
amplios como para permitir que las moléculas proteicas entren en contacto
con las bases (Figura de la derecha).
Esta estructura descrita por Watson y Crick es la que adopta el DNA en condiciones de humedad
elevada (92% de humedad relativa) y corresponde al B-DNA. Sin embargo, el DNA puede adoptar otras
estructuras:
A-DNA: Es la estructura que adopta cuando está menos hidratado (65-75% de humedad
relativa). En este caso, el diámetro de la molécula es mayor y los pares de bases están más juntos
y ya no son perpendiculares al eje de la molécula, sino que adoptan un ángulo de unos 20º.
Z-DNA: Es una estructura que se encuentra cuando alternan purinas y pirimidinas en la
secuencia. En este caso, el diámetro de la molécula es menor y las cadenas principales de la
molécula discurren en "zig-zag" (de ahí su nombre) con una trayectoria levógira.
Cuando se calienta un DNA de doble hebra (forma nativa) se rompen las fuerzas de unión entre las
dos hebras y acaban por separarse. Por tanto, el DNA desnaturalizado es de una sola hebra. La transición
entre el estado nativo y el desnaturalizado se conoce como desnaturalización. En determinadas
condiciones, una disolución de DNA monocatenario (desnaturalizado), puede volver a formar el DNA
nativo (de doble hebra). Este proceso recibe el nombre de renaturalización del DNA. Cuando el DNA
renaturalizado se forma a partir de moléculas de DNA de distinto origen, o entre una molécula de DNA y
otra de RNA, la renaturalización se conoce como hibridación.
La forma más corriente de desnaturalizar el DNA es por calentamiento. Otro agente desnaturalizante
es el pH elevado porque cambia la carga de algunos grupos que forman parte de los puentes de
hidrógeno. En agua destilada (con una fuerza iónica muy reducida) se produce la separación de las
hebras. Este fenomeno se debe a que en agua muy pura, la fuerte repulsión entre las cargas negativas
de los grupos fosfato no es contrarrestada por los correspondientes contraiones (Na+, Mg+2).
La gráfica que representa la medida de A260 en función de la temperatura se llama curva de fusión
del DNA (Figura inferior). Esta curva presenta las siguientes características:
1.- La A260 permanece constante
hasta temperaturas bien por encima de las
fisiológicas. En este intervalo, la molécula
está en forma de doble hebra.
2.- El aumento de A260 tiene lugar en
un estrecho rango de temperaturas (6-8
ºC). La A260 empieza a aumentar cuando
comienzan a romperse las uniones entre
las bases en varios segmentos de la
molécula. El número de PB que se
rompen aumenta con la temperatura, y
con ella la A260. Al final del tramo
ascendente, las dos hebras se mantienen
juntas por unos cuantos PB.
3.- La A260 máxima es
aproximadamente un 37% mayor que el
valor inicial, y corresponde al estado en
que las dos hebras están completamente
separadas.
Los
neumococos de
tipo R (rugoso)
forman colonias de
aspecto rugoso
sobre un medio
sólido, y son poco
virulentos.
Los
neumococos de
tipo S (liso) forman
colonias de
aspecto liso y
brillante sobre un
medio sólido, y
provocan
infecciones letales.
Los
neumococos de
tipo S (liso)
provocan
infecciones letales,
pero son sensibles
al calor. Si se
inyectan al ratón
neumococos de
tipo S que han sido
calentados, el
animal sobrevive.
Si se inyectan
a un ratón
neumococos vivos
de tipo R y
neumococos
muertos de tipo S
(ninguno de los
dos es letal por
separado) se
produce la muerte
del ratón. En los
ratones muertos se
encontraron
neumococos vivos
del tipo S que, a su
vez, eran capaces
de infectar a otros
ratones: el cambio
que se había
producido era
estable y era
heredado por la
descendencia
Griffith concluyó que un "FACTOR DE TRANSFORMACIÓN" había sido transferido desde los
neumococos S muertos a los neumococos R vivos. Este factor de transformación convirtió a los
neumococos R en neumococos S con la cápsula de polisacáridos que les hace letales.
Para ello:
Trataron los pneumococos S muertos por calentamiento con detergente para obtener un lisado
celular (un extracto libre de células que contenía el FT). Este lisado contiene (entre otras cosas) el
polisacárido de la superficie celular, las proteínas, el ARN y el ADN de los neumococos S.
Sometieron al lisado a diversos tratamientos enzimáticos
Inyectaron en ratones los neumococos de tipo R vivos junto con una fracción del lisado modificada
enzimáticamente
Los resultados de sus experimentos se reflejan en la siguiente tabla:
El FT está
Ninguno
presente en el lisado
El FT no era el
Se añadió la enzima SIII,que polisacárido que
degrada la cápsula de polisacárido estaba presente en el
lisado
Al extracto de ácidos
nucleicos anterior se le añadió la
FT = ADN
enzima ADNasa (que degrada el
ADN)
Esta serie de experimentos demostró que la naturaleza química del factor de transformación (la
información genética capaz de convertir neumococos R en nuemococos S) era un DNA y no una proteína
como se sospechaba en aquella época.
BACTERIÓFAGOS
Las células hijas deben tener la misma dotación genética que su progenitora.
Para obtener esta duplicación exacta, basta la separación de las dos cadenas de
la doble hélice progenitora (en azul en la figura de la derecha) y la síntesis de las
hebras complementarias (en color rosado en la figura).
En 1958, Meselson y Stahl realizaron un experimento en el que demostraron
que la replicación del DNA se ajustaba al modelo de replicación
semiconservativa(separación de las hebras y síntesis de las complementarias).
Pincha aquí para ver una animación sobre el experimento.