TAMIZADO VIRTUAL DE POSIBLES INHIBIDORES DE LA PROTEASA NS2B-NS3

DEL VIRUS DEL DENGUE

Miguel Fernándeza, Maria Luisa Serranob

a
Laboratorio de Química Computacional, Centro de Química “Dr. Gabriel Chuchani”,
Instituto Venezolano de Investigaciones Científicas (IVIC), Altos de Pipe, Miranda-
Venezuela.
b
Unidad de Química Medicinal, Facultad de Farmacia, Universidad Central de
Venezuela, Caracas-Venezuela
miguel2158@gmail.com

RESUMEN

El dengue es una enfermedad viral que afecta a países como Venezuela cuyo entorno
favorece a la vida y reproducción de los mosquitos Aedes aegypti y Aedes albopictus,
vectores de este virus. A pesar de los numerosos estudios realizados hasta la fecha, no
se ha encontrado una droga efectiva contra esta enfermedad. Sin embargo, se ha
puntualizado que la proteasa NS2B-NS3 de este virus es un potencial blanco
terapéutico y donde compuestos con un centro quinolinico ejercen una actividad
prometedora. Por otro lado, el grupo Medicines for Malaria Venture ha desarrollado
Pathogenbox, una librería de compuestos con características drug-like y lead-like
disponibles para ser evaluados contra enfermedades desatendidas, incluyendo el
dengue. En esta dirección, se propone el tamizado virtual basado en estructura para
determinar compuestos que presenten un alto ΔG de interacción con un modelo de la
proteasa NS2B-NS3 del virus del dengue (PDB: 2FOM) usando dos bases de datos, la
primera formada por los compuestos de pathogenbox, y la segunda creada a partir de
una búsqueda por similaridad en las páginas web de PubChem y Zinc15 de
compuestos activos con centros quinolinicos reportados en la literatura. El docking
molecular se ejecutó con el programa AutoDock dentro del programa VegaZZ y los
análisis se hicieron con el programa Discovery Studio Visualizer y un script desarrollado
por nosotros.
El docking molecular revela cuatro compuestos con constates de inhibición teórica
inferior a 1 µM, tres de Pathogenbox (MMV020623, MMV688407 y MMV688361) y uno
de Zinc15 (ZINC000015785651). El análisis de poses muestra que hay una diferencia
importante entre la pose con el ΔG más negativo y las obtenidas en el resto de los
docking para la mayoría de los compuestos. Este resultado probablemente se relacione
a la forma del sitio activo de la proteasa, el cual ha sido descrito como plano en la
literatura. Estos resultados brindan una oportunidad de estudio de compuestos
accesibles con una posible actividad contra el virus del dengue

Palabras Clave: Proteasa NS2B-NS3 del dengue, tamizado virtual.