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INTRODUCCIÓN
II. OBJETIVOS
Objetivo general
Estudiar, analizar e interpretar la biosíntesis de proteínas.
Objetivo específico:
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III.MARCO TEÓRICO
1. BIOSINTESIS DE PROTEÍNAS
La biosíntesis de proteínas constituye en un proceso indispensable para
promover a la célula de esas moléculas tan importantes para la vida. Este
proceso es uno de los mecanismos biológicos sintéticos más complejos que
existen.
La síntesis proteica ocurre gracias a la disponibilidad de aminoácidos libres que
provienen de la dieta o del recambio proteico que se da en el organismo.
DESCRIPCIÓN DEL DIBUJO:
El proceso de síntesis de las proteínas se inicia en el núcleo de la célula, ya que
es el lugar donde se encuentra el ADN que tiene la información necesaria para
ello. De allí es trasmitida a través del ARN mensajero, y es transportada al
ribosoma de la célula, por medio del ARN de trasferencia al ARN ribosomal, que
ayuda a armar la proteína incorporando aminoácidos a la cadena que luego será
la proteína.
3. CÓDIGO GENÉTICO
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B. Código abreviado
Con el objetivo de ahorrar espacio, las secuencias largas de aminoácidos se
designan con las abreviaturas de una sola letra.
C. Marcos de lectura superpuesto
Marco de lectura es una secuencia de nucleótidos que va desde el codón de
iniciación hasta un codón de terminación. El intervalo que queda entre los
codones de iniciación el intervalo que queda entre los codones de iniciación y
terminación que contiene la información genética se llama marco de lectura
abierto (ORF, open reading frame). Un ORF no contiene más de un codón de
terminación. Los marcos de lectura normales no se superponen. De los tres
Marcos de lecturas posibles A, B o C, sólo uno es correcto (el marco de lectura
abierto A). Los marcos de lectura B y C son interrumpidos por un codón de
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Proteína N-t Tyr Ala Gly Lys Ser Ile Leu Cys C-t
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FIGEberhard Passarge
5. CLASIFICACION DE ACIDOS NUCLEICOS
5.1ADN
Un aspecto bioquímico fundamental, común a todos los organismos
formados por células, es la utilización de ADN como almacén de la
información genética. El descubrimiento de que el ADN desempeña una
función crucial tuvo lugar en los estudios sobre bacterias en la década de los
cuarentas. Este hallazgo es seguido del descubrimiento de la estructura
tridimensional de ADN en 1953, un hech0 que sentó las bases para muchos
avances en bioquímica y otros muchos campos, hasta el momento presente.
La estructura del ADN ilustra con brillantez un principio básico común a todas
las biomoléculas: la estrecha relación entre la estructura y relación. Las
extraordinarias propiedades de esta sustancia química le permiten funcionar
como un vehículo robusto y eficiente en el almacenamiento de la información.
Comenzaremos con un análisis covalente del ADN y su extensión en las tres
dimensiones.
El ADN está constituido por cuatro tipos de precursores:
El ADN es un polímero lineal formado por cuatro, monómeros distinto. Posee
un esqueleto fijo del cual sobresalen distintos sustituyentes. Este esqueleto
esta constituido por unidades repetitivas de azúcar-fosfato. Los azucares son
moléculas de desoxirribosa que dan nombre al ADN. Cada azúcar, cada
azúcar está unido a dos grupos fosfato mediante diferentes enlaces. Además
cada azúcar está orientado de la misma manera, de modo que cada hembra
de ADN es polar, con un extremo diferenciado de otro. A cada desoxirribosa
se puede unir una de estas cuatro bases: adenina (A), citocina (C), guanina
(G) o tiamina (t)
DESCRIPCIO DEL DIBUJO:
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FIG. ADN
6.REPLICACION DE ADN
La replicación del ADN implicando moléculas loneales, pero también es
importante conocer cómo se replica las moléculas de ADN circulares de
cadenas doble. Los estudios de Cairns sobre la replicación in vivo en E.coly
fueron claves para el conocimiento de este problema. Los estudios de Cains
con el cromosoma de E. coly mostraron que la replicación era
semiconservativa e implicaba una estructura llamada horquilla de replicación,
y que las moléculas del ADN retenían su circularidad mientras estaban siendo
replicadas. La técnica empleada fue la autorradiografia. Cultivo a E. coly es
un medio con timidina-H y analizo los cromosomas durante diferentes
estadios de la replicación.
DESCRIPCIÓN DE LA FIGURA:
ORIGEN DE LA REPLICACION
Los experimentos de Cainns originaron una serie de preguntas. Por ejemplo,
¿ la replicación comienza en un punto determinado del cromosoma E.Coly o
puede comenzar en cualquier parte ?¿ es unidireccional o bidireccional la
replicación?- esto hizo que se hicieran una serie de experimentos
encaminados a una serie de problemas. En un experimento, Inman
desnaturalizo parcialmente al ADN, exponiéndolo a un pH elevado. Las
regiones ricas en pares AT se desnaturalizaban primero, porque los pares AT
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FIG.origen de la replicación
La localización relativa de estas burbujas era constante para cualquier ADN
de una especie. Las burbujas se utilizaron ahora como puntos de referencia
durante el examen de la molécula de DNA replicándose. Inman aislo el ADN
del bacteriófago en varios momentos de su replicación y lo desnaturalizo para
formar las burbujas. Si la replicación comenzaba en un sitio especifico y
procedía unidireccionalmente, debería cambiar la posición de la horquilla de
replicación relativa a las burbujas de refencia a medida que prosiguiera la
replicación.
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Las pruebas apoyan a este último modelo, sugiriendo que hay un puente
específico para comenzar la replicación, con dos puntos de replicación
moviéndose direccionalmente desde este punto.
El retículo endoplasmático Birds y sus colaboradores realizaron una
interesante experimento para confirmar estos resultados. Estudiaron las
cantidades relativas de diferentes genes de E. coli en condiciones en las que
las células estaban sintetizando su DNA a la máxima velocidad.
Consideremos dos genes, X e Y. supongamos que la replicación comience
en un sitio único y que es bidireccional. Si X está cerca del origen e Y cerca
del fin, entonces, en cualquier momento deberá haber doble número de
copias del gen X.(John B. Jenkins; 1985)
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polimerasa III extiende ahora esas cadenas y cuando se han sintetizado los
fragmentos de Okazaki, los fragmentos de ARN que han servido de
cobadores son eliminados por el ADN polimerasa I y, finalmente, el ADN
ligasa une los fragmentos unos con otros.
Un modelo interesante para la replicación de las moléculas del ADN circular
es el llamado modelo del círculo rodante. Este modelo elimina la necesidad
de un ARN cebador y explica muy bien la replicación de moléculas circulares
y la replicación durante la conjugación.
En un cromosoma como en el T4, la molécula lineal se circularía y luego se
induce un corte en una de las dos cadenas. El extremo 5¨se puede unir a la
membrana celular y las bases nuevas se añaden al extremo 3¨. Al seguir la
replicación, la cadena circular va rodando a medida que se van añadiendo
las bases nuevas. Las proteínas de T4 se van condensando alrededor del
ADN sintetizado, y cuando la cabeza de T4 está completa se corta el ADN.
En un cromosoma de cadena sencilla tal y como el de X174, la replicación
puede proceder de la forma replicativa de cadena doble. La única diferencia
que mostramos es que la formación de una cadena doble se evita por la unión
de proteínas del fago al ADN de cadena sencilla.
5.2. ARN
Según su función que cumplen, existen tres clases principales de ARN:
ARN mensajero (ARN m): es el portador de la secuencia de bases que codifican
la secuencia de aminoácidos de uno o más polipéptidos especificados en un gen
o conjunto de genes. Las moléculas de ARN m sirven como molde para la
síntesis de proteínas y llevan la información desde el ADN hasta los ribosomas.
DESCPCION DEL DEBUJO
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ARN de transferencia (ARN t): el ARN t actúa como un adaptador que lee la
información codificada en el ARN m y transfiere el aminoácido adecuado a la
cadena polipeptídica en crecimiento durante la síntesis de proteínas. Los ARN
se transfieren los aminoácidos específicos desde los “pools” de aminoácidos
solubles a los ribosomas y aseguran el ordenamiento de estos aminoácidos en
la secuencia adecuada antes de la formación del enlace peptídico. Existe, al
menos, un ARN t específico para cada uno de los 20 aminoácidos que forman
las proteínas.
ARN ribosómico (ARN r): los ARN sr forman, junto a las proteínas la compleja
maquinaria que cataliza la síntesis proteica: los ribosomas. Los ribosomas son
partículas subcelulares formados por, al menos tres moléculas diferentes de
ARN r y de 70 a 80 proteínas ribosómicas.
DESCRIPCION DEL DIBUJO.
1. PROCESAMIENTO DE ARN
Gran parte de las moléculas de ARN en procariotas y virtualmente todas
las moléculas de ARN de eucariotas son modificadas en mayor o menor
grado después de su síntesis. Una molécula de ARN recién sintetizada se
llama transcrito primario y este debe ser modificado posteriormente para
dar una molécula de ARN madura, funcionalmente activa.
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Las reacciones que dan lugar a las formas maduras de ARN comprenden:
Adición de secuencias o nucleótidos no codificados por los genes
correspondientes.
2. ARN MENSAJERO
Los ARN m son los portadores directos de la información genética desde
el núcleo a los ribosomas. Son productos de la transcripción del ADN
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GIRASAS
Son las únicas enzimas que introducen vueltas superhelicoidales negativas en
el ADN relajado. Estas enzimas son solo bacterianas. No se ha encontrado
ninguna enzima análoga en eucariotas. Las eucariotas usan el enrollamiento del
ADN alrededor de proteínas cromosómicas para introducir superhelicoidal
negativas en el ADN relajado. La girasa introduce vueltas super helicoidales
negativas en el ADN en una velocidad de unas 100por minuto. La regulación de
la superhelicidad en la célula requiere la participación tanto de la actividad de la
topoisomerasa II/grasa como de la topoisomerasa 1. El equilibrio entre dos
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El ARN suele tener una sola hélice o cadena de nucleótidos pudiendo formar una
amplia gama de estructuras tridimensionales diferentes. El ARN contiene como
azúcar a la ribosa y las bases nitrogenadas mayoritarias que posee son adenina
(A), guanina (G), citosina (C) y uracilo (U). Por tanto, el uracilo (U) es
característico del ARN. También se han encontrado bases poco frecuentes que
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forman parte del ARN, como son: la pseudouridina (ψ), metilguanosina (mG),
dimetilguanosina (m2G), metilinosina (mI) y dihidrouridina (DHU, UH2).
En las células existen diferentes tipos de ARN. Por un lado están los ARN
funcionales, o ARN que tienen una función o actividad en la célula y que no se
traducen a proteína. Dentro de esta categoría están el ARN ribosómico (ARN-r)
que forma parte de los ribosomas que intervienen en la traducción, los ARN
transferentes (ARN-t) cuya función es transportar a los aminoácidos durante el
proceso de traducción, los ARN nucleares pequeños (ARN-np) que
interaccionan con proteínas formando los complejos de ribo nucleoproteínas
necesarios para el procesamiento de los transcritos en el núcleo y los ARN
citoplásmicos pequeños (ARNcp) que intervienen en el trasporte de los
polipéptidos en las células eucarióticas.
Por otro lado, están los ARN informativos que son los que se van a traducir a
proteínas. Estos ARN informativos son los ARN mensajeros (ARN-m). En
bacterias el transcrito primario, tal y como se sintetiza ya es el ARN-m maduro
que se traduce a proteínas. En eucariontes, el ARN recién transcrito se
denomina ARN heterogéneo nuclear (ARN-hn) y es un pre-ARN-m que es
procesado antes de convertirse en el ARN-m maduro que posteriormente se
traducirá a proteína. En bacterias, existe solamente una ARN polimerasa que es
capaz de sintetizar todos los tipos de ARN, el ribosómico, el transferente y los
mensajeros.
B.CARACTERÍSTICAS DE LA TRANSCRIPCIÓN:
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FIG:
https://webs.ucm.es/info/genetica/grupod/Transcripcion/Transcripcion.htm
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3.1.2.4. Ribosomas
Son orgánulos celulares de provistas de membrana, constituidos en su mayor
parte por diferentes tipos de ARN ribosomático(ARNr) y proteínas que actúan
como en realidad, como un sistema multienzimatico que dirige el proceso de
síntesis de proteínas enlace. En las células procariotas tiene un coeficiente de
sedimentación de 70s y está formado por dos subunidades, una grande y otra
pequeña, de 30s y 50s, respectiva. La pequeña está constituida por una ARNr
16s y 21 proteínas que se identifican de la s - 1 a s -21. Unidad grande la forman
dos tipos de ARNr, 5s y 23 s, proteínas que se conocen cómo l - 1 a - 34. En
cada una de ella se localiza puntos críticos donde tiene lugar los diferentes pasos
de la síntesis de proteínas. En la porción pequeña, se localiza el punto de Unión
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del ARNm, al extremo 3" de la cadena de ARNr, 16s. en esta misma subunidad,
es una hendidurq a se situa el punto de union de los ARNt. la subunidad 50s
muestra 3 protuferancias. entre dos de ellas se localiza la actividad
peptidiltransferasa, que se encarga de la formacion del enlace peptidico entre los
aminoacidos, y en la tercera de aspecto mas estlizxado, se situa el centro
GTPasa, que se encarga de dirigir los desplazamientos de ARNm y de
transferentes. ambas subunidades tienen, por lo tanto forma irregulas, de m,odo
que, cuando se acoplan, dejan entre ellas una hendidura en la que se inserta en
ARNm durrante la traduccion, el cual es leido en direccio 5"- 3". el el ribosoma
se delimitan dos regiones en las que participan ambas subunidades, el lugar
aminoacilo o locusA , donde se priduce la incorporacion de los diferentes
aminoacil-ANRt durante kla sintesis de la cadena polipetidica y el peptidilo o
locusP, en las que se encuentra el ARN inmediato anterior unido a la cadena
polipetidica en formacion a la espera de la incoporacion de un nuevo
transferente.
en eucaiotas los ribosomas son mayores, con un coeficiente de sedimentacion
80s, exceptuando los de la mitocondria y cloroplastos que mantienen
caracteristicas similares a las de las procariotas. poseen tambien dos
subunidades, la menor de 40s contiene ARNr 18s, y la mayor 60s,con ARNr 5s,
5,8s y 28s, y en ellos ta,bien se delimitan regiones A y P con funciones
especificas durante la sintesis de proteinas.( Donald Voet, Judith G
Voet, Charlotte W. Pratt,2007)
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3.2.2.2. La traducción
3.2.2.2.1. Inicio de la formación de la cadena polipeptídica.
Resulta ser la unión del ARNt iniciador a una señal de inicio del ARNm.
La señal de comienzo sobre el ARNm es el codón AUG que esta
precedido por una secuencia rica en purinas y que pueden aparearse con
el ARNr de 16S localizado en la subunidad ribosomal 30S. El ARNt
iniciador, ocupa un sitio en el ribosoma que se denomina sitio peptídico
(sitio P).q2z
La biosíntesis de un péptido comienza por el extremo amino terminal, es
decir por el aminoácido con el grupo amino libre.
Para el proceso de iniciación se requiere:
Un ribosoma separado en sus subunidades mayor y menor.
Un RNAm que contenga las secuencias de nucleótidos específicos para
la iniciación: una para emparejarlo con el RNAr y otra para emparejarlo
con el ARNt. Esta última secuencia suele ser el codón AUG.
Un ARNt, ya que el primer aminoácido de la cadena siempre es MET. En
procariotas esta primera metionina está formulada (fMed).
Unas proteínas llamadas factores de iniciación (IF).
GTP como fuente de energía libre.
Todos estos elementos se combinan, siguiendo una secuencia determinada
(ligeramente distinta en procariotas y en eucariotas) para dar el llamado
complejo de iniciación, que comprende el ribosoma completo, el RNAm y el
Med-RNAt.
Un complejo ternario(paso 1) se combina primero con la subunidad
ribosómica pequeña para colocar el RNAt iniciador(paso 2).A continuación la
interaccion con el RNAm forma un complejo de primiciacion (paso 3). La
unión de la subnidad grande completa la formación del complejo de
iniciación(paso).
La distinta forma del elF-2ª en los complejos con GTP y GDP indica el cambio
conformacional que tiene el lugar en la proteína tras la hidrolisis del triofosfato
. una vez iniciada la elongación, subunidasdes adicionales se unen al mismo
RNAm a medida que se unen los polisomas.
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FIG:
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3.2.2.3.1. Maduración
El péptido ha sintetizado una serie de procesos de maduración hasta
convertirse en una proteína funcional, entre ellos tenemos:
Deformilación del extremo amino y otras modificaciones de los
extremos amino y carboxilo
Perdida de determinadas secuencias, en general de unas
decenas de aminoácidos, por medio de peptidasas específicas
.Este es uno de los pasos para la conversión de zimógenos de
enzimas y pro-hormonas en hormonas.
Modificación de las cadenas laterales de ciertos aminoácidos,
por fosforilación, carboxilación, metilación. hidroxilación, etc.
Unión de grupos prostéticos, como azúcares, lípidos y hemo.
Además de estas modificaciones químicas el péptido recién sintetizado
sufre un serie de procesos físico-químicos no menos importantes, tales
como plegamientos, formación de enlaces intramoleculares (puentes
disulfuro, puentes de hidrogeno, enlaces hidrofóbicos, enlaces salinos) y
asociación con otros péptidos que van fijando las estructuras secundarias,
terciarias y cuaternarias de las proteínas.
3.2.2.3.2. Plegamiento
Este proceso permite que la cadena quede conformada con su forma
biológica activa. La cadena una vez formada adopta de manera
espontánea su conformación natural por medio de puentes de hidrógenos,
y de interacciones de fuerzas de Van der Waals, iónicas e hidrofóbicas.
Es decir, finalmente el mensaje genético queda convertido en una
estructura tridimensional.
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4. INHIBIDORES
4.1 Aplicaciones como herramientas de investigación
Puromicina:
Se une al sitio A del ribosoma, aceptando el polipéptido naciente
terminación prematura de la síntesis de proteínas
Cicloheximida:
Inhibe la actividad peptidil-transferasa en eucariontes
Tetraciclina:
Inhibe la unión de aminoacil-tRNAs sobre la subunidad pequeña
Cloranfenicol:
Inhibe la actividad peptidil-transferasa de procariontes y mitocondrias
Eritromicina:
Inhibe la translocación
4.3 Otros: toxinas (eucariontes)
Toxina diftérica
ADP-ribosilasa-NAD+-dependiente. Produce la ADP-ribosilaciónde EF-
2 EF-2 no puede hidrolizar GTP bloqueo de la traducción
Ricina:
Inactiva la subunidad grande del ribosoma bloqueo total de la
biosíntesis de proteínas
5. REGULACION
5.1 Regulación de la expresión génica en procariotas
5.1.1 La lógica de la regulación genética
Una propiedad fundamental de los seres vivos es su capacidad para adaptarse
rápidamente al ambiente la activación o inactivación de genes. Esta habilidad
permite que las células de un organismo puedan sintetizar proteínas en el
momento y lugar precisos
Genes regulados: aquellas cuya actividad es controlada en respuestas a
necesidades de una célula u organismo
Genes constituvos: son los genes que están siempre activos, con
independencia de las condiciones ambientales.
5.1.2. Regulación genética en procariotas
La actividad genética que controla mediante la regulación de la transcripción
Proteínas reguladoras interacciones con secuencias reguladoras del gen
(operadores) para incluir o reprimir la expresión genética.
Control positivo: la unión de una proteína activadora induce la
expresión genética
Control negativo: la unión de la proteína represora impide la expresión
genética
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FIG:
Los genes que codifican proteínas con relaciones se suelen organizar
en operones. Un operón es una unidad genética de expresión
coordinada de genes.
5.2. Regulación de la expresión genética en eucariotas
5.2.1. Control de la expresión genética en eucariotas
Las eucariotas carecen de operones
Regulación más compleja :
Respuesta rápida para adaptarse a cambios ambientales
Respuesta a largo plazo para regular los procesos de desarrollo
y diferenciación celular.
Varios niveles de control de expresión:
Transcripción del ARNm
Procesamiento del ARNm
Transporte del ARNm
Degradación del ARNm
Traducción y degradación de proteica
CONCLUSIONES
BIBLIOGRAFIA
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