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TEMAS PROPOSTOS PARA A

UNIDADE CURRICULAR
PROJECTO/ESTÁGIO

LICENCIATURA EM
BIOQUÍMICA

2018/2019
Tabela resumo dos temas propostos para Projeto/Estágio - 3º Ano
Licenciatura em Bioquímica 2018-2019

Instituição(ões)
Orientador(es) de acolhimento
Título do Projeto
Effect of Dietary Phenolic Acids on Glucose Uptake
01 Fátima Martel FMUP by Breast Cancer Cells: Relationship with their
Anticarcinogenic Effect
Maria Irene Jesus Oxidative Status in Assisted Reproductive
02 FFUP
Lia Costa Technology Outcome
Study of the Protective Effect, Using an Intranasal
03 Margarida Borges FFUP Immunization with Toxoplasma Gondii Membrane
Antigens, against Murine Toxoplasmosis
Lucília Saraiva Improving Colon Cancer Therapy with a New Mutant
04 FFUP
Helena Rocha P53-Targeting Agent
The Interaction of Silver Nanoparticles with Human
05 Marisa Freitas FFUP
Neutrophils
Natércia Teixeira Polifenois em Arte – Investigação em Tintas
06 FCUP
Victor Freitas Ferrogálhicas Medievais.
Estudos sobre a Hidroxylase de Triptofano , uma das
Maria João Ramos
07 FCUP Enzimas Envolvidas na Biossíntese da Melatonina, a
Diana Gesto da Silva
Hormona Reguladora do Sono
Como Otimizar a Produção de Bioplásticos - Estudo
Diana Gesto da Silva
08 FCUP do Mecanismo Catalítica da Acetil-Coa
Pedro Alexandrino
Acetiltransferase
Síntese de Precursores Quirais na Síntese de Novos
09 José Enrique Borges FCUP
Sila-Derivados da Vitamina D
André Silva Estudo da Etiologia do Ferro Não Ligado à
10 FCUP
Conceição Rangel Transferrina em Indivíduos com Diabetes
André Silva Preparação de Sensores Fluorescentes para Deteção
11 Ana Silva FCUP de Iões de Metal usando Proteínas como Scaffold
Andreia Leite Molecular
Avaliação da Influência da Radiação UV na
12 Lúcia Guilhermino ICBAS Toxicidade e Acumulação de Microplásticos num
Bivalve de Consumo Humano
13 Nanomateriais de Carbono e Compostos 2D como
Diana Fernandes
- FCUP Novas Plataformas para Tecnologias de Conversão e
Ana Cristina Freire
15 Armazenamento de Energia
Estudo Térmico de Cocristais de Fármacos
16 Mafalda Cruz FFUP
Antidiabéticos
Nanocompósitos de Materiais Inorgânicos 2D e
Marta Nunes
17 FCUP Óxidos Metálicos para Aplicação na Degradação de
Ana Cristina Freire
Fármacos
Efeito das Fluoroquinolonas e Respetivos
Paula Gameiro Metaloantibióticos na Fluidez da Membrana
18 FCUP
Lucinda Bessa Bacteriana de Staphylococcus aureus usando
Espectroscopia de Fluorescência

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Tabela resumo dos temas propostos para Projeto/Estágio - 3º Ano
Licenciatura em Bioquímica 2018-2019
Susana Sousa FCUP The Angiogenic Potential Role of Peptides on
19
Paula Gomes INEB-I3S Endothelial/Osteoblast Cell Co-Culture Model
New Generation Peptides with Antibiotic Potential:
Cátia Teixeira
20 FCUP Unveiling the Target Pathways in E. amylovora and
Conceição Santos
the Pathosystem
Cátia Teixeira FCUP Antimicrobial Peptides as Potential Alternatives to
21
Paula Gomes ISS-IPP Antibiotics in the Agro-Food Industry
Putting Membrane Lipids on the Radar of Drug
Catarina Pereira Leite
Development: the Case of Nonsteroidal Anti-
22 Cláudia Nunes FFUP
Inflammatory Drugs Associated with Protective
Salette Reis
Mediators
Daniel Carvalho Compostos Antioxidantes e Bioactivos de Extratos de
23 FCUP, FMUP e I3S
Raquel Costa Açaí
Iva Fernandes Wine-Inspired Synthesis of Blue Pyranoflavyliums for
24 FCUP
Joana Oliveira Topical Photodynamic Therapy
Atividade de Antivirulência de Extratos Naturais e
25 Paolo De Marco CESPU
Compostos de Síntese
Perfil de Compostos Fenólicos em Vinhos Tintos
Joana Oliveira Envelhecidos em Barricas com Diferentes Graus de
26 FCUP
Nuno Mateus Oxigenação. Impacto na Formação de Novos
Pigmentos
Luzia Teixeira Caracterização da Resposta Imunológica Induzida no
27 Bárbara Oliveira ICBAS Tecido Adiposo de Animais Infectados com Neospora
Alexandra Correia Caninum
Design and Development of Cationic Nanoparticles
Fernanda Borges
28 FCUP for the Delivery of a Catecol O-Metiltransferase
Carlos Fernandes
Inhibitor into Brain
Vitor Costa Deciphering the Role of Frq1 Binding to Ceramide as
29 I3S
Clara Pereira a Switch between Life and Death
Susana Soares Estudo da Modelação de Propriedades Organoléticas
30 FCUP
Victor Freitas (Adstringência) com Polissacáridos Alimentares
Clara Quintas Tracking Astrocytes and Microglia Phenotypes in
31 FFUP
Paula Fresco Melanoma-Glia Interaction
Joaquim Silva Antibiotic and Antibiotic Resistance Genes in the
32 FCUP
Luís Silva Environment
Joaquim Silva Recycling Sewage Water for Human Consumption
33 FCUP
Luís Silva and Disinfection By-Products
Luís Silva Development of Modified Photodynamic Therapies
34 FCUP
Joaquim Silva for Cancer
Luís Silva Mimicking Biologic Light-Emitting Systems for
35 FCUP
Joaquim Silva Catalytic Purposes
Luís Silva Development of Strategies for Solar-based Hydrogen
36 FCUP
Joaquim Silva Production Catalyzed by Carbon Nanomaterials
Luís Silva Design of Novel Organocatalysts for Sustainable CO2
37 FCUP
Joaquim Silva Recycling
Carmen Brás Silva Pathophysiological Role of MicroRNAs in Pulmonary
38 FMUP
Isabel Miranda Arterial Hypertension – Therapeutic Implications

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Tabela resumo dos temas propostos para Projeto/Estágio - 3º Ano
Licenciatura em Bioquímica 2018-2019
Elizabeth Tiritan
Síntese de Derivados Xantónicos Quirais com
39 Paolo de Marco CESPU/FFUP
Potencial Atividade Antimicrobiana
Carla Fernandes
Paula Fresco
40 FFUP Insight of Nitric Oxide Mechanisms in Carcinogenesis
Clara Quintas
Luísa Vale Sistemas de Veiculação (DNA/RNA) Inteligentes
41 FCUP
Sandra Silva Baseados em Tensioativos Derivados de Serina
Tensioativos Derivados de Serina como Potenciais
Sandra Silva
42 FCUP Agentes Antimicrobianos: Síntese e Avaliação
Luísa Vale
Biológica
Estudo Metabólico e Enzimático Envolvendo
Nuno Vale
43 FFUP Combinação de Fármacos Anti-Helmínticos e
Maria João Gouveia
Biomoléculas Antioxidantes
Estudo da Afinidade de Fármacos para uma
Paula Gameiro
44 FCUP Proteína-Canal Membranar e sua Influência no
Carla Sousa
Combate à Resistência Bacteriana
Nanosistemas como Sistemas de Libertação do
Salette Reis
45 FFUP Fármaco Lapatinib para o Tratamento de Cancro
Marina Pinheiro
TRABALHO MONOGRÁFICO
Georgina Silva Cannabinoid Signaling in Reproduction: Effects Of
46 FFUP
Bruno Fonseca Cannabinoids in Placental Cells
Use of Marine Algae as Functional Food Ingredient in
Sónia Batista European Sea Bass (Dicentrarchus Labrax) Diets and
47 CIIMAR/ICBAS
Luísa Valente Evaluation of Their Immunostimulatory Effect on
Innate Immune Status.
Cristina Catarino Sistema Antioxidante do Eritrócito em Doentes com
48 FFUP
Susana Rocha Doença Renal Crónica em Hemodiálise
Sílvia Pedrosa Citocompatibilidade de Novos Materiais
49 ICBAS
Ana Colette Maurício Hemostáticos
New Family of Antioxidants that May Act as
Fátima Paiva Martins
50 FCUP Antioxidants and Emulsifiers for the Protection of
José Enrique Borges
Foods Containing Emulsified Fish Oil
Clara Pereira Mitochondrial Atp2p as a Potential Target of the Cell
51 I3S
Ana Cláudia Leite Cycle Regulator Cdh1
Carla Fernandes Síntese de Análogos de Compostos de Origem
52 FFUP
Elizabeth Tiritan Marinha com Potencial Atividade Antimicrobiana

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 01

Title: “Effect of Dietary Phenolic Acids on Glucose Uptake by Breast Cancer


Cells: Relationship with their Anticarcinogenic Effect”

Supervisor: Profª. Doutora Maria de Fátima Martel: fmartel@med.up.pt

Host Institution: Unidade de Bioquímica, Dep. de Biomedicina, Faculdade de Medicina-UPorto

Summary: One of the cancer molecular hallmarks is a deviant energetic metabolism, known as the
Warburg effect, whereby the rate of glucose uptake is significantly increased and a high rate of glycolysis
and lactic acid production occurs even when oxygen is present (Hanahan and Weinberg 2011). Accordingly,
GLUT1, which is the main glucose transporter in cancer cells, has been proposed as oncogene and is currently
seen as a potential therapeutic target in cancer treatment (Furuta et al. 2010; Rodriguez-Enriquez 2009).
Polyphenols, commonly contained in fruits and vegetables, have long been associated with a protective role
against cancer. In vitro studies have shown that some polyphenols belonging to the flavonoid and stilbene
classes act as specific inhibitors of glucose (eg. Moreira et al. 2013; Azevedo et al. 2015) transport in breast
cancer cell lines, and an association between inhibition of glucose cellular uptake and their anticarcinogenic
effect has been described (Moreira et al. 2013; Azevedo et al. 2015). Moreover, some of these polyphenols
behave as inhibitors of both glucose and lactate cellular uptake by breast cancer cells and these compounds
are thus very interesting in the context of an anticarcinogenic effect, because they deplete breast cancer cells
of their two most important energy suppliers (Martel et al. 2016).
In this context, the aim of this work will be to investigate the effect of polyphenols belonging to another class,
the phenolic acids, which are very abundant in the human diet (Clifford and Scalbert 2000), on glucose uptake
by breast cancer cells, and the involvement of this effect in their anticarcinogenic effect.

Type of Work: Experimental

Most Relevant Methodologies: in vitro cell culture; cellular uptake experiments using radioactive
substrates (3H-deoxy-glucose); quantification of mRNA levels of GLUT1 by quantitative reverse transcriptase-
polymerase chain reaction; quantification of cell proliferation (sulforhodamine B assay), viability
(quantification of extracellular lactate dehydrogenase activity), apoptosis (TUNEL assay) and migration (in
vitro wound healing assay).

References
Azevedo C, Correia-Branco A, Araújo JR, Guimarães JT, Keating E, Martel F. The chemopreventive effect of the dietary
compound kaempferol on the MCF-7 human breast cancer cell line is dependent on inhibition of glucose cellular uptake.
Nutr Cancer. 2015;67:504-13.
Clifford MN, Scalbert A. Ellagitannins-occurrence in food, bioavailability and cancer prevention. J Sci Food Agricult.
2000;80:1118–1125.
Hanahan D, Weinberg RA. Hallmarks of cancer: the next generation. Cell. 2011;144:646–674.
Furuta E, Okuda H, Kobayashi A, Watabe K. Metabolic genes in cancer: their roles in tumor progression and clinical
implications. Biochim Biophys Acta. 2010;1805:141–152.
Martel F, Guedes M, Keating E. Effect of polyphenols on glucose and lactate transport by breast cancer cells. Breast
Cancer Res Treat. 2016;157:1-11
Moreira L, Araújo I, Costa T, Correia-Branco A, Faria A, Martel F, Keating E. Quercetin and epigallocatechin gallate inhibit
glucose uptake and metabolism by breast cancer cells by an estrogen receptor-independent mechanism. Exp Cell Res.
2013;319:1784-95.
Rodriguez-Enriquez S, Marin-Hernandez A, Gallardo-Perez JC, Carreno-Fuentes L, Moreno-Sanchez R. Targeting of
cancer energy metabolism. Mol Nutr Food Res. 2009; 53:29–48.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 02

Title: “Oxidative Status in Assisted Reproductive Technology Outcome”

Supervisor: Profª Doutora Maria Irene de Oliveira Monteiro Jesus: irebelo@ff.up.pt


Co-Supervisor: Mestre Lia Filipa Costa: liacosta@ua.pt

Host Institution: Laboratório de Bioquímica; Dep. de Ciências Biológicas, Fac. Farmácia-UPorto

Summary: Infertility, defined by “the failure to achieve a clinical pregnancy after 12 months or more of
regular unprotected sexual intercourse”, is considered a disease of the reproductive system by the World
Health Organization (WHO) affecting about 10-15% of the overall population in reproductive age.
Human follicular fluid (FF) has attracted researcher’s interest since it is non-invasive and easily available. FF
is a complex mixture of proteins, metabolites and ionic compounds, produced during folliculogenesis from
both the transfer of blood plasma constituents that cross the blood follicular barrier and of the secretory
activity of oocyte, granulosa and thecal cells [1]. Alterations in FF’s composition has been associated with a
diminished reproductive capacity [2,3]. Therefore, it is reasonable to think that some FF components may
play a critical role determining oocyte quality and the subsequent potential to achieve fertilization and
embryo development. Although the research in this area has progressed toward a more complex type of
molecular analysis in order to scrutiny all the substances contained in FF, no reliable biochemical predictors
of oocyte quality in FF were determined so far.
It is likely that an optimal balance between oxygen available to the oocyte and antioxidants is critical to
permit normal development, meiotic spindle formation and correct chromosome alignment [4]. Thus, we
intend to investigate how oxidative stress can alter normal ovarian follicular dynamics and, thus, impairs
oocyte quality, anovulation, and associated infertility.

Type of Work: Experimental


Most Relevant Methodologies: The student will perform quantification of oxidative markers, such
as advanced oxidation protein products, total hydroperoxides, thiol group levels and malondialdehyde (MDA)
in FF of healthy women and women with subfertility-associated disorders. The results will then be related
with assisted reproductive technology (ART) outcomes.
It was demonstrated that granulosa cells (GCs) have the ability to metabolize and regulate some FF-
component levels. Thus, the student will perform and maintain primary cultures of GCs obtained from human
FF. GCs viability and morphology in response to oxidative stress will also be explored by MTT and LDH release
assays, Giemsa and Hoechst stains

References
[1] Fortune JE. Ovarian follicular growth and development in mammals. Biology of Reproduction. 1994;50(2):225-32.
[2] Ocal P, Aydin S, Cepni I, Idil S, Idil M, Uzun H, et al. Follicular fluid concentrations of vascular endothelial growth
factor, inhibin A and inhibin B in IVF cycles: are they markers for ovarian response and pregnancy outcome? European
Journal of Obstetrics, Gynecology, and Reproductive Biology. 2004;115(2):194-9.
[3] Artimani T, Karimi J, Mehdizadeh M, Yavangi M, Khanlarzadeh E, Ghorbani M, et al. Evaluation of pro-oxidant-
antioxidant balance (PAB) and its association with inflammatory cytokines in polycystic ovary syndrome (PCOS).
Gynecological Endocrinology. 2017;(4):1-5
[4] Prasad S, Tiwari M, Pandey AN, Shrivastav TG, Chaube SK. Impact of stress on oocyte quality and reproductive
outcome. Jornal of Biomedical Science. 2016;23:36
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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 03

Title: “Study of the Protective Effect, Using an Intranasal Immunization with


Toxoplasma Gondii Membrane Antigens, against Murine
Toxoplasmosis”

Supervisor: Profª Doutora Margarida Maria C. N. Marta Borges: mborges@ff.up.pt


Host Institution: Laboratório de Bioquímica; Dep. de Ciências Biológicas, Fac. Farmácia-UPorto

Summary: Toxoplasma gondii is a successful zoonotic parasite worldwide that may cause human
congenital toxoplasmosis, a prevalent disease worldwide with serious implications for the fetus
(Chaudhry, Gad, & Koren, 2014). At present, the usual treatments against toxoplasmosis are not
effective and there are no adequate vaccines preventing human toxoplasmosis (Li, Wei, Zhang,
Peng, & Lindsay, 2014). This project aims to determine, if using an intranasal immunization protocol,
previously established for Neospora caninum, in Prof. Manuel Vilanova laboratory (Ferreirinha et
al., 2014), works for T. gondii infection. It will be tested if intranasal immunization using membrane
antigens from T. gondii (TgMP), confers protection against T. gondii infection using Balb\c/cByJ
mice, a murine strain commonly used as an animal model of T. gondii vertical transmission (Roberts
& Alexander, 1992). The student will isolate and quantify nucleic acids, from tissues previously
collected, from infected animals immunized with adjuvant or adjuvant plus TgMP. The
quantification of the parasite will be performed by quantitative real-time PCR, using primers and a
probe designed for T. gondii surface antigen 1.

Type of Work: The student will develop a background knowledge concerning laboratory
experimental techniques and write a scientific report

Most Relevant Methodologies: The student will learn quantitative real time PCR and data
analysis.

References
Chaudhry, S. A., Gad, N., & Koren, G. (2014). Toxoplasmosis and pregnancy. Can Fam Physician, 60(4), 334-336.
Ferreirinha, P., Dias, J., Correia, A., Perez-Cabezas, B., Santos, C., Teixeira, L., . . . Vilanova, M. (2014).
Protective effect of intranasal immunization with Neospora caninum membrane antigens against murine
neosporosis established through the gastrointestinal tract. Immunology, 141(2), 256-267.
doi:10.1111/imm.12191
Li, X. L., Wei, H. X., Zhang, H., Peng, H. J., & Lindsay, D. S. (2014). A meta analysis on risks of adverse pregnancy
outcomes in Toxoplasma gondii infection. PLoS One, 9(5), e97775. doi:10.1371/journal.pone.0097775
Roberts, C. W., & Alexander, J. (1992). Studies on a murine model of congenital toxoplasmosis: vertical
disease transmission only occurs in BALB/c mice infected for the first time during pregnancy. Parasitology,
104 Pt 1, 19-23.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 04

Title: “Improving Colon Cancer Therapy with a New Mutant P53-Targeting


Agent”
Supervisor: Profª. Doutora Lucília Helena Ataíde Saraiva: lucilia.saraiva@ff.up.pt
Co-Supervisor: Mestre Helena Isabel Rocha: helenainrr@gmail.com
Host Institution: Laboratório de Microbiologia, Dep. de Ciências Biológicas, Fac. Farmácia-UPorto

Summary: The inactivation of the p53 transcription factor is a key event in the development and
maintenance of tumors. In half of human cancers, the p53 pathway is impaired by mutation inthe
TP53 gene. Additionally, the association of mutant p53 (mutp53) with more aggressivetumor
phenotypes, characterized by increased therapeutic resistance and metastatic potential, support
the concept that mutp53 is a promising therapeutic target in the development ofanticancer drugs
[1-4]. In a previous work, we identified the first reactivator of mutp53 R280K,the compound
SLMP53-1, with potent in vitro and in vivo antitumor properties, and with no genotoxicity and
apparent signs of in vivo toxicity [5] [International patent (6)]. Recent data confirmed the ability of
SLMP53-1 to directly bind to mutp53 (unpublished data). The rational synthesis of SLMP53-1
derivatives led to the identification of new compounds, particularly SLMP53-3, with improved
potency and selectivity to the p53 pathway. With the presente project, it is intended to validate the
molecular mechanism of action and antitumor potential of SLMP53-3, particularly to:
a) Study its impact on an array of highly prevalent mutp53 forms by ectopic expressing in a p53-null
tumor cell line, followed by analysis of cell proliferation, cell cycle, apoptosis, mutp53 transcriptional
activity, invasion and migration;
b) Study its efficacy in combination therapy with conventional chemotherapeutic agents: acquired
and cross-resistance studies.

Type of Work: Experimental

Most Relevant Methodologies: Human colon cancer cell lines: cell proliferation and viability
assays, colon spheroid formation assay, flow cytometry, western blot, RT-qPCR, p53 dual-luciferase
reporter assay, wound healing scratch and cell migration assay. In general, the project will
encompass distinct research areas: Pharmacology, Oncobiology, Molecular and Cellular Biology.

References
1. Khoo KH, Verma CS, Lane DP. Nat Rev Drug Discov 2014, 13:217-36;
2. Zawacka-Pankau J, Selivanova G. J Intern Med 2015, 277: 248-259;
3. Girardini JE, Marotta C, Del Sal G. Pharmacol Res2014, 79:75-87;
4. Kim MO & Lozano G. Cell Death and Differentiation 2018, 25, 161-168;
5. Soares et al. Oncotarget 2016; 7:4326-4343;
6. Saraiva et al., European patent application nº EP14739561.0. US patent application 20160347765.
Publication number WO2014207688 A1.
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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 05

Title: “The Interaction of Silver Nanoparticles with Human Neutrophils”

Supervisor: Doutora Marisa Andreia Carvalho de Freitas: marisafreitas@ff.up.pt

Host Institution: Laboratório de Química Aplicada, Departamento de Ciências Químicas,


Faculdade de Farmácia - UPorto

Summary: Silver nanoparticles (AgNPs) are among the most widely used nanomaterials. Humans
may be exposed to AgNPs via water, food, cosmetics, drugs, medical devices, etc. Therefore,
nonvoluntary human contact with AgNPs is unavoidable, leading to systemic exposure and
consequent interaction with immune cells. Neutrophils, as host defense cells, play a key role in
recognizing, ingesting, digesting, and eliminating foreign agents, including nanoparticles (especially
those with a low size). During phagocytosis, neutrophils increase their consumption of molecular
oxygen, with the consequent production of reactive species (RS), a process named oxidative burst.
Herein we propose a study to evaluate the effect of different sizes of AgNPs in human neutrophils’
cell death and oxidative burst. To achieve the proposed goals, two microanalysis equipment will be
used, flow cytometer and microplate reader.
This study will certainly contribute to better understand the human immune response against these
types of nanoparticles.

Type of Work: Experimental.

References
Soares, T., Ribeiro, D., Proenca, C., Chiste, R. C., Fernandes, E., and Freitas, M. (2016) Size-dependent
cytotoxicity of silver nanoparticles in human neutrophils assessed by multiple analytical approaches.
Life Sciences 145, 247-254

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 06
Advances on iron gall inks: revealing the complex polyphenol systems used to write the
Título: “Polifenois em Arte – investigação em tintas ferrogálhicas
medieval book medievais” Maria J. Melo1*, Paula Nabais1, Fernando Pina1, Natércia Teixeira2, Victor Freitas2
1
Department of Conservation and Restoration and LAQV-REQUIMTE, Faculty of Sciences and Technology,
Universidade NOVA de Lisboa, 2829-516 Monte da Caparica, Portugal;
Orientadora: Doutora Natércia do Carmo Teixeira: natercia.teixeira@fc.up.pt
2
QUINOA-LAQV-REQUIMTE, Departamento de Química e Bioquímica, Faculdade de Ciências, Universidade do Porto,
Rua do Campo Alegre, 687, 4169-007 Porto, Portugal;

Co-orientador: Professor Doutor


The Victor
origins of ironFreitas: vfreitas@fc.up.pt
gall ink-making process get lost in the depths of the most ancient records of the history of
human civilizations [1]; the formation of intense blue black complexes was obtained by adding iron salts to
specific plant extracts such as of Q uercus infectoria. Presently, degradation of manuscripts catalysed by iron
gall inks poses a serious threat to the world written heritage. Characterization of the complex structures
Instituição de Acolhimento: Departamento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências
responsible for the colour of iron gall inks is yet to be achieved, being fundamental for the understanding of
the degradation processes that may lead to the complete disappearance of the ink support. This knowledge
da UPorto – DQB - FCUP is also necessary for the development of accurate model systems were novel treatments may be tested. In
the field of cultural heritage, the model systems proposed are based on tannic or gallic acid [2,3]. Our results
suggest that they do not represent accurately iron gall ink chromophores. In fact, HPLC-DAD-MS reveals that

Resumo: free gallic or tannic acid are minor components in the gall extracts, which are found largely as polygalloyl
A degradação das tintas ferrogálhicas utilizadas em manuscritos medievais coloca em risco a
esters of glucose, Figure 1. In alternative to iron-carboxylate binding, we argue that colour may be developed
through the catechol with 2 OH or galloyl with 3 OH groups present in phenolic compounds provide binding
conservação do património cultural, podendo acarretar uma perda total da informação de uma obra e do
sites for metal ions to chelate.
seu valor histórico [1]. Pouco se sabe sobre a composição
In this work, historical accuratequímica destas
reconstructions tintas
of medieval inks areeprepared;
sobretheosgallseus
extractsfenómenos
and the inks
are analysed by HPLC-DAD-MS. These inks, applied on filter paper and parchment, are next characterized by
de degradação. Este conhecimento a nível molecular
Raman microscopy andé indispensável
microFourier Transformpara
Infrareddesenvolver, testartoeoriginal
Spectroscopy, and compared implementar
medieval
inks. We also prepared simpler ink references that include iron complexes with tannic acid, gallic acid, mono
intervenções de estabilização duradouras (conservação e restauro) bem como para minimizar possíveis
and digalloylglucose. These data enable us to discuss the chemical structures of these complex polyphenol
efeitos secundários indesejáveis [2,3]. systems used to write the medieval book and the analytical challenges posed to an accurate description of a
medieval ink. The causes of colour, in the origin black and transformed over time into brownish-red, will be
also discussed.
OH

HO OH
OH

HO OH C
FeSO4
A + CuSO4
HO
+ O
Ligante O O
OH

OH

Noz galha HO
O O O
OH
HO O
O
O
O
O
OH O O
O

O
B HO O O
HO O O OH
O OH
OH
O O O
O
O HO HO O
HO O HO HO OH
OH OH

Romã Extração de OH OH O OH
O
HO
OH

polifenois HO OH
OH
OH OH

OH
OH HO
HO OH

Figure 1. Polygalloyl esters of glucose: A-Pentagalloylglucose; B-Monogalloylglucose; C-Heptagalloylglucose

Murta REFERENCES
1. S. Quideau, D. Deffieux, C. Douat-Casassus, L. Pouységu, Plant polyphenols: chemical properties, biological activities,
and synthesis, A ngew andte Chem ie, 50 (2011) 586 Tinta Ferrogálhica
2. A. Lerf, F. E. Wagner, Model compounds of iron gall inks – a Mössbauer study, H yperfine Interact, 237 (2016) 36
3. A. Ponce et al., Elucidation of the Fe(III) Gallate Structure in Historical Iron Gall Ink, A nalytical Chem istry 88 (2016)
5152−5158

Decomposição da Tinta Ferrogálhica e do suporte

Neste trabalho pretende-se: 1) caraterizar a composição polifenólica de murta (Myrtus communis), romã
(Punica granatum) e galhas (Quercus infectoria); 2) reproduzir tintas medievais ibéricas segundo receitas da
época (códice medieval), quer com extratos quer com padrões, com e sem os principais aditivos descritos
nos tratados medievais; 3) estimar a concentração de acido gálhico consoante a fonte, pH e quantificação de
ferro não complexado.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias Mais Relevantes: Serão utilizadas diversas técnicas laboratoriais e diversas técnicas
de análise química como: espetrofotometria, cromatografia em coluna com diferentes suportes sólidos,
HPLC-DAD, HPLC-ESI-MS e espetroscopia de ressonância magnética nuclear (RMN).

Bibliografia
[1] S. Quideau, D. Deffieux, C. Douat-Casassus, L. Pouységu, Angewandte Chemie, 50, 2011
[2] A. Lerf, F. E. Wagner, Hyperfine Interact, 237, 2016
[3] A. Ponce et al., Analytical Chemistry, 88, 2016
10
Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 07

Título: “Estudos sobre a Hidroxylase de Triptofano, uma das Enzimas


Envolvidas na Biossíntese da Melatonina, a Hormona Reguladora
do Sono”
Orientador: Professora Doutora Maria João Ramos: mjramos@reit.up.pt
Co-orientadora: Doutora Diana Sofia Gesto da Silva:
Instituição de Acolhimento: UCIBIO@REQUIMTE, Departamento de Química e Bioquímica da
Faculdade de Ciências da UPorto – DQB - FCUP

Resumo:Tal como imensos processos cerebrais, os mecanismos de regulação do sono são muito mal
compreendidos do ponto de vista químico.
Este projeto visa o estudo do caminho de biossíntese da melatonina. A melatonina é uma hormona
envolvida na regulação do sono. Sendo a serotonina um percursor da melatonina, a biossíntese da
última afeta os níveis da primeira, com reflexos não só no sono, mas também no controle do apetite,
desejo sexual, agressividade, estado de humor, temperatura corporal, e demais funções onde a
serotonina está envolvida.
A melatonina é pequena molécula, biossintetizada pela ação de quatro enzimas consecutivas,
nomeadamente a hidroxilase de triptofano, a descarboxilase de L-aminoácidos aromáticos, a N-
acetiltransferase e a hidroxindol-O-metiltransferase, cujos mecanismos de reação são mal conhecidos.
O projeto será realizado com recurso à modelação molecular computacional, e focar-se-á no estudo do
mecanismo catalítico da hidroxilase de triptofano, a primeira das enzimas do processo. Neste contexto,
o estudante deverá obter as estruturas tridimensionais da enzima por recolha no Protein DataBank
e/ou por modelação por homologia. Irá completar as estruturas, solvatá-las, e refina-las
computacionalmente. Posteriormente, o estudante deverá modelar os substratos da enzima complexado
no centro ativo, e tentar determinar o mecanismo químico pelo qual ele se transforma em melatonina.
Por fim, o estudante poderá modelar o recetor de melatonina, responsável pelos seus efeitos na
regulação do sono, em complexo com os seus agonistas e antagonistas, servindo estes últimos de
modelo para o design de novos fármacos que auxiliem na regulação do sono, em especial em situações
de jet-lag, nas quais a melatonina é frequentemente utilizada como terapia.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias Mais Relevantes: Bioquímica computacional - Modelação por homologia,


docking molecular, dinâmica molecular, métodos QM/MM.

Bibliografia
[1] Sousa Sérgio Filipe, Ribeiro António J. M., Neves Rui P. P., Brás Natércia F., Cerqueira, Nuno M. F. S. A.,
Fernandes Pedro A., Ramos Maria João. Application of quantum mechanics/molecular mechanics methods
in the study of enzymatic reaction mechanisms. WIREs Comput Mol Sci 2017, 7: doi: 10.1002/wcms.1281
[2] Ribeiro A; Santos-Martins D; Ramos MJ; Fernandes PA, Enzymatic Flexibility and Reaction Rate: A QM/MM
Study of HIV1 Protease, ACS CATALYSIS, 5617, 2015.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 08

Título: “Como Otimizar a Produção de Bioplásticos - Estudo do Mecanismo


Catalítica da Acetil-Coa Acetiltransferase”
Orientador: Doutora Diana Sofia Gesto da Silva:
Co-orientadora: Prof. Doutor Pedro Alexandrino Fernandes: pafernan@fc.up.pt
Instituição de Acolhimento: UCIBIO@REQUIMTE, Departamento de Química e Bioquímica da
Faculdade de Ciências da UPorto – DQB - FCUP

Resumo: O plástico é simultaneamente uma das invenções mais úteis alguma vez criada e um dos maiores
flagelos da humanidade. As características que o tornaram um dos materiais mais usados como matéria
prima - o baixo custo de produção e a durabilidade - são também aquelas que o tornaram num perigo para
o ambiente. Alguns dos plásticos mais comuns podem levar de 450 a 1000 anos até serem degradados
completamente, o que leva à sua acumulação por todo o planeta. De forma a reduzir a quantidade de plástico
presente em aterros e diminuir os seus níveis actuais de poluição, uma das soluções passa pelo aumento de
produção e uso dos chamados bioplásticos: polímeros com características semelhantes às dos plásticos
convencionais, produzidos a partir de fontes renováveis, como óleos vegetais ou amido de milho, e
biodegradáveis no meio ambiente.
Um dos bioplásticos biodegradáveis que mais atenção tem chamado actualmente tem origem bacteriana. Os
polihidroxialcanoatos (PHAs) são produzidos por diversas bactérias em determinadas
condições e têm funções de armazenamento de carbono e energia. A sua biossíntese é catalisada por três
enzimas: a acetil-CoA acetiltransferase, a acetoacetil-CoA reductase e a PHA sintase.
Para este projecto propomos o estudo do mecanismo catalítico da primeira enzima deste processo, a acetil-
CoA acetiltransferase. Este estudo será feito recorrendo a ferramentas computacionais, como a modelação
molecular, dinâmica molecular e métodos híbrido QM/MM. Inicialmente o estudante deverá criar um
modelo computacional da enzima, recorrendo a estruturas tridimensionais armazenadas no Protein
DataBank e/ou modelação por homologia. Em seguida terá que validar o modelo usando dinâmica molecular.
Uma vez completo e validado o modelo da enzima, o estudante irá investigar o mecanismo catalítico desta
usando métodos QM/MM. Esta metodologia permitir-lhe-à caracterizar todos os estados da reação
(reagente, estados de transição, intermediários e produto) estrutural e energeticamente. Com esta
informação, o aluno poderá, no final, testar mutações na enzima e ver que alterações estas provocam nas
energias de ativação e reação, de forma a averiguar possíveis mutações que possam tornar a enzima mais
eficiente. Estas são informações com grande valor, pois as enzimas mutantes poderão ser usadas na indústria
de forma a tornar o processo de produção de bioplástico mais rentável, reduzindo o seu custo de produção.

Tipo de trabalho: Experimental


Metodologias Mais Relevantes: Bioquímica computacional - Modelação por homologia,
docking molecular, dinâmica molecular, métodos QM/MM.

Bibliografia
[1] Sousa Sérgio Filipe, Ribeiro António J. M., Neves Rui P. P., Brás Natércia F., Cerqueira, Nuno M. F. S. A.,
Fernandes Pedro A., Ramos Maria João. Application of quantum mechanics/molecular mechanics methods
in the study of enzymatic reaction mechanisms. WIREs Comput Mol Sci 2017, 7: doi: 10.1002/wcms.1281
[2] Ribeiro A; Santos-Martins D; Ramos MJ; Fernandes PA, Enzymatic Flexibility and Reaction Rate: A QM/MM
Study of HIV1 Protease, ACS CATALYSIS, 5617, 2015.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 9

Título: “Síntese de Precursores Quirais na Síntese de Novos Sila-Derivados


da Vitamina D”
Supervisor: Prof. Doutor José Enrique Rodriguez Borges: jrborges@fc.up.pt
Host Institution: Dep.de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências da UPorto – DQB-FCUP
Summary: Calcitriol and 1α,25-Dihydroxy-19-norvitamin D3 derivatives, regulates mineral metabolism, promotes
cellular differentiation, inhibits cellular proliferation and controls immunomodulation. However, the therapeutic
applications of calcitriol in pharmacological doses to correct dysfunction of one or more of these processes are
severely limited by its potent calcemic effects. To date calcitriol and only eight synthetic analogues have been used
used for chemotherapy of patients with secondary hyperthyroidism, osteoporosis, and psoriasis, and only four
analogues are in advanced clinical trials for cancer and osteoporosis. The overall objective of this research program
is the rational development of an useful analogue for cancer, osteoporosis, psoriasis or rickets.1-3
OBJECTIVE: Our general approach for the construction of new vitamin D3 sila-analogues (1 and 2) as potential
drugs for treatment of cancer is shown below. A critical feature of this strategy is the availability of CD-ring
fragment (3). The objective of this project (Estágio) is the study of alternative chiral synthesis of the CD-ring
precursor (9) as outlined in the figure below.

WORK PLAN (EXPERIMENTAL): To determine the viability of this approach, the student will perform a study
of stereoselective synthetic strategies to ketone 9 from 5-hexyn-1-ol, where the key step is a Pauson-khand
catalytic cyclization (C) and chiral methyl rearrangement reaction (D).3 (See figure below).

Most Relevant Methodologies: Organic Chemistry synthesis, purification and structural


characterization of compounds (selective reactions, chromatography, NMR, IR, MS, etc)

References
1. Recents papers from this laboratory: (a) Chem. Eur. J. 2010, 16, 1432-1435. (b) J. Med. Chem. 2010, 53, 1159-1171.
(c) ChemMedChem. DOI: 10.1002/cmdc.201100021. (d) J. Steroid Biochem. Molec. Biol. 2010, 121, 7-12.
(e) PLoS ONE. 2011, 66, e18124 (Doi:10.1371/Journal.pone.0018124.g001.
(http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0018124).
2. For a review, see: Flynn, A.B.; Ogilvie, W.W. Chem. Rev. 2007, 107, 4698-4745.
3. Mouriño et al. PATENT ES2396524A1

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 10

Título: “Estudo da Etiologia do Ferro Não Ligado à Transferrina em


Indivíduos com Diabetes”

Orientador: Doutor André Moreira Neto da Silva: andre.silva@fc.up.pt


Co-orientadora: Profª Doutora Maria da Conceição Rangel: mrangel@icbas.up.pt

Instituição de Acolhimento: LAQV-REQUIMTE, Departamento de Química e Bioquímica da


Faculdade de Ciências da UPorto – DQB - FCUP

Resumo: O ferro é um elemento essencial à vida, e no corpo humano o seu transporte e


distribuição pelos vários tecidos são assegurados pela transferrina do soro (Tf). Esta proteína
apresenta uma grande afinidade para este metal de transição, eliminando a sua disponibilidade para
catalisar a ocorrência de danos oxidativos. Contudo, podem ser detectadas espécies de ferro não
ligado à Tf (NTBI – non-transferrin-bound iron) em doenças metabólicas que conduzam à excessiva
acumulação de ferro no organismo (ex. hemocromatose, diabetes mellitus). Contudo, pouco é
conhecido sobre a natureza bioquímica destas espécies: o ferro é pouco solúvel a pH fisiológico, e
assim, no soro, encontra-se associado ou a aniões que de baixo peso molecular, como o citrato ou
o acetato, ou de forma não específica a proteínas do soro.
O objectivo deste trabalho é verificar a hipótese de que modificações pós-tradução das proteínas
do soro desempenham um papel fundamental na especiação e toxicidade destas espécies de ferro.
Na diabetes mellitus, a modificação mais prevalente é a glicação não enzimática. Já foi demonstrado
in vitro que esta modificação desempenha um papel fundamental na ligação do ferro a proteínas
como a albumina. Desta forma o objetivo será identificar estas modificações in vivo e correlacioná-
las com os níveis de NTBI.
O aluno aprenderá a analisar as modificações das proteínas séricas por espectrometria de massa de
alta resolução acoplada a cromatografia líquida (HPLC-HRMS).

Tipo de trabalho: Experimental


Metodologias mais relevantes: HPLC, Espectrometria de massa de massa de alta resolução
(HRMS), SDS-PAGE

Bibliografia
[1] P. Brissot, M. Ropert, C. Le Lan, O. Loreal (2012) Non-transferrin bound iron: A key role in iron overload
and iron toxicity, Biochimica Et Biophysica Acta-General Subjects, 1820 (2012) 403-410.
[2] Silva AMN, Hider RC (2009) Influence of non-enzymatic post-translation modifications on the ability of
human serum albumin to bind iron. Implications for non-transferrin-bound iron speciation. Biochim. Biophys.
Acta 1794(10), 1449-1458
[3] Silva AMN, Sousa PRH, Coimbra JTS, Brás NF, Vitorino R, Fernandes PA, Ramos MJ, Rangel M, Domingues
P (2014) The glycation site specificity of human serum transferrin is determinant for the protein functional
impairment under elevated glycemic conditions. Biochem. J. 461(1), 33-42

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 11

Título: “Preparação de Sensores Fluorescentes para Deteção de Iões de


Metal usando Proteínas como Scaffold Molecular”
Orientador: Doutor André Moreira Neto da Silva: andre.silva@fc.up.pt
Co-orientadoras: Doutora Ana Margarida Gomes da Silva: ana.silva@fc.up.pt
Doutora Andreia Daniela Moreira da Cruz Leite: acleite@fc.up.pt
Instituição de Acolhimento: LAQV-REQUIMTE, Departamento de Química e Bioquímica da
Faculdade de Ciências da UPorto – DQB - FCUP

Resumo: Todas as formas de vida necessitam de iões de metal para o seu metabolismo. Assim, a deteção,
quantificação e manipulação destes micronutrientes têm-se destacado como campos essenciais em
disciplinas como a bioquímica, a química biológica e a medicina. Um esforço fundamental tem sido colocado
no desenvolvimento de sensores fluorescentes [1,2].
A química de proteínas [2] tem sido utilizada para produzir produtos farmacêuticos, modificar enzimas ou
mesmo para sintetizar enzimas de novo. O objetivo deste trabalho é utilizar reações simples de química
orgânica para produzir conjugados de proteína (albumina do soro) com diferentes sondas fluorescentes
(fluoróforos) e verificar a possibilidade da sua utilização como sensores de iões de metal, em particular
ferro(III). Diferentes metodologias de preparação serão utilizadas de forma a promover a formação de
conjugados específicos (ou não específicos) com os fluoróforos. A possibilidade de utilizar a reação de
glicação como forma barata e eficiente de aumentar a afinidade das proteínas para os metais também será
explorada. A glicação proteica resulta da reação espontânea entre grupos nucleófilos nas proteínas e
açucares redutores, sendo uma das vias de toxicidade da hiperglicemia na diabetes mellitus. É conhecido que
as proteínas glicadas apresentam um aumento da afinidade para metais de transição como o ferro e o cobre,
formando espécies conhecidas como glicoquelatos [4].
O aluno terá de proceder à preparação dos conjugados de fluoróforo com proteínas nativas e proteínas
glicadas. Posteriormente procederá à sua caracterização usando espectrometria de massa para caracterizar
as modificações induzidas na proteína e espectroscopia de fluorescência para caracterizar as suas
propriedades óticas. Serão realizados testes de interação com diferentes iões de metal e a obtenção de
conjugados com propriedades adequadas permitirá a sua utilização no estudo de fluídos biológicos (soro de
pacientes com diferentes patologias).

Tipo de trabalho: Experimental


Metodologias mais relevantes: Síntese orgânica, Espectrometria de massa, Espectroscopia de
fluorescência
Bibliografia
[1] Carter KP, et al. (2014) Fluorescent Sensors for Measuring Metal Ions in Living Systems. Chem. Rev. 114, 4564-4601
[2] Leite A, et al (2016) Design of a Water Soluble Fluorescent 3-Hydroxy-4-Pyridinone Ligand Active at
Physiological pH Values. J. Fluorescence 26(5), 1773-1785
[3] Wright TH, et al. (2017) Posttranslational mutagenesis: A chemical strategy for exploring protein side-
chain diversity. Science 354(6312), aag1465
[4] Silva AMN, Hider RC (2009) Influence of non-enzymatic post-translation modifications on the ability of
human serum albumin to bind iron. Implications for non-transferrin-bound iron speciation. Biochim. Biophys.
Acta 1794(10), 1449-1458

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 12

Título: “Avaliação da Influência da Radiação UV na Toxicidade e


Acumulação de Microplásticos num Bivalve de Consumo Humano”
Orientadora: Professora Doutora Lúcia Guilhermino: lguilher@icbas.up.pt
Instituição de Acolhimento: Laboratório de Ecotoxicologia (ECOTOX), Instituto de ciências
Biomédicas Abel Salazar UPorto - ICBAS-UP

Resumo: A poluição por microplásticos e o aumento da exposição de organismos e do Homem à radiação


por UV decorrente do incremento da temperatura global do planeta são paradigmas atuais que a sociedade
tem de enfrentar e desenvolver estratégias para os ultrapassar. Ambos têm efeitos adversos na saúde
ambiental e humana e interagem entre si, aumentando os riscos de doenças no Homem e em animais. Os
microplásticos são poluentes globais, presentes no ar, água, solos e alimentos de origem animal e vegetal,
cujos efeitos tóxicos na saúde ambiental e humana são ainda largamente desconhecidos. Modulam a
toxicidade de outros poluentes incluindo agentes teratogénicos e carcinogénicos. Para contribuir para o
conhecimento e avaliar os riscos para a saúde ambiental e animal, incluindo no que se refere à segurança
alimentar, está atualmente em curso o projeto PLASTICGLOBAL financiado pela FCT e fundos Europeus. O
projeto/estágio que se propõe está incluído no projeto PLASTIGLOBAL e tem como objetivo investigar os
efeitos combinados daradiação UV (exposição solar), de microplásticos e de um antibiótico, utlizando um
bivalve de consumo (como alimento) humano que é uma espécie exótica invasora no nosso país (Corbicula
fluminea) como modelo. Espera-se que o trabalho deste projeto possa contribuir para uma publicação.

Tipo de trabalho: Experimental


Metodologias mais relevantes: recolha de animais no estuário do rio Minho; manutenção dos
bivalves em laboratório; produção de culturas de microalgas para alimentação dos animais; doseamentos de
microplásticos; ensaios de toxicidade com bivalves, técnicas bioquímicas utilizadas como biomarcadores
ambientais para avaliação de efeitos neurotóxicos (acetilcolinesterase), de stresse oxidativo (catalase,
glutationa S-transferases, superóxido dismutase, glutationa redutase, glutationa peroxidase, peroxidação
lipídica), indicadores energéticos, entre outras metodologias. Indicam-se de seguida alguns artigos onde
poderá ser obtida mais informação sobre o paradigma dos microplasticos, tipo de trabalho e metodologias.

Bibliografia
Barboza, L.G.A.; Vieira, L.R.; Branco, N.; Figueiredo, N.; Carvalho, F.; Carvalho, C.; Guilhermino, L. 2018a. Microplastics
cause neurotoxicity, oxidative damage and energy-related changes and interact with the bioaccumulation of Mercury
in the European seabass, Dicentrarchus labrax (Linnaeus, 1758). Aquatic Toxicology 195: 49-57.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166445X17303776
Barboza, L.G.A.; Vieira, L.R.; Guilhermino, L. 2018b. Single and combined effects of microplastics and Mercury on
juveniles of the European seabass (Dicentrarchus labrax): changes in behavioural responses and reduction of swimming
velocity and resistance time. Environmental Pollution 236: 1014-1019.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0269749117337995
Barboza, L.G.A.; Vethaak, A.D.; Lavorante, B.R.B.O.; Lundebye, A.-K.; Guilhermino, L. 2018c. Marine microplastics debris:
na emerging issue for food security, food safety and human health. Marine Pollution Bulletin 133: 336-348.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0025326X1830376X
Ferreira, P.; Fonte, E.; Soares, M.E.; Carvalho, F.; Guilhermino, L. 2016. Effects of multi-stressors on juveniles of the
marine fish Pomatoschistus microps: gold nanoparticles, microplastics and temperature. Aquatic Toxicology 170: 89-
103. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166445X15300941
Fonte, E.; Ferreira, P.; Guilhermino, L. 2016. Temperature rise and microplastics interact with the toxicity of the
antibiotic cefalexin to juveniles of the common goby (Pomatoschistus microps): post-exposure predatory behaviour,
acetylcholinesterase activity and lipid peroxidation. Aquatic Toxicology 180: 173-185.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166445X16302715
Guilhermino, L.; Vieira, L.R.; Ribeiro, D.; Tavares, S.; Cardoso, V.; Alves, A.; Almeida, J.M. 2018. Uptake and effects of the
antimicrobial florfenicol, microplastics and their mixtures on freshwater exotic invasive bivalve Corbicula fluminea.
Science of the Total Environment 622-623: 1131-1142.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969717334393

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Temas de Projeto/Estágio nºs 13 ‒ 15

Título: “Nanomateriais de Carbono e Compostos 2D como Novas Plataformas


para Tecnologias de Conversão e Armazenamento de Energia”
Orientadora: Doutora Diana Mónica Sousa Fernandes: diana.fernandes@fc.up.pt
Co-orientadora: Professora Doutora Ana Cristina Moreira Freire: acfreire@fc.up.pt
Instituição de Acolhimento: LAQV-REQUIMTE, Departamento de Química e Bioquímica da
Faculdade de Ciências da UPorto – DQB - FCUP

Resumo: A electrocatálise tem um papel fundamental na conversão de energia limpa, permitindo um número
de processos sustentáveis para tecnologias futuras e o desenvolvimento de materiais altamente eficientes e de
baixo custo é um dos maiores desafios atuais [1-3]. Isso resulta da atual crise energética global, refletida na
diminuição dos combustíveis fósseis e no crescente aumento da poluição ambiental, que tem vindo a estimular o
desenvolvimento de novas tecnologias de armazenamento e conversão de energia renovável.
Os materiais de carbono têm vindo a despertar um crescente interesse nesta área devido às suas propriedades
físicas e químicas. Entre estes encontram-se os nanotubos de carbono e o grafeno. Os nanotubos de carbono
possuem estruturas cilindricas (1D) e propriedades únicas que os tornam adequados e muito atraentes para um
grande número de aplicações em várias áreas [4,5]. O grafeno é um nanomaterial bidimensional (2D) constituído
por uma folha plana de átomos de carbono sp2, e que tem vindo a ser usado em áreas científicas tais como
electrónica, energia e sensores, igualmente devido às suas excelentes propriedades [6]. A funcionalização química
através da modificação não covalente permite manter a integridade estrutural e as propriedades
electrónicas/eléctricas dos nanotubos/grafeno e das espécies imobilizadas. Esta funcionalização permitirá
melhorar o desempenho dos materiais híbridos resultantes e ampliar o conjunto de aplicação dos mesmos [7].
Entre as várias moléculas que podem ser imobilizados em ambos os nanomateriais de carbono estão os
polioxometalatos (POMs). Estes aniões representam uma importante classe de agregados metal-óxido
constituídos por metais de transição do bloco d e com aplicação em diversas áreas nomeadamente na catálise,
medicina e ciência de materiais devido ao fato de possuírem uma química redox bastante rica [8-10].
Neste trabalho pretende-se preparar nanomateriais híbridos de nanotubos de carbono ou grafeno e
polioxometalatos, optimizar as condições de preparação,
caracterização química e estrutural por diversas técnicas,
como por exemplo, espectroscopia de FTIR e de UV-Visível e
espectroscopia fotoelectrónica de Raios X. Por último, serão
estudadas as propriedades electroquímicas dos materiais
preparados por voltametria cíclica e serão avaliadas as suas
propriedades electrocatalíticas, nomeadamente para a
produção de H2 (HER) e O2 (OER) e a redução do O2 (ORR).
Figura 1. Ilustração esquemática do ciclo do H2 e O2 para
armazenamento e conversão de energia renovável.

Bibliografia
[1] C. Freire, D. M. Fernandes, M. Nunes, V. K. Abdelkader, ChemCatChem, 10, 1703, 2018. [2] M. Kuang, G. Zheng,
Small, 12, 5656, 2016. [3] Z. W. Seh, J. Kibsgaard, C. F. Dickens, I. Chorkendorff, J. K. Nørskov, T. F. Jaramillo, Science,
355, 146, 2017. [4] N. Karousis, N. Tagmatarchis and D. Tasis, Chem. Rev., 110, 5366, 2010. [5] R.H. Baughman, A.A.
Zakhidov and W.A. de Heer, Science, 297, 787, 2002. [6] M.J. Allen, V.C. Tung and R.B. Kaner, Chem. Rev., 110, 132, 2010.
[7] D. Eder, Chem. Rev., 110, 1348, 2010. [8] M.T. Pope, Heteropoly and Isopoly Oxometalates, Spring Verlag, New York,
1983.[9] D. M. Fernandes, M. P. Araújo, A. Haider, A. S. Mougharbel, A. J. S. Fernandes, U. Kortz, C. Freire,
ChemElectroChem, 5, 273, 2018. [10] D. M. Fernandes, H. C. Novais, R. Bacsa, P. Serp, B. Bachiller-Baeza, I. Rodríguez-
Ramos, A. Guerrero-Ruiz, Cristina Freire, Langmuir, 2018.
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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 16

Título: “Estudo Térmico de Cocristais de Fármacos Antidiabéticos”

Orientadora: Doutora Mafalda Sofia Coelho da Cruz Sarraguça: mafalda.cruz@ff.up.pt

Instituição de Acolhimento: LAQV/REQUIMTE, Laboratório de Química Aplicada, Faculdade de


Farmácia da UPorto – FFUP

Resumo: Este projeto tem como objetivo o estudo de novos fármacos com solubilidade melhorada
(cocristais) com particular enfase no cocristal de glibenclamida (GLB) com trometamina [1]. A GLB é
um fármaco que apresenta baixa solubilidade e como tal baixa biodisponibilidade, cuja a indicação
terapêutica é o tratamento de diabéticos que estão dependentes de insulina. O cocristal será
produzido por diversas metodologias como evaporação de solvente e por slurry [2]. O produto final
será caracterizado por difração de raios-X de pós (XRPD), e espectroscopia de infravermelho médio
(MIRS) e próximo (NIRS). Para o estudo térmico será utilizada a técnica de calorimetria diferencial
de varrimento (DSC). A solubilidade do cocristal irá ser avaliada por cromatografia liquida de alto
rendimento (HPLC) [3].

O estudo tem como principais objetivos a avaliação da pureza, solubilidade e o estudo da


estabilidade térmica do novo composto.

Tipo de trabalho: Experimental

Bibliografia
[1] Silvério Fiho et al., Synthesis of a Glibenclamide Cocrystal: Full Spectroscopic and Thermal
Characterization, Journal of Pharmaceutical Sciences 107 (2018) 1597-1604.
[2] Mafalda Sarraguça et al., Real-time monitoring of cocrystallization processes by solvent evaporation: A
near infrared study, European Journal of Pharmaceutical Sciences 90 (2016) 76–84.
[3] Bárbara Violinha Baptista, From synthesis to formulation of gliclazide and glibenclamide cocrystal
pharmaceutical solid dosage forms, Dissertation to obtain the Master of Science Degree in Pharmaceutical
Engineering.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 17

Título: “Nanocompósitos de materiais inorgânicos 2D e óxidos metálicos


para aplicação na degradação de fármacos”
Orientadora: Doutora Marta Susete da Silva Nunes: marta.nunes@fc.up.pt
Co-orientadora: Professora Doutora Ana Cristina Moreira Freire: acfreire@fc.up.pt
Instituição de Acolhimento: LAQV-REQUIMTE, Departamento de Química e Bioquímica da
Faculdade de Ciências da UPorto – DQB - FCUP

Resumo: Os processos de oxidação avançada baseados no radical hidroxilo (HO●) são apontados
como um dos métodos mais eficientes para a mineralização de contaminantes orgânicos.[1] Em
particular, a reacção de Fenton acoplada a processos de fotocatálise e/ou electrocatálise – foto/electro-
fenton – tem-se revelado bastante promissora no tratamento de águas residuais.[1,2]
Neste projecto pretende-se desenvolver novos nanocompósitos baseados em análogos de grafeno (ex.
C3N4, BN, MoS2) e óxidos metálicos (ex. TiO2, ZnO, Fe3O4, Co3O4, Mn3O4), para aplicação na degradação
de fármacos e seus metabolitos por foto/electro-fenton. A actividade foto/electrocatalítica de alguns
destes materiais já é conhecida.[1,3,4] Com este projecto pretende-se avançar no desenvolvimento
racional de novos materiais híbridos através do estabelecimento de relações composição vs.
desempenho catalítico, bem como a sua aplicação concreta na degradação de fármacos alvo
(antibióticos, analgésicos e/ou antidepressivos) e seus metabolitos em águas residuais.
Pretende-se que o estudante participe activamente em todas as fases de execução do plano de
trabalhos, nomeadamente:
(i) preparação dos nanomateriais/nanocompósitos e sua caracterização por técnicas
espectroscópicas e microscópicas avançadas;
(ii) avaliação da actividade foto/electrocatalítica dos materiais preparados na degradação de
fármacos e seus metabolitos;
(iii) caracterização dos produtos de reacção.
Este projeto permitirá ao estudante adquirir um vasto conjunto de competências, ao nível de
procedimentos de laboratório de uso comum e também de procedimentos específicos, como
caracterização de materiais por técnicas avançadas e técnicas electroquímicas.

Tipo de trabalho: Experimental


Metodologias mais relevantes: Técnicas espectroscópicas: espectroscopia de Ultravioleta-
Visível, espectroscopia de Infravermelho e espectroscopia de Fotoelectrões de Raios-X. Técnicas de
difracção e microscópicas: Difracção de Raios-X, Microscopia Electrónica de Varrimento (SEM) e de
Transmissão (TEM). Técnicas electroquímicas: voltametria cíclica, voltametria de varrimento linear,
cronoamperometria.

Bibliografia
[1] D. Yue, X. Qian, M. Kan, M. Fang, J. Jia, X. Yang, Y. Zhao, Appl. Catal. B Environ., 2018, 229, 211.
[2] P.V. Nidheesh, M. Zhou, M.A. Oturan, Chemosphere, 2018, 197, 210.
[3] H. Lu, J. Wang, H. Hao, T. Wang, Nanomaterials, 2017, 7, 303.
[4] A. Primo, S. Navalón, A.M. Asiri, H. García, Chem. Eur. J., 2015, 21, 324.
19
Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projeto/Estágio nº 18

Título: “Efeito das Fluoroquinolonas e Respetivos Metaloantibióticos na


Fluidez da Membrana Bacteriana de Staphylococcus aureus Usando
Espectroscopia de Fluorescência”

Orientadora: Profª Doutora Paula Gameiro: agsantos@fc.up.pt


Co-orientadora: Doutora Lucinda da Silva Bessa: lucinda.bessa@fc.up.pt

Instituição de Acolhimento: LAQV-REQUIMTE, Departamento de Química e Bioquímica da


Faculdade de Ciências da UPorto – DQB - FCUP

Resumo: A resistência aos antibióticos é um problema global que põe em risco o tratamento de
muitas infeções. Urge, portanto, a necessidade de desenvolver novos antibióticos. A maioria dos
antibióticos tem alvos intracelulares, tendo por isso que atravessar a membrana bacteriana para
atingir o seu alvo. Para além da permeabilidade, alterações na fluidez da membrana podem também
influenciar a capacidade dos antibióticos atravessarem a membrana citoplasmática [1]. Atualmente,
uma das novas apostas constitui a síntese de metaloantibióticos, ou seja, complexos de metais de
transição com ligandos da família de antibióticos que embora tenham uma atividade microbiana
análoga à dos antibióticos parecem ter um mecanismo de entrada diferente e dependente da
camada lipídica.
Assim sendo, o objetivo deste projeto é avaliar eventuais alterações da fluidez da membrana do
Staphylococcus aureus (bactéria Gram-positiva) na ausência e na presença de fluoroquinolonas e
dos seus complexos de cobre(II) recorrendo à espectroscopia de fluorescência.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias mais relevantes: Este estudo será efetuado maioritariamente por


espectroscopia de fluorescência usando uma sonda fluorescente – Laurdan, que é incorporada na
membrana citoplasmática, originando um espectro de emissão de fluorescência que permite inferir
o estado físico dos fosfolípidos envolventes [2].

Bibliografia
[1] N.C.S. Mykytczuk, et al. Fluorescence polarization in studies of bacterial cytoplasmic membrane
fluidity under environmental stress, Prog. Biophys. Mol. Biol. 95 (2007) 60–82.
[2] L.J. Bessa, M. Ferreira, P. Gameiro, Evaluation of membrane fluidity of multidrug-resistant
isolates of Escherichia coli and Staphylococcus aureus in presence and absence of antibiotics, J.
Photochem. Photobiol. B 181 (2018) 150–156.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 19

Title: “The Angiogenic Potential Role of Peptides on Endothelial/Osteoblast


Cell Co-Culture Model”
Supervisor: Profª Doutora Susana Maria Ribeiro e Sousa: efmarque@fc.up.pt
Co-supervisor: Profª Doutora Paula Alexandra de Carvalho Gomes: pgomes@fc.up.pt
Host Institution: Departamento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências da UPorto –
DQB – FCUP; Instituto de Engenharia Biomédica – Instituto de Investigação e Inovação em Saúde da
Universidade do Porto (INEB-I3S)

Summary: The aim of this study is to evaluate the role of specific peptides on angiogenesis in bone. To
achieve this, an in vitro co-culture model will join osteoblasts and endothelial cells in a bone-biomimetic
biomaterial adequate for the functionalization/conjugation with peptides.1-3
Bone is a dynamic tissue that includes the joint occurrence of chemical, cellular, biophysical, and hormonal
processes that lead to a constant turnover/remodeling between bone resorption (by osteoclasts) and bone
formation (by osteoblasts). Angiogenesis and bone formation are closely linked during skeletal development
and fracture healing. Angiogenesis provides a source of nutrients, oxygen, metabolic substrates, and access
for circulating cells that help to support new bone formation. Several peptides have been shown to influence
endothelial cells behavior through interaction with angiogenic growth factors (VEGF, TGF, PDGF or bFGF),
thus influencing angiogenesis.4-7 The study of this complex system through both direct cell-cell contact and
indirect paracrine signaling/angiogenic factors among osteoblasts and endothelial cells may lead new
therapeutic interventions for bone pathologies treatment and bone tissue regeneration and reconstruction.

Type of Work: Experimental.

Most Relevant Methodologies: The biomaterial of collagen/nanohydroxyapatite (col/nanoHA) will


be prepared using the electrospinning/electrospraying techniques. Scaffolds morphology, chemistry and
mechanical properties will be fully characterized and compared with the non-aligned collagen fibers scaffold
using SEM, AFM and FTIR. The biomaterial of col/nanoHA is adequate for the functionalization with SPARC
or SPARC-derived peptides, providing a structure capable of supporting cell adhesion and migration. The
selected SPARC-derived peptides, an inhibitor and a stimulator of angiogenesis, will be synthesized by solid-
phase peptide synthesis, purified by preparative high-performance liquid chromatography (HPLC) and
analyzed by analytical HPLC and mass spectrometry (MS), using both electrospray ionization/ion-trap (ESI-IT)
and matrix-assisted laser desorption ionization/time of flight (MALDI-TOF) techniques. The peptides will be
next bound onto scaffold surfaces, and the amount, density and its conformational structure influence on
cell adhesion, proliferation and morphology will be assessed by fluorescence microscopy and CLSM.

References
1 - N Ribeiro, SR Sousa, CA van Blitterswijk, L Moroni, FJ Monteiro, A biocomposite of collagen nanofibers and
nanohydroxyapatite for bone regeneration, Biofabrication. 2014 Jun 13;6(3):035015. 2 - PCT Application
WO2015/162559 A1 entitled “mesh composition for repairing or the regeneration of tissues and methods thereof”.
3 - Termine, J.D., Kleinman, H.K., Whitson, S.W.et al. (1981) Osteonectin, a bone- specific protein linking mineral to
collagen. Cell 26, (1) 99-105. 4 - N Ribeiro, SR Sousa, FJ Monteiro, Influence of crystallite size of nanophased
hydroxyapatite on fibronectin and osteonectin adsorption and on MC3T3-E1 osteoblast adhesion and morphology, J
Colloid Interface Sci. 2010 Nov 15;351(2):398-406. 5 - Sage, E.H., Reed, M., Funk, S.E. et al. (2003) Cleavage of the
matricellular protein SPARC by matrix metalloproteinase 3 produces polypeptides that influence angiogenesis. Journal
of Biological Chemistry 278, 39, 37849-37857. 6 - Rivera, B., Bradshaw, D., and Brekken, R.A., (2011) The regulatory
function of SPARC in vascular biology. Cellular and Molecular Life Sciences 68, 3165-3173. 7 - Kupprion C., Motamed, K.,
Sage, E.H. 1998. SPARC (BM‐40, osteonectin) inhibits the mitogenic effect of vascular endothelial growth factor on
microvascular endothelial cells. Journal of Biological Chemistry 273, 29635–29640.
21
Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 20

Title: “New Generation Peptides with Antibiotic Potential: Unveiling the


Target Pathways in E. amylovora and the Pathosystem”
Supervisor: Doutora Cátia Andreia Silva Teixeira: catia.teixeira@fc.up.pt
Co-supervisor: Profª Doutora Maria da Conceição L.V. dos Santos: csantos@fc.up.pt
Host Institution: Departamento de Química e Bioquímica e Departamento de Biologia da
Faculdade de Ciências-UPorto

Summary: The rapid emergence of multidrug-resistant pathogens has become a global concern,
which has prompted the search for alternative antibacterial agents for use in the agro-food industry.
Antimicrobial peptides (AMPs) are produced by all organisms, from prokaryotes to human beings,
and have been described as evolutionarily ancient weapons against microbial infections [1,2]. AMPs
serve a fundamental role in innate immunity, being particularly attractive candidates for the design
of new antimicrobial agents for specific application because of their natural antimicrobial properties
and a low propensity for the development of bacterial resistance[2,3]. As such, this work will focus
on a model a phytopathogenic bacterial, responsible for the fireblight disease in pears and apples [3],
for which no efficient combat measures are available.
In this context, the student will be responsible for i) the synthesis of new antimicrobial peptides
prone to control E. amylovora proliferation/growth in vitro and control its proliferation in the
pathosystem. Subsequently, the student will also try to understand the cell pathways in the
bacteria/pathosystem like virulence factors, specific receptors, cell cycle, death[2,3] that are
influenced by these peptides. Cell susceptibility to these AMPs will include omics approach [4,5] for
cell cycle dynamics and death, and gene expression of target pathways[5-7].
Type of Work: Experimental.
Most Relevant Methodologies: Solid-phase peptide synthesis (manual and automated
modes); analytical and preparative high-performance liquid chromatography and mass
spectrometry. Bacterial culture, EPPO tests of pathogenicity/virulence; cell-cycle assessment, cell
viability (eg fluorescence microscopy); flow cytometry; inoculation; RNA extraction; primer design;
gene expression (RTqPCR)
References
1
- Bessa J, …Gomes, P., et al (2018) Synergistic and antibiofilm properties of ocellatin peptides against
multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa Future Microbiology 13(2), pp. 151-163
2
- RuizC., Nadal A, Montesinos E, Pla M (2017) Novel Rosaceae Plant Elicitor Peptidesas sustainable tools to
control Xanthomonas arboricola pv. Pruni in Prunus spp. Molecular Plant Pathology 01/2017
3
- Montesinos L.,Bundó M, Badosa E,et al (2017) Production of BP178,a derivative of the synthetic
antibacterial peptide BP100, in the rice seed endosperm. BMCPlantBiology 17(1):63.
4
- Piqué N, et al (2015) Virulence Factors of Erwinia amylovora: A Review. Int J Mol Sci. 16(6):12836-54.
5
- Kałużna M, Kuras A, Puławska J. (2017) Validation of reference genes for the normalization of the RT-qPCR gene
expression of virulence genes of Erwinia amylovora in apple shoots. Sci Rep. 2017 May 17;7(1):2034
6
- Kamber T, Buchmann JP, Pothier JF, Smits TH, Wicker T, Duffy B (2016) Fire blight disease reactome:
RNA-seq transcriptional profile of apple host plant defense responses to Erwinia amylovora pathogen
infection. (Nature insights) Scientific Reports 6, 21600
7
- Santos C (2015) Integrating Metabolome and Functional Data in Plant Pathology and Protection Studies. J
Plant Pathol Microb 6:e108.
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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 21

Title: “Antimicrobial Peptides as Potential Alternatives to Antibiotics in the


Agro-Food Industry”
Supervisor: Doutora Cátia Andreia Silva Teixeira: catia.teixeira@fc.up.pt
Co-supervisor: Profª Doutora Paula Alexandra de Carvalho Gomes: pgomes@fc.up.pt

Host Institution: Departamento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências da


Universidade do Porto; Escola Superior de Saúde do Instituto Politécnico do Porto (ESS-IPP)

Summary: Microbial pathogens are a real burden to the agro-food industry (AFI), spanning from
plant infections to food spoilage. Antimicrobial peptides (AMPs) are not as new as food
preservatives, since bacteriocins like pediocin (natural AMP with 62 AA) are widely used in AFI.[1]
Yet, smaller AMPs have not been explored, although they might represent cheaper alternatives with
increased safety as small peptides seldom trigger allergic reactions.[2] AMPs derived from bovine
lactoferrin (bLf),[3] a natural protein in cow’s milk approved to be used as nutraceutical,[4] might
be of particular interest for the AFI. The application of bLf-derived AMPs as key components in active
edible films and coatings has never been reported and holds great promise in improving food safety.
In this context, the student will be responsible for the synthesis of selected bLf-derived peptides
that will then be screened for their activities against a panel of selected microorganisms covering
the entire spectrum of the most common causative agents of smoked sausage spoilage, namely
Gram-positive bacteria (e.g. Clostridium perfringens, Listeria monocytogenes and Staphylococcus
aureus), Gram-negative bacteria (e.g. Escherichia coli, Salmonella enteritidis, Campylobacter jejuni),
fungus (e.g. Candida albicans) and mold (e.g. Aspergillus flavus).

Type of Work: Experimental.

Most Relevant Methodologies: Solid-phase peptide synthesis (manual and automated


modes); analytical and preparative high-performance liquid chromatography and mass
spectrometry. Bacterial and cell culture, and minimum inhibitory concentration (MIC)
determination by the broth micro dilution method.

References
[1] Sanchez-Ortega, I., et al. The Scientific World Journal 2014, Article ID 248935 (doi: 10.1155/2014/248935)
[2] Martins, M.C.L., et al. Acta Biomaterialia 2011, 7, 1431-1440 (doi: 10.1016/j.actbio.2010.11.005)
[3] Théolier, J., et al. Dairy Sci. & Technol. 2014, 94, 181-193 (doi: 10.1007/s13594-013-0153-2)
[4] EFSA Panel on Contaminants in the Food Chain, EFSA Journal 2016, 14 (5), 4426-4585
(doi:10.2903/j.efsa.2016.4426)

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 22

Title: “Putting Membrane Lipids on the Radar of Drug Development: the


Case of Nonsteroidal Anti-Inflammatory Drugs Associated with
Protective Mediators”
Supervisor: Doutora Maria Catarina F. da S. Pereira Leite: mleite@ff.up.pt
Co-supervisors: Doutora Cláudia Daniela O. de L. Nunes Pinho: cdnunes@ff.up.pt
Profª Doutora Salette de F. F. H. Reis Dias Rodrigues: shreis@ff.up.pt

Host Institution: LAQV, REQUIMTE, Faculdade de Farmácia-UPorto

Summary: The efficacy of nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) against inflammation,


pain, and fever explains their worldwide use in the treatment of inflammatory conditions. However,
the long-term therapy with NSAIDs is associated with a high incidence of adverse events. This fact
has been the root for a long journey in the search for novel anti-inflammatory drugs with improved
tolerability. One of the main strategies to improve NSAIDs safety comprises the modification of
existing NSAIDs to release in vivo protective mediators, such as phosphatidylcholines, nitric oxide
(NO) and hydrogen sulfide (H2S). (1)
Drug development is a laborious process with huge costs. Even though, the toxic effects of
pharmaceuticals are often recognized after commercialization, resulting in post-marketing
withdrawal. In this sense, the complete description of the pharmacological actions of novel drugs is
crucial before market launch. Since the therapeutic and toxic effects of NSAIDs are related to their
effects on membrane lipids (2), this project aims at evaluating the effect of novel NSAIDs, namely
H2S- and NO-releasing NSAIDs, and the corresponding parent NSAIDs on membrane lipids to give
insights into the pharmacological mechanisms of the novel drugs.
H2S- and NO-hybrids of indomethacin and diclofenac will be studied, and Langmuir monolayers
made of phosphatidylcholines and cholesterol will be used as membrane model systems. The
interactions of drugs with membrane lipids will be evaluated using complementary biophysical
techniques, namely surface pressure-area isotherms, infrared reflection-adsorption spectroscopy
and Brewster angle microscopy.
This project results will contribute to the enlightenment of the membrane lipid-related
pharmacological actions of NSAIDs, and to the prediction of novel drugs ability to induce in vivo
toxicity. In this sense, this project is another small step toward the development of safer anti-
inflammatory therapies.

Type of Work: Experimental.


References
1. Pereira-Leite C, Nunes C, Jamal SK, Cuccovia IM, Reis S. Med Res Rev. 2017; 37(4): 802-59.
2. Pereira-Leite C, Nunes C, Reis S. Prog Lipid Res. 2013; 52(4): 571-84.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 23

Título: “Compostos Antioxidantes e Bioactivos de Extratos de Açaí”

Orientadora: Doutor Daniel Oliveira Carvalho: agsantos@fc.up.pt


Co-orientadora: Doutora Maria Raquel Martins da Costa: mrcosta@med.up.pt

Instituição de Acolhimento: Departamento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências


DQB-FCUP-UPorto; Departamento de Biomedicina, Unidade de Bioquímica, Faculdade de Medicina
UPorto e Instituto de Investigação e Inovação em Saúde – I3S.

Resumo: O açaí (Euterpe olerácea) é uma palmeira originária da América Central e do Sul, sendo
encontrada em grandes quantidades na região Amazónica. O seu fruto tem vindo a despertar o
interesse da comunidade científica devido aos seus benefícios nutricionais e terapêuticos [1, 2].
Estes efeitos são maioritariamente atribuídos aos compostos fenólicos presentes no fruto [2] e cujos
extratos poderão ter potencial de aplicação terapêutica e serem utilizados como aditivo em
alimentos funcionais e cosméticos. Assim, este projeto tem como principais objetivos a identificação
de compostos antioxidantes em estratos de açaí e a avaliação da sua actividade bioactividade.

Este projecto será dividido nas seguintes etapas: 1) Preparação de extratos aquosos e
hidroetanólicos de açaí; 2) Avaliação do teor de polifenóis totais e capacidade antioxidante dos
extratos; 3) Identificação dos principais compostos presentes nos extratos; 4) Estudo da
bioatividade dos extratos em culturas celulares.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias mais relevantes: - HPLC-DAD-ESI-MS; Culturas celulares e ensaios bioquímicos

Bibliografia
[1] Schauss et al., J. Agric. Food Chem. 2006, 54(22): 8598-603.
[2] Yamaguchi et al., Food Chem. 2015, 179: 137-51.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 24

Title: “Wine-Inspired Synthesis of Blue Pyranoflavyliums for Topical


Photodynamic Therapy”

Supervisor: Doutora Iva Luzia Reis Fernandes: iva.fernandes@fc.up.pt


Co-supervisor: Doutora Joana Alexandra da Silva Oliveira: jsoliveira@fc.up.pt.

Host Institution: Departamento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências-UPorto

Summary: This project aims to hemi-synthetize a library of bluish pigments (lambdamax > 600 nm)
and to use them in new formulations taking advantage of both their physicochemical properties and
bioactivity towards skin PDT (photodynamic therapy).
The project includes extraction of anthocyanins from wine and fruit by-products, the synthesis of 3-
O-deoxyanthocyanidins and their chemical transformation into a series of blue pyranoflavyliums
and evaluation of their physicochemical stability. Then, assays will include skin toxicity, penetration
capacity and bioactivity in in vitro models for a simple screening of the capacity of the more stable
compounds towards phototherapy.

Type of Work: Experimental.

Most Relevant Methodologies: To test the toxicity, permeability and wound-healing


properties of the blue compounds (PS) in skin cells. This screening will be performed in Keratinocytes
and Human fibroblasts, in a rather FAST and simple manner by using an ECIS system.

References
J. Oliveira, N. Mateus, V. de Freitas. Previous and recent advances in pyranoanthocyanins equilibria in
aqueous solution. Dyes and Pigments, 2014, 100, 190-200.

A. Évora, V. de Freitas, N. Mateus, I. Fernandes. Effect of anthocyanins from red wine and blackberry on the
integrity of a keratinocyte model using ECIS. Food & Function, 2017, 8, 3989-3998.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 25

Título: “Atividade de Antivirulência de Extratos Naturais e Compostos de


Síntese”
Orientador: Prof. Doutor Paolo De Marco: paolo.demarco@iucs.cespu.pt
Instituição de Acolhimento: Instituto de Investigação e Formação Avançada em Ciências e
Tecnologias da Saúde (IINFACTS), Campus CESPU, Gandra, Paredes.

Resumo: Dado o crescente insucesso dos agentes antimicrobianos, novas direções para a
investigação têm de ser exploradas. Neste projeto, propomos testar a capacidade de vários
compostos sintéticos e extratos naturais em inibir a expressão de características de virulência de 5
espécies bacterianas patogénicas (Staphylococcus aureus, S. epidermidis, Enterococcus faecalis,
Escherichia coli e Pseudomonas aeruginosa) e um fungo patogénico (Candida albicans). Testaremos
o potencial dos compostos em dificultar a formação de biofilme ou em destruir biofilme
estabelecido pelas 6 espécies, ou em inibir a biossíntese de pigmentos importantes para o
comportamento virulento de S. aureus (stafiloxantina) ou P. aeruginosa (piocianina). Os compostos
que demonstrarem atividade serão depois estudados mais aprofundadamente e a resposta dos
microrganismos (ao nível do transcriptoma e proteoma) serão alvo de pesquisa para percebermos
os mecanismos na base da antivirulência. Os compostos comprovadamente ativos em futuro
poderão ser usados como fármacos antimicrobianos para diminuir a carga de virulência do
patogénio no hospedeiro e assim aumentar as possibilidades das terapias serem bem sucedidas e
da resposta imunitária do hospedeiro conseguir debelar a infeção.
Tipo de trabalho: Experimental
Metodologias Mais Relevantes: Cultura de microrganismos; técnicas assépticas; utilização da
câmara de fluxo laminar; espetrofotometria em leitor de placas multipoço e confirmação em
volumes maiores; preparação de material biológico para análise do transcriptoma e/ou proteoma.

Bibliografia
[1] Brannon & Hadjifrangiskou (2016) The arsenal of pathogens and antivirulence therapeutic strategies for
disarming them. Drug Design, Development and Therapy 10:1795–1806
[2] Gupta et al. (2016) Biofilm, pathogenesis and prevention—a journey to break the wall: a review. Arch
Microbiol 198:1
[3] Clauditz et al. (2006) Staphyloxanthin plays a role in the fitness of Staphylococcus aureus and its ability to
cope with oxidative stress. Infect Immun 74:4950–4953
[4] Lau et al. (2004) Pseudomonas aeruginosa pyocyanin is critical for lung infection in mice. Infect Immun
72:4275–4278
[5] Fernandes et al. (2014) New chiral derivatives of xanthones: Synthesis and investigation of
enantioselectivity as inhibitors of growth of human tumor cell lines. Bioorganic & Medicinal Chemistry
22:1049-1062
[6] Dias et al. (2016) Oxygenated monoterpenes rich volatile oils as potential antifungal agents for
dermatophytes. Nat Prod Res. 16:1-5.
[7] Machado et al. (2014) Antiprotozoa activity of the essential oil of Thymus capitellatus against Giardia lamblia,
Leishmania infantum, Leishmania tropica and Leishmania major. Veterinary Parasitology (1-2): 39-49.
[8] Machado et al. (2011) Anti-Giardia activity of Syzygium aromaticum essential oil and eugenol: effects on
growth, viability, adherence and ultrastructure. Experimental Parasitology 127:732-9.
[9] Machado et al. (2012) Aldheides monoterpenes as potential anti-Leishmania agents: activity of Cymbopongon
citratus and citral on L. infantum, L. tropica and L. major. Experimental Parasitology 130: 223-31.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 26

Título: “Perfil de Compostos Fenólicos em Vinhos Tintos Envelhecidos em


Barricas com Diferentes Graus de Oxigenação. Impacto na
Formação de Novos Pigmentos”

Orientadora: Doutora Joana Alexandra da Silva Oliveira: jsoliveira@fc.up.pt


Co-orientador: Prof. Doutor Nuno Filipe da Cruz Baptista Mateus: nbmateus@fc.up.pt

Instituição de Acolhimento: Departamento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências


UPorto

Resumo: A utilização da madeira no setor vitivinícola associada à elaboração, conservação, mas


sobretudo ao transporte dos vinhos é uma prática já bastante antiga. Desde cedo se reconheceu a
importância da influência da madeira, na qualidade dos produtos enológicos. Uma das principias
caraterísticas que a madeira adequada a fins enológicos deverá ter é uma porosidade ligeira, sendo
permeável à passagem de gases, especialmente oxigénio, que está envolvido nas reações de
oxidação e noutros processos físico-químicos que ocorrem durante o processo de envelhecimento.
Este trabalho visa a caracterização dos compostos fenólicos presentes em vinhos tintos
envelhecidos em barricas com diferentes graus de oxigenação e o seu impacto na formação de
novos pigmentos derivados das antocianinas.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias Mais Relevantes: Espectrofotometria de UV-Vis; HPLC-DAD; purificação por


cromatografia de baixa pressão; análise de espectrometria de massa – LC/MS; RMN.

Bibliografia
1. Mateus, N.; de Freitas, V. Evolution and stability of anthocyanin-derived pigments during port wine aging.
J. Agric. Food Chem. 2001, 49, 5217-5222.

2. https://sigarra.up.pt/fcup/pt/pub_geral.show_file?pi_gdoc_id=69002

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 27

Título: “Caracterização da Resposta Imunológica Induzida no Tecido


Adiposo de Animais Infectados com Neospora Caninum”
Orientadora: Doutora Luzia Manuela Lima Teixeira Ranginha: lmteixeira@icbas.up.pt
Co-orientadoras: Mestre Bárbara Maria Nascimento Oliveira: bmnoliveira@icbas.up.pt
Profª Doutora Alexandra Correia: alexandra.correia@ibmc.up.pt

Instituição de Acolhimento: Departamento de Anatomia, Instituto de Ciências Biomédicas Abel


Salazar – ICBAS UPorto

Resumo: Neospora caninum é um protozoário da família apicomplexa, relacionado com o


patogénio humano Toxoplasma gondii. Embora o parasita N. caninum tenha sido isolado de várias
espécies animais, a neosporose assumiu uma importância particular no gado bovino, como
responsável pelaocorrência de abortos, descritos em muitos países em todo o mundo, incluindo em
Portugal. Não existe uma vacina atualmente comercializada para prevenir esta infecção, o que leva
a um enorme impacto económico desta na indústria leiteira e de produção de carne. Nos últimos
anos temos vindo a fazer contribuições significativas para a caracterização dos mecanismos
imunológicos desencadeados pela infecção por N. caninum. No nosso trabalho mais recente
demonstramos, em murganhos, que a infecção com N. caninum induz alterações significativas em
várias populaçõesde células imunológicas presentes no tecido adiposo, que persistem após
eliminação local do parasita (1-2). Curiosamente, foi evidenciada uma resposta imunitária do tipo
Th1 no tecido adiposo de ratinhos infectados (1-2). Respostas deste tipo estão associadas a proteção
contra a neosporose. Assim, neste projeto pretendemos continuar esse trabalho, investigando o
papel de populações celulares especificas presentes no tecido adiposo, na modulação da resposta
imunitária de hospedeiros infectados com N. caninum. Os resultados obtidos irão contribuir não só
para melhorar o conhecimento atual sobre a imunobiologia da neosporose como também contribuir
para a compreensão da resposta imunitária que ocorre no tecido adiposo após infecção, um campo
ainda pouco explorado.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias mais relevantes: Citometria de fluxo e separação celular, Cultura de células,


ELISA, Imunohistoquímica, Extração de DNA/RNA e PCR em tempo real.

Bibliografia
1. Teixeira L, Marques RM, Ferreirinha P, Bezerra F, et al. Enrichment of IFN-γ producing cells in different
murine adipose tissue depots upon infection with an apicomplexan parasite. Sci Rep. 2016 Mar 22;6:23475.
doi: 10.1038/srep23475.
2. Teixeira L, Moreira J, Melo J, Bezerra F, Marques RM, et al. Immune response in the adipose tissue of lean
mice infected with the protozoan parasite Neospora caninum. Immunology. 2015;145:242-57.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 28

Title: “Design and Development of Cationic Nanoparticles for the Delivery


of a Catecol O-Metiltransferase Inhibitor into Brain”

Supervisor: Profª. Doutora Maria Fernanda Martins Borges: fborges@fc.up.pt


Co-Supervisor: Doutor Carlos Eduardo Vinhas Fernandes: carlos.fernandes@fc.up.pt

Host Institution: CIQUP/Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências UPorto

Summary: One area in which nanotechnology may have a significant clinical impact is in
neuroscience, namely for the selective transport and delivery of drugs, and other small molecules,
across the blood brain barrier (BBB).
In particular, polymeric nanocarriers ensure that the drug is delivered to the right site of action where
a biological trigger promotes drug release. With this aim, polymeric nanoparticles (NPs) backbone
will be conjugated with entities recognized by BBB receptors in order to deliver a catecol O-
Metiltransferase inhibitor.
The project is interdisciplinary, spanning from the functionalization of nanoparticles and the in vitro
characterization of the nanoformulations. The toxicity profile of the most promising
nanoformulations will be evaluated in in vitro assays and their capacity to surpass in vitro models of
biological barriers, namely BBB, will be tested using human brain endothelial cells.

Type of work: Experimental

Most Relevant Methodologies: Nuclear magnetic resonance, UV-Vis spectroscopy, dynamic


light scattering and matrix-assisted laser desorption/ionization, cellular studies

References
[1] M.T. Lin, M.F. Beal, Mitochondrial dysfunction and oxidative stress in neurodegenerative diseases, Nature
443 (2006) 787-795.
[2] Q.R. Smith, A review of blood-brain barrier transport techniques, Meth. Mol. Med. 89 (2003) 193-208.
[3] S.V. Vinogradov, T.K. Bronich, A.V. Kabanov, Nanosized cationic hydrogels for drug delivery: preparation,
properties and interactions with cells, Adv. Drug Deliv. Rev. 54 (2002) 135-47.
[4] A, Reisch, A, Runser, Y, Arntz, Y, Mély, A. S. Klymchenko, Charge-controlled nanoprecipitation as a modular
approach to ultrasmall polymer nanocarriers: making bright and stable nanoparticles, ACS Nano 9 (2015)
5104–5116

30
Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 29

Title: “Deciphering the Role of Frq1 Binding to Ceramide as a Switch


between Life and Death”
Supervisors: Prof. Doutor Vitor Manuel Vieira da Costa: vcosta@ibmc.up.pt
Doutora Clara Isabel Ferreira Pereira: clara.pereira@ibmc.up.pt
Host Institution: Instituto de Investigação e Inovação em Saúde – I3S

Summary: Neuronal calcium sensor proteins (frequenin or NCS) are calcium-binding proteins
expressed in the brain and other tissues where they transduce calcium signals. Calcium binding to
NCS exposes a hydrophobic patch that localizes NCS to membranes where it regulates PI4KIII, a
phosphatidylinositol 4-kinase involved in the regulation of protein trafficking. Notably, the
hydrophobic patch exposed by calcium binding overlaps with predicted sites of ceramide binding
and recent studies identified NCS as ceramide binding proteins. Moreover, NCS are genetically
linked to degenerative diseases and changes in the levels of ceramides, bioactive sphingolipids
implicated in regulated cell death, have been associated with aging and age-related disorders.
NCS proteins and ceramide metabolism are highly conserved from yeast to mammals. The yeast
frequenin (Frq1) controls the activity and localization of Pik1, a phosphatidylinositol 4-kinase
isoform that regulates autophagy. Notably, autophagy is critical for cellular homeostasis/survival
and ceramide signalling affects autophagy. Our studies have predicted a ceramide binding pocket
on yeast Frq1. Thus, we postulate that the increase of ceramide levels and its binding to Frq1 may
contribute to the impairment of autophagy, favouring cell death.
This project aims to characterize the regulation of Frq1 by ceramide and its impact on autophagy and
lifespan, using the yeast S. cerevisiae as eukaryotic model. For that, we will assess how mutations on the
amino acid residues that mediate the binding of Frq1 to ceramide affect Frq1 protein localization,
cellular longevity, and autophagy. Frq1 mutations will be introduced by site-directed mutagenesis.
Cellular localization of Frq1 will be evaluated by fluorescence microscopy, in cells expressing Frq1-GFP.
Yeast lifespan will be determined by following the survival of stationary phase cells. Intracellular
oxidation, a biomarker of aged cells, will be monitored by flow cytometry, in cells stained with molecular
probes. Autophagy will be assessed by Western-blotting, using the GFP-Atg8 processing assay.
The results obtained will contribute to our understanding of the interplay between ceramide
signaling and Frq1 function and may open novel avenues for investigating the molecular basis of
disorders associated with deregulation of ceramide levels and for the development of therapeutic
strategies aimed at counteracting the development of those diseases.
Type of work: Experimental
Most Relevant Methodologies: Cell cultures (yeast and E. coli); polyacrylamide (proteins) and
agarose (DNA) gel electrophoresis; Western blotting; DNA purification; fluorescence microscopy;
flow cytometry.
References
Lim S, et al. (2014) Front Mol Neurosci 17:19.
Bidlingmaier S, et al. (2016) Mol Cell Proteomics 15: 1232-1245.
Teixeira V, Costa V et al. (2016) Biochim Biophys Acta - Mol Cell Biol Lipids 1861, 21-33.
Teixeira V, Costa V (2016) Prog Lipid Res 61: 109-133.
Hannun YA, Obeid LM. (2018) Nat Rev Mol Cell Biol 19: 175-191.
31
Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 30

Título: “Estudo da Modelação de Propriedades Organoléticas


(Adstringência) com Polissacáridos Alimentares”
Orientadora: Doutora Susana Isabel P.T. Pereira Soares: susana.soares@fc.up.pt
Co-orientador: Prof. Doutor Victor Armando Pereira de Freitas: vfreitas@fc.up.pt

Instituição de Acolhimento: Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências


– DQB-FCUP - UPorto

Resumo: Os polifenóis estão presentes em alimentos e bebidas de origem vegetal. Alguns


polifenóis estão relacionados com aspetos sensoriais (cor e sabor) destes produtos alimentares e,
adicionalmente, também têm sido conhecidos pelos seus benefícios para a saúde (ação
antioxidante, entre outras).
Uma classe de polifenóis, os taninos, estão envolvidos na perceção da adstringência (sensação de
secura e constrição na cavidade oral). Esta sensação é desejada em algumas bebidas em níveis
equilibrados. O mecanismo mais aceite para a sua origem resulta da interação/precipitação das
proteínas salivares (PS) pelos taninos 1-4. É conhecido que a adstringência pode ser influenciada por
diversos fatores, força iónica, pH, e pela presença de outros compostos (e.g. polissacáridos). No
entanto, ainda há muito por estudar nesta sensação e principalmente na sua modelação. Deste
modo, este trabalho pretende conciliar a valorização de subprodutos, pela utilização de
polissacáridos presentes na película de uva, com uma necessidade da indústria alimentar, a de
modelar a adstringência.
A indústria vinícola produz uma grande quantidade de resíduos, nomeadamente o bagaço (inclui o
engaço, as películas e as grainhas) dos quais podem ser isolados polissacáridos com diferentes
composições químicas e que apresentam um elevado potencial. Os polissacáridos têm apresentado
capacidade para diminuir a interação dos taninos com PS e deste modo reduzir a adstringência. Assim,
neste trabalho propõe-se o isolamento de polissacáridos, taninos e PS para se estudar o efeito e a
possível aplicação destes compostos na modelação da interação de taninos/diferentes famílias de PS.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias mais relevantes: Este trabalho implica a utilização e aprendizagem de técnicas


muito distintas, diálise, extração liquído-líquido, cromatografia líquida de elevada eficiência (HPLC),
cromatografia líquida em coluna, espectrometria de massa (ESI-MS, MALDI-TOF) e extinção da
fluorescência

Bibliografia
[1].Soares, S., et al., J. Agric. Food Chem., 2011. 59(10): p. 5535-5547.
[2].de Freitas, V., et al., Current Organic Chemistry, 2012. 16(6): p. 724-746.
[3].Brandão, E., et al., J. Agric. Food Chem., 2014. 62(39): p. a9562-9568.
[4].Soares, S., et al., Crit. Rev. Food Sci. Nutr., 2017. 57(5): p. 937-948
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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 31

Title: “Tracking Astrocytes and Microglia Phenotypes in Melanoma-Glia


Interaction”

Supervisor: Prof. Doutora Maria Clara Ferreira de Oliveira Quintas: cquintas@ff.up.pt


Co- Supervisor: Prof. Doutora Paula Maria Façanha Cruz Fresco: pfresco@ff.up.pt

Host Institution: Faculdade de Farmácia da UPorto

Summary: Brain metastasis, the secondary growth of malignant cells within the central nervous
system (CNS), is a common complication of patients with melanoma. Malignant brain metastasis are
highly aggressive diseases that are often resistant to treatments resulting in extremely poor
prognosis.
Following invasion, colonization is crucial for the formation of macroscopic metastasis1. Therefore,
it is fundamental to study the specific microenvironments of individual metastatic host organs in
order to understand the mechanisms underlying metastatic colonization.
The brain has a unique defence system composed of microglia and astrocytes. These glial cells play
an important role in brain tumour progression. Microglia and astrocytes have the ability to assume
different phenotypes and to exhibit either anti-tumour functions by phagocytosis and the release
of cytotoxic factors or tumour-supportive functions, by certain tumour-derived soluble factors,
promoting tumour maintenance and progression.1,2
The present project aims to investigate how A375 melanoma cells manage to adapt to the tissue
environment of the CNS, regarding the morphological and functional manipulation of glial cells. For
this purpose, A375 melanoma cell line will be co-cultured with microglia and/or astrocytes and the
morphology and function of glial cells (motility, phagocytosis, proliferation, production of cytokines)
will be investigated.

Type of work: Experimental

Most Relevant Methodologies: With this project the student may expect to develop the
following methodologies and skills: 1) cell cultures; 2) pharmacological and biochemical assays; 3)
immunofluorescence imaging; 4) critically interpret and discuss experimental data.

References
1
Kienast et al., 2010; Nat Med 16:116
2
Wu and Watabe, 2017; Front Biosci 22:1805
3
Wasilewski et al., 2017; Front Oncol. 7: 298

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 32

Title: “Antibiotic and Antibiotic Resistance Genes in the Environment”

Supervisor: Prof. Doutor Joaquim C.G. Esteves da Silva: jcsilva@fc.up.pt


Co- Supervisor: Doutor Luís Pinto da Silva: luis.silva@fc.up.pt

Host Institution: CIQUP e Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências –


DQB-FCUP - UPorto

Summary: Currently there are two environmental problems related to antibiotics. The first is
related with the presence of antibiotics in environmental compartments due to the discharge of
untreated sewage containing pharmaceutical drugs. The second is related with increasing amounts
of antibiotic resistance genes (ARG) in the environment [1,2]. In this fellowship, besides the state of
the art of these two problems, either from an environmental and analytical methodology point of
view, a research work on the existence and concentrations of antibiotics and ARG in the Porto area
will be done.

Type of work: Experimental

References
1. Jing Li et al, Global Survey of Antibiotic Resistance Genes in Air, Environmental Science and Technology,
2018 DOI: 10.1021/acs.est.8b02204.
2. Yuyi Yang et al, Antibiotics and antibiotic resistance genes in global lakes: A review and meta-analysis,
Environment International 116 (2018) 60–73.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 33

Title: “Recycling Sewage Water for Human Consumption and Disinfection


By-Products”

Supervisor: Prof. Doutor Joaquim C.G. Esteves da Silva: jcsilva@fc.up.pt


Co- Supervisor: Doutor Luís Pinto da Silva: luis.silva@fc.up.pt

Host Institution: CIQUP e Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências –


DQB-FCUP - UPorto

Summary: One of the biggest scientific and technological challenges of the near future is to solve the
scarcity of good quality water suitable for human and animal consumption. Water quality can only be
achieved by a series of physico-chemical processes and the more contaminated the water is more treatment
is required. One of the ultimate challenges is the recycling of water, i.e. obtaining potable water from sewage.
Although this task is relatively simple to control from the microbiological point of view, the generation of
disinfection by-products (DBP) makes it a difficult task from a chemical and human health risks point of view
[1,2]. One DBP family that involves higher human health risks is the nitrosamines, and the most typical
molecule is N-nitrosodimethylamine (NDMA). In this fellowship the current state of the art analytical
methodologies to detect NDMA will be reviewed as well as the mechanisms of its formation in disinfected
water. Also, from the experimental point of view, disinfection simulations, using standard and advanced
water treatment methodologies, and NDMA quantification will be made.

Type of work: Experimental

References
1) Urs von Gunten, Oxidation Processes in Water Treatment: Are We on Track?, Environ. Sci. Technol.
2018, 52, 5062−5075.
2) Xing-Fang Li and William A. Mitch, Drinking Water Disinfection Byproducts (DBPs) and Human Health
Effects: Multidisciplinary Challenges and Opportunities, Environ. Sci. Technol. 2018, 52, 1681−1689.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 34

Title: “Development of Modified Photodynamic Therapies for Cancer”

Supervisor: Doutor Luís Pinto da Silva: luis.silva@fc.up.pt


Co- Supervisor: Prof. Doutor Joaquim C.G. Esteves da Silva: jcsilva@fc.up.pt

Host Institution: CIQUP e Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências –


DQB-FCUP - UPorto

Summary: The student will be integrated into a patent-pending research project, towards the
development of modified photodynamic therapies for cancer based on chemiluminescence.
Photodynamic therapy is a minimally invasive and clinically-available cancer therapy with the
potential to supersede chemo- and radiotherapy due to its limited number of side-effects. This
approach consists on the administration of a drug to the patient, which is only activated by light
emitted from an external light source. Despite good results, photodynamic therapy is only mainly
used on skin cancer, as light has not a significant penetration depth into biologic tissue.
Herein, we aim to develop a new drug able to be self-activated by light inside the cell, without the
need for an external light source. To this end, we have based our work on chemiluminescent
processes. Chemiluminescence consists on the emission of light as the result of a chemical reaction
and is a widespread phenomenon in nature. In fact, this is the phenomenon that explains the well-
known luminescence of fireflies and other living organisms (jellyfishes, fishes, fungi and bacteria).
So, chemiluminescence has the potential for allowing for intracellular light emission without a light
source, opening the door for eliminating the spatial restrictions currently associated with
photodynamic therapy of cancer.

Type of work: Experimental

Most Relevant Methodologies: yeast growth, flow cytometry, polyacrylamide (proteins) and
agarose (DNA) gel electrophoresis, Western blot, PCR, DNA purification.

References
 C.M. Magalhães, J.C.G. Esteves da Silva, L. Pinto da Silva. ChemPhysChem 2016, 17, 2286-2294.
 M. Vacher, I.F. Galván, B.W. Ding, S. Schramm, et al. Chem. Rev. 2018, DOI:
10.1021/acs.chemrev.7b00649.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 35

Title: “Development of Modified Photodynamic Therapies for Cancer”

Supervisor: Doutor Luís Pinto da Silva: luis.silva@fc.up.pt


Co- Supervisor: Prof. Doutor Joaquim C.G. Esteves da Silva: jcsilva@fc.up.pt

Host Institution: CIQUP e Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências –


DQB-FCUP - UPorto

Summary: The student will be integrated into a patent-pending research project, towards the
development of light-emission systems mimicking those responsible for luminescence observed in Nature,
namely for fireflies, jellyfishes, fishes, insects and bacteria, with the final goal of using them as electricity-
free light sources for photocatalysis.

Photocatalysis uses light instead of thermal energy to drive chemical reactions, allowing for catalysis under
milder conditions than regular catalysis. The use of light as a driving force also allows for the use of reaction
pathways not accessible by thermal energy. Thus, it is an innovative and useful catalytic strategy for the
development of drugs, polymers and other fine chemicals, as well as in environmental remediation.

Type of work: Experimental

Most Relevant Methodologies: Luminescence spectroscopy, Raman spectroscopy, Liquid


Chromatography, UV-Vis spectroscopy, Mass spectrometry and Gas chromatography.

References
 C.M. Magalhães, J.C.G. Esteves da Silva, L. Pinto da Silva. ChemPhysChem 2016, 17, 2286-2294.
 L.I. Granone, F. Sieland, N. Zheng, R. Dillert, D.W. Bahnemann. Green Chem. 2018, 20, 1169-1192.
 S. Xu, P. Zhou, Z. Zhang, C. Yang, B. Zhang, K. Deng, S. Bottle, H. Zhui. J. Am. Chem. Soc. 2017,
139, 14775-14782.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 36

Title: “Development of Strategies for Solar-based Hydrogen Production


Catalyzed by Carbon Nanomaterials”

Supervisor: Doutor Luís Pinto da Silva: luis.silva@fc.up.pt


Co- Supervisor: Prof. Doutor Joaquim C.G. Esteves da Silva: jcsilva@fc.up.pt

Host Institution: CIQUP e Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências –


DQB-FCUP - UPorto

Summary: The student will be integrated into a project with the aim of producing green hydrogen
fuel from water in a photocatalytic pathway involving carbon-based nanomaterials.
The reserves of fossil fuels are quite limited and are expected to be depleted within a few hundred
years. Moreover, CO2 released from the use of fossil fuels has been one of the responsible for
unwanted climate change. Thus, it is essential to develop alternative energy supplies. One of the
most promising approaches is the production of greener fuels using sunlight, namely in the
conversion of water to hydrogen fuel, which burns without any CO2 or NOX release.
The light-absorption catalysts will be carbon-based nanoparticles, more specifically, carbon dots
(CDs). These are photoluminescent nanoparticles with a carbon core and a diameter ranging from 1
to 10 nm. Moreover, they can be produced on a multi-gram scale by green and efficient
hydrothermal or microwave approaches, with limited generation of waste and by-products.

Type of work: Experimental

Most Relevant Methodologies: Luminescence spectroscopy, Gas Chromatography, Mass


Spectrometry, Dynamic light scattering, Raman spectroscopy, XPS spectroscopy and electronic
microscopy.

References
 G.A.M. Hutton, B.C.M. Martindale, E.Reisner. Chem. Soc. Rev. 2017, 46, 6111-6123.
 M.Z. Rahman, K. Davey, S.Z. Qiao, J. Mater. Chem. A, 2018, 6, 1305-1322.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 37

Title: “Design of Novel Organocatalysts for Sustainable CO2 Recycling”

Supervisor: Doutor Luís Pinto da Silva: luis.silva@fc.up.pt


Co- Supervisor: Prof. Doutor Joaquim C.G. Esteves da Silva: jcsilva@fc.up.pt

Host Institution: CIQUP e Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências –


DQB-FCUP - UPorto

Summary: Due to its greenhouse properties, reducing the levels of atmospheric CO2 is one of the
most important issues of our time. However, from a synthetic point of view, this gas can be
considered as an abundant, renewable, cheap and nontoxic C1 source. Namely, CO2 can be recycled
into heterocyclic carbonates, which are useful raw materials in the synthesis of pharmaceuticals,
polymers, electrolytes and other fine chemicals. Thus, the development of efficient synthetic
processes to exploit CO2 as a renewable carbon source could diminish our dependence on fossil
fuels for raw materials, leading to a reduction of fossil fuel-related emissions.
However, the thermodynamic stability and relative inertia of CO2 makes it difficult to develop such
processes. Herein, the goal of this internship is the development of novel organocatalysts that allow
for the efficient recycling of CO2 into heterocyclic carbonates under sustainable conditions. To this
end, it will be used an approach based on computational modelling and simulation.

Type of work: Experimental

Most Relevant Methodologies: Computational chemistry-based methods, namely density


functional theory (DFT).

References
 L. Pinto da Silva. J. Phys. Chem. C 2017, 121, 16300-16307.
 G. Fiorani, W. Guo, A.W. Kleij. Green Chem. 2015, 17, 1375-1389.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 38

Title: “Pathophysiological Role of MicroRNAs in Pulmonary Arterial


Hypertension – Therapeutic Implications”

Supervisors: Professora Doutora Carmen Brás Silva: carmensb@med.up.pt


Co-supervisors: Doutora Isabel Alexandra Marcos Miranda: imiranda@med.up.pt
Dr. Rui Miguel da Costa Adão: ruiadao@med.up.pt

Host Institution: UnIC – Unidade de Investigação e Desenvolvimento Cardiovascular,


Departamento de Cirurgia e Fisiologia, Faculdade de Medicina da Universidade do Porto (FMUP)

Summary: This project aims to investigate the role of some selected miRs in the pathophysiology
of pulmonary arterial hypertension and in the progression to heart failure, to explore its diagnostic
and prognostic value and to evaluate the efficacy of antimiR as a novel therapeutic strategy in this
disease.

Most Relevant Methodologies: Disponibilidade para aprendizagem de técnicas de avaliação


da função cardiovascular in vitro (avaliação funcional em cardiomiócitos, avaliação funcional de
vasos em miógrafo) e in vivo (ecocardiografia, cateterização cardíaca animal), técnicas de biologia
molecular, histologia e imunohistoquímica; análise de biomarcadores sanguíneos.

References
1. Adão R, Mendes-Ferreira P, Santos-Ribeiro D, Maia-Rocha C, Pimentel L, Pinto C, Mulvaney EP, Reid HM,
Kinsella T, Potus F, Breuils-Bonnet S, Rademaker MT, Provencher S, Bonnet S, Leite-Moreira A, Brás-Silva C.
Urocortin-2 improves right ventricular function and attenuates pulmonary arterial hypertension.
Cardiovascular Research. 2018;114: 1165–1177.

2. Mendes-Ferreira P, Maia-Rocha C, Adão R, Mendes MJ, Santos-Ribeiro D, Alves BS, Cerqueira RJ, Castro-
Chaves P, Lourenço AP, De Keulenaer GW, Leite-Moreira AF, Brás-Silva C. Neuregulin-1 improves right
ventricular function and attenuates experimental pulmonary arterial hypertension. Cardiovascular Research.
2016;109(1):44-54.

3. Santos-Ribeiro D, Mendes-Ferreira P, Maia-Rocha C, Adão R, Leite-Moreira A, Brás-Silva C. Pulmonary


Arterial Hypertension: basic knowledge for clinicians. Archives of Cardiovascular Diseases. 2016; 109:550-
561.

4.Gurha P. MicroRNAs in cardiovascular disease. Curr Opin Cardiol. 2016;31(3):249-54

40
Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 39

Título: “Síntese de Derivados Xantónicos Quirais com Potencial Atividade


Antimicrobiana”

Orientadora: Profª Doutora Elizabeth Tiritan: elizabeth.tiritan@iucs.cespu.pt/beth@ff.up.pt


Co-orientadores: Prof. Doutor Paolo de Marco: paolo.demarco@iucs.cespu.pt
Profª Doutora Carla Sofia Garcia Fernandes: cfernandes@ff.up.p

Instituição de Acolhimento: Cooperativa de Ensino Superior Politécnico e Universitário


(CESPU) Gandra - Paredes e Faculdade de Farmácia da UPorto

Resumo: Compostos quirais representam em torno de 50% dos fármacos comercializados em todo
o mundo e são de extrema importância em Química Medicinal e no desenvolvimento de novos
fármacos. Isto deve-se aos conceitos baseados em bioquímica fundamental em que os mensageiros
biológicos e recetores onde os fármacos atuam são estruturas assimétricas e, consequentemente,
as estruturas dos fármacos devem concordar com esta assimetria. Portanto os enantiómeros
geralmente apresentam comportamentos diferentes diante de uma entidade quiral, que pode
significar diversidade na atividade biológica.
Apesar do grande interesse na investigação sobre derivados xantónicos e seu amplo espectro de
atividade farmacológica como anticonvulsivantes, antidepressivos, anti-inflamatórios e
antitumorais entre outros, há poucos exemplos de derivados xantónicos quirais. Assim, este projeto
tem como objetivo preparar uma série de novos pares de enantiómeros de derivados xantónicos
quirais e intermediários na forma enantiomericamente pura para avaliação de atividades biológicas
diversas, mas com especial enfoque na atividade antimicrobiana.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias mais relevantes: O núcleo xantonico será sintetizado por um método


estabelecido com base na reação de Ullmann e subsequente ligação covalente ao enantiómero puro
de um aminoácido comercial com a finalidade de produzir os derivados xantónicos quirais [1]. Os
intermediários e os produtos finais serão estruturalmente elucidados por 1H RMN, 13C RMN, IV e
MS. A pureza enantiomérica será avaliada por HPLC utilizando fases estacionárias quirais por uma
metodologia já estabelecida.

Bibliografia
[1] Carla Fernandes, Kamonporn Masawang, Maria Elizabeth Tiritan, Emília Sousa, Virgínia de Lima, Carlos Afonso,
Hassan Bousbaa, Wanwisa Sudprasert, Madalena Pedro, Madalena M. Pinto. (2014). New chiral derivatives of
xanthones: synthesis and investigation of enantioselectivity as inhibitors of growth of human tumor cell lines
Bioorganic & Medicinal Chemistry 22 1049–1062. DOI:http://dx.doi.org/10.1016/j.bmc.2013.12.042 5
41
Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 40

Title: “Insight of Nitric Oxide Mechanisms in Carcinogenesis”


Supervisor: Profª Doutora Paula Maria Façanha Cruz Fresco: pfresco@ff.up.pt
Co-Supervisor: Profª Doutora Maria Clara Ferreira de O. Quintas: cquintas@ff.up.pt

Host Institution: Faculdade de Farmácia da UPorto

Summary: Nitric oxide (NO) is a pleiotropic regulator, critical to numerous physiological and
pathological processes. NO has emerged in the last decades as a molecule of interest in carcinogenesis
and tumor growth progression but there is still considerable controversy in understanding its role in
cancer biology. It is said to have both tumoricidal as well as tumor promoting effects which depend on
its timing, location, and concentration.
The family of nitric oxide synthases (NOS), enzymes responsible for the production of NO comprises
inducible NOS (iNOS), endothelial (eNOS), and neuronal NOS (nNOS). Interestingly, studies have shown
that all three isoforms can be involved in promoting or inhibiting the etiology of cancer. NOS activity has
been detected in tumour cells of various histogenetic origins and has been associated with tumour
grade, proliferation rate and expression of important signaling components associated with cancer
development such as the oestrogen receptor. It appears that high levels of NOS expression may be
cytostatic or cytotoxic for tumor cells, whereas low level activity can have the opposite effect and
promote tumour growth. NO has been suggested to modulate different cancer-related events including
angiogenesis, apoptosis, cell cycle, invasion, and metastasis. By opposition, it is also emerging as a
potential anti-oncogenic agent. As such, strategies for manipulating in vivo production and exogenous
delivery of this molecule for therapeutic gain are being investigated. An understanding at the molecular
level of the role of NO in cancer will have profound therapeutic implications for the diagnosis and
treatment of disease.1
Previous results from our group confirmed that low concentrations of pharmacologically distinct NO
donors increased cell viability/proliferation and high concentrations decreased cell survival of human
breast cancer MCF-7 cells line, probably by increasing apoptotic pathways (data not published). The aim
of the present project is to clarify the mechanisms of endogenously produced NO to the carcinogenesis
processes.

Type of Work: Experimental.

Most Relevant Methodologies: With this project the student may expect to develop the
following methodologies and skills: 1) cell cultures; 2) pharmacological and biochemical assays; 3)
immunofluorescence imaging; 4) critically interpret and discuss experimental data.

References
1
Choudhari at al., 2013; World J Surg Oncol 11:118
42
Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 41

Título: “Sistemas de Veiculação (DNA/RNA) Inteligentes Baseados em


Tensioativos Derivados de Serina”

Orientadora: Profª Doutora Maria Luísa Cardoso do Vale: mcvale@fc.up.pt


Co-Orientador: Doutora Sandra Goreti Ferreira da Silva: sandra.silva@fc.up.pt

Instituição de Acolhimento: Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências


– DQB-FCUP – UPorto

Resumo: Pretende-se desenvolver novos sistemas de veiculação de DNA/RNA baseados em


tensioativos derivados de serina e funcionalizados com ácido fólico, para uma terapia do
glioblastoma.
Assim, proceder-se-á à síntese dos tensioativos derivados da serina usando diferentes metodologias
sintéticas envolvendo várias reações, de entre as quais se destacam:
- Aminação redutiva/condensação para introdução da cadeia alifática.
- Condensação com dióis/diaminas para obtenção dos correspondentes precursores gemini.
- Introdução/remoção de grupos protetores.
- Introdução de ácido fólico para reconhecimento celular.
Será efetuada a purificação e caracterização estrutural de todos os compostos sintetizados.
Será também efetuada a caracterização físico-química destes compostos.

Metodologias mais relevantes: Extração líquido-líquido, cristalização e cromatografia de


adsorção em coluna para isolamento e purificação dos compostos pretendidos.
- Análise espectroscópica por RMN 1H e 13C e espectrometria de massa para determinação da
estrutura dos compostos.
- Caracterização dos sistemas por espetroscopia de UV/Vis, DLS e microscopias.

Bibliografia
- S. Goreti Silva, Ricardo F. Fernandes, Eduardo F. Marques, M. Luísa C. do Vale, Eur. J. Org. Chem.,
345-352 (2012).
- Sandra G. Silva, Cláudia Alves, Ana M. S. Cardoso, Amália S. Jurado, Maria C. Pedroso de Lima, M.
Luísa C. Vale, Eduardo F. Marques, Eur. J. Org. Chem., 1758-1769 (2013).
- Ana M. Cardoso, Catarina M. Morais, A. Rita Cruz, Sandra G. Silva, M. Luísa do Vale, Eduardo F.
Marques, Maria C. Pedroso de Lima, Amália S. Jurado, Eur. J. Pharm. Biopharm. 89, 347-356 (2015).

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 42

Título: “Tensioativos Derivados de Serina como Potenciais Agentes


Antimicrobianos: Síntese e Avaliação Biológica”

Orientadora: Doutora Sandra Goreti Ferreira da Silva: sandra.silva@fc.up.pt


Co-Orientador: Profª Doutora Maria Luísa Cardoso do Vale: mcvale@fc.up.pt

Instituição de Acolhimento: Departmento de Química e Bioquímica da Faculdade de Ciências


– DQB-FCUP – UPorto

Resumo: Pretende-se sintetizar novos tensioativos derivados de serina e avaliar as suas


potencialidades como agentes antimicrobianos.
A síntese envolve diferentes metodologias sintéticas de entre as quais se destacam:
- Acilação para introdução da cadeia alifática.
- Condensação com dióis/diaminas para obtenção dos correspondentes precursores gemini.
- Introdução/remoção de grupos protetores.
Será efetuada a purificação e caracterização estrutural de todos os compostos sintetizados.
A atividade antimicrobiana dos compostos será avaliada (colaboração) usando diferentes estirpes
de bactérias gram-positivas e gram-negativas.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias mais relevantes: - Extração líquido-líquido, cristalização e cromatografia de


adsorção em coluna para isolamento e purificação dos compostos pretendidos.
- Análise espectroscópica por RMN 1H e 13C e espectrometria de massa para determinação da
estrutura dos compostos.

Bibliografia
- S. Goreti Silva, Ricardo F. Fernandes, Eduardo F. Marques, M. Luísa C. do Vale, Eur. J. Org. Chem., 345-352
(2012).
- Sandra G. Silva, Cláudia Alves, Ana M. S. Cardoso, Amália S. Jurado, Maria C. Pedroso de Lima, M. Luísa C.
Vale, Eduardo F. Marques, Eur. J. Org. Chem., 1758-1769 (2013).

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 43

Título: “Estudo Metabólico e Enzimático Envolvendo Combinação de


Fármacos Anti-Helmínticos e Biomoléculas Antioxidantes”
Orientadora: Prof Doutor Nuno Filipe de Sousa Vale: nuno.vale@ff.up.pt
Co-Orientador: Drª Maria João de Castro Gouveia: mariajoaogouveia@gmail.com
Instituição de Acolhimento: Instituto Nacional de Saúde Dr. Ricardo Jorge, INSA (Porto) e
Laboratório de Farmacologia da Faculdade de Farmácia da UPorto

Resumo: As infecções causadas pelos parasitas Opisthorchis viverrini (Ov) e Schistosoma haematobium
(Sh) são consideradas como agentes biológicos carcinogénicos do grupo I, sendo que a infecção causada por
Ov e Sh estão associadas ao aparecimento de colangiocarcinoma e carcinoma das células escamosas da
bexiga, respetivamente [1-5]. Apesar do mecanismo molecular que desencadeia o desenvolvimento de
cancro é ainda desconhecido [2], recentemente, foi postulado o envolvimento de metabolitos parasitários
no processo de carcinogénese associado a estas infecções [2-5]. Nos últimos 40 anos, o tratamento para a
schistosomiasis e opisthorchiasis recorre à utilização de um único fármaco, o praziquantel (PZQ). Apesar da
sua eficácia, o PZQ apresenta várias desvantagens como a incapacidade de contrariar as sequelas associadas
à infeção [6,7]. Desta forma, é necessário desenvolver novas estratégias terapêuticas que não só eliminem o
parasita, mas também contrariem os problemas induzidos pela infeção e a carcinogénese. Com este intuito
foi recentemente desenvolvido no nosso grupo de investigação uma nova estratégia terapêutica que consiste
na combinação de fármacos anti-helmínticos, como o caso do PZQ e artesunato (AS) com biomoléculas
antioxidantes.

Tipo de trabalho: Experimental


Metodologias mais relevantes: Neste projeto pretende-se avaliar o contributo da nova estratégia
terapêutica para inibição da formação de aductos de DNA de origem parasitária implicados no processo de
carcinogénese. Será avaliada o papel das enzimas CYP450 (CYP 1A1, 2E1 e 3A4) na formação destes aductos
ou de outros metabolitos relevantes. Serão realizados diferentes ensaios in vitro utilizando compostos de
partida na presença e ausência das diferentes formas de CYP450. Para além disso, será também aplicada a
melhor combinação fármaco/antioxidante previamente testados em ensaios in vitro com diferentes fases de
desenvolvimento do parasita. As técnicas de LC-MS/MS/MS serão utilizadas para a deteção e identificação
dos produtos de reação. A combinação das propriedades antischistosomais de fármacos anti-helmínticos
clássicos com as propriedades antioxidantes das biomoléculas poderá ser um contributo valioso para o
tratamento destas infeções parasitárias e cancros associados.

Bibliografia
[1] IARC, Int. Agency Res Cancer, 100B (2012) 1-441; [2] Brindley et al., Trends in Cancer, 1 (2015) 174-182;
[3] Vale et al., Parasitol Int, 62 (2013) 535-542; [4] Gouveia et al., Cancer Lett, 359 (2015) 226-232; [5] Gouveia
et al., Carcinogenesis, 38 (2017) 929-937; [6] Vale et al., Antimicrob Agent Chemother, 61 (2017) e02582-16;
[7] Gouveia et al., Pharmaceuticals, 11 (2018) 15.
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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 44

Título: “Estudo da Afinidade de Fármacos para uma Proteína-Canal


Membranar e sua Influência no Combate à Resistência
Bacteriana”

Orientadora: Profª Doutora A. Paula L. M. Gameiro dos Santos: agsantos@fc.up.pt


Co-Orientador: Drª Carla Filipa Martins Sousa: cfilipams@gmail.com

Instituição de Acolhimento: Departamento de Química e Bioquímica, DQB - FCUP.

Resumo: O orientando irá desenvolver o estudo comparativo das contantes de afinidade de


diferentes fármacos para com a proteína membranar OmpF. Esta proteína é fundamental para o
transporte de fármacos para o interior das bactérias Gram-negativas e encontra-se muitas vezes
mutada em estirpes resistentes. [1,2] Desta forma, a afinidade de diferentes fármacos para esta
proteína será relevante para o estudo do mecanismo de resistência bacteriana e para a definição de
uma estratégia de combate à mesma. Os fármacos em estudo serão as fluoroquinolonas,
amplamente utilizadas atualmente na clínica, e para as quais crescentes taxas de resistência
bacteriana têm sido observadas. [3] Por comparação, serão estudados complexos ternários
contendo uma molécula de cobre, uma fluoroquinolona e uma molécula de fenantrolina. Estes
complexos têm sido estudados como alternativas às fluoroquinolonas em bactérias resistentes.

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias mais relevantes: O estudo de interação entre os diferentes fármacos e a


proteína OmpF serão levados a cabo por espetroscopia de UV-Visível e espetroscopia de
fluorescência. [4]

Bibliografia
1. Nikaido, H., Molecular basis of bacterial outer membrane permeability revisited. Microbiology and
Molecular Biology Reviews, 2003 Dec; 67(4): 593–656
2. Tenover, F.C., Mechanisms of antimicrobial resistance in bacteria. American Journal of Infection Control,
2006 34(5): p. S3-S10.
3. World Health Organization, Antimicrobial Resistance Global Report on Surveillance. 2014, France.
4. Neves, P., et al., Interaction between quinolones antibiotics and bacterial outer membrane porin OmpF.
Biophys Chem, 2005. 113(2): p. 123-8.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 45

Título: “Nanosistemas como Sistemas de Libertação do Fármaco Lapatinib


para o Tratamento de Cancro”

Orientadora: Profª Doutora Maria de La Salette Reis: shreis@ff.up.pt


Co-orientadora: Doutora Marina Barroso Pereira Pinheiro: mpinheiro@ff.up.pt

Instituição de Acolhimento: Laboratório de Química Aplicada, Departamento de Ciências


Químicas da Faculdade de Farmácia da UPorto

Resumo: Pesquisa de artigos com palavras-chave que permitam a obtenção de uma bibliografia
adequada para a escrita da monografia. Escrita científica com utilização de um gestor de referências
como o Endnote

Tipo de trabalho: Monográfico

Metodologias mais relevantes: Pesquisa bibliográfica, leitura e interpretação de artigos


científicos, escrita científica. Artigos científicos (incluindo de investigação experimental e de revisão)
pesquisados em bases de dados como a PubMed, ISI web of knowledge.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 46

Title: “Cannabinoid Signaling in Reproduction: Effects of Cannabinoids in


Placental Cells”

Supervisor: Profª Doutora Georgina Lopes Correia da Silva: george@ff.up.pt


Co-supervisor: Doutor Bruno Miguel Reis da Fonseca: brunofonseca@ff.up.pt

Host Institution: Laboratório de Bioquímica da Faculdade de Farmácia da UPorto

Summary: Cannabis consumption disturbance in reproductive health is attributed to the actions


of the psychoactive cannabinoid tetrahydrocannabinol (THC) but, in fact, the molecular mechanisms
underlying these effects are unknown. The effects may result not only from the direct action of
cannabinoids but also from alterations in the levels of the endogenous cannabinoids
(endocannabinoids (eCBs) that activate the same cannabinoid receptors, triggering pathways
involved in fundamental physiological processes. The endocannabinoid system (ECS) modulates
metabolism, neural plasticity, pain, inflammation, embryological development and reproduction
and is a pharmacological target (1,2).
During the period of placental development, a tightly regulated tissue remodeling occurs, involving
proliferation, apoptosis, differentiation and invasion of trophoblasts. We demonstrated that eCBs
induce apoptosis and impair their differentiation affecting the synthesis of human chorionic
gonadotropin (hCG), leptin and steroid hormones (3). We intend to determine the impact of
THC/SCs in trophoblast turnover and placental angiogenesis. This will be achieved by evaluating
placental factors involved in these processes by quantitative RT-PCR, western blot, and/or ELISA and
the signal transduction mechanisms responsible for cannabinoid responses. (FCT-FEDER funded
research project).

Type of Work: Experimental.

Most Relevant Methodologies: Cell culture, cell viability assays, microscopy techniques, RT-
PCR, Western Blot.

References
1. Ligresti A, De Petrocellis L, Di Marzo V. From Phytocannabinoids to Cannabinoid Receptors and
Endocannabinoids: Pleiotropic Physiological and Pathological Roles Through Complex Pharmacology. Physiol
Rev. 2016 Oct;96(4):1593-659.
2. Rapino C, Battista N, Bari M, Maccarrone M. Endocannabinoids as biomarkers of human reproduction.
Hum Reprod Update. 2014 Jul-Aug;20(4):501-16.
3. Costa MA, Fonseca BM, Mendes A, Braga J, Teixeira NA, Correia-da-Silva G. The endocannabinoid 2-
arachidonoylglycerol dysregulates the synthesis of proteins by the human syncytiotrophoblast. Biochim
Biophys Acta. 2016 Mar;1861(3):205-12.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 47

Title: “Use of Marine Algae as Functional Food Ingredient in European Sea


Bass (Dicentrarchus Labrax) Diets and Evaluation of Their
Immunostimulatory Effect on Innate Immune Status”

Supervisors: Drª Sónia Maria Gomes Batista: sbatista@ciimar.up.pt


Profª Doutora Luísa Maria Pinheiro Valente: lvalente@icbas.up.pt

Host Institution: LANUCE - CIIMAR

Summary: Intensive aquaculture production has led to a growing need in preventing diseases,
the most important constraints of fish production. To avoid the use of antibiotics and others
chemotherapeutants it is mandatory to find alternatives that could enhance the immunity of the
fish to fight against pathogens outbreak. In the last decade, there has been a growing interest in the
use of plant, herbs and algae extracts as immunostimulant dietary supplements in fish. Microalgae
and seaweeds, in addition to being possible alternative ingredients to fishmeal and fish oil [1-4] are
also a good potential source of bioactive metabolites that could reinforce the immune status of the
fish [5]. One of the most commonly used strategies to stimulate the immune system in fish is the
administration of immunostimulants in the diet that can modulate the immunological activity.
The innate immune system is divided into physical barriers, cellular and humoral components and
it is a fundamental defence mechanism of the fish. In this study, we will focus on the evaluation of
the immunostimulant effect of algae used in the in European sea bass diets on some important
humoral parameters like lytic enzymes and components of the complement pathways.
The student will always follow a qualified technician and will participate in all analysis to be
performed with the plasma of the European sea bass that were fed diets with algae inclusion during
an in vivo growth trial.
The student will have the possibility to deepen his knowledge in the evaluation of the activity of
some important enzymes of the innate immune system and will also be able to determine the
hemolytic activity of alternative complement pathway as an indicator of innate immunity.
The student will gain good experience in pipetting and working with microplate and spectrophotometry
techniques. All the methodologies to be performed by the student will need a lot of focus and attention,
permitting to improve the precision skills so important in experimental laboratory work.
The student will also participate into the data analysis. Collected data and calculation will be
included in an excel file prepared by the student to run appropriate statistical analysis using the
SPSS program and a final report will be produced.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Type of Work: Experimental.

Most Relevant Methodologies: Plasma lysozyme activity will be determined using a


turbidimetric assay adapted to microtitre, as described by Hutchinson and Manning [6]. One
Lysozyme enzyme unit (EU) was defined as the amount of lysozyme that caused a decrease in 0.001
absorbance units min-1.
Plasma total peroxidase activity will be measured following the procedure adapted by Costas et al.
[7], defining that one unit of peroxidase produces an absorbance change in one.
Alternative complement pathway activity (ACH50) will be based on the lysis of rabbit red blood cells
(2.8 × 108 cells mL-1), and will be measured as reported by Sunyer and Tort [8]. ACH50 units are
defined as the concentration of plasma giving 50% lysis of rabbit red blood cells.
All measurements will be done in triplicate on a Power-WaveTM microplate spectrophotometer
(BioTek Synergy HT, USA).

References
1. Tulli F., Chini Zittelli G., Giorgi G., Poli B.M., Tibaldi E., Tredici M.R., 2012. Effect of the Inclusion of Dried
Tetraselmis suecica on Growth, Feed Utilization, and Fillet Composition of European Sea Bass Juveniles Fed
Organic Diets. J. Aquat. Food Prod. T., 21: 188-197.
2. Tibaldi E., Chini Zittelli G., Parisi G., Bruno M., Giorgi G., Tulli F., Venturini, S., Tredici, M.R., Poli B.M., 2015.
Growth performance and quality traits of European sea bass (D. labrax) fed diets including increasing levels
of freeze-dried Isochrysis sp. (T-ISO) biomass as a source of protein and n-3 long chain PUFA in partial
substitution of fish derivatives. Aquaculture, 440: 60-68.
3. Marinho G.M.S., Nunes C., Sousa Pinto I., Pereira R., Rema P., Valente L.M.P., 2013. The IMTA cultivated
Chlorophyta Ulva spp. as a sustainable fish feed ingredient for Nile tilapia (Oreochromis niloticus). Journal of
Applied Phycology, 25: 1359-1367.
4. Pereira R., Valente L.M.P., Sousa-Pinto I., Rema P., 2012. Apparent Nutrient Digestibility of Seaweeds by
Rainbow Trout (Oncorhynchus mykiss) and Nile Tilapia (Oreochromis niloticus). Algal Research, 1: 77–82.
5. Balaraman, D., & Subramanian, V. (2017). Immunity Enhancement through Seaweed Extracts in Fish.
6. Hutchinson, T.H. and Manning, M.J. (1996). Seasonal trends in serum lysozyme activity and total protein
concentration in dab (Limanda limanda L.) sampled from Lyme Bay, U.K. Fish Shellfish Immunol., 6, 473-482.
7. Costas, B., Conceição, L.E.C., Dias, J., Novoa, B., Figueras, A. and Afonso, A. (2011). Dietary arginine and
repeated handling increase disease resistance and modulate innate immune mechanisms of Senegalese sole
(Solea senegalensis Kaup, 1858). Fish Shellfish Immunol., 31, 838-847.
8. Sunyer, J. and Tort, L. (1995). Natural hemolytic and bactericidal activities of sea bream Sparus aurata
serum are effected by the alternative complement pathway. Vet. Immunol. Immunopathol., 45, 333-345.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 48

Título: “Sistema Antioxidante do Eritrócito em Doentes com Doença Renal


Crónica em Hemodiálise”

Orientadora: Profª Doutora Rosa Cristina Barreto Catarino - cristinacatarino@ff.up.pt


Co - Orientadora: Doutora Susana Maria Santos Rocha: srocha@ff.up.pt

Instituição de Acolhimento: Laboratório de Bioquímica, Faculdade de Farmácia da UPorto

Resumo: Apesar dos desenvolvimentos tecnológicos associados ao procedimento de

hemodiálise e de apoio médico, nos últimos anos, a morbilidade e a mortalidade destes doentes
permanece alta, cerca de 10 a 20 vezes maior que a encontrada na população em geral. Existe
evidência crescente de que as espécies reativas de oxigénio (ROS) estão envolvidas na progressão
de lesão renal e dos sintomas urémicos. Diversos fatores têm sido descritos como associados ao
desenvolvimento de stress oxidativo em doentes renais terminais em hemodiálise, nomeadamente
uremia, inflamação, alterações no metabolismo do ferro, e nos mecanismos de defesa
antioxidantes. Esta alteração do sistema antioxidante poderá afetar tanto os componentes
enzimáticos como não enzimáticos do eritrócito.
O objetivo deste trabalho será avaliar em doentes com doença renal crónica em hemodiálise, as
atividades de algumas enzimas, nomeadamente a glutationa peroxidase (GPx) e a catalase (Cat),
bem como, determinar as quantidades de glutationa na forma oxidada e reduzida e a capacidade
antioxidante total do eritrócito.

Tipo de trabalho: Experimental

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 49

Título: “Citocompatibilidade de Novos Materiais Hemostáticos”


Orientadora: Doutora Sílvia M. A. Santos Pedrosa - s.santospedrosa@gmail.com
Co - Orientadora: Profª Doutora Ana Colette Maurício: acmauricio@icbas.up.pt

Instituição de Acolhimento: Departamento de Clínicas Veterinárias do ICBAS

Resumo: Hemorragia pode ser descrita como um extravasamento do sangue do sistema


circulatório. Apesar de todos os mecanismos compensatórios do corpo humano, as hemorragias
severas podem levar a uma falência geral do organismo e morte. O desenvolvimento de novos
materiais hemostáticos revolucionário, que promovam a coagulação natural, interrompendo o
sangramento severo em segundos. No entanto o desenvolvimento de qualquer biomaterial para
aplicação in vivo obedece a critérios estreitos que incluem a avaliação da biocompatabilidade dos
mesmos in vivo e in vitro. Durante este trabalho, pretende-se proporcionar conhecimentos básicos
sobre cultura de células animais, especialmente as células estaminais mesenquimatosas. Conhecer
os tipos de cultura de células, as suas características, os princípios básicos da cultura de células
nomeadamente o ambiente laboratorial e as condições ideais para a cultura de células e as regras
de assepsia. Também serão abordadas as regras básicas, técnicas materiais e equipamento de
cultura de células. Pretende-se ainda estudar a citocompatibilidade de novos materiais
hemostáticos através da sua interação com um sistema celular. Para o efeito, será aplicável a norma
internacional ISO 10993-5 Biological evaluation of medical devices - Part 5: Tests for in vitro
cytotoxicity, que estabelece padrões e metodologias que permitem concluirquanto à
citocompatibilidade dos biomateriais. Para tal serão utilizadas populaçõescelulares de proliferação
rápida, como são as células estaminais do cordão umbilical, tal como o definido na norma acima
referida. A viabilidade e metabolismos celular serão avaliados pelo método do PrestoBlue® Cell
Viability Assay, e a hemocompatibilidade do sistema será avaliado segundoa a ISO 10993-4
Biological evaluation of medical devices - Part 4: Selection of tests for interactions with blood/ ASTM
F756-17 Standard Practicefor Assessment of Hemolytic Properties of Material.

Tipo de trabalho: Experimental


Metodologias mais relevantes: Técnica Asséptica; Procedimentos básicos laboratoriais de
cultura de células de mamíferos; Determinação da viabilidade celular através da técnica de exclusão
(Trypan Blue); Determinação da viabilidade celular através do método do PrestoBlue® Cell Viability
Assay; Determinação das propriedades hemolíticas de um material Avaliação da capacidade de
indução da formação de coágulo

Bibliografia
Freshney, R. Ian. Culture of animal cells: a manual of basic technique and specialized applications. John Wiley
& Sons, 2015.
Leitão, Alexandre F., et al. "Hemocompatibility study of a bacterial cellulose/polyvinyl alcohol
nanocomposite." Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 111 (2013): 493-502.
ISO 10993-5 Biological evaluation of medical devices - Part 5: Tests for in vitro cytotoxicity
ISO 10993-4 Biological evaluation of medical devices - Part 4: Selection of tests for interactions with blood
ASTM F756-17 Standard Practice for Assessment of Hemolytic Properties of Material.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 50

Title: “New Family of Antioxidants that May Act as Antioxidants and


Emulsifiers for the Protection of Foods Containing Emulsified Fish Oil”

Supervisor: Profª Doutora Maria de Fátima A. B. A. Paiva Martins: mpmartin@fc.up.pt


Co-Supervisor: Prof Doutor José Enrique Borges: jrborges@fc.up.pt

Host Institution: Departamento de Química e Bioquímica, DQB - FCUP.

Summary: Fish oil is highly susceptible to oxidation, leading to unhealthy compounds and off-
flavors with a consequent decrease in shelf-life. Recently, New Zeeland reviewed fish oil
supplements and oxidation was found in 92% of the tested brands. In order to tackle this problem,
different strategies such as antioxidant (AO) addition are necessary. However, the antioxidants
available have been proved not to be very efficient in these fish oil rich foods. After the recent
findings by our research group showing that the antioxidant efficiency in emulsified systems is highly
correlated with the antioxidant concentration at the interface 1-3, a new family of antioxidants that
may act as antioxidants and emulsifiers at the same time is proposed for the protection of foods
containing emulsified fish oil. The antioxidant efficiency will be improved through chemical
modifications of the hydrophobicity of potent, natural AOs by fine-tuning their concentration at the
reaction site of these highly unstable matrixes. A family of monoacylglycerols containing a
polyphenolic moiety (W/O emulsifiers) and an aminoacid moiety (O/W emulsifiers) will be
synthetized and their distribution and efficiency will be evaluated in fish oil-in-water emulsions.

Note: This project gives the possibility of applying for the Erasmus program (University of Vigo) in
the following year.

Type of Work: Experimental.

Most Relevant Methodologies: RMN, Espectrofotometria de UV-Vis; HPLC-DAD;


cromatografia de baixa pressão; análise de espectrometria de massa – LC/MS.

References
Costa, M., Losada-Barreiro, S., Paiva Martins, F. & Bravo Díaz, C. (2017). Physical evidence that the variations
in the efficiency of homologous series of antioxidants in emulsions are due to differences in their partitioning.
Journal of the Science of Food and Agriculture, 97, 564-571.
Almeida, J., Losada-Barreiro, S., Costa, M., Paiva-Martins, F., Bravo-Díaz, C. (2016) Interfacial concentrations
of hydroxytyrosol and its lipophilic esters in intact olive oil-in water emulsions: effects of antioxidant
hydrophobicity, surfactant concentration and the oil:water ratio on the oxidative stability of the emulsions.,
Journal of Agricultural and Food Chemistry, 64, 5274-5283.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 51

Title: “Mitochondrial Atp2p as a Potential Target of the Cell Cycle Regulator


Cdh1”

Supervisor: Doutora Clara Isabel Ferreira Pereira: clara.pereira@ibmc.up.pt


Co-Supervisor: Drª Ana Cláudia Leite: jrborges@fc.up.pt

Host Institution: Instituto de Investigação e Inovação em Saúde – I3S – UPorto

Summary: Dysregulation of mitochondrial function has broad implications for human diseases
including diabetes, heart failure and neurodegeneration. The beta subunit of ATP synthase, an
evolutionarily conserved complex required for ATP synthesis, is canonically mitochondrial, but it has
also been detected in the nucleus in several species. Our preliminary data suggests this nuclear beta
subunit pool may be regulated by the anaphase-promoting complex/cyclosome (APCCdh1), a E3
ubiquitin ligase with a central role in cell cycle. To confirm this hypothesis and using S. cerevisiae as
a model, synchronized cells will be used to investigate: i) if deleting or overexpressing CDH1
increases and decreases, respectively, Atp2 degradation; ii) if Atp2 levels are coupled to cell cycle
progression; and iii) if mutating the Cdh1 recognition domains in Atp2p(Dbox) prevents degradation
of the protein.

Type of Work: Experimental.

Most Relevant Methodologies: Yeast and bacterial culture and manipulation; oxygen
electrode; co-immunoprecipitation; PCR; Western blotting; flow citometry.

References
R.M. Whitaker, et al, Mitochondrial Biogenesis as a Pharmacological Target: A New Approach to Acute and
Chronic Diseases, Annu Rev Pharmacol, 56 (2016) 229-49.
C. Pereira, et al, Sit4p-mediated dephosphorylation of Atp2p regulates ATP synthase activity and
mitochondrial function, Biochimica et biophysica acta, 1859 (2018) 591-601.

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Proposta de tema para Projecto/Estágio do 3º ano da Licenciatura em Bioquímica 2018/2019

Tema de Projecto/Estágio nº 52

Título: “Síntese de Análogos de Compostos de Origem Marinha com


Potencial Atividade Antimicrobiana”

Orientadora: Profª Doutora Carla Sofia Garcia Fernandes: cfernandes@ff.up.pt


Co-orientadora: Profª Doutora Elizabeth Tiritan: elizabeth.tiritan@iucs.cespu.pt/beth@ff.up.pt

Instituição de Acolhimento: Faculdade de Farmácia da UPorto

Resumo: Os oceanos são uma fonte rica de compostos bioativos estruturalmente únicos sob a
perspetiva de potenciais agentes terapêuticos. Nos últimos anos, os produtos naturais marinhos
têm despertado grande interesse, essencialmente devido ao leque alargado de atividades biológicas
e farmacológicas que demonstram exibir. Para além disso, são interessantes modelos para
modificações moleculares e / ou síntese total, de modo a obter compostos mais potentes e em
maior quantidade. Os péptidos marinhos constituem um grupo particularmente interessante devido
à sua química e diversas atividades biológicas, incluindo antimicrobiana.
Neste contexto, esta proposta tem como objetivo sintetizar análogos de péptidos marinhos para
posterior avaliação de atividade antimicrobiana.
A pureza enantiomérica dos péptidos obtidos será avaliada por cromatografia líquida (LC) utilizando
fases estacionárias quirais (FEQ).

Tipo de trabalho: Experimental

Metodologias mais relevantes: - Síntese orgânica de péptidos; Elucidação estrutural por 1H


RMN, 13C RMN, IV e MS; Avaliação da pureza enantiomérica por LC.

Bibliografia
- Y.Phyo, J. Ribeiro, C. Fernandes, A. Kijjoa, M.M.M. Pinto, Marine Natural Peptides: Determination of
Absolute Configuration using Liquid Chromatography Methods and Bioactivities, Molecules, 2018, 23(2), 306,
doi:10.3390/molecules23020306.
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