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Polisacáridos
Enzima
extracelular Mono y Ácidos orgánicos,
Polisacáridos Alcoholes,
disacáridos
Hidrocarburos
DEFINICIONES
• Metabolito: es una substancia producida por el metabolismo.
• Metabolismo
• Anfibolismo (anfi = doble): reacciones metabólicas que tiene como fin proporcionar
precursores biosintéticos (anabolismo) y obtener energía (catabolismo)
• Anaplerosis (ana = volver a llenar): enlace entre procesos metabólicos, flujo invertido
del C
DEFINICIONES
• Heterotrófo es catabólico
• Autótrofo es anabólico
• Heterótrofo es anfibólico
• Autótrofo es anabólico
Definiciones
DEL DEL
CATABÓLICAS GRIEGO Catabole Anabole GRIEGO
ANABÓLICAS
Fuente de - CO2
carbono - Compuestos Carbohidratos, azúcares,
orgánicos proteínas, aminoácidos,
lípidos, ácidos grasos,
glicerol
Fuente de - Inorgánica NH4, NO3-, N2
nitrógeno - Orgánica Proteínas, peptonas, aa,
bases púricas y
pirimídicas, urea
Fuente de - Inorgánica Fosfatos
fósforo - Orgánica Esteres del ácido
fosfórico
Fuente de - Inorgánica Sulfuros y sulfatos
azufre - Orgánica Aminoácidos sulfurados,
vitaminas
Las bacterias necesitan fundamentalmente para sobrevivir:
Ø Agua
Ø Fuente de Carbono:
Ø Nitrógeno (N2):
Ø Azufre (S):
Son aquellos elementos que las bacterias requieren en cantidades muy pequeñas,
como Fe, Cu, Mo, Zn. Generalmente, basta con la cantidad que contiene el H2O u otros
elementos del medio..
Ø Factores de crecimiento:
Aquellas sustancias que son indispensables para la vida de la bacteria, pero que esta
es incapaz de sintetizar
Ej.: vitaminas, bases nitrogenadas, aminoácidos y colesterol.
ANABOLISMO:
Es el metabolismo constructivo o de biosíntesis.
CATABOLISMO .
Es el metabolismo degradativo de aquí se obtiene la
energía requerida en el anabolismo.
ANFIBOLISMO.
Es el metabolismo simultáneamente catabólico y anabólico.
La mayoría de las reacciones en los organismos vivos no
ocurren espontáneamente, sino que requieren la acción de un
catalizador, el cual incrementa la velocidad de la reacción.
Enzimas
Enzima Complejo
Complejo Enzima Enzima
EnzimaEnzima-Sustrato
Enzima-Sustrato
Catalizadores
Catalizadores biol
biológicos deógicos
Catalizadores biológicos de
naturaleza proteíca. Reducen
naturaleza proteíca. Reducen
lade naturaleza
energía de activaciónprote
de íca.
la energía de activación de
una reacción química. Son
Reducen laun sustrato.
una reacción
específicos para energ
química.íaSonde
específicos para un sustrato.
activación de una reacció
n química. Son específicos
para un sustrato.
Las enzimas bacterianas, también pueden ser clasificadas considerando sí su
síntesis es o no modificada por el medio ambiente.
CONSTITUTIVAS o INDUCIBLES.
◦ Permeasas o translocasas
◦ Hidrolasas
◦ Oxido-reductasas
◦ Deshidrogenasas
◦ Catalasa
Clasificación
1.- El enzima y su sustrato 2.- Unión al centro activo 3.- Formación de productos
la actividad
PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS
enzimática
Estas derivan del hecho de ser proteínas y de actuar como pH
ividad
conformación suelen
del centro activoir y,asociados
por lo tanto,en cambios en la actividad
también
catalítica. influirá que
Los factores sobre la actividad
influyen de manera más directa sobre la
ática enzimática.
actividad de un enzima son:
!La temperatura elevada
pH
Temperatura
atura elevada
za lasActividad
moléculasde la
enzima Actividad de la
or lo que los sitios activos enzima
Estructura
Cofactores y coenzimas
apoenzima + grupo prostético
= holoenzima
COFACTORES.
Mo Nitratoreductasa, nitrogenasa.
Ni Ureasa.
ACTIVADORES COENZIMAS
q Piridoxal.
q Biotina.
q Tiamina.
q Cobalamina.
NAD ↔ NADH
NAD ↔ NADH
Nicotinamida Adenina
Nicotinamida Adenina Di-nucleótido
Di-nucleótido (NAD), es
(NAD), es la principal
coenzima de óxido-reducción.
la principal coenzima de óxido-reducción.
RNA CATALÍTICO O RIBOZIMAS
Las ribozimas son moléculas
de RNA con actividad
catalítica, capaces de
catalizar reacciones químicas
en el interior celular.
B Sustrato
metabólicas
Intermediario 1
mediante inhibición
inhibicienzimática
ón enzim ática
por Enzima 3
producto final.
por producto final. Intermediario 3
Enzima 4
Producto final
Regulación de la expresión y
Regulación de la expresión y síntesis de las
síntesis de las enzimas
enzimas
Nivel transcripcional
Ø Nivel transcripcional
Ø Procesos de inducci
!Procesos n y represi
de óinducción y ón.
represión.
Ø Atenuaci ón y procesamiento
!Atenuación del
y procesamiento
del ARNm.
mARN.
Nivel traduccional
Ø Nivel traduccional
!Regulación de la síntesis de las
Ø Regulaci ón de ribosómicas.
proteínas la síntesis de las
!Inhibición de la síntesis de
proteínas ribosómicas. Inhibición
proteínas.
de la síntesis de proteínas.
ATP ATP
ATP
Compuesto Compuesto
Compuesto de alta de
dealta altaía,
energ
energía, se produce
seenergía,
produce sepor
produce
fosforilación
por fosforilación
por fosforilación a a
a nivel nivel
niveldede de sustrato,
sustrato,
sustrato, cadena
cadena cadena respiratoria
respiratoria y y
respiratoria y fotofos-
fotofosforilación.
fotofosforilación.
forilación.
Oxidación-reducción
Oxidación-reducción
Par redox
Par redoxoxidado/reducido
oxidado/reducido
Donador de electrones
Donador de electrones H+ →2e +2H
H2 → 2e- + 2H
- +
2
Aceptor de electrones
½O2 + 2e- →
Aceptor de electrones
O2-
1⁄2O +2e →O - 2-
2
Formación de agua
Formaci2H
ón de+agua
O2- →
2H H+2O
+
+ O →HO 2-
2
Reacción total
H2 + ½O2 → H2O
Reacción total H2+1⁄2O2 →H2O
FUNCIONES DEL METABOLISMO
1. Abastecimiento
Glucosa Glucosa-6P
PEP
Piruvato
Mutasa
(Glucosa)n (Glucosa)n-1 + Glucosa-1P Glucosa-6P
Pi
Glucosa-6P Gliceraldehído-3P
Vías de degradación
•Embden-Meyer-Parnas
•Etner-Doudorof
•Fosfocetolasa
•Bifidiobacterias
•Pentosas
FUNCIONES EL METABOLISMO
Abastecimiento
Pi
Gli-3P DHasa Quinasa
Gli-1,3-Bi-P Gli-3P Gli-2P
NAD+ NADH+ ADP ATP
Independiente del aceptor de e-
PEP
ADP
Respiración aeróbica
Productos de H O
2
Sustrato oxidable la respiración
F ADP + Pi
NAD+ ATP + H2O F
A
A
N
C
S
ATP + H2 NADH T
ADP + Pi
E
Pir Aceptor de e-
O2
Funciones del metabolismo
Respiración anaeróbica
Alcoholes
Productos de SO
Sustrato oxidable la respiración
3 Ácidos
NO2 excepto láctico
F ADP + Pi
NAD+ ATP F
A
A
N
C
S
ATP + H2 NADH T
ADP + Pi
E
Pirúvico Aceptor de e-
acetaldehído
NO3
SO4
Fumarato
EN PRESENCIA DE 02 EN AUSENCIA DE 02 4 ATP
4 ATP
Glucosa Glucosa
GLICOLISIS 2 H2O GLICOLISIS 2 H2O
2ATP 2ATP
2 NADH
FANS
2 NADH
2 CO2
FERMENTACIÓN
2 FADH2
6 NADH 2 Lactato
2 Etanol
2 H2O
CICLO DE KREBS
(Ciclo del citrato) 2 CO2
4 CO2
RENDIMIENTO TOTAL
2 ATP
2 ATP
O2 FACTE
RENDIMIENTO TOTAL
34 ATP 38 ATP
RUTA DEL EMPLEO DE GLUCOSA EN CONDICIONES AEROBIAS
RENDIMIENTO: 30 ATP (procedentes de 10xNADH) + 4 ATP (procedentes de 2xFADH2) + 6 ATP – 2 ATP= 38 ATP
(2 ATP pueden emplearse en la entrada de 2xNADH de la glicolisis en la mitocondria)
Glicolisis
NAD+ NADH
ATP ADP ATP ADP Pi H+
ADP
Glucosa Glucosa 6P Fructosa 6P Fructosa 1,6 diP Gliceraldehido 3P Gliceraldehido 1,3 diP
(6 C) (6C) (6C) (6C) (3C) (3C)
ATP
H2O Isocitrato
(6C)
Fumárico
(4C)
x2 NAD+
NADH
FADH2 H+
Cadena respiratoria
CO2
α-cetoglutarico Cadena de transporte electrónico Síntesis ATP
FAD+
Succínico (5C) MME
(4C) CoA H+ H+ H+ H+ H+
H+ H+ H+ H+ H+
NAD+ H+ H+
GTP MMI
NADH e-
Succinil co A H+
H + H+
ADP GDP (4C) NADH H+
H+
+ CO2 NAD+
ATP Pi FADH2 2H + ½ O2 H2O ADP+Pi H+ ATP
Glicolisis
NAD+ NADH
ATP ADP ATP ADP Pi H+
ADP
Glucosa Glucosa 6P Fructosa 6P Fructosa 1,6 diP Gliceraldehido 3P Gliceraldehido 1,3 diP
(6 C) (6C) (6C) (6C) (3C) (3C)
ATP
x2 3-fosfoglicérico
(3C)
ATP ADP
x2
RUTAS IMPLICADAS EN LA OBTENCIÓN DE ENERGÍA A PARTIR DE
GLUCOSA
Glicolisis
NAD+ NADH
ATP ADP ATP ADP Pi H+
ADP
Glucosa Glucosa 6P Fructosa 6P Fructosa 1,6 diP Gliceraldehido 3P Gliceraldehido 1,3 diP
(6 C) (6C) (6C) (6C) (3C) (3C)
ATP
GTP MMI
NADH e-
Succinil co A H+ H + H+
ADP GDP (4C) NADH H+
H+
+ CO2 NAD+
ATP Pi FADH2 2H + ½ O2 H2O ADP+Pi H+ ATP
Transducción de la energía
Redox ATP
Gliceraldehído-3P Glicerato-3P
DG°’ = -7.3 kcal/mol
Proceso
Lítico no “Evento exergónico”
Redox
Piruvato Acetil CoA Acetato
ATP
FUNCIONES DEL METABOLISMO
Estructuras de alta energía
No hay relación temporal entre eventos
FANS Si hay relación física (forma un gradiente de e-)
Proceso exergónico (DG°’ = positivo), alta energía
Monoazúcares polisacáridos
Aminoácidos proteínas
Etc.
Importancia:
Produce los precursores de la
ribosa, desoxirribosa en los ácidos
condiciones
• +CO2
CO2 +2H
anaeróbicas.
Emplea como aceptor de Acido oxaloacético
2,3-butanediol
electrones a
!Emplea como una +2H
Shigella Klebsiella
aceptor
molécula de
orgánica. Acido málico
Ácido fórmico
Acetil-S-CoA Enterobacter
Bacillus
electrones a una -H2O +4H
• Utiliza el NADH
molécula +2H -CoA-SH -CoA-SH
Acido succinico Etanol
orgánica. en
producido la CO2 H2
-CO2 Acido
+Acetil S-CoA
glicólisis.
!Utiliza el NADH E. coli Acético
-CoA-SH
Acido propionico Salmonella
producido
• Se conserva la en la
energía Clostridium
E + S ↔ ES ↔ E + P
•YODO
HIDRÓLISIS DE LA CASEÍNA
1. Acidificación:
2. Alcalinización :
Caseína Coagulación
coágulo
Fermenta
ción
tormento
Fermentación sa
Lactosa ácido + gas
LECHE TORNASOLADA (LITMUS
MILK):
4. Licuefacción:
Peptidasas
Fermentac
ión
tormentos
a
Precipitado
blanco (Ca+2)
LECHE TORNASOLADA (LITMUS
MILK):
5. Reducción:
Indicador redox
e-
De donde obtienes su energía las células para realizar sus
funciones metabólicas?
1. LUZ
2. COMPUESTOS ORGÁNICOS
3. COMPUESTOS INORGÁNICOS.
HETEROTROFOS COMPUESTOS
ORGANICOS
Fotoheterotrofos: Bacterias
Quimioautotrofos: Bacterias.
LITOTRÓFICOS INORGÁNICA
ORGANOTRÓFICOS ORGÁNICA
FERMENTACIÓN ORGÁNICO
RESPIRACIÓN INORGÁNICO
ANAEROBIA
RESPIRACIÓN O2
AEROBIA
FOTOSÍNTESIS CO2
PROCESOS QUE CONDUNCEN A LA OBTENCIÓN DE ENERGÍA
y SU CONVERSION A ATP
Fermentación:
Se obtiene el ATP por fosforilación a nivel de sustrato.
Respiración:
Se obtiene ATP por fosforilación oxidativa.
Aeróbica: oxígeno
Fotosíntesis:
Se obtiene ATP por fotofosforilación.
FERMENTACIÓN:
Fermentación butanodiólica
La glucosa, tanto en el metabolismo respiratorio como en el
fermentativo, se transforma en ácido pirúvico por una de las
siguientes rutas:
fermentan
permitiendola lactosa 1%, permitiendo
la acidificación completa del
la acidificación completa del medio.
medio.
MEDIO DE KLIGLER
+
METABOLISMO DE
AMINOÁCIDOS
N
calentamiento
H CH N(CH3)2
N(CH3)2
HN
La estructura pirrólica por medio de una
reacción de condensación con el p-
dimetilamino-benzaldehído y
deshidratación con el alcohol forma una
estructrura quinoide ce color rojo
CALDO TRIPTONA
NH3+ +
A B
Indol +
RESPIRACIÓN
a) El ciclo de Krebs y
b) El transporte terminal de electrones (cadena respiratoria).
En el curso de la
respiración, las moléculas de tres
carbonos de ácido pirúvico
producido por la glicólisis son
degradadas a grupos acetilo de
dos carbonos, que luego entran
al ciclo de Krebs.
En el ciclo de Krebs, el
grupo acetilo es oxidado
completamente a dióxido de
carbono.
En el ciclo de Krebs. los carbonos
donados por el grupo acetilo se oxidan a
dióxido de carbono y los electrones pasan a
los transportadores de electrones.
No prote ínas
No proteínas
ü Quinonas.
!Quinonas.Transfieren los los e- y
Transfieren
los H
e- y los H++..
ATPasa
ATPasa
La ATP sintasa es una proteína con
una de sus fracciones embebida en
la membrana y la otra en la cara
citoplasmática:
Complejo catalítico F1 (subunidades
α3β3γεδ), responsable de la
interconversión de ADP+ Pi y ATP.
Complejo F0 (subunidades ab2c12),
responsable de la transferencia de
protones através de la membrana.
Formación
Formación de de ATP
ATP
Formación de ATP
Respiración aerobia
aerobia
2 2HH
+ + FpFp NADH
NADH+ +HH+
+
aerobia 2e-
2e-
Fe-S
Fe-S
QQ 2 2H+H+
2e-
2e-
2 2HH
+ +
Cyt
Cytb556
b556
Cyt b562
Cyt b562
3 3H+H+ ½O
+ + ½O
2 2
Cyt
Cyto o
2 2HH
+ + H2HOO
2
ADP
ADP+ +PiPi
HH
+ + ATPasa
ATPasa H+H+
ATP
ATP
Respiración
Respiración
anaerobia
Respiración anaerobia
Fuera
2 H+ Fp Citoplasma
NADH + H+
anaerobia
2 H+ 2e- Fp NADH + H+
2e- Fe-S
Fe-S
Q 2 H+
Q 2e- 2 H+
2 H+
2e-b556
Cyt
2 H+
Cyt b556
NO3- + 2 H+
H+ ATPasa HADP
+
+ Pi
H+ ATPasa H+ ATP
ATP
REDUCCIÓN DEL AZUL DE
METILENO
Reductasa
N NH
2H
(H3C)2N N(CH3)2 Reductasa (H 3C)2N N(CH 3)2
AZUL DE METILENO
(ESTADO OXIDADO) S
(COLOR AZUL)
LEUCO-AZUL DE METILENO
(ESTADO REDUCIDO)
(INCOLORO)
REDUCCIÓN DE NITRATOS
Nitrato (NO3-)
ß
A Nitrito (NO2-)
B ß
Oxido nítrico (NO)
ß
Oxido nitroso (N2O)
ß
Nitrógeno (N2)
NH2 N
N
+ + HNO2 + 2H2O
SO 3H NH 2
NH 2
Alfa-naftilamina SO3H
Acido Sulfanilico p-sulfobenceno-azo-alfa-naftilamina
Reducción de Nitratos
Caldo nitratos
Sustrato: Nitrato de sodio. Enzima: Nitrato
reductasa. Producto: Nitritos.
Revelador: Reactivos de Griess.
Caldo
Cuando
Caldo nitratos
nitratos
la prueba resulta negativa para nitritos se utiliza la
Sustrato:
Sustrato: Nitrato
Nitrato de de sodio.
sodio.
prueba del zinc para reducir químicamente los nitratos
Enzima:
Enzima: Nitrato
Nitrato reductasa.
reductasa.
presentes a nitritos y formar con los reactivos de Griess el
Producto:
Producto: Nitritos.
Nitritos.
compuesto colorido.
Revelador:
Revelador: Reactivos
Reactivos de Griess.
de Griess.
•Nitrato
•Nitrato re
OXIDASA
H3 C CH3
N
H3 C CH3
N OH
O2 +2H 2O
+ N
NH 2
Alf a-naf tol
Dimetil-p-f enildiamina
O
Azul de indof enol
CATALASA
El mecanismo completo de la catalasa no se conoce, aun así la
reacción química se produce en dos etapas:
H2O2 + Fe(III)-E → H2O + O=Fe(IV)-E
H2O2 + O=Fe(IV)-E → H2O + Fe(III)-E + O2
FOTOSÍNTESIS:
Chloroflexus (bacteria
Chloroflexus (bacteria verde
verde no del no del Rhodospirillum
azufre, Chloroflexaceae), azufre, (bacteria
Chloroflexaceae),
púrpura,
Rhodospirillaceae), Chlorobium (bacteria verde del azufre, Chlorobiaceae), Heliobacterium
Rhodospirillum (bacteria ypNostoc
(Gram-positiva, Heliobacteriaceae), úrpura, Rhodospirillaceae),
(cianobacteria, Nostocaceae). Chlorobium
(bacteria verde del azufre, Chlorobiaceae), Heliobacterium (Gram-
positiva, Heliobacteriaceae), y Nostoc (cianobacteria, Nostocaceae).
Fase luminosa Fase obscura