Apuntes Biomoléculas – Profesor: Carlos Silva Pradel

PROTEINAS: del griego “proteios” que significa lo primero.

Definición:
• “Son polímeros de condensación de α –aminoácidos con configuración L”
• Son moléculas complejas de gran peso molecular (Insulina: 6000-Queratina
20x106) que contienen C, H, O, N y a veces S y P.
• Tienen gran importancia biológica pues:
Las estructuras celulares están constituidas por ellas.
Las reacciones químicas que ocurren al interior de las células son
catalizadas por enzimas que son de naturaleza proteica.
Cumplen funciones específicas muy diversas en el organismo humano
como por ejemplo:
Hemoglobina (transporte de oxigeno)
Fribrinógeno (coagulación sanguínea)
Anticuerpos (responsables de la inmunidad)
Hormonas (regulan equilibrio funcional)
• Cada proteína tiene una secuencia única de aminoácidos

CLASIFICACIÓN DE LAS PROTEINAS

1. PROTEINAS NATIVAS

PROTEINAS SIMPLES (formadas sólo por aminoácidos). Como ejemplos:

- Albúmina
- Globulinas

(*)PROTEÍNAS CONJUGADAS (tienen grupo prosteéico): Como ejemplos:

- Fosfoproteínas
- Hemoproteínas
- Núcleoproteinas

2. PROTEÍNAS DERIVADAS (modificadas por el hombre)

- Alcaliproteínas
- Ácidoproteínas

(*) Las proteínas conjugadas además de su porción aminoacídica tienen un grupo de

diferente naturaleza que se llama GRUPO PROSTÉTICO

Ej.:
caseína, fosfoproteína, grupo prostético: fosfato.
cromosomas, nucleoproteina, Grupo prostético: ácido nucleico.
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Estructura de α-aminoácido: Las unidades que forman las proteínas se llaman

α-aminoácidos y su estructura es la siguiente:

cadena lateral

R
α
H C COOH
NH2

• Si R ≠ H el C α es asimétrico y el aminoácido tiene actividad óptica.

Ejs:
H3C CH3
CH3 C
H C COOH H C COOH
NH2 NH2

alanina valina

• Todos los aminoácidos naturales tienen configuración L:

Ejs:
1 1
1
CHO COOH COOH
2 2 2
HO C H H2N C H H2N C H
3 3 3
CH2OH CH2OH CH2OH

L-gliceraldehído L-serina L-valina

patrón de comparación

CLASIFICACIÓN DE AMINOÁCIDOS (aa)

I. Ácido. monoamino monocarboxílicos (neutros)

a) Ácidos alifáticos: Glicina, alanina, valina(*), nor-leucina, leucina, isoleucina,
serina, treonina.
b) Ácidos con núcleos aromáticos: Fenilanina, tirosina, triptofano.
c) Ácidos que contienen azufre: Cisteina, cistina, metionina.

II. Ácidos monoaminodicarboxílicos (ácidos)

Ácido aspártico, ácido glutámico.

III. Ácido diaminomonocarboxílicos (básicos)

Lisina, arginina, histidina. (en niños)

IV Aminoácidos con núcleos heterocíclicos.

Prolina, hidroxiprolina.
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• Hay 20 aminoácidos naturales conocidos.

(*) Los subrayados son los llamados aminoácido esenciales (son 8) los cuales deben
proporcionarse en la dieta.

ABREVIATURAS DE AMINOÁCIDOS

Glicina Gly Treonina Thr

Alanina Ala Tirosina Tyr
Valina Val Hidroxipolina Hyp
Leucina Leu Cisteína Cys
Isoleucina Ile Cistina Cys-Cys
Fenilalanina Phe Metionina Met
Asparragina Asn Ácido aspártico Asp
Glutamina Gln Ácido glutámico Glu
Triptofano Trp Lisina Lys
Prolina Pro Arginina Arg
Serina Ser Histidina: His

ION DIPOLAR O ZWITTERION: todos los aminoácidos al estado de cristal o en

solución acuosa se encuentran como “ión dipolar"

"ion dipolar"

H H
+ -
H2N C COOH H3N C COO
R R

carga eléctrica cero (0)

- +
OH H

H H
- +
H2N C COO H3N C COOH
R R
predominante en medio básico predominante en medio ácido

Punto Isoeléctrico o Punto Isoiónico (pI): es aquel pH en que el aminoácido tiene una
carga eléctrica neta igual a cero, por lo tanto “la concentración de la forma aniónica es
igual a la concentración de la forma catiónica.”
• Se dice que a ese pH el aminoácido tiene su mínima solubilidad, es
característico de cada aminoácido y no se mueve en un campo eléctrico.
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CALCULO DEL PUNTO ISOELÉCTRICO (Ejemplo: Glicina)

"zwitterion"

O O O
pKa1 pKa2
C OH C O C O
H2C H2C H2C
+ Ka1 +
NH3 Ka2
NH3 NH2

carga eléctrica: +1 0 -1

1
pH = pI = (pKa 1 + pKa 2 )
2

• En cualquier aminoácido el “punto isoeléctrico” se calcula con los pKa vecinos

al “zwitterion” (carga eléctrica = cero)
• El “punto isoeléctrico” depende si el aminoácido es básico, neutro o ácido:
aminoácido básico: pI = 7,5 a 11,2; aminoácido neutro: pI = 5 a 6,3;
aminoácido ácido: pI = 2,8 a 3,2.

CALCULO DEL pI DE LA LISINA

HO
C O COO- COO-
+ + COO-
H3N CH OH- H3N CH H2N CH
OH- OH- H2N CH
CH2 CH2 CH2
H+ H+ H+
CH2
H2C H2C H2C
pKa1 pKa2 pKa3
H2C
CH2 CH2 CH2 CH2
2,18 8,95 10,53
+ + +
NH3 NH3 NH3 NH2
carga eléctrica: +2 +1 0 -1

pI = ½ pKa2 + ½ pKa3 ; pI = ½ (pKa2 + pKa3)

pI = ½ ( 8,95 + 10,53 )
pI = 9,74

REACCIONES QUÍMICAS REFERIDAS AL GRUPO NH2

a) Los aminoácidos forman sales con los ácidos.

R + - R
+ +
H3N C COO- + H-Cl Cl H3N C COOH
H H
clorhidratos de aminoácidos
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b) Método de Van – Slyke (Reacción cuantitativa)

R R
+
H3N C COO- + HNO2 HO C COOH + N2 + H2O
(g)
H H
ácido hidroxiácido

• Se puede calcular la cantidad de N2 liberado en condiciones normales que es

proporcional a la cantidad de aminoácido.

c) Reacción de Sorensen.

CH2OH
R R
+
H3N C COO- + OH- + 2 H-CHO N CH COO- + H2O
H formalina
CH2OH

d) Reacción de Sanger: determina N – terminal (péptidos).

R
F HN CH COOH
1
NO2 R NO2
2
+ H2N CH COOH + HF
3
4 aminoácido
NO2 NO2
2,4-dinitrofluorobenceno aminoácido N-terminal "marcado"
2,4-DNFB o DNFB

REACCIONES QUÍMICAS REFERIDAS AL GRUPO COOH

a) Formación de sales con Cu +2 ; Ag+ ; Pb+2

R R 2+ R
+ OH- Cu
H3N C COO- H2N C COO- ( H2N C COO- )2Cu
H H H
sal insoluble

b) Formación de esteres.

+ R O
R H
+ - + +
H3N C COO- + CH3OH H3N C C O CH3
H H
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REACCIONES DE LAS CADENAS LATERALES

A) Reacción de Millon.
B) Reacción Xantoproteica.
C) Reconocimiento de azufre.

PÉPTIDOS: Los oligómeros formados por la unión de aminoácido y pérdida de H2O se

llaman “peptidos”.

• Cuando se unen dos aminoácidos se forma un DIPEPTIDO que tiene 1 enlace

peptídico (*) formándose también 1 mol de H2O (*) no hay rotación libre
alrededor de enlace peptídico.
• Cuando se unen tres aminoácidos se forman un TRIPEPTIDO que tiene dos
enlaces peptídico, y se forman también 2 moles de H2O.
• Las unidades de aminoácido que forman los péptidos se llaman RESIDUOS. Y
se puede decir que los polipéptidos están caracterizados por la secuencia de sus
residuos de aminoácido.
• Los polipéptidos son relativamente rígido pero sin embargo suficientemente
móviles para adoptar una variedad de conformaciones. Por lo tanto ellos pueden
“plegarse” en muchas forman diferentes.
• Al dibujar una cadena de un polipéptidos, el aminoácido N- terminal o Terminal
amino se coloca a la izquierda y el aminoácido C- terminal o terminal carboxise
coloca a la derecha.
• La cadena que incorpora los enlaces peptídico se llaman la cadena principal y
los sustituyentes R, R’, R”, etc. son las cadenas laterales

FORMACIÓN DE UN DIPEPTIDO
GLICILGLICINA:

2 aminoácido unidos = 1 enlace peptídico

FORMACIÓN DE UN TRIPEPTIDO
ALANILGLICILVALINA.

• Los enlaces peptídico se reconocen con el reactivo de Biuret

(CuSO4 + NaOH)→ se obtiene un color violeta.
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RESUMEN DE ESTRUCTURA DE PROTEINAS

(Las proteínas están organizadas en distintos niveles)

Nivel de estructura Relacionada a: Fuerzas de estabilización

Primaria Aminoácido presente y Enlaces covalentes
secuencia de aminoácido (Ej.: enlaces peptídicos)
Secundaria Arreglo de cadena Enlaces de H
polipeptídica en el espacio
formando espiral llamada
α-helice o láminas u hojas-
β (hojas plegadas)
Terciaria Doblez del peptído en el -Puentes salinos.
espacio o solución por -Fuerzas de Vander Wals.
medio de interacciones de -Enlaces de H
cadenas laterales (Ej.: -Uniones disulfuros, etc.
proteínas globulares, (-S-S-)
proteínas fibrilares)
Cuaternaria Varias subunidades de una -Puentes salinos
proteína se combinan para -Fuerzas Vander Wals.
formar agregados grandes -Enlaces de H
un Ej.: es la Hemoglobina -Uniones disulfuro, etc.
formada por 4 unidades (-S-S-)
esta estructura también se
define como un
“ordenamiento de las
cadenas de subunidades en
relación mutua”

• Algunos autores resumen estos 4 niveles de organización:

- Estructura primaria: secuencia
- Estructura secundaria: plegado local (α-helice, β-hoja plegada)
- Estructura terciaria: plegado global
- Estructura cuaternaria: asociación de múltiples cadenas.

PROPIEDADES DE PROTEÍNAS:
• DESNATURALIZACIÓN (O DESNATURACIÓN): Es la precipitación
irreversible que sufren las proteínas cuando son sometidas a ciertos agentes
como la temperatura (>40ºC), ácidos y bases fuertes, solvente orgánicos
(alcohol, acetona, etc.). Se alteran sus propiedades químicas, físicas y biológicas
naturales. Lo más característico es la pérdida de las estructuras secundarias y
terciaria. No hay ruptura de “enlaces peptídicos”.
Un ejemplo sería un huevo cocido.
• PRECIPITABILIDAD:
I) CON SALES (como Na2SO4 o (NH4 )2SO4) a ciertas concentraciones se
producen precipitaciones (“saltingout”). Si se agrega H2O (disminuye
concentración) la proteína se redisuelve.
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II) CON SALES DE METALES (Hg2+, Cu2+, Pb2+) y si la proteína está sobre su
pI (cargada -) se producen precipitaciones que también son reversibles y
pueden servir para su aislamiento y purificación.