03 DE SEPTIEMBRE DEL 2018

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE BAJA

CALIFORNIA
Escuela de ciencias de la salud

LABORATORIO DE FISIOLOGIA: PRACTICA 1

ANÁLISIS IN-SILICO DE CANALES IÓNICOS

PABLO MANUEL CORONADO GARCIA

LAURA ALICIA SANCHEZ ESPINOZA
GRUPO 302
M. en C- Alejandro Beltrán Aguilar
Introducción.
Todos los seres humanos tenemos nuestra huella de ADN que compartimos con los
demás miembros de nuestra especie e incluso grandes regiones con otras especies. Sin
embargo, el ADN de cada individuo contiene secuencias que se distribuyen a lo largo del
árbol genealógico de sus parientes más cercanos y tales secuencias determinan su
parecido, pero también puede contener codificadas enfermedades heredadas o recién
adquiridas por mutación.
Hoy día algunas bases de datos en línea como NCBI y PDB ofrecen gran diversidad de
servicios gratuitos, como el poner a disposición del público en general, secuencias de
ADN de genes y regiones de ADN, proteínas y sus datos cristalográficos de interés
filogenético y fisiológico. El Dogma Central de la Biología Molecular nos dice que el ADN
se transcribe a ARNm y éste último a proteína, aunque existen pequeñas variantes y el
caso de los retrovirus (Crick, 1970; Gilboa et al., 1979). De tal manera que un cambio en
la secuencia de ADN tiene implicaciones en la secuencia y distribución espacial de los
aminoácidos. Los cambios en la secuencia de las proteínas pueden determinar sitios o
dominios con afición a ciertos átomos o moléculas. Todos sabemos que existen 20
aminoácidos codificados por alrededor de 60 codones de ác. nucleicos.
Antecedentes.

El Ácido Desoxirribonucleico “es una macromolécula que codifica los genes de las
células, bacterias y algunos virus. Esta información genética del ADN se usa para fabricar
las proteínas necesarias para el desarrollo y funcionamiento del organismo”.
(Enciclopediasalud, 2016)
-Estructura química y física:
El ADN está formado por una larga secuencia de nucleótidos. Cada nucleótido contiene
una de las 4 bases nitrogenadas propias del ADN: adenina, timina, citosina y guanina.
En los seres vivos el ADN forma una cadena de dos hebras enlazadas en doble hélice.
Las dos hebras están unidas entre sí mediante puentes de hidrógeno que aparean las
bases nitrogenadas: Adenina-Timina, Citosina-Guanina. (Enciclopediasalud, 2016)
-La persona que descubrió el ADN fue Johan Friedrich Miescher (1844 - 1895), un biólogo
suizo. Aisló varias moléculas ricas en fosfatos, a las cuales llamó nucleínas (actualmente
ácidos nucleicos), a partir del núcleo de los glóbulos blancos en 1869, preparando el
camino para su identificación como los portadores de la información hereditaria, el ADN
(ácido desoxirribonucleico). Miescher era estudiante de medicina y en el laboratorio de
Hoppe-Seyler, su maestro, comenzó a analizar los restos de pus de los desechos
quirúrgicos, aislando los núcleos de los glóbulos blancos y extrayendo una sustancia
ácida y cargada de fósforo a la que denominó "nucleína" (hoy sabemos que esta
sustancia es la nucleoproteína). Este descubrimiento, que se publicó por primera vez en
1871, al principio no pareció relevante, hasta que Albrecht Kossel hizo sus primeras
investigaciones en su estructura química. (ciencias, s.f.)
Objetivo.
El objetivo de esta práctica es descargar, instalar y utilizar programas (Ape y Swiss PDB
viewer para ser exactos) para observar la secuencia del ADN del homosapiens y ver
también los aminoácidos que lo conforman.

Material y Equipo
1. Ape DNA Plasmid Editor.
2. Swiss PDB Viewer.
3. Equipo de cómputo personal (al menos 1 por equipo).
4. Secuencias de ADN y datos cristalográficos referentes a canales iónicos.

Procedimiento
1. Instale los softwares en su ordenador.
2. Abra el archivo de secuencia de ADN en Ape DNA y compárelo con el de la secuencia
de aminoácidos y proyección del programa SPDB Viewer.
3. Anote en una hoja de Word la secuencia de ADN y su secuencia de ADN
correspondiente.
Resultados.
-Como tarea se nos encargo elegir 3 aminoácidos de la secuencia de ADN y
seleccionarlos en un intervalo de codón a codón. En nuestro caso se seleccionaron los
siguientes 3 aminoácidos: Prolina (Pro), Glutamina (Gln) e Histamina (His) y le secuencia
elegida fue del codón 1474 al 1535.
Para identificar estos aminoácidos se utilizo una tabla del código genético proporcionada
por el profesor. (tabla 1)

Tabla 1.- Códigos genéticos de la secuencia de aminoácidos

 Con el programa Ape se hizo todo lo anterior mencionado (ilustración 1)

Ilustración 1.- Programa Ape

 Además, se utilizó el programa SPDB Viewer para poder apreciar estos 3 aminoácidos
en una forma tridimensional.

Ilustración 2.- Programa SPDB Viewer

Discusiones
Conclusiones
Bibliografía
ciencias, A. (s.f.). Area ciencias. Obtenido de http://www.areaciencias.com/biologia/quien-descubrio-el-
adn.html

Enciclopediasalud. (16 de Febrero de 2016). Enciclopedia salud. Obtenido de

https://www.enciclopediasalud.com/definiciones/adn