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16 Agosto 2016
Artículo
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Amonio (NH4+)
cientemente, multiplicándose por seis en tan sólo 100 años. Sin
Dioxido de carbono (CO2)
embargo, para mantener este ritmo acelerado de crecimiento,
Dioxido de nitrógeno (NO2) también fue necesario aumentar la producción de fertilizantes
Nitrato (NO3-) y el uso de combustibles fósiles, y es así como comenzaron los
Nitrito (NO2-) problemas que aquejan hoy a nuestro planeta: sobrepoblación,
calentamiento global, pérdida de biodiversidad, contaminación
Nitrógeno (N2)
y cascada de nitrógeno, entre otros.
Óxido Nítrico (NO) De hecho, de todos los fertilizantes que se aplican a un culti-
Óxido nitroso (N2O) vo, las plantas sólo absorben cerca de la mitad. El resto de los fertili-
Ozono (O3) zantes se lava con el riego y termina en los mantos acuíferos, donde
ocasiona problemas en los ecosistemas, tiene efectos nocivos para la
Antes de la revolución industrial, el nitrógeno reactivo se salud, y se volatiliza a la atmósfera en forma de gases reactivos que
originaba a partir del N2 por dos procesos: relámpagos y fijación contribuyen con el calentamiento global y la contaminación del
biológica del nitrógeno. El nitrógeno reactivo no se acumulaba aire. Conforme estos compuestos nitrogenados avanzan a través de
en el ambiente, porque existía un equilibrio entre el nitrógeno los ecosistemas, desencadenan lo que se conoce como cascada del
que fijaban los organismos biológicamente y la desnitrificación. nitrógeno, que se muestra en la Figura 4.
Sin embargo, en las últimas décadas el nitrógeno reactivo se Actualmente la aplicación de fertilizantes químicos ha
está acumulando en la naturaleza como consecuencia de las ac- duplicado la cantidad de nitrógeno reactivo que circula por el
tividades humanas: incremento de los cultivos de leguminosas planeta, provocando que el ciclo del nitrógeno esté alterado en
(los principales son el frijol y la soya), el uso de combustibles más del 80%, mientras que el del carbono lo está en menos del
fósiles y sobre todo, para producir fertilizantes inorgánicos me- 10%. Por ello, el nitrógeno antropogénico es probablemente
diante el proceso desarrollado por los investigadores Haber y una amenaza medioambiental mayor que el carbono debido a
Bosch, como se ve en la Figura 3. Fritz Haber recibió el premio las actividades humanas y de la que se habla muy poco.
Nobel de Química en 1918 por desarrollar la síntesis catalítica
del amoniaco a partir del dihidrógeno y el dinitrógeno atmos- El ciclo alterado del nitrógeno, un serio problema ambiental
férico en condiciones de alta temperatura y presión. El método
Haber-Bosch, como se le conoce, solucionó los problemas de la Las actividades agrícolas liberan, por una parte, amoniaco (NH3),
agricultura a escala mundial porque fue posible producir ferti- óxido nitroso y óxido nítrico (N2O y NO, respectivamente) que
lizantes de manera industrial, sin necesidad de depender de de- se van a la atmósfera y, por otra, nitratos (NO3-) que llegan a los
sechos orgánicos como el estiércol. Al principio fue una historia acuíferos. De la combustión de carburantes fósiles se desprende
de enorme éxito, ya que gracias a los fertilizantes inorgánicos la NO y dióxido de nitrógeno (NO2), compuestos que se conocen
producción mundial de alimentos se disparó. Esta es una de las genéricamente como NOx. La intensificación de las actividades
razones por las que la población humana ha crecido tanto re- agrícolas y la combustión de carburantes fósiles aumentan la
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Figura 4. La cascada del nitrógeno en el ambiente. Muestra los efectos secuenciales que un sólo átomo de N puede tener en los compartimentos terrestres, atmosfé-
ricos y acuáticos después de transformarse de N2 no reactivo a una forma reactiva (flechas amarillas). Adaptado de United Nations Environment Programme (2007).
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Soluciones futuras a los efectos en cascada que provoca el yéndolos por fuentes de energías renovables o limpias (como la
exceso de nitrógeno en el ambiente solar o la eólica), disminuyendo el consumo eléctrico, fomen-
tando el uso del transporte público, la bicicleta o de autos híbri-
Existe poca conciencia pública sobre la importancia del exceso dos e instalando catalizadores en los autos.
de nitrógeno reactivo y la amenaza que supone para el medio Además, para encontrar soluciones acertadas ante este grave
ambiente y la salud humana. La complejidad de las interaccio- problema ambiental, económico y social se necesita de la colabo-
nes entre diferentes contaminantes nitrogenados y sus múltiples ración de la comunidad científica. Por ejemplo, en el Laboratorio
efectos es uno de los principales obstáculos cuando se intenta de Ecología Microbiana Molecular del Instituto de Ciencias del
sensibilizar a la sociedad. Sin embargo, a pesar de la falta de Mar y Limnología de la unam, tratamos de comprender cómo la
concienciación a este gravísimo problema, existen diversos tipos disminución del oxígeno en el Pacífico mexicano y en lagos tro-
de propuestas para ponerle solución. picales de México, debido al calentamiento global y la eutrofiza-
Además, como el ciclo del nitrógeno está acoplado al del ción del agua, afecta a las comunidades microbianas acuáticas que
carbono, muchas de las soluciones a los efectos de la cascada del controlan el ciclo del nitrógeno y las consecuencias que tendrá en
nitrógeno ayudarán a mitigar también el acelerado crecimiento el funcionamiento de estos ecosistemas acuáticos.
del dióxido de carbono (CO2), principal causante del cambio México, al igual que el resto del mundo, tiene un gran
climático que estamos viviendo. reto en la lucha contra el cambio climático. Entre las estrategias
Desde la parte agrícola, se propone mejorar el rendimiento a implementar, una de las prioridades es reducir el nitrógeno
de los cultivos e incrementar la eficiencia en el uso de nitrógeno reactivo en el ambiente.
con algunas medidas, como son evitar la fertilización excesiva, Actualmente nuestro país está instrumentando la Estra-
limitar los riegos tras la fertilización, usar fertilizantes de libera- tegia Nacional de Cambio Climático, además acaba de aceptar
ción lenta, abonos verdes o estiércol e implementar la rotación una serie de compromisos en la XXI Cumbre de Cambio Cli-
de cultivos. Adicionalmente, se ha propuesto tratar de cambiar la mático, celebrada recientemente a finales 2015 en París. Entre
política alimentaria a nivel mundial, fomentando el consumo de las acciones, México se ha comprometido a reducir las emisio-
menos carne y la producción local de alimentos para reducir la nes de gases de efecto invernadero en un 22 % para el 2030,
necesidad de fertilizantes en grandes zonas agrícolas. incentivando el uso de energías renovables y la conservación de
También se necesitan mejorar los sistemas de depuración ecosistemas, como los bosques y humedales, que contribuyen a
de aguas. Existen algunas propuestas ingeniosas y sencillas, como la reducción de los gases de efecto invernadero. Estas son sólo
la de colocar redes que atrapen el nitrógeno mediante una tela de algunas de las medidas que se tienen que impulsar para luchar
alambre cubierta por algas que se coloca en zonas acuáticas con contra el cambio climático.
altas concentraciones de nitrógeno. Las algas capturan el nitróge-
no y lo usan para crecer, disminuyendo la cantidad de nitrógeno
en el agua. Posteriormente, parte de estas algas se pueden dar Silvia Pajares. Es investigadora asociada C del Instituto de Ciencias
como alimento al ganado, repitiéndose de nuevo el proceso. del Mar y Limnología de la unam. Su línea de investigación buscar la
relación entre las comunidades microbianas que controlan en ciclo
Por supuesto, otra solución necesaria es la de reducir emi- del nitrógeno en sistemas acuáticos y el cambio climático global.
siones de combustibles fósiles. Esto se podría conseguir sustitu-
•• Galloway, J.N., Aber, J.D., Erisman, J.W., Seitzinger, S.P., Howarth, R.W., Cowling, E.B.y B.J., Cosby. 2003. The nitrogen
cascade. BioScience, 53:341-356.
•• Galloway, J.N., Townsend, A.R., Erisman, J.W., Bekunda, M., Cai, Z., Freney, J.R., Martinelli, L.A., Seitzinger, S.P. y M.A.,
Sutton. 2008. Transformation of the nitrogen cycle: Recent trends, questions, and potential solutions. Science, 320:889-892.
•• Fowler, D., Pyle, J.A., Raven, J.A. y M.A., Sutton. 2013. Discussion Meeting Issue 'The global nitrogen cycle in the twenty-first
century'. Philosophical Transactions of the Royal Society, 368, issue 1621.
•• United Nations Environment Programme. 2007. Reactive nitrogen in the environment: Too much or too little of a good thing. The
Wood Hole Research Center, usa.
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Recapitulando: la formación de los átomos en el universo, la atmósfera debido al sol. Además, el reciclamiento de los átomos
Tierra primitiva y los ciclos biogeoquímicos en la Tierra no sólo se ha dado por procesos abióticos, si no que
fundamentalmente se ha llevado a cabo por los procesos meta-
Milisegundos después del Big Bang, el universo era una sopa bólicos derivados de los organismos más pequeños: las bacterias
caliente de plasma de partículas elementales que dieron lugar a y arqueas. Estos microorganismos procariontes, fueron las pri-
toda la materia en el universo. Minutos después, ya se habían meras formas de vida que aparecieron en la Tierra hace 3,800
formado todos los neutrones y protones los cuales comenzaron millones de años, y con el paso del tiempo, evolucionaron hasta
a fusionarse entre sí, formando núcleos atómicos en un pro- cambiar la química del planeta para siempre. Lo anterior dio
ceso conocido como nucleosíntesis del Big Bang. Trescientos lugar a los ciclos biogeoquímicos que son la razón fundamental
mil (300,000) años después, el universo ya se había enfriado de la existencia de la vida en el planeta Tierra, tal y como la
significativamente como para que los electrones se combinaran conocemos hoy en día.
con los protones y neutrones formando los primeros átomos
de helio e hidrógeno. Los gases de estos átomos, dieron lugar a Las primeras formas de vida en la Tierra se basaron en com-
nubes gigantes que al colapsar formaron las primeras estrellas y puestos de azufre
galaxias, generando en su interior los átomos esenciales para la
vida en la Tierra: carbono, oxígeno, nitrógeno, azufre y fósforo El planeta Tierra se formó hace aproximadamente 4,600 mi-
(CHONP). Los primeros en formarse en el interior de las estre- llones de años y por términos prácticos, la historia de la vida
llas fueron el carbono y oxígeno, y los ciclos biogeoquímicos de se divide en cuatro grandes eones: Hadeano, Archeano, Pro-
estos dos elementos se conocen con detalle (ver en esta edición a terozoico y Fanerozoico (ver Figura 1). En el Hadeano (nom-
Campo y a Souza y Viladomat-Jasso). Pero existen átomos más brado así por el Dios griego del inframundo Hades), la Tierra
complejos, como el azufre, que se formaron posteriormente en era excesivamente caliente, sin oxígeno, en donde una cantidad
las estrellas. La complejidad de los átomos se da al aumentar el inimaginable de meteoritos hubiera destruido cualquier intento
número de electrones, ya que éstos les confieren la posibilidad de vida, sin embargo, dichos impactos pudieron haber traído
de asociarse con otros elementos. Es decir, los electrones dispo- los compuestos esenciales para el inicio de la vida en la Tierra
nibles les confieren mayores posibilidades de asociarse con otros (moléculas orgánicas y posiblemente agua). La evidencia cien-
elementos, porque estos electrones son los responsables de la tífica indica que la vida empezó al principio del eón Arqueano
interacción entre los átomos: mientras más haya, aumentan los (3,800 millones de años), en un mar caliente sin oxígeno con
tipos de enlaces posibles que pueden formarse. Debido a esto, abundante hierro. Las teorías más recientes indican que posi-
entender cómo se reciclan estos átomos “complejos” en nuestro blemente la vida se originó en ambientes parecidos a las ventilas
planeta no ha sido algo trivial, ya que tienen la capacidad de hidrotermales, las cuales son creadas a lo largo de las líneas de
interaccionar con una gran cantidad de átomos y elementos di- separación de las placas tectónicas en el fondo marino.
ferentes (ver glosario). Existen principalmente dos tipos de ventilas hidroterma-
Los átomos que constituyen la vida, y que se formaron les, clasificadas por color del efluente: negro o blanco. Las ven-
en las estrellas, se han reciclado en nuestro planeta y continúan tilas o fumarolas negras, se encuentran cerca de los centros de
haciéndolo por medio de diferentes procesos como son: 1. el expansión donde el magma calienta el agua de mar que se filtra
movimiento del magma que proviene del centro de la Tierra a la corteza terrestre, emitiendo agua caliente (300-400°C), áci-
2. la tectónica de placas y 3. las reacciones que ocurren en la da (pH 2-3), rica en azufre reducido (H2S 3-110 mm/kg), dióxi-
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Glosario co) durante largo tiempo albergando las primeras formas de vida,
cuyos metabolismos, en ausencia de oxígeno y en un ambiente
hipercaliente, dependían del azufre para obtener energía.
Big Bang: Explosión cósmica de una muy pequeña cantidad En el árbol de la vida se encuentra evidencia de esta teoría,
de materia a grandes temperaturas que ocurrió hace 20 mil
millones y que dio origen al universo. en donde los linajes más ancestrales son arqueas hipertermófilas
que utilizan compuestos reducidos de azufre, así como hidróge-
Partículas elementales: Constituyentes más básicos de la
materia que transmiten las interacciones fundamentales. no molecular. Estos primeros organismos que respiraron azufre,
fueron los predecesores de todos los metabolismos que surgie-
Partículas subatómicas: Partículas que constituyen los
átomos, y que están formadas por algunas partículas ron posteriormente en la Tierra primitiva, como lo son la foto-
elementales. síntesis anoxigénica llevada a cabo por bacterias púrpuras y por
las verdes del azufre, así como la fotosíntesis oxigénica que por
Protón: Partícula subatómica que se encuentra en el núcleo
atómico y que tiene carga positiva. El número de protones primera vez la llevaron a cabo las cianobacterias (Figura 1) que
en un átomo determina el elemento. se describen con detalle en el artículo de Souza y Viladomat-
Neutrón: Partícula subatómica que se encuentra en el Jasso de este número de Oikos=.
núcleo atómico; a diferencia del protón, no tiene carga
eléctrica neta. El número de neutrones en un núcleo La sucesión de eventos en la historia de la vida en la Tierra y
atómico determina el isótopo de ese elemento. los tapetes microbianos
Electrón: partícula subatómica con carga negativa que se
encuentra fuera del núcleo atómico. El dilucidar la historia de la vida en la Tierra primitiva no ha
Nucleosíntesis: Proceso por el cual protones y neutrones sido, ni es, tarea fácil. Para poder entender los eventos involu-
se fusionan para crear nuevos núcleos atómicos. crados en la aparición de la vida en la Tierra y los consecuentes
Dependiendo el momento y el lugar donde se lleve a cabo, metabolismos anaerobios que respiraron azufre, hasta la fotosín-
la nucleosíntesis se divide en 4: i) del Big Bang (primeros 3
minutos después de la formación del universo), ii) estelar tesis oxigénica, ha sido necesaria una gran cantidad de pruebas
(dentro de las estrellas donde se formaron los elementos moleculares: fisicoquímicas, geoquímicas, fósiles, etcétera. Sin
esenciales para la vida, iii) explosiva (supernovas, donde embargo, una evidencia muy clara de esta sucesión de eventos
se producen los elementos más pesados que el He) y iv) a en la historia de la vida de la Tierra se encuentra en estructuras
espalación de rayos cósmicos (elementos ligeros). microbianas actuales que existen en muy pocos lugares en el
Átomo: Partícula más pequeña en la que un elemento puede mundo como Australia, Francia y México (Cuatro Ciénegas,
ser dividido. El átomo es un constituyente de la materia que Guerrero Negro y Puebla). Estas estructuras se conocen como
está conformado por partículas subatómicas. microbialitos o tapetes microbianos (Figura 2).
Elemento: Átomos que tienen el mismo número de El término microbialito se refiere a las estructuras órgano-
protones en su núcleo (conocido como número atómico z) y sedimentarias que forman láminas arregladas de manera vertical
que se encuentran en la tabla periódica.
que se desarrollan en interfases sólido/agua (Figura 2). Cuando
Arqueas: Organismos unicelulares sin núcleo definido
(procariontes) que difieren de las bacterias y eucariontes y
que generalmente viven en ambientes extremos.
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precipitan minerales como los silicatos o carbonatos de su en- esta tecnología resaltó la importancia de los gradientes de azufre y
torno, se convierten en roca y son denominados estromatolitos. oxígeno, e identificó la reducción de sulfato y la fotosíntesis como
Cuando no precipitan minerales de su entorno son denomina- principales procesos geoquímicos de los tapetes microbianos.
dos tapetes microbianos. Los microorganismos que habitan los En los noventas, el uso de técnicas moleculares y micro-
tapetes microbianos viven intercambiando entre sí nutrientes, sensores de alta resolución (Figura 3) ayudó a estimar la estruc-
materia orgánica y compuestos de azufre, lo que contribuye a tura de la comunidad de muestras ambientales y reveló una in-
que exista una fina formación de capas o estratificación vertical, esperada gran diversidad microbiana, contrario a lo que se había
donde se llevan a cabo la mayoría de los ciclos biogeoquímicos, observado con técnicas que dependen de cultivos y microsco-
de los cuales el ciclo del azufre es el eje rector de todos los de- pía. A principios de siglo XXI, el uso de marcadores moleculares
más. La organización de los microorganismos, de abajo hacia abrió la posibilidad de estudiar el potencial metabólico de los
arriba, recapitulan la historia de la vida en la Tierra en tan sólo tapetes microbianos y resaltó la importancia de la reducción de
unos cuantos centímetros (Figura 2). sulfato y la fijación de nitrógeno. De igual manera, la combi-
Durante más de dos décadas, la falta de métodos y herra- nación de medidas radiométricas, perfiles químicos y análisis
mientas adecuadas dificultó entender la diversidad microbiana en filogenéticos sirvió para estudiar lo que hacen algunos tipos de
los tapetes. A principios de los años ochenta, el uso de microsen- bacterias en particular. Actualmente, técnicas como la metage-
sores de alta resolución (Figura 3), ayudó para caracterizar el me- nómica (descrita ampliamente en la revisión de S. Nikolaki y G.
dio ambiente físico y químico a pequeña escala espacial. El uso de Tsiamis de 2013), que consiste en conocer la secuencia del adn
Figura 2. Modelo de un tapete microbiano. a) Representación de la estratificación vertical de los microorganismos del tapete donde se ilustra la interacción fisio-
lógica, metabólica y geoquímica de acuerdo con el potencial redox. b) Esquema de la intersección de los ciclos biogeoquímicos en el tapete microbiano, donde el
ciclo del azufre es el eje rector de la intersección.
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orden y los microorganismos de cada una de las capas del tapete Las propiedades fisicoquímicas del azufre complican su en-
microbiano, que está determinado por el gradiente de azufre tendimiento como ciclo biogeoquímico
(Figura 2). Consideramos que éste es un modelo que representa
a los ciclos biogeoquímicos, y con base en esta información ge- El azufre es un elemento no metal que se encuentra en la sexta
neramos el algoritmo que nos permite entender el ciclo del azu- familia de la tabla periódica, justo debajo del oxígeno. El azufre
fre a escala global desde perspectivas diferentes: molecular, eco- tiene un número atómico de 16 (es decir, tienen 16 protones)
lógica y biogeoquímica. Como parte de nuestra investigación y una masa atómica de 32 (suma de protones y neutrones). En
realizamos un análisis bibliográfico para recopilar la informa- cuanto a su configuración electrónica 1s22s22p63s23p4, tiene
ción de todos los genomas secuenciados hasta el momento de seis electrones de valencia, los cuales son los responsables de la
arqueas y bacterias (incluyendo todos los organismos del azufre, interacción entre átomos, es decir, el número potencial de enlaces
psb, gsb, clsb, srb) y todos los genomas de ambientes naturales con otros elementos químicos.
secuenciados hasta ahora (incluyendo los tapetes microbianos El azufre, a diferencia de los otros elementos que compo-
y estromatolitos de Cuatro Ciénegas, Francia, Australia, Chi- nen la vida en la tierra (CHONP), tiene ocho estados de oxida-
le, etcétera) que se encuentran en las bases de datos públicas ción, lo cual indica que el azufre puede tomar diferentes “formas
como el Centro Nacional para la Información Biotecnológica químicas” que se pueden mover en la Tierra de manera abiótica y
(ncbi por sus siglas en inglés). Desarrollamos un algoritmo que biótica por diferentes grupos bacterianos que son muy divergen-
describe la importancia del ciclo del azufre, a escala global, por tes en términos evolutivos, ecológicos y metabólicos (las bacterias
medio de un valor numérico. De esta manera podemos cono- que encontramos en los tapetes microbianos).
cer qué tan importante es un ambiente determinado u orga- Dependiendo del enfoque con el que se estudie el ciclo
nismo para el ciclaje del azufre, sin contar con ninguna prueba del azufre, se pueden estudiar sus transformaciones de manera
anterior, más que conociendo su genoma o en el caso de un parcial o general. Por ejemplo, la Oceanografía y la Geología
ambiente, el conjunto de genomas o metagenoma. Nuestros sólo estudian los procesos meramente abióticos. Por otra parte,
resultados comprueban la importancia de los microorganismos desde la perspectiva de la Ecología Microbiana, estudiamos los
que se encuentran en los tapetes microbianos y estromatolitos: procesos y las relaciones entre los diferentes organismos que me-
todos los genomas del azufre secuenciados hasta ahora, tienen tabolizan compuestos de azufre, y el ambiente donde se llevan
un valor muy alto en nuestro algoritmo. Además, los ambientes a cabo, involucrando tanto procesos bióticos como abióticos.
en donde el ciclo del azufre es más importante, se encuentran en De esta forma, reuniendo la información de los enfoques de
los tapetes microbianos de Cuatro Ciénegas y en manglares de Oceanografía, Geología y Ecología Microbiana, hoy sabemos
Brasil, confirmando que estos ambientes son claves para el reci- que el ciclo del azufre influye en la respiración de la materia
claje completo de las formas orgánicas e inorgánicas de azufre. orgánica sedimentaria, el estado de oxidación de la atmósfera
Con este algoritmo no sólo se puede estudiar el ciclo del y los océanos, y la composición del agua de mar. Lo anterior
azufre, sino que está diseñado para que se entienda cualquier ci- está íntimamente relacionado con los otros ciclos biogeoquí-
clo biogeoquímico de nuestro planeta, desde un punto de vista micos (como por ejemplo el carbono). Sin embargo, debido a
ecológico, molecular y geoquímico. De esta forma se pueden ge- que los diferentes compuestos de azufre son movilizados por
nerar valores numéricos de ciclos biogeoquímicos con los que es una gran cantidad de grupos bacterianos, el ciclo del azufre sólo
posible hacer análisis que integran la información de forma glo- se estudia por partes. Es decir, existen grupos de investigación
bal, y detectar así ambientes clave para el ciclaje de los elementos que están enfocados en entender procesos, vías metabólicas y
esenciales para la vida en el planeta. Además, también se puede grupos bacterianos específicos de cada parte del ciclo del azu-
analizar y dar seguimiento en la misma escala global a las vías fre. Por ejemplo, analizan la distribución de las bacterias sulfato
metabólicas de ciclos biogeoquímicos específicos. Por ejemplo, reductoras por medio de un solo gen. Por lo tanto, los intentos
en el caso particular del ciclo del carbono, estamos trabajando por entender el ciclo del azufre, sólo han reconstruido peque-
con nuestro algoritmo para que sea capaz de detectar aquéllos ños fragmentos del rompecabezas. Debido a esto, existe poca
ambientes importantes en los que está ocurriendo la degrada- información acerca de los patrones de diversidad y distribución
ción de hidrocarburos o compuestos aromáticos tóxicos (como el de los microorganismos que llevan a cabo las reacciones redox
benceno nitrotolueno que contienen algunas gasolinas). De esta del ciclo del azufre, y por lo tanto se desconocen los factores
forma es posible encontrar en qué ambientes del mundo existen ambientales precisos que regulan su abundancia relativa. Au-
organismos potencialmente útiles para procesos como la biorre- nado a esto, no hay evidencia directa del ciclaje activo a gran
mediación, entre otras cosas. escala de este elemento. Lo anterior resalta la importancia de
Pero, ¿por qué estudiar el ciclo del azufre en una escala nuestro algoritmo que se apoya en la información de los ta-
global? y ¿por qué es necesario un algoritmo que detecte la im- petes microbianos, los cuales no sólo recapitulan la historia de
portancia del ciclo del azufre? la vida en la Tierra, sino que también llevan a cabo todos sus
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ciclos biogeoquímicos. El utilizarlos como modelos de estudio Lo anterior nos hace preguntarnos ¿la vida podido evolucio-
es esencial para entender la vida en el pasado, y también para nar en el universo si los valores de las constantes fundamentales
comprender la biogeoquímica del planeta actual, con ayuda de o las condiciones iniciales del Big Bang hubieran sido diferentes?,
técnicas actuales. ¿qué consecuencias hubiera tenido en la Tierra si el orden de apa-
Como ya lo hemos mencionado, el azufre ha sido y es un rición de los elementos en las estrellas hubiera sido diferente?, o ¿si
elemento esencial para la vida en el planeta. Lo encontramos en las propiedades de los elementos que conforman la vida en la Tie-
los aminoácidos esenciales como la cisteína y la metionina, y rra hubieran tenido un cambio menor en su termodinámica?, ¿qué
también en coenzimas y cofactores que se encuentran en todos hubiera pasado con el metabolismo y la evolución de la vida en la
los seres vivos (biotina, la tiamina, la coenzima A, y los clusters Tierra?. Quizás nunca lo sabremos, pero nada nos cuesta imaginar.
de hierro y azufre). Las proteínas que necesitan estos cofactores
son esenciales en una gran variedad de procesos metabólicos y
celulares fundamentales, como la fijación de carbono, la asi-
milación de lípidos y carbohidratos, la síntesis de pentosas, la
duplicación celular, la replicación del adn (ácido desoxirribo- Valerie de Anda. Es Bióloga por la Facultad de Ciencias de la unam.
nucleico), la fotosíntesis, la respiración y la regulación génica. Realizó su tesis de investigación en el Instituto de Biotecnología de la
unam sobre la evolución dirigida de proteínas recombinantes. Actual-
Sin el átomo de azufre no se podrían llevar a cabo proce- mente imparte clases de microbiología en la Facultad de Ciencias
sos celulares indispensables para la vida en la Tierra, por lo que unam, y estudia el doctorado en el Instituto de Ecología de la unam.
su importancia no sólo radica como un elemento fundamental Valeria Souza. Es investigadora del Laboratorio de Evolución Mole-
en la biogeoquímica del planeta, sino también como un ele- cular y Experimental del Departamento de Ecología Evolutiva. Estu-
dia la ecología evolutiva de los microorganismos. Su trabajo ha sido
mento clave para mantener funcionando la maquinaria celular reconocido con diversos premios nacionales.
de eucariontes y procariontes.
•• De Anda Torres V., C. Poot-Hernandez, I. Contreras-Moreira, L. Eguiarte y V. Souza. Enviado a Environmental Microbiology.
A new multigenomic approach for the study of biogeochemical cycles at global scale: the complete molecular reconstruction of the
sulfur cycle.
•• Nikolaki S, Tsiamis G. 2013 Microbial diversity in the era of omic technologies. Biomed Res Int. 2013;2013:958719. doi:
10.1155/2013/958719. Epub 2013 Oct 24. Review. PubMed PMID: 24260747; PubMed Central PMCID: PMC3821902.
•• Olson, K.R. y K.D. Straub. 2016. The Role of Hydrogen Sulfide in Evolution and the Evolution of Hydrogen Sulfide in Me-
tabolism and Signaling. Physiology (Bethesda). 31: 60-72. doi: 10.1152/physiol.00024.2015. Review. PubMed PMID: 26674552.
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La aplicación de enzimas microbianas en el tratamiento de aguas residuales industriales
Introducción
Las enzimas son biocatalizadores producidos por las células vivas para causar reacciones
bioquímicas específicas formando generalmente los diversos procesos metabólicos de las células y
son indispensables para el mantenimiento y la actividad de la vida. Las enzimas son altamente
específicos en su acción sobre substratos y, a menudo se requieren muchas enzimas diferentes para
llevar a cabo la secuencia de reacciones metabólicas realizadas por las células vivas. Cada cepa de
un microorganismo produce un gran número de enzimas que pueden hidrolizar, oxidante o reductor
y metabólicos en la naturaleza. enzimas microbianas se sabe que juegan un papel crucial como
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catalizadores metabólicos, lo que resulta en su uso en diversas aplicaciones industriales. El mercado
de uso final para las enzimas industriales está muy extendido de amplio con numerosas aplicaciones
comerciales industriales [1]. Los microbios han servido y seguirá sirviendo como una de las fuentes
más grandes y útiles de muchas enzimas [2]. Muchos procesos industriales tienen varias desventajas
como la baja eficiencia catalítica, la falta de especificidad enantiomérica para la síntesis quiral,
requisito de alta temperatura, bajo pH y alta presión. También, el uso de disolventes orgánicos
conduce a residuos orgánicos y los contaminantes. Las enzimas son más útiles para estas
aplicaciones, ya que trabajar en condiciones suaves de reacción (por ejemplo, temperatura, pH,
condiciones atmosféricas), no necesitan protección de los grupos funcionales del sustrato, tienen
una vida media larga, un alto estéreo-selectividad dando estereo- y región de los productos de
reacción química definida en una aceleración de 105 a 108 veces, y, además, que trabajan sobre
sustratos no naturales [3]. Además, enzimas se pueden seleccionar genéticamente y químicamente
modificados con el fin de mejorar sus propiedades clave: estabilidad, especificidad de sustrato y la
actividad específica. En el caso del océano y calidad de los ríos, la contaminación es causada
principalmente por la descarga de aguas residuales tratadas inadecuadamente industriales y
municipales.
En la descarga inicial, estas aguas residuales pueden contener altos niveles de contaminantes
inorgánicos que pueden ser biodegradados fácilmente, pero cuya carga de impacto sobre los
ecosistemas, ya sea en sólidos suspendidos totales (SST), Demanda Bioquímica de Oxígeno (DBO),
o Demanda Química de Oxígeno (COD) , puede estar en las decenas de miles mg / L [4]. Para
combatir esta carga cada vez mayor en nuestro medio ambiente acuático, la regulación cada vez
más estrictas en la descarga de la contaminación está siendo implementado por diversos organismos
gubernamentales, con el foco principalmente en la reducción de residuos. El cumplimiento de las
legislaciones ambientales no deben plomo necesaria para la creación de los costes adicionales, sino
que puede proporcionar una fuente secundaria de ingresos.
Las características de las aguas residuales pueden diferir considerablemente tanto dentro como entre
las industrias. En el tratamiento de aguas residuales, tratamiento biológico parece ser una tecnología
prometedora para alcanzar ingresos de Certificados de Reducción de Emisiones (RCE), más
comúnmente conocidos como créditos de carbono, que se genera gas metano a partir de la digestión
anaerobia y puede ser utilizada como energía renovable. Con el análisis apropiado y control
ambiental, casi todas las aguas residuales que contienen componentes biodegradables con una
relación BOD / COD de 0,5 o mayor pueden ser tratados fácilmente por medios biológicos [5].
En comparación con otros métodos de tratamiento de aguas residuales, sino que también tiene las
ventajas de reducir los costos de tratamiento con ninguna contaminación secundaria [6]. Ambos
procesos aeróbicos y anaeróbicos se pueden utilizar; el primero consiste en microorganismos
(aerobios) que utilizan oxígeno libre o disuelto y convierten los residuos orgánicos a la biomasa y
CO2 mientras que en los últimos residuos orgánicos complejos son degradados en metano, CO2 y
H2O a través de tres pasos básicos (hidrólisis, acidogénesis incluyendo acetogénesis y
metanogénesis) en la ausencia de oxígeno.
La mayoría de los procesos de tratamiento de residuos se pueden clasificar como cualquiera de los
procesos biológicos físico-química o. El tratamiento enzimático se encuentra entre estas dos
2
categorías convencionales ya que implica procesos químicos basados en la acción de catalizadores
biológicos.
La destoxificación de compuestos orgánicos tóxicos por varias bacterias y hongos [9] y plantas
superiores [10] a través de acoplamiento oxidativo está mediada con oxidorreductasas.
oxigenasas microbianas
monooxigenasas
Estas enzimas catalizan reacciones de oxidación de sustratos a partir de alcanos a las moléculas
complejas como los esteroides y los ácidos grasos y sólo requieren oxígeno molecular para su
actividad. Estas enzimas requieren oxígeno molecular única para sus actividades y utilizan el
sustrato como agente de [12] reductor. La desulfuración, deshalogenación, desnitrificación,
amonificación, hidroxilación, biotransformación, y la biodegradación de varios compuestos
aromáticos y alifáticos son catalizadas por monooxigenasas.
dioxigenasas microbianas
lacasas microbianas
peroxidasas microbianas
3
Estas enzimas catalizan la oxidación de compuestos fenólicos de la lignina y otros a expensas de
peróxido de hidrógeno (H2O2) en presencia de un mediador. Debido a su alto potencial de degradar
sustancias tóxicas en la naturaleza, la peroxidasa de lignina (LIP) y peroxidasa de manganeso-
dependiente (MNP) se han estudiado más.
lipasas microbianas
Estas enzimas pueden catalizar diversas reacciones tales como hidrólisis, interesterificación,
esterificación, alcoholisis y aminolisis [14]. Además de su uso diagnóstico en la biorremediación,
lipasa tiene muchas aplicaciones potenciales en los alimentos, química, fabricación de detergente,
cosmético, y las industrias de fabricación de papel, pero su costo de producción ha restringido su
uso industrial [15].
celulasas microbianas
Durante la hidrólisis enzimática, la celulosa se degrada por las celulasas de azúcares reductores que
pueden ser fermentados por levaduras o bacterias a etanol [16]. Las celulasas causar la eliminación
de microfibrillas de celulosa, que se forman durante el lavado y el uso de los paños basados en
algodón. En industria del papel y pulpa, celulasas se utilizan para la eliminación de la tinta durante
el reciclado de papel.
Las proteasas pertenecen al grupo de enzimas que hidrolizan enlaces peptídicos en el ambiente
acuoso y sintetizarlos en entorno no acuoso. Las proteasas tienen una amplia gama de aplicaciones
en alimentos, cuero, detergente, y la industria farmacéutica [17] (Tabla 2).
Industrias y contaminantes
Los compuestos aromáticos, incluidos fenoles y aminas aromáticas, comprenden una de las clases
principales de contaminantes y se regulan estrictamente en muchos países. Se encuentran en las
aguas residuales de una amplia variedad de industrias, incluyendo la conversión de carbón, refino
de petróleo, resinas y plásticos, conservación de la madera, recubrimiento de metales, colorantes y
otros productos químicos, textiles, minería y vestirse, y pulpa y papel [18]. El proceso Kraft que se
utiliza ampliamente en la fabricación de pasta de madera hojas de 5-8% (w / w) de lignina
modificada residual en la pulpa. Esta residual es responsable del color marrón característico de la
pulpa y se elimina comercialmente por el uso de agentes de blanqueo tales como el cloro y cloro
óxidos de [19].
operaciones de blanqueo producen efluentes de color marrón oscuro, que contienen productos
clorados tóxicos y mutagénicos que constituyen un peligro ambiental [20]. Ha habido un número de
estudios, incluyendo el uso de peroxidasas y lacasas para el tratamiento de efluentes de blanqueo.
Pesticidas, que incluyen herbicidas, insecticidas y fungicidas, son ampliamente utilizados en todo el
mundo hoy en día para la protección de cultivos y se espera que este uso seguirá creciendo [21].
Los efectos adversos potenciales que la industria de los plaguicidas puede tener en el medio
ambiente surgen de la eliminación de los desechos formados durante la producción y la formulación
de los plaguicidas, la desintoxicación de los envases de plaguicidas y los tanques de pulverización,
y la contaminación de las aguas superficiales y subterráneas por escurrimiento de plaguicidas [22].
Se estima que 3 millones de toneladas de cianuro se usan anualmente en todo el mundo en
4
diferentes procesos industriales, incluyendo la producción de productos químicos intermedios,
fibras sintéticas, goma y productos farmacéuticos, así como en la lixiviación de minerales,
procesamiento de carbón y de las planchas de metal.
Las enzimas podrían ser utilizados para disminuir los desechos de alimentos a través de
procesamiento enzimático para producir de mayor valor de los subproductos y para ayudar en la
limpieza de los flujos de residuos de alimentos [23]. Durante la última década, ha habido un interés
creciente en la hidrólisis enzimática de la celulosa [24]. Este interés se debe a las ventajas que tal
proceso podría ofrecer, a saber, la conversión de residuos lignocelulósicos y celulósicos a una
fuente de energía útil a través de la producción de azúcares, etanol, biogás o de otros productos
finales energético [25].
Los metales pesados tales como arsénico, cobre, cadmio, plomo y cromo entre otros, son
contaminantes peligrosos que se encuentran en un número de corrientes de desechos industriales y
de minería, así como en residuos sólidos, lodos de aguas residuales municipales y lixiviados de
vertedero [26] (Tabla 1). Tensioactivos o agentes de superficie activa son sustancias orgánicas que
tienen más bien grandes moléculas polares y son ingredientes básicos de detergentes [27]. Los
tensioactivos pueden causar problemas significativos de contaminación cuando las altas
concentraciones de las fábricas de formulación de champú, por ejemplo, entran en los sistemas de
alcantarillado municipales y generar condiciones no deseables tales como la formación de espuma
[28]. Las aguas residuales de las industrias lácteas [29] y los mataderos [30] son a menudo ricos en
moléculas orgánicas biodegradables y nutrientes y contienen altos niveles de grasas y proteínas que
tienen un coeficiente de biodegradabilidad baja. Algunos colorantes son polímeros altamente
estructurados y son muy difíciles de descomponer. Muchos de los colorantes son cancerígenos,
mutagénicos y perjudicial para el medio ambiente. industrias de procesamiento de cuero son
también una enorme fuente de residuos que incluyen residuos de cueros sin curtir / pieles (recortes,
desechos descarnado), residuos de cuero curtido (Afeitado residuos, polvo), residuos de teñido y
acabado de cuero (recortes de cuero) [31 ], tolueno y benceno.
5
Las enzimas celulolíticas: celulasa, celobiasa Cellobio-hidrolasa, Exo-1,4-BD-glucosidas: hidrólisis
de lodos celulósicas de pulpa y papel para producir azúcares y alcohol, la hidrólisis de la celulosa en
los residuos sólidos municipales para azúcares y otras fuentes de energía [34]
Quitinasa: bioconversión de mariscos residuos a N-acetil
glucosamina [35]
Cloro-peroxidasa: La oxidación de compuestos fenólicos [36]
Cyanidase: descomposición Cyanide [37]
El cianuro hidratasa: hidrólisis Cyanide [38]
L-Galactono-lactona oxidasa: Conversión de galactosa de la hidrólisis de suero de leche al ácido L-
ascórbico.
lacasa : Remoción de fenoles, decoloración de los efluentes de blanqueo Kraft, la unión
de fenoles y aminas aromáticas con humus [40]
Lactasas: Dairy estabaprocesamiento de te y la producción de productos de valor añadido [41]
lignina peroxidasa: La eliminación de fenoles y compuestos aromáticos, decoloración de los
efluentes de blanqueo Kraft [42]
Lipasa: Mejora de la deshidratación de lodos [43]
Lisozima: Mejora de la deshidratación de lodos [44]
Mn-peroxidasa: La oxidación de fenoles monoaromáticos y colorantes aromáticos [45]
Paratión hidrolasa: hidrolización de los plaguicidas organofosforados [46]
La pectina liasa: Pectina degradación [47]
Peroxidasa: La eliminación de fenoles y aminas aromáticas, decoloración de los efluentes de
blanqueo Kraft, deshidratación de lodos [48]
Fosfatasa: La eliminación de metales pesados [49]
Las proteasas: La solubilización de pez y carne La mejora de restos de lodos
deshidratación [50]
La tirosinasa: La eliminación de fenoles [51]
6
La nanotecnología es otra área que está ganando importancia en el tratamiento de aguas residuales.
El uso de nanopartículas en Reactive Remediation Technology es de gran interés para el tratamiento
de aguas residuales, ya que implica la degradación completa de los contaminantes a productos
inocuos tales como dióxido de carbono y agua [53]. La remediación de aguas residuales
contaminadas se puede lograr mediante el uso de una combinación de la tecnología de enzimas y la
nanotecnología conocido como el SEN, es decir, sola enzima de nanopartículas [54]. A SEN puede
ser descrita como una enzima cubierto por unos pocos nanómetros de protección jaula de espesor.
libre de células extractos crudos o formas purificadas de enzimas como peroxidasas, polifenol
oxidasas, deshalogenasas, hidrolasas se pueden utilizar para la síntesis de SEN. Una variedad de
compuestos recalcitrantes tales como fenoles, colorantes poliaromáticos, los pesticidas pueden ser
degradados por estas enzimas. Similar,
biorreactores de membrana constituyen una interesante posibilidad para ser aplicado en el
tratamiento de aguas residuales. La combinación de la tecnología de membrana con reactores
enzimáticos para tratamiento de aguas residuales ha llevado al desarrollo de tres sistemas genéricos:
reactor de membrana enzimática inmovilizada (IEMR), biorreactor de membrana extractivas (EMB)
y el reactor de membrana de contacto directo (DCMR). En ambos sistemas, IEMR y EMB, el uso
de biorreactores de fibra hueca o reactores de membrana capilar aumenta considerablemente la
relación de volumen de área de superficie y, por lo tanto, la capacidad de tratamiento del sistema
[55].
7
enzimas son altamente específicos y catalizadores extremadamente eficientes [59]. Ellos pueden
degradar selectivamente un contaminante objetivo sin afectar a los otros componentes en el
efluente. Más importante, pueden operar bajo condiciones de reacción suaves, especialmente
temperatura y pH. En este sentido, las enzimas superan a los catalizadores regulares (elementos de
transición como Cu, Ni, etc.). que pueden operar bajo condiciones de reacción suaves,
especialmente temperatura y pH. En este sentido, las enzimas superan a los catalizadores regulares
(elementos de transición como Cu, Ni, etc.). que pueden operar bajo condiciones de reacción
suaves, especialmente temperatura y pH. En este sentido, las enzimas superan a los catalizadores
regulares (elementos de transición como Cu, Ni, etc.).
Desde la perspectiva del medio ambiente, las enzimas son más aceptable debido a su
biodegradabilidad [60]. En el caso de reacciones en las que el contaminante objetivo se oxida, la
enzima recibe uno o más electrones desde el sustrato y dona estos electrones a un aceptor de
electrones. Por lo tanto, al final de la reacción la enzima se regenera y está disponible para el
próximo ciclo catalítico. El origen biológico de las enzimas reduce su impacto adverso sobre el
medio ambiente haciendo así tratamiento de aguas residuales enzimática una técnica
ecológicamente sostenible.
escenario actual
El uso de enzimas como las amilasas y celulasas en lugar de tratamientos químicos en diversas
industrias ha dado lugar a la reducción de descarga de residuos químicos en el medio ambiente.
Nuevos procesos enzimáticos se están desarrollando tienen el potencial de reemplazar totalmente el
uso de productos químicos en diferentes industrias. El uso de enzimas como xilanasa ha mejorado la
eficacia de blanqueo reduciendo así el consumo de cloro. Inmovilización aumenta la estabilidad
mecánica y térmica de las enzimas que disminuye la probabilidad de la lixiviación de la enzima en
la solución. La investigación y desarrollo se centra actualmente en impartir propiedades deseables,
el desarrollo de sistemas microbianos y otras proteínas heterólogas a través de la clonación de
genes, más de expresión y de la ingeniería de enzimas. Algunos de los programas en curso sobre
enzimas incluyen la ingeniería de una fitasa termo-tolerantes [61],
Perspectivas de futuro
Las tendencias futuras pueden implicar el desarrollo de sistemas más eficaces que emplean menores
cantidades de productos químicos, menos agua y menos energía para alcanzar el máximo
rendimiento. El uso de técnicas de la biotecnología moderna dará lugar a sistemas de enzimas con
efectos mejorados en diversas condiciones fisiológicas de temperatura y pH que resulta en una
mayor eficacia con menor consumo de energía y costos más bajos.
8
establecer una economía de base biológica y lograr una baja crecimiento verde de carbono [65].
Los microorganismos proporcionan una enorme cantidad de catalizadores con una amplia gama de
aplicaciones en diversas industrias, tales como alimentos, textiles, cuero, productos farmacéuticos y
muchos más. En el tratamiento de aguas residuales, las enzimas pueden ser utilizados para
desarrollar procesos de remediación que son ambientalmente menos peligrosos que las técnicas
convencionales. Su naturaleza versátil y la eficacia incluso en condiciones de reacción suaves les da
una ventaja sobre los métodos de tratamiento físico-químicas convencionales.
Las enzimas pueden actuar sobre los contaminantes recalcitrantes específicos para eliminarlos o
transformarlos a otros productos menos nocivos. Las características de un residuo dado también
pueden ser modificados por enzimas dejar los desechos más susceptible al tratamiento o ayuda en
bio conversión de material de desecho a productos de valor añadido.
9
CT 3 (2011) 173-186
SUMARIO
Algunas plantas establecen simbiosis con bacterias fijadoras de nitrógeno. Esta sim-
biosis proporciona beneficios durante la vida en común a ambos simbiontes. Las bacterias
pueden aprovechar directamente el nitrógeno del aire, originando compuestos absorbibles
y susceptibles de incorporarse a la composición del suelo o de los seres vivos. Dicha fija-
ción de nitrógeno se realiza en los nódulos radiculares, gracias a la catálisis del complejo
enzimático nitrogenasa.
Palabras clave: bacterias fijadoras de nitrógeno, simbiosis, nódulos radiculares, com-
plejo enzimático nitrogenasa.
SUMMARY
Some plants establish symbiosis with nitrogen-fixing bacteria. This symbiosis pro-
vides benefits throughout both symbionts’ life in common. Bacteria can take the nitrogen
directly from air, resulting absorbable compounds and capable of joining the soil or living
being composition. This nitrogen fixing takes place in root nodules, through the enzyme
complex nitrogenase catalysis.
Keywords: nitrogen-fixing bacteria, symbiosis, root nodules, enzyme complex nitro-
genase.
1. INTRODUCCIÓN
2 Cf. M. Javierre González (ed.), Gran Enciclopedia Universal, Vol. IX y XII, Madrid 2004,
383.
Bacterias simbióticas fijadoras de nitrógeno 175
N2 + 3 H2 → 2 NH3
6 www.unavarra.es (19/4/2011)
178 Sergio Calvo García
Casuarina, etc. Esta nodulación es de gran importancia para plantas leñosas peren-
nes, porque aporta nitrógeno al suelo en zonas pobres o repobladas.
Entre las plantas simbiontes destacaremos las leguminosas (Fabáceas) por
su importante papel en la evolución humana, proporcionando alimento (lentejas,
alubias y guisantes), forraje para la nutrición de animales (trébol, arveja, alfalfa...),
obtención de madera (Acacia, Leucaena) o para colonizar suelos pobres faltos de
nutrientes (retama, tojo, escoba…).
4. NÓDULOS RADICULARES
P y citrina, son una clase de metabolitos secundarios de las plantas. Son sinteti-
zados a partir de una molécula de fenilalanina y 3 de malonil-CoA. La estructura
base presenta un esqueleto C6-C3-C6 y se cicla gracias a una enzima isomerasa.
Los flavonoides constituyen una familia muy diversa de compuestos, debido a las
modificaciones y adicción de grupos funcionales a su estructura base. Un ejemplo
de bioflavonoides son el eriodictiol y la apigenina-7-O-glucósido; estos inducen
la nodulación de la agrobacteria Rhizobium leguminosarum. También los dos bio-
flavonoides: daidzeina y genisteina son inductores de los genes de la nodulación
de varias cepas de Bradyrhizobium japonicum. La daidzeina se encuentra en exu-
dados de soja. Además de flavonoides la planta también exuda compuestos tales
como aminoácidos y ácidos dicarboxílicos, que actúan como atrayentes nutritivos.
Daidzeina. Genisteina.
5. TUBO DE INFECCIÓN
Los nódulos presentan dos regiones. La primera es una región central con
células de gran tamaño invadidas por bacteroides10. En esta región, formada por
células vegetales, las bacterias modificadas que se encuentran en el interior de sus
citoplasmas se multiplican con rapidez. La segunda región es una zona meristemá-
tica externa. Aquí continuamente se agregan nuevas células permitiendo al nódulo
crecer. El crecimiento del nódulo alargará la vida útil del mismo, lo que permite al
nódulo fijar nitrógeno de forma indefinida. La zona meristemática presenta células
más pequeñas, ricas en peroxisomas y retículo endoplasmático. Las células meris-
temáticas no están invadidas por bacteroides. El nódulo a través del floema de la
raíz recibe fotosintatos originados en la planta a cambio del nitrógeno fijado. En
su periferia el nódulo está rodeado por una endodermis que está conectada direc-
tamente con la endodermis radicular. El diámetro de estas estructuras es de pocos
milímetros, varía de unas especies a otras entre 0,2 milímetros y 4 milímetros.
Existen dos tipos de nódulos. Por un lado, están los nódulos que presentan
un crecimiento limitado, denominados nódulos de crecimiento determinado, que
se caracterizan por presentar una estructura externa con apariencia esférica. Los
nódulos de crecimiento limitado no presentan células de transferencia. El otro tipo
son los denominados nódulos de crecimiento indeterminado o ilimitado. Estos
nódulos siempre poseerán células meristemáticas en división que permitirán al
nódulo crecer, sí presentan células de transferencia y las células presentan un ele-
vado número de vacuolas, principalmente las células periféricas.
10 Cf. E. Villalobos Rodríguez, Fijación simbiótica del Nitrógeno, San José (Costa Rica)
2006, 5.
182 Sergio Calvo García
11 www.rcbs.org (19/4/2011)
12 www.fisicanet.com (22/4/2011)
Bacterias simbióticas fijadoras de nitrógeno 183
No todas las especies vegetales son capaces de establecer simbiosis con una
bacteria. Esas especies que no establecen simbiosis absorben fuentes de nitrógeno
disponibles en el suelo, debido a que no realizan el mecanismo de fijación bioló-
gica. Normalmente absorben nitratos y en ocasiones amonio13. El nitrato puede ser
utilizado directamente, según entra en la célula, o acumularse en vacuolas, debido
a que en determinadas concentraciones es tóxico. Una vez en la planta, el nitrato
debe reducirse hasta amonio mediante una reacción en la cual no hay actividad
nitrogenasa. Hay una primera reacción en la cual el nitrato se reduce a nitrito. Esta
reacción está catalizada por el enzima nitrato reductasa. En la segunda reacción el
nitrito se convierte en amonio mediante la catálisis del enzima nitrito reductasa.
Finalmente, el amonio se transforma en los plastidios o en el citoplasma, en ami-
noácidos. El tejido vascular transportador de sabia bruta o xilema transporta poste-
riormente a los aminoácidos hasta los centros de consumo.
NO3– ----- R1 ----> NO2– ---- R2 ----> NH4+
R1: Nitrato reductasa. R2: Nitrito reductasa.
Para formar elementos más complejos se realiza una reacción entre un ami-
noácido y un alfa-cetoácido, es decir, una transaminación. El nitrógeno reducido
se asimila en una reacción catalizada por dos enzimas; la enzima glutamina sinte-
tasa y glutamato sintasa. En un primer paso, se forma glutamina y posteriormente
dos moléculas de glutamato. Una de las moléculas de glutamato se utiliza para
incorporar amonio y la otra es transferida directamente al xilema para su posterior
utilización como amida o ureidos. Entre las amidas destacan la asparragina y glu-
tamina, mientras que en los ureidos, la alantoina y ácido alantoico14.
Una cantidad excesiva de amonio o nitrato puede ser nociva para la planta. Por
esta razón la planta se ve sometida a un proceso de regulación génica y enzimática.
9. BIBLIOGRAFÍA
E. Villalobos Rodríguez, Fijación simbiótica del Nitrógeno, San José (Costa Rica) 2006.
F. Castillo Rodríguez, Biotecnología ambiental, Madrid 2005.
J. R. Peña, Cuaderno de Histología vegetal, Salamanca 2010.
L. Taiz-E. Zeiger, Fisiología Vegetal, Vol. I, Castellón de la Plana 2006.
M. J. Bonete Pérez y R. M. Martínez-Espinosa (coords.), Avances en el metabolismo del
Nitrógeno, Alicante 2009.
M. Javierre González (ed.), Gran Enciclopedia Universal, Vol. IX y XII, Madrid 2004.
M. Megías Guijo- A. J. Palomares Díaz- F. Ruiz Berraquero (eds.), Aportaciones a la
Biología de la fijación del Nitrógeno atmosférico, Sevilla 1991.
N. J. Fraume Restrepo, Abecedario Ecológico. La más completa guía de términos
ambientales, Bogotá 2006, 147.
www.fisicanet.com (22/4/2011)
www.rcbs.org (19/4/2011)
www.unavarra.es (19/4/2011)
Capitulo 2
Las lacasas: una enzima azul por Greener tecnologías alternativas en la detección y tratamiento
de contaminantes emergentes
Resumen: La contaminación continua de los cuerpos de agua en todo el mundo, por la presencia
de contaminantes emergentes, ha levantado una gran importancia en las últimas décadas. Este
grupo de contaminantes comprende una gran variedad de productos químicos, comprendiendo
asimiento House- y productos de cuidado personal, medicamentos humanos y veterinarios, así
como compuestos industriales. Si bien, los datos científicos han puesto de manifiesto las
posibles amenazas de los contaminantes emergentes para la salud pública y el medio ambiente,
todavía hay poca información disponible sobre la ecotoxicidad, la concentración y distribución
de estos compuestos, lo que hace que su regulación ecológica, la detección y el tratamiento muy
difícil. Por lo tanto, la búsqueda de tecnologías verdes para detectar y tratar los posibles
contaminantes del medio ambiente es fundamental para la protección de la salud humana y
ecológica. En este contexto, lacasas han ganado interés científico debido a su amplia gama de
sustrato, incluidos los contaminantes ambientales recalcitrantes, y su capacidad para utilizar
solamente el oxígeno como co-sustrato. Este trabajo explora el potencial de enzima lacasa como
elemento de biodetección y biorremediación, e identifica los inconvenientes que tienen que ser
excesiva llegado el fin de demostrar su viabilidad e implementar un proceso a gran escala.
Introducción:
Hasta la fecha, hay un problema ambiental crítico de contaminación de los recursos hídricos con
persistente, bioactivo, y sustancias bioacumulables, que causan efectos ecológicos potenciales
para la salud y. Algunos de estos productos químicos son los artículos de la vida diaria, tales
como el hogar y productos de cuidado personal, humano y medicamentos veterinarios, que se
utilizan ampliamente y constantemente liberan en los sistemas acuáticos eco por las actividades
humanas y las descargas directas de las plantas de tratamiento de aguas residuales (EDAR).
Estos grupos de sustancias se conocen como contaminantes emergentes y su detección y
eliminación es crucial debido a su alta persistencia y la toxicidad, incluso a concentraciones tan
bajas como ng / L. Es bien conocido que la mayoría de los contaminantes emergentes que pasan
a través WWTPs convencionales no se eliminan por completo. Así, el desarrollo de biosensores
resultó como un esfuerzo en la búsqueda de herramientas analíticas capaces de detectar este tipo
de contaminantes en concentraciones bajas con una alta especificidad. Sin embargo, una vez que
se han identificado los contaminantes, un proceso de descontaminación se tiene que realizar. En
este contexto, la biorremediación de los recursos hídricos por el uso de biocatalizadores, tales
como enzimas, se ha sugerido en los últimos años. Las enzimas son biomoléculas que tienen la
capacidad para mediar reacciones; No se requieren condiciones severas para su acción y,
normalmente, los subproductos formados durante la catálisis son benignos, lo que implica una
gran oportunidad para el uso de enzimas en la biorremediación. Actualmente, varias enzimas se
han utilizado en diferentes aplicaciones biotecnológicas e industriales; sin embargo, lacasas
enzimas han recibido una atención especial debido a su capacidad de oxidar una amplia gama de
sustratos, que acompaña a la reducción de oxígeno al agua como un subproducto de la reacción.
Las lacasas son capaces de oxidar, polimerizar, o transformar diversas sustancias recalcitrantes
en moléculas menos tóxicas; Por lo tanto, estas enzimas podrían ser biocatalizadores adecuados
para la biorremediación de agua. Sin embargo, varios inconvenientes tienen que ser superado
con el fin de implementar el uso de lacasas para el alivio de la contaminación, principalmente,
debido a los gastos elevados que implica una producción de enzimas a gran escala. estas
enzimas podrían ser biocatalizadores adecuados para la biorremediación de agua. Sin embargo,
varios inconvenientes tienen que ser superado con el fin de implementar el uso de lacasas para
el alivio de la contaminación, principalmente, debido a los gastos elevados que implica una
producción de enzimas a gran escala. estas enzimas podrían ser biocatalizadores adecuados para
la biorremediación de agua. Sin embargo, varios inconvenientes tienen que ser superado con el
fin de implementar el uso de lacasas para el alivio de la contaminación, principalmente, debido
a los gastos elevados que implica una producción de enzimas a gran escala.
lacasa
Lacasa Fuente:
Como enzimas oxidorreductasa, lacasas poseen la capacidad de oxidar diversos compuestos
fenólicos con la reducción concomitante de oxígeno. Estos biocatalizadores han sido
ampliamente encontrado como enzimas extracelulares e intracelulares en varios organismos,
microorganismos que abarcan (Bacillus), plantas (género Rhus), hongos (tales como géneros
Trametes, Cerrena, Ganoderma, Pycnoporus, y Coriolopsis), y los insectos (M. sexta ). En
especies de insectos, lacasas son responsables del proceso de Esclerotización; mientras que en
especies de Bacillus, que desempeñan un papel relacionado con la pigmentación, la patogénesis,
y el conjunto de las esporas resistentes a los UV. En las plantas, las lacasas se encuentran en el
xilema y, junto con las peroxidasas, están involucrados en la lignificación; Por otra parte, las
lacasas fúngicas desempeñan un papel en los procesos de deslignificación y humificación.
En una enzima, el sitio activo es el lugar donde el reconocimiento, la unión, y la oxidación del
sustrato se llevan a cabo. El sitio activo de las lacasas comprende cuatro núcleos de cobre, cada
uno de ellos se agrupan en tres clases diferentes de átomos de acuerdo tanto a su distribución en
la enzima (sitios T1, T2, y T3) y su naturaleza espectroscópico. Los sitios de T1 y T2 solamente
poseen un átomo de cobre; los dos átomos restantes se encuentran en el sitio de T3. Cada tipo
de cobre tiene características únicas: tipo 1 es responsable del color azulado emblemáticos de la
enzima, es una cavidad hidrófoba en la que se oxida el sustrato durante el mecanismo catalítico
de la lacasa; tipo 2 es incoloro, ya que se observó ninguna absorción en la región visible;
Mientras tanto, el tipo 3 exhibe un pico débil a 330 nm (Ba et al. 2013).
A pesar del alto potencial de lacasa con fines biotecnológicos e industriales, es importante
destacar que se necesita una gran cantidad de enzima para un proceso a gran escala. Según
Osma, el medio de cultivo representa el costo más alto a los gastos totales de producción de
lacasa; Mientras tanto, los costos de infraestructura son los más bajos. Por lo tanto, con el fin de
superar este problema, varios estudios se han centrado en el desarrollo de modificaciones
genéticas estables de microorganismos con el fin de lograr la expresión de genes para lacasa; (2)
la optimización y reducción de los costos de los medios de cultivo utilizando desechos agrícolas
como sustratos de crecimiento baratas (que también ayuda a aliviar la contaminación del medio
ambiente); (3) buscar nuevas cepas de microorganismo capaz de producir lacasa. Ramírez
Cavazos probado una cepa de Pycnoporus sanguineus, nativa del norte de México, usando un
jugo de tomate como medio de cultivo, lo que resulta en el título de lacasa de 143.000 U / L.
Fenice (2003) obtuvo una producción de 4.600 U / L en el agua residual de oliva-molino.
Mientras tanto, Songulashvili (2007) informó de la producción de lacasa utilizando desechos de
alimentos, tales como cáscaras de mandarina, el salvado de trigo y el salvado de soja, kiwis,
plumas de pollo, y etanol, obteniendo una máxima actividad de la lacasa de 93,000-97,000 U /
L, luego de la fermentación sumergida de salvado de trigo y el salvado de soja por Ganoderma
spp. Varios agro-residuos tales como mandarina y cáscara de plátano son sustratos ricos en
hidratos de carbono de lignina y ácidos orgánicos, que podrían actuar como inductores para
estimular la producción de lacasa. En este contexto, diversos estudios han reportado el uso de
soportes sólidos tales como las semillas de uva, piel de plátano, y cacahuete como sustratos de
crecimiento para hongos. Sin embargo, el uso de estos sustratos complejos tiene como
desventaja la utilización posterior / purificación de la lacasa después de la fermentación; por lo
tanto se requiere el desarrollo de protocolos robustos que permiten el uso de enzimas en bruto
(sin proceso de purificación) en aplicaciones biotecnológicas.
Los disruptores endocrinos son compuestos que mimetizan la acción de las hormonas en los
organismos, haciendo que la alteración del sistema endocrino, que se ha relacionado con
trastornos sexuales, cáncer, e incluso enfermedades crónicas. Hoy en día, la presencia de
productos químicos que exhiben alteraciones hormonales y están involucrados en la elaboración
de plásticos y productos para el hogar se ha informado ampliamente, por ejemplo, agentes
tensioactivos, agentes ignífugos, parabenos, y plastificantes. Mientras tanto, los productos
químicos presentes en productos de cuidado personal y considerados como contaminantes
emergentes abarcan desinfectantes (triclosan), agentes de conservación, fragancias (Celestolide,
tonalide, galaxolide), y pantallas de UV (octil-dimetil-PABA, octil-methoxycinnamte,
homosalato). Por otro lado, los compuestos farmacéuticos, como contaminantes emergentes,
abarcar medicamentos humanos y veterinarios que se han encontrado ampliamente en los
suministros de agua, tales como antibióticos, fármacos anti-inflamatorios no esteroides, y los
bloqueadores beta. Numerosos estudios han informado de la presencia de productos de cuidado
personal, compuestos farmacéuticos, y disruptores endocrinos en varios suministros de agua a
concentraciones alarmantes. Teijon (2010) informaron un estudio de monitoreo de compuestos
farmacéuticos en el agua muestreada de una PTAR y del acuífero que se recarga por la descarga
de esta PTAR, lo que resulta en la detección de estos productos químicos en concentraciones de
g / L. Un gran número de protocolos analíticos se han desarrollado para la detección de este tipo
de contaminantes, principalmente mediante técnicas de cromatografía y espectroscopía, ya que
estos métodos son extremadamente precisos y capaz de detectar concentraciones muy bajas; sin
embargo, que requieren complicados pretratamiento de la muestra, personal capacitado, los
altos costos de operación, y carecen de aplicabilidad en el lugar (Teijon et al., 2010). En este
contexto, la necesidad de instrumentos analíticos portátiles, capaces de vigilancia sobre el
terreno con alta selectividad, sensibilidad y tiempos de ensayo cortos, ha promovido el diseño
de nuevos dispositivos, tales como biosensores.
Un biosensor es un instrumento capaz de medir una molécula diana específica en una muestra,
tomando ventaja de su afinidad hacia una bio-elemento específico de reconocimiento
(bioreceptores, inmunorreactivos, enzimas). Hay tres elementos esenciales que comprenden un
biosensor (Fig. 2.2). El bioreceptor interactúa específicamente con el analito presente en la
muestra, produciendo una reacción bioquímica derivada de esta interacción, que es amplificada
y convertida en señales eléctricas cuantificables. El transductor está en contacto íntimo con la
bioreceptor y es responsable de la traducción de la prueba bioquímica en una señal eléctrica. El
uso de enzimas como bioreceptores se ha empleado ampliamente en biosensor debido a su
estabilidad y más fácil el control de sus propiedades de reconocimiento en comparación con
otras biomoléculas tales como anticuerpos o células. En este contexto, los enzimas oxidasa
(tirosinasa, peroxidasa, y lacasa) aparecen como buenos candidatos debido a su capacidad para
catalizar reacciones en las que se produce la transferencia de electrones, que puede ser utilizado
como el principio de la transducción. enzimas lacasa tienen algunas ventajas sobre las otras
oxidasas, que los hacen muy interesante para aplicaciones de biosensores; su termoestabilidad,
versatilidad para reaccionar con una amplia gama de sustratos, no se necesitan cofactores para
llevar a cabo la catálisis y la formación de agua como subproducto, son algunas de estas
ventajas. lo que las hace muy interesantes para aplicaciones de biosensores; su termoestabilidad,
versatilidad para reaccionar con una amplia gama de sustratos, no se necesitan cofactores para
llevar a cabo la catálisis y la formación de agua como subproducto, son algunas de estas
ventajas. lo que las hace muy interesantes para aplicaciones de biosensores; su termoestabilidad,
versatilidad para reaccionar con una amplia gama de sustratos, no se necesitan cofactores para
llevar a cabo la catálisis y la formación de agua como subproducto, son algunas de estas
ventajas.
Principios de transducción
En este contexto, Mei (2015) preparó una mezcla de paladio y cobre para cubrir un soporte de
óxido de grafeno con el fin de construir una plataforma para la inmovilización lacasa; la
obtención de un límite de detección de 2,0 mM para catecol. Según Rodríguez-Delgado (2015),
los métodos amperométricos son altamente empleados en biosensores basados lacasa; Mientras
tanto, los métodos potenciométricos conductometricos y no están muy a menudo se emplean
para este uso.
Del mismo modo, Cabana (2007) informó de la actividad no estrogénica en los productos de
reacción mediante la catálisis de bisfenol A, triclosán, y nonilfenol empleando Coriolopsis
lacasa polyzona. La eliminación de los contaminantes que emerge de los suministros de agua
usando lacasa podría lograrse dentro de varios sistemas: (1) la enzima libre; (2) enzima
inmovilizada; y (3) células de los caldos de cultivo. Varios estudios han reportado el uso de
lacasas gratuitas para la eliminación de contaminantes emergentes. Yang et al. (2013)
informaron de 27% de la eliminación diclofenac. La eliminación total de estrona, 17β-estradiol,
estriol, y 17α-etinilestradiol, y oxibenzona se logró mediante Trametes versicolor lacasa. Casi la
eliminación completa de 2,4-diclorophenol fue observada por lacasa libre a pH ácido, las
temperaturas alrededor de 30 y 50 ° C, y el uso de concentraciones elevadas de enzima.
El uso de mediadores también es común durante degradaciones enzimáticas; estos com- puestos
son moléculas de pequeño tamaño que pueden ampliar la capacidad de una enzima para
reaccionar hacia sustratos no comunes; también son estables y reutilizable por varios ciclos.
ABTS, 1-hidroxi-benzotriazol (HBT), nitroso-2-naftol- ácido 2,6-disulfónico (NNDS),
siringaldehído, 4-acetilamino-TEMPO TEMPO 4-hidroxi-, ácido violuric (VIO), y p-cumárico
ácido son algunos de los mediadores más ampliamente empleadas para la catálisis lacasa.