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Le proteine mediano praticamente tutti i processi che hanno luogo nelle cellule e svolgono un numero
enorme di funzioni.
Le proteine sono le biomolecole più abbondanti, presenti in tutti i tipi di cellule e in tutte le frazioni
subcellulari.
Le proteine di qualsiasi organismo, dai batteri più semplici agli esseri umani, sono formate sempre dalla
stessa serie di venti amminoacidi.
Per generare una particolare proteina, gli amminoacidi vengono legati covalentemente in una caratteristica
sequenza lineare.
Gli enzimi sono i composti più vari e specializzati e questi costituiscono una delle chiavi per la
comprensione della chimica della vita poiché sono i catalizzatori di praticamente tutte le reazioni cellulari.
GLI AMMINOACIDI
GRUPPI R POLARI, NON CARICHI: I gruppi R di questi amminoacidi sono molto più solubile in ac qua, o più
idrofilici, di quelli degli amminoacidi non polari, perché contengono gruppi funzionai che formano legame
idrogeno con l’acqua; La cisteina è facilmente ossidabile e forma, mediante un legame covalente, un
dimero chiamato cistina, in cui i due monomeri sono uniti da un ponte disolfuro (stabilizzano la struttura di
alcune proteine)
GRUPPI R CARICHI POSITIVAMENTE (BASICI): L’istidina p l’unico amminoacido delle proteine ad avere una
catena laterale ionizzabile con un pKa vicino alla neutralità e in molte reazioni catalizzate da un enzima i
residui di His facilitano la reazione agendo da donatori o da accettori di protoni.
I PEPTIDI E LE PROTEINE
I PEPTIDI SONO CATENE DI AMMINOACIDI
Due molecole di amminoacido posso unirsi covalentemente mediante un legame ammidico, chiamato
legame peptidico, formando un dipeptide.
LEGAME PEPTIDICO: Questo legame si genera per eliminazione di una molecola di acqua (deidratazione)
dal gruppo α-carbossilico di un amminoacido e dal gruppo α-amminico dell’altro.
Struttura Primaria: La definizione di tutti i legami covalenti che uniscono tra loro i vari amminoacidi in una
catena polipeptidica. L’elemento principale della struttura primaria di una proteina è la sequenza degli
amminoacidi che la compongono.
Struttura Secondaria: Se riferisce a particolari organizzazioni stabili di brevi sequenze amminoacidiche, che
danno origine a profili strutturali ricorrenti (α-elica e foglietto-β)
Struttura Terziaria: Descrive tutti gli aspetti tridimensionali di un polipeptide.
Struttura Quaternaria: Se una proteina è costituita da due o più subunità polipeptidiche, la sua struttura è
definita quaternaria.
LE SEQUENZE PROTEICHE POSSONO FAR LUCE SULLA STORIA DELLA VITA SULLA TERRA
Per una data proteina, i residui amminoacidici essenziali per l’attività sono rimasti gli stessi durante tutta
l’evoluzione, invece i residui meno importante per la funzione possono variare nel tempo, cioè un
amminoacido può essere stato sostituito da un altro. Sono questi residui variabili che possono fornire
informazioni sull’evoluzione delle proteine.