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Facultad de Medicina
Cátedra de Bioquímica
REGULACION DE LA EXPRESION
GENETICA
Brandan, Nora
Profesora Titular. Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE.
Juaristi, Julián
Profesor Titular. Cátedra de Bioquímica. Carrera de Enfermería. Facultad de Medicina.
UNNE.
Aguirre, Victoria
Profesora Adjunta. Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE.
Romero Benítez, Margarita
Jefa de Trabajos Prácticos. Cátedra de Bioquímica. Facultad de Medicina. UNNE.
INTRODUCCION
NIVELES DE REGULACION DE LA EXPRESION PROTEICA EN
EUCARIONTES
1) CONFORMACION Y ESTRUCTURA DEL ADN
Compactación diferencial de la cromatina
Modificaciones covalentes del ADN
2) CONTROL TRANSCRIPCIONAL DE LA EXPRESION GENETICA
Regulación en CIS
Regulación en TRANS
PROTEINAS DE UNION AL ADN: CARACTERISTICAS
ESTRUCTURALES
1- MOTIVO HELICE–GIRO-HELICE (HLH: Helix- loop-helix )
2-DEDOS DE ZINC
3- CIERRE DE LEUCINA (Leucine zipper)
Otros modos de control transcripcional de la expresión genética
3)- CONTROL POST-TRANSCRIPCIONAL DE LA EXPRESION GENETICA
SITIOS DE POLIADENILACION ALTERNATIVA:
SPLICING ALTERNATIVO:
EDICIÓN DEL ARN (Mutagénesis dirigida del ARN):
TRANSPORTE DEL ARN AL CITOPLASMA:
4)- CONTROL TRADUCCIONAL DE LA EXPRESION GENETICA
5)- CONTROL POST- TRADUCCIONAL DE LA EXPRESION GENETICA
Proteólisis limitada: poliproteínas
Control sobre la estabilidad de las proteínas
BIBLIOGRAFIA
2002
INTRODUCCION
Regulación en CIS
Promotores
El paso inicial de la síntesis de los tres tipos de ARN es la ubicación de las ARN
polimerasas junto a una secuencia del ADN a la altura del denominado promotor del
gen a ser transcripto. La ARN polimerasa I sintetiza los ARN r (excepto el 5S), la de
tipo II sintetiza los ARN m y algunos ARN sn involucrados en el proceso de corte y
empalme del transcripto primario (splicing), mientras que la ARN polimerasa III
sintetiza el ARN r 5S y los ARN t.El más complejo de los procesos regulatorios es el
que comprende a los genes de clase II o codificantes de ARN m. Casi todos los
genes codificantes de proteínas contienen promotores basales de dos tipos y un
número variable de dominios regulatorios transcripcionales.
El promotor es una secuencia que define el sitio de iniciación de la
transcripción del ARN.
Los promotores más frecuentes son los de tipo CCAAT y TATA , denominados
motivos o cajas por su alta conservación evolutiva.
La caja TATA está localizada 20-30 pb corriente arriba del sitio de inicio de la
transcripción . Numerosas proteínas identificadas como TF IIA,B,C, etc. (factores
regulatorios de la ARN polimerasa II) interaccionan con la caja TATA. El promotor
CCAAT reside 50-130 pb corriente arriba del sitio de inicio transcripcional. La
proteína denominada C/EBP (CCAAT-box /enhancer/binding/protein) se une a esta
secuencia. Otra secuencia regulatoria incluye a la caja GC.
Si bien los promotores están preferentemente localizados corriente arriba (5’) del
inicio transcripcional, algunos pueden ubicarse corriente abajo (3’) o bien ser de
tipo intragénicos. El número y tipo de eleemntos regulatorios varían según cada
ARNm. La naturaleza de los promotores y la combinatoria de las proteínas
interactuantes con ellos es uno de los principales mecanismos de regulación en los
genes de tipo inducibles.
Existen además secuencias del ADN que pueden localizarse corriente arriba o abajo
del gen a regular situadas a miles de pares de bases con respecto al promotor. Las
zonas de ADN sobre las cuales se ejercen acciones activadoras son llamadas
potenciadoras o aumentadoras (enhancers en inglés). En términos generales
una secuencia regulatoria potenciadora o enhancer regula la frecuencia
con la que se realiza el proceso transcripcional.
Para un mismo gen pueden existir varias secuencias regulatorias. También existen
reguladores de acción opuesta (silenciadores o amortiguadores de la transcripción).
La explicación más simple del fenómeno regulatorio a distancia es propone que la
molécula de ADN se dobla en asa para permitir la aproximación de estas zonas
alejadas de la doble hélice y ubica a la proteína activadora unida al “enhancer".
Regulación en TRANS
Factores transcripcionales:
2-DEDOS DE ZINC
SPLICING ALTERNATIVO:
Es un mecanismo muy difundido, que permite que un solo gen pueda codificar para
más de una proteína. En muchos de estos casos se conoce más de una vía para
procesar el transcripto primario obteniendo proteínas estructural y funcionalmente
diferentes o bien isoformas de una proteína. Los cortes sobre el RNAhn deben
producirse con absoluta precisión. Puede ocurrir que uno más exones sean
removidos (dando una proteína más corta), o que uno o más intrones no sean
removidos (dando una proteína más larga). Se conoce una familia de 6 proteínas
llamadas ASF (factores de splicing alternativo) responsables de reconocer y
seleccionar los lugares para los cortes alternativos, poseen la característica de
contener dominios ricos en serina y arginina por lo que se las llama también
proteinas SR. El mecanismo por el cual la célula selecciona los sitios no está claro.
Los siguientes son algunos ejemplos de genes cuya expresión puede regularse por
splicing alternativo:
la α tropomiosina: esta se codifica a partir de un mismo gen pero con una
secuencia primaria diferente a partir de ARNm diferentes específicos en 7
tejidos.
el gen de la tirosinhidroxilasa humana: Esta enzima expresa 4 isoformas
diferentes, es decir similar actividad biológica con diferentes propiedades, en
este caso se expresan todas en médula suprarrenal y cerebro. El gen contiene
14 exones, al cortar y empalmar de diferente manera, la isoforma 2 tiene 12
nucleótidos más que la isoforma 1, la isoforma 3 tiene 81 más y la isoforma 4
tiene 93 nucleótidos más que la isoforma 1.
Los RNAm de las cadenas livianas de inmunoglobulinas sufren corte y
empalme alternativo, esto contribuye, como veremos en inmunología, a
ampliar el repertorio de anticuerpos, es decir a reconocer más antígenos
(elementos no propios) a los que pueda ser expuesto el organismo. Así como
permite mejorar la respuesta inmune a un antígeno en particular.
Un mismo gen como el que codifica para la hormona calcitonina –
interviniente en la regulación de los niveles de Calcio plasmático- al ser
expresado en las células parafoliculares de la tiroides cuando se expresa en
las neuronas hipotalámicas produce una proteína llamada CGRP (Producto
relacionado al gen de calcitonina) que actúa como neurotransmisor.
La fibronectina que cuando es sintetizada por el fibroblasto y liberada a la
matriz extracelular expresa dos intrones que no son expresados cuando la
proteína es sintetizada en los hepatocitos y secretada al plasma.
Algunos genes codificantes para factores de transcripción en células en
etapas del desarrollo pueden ser ensamblados alternativamente, la
producción de una u otra variante determinará la vía de diferenciación
adoptada por la célula.
En la mayor parte de los casos, la diferencia entre los productos de splicing
alternativo sobre un mismo ARN difieren en regiones claves que pueden afectar a la
proteína en propiedades como: la compartimentalización, el tipo de ligandos al que
se unirá, la afinidad con que lo hará y si es una enzima su actividad catalítica.
CONTROL GENERAL DE LA TRADUCCIÓN: Todos los ARNm celulares tienen cap con
la guanosina metilada y esa estructura aumenta la traducción. Cuando por alguna
razón de disposición espacial del extremo 5’ del ARN el cap no queda disponible
para su interacción el factor de iniciación Ife4E la traducción disminuye. Puede
controlarse también la actividad de los factores de iniciación: IFe2B, IFe3, IFe4B e
IFe4F. La actividad de estos factores se controla por fosforilación. Esta fosforilación a
su vez responde a diversos estímulos que pueden ser fisiológicos (factores
activadores de cascadas de quinasa) o no ( desnutrición severa, hiperosmolaridad,
infección viral o shock térmico)
El IFe2B parece ser entre ellos el más importante desde el punto de vista del control
de la traducción. En el caso particular del IFe2B es la subunidad α la susceptible de
ser fosforilada por una proteinquinasa independiente de AMPc que responde a
señales de estrés y se inactiva evitando la formación del complejo 40S.
El IFe4F puede ser fosforilado por Insulina y Cascadas de quinasa activadas por
mitógeno en este caso la fosforilación activa al factor promoviendo un aumento en
la traducción. Existen 2 proteínas (4E-BP1 y 4E-BP2) que se ligan al IFe4F
inactivándola. La insulina y los factores de crecimiento pueden fosforilarlas
liberando al IFe4F y dejando disponibles los sitios de fosforilación para potenciar la
estimulación de la actividad del factor y con ello la síntesis de proteínas.
El péptido naciente del ribosoma puede sufrir diversas modificaciones acorde con su
función biológica posterior incluyendo, remoción del extremo amino terminal,
agregado se secuencias señal para exportación, acilaciones, metilaciones,
sulfataciones, glicosilaciones, prenilaciones, modificaciones dependientes de
vitamina C, carboxilaciones dependientes de vitamina K –como en el caso de los
factores de coagulación- o bien clivajes post-traduccionales para tornarse activas
(lo cual es un modo de controla su actividad como en el caso de algunas enzimas y
hormonas peptídicas)
Todas estas modificaciones pueden ser controladas por señales internas (pH
intracelular, actividad de chaperonas moleculares) o externas (cascadas de quinasa
que controlan fosforilaciones) Cualquier problema en estas modificaciones post-
traduccionales puede desencadenar alteraciones en la fisiología de la célula. La
actividad post-traduccional se controla a través de la regulación de la actividad de
las enzimas intervinientes en los procesos citados.
Cualquiera sea la estructura y función de la proteína es indispensable un correcto
plegamiento post-traduccional de los péptidos ya que la formación de estructuras
2º, suprasecundarias y 3º, así como las oligomerizaciones serán las responsables de
que la proteína sea funcional.
BIBLIOGRAFIA
1. Murray, Granner, Johnes. Bioquímica de Harper. 15º Edición. (2002).
2. Roscovsky, R. Bioquímica. (1999).
3. Karp, G. Biología Celular. (2000).
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5. Cox T.M., Sinclair D. Biología Molecular en Medicina. Ed. Médica
Panamericana. (1998).
6. Balcavage W.X., King M.W., Appleton, Lange. Biochemistry. 1ª Ed. (1995).