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Bioquímica y Biología Molecular Seminario de Bioquímica

Unidad Temática 5: Bioenergética y Oxidación Biológica

1.- Calcule la variación de energía libre estándar de las siguientes reacciones metabólicamente importantes,
catalizadas por enzimas a 25ºC y pH 7,0 a partir de las constantes de equilibrio dadas.
Aspartato
aminotransferasa
Glutamato + oxalacetato aspartato + α-cetoglutarato K’eq = 6.8

Triosa fosfato
isomerasa
Dihidroxiacetona fosfato gliceraldehído-3-fosfato K’eq = 0.0475

Fosfofructoquinasa
Fructosa-6-fofato + ATP Fructosa-1,6-bifosfato + ADP K’eq = 254

2. Calcule las constantes de equilibrio K’eq para cada una de las siguientes reacciones a pH 7,0 y 25ºC.
Glucosa-6-
fosfatasa
Glucosa-6-fosfato + H2O glucosa + Pi ∆G’O = -13.8 kJ/mol

Β-galactosidasa
Lactosa + H2O glucosa + galactosa ∆G’O = -15.9 kJ/mol

Fumarasa
Malato fumarato ∆G’O = 3.1 kJ/mol

3. Los cambios de energía libre en condiciones intracelulares difieren considerablemente de los determinados en
condiciones estándar. El ΔG´o para la hidrólisis del ATP en ADP y Pi es de –30,5 kJ/mol. Calcúlese el valor de ΔG
real para la hidrólisis del ATP en un eritrocito humano a pH 7 y 25ºC que contiene ATP 2,25 mM, ADP 0,25 mM y
Pi 1,65 mM.

4.- Considere la interconversión siguiente, catalizada por la fosfohexosa isomerasa, que tiene lugar en la
glucolisis y en la gluconeogénesis.
Fructosa-6-fosfato ⇄ Glucosa-6-fosfato K’eq = 1.97
O
¿Cuál es el ∆G’ para la reacción?
Si se ajusta la concentración de fructosa-6-fosfato a 1,5 M y la de glucosa-6-fosfato se ajusta a 0,5M, ¿cuál
será el valor de ∆G’?
Si se ajusta la concentración de fructosa-6-fosfato a 0,5 M y la de glucosa-6-fosfato se ajusta a 1,5M ¿cuál
será el valor de ∆G’?

5.- La fosforilación de la glucosa a glucosa-6-fosfato por la hexoquinasa es el paso inicial en el catabolismo de la


glucosa. La fosforilación directa de la glucosa por el Pi se describe mediante la ecuación:
Glucosa + Pi → Glucosa-6-fosfato + H2O ∆G’O = 13.8 kJ/mol

a) Calcule la constante de equilibrio de la reacción anterior. En el hepatocito de rata las concentraciones


fisiológicas de glucosa y Pi se mantienen a aproximadamente 4.8 mM ¿Cuál es la concentración de
equilibrio de la glucosa-6-fosfato obtenida por la fosforilación directa de la glucosa por el Pi?
¿Representa esta reacción una vía metabólica razonable para el catabolismo de la glucosa? Explíquelo.
b) En principio, al menos una forma de aumentar la concentración de glucosa-6-fosfato es impulsar la
reacción de equilibrio hacia la derecha mediante el aumento de las concentraciones intracelulares de
glucosa y Pi. Suponiendo una concentración fija de Pi de 4.8 mM ¿qué valor habría de alcanzar la
concentración intracelular de glucosa para tener una concentración de equilibrio de glucosa-6-fosfato
de 250 µM (concentración fisiológica normal). ¿Sería esta ruta fisiológicamente razonable puesto que la
solubilidad máxima de la glucosa es inferior a 1M?
c) La fosforilación de la glucosa en la célula está acoplada a la hidrólisis de ATP
Glucosa + Pi → Glucosa-6-fosfato + H2O ∆G’O = 13.8 kJ/mol
ATP + H2O → ADP + Pi ∆G’O = -30.5 kJ/mol
Glucosa + ATP → glucosa-6-fosfato + ADP ∆G’O = -16.7 kJ/mol
Calcular la K’eq a 25ºC de la reacción global.
Cuando se lleva a cabo la fosforilación de la glucosa dependiente de ATP., ¿Qué concentración de glucosa
es necesaria para conseguir una concentración intracelular de 250 µM cuando las concentraciones de ATP
y ADP son 3,38 mM y 1,32 mM, respectivamente? ¿Proporciona este proceso de acoplamiento una ruta
factible, el menos en principio, para la fosforilación de la glucosa en la célula? Expliquelo.

6.- Los ácidos grasos se activan en las células mediante las siguientes reacciones:
R-COOH → R-CO-S-CoA ΔGᴼ´= +7,5 kcal/mol
ATP → AMP + PPi ΔGᴼ´= - 7,7 kcal/mol.

R-COOH + SH-CoA +ATP → R-CO-S-CoA + AMP + PPi

a) Calcular el ΔGᴼ´ y la constante de equilibrio de la activación de los ácidos grasos.


b) La reacción de activación de los ácidos grasos se ve favorecida por la presencia de la enzima pirofosfatasa
que hidroliza el pirofosfato (PPi) formado a 2 fosfatos inorgánico (Pi)
R-COOH → R-CO-S-CoA ΔGᴼ´= +7,5 kcal/mol
ATP → AMP + PPi ΔGᴼ´= - 7,7 kcal/mol.
PPi → 2Pi ΔGᴼ´= - 6,9 kcal/mol
R-COOH + SH-CoA +ATP → R-CO-S-CoA + AMP + 2Pi

c) Calcular el ΔGᴼ´ y la constante de equilibrio de la activación de los ácidos grasos en presencia de


pirofosfatasa e indicar la importancia de esta enzima en la reacción global de activación de los ácidos grasos.

7.- Determine cuál de las siguientes reacciones procederá tal como está escrita:
CH3-CH2OH + 2cit b (Fe3+) → CH3CHO + 2 cit b (Fe2+) + 2 H+
Lactato + NAD+ → Piruvato + NADH +H+
NAD+ + H2O→ ½O2 + NADH + H+

Potenciales de reducción estándar:


(NAD+/NADH) = - 0,32 V
(½O2/ H2O) = 0,82 V
(Piruvato/Lactato) = - 0,19 V
(CH3CHO/CH3-CH2OH) = - 0,20 V
(cit b (Fe3+)/cit b (Fe2+)) = 0,075 V

8.- El complejo I de la cadena respiratoria mitocondrial promueve la siguiente serie de reacciones de


oxidoreducción, en las que Fe3+ y Fe2+ representan los centros ferrosulfurados, Q es la coenzima Q y E es el
enzima:
NADH + H+ +E-FMN + E-FMN → NAD+ + E-FMNH2
E-FMNH2 + 2Fe3+ → E-FMN + 2Fe2+ + 2H+
2Fe2+ + 2H++ Q → 2Fe3+ + QH2
Para cada una de las tres reacciones catalizadas por el complejo I, identifique:
a) El dador electrónico
b) El aceptor electrónico
c) El par redox conjugado
d) El agente oxidante

9.- En la cadena de transporte electrónico hay descenso de energía libre relativamente amplio. Esa energía libre
se utiliza para la síntesis de ATP. Calcular la ∆G’O cuando pasan, en condiciones estándar, dos electrones por
cada uno de estos complejos:
Complejo I: NADH + H+ +CoQ → NAD+ + CoQH2
Complejo II: FADH2 + CoQ → FAD + CoQH2
Complejo III: CoQH2 + 2cit. c ox. (Fe3+) → CoQ + 2Cit c red (Fe2+)
Complejo iV: 2Cit c red (Fe2+) + 2H+ + ½O2 → 2cit cox (Fe3+) + H2O

Potenciales de reducción estándar en la siguiente tabla


(NAD+/NADH) = - 0,32 V
(CoQ/CoQH2) = 0.045 V
(FAD/FADH2) (unido a la enzima) ≈ 0 a -0.30 V
(citocromo c (Fe3+)/citocromo c (Fe2+) = 0.25 V
(½O2/ H2O) = 0,82 V

10.- Todas las deshidrogenasas que intervienen en la glicolisis y el ciclo del ácido cítrico utilizan NAD + (E’o para
NAD+/NADH = - 0,32 V) como aceptor electrónico, excepto la succinato deshidrogenasa que utiliza FAD unido
covalentemente (E’o para FAD/FADH2 en este enzima = 0,050 V). Sugiera por qué el FAD es un receptor
electrónico más adecuado que el NAD+ para en la deshidrogenación del succinato basándose en los valores de
E’o del par fumarato/succinato (E’o = 0.031 V), el par NAD+/NADH y el par FAD/FADH2 de la succinato
deshidrogenasa

11.- La rotenona inhibe el flujo electrónico a través de la NADH-Q oxidorreductasa. La antimicina A bloquea el
flujo electrónico entre los citrocromos b y c1. El cianuro bloquea el flujo de electrones que va desde la
citocromo oxidasa al O2. Predecir el estado de oxidación-reducción relativo de cada uno de los siguientes
componentes de la cadena respiratoria al tratar mitocondrias con estos inhibidores: NAD+; NADH-Q
oxidorreductasa; citocromo c1; citocromo c; citocromo a.

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