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Bases de Microbiología

Prof. Pablo A. Araujo G. Ph.D.

paaraujo@uce.edu.ec
Lecturas preliminares

• Cap. 2 The basics of Biology . An Engineer´s


Perspective - M.Schuler F. Kargi – 2002

• Cap. 1. Rittmann McCarty 2001 - Basis of


Microbiology
¿qué es lo que veremos?

• ¿Cómo están clasificados los microorganismos?


(Taxonomía)

• ¿Cómo se ven los microorganismos? (Morfología)

• ¿Cómo se reproducen los microorganismos?

• Las reacciones bioquímicas que ocurren


(Metabolismo)
¿qué es lo que veremos?
• La clasificación general de los microorganismos
basándonos en su función en el medio ambiente.
(Grupos tróficos).

• ¿Cómo la información referente a la estructura y


funciones de los microorganismos es transmitida y
modificada (Genética)

• La interacción entre los microorganismos y su entorno.


La célula
¿qué es?

• Es el bloque fundamental de la vida

• Entidad separada de otras células y del medio


ambiente.

• Un complejo sistema de reacciones químicas


¿cómo se diferencia?

• Capacidad de crecer y reproducirse


• Solas pueden producir otra célula identica a si mismas.

• Son altamente organizadas y muy selectivas de lo


que cruza por su membrana.
• Son de baja entropia comparada con el medio ambiente.
¿cómo se diferencia?

• Están compuestas por los elementos químicos


principales (C, N, O, H y S).

• Se auto-alimentan.
• Toman elementos, electrones y energia del medio
ambiente para crear, reproducirse y mantenerse a si
mismas.

• Reacciones = Metabolismo
¿como esta organizada?
• Físicamente organizada = Procesos “vida”

• Componentes esenciales:
• La membrana celular
• La pared celular
• El citoplasma
• Los cromosomas
• Los ribosomas
• Las enzimas
árbol filogenético de la vida
Filogenia .. Clasificación

• ¿cromosomas dentro o fuera del núcleo?


• Fuera (sin núcleo) = Procariotas

• Dentro (con núcleo) = Eucariotas

• Unicelulares = Bacteria y Arquea (eucariotas)

• Uni y Policelulares = Eucariotas (plantas y


animales)
.. Seguimos clasificando …

• Procariotas = microorganismos (microscopio)

• Eucariotas = algunos si y otros no


microorganismos (algas microscópicas y
protozooarios) hasta ( mamíferos, plantas, árboles)
Algunas diferencias …
Animal vs. vegetal
Algunos organelos … comunes

• Mitocondria = Metabolismo oxidativo

• Retículo endoplasmático = Síntesis de proteínas

• Complejo de Golgi = Secretan y desplazan nuevas


proteínas

• Núcleo = Genética – DNA - Cromosomas


Algunos organelos … no comunes

• (animales) = Lisosomas = cuerpos digestivos

• (vegetales) = cloroplastos = fotosíntesis

• (vegetal) = vacuola (llena de agua)

• (animales) = membrana plasmática

• (vegetales) = pared celular


Diferenciación …

• Cambios en la forma y su función

• Humano = actúan diferente depende de su función.

• Pueden interactuar con otras = señales químicas.


• Las hijas pueden actuar diferente que los padres.

• Desarrolla rnuevas “habilidades”


Ideas sobre tamaño
• Tamaño celular no relacionado con tamaño organismo
(elefante y pulga).

• Proporción superficie / volumen

• Reacciones bioquimicas = volumen considerable

• Intercambio de moléculas con su entorno

• Célula grande = poca superficie

• Célula pequeña = mucha superficie


Taxonomia y filogenia

• Taxonomia = ciencia de la clasificación.

• Bases = Propiedades físicas observables (PFO).

• PFO = involucra:
• Fenotipo celular (apariencia = morfología)

• Como interactua con tintes (manchas)

• Habilidad para convertir un químico en otro (Transformación)


Taxonomia y filogenia

• Filogenia

• Clasificación basada en características genéticas.


• DNA = material hereditario de las células.

• RNA = involucrado en síntesis de proteínas.

• Basada en la historia evolutiva


Taxonomia y Filogenia

• Unidad básica taxonómica = Especies

• Muchas similitudes = Géneros

• Muchos géneros = Familias

• Escherichia coli / E.coli

• Código Internacional de nomenclatura de bacterias


Característica Bacteria Arqueobacteria Eucariota

Membrana en el
Ausente Ausente Present
núcleo

Acido Murámico
Pared celular Acido Murámico Presente Acido Murámico Ausente
Ausente

Fotosíntesis Si No Si
Metanogénesis No Si No
Reducción de S a H2S Si Si No
Nitrificación Si No No
Desnitrificación Si Si No
Fijación de Nitrógeno Si Si No

Síntesis de Poly-Beta-
Si Si No
Polihidroxialcanoato

Sensibilidad al
Si No No
Cloramfenicol

Sensibilidad de
No Si Si
ribosomas a difteria
Ácido Murámico
Clorofila
Metanogénesis

CO2 + 4 H2 → CH4 + 2 H2O

CH3COOH → CH4 + CO2


Metanogénesis
Metanogénesis
Reducción S hacia H2S
Nitrificación – Desnitrificación
Síntesis de PHA
Cloroamfenicol
Estreptomicina
Toxina de la Difteria
Bacterias -
Arqueobacterias
Entonces …
• Trabajan juntas bacterias y arqueobacterias
• Procariotas
• Eucariotas microscópicas
• Simples algas y prozooarios
• Organismos multicelulares – Hongos (materia muerta del
medio ambiente).
• Virus - ¿vivo o muerto?
Entonces …

• Bacterias = omnipresentes (tierra, aire y agua)

• Movimiento del aire o del agua

• Mineralización de plantas y animales

• Contaminantes orgánicos e inorgánicos en


sustancias inofensivas (reciclaje)
… mas sobre bacterias …
• Endosporas (esporas dentro de la célula)

• Respuesta a condiciones del medio ambiente

• Muchas capas

• Lo necesario para “vivir”

• Ambiente favorable = germina de nuevo

• Alta resistencia a los ataques químicos / esterilización


… mas sobre bacterias …

• Flagelos = uno / varios / muchos / distintas


posiciones.

• Condiciones Químicas ó físicas

• Quimiotaxis / Fototaxis

• Agregados de bacterias / señales químicas


Composición Química
Composición Química
Constituyente Porcentaje
Agua 75
Materia seca 25
Materia orgánica 90
Carbono 45 - 55
Oxígeno 22 - 28
Hidrógeno 5-7
Nitrógeno 8 - 13
Materia Inorgánica 10
P2O5 50
K2O 6.5
Na2O 10
MgO 8.5
CaO 10
SO3 15
Reproducción
• División binaria

• Alcanzar cierto tamaño / tiempo para dividirse

• Tiempo de generación

• Esporulación

• División sexual / asexual

• Gemación

• Transferencia de información
División Celular - Eucariota
División Celular - Levaduras
Fuente de Carbono y energía

• Fototrofos = Energía de la Luz

• Quimiotrofos = Energía de Reacciones Químicas

• Quimiorganotrofos = Químicos orgánicos

• Quimiolitotrofos = Químicos inorgánicos

• Autotrofos = Carbono inorgánico (CO2)

• Heterotrofos = Compuestos orgánicos


Medio ambiente para crecer
Medio ambiente
• Temperatura

• pH (6 a 8)

• Ausencia o presencia de O2

• Aerobios / Anaerobios / Facultativos

• Anaerobios estrictos / Anaerobios aerotolerantes /


Aerobios facultativos / microaerofilos

• Halofilas / Halofilas extremas


C- and N-Sources
Macronutrientes
Medio de Cultivo (típico)
Arquea vs bacteria
• Metanogénesis (H2 y Acetato en CH4)
• H2 y Acetato = Transformación Bacteriana M.O.

• Destrucción fotoquímica = lento = Gas Invernadero

• Bacteria = peptidoglucano / Arquea = NO

• Lípidos membrana
• Acidos grasos + esteres (bacteria)

• Lípidos + éteres (arquea) / HC de cadena larga


Eucariotas
• Unicelulares • Mayores
• Hongos • Animales
• Algas • Plantas
• Protozoos • Pequeños no hay clara
• Multicelulares diferencia entre “animal”
• Rotíferas y “planta”.
• Nemátodos
• Zooplacton
Hongos
¿qué son? - Hongos

• Agentes de descomposición (bacterias y arquea)

• Organolitotroficos (lignocelulosa)

• Bacterias NO (enzima peroxidasa)

• Lenta velocidad = descomposición


Morfología - Hongos

• 50.000 especies diferentes

• Mohos / Levaduras / añublos / royas / tizones /


bejines / setas.

• Células eucariotas

• Masa de filamentos = hifas => juntas = micelio

• Compuesto de ¿quitina?
Reproducción asexual - Mohos
Compuestos de Quitina
• Polisacárido que contiene nitrógeno.

• Similar a la celulosa.

• Cambio en C-2 OH por grupo acetilamino.


Quitina - Quitosano
• Glucosa es a celulosa

• N-acetilglucosamina (N-acetil-D-Glucos-2-amina) es a quitina.

• Quitina – acetilo = quitosano (soluble acidos inorgánicos)

• Medicina, fungicida, crecimiento plantas, quesos light…


Clasificación - Hongos

• Verdaderos Hongos = Eumycota

• Mohos delgados = Mycophycomycota

• Líquenes junto algas = Myxophycomycota


Eumycota - Hongos
Requerimientos Nutricionales -
Hongos
• Descomponer Materia Orgánica = Energía
• Nitrógeno = Fuentes inorgánicas (NH4+ / NO3-)
• Menos que bacterias = menos necesidad

• Mohos = aerobios
• Levaduras = facultativas
• Hongos mas lentos que bacterias
• Viven en condiciones mas extremas (secas)(presión
osmótica)(pH)(temperatura)
• Terrestres / Acuáticas / anaeróbias
Algas
Introducción - Algas
• Fototrofos oxigénicos

• Base de la cadena alimentaria => contaminación (alto


crecimiento = estorbo) (descomposición = consumo de oxígeno)

• Crecimiento = Minerales (cambios en pH, dureza y alcalinidad)


(M.O. para bacterias) (toxinas para peces y crustáceos)

• Calidad de agua / Control contaminación agua

• Fitoplacton = Luz en M.O. en el agua (Protozoos, crustáceos y


peces)
Morfología - Algas
• Eucariota / Clorofila / Fotosíntesis
• Algas verdiazules = cianobacterias
• Algas auténticas = microscópicas (Macrocystis marina)
• Océanos / lagos / ríos / depósitos salinos / manantiales
termales / árboles y rocas / suelos húmedos / plantas /
animales
• Junto a hongos = líquenes (rocas y árboles)
• Diferentes tipos de clorofila (espectro de luz)
Algas – Tipos de Clorofila
Reproducción y crecimiento - Algas
• Sexual y asexualmente (bacterias y hongos)

• Ambiente favorable = bajo tiempo de generación


(pocas horas = unicelulares)

• Heterotróficamente ó fototroficamente

• Fototrofas estrictas

• Autótrofas = C, H , O , N, P, S , Fe (Minerales H2O)


Reproducción y crecimiento - Algas

• 50% C / 10% N / 2% P (en C. Favorables)

• En C. Desfavorables = 2% N y 0.2% P (lento


crecimiento)

• Buen contenido de proteínas (alimento)

• Amplio rango de temperatura de crecimiento

• pH neutro ó alcalino
Protozoos
Introducción - Protozoos

• Unicelulares / Eucariotas / Heterotrofos

• Perseguir + Ingerir sus alimentos

• Aerobios / Anaerobios (sistemas tratamiento aguas)

• Sin una verdadera pared celular

• Tamaño = desde bacteria grande hasta visibles ojo.


Clasificación - Protozoos
Reproducción y Crecimiento -
Protozoos
• Agua fresca y agua marina

• Alimentan de bacterias / partículas orgánicas

• Libres / Parásitos / Limpieza de materia fina /


Indicadores de toxinas

• Condiciones crecimiento: (pH buen


rango)(Temperatura hasta 55ºC)(aerobios /
anaerobios)
Autoaprendizaje

Ejercicios desde 2.1 al 2.17 (todos)

Cap. 2 The basics of Biology.

An Engineer´s Perspective

Schuler and Kargi - 2002


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