Universidad de las Fuerzas Armadas ESPE

Ingeniería en Biotecnología
Ecología

Integrantes: Daniel Carrera – Diego Garzón – Sebastián Gómez

Fecha: 2017/05/22
Tema: CSI Wildlife

1) Parte A:
a. Es una especie que tiene un efecto desproporcionadamente grande comparado con
su abundancia, es decir que tiene un rol critico en el mantenimiento de la
comunidad ecológica.
b. 50000/470000*100=10.64% de elefantes son asesinados anualmente
c. Realiza estudios forenses utilizando análisis de DNA, para luchar contra los
grandes sindicatos de crimen organizado que venden marfil ilegalmente,
permitiendo determinar de dónde proviene el marfil.
2) El objetivo del caso es identificar el origen del marfil mediante análisis de DNA y
determinar si el marfil encontrado corresponde a los elefantes asesinados en el Parque
Garamba.
3) La mayor cantidad de elefantes africanos se encuentra distribuido en: Gabón,
República del Congo, Sudán, República Central Africana, Angola, Namibia,
Botsuana y Tanzania.
4) STR significa short tandem repeats (repeticiones cortas en tándem) y consisten en
secuencias de DNA altamente variables, incluso en individuos de la misma especie.
5) Las bandas evidenciadas en el gel formadas tras el proceso de electroforesis,
representan fragmentos de DNA de un tamaño específico que es comparado y
definido mediante el uso de un marcador de peso molecular.
6) Los STR en un locus específico tienen las siguientes características en común:
constituidos por nucleótidos, secuencias de flanqueo y son formados por repeticiones
de una unidad (por ejemplo: CTA).
7) Una semejanza entre el patrón de bandas presente en el gel de electroforesis y las
huellas digitales humanas es que ambas al ser sumamente variables son empleadas
para identificar individuos. Mientras una diferencia entre ambas es que las huellas
digitales son características anatómicas, mientras que el patrón de bandas es una
característica molecular o genética.
8) La muestra de DNA puede ser obtenida de: 1) cabello, 2) saliva o 3) colmillos del
elefante.
9) Las secuencias de flanqueo son importantes para amplificar los fragmentos STR
debido a que los primers se añaden a dichas secuencias, lo cual permite la actividad
de la polimerasa de DNA y la amplificación específica de los fragmentos de STR.
10) Los fragmentos obtenidos no van a ser del mismo tamaño en todos los elefantes, esto
se debe que los fragmentos STR son altamente variables, principalmente en el número
de repeticiones de unidades presentes, por lo cual se van a tener fragmentos de mayor
o menor tamaño.
11) Para ello emplean diferentes primers específicos para las secuencias de flanqueo de
cada STR.
12) Mientras mayor sea el tamaño del fragmento de DNA, menor será la distancia de
migración en el gel, es decir, los fragmentos más pesados se encontraran en la parte
superior del gel, mientras que los de menor peso en la parte inferior del mismo.
13) El DNA migra al electrodo positivo debido a que la carga neta del DNA es negativa,
y al hacer pasar una corriente eléctrica, esta induce la migración.
14) El elefante de la derecha, presenta tanto el fragmento de menor tamaño como el de
mayor. El fragmento de mayor tamaño es de aproximadamente 190bp, mientras que
el de menor tamaño es de aproximadamente 65pb.
15) Heterocigoto, debido a que presenta dos fragmentos uno de 142 pares de base y otro
de 130 pares de bases.
16) Si el gel mostrará a dos elefantes hermanos, los perfiles deberían ser similares,
debido a que comparten alelos similares a la de los padres, por lo cual se tendrán
algunas bandas similares.
17) Debido a que entre poblaciones de elefantes existen muchas similitudes entre varios,
marcadores por lo cual una mayor cantidad de marcadores entregara una mayor
cantidad de información para poder dilucidar de donde viene la muestra.
18) 𝑙𝑜𝑛𝑔𝑢𝑖𝑡𝑢𝑑 = #𝑟𝑒𝑝𝑒𝑡𝑖𝑐𝑖𝑜𝑛𝑒𝑠 ∗ #𝑛𝑢𝑚𝑒𝑟𝑜 𝑑𝑒 𝑛𝑢𝑐𝑙𝑒𝑜𝑡𝑖𝑑𝑜𝑠 𝑟𝑒𝑝𝑒𝑡𝑖𝑑𝑜𝑠 + 𝑏𝑜𝑟𝑑𝑒𝑠

𝑙𝑜𝑛𝑔𝑢𝑖𝑡𝑢𝑑 = 10 ∗ 4 + 9 = 49 𝑛𝑢𝑐𝑙𝑒𝑜𝑡𝑖𝑑𝑜𝑠
19) Debido a que en sus perfiles poseen más de una banda diferente con los diferentes
marcadores por lo cual se puede asumir que no existe un error, como si con el 3 y 5
que poseen una igualdad es 3 marcadores y una falla solo en uno.
20) La primera propiedad es que exista una variabilidad genética entre especies, que la
zona sea amplificable de la muestra como por ejemplo heces o cuernos. La
importancia radica en que gracias ha eso existirá una buena variación para poder
diferenciar muestras.
21) Se determina dividiendo el número de alelos diferentes presentes en la población
para el total de individuos en la población.
22) El valor del fragmento es 0.09, el valor significa que de cada 100 elefantes existen 9
con la presencia del alelo para este gen
23) Porque esta técnica les permitirá ir descartando mediante las distancias y poderse
centrar en muestrear únicamente en los tres lugares donde hay las frecuencias
alélicas.
24) P^2 es la probabilidad de heredar un alelo del padre y un alelo de la madre
25) 2pq representa la probabilidad de tener un alelo (p) y la probabilidad de tener el otro
alelo (q) y la multiplicación por 2 es importante debido a que se debe a que se puede
obtener de dos maneras estos alelos.
26) Parte A
P+2qp+q= Probabilidad
Probabilidad= (0.08^2)+ 2*0.08*0.05+(2*0.05)= 0.0169
Parte B
P*P=Probabilidad homocigota
0.06*0.06=0.0036
Parte C
P1*P2*P3*P4*P5*P6
0.06*0.08*0.05*0.1*0.24*0.09=1.12 *10^-8
27) Las principales diferencias son que en el caso uno solo se comparaba las muestras
con los elefantes del país ahora se compara con otras partes de África, además de
quiere verificar utilizando la misma técnica para comparar la similaridad con
poblaciones y no solo individuos.