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PROCESOS BIOQUÍMICOS DE
CONTAMINANTES EN SUELOS
Mejoras tú. Mejora el mundo Mg. Ing. Edgar Mg. Ing. Edgar A. Marcelino
A. Marcelino Tarmeño Tarmeño
Procesos bioquímicos de contaminantes
en el suelo
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Mg. Ing. Edgar A. Marcelino Tarmeño
Procesos bioquímicos de contaminantes
en el suelo
Existe diversos procesos bioquímicos que los contaminantes
experimentan en el suelo, entre los principales tenemos:
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Reacciones Redox
Tipos:
• Procesos de degradación descomposición de
compuestos orgánicos
• Procesos de oxidación / reducción de un
compuesto
• Oxidación de 2-4D mediante o-alquilación
• Reducción de Percloroetileno (PCE) mediante
deshalogenacion alquilica
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Reacciones Redox
Procesos que participan en
los ciclos biogeoquímicos
de otros elementos:
• Nitrificación Oxidación
de amonio a nitrato
• Desnitrificación
(proceso de reducción
de Nitrato a N2 y NO2)
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Reacciones de hidrólisis
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Reacciones de metilación
• La metilación es la adición de un grupo metilo (-CH3) a
una molécula.
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Mg. Ing. Edgar A. Marcelino Tarmeño
Reacciones de metilación
Por ejemplo:
• La metilación del mercurio resulta CH3Hg, es un compuesto
mucho mas toxico que el mercurio, este elemento es
ampliamente utilizado para extraer oro de sedimentos y suelos.
Enfermedad de Minamata
Es un síndrome neurológico grave y permanente causado por mercurio
Adsorción / Desorción:
• Que se dan en los coloides del suelo como caso de los
plaguicidas.
• Las paredes y membranas de organismos vivos son capaces de
retener contaminantes también.
• Ejemplo:
El cadmio puede quedarse atrapado en las paredes de la célula
de una bacteria Biosorción
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Descripción de procesos bioquímicos
Termodinámica y bioquímica
Cinética bioquímica
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Mg. Ing. Edgar A. Marcelino Tarmeño
Termodinámica y bioquímica
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Mg. Ing. Edgar A. Marcelino Tarmeño
Cinética bioquímica
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Cinética bioquímica
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Cinética bioquímica
Una reacción de segundo orden es aquella en la que la
velocidad de formación del producto depende:
• De la concentración de dos sustratos (como en una
reacción de condensación): v = k [A1] [A2]
• Del cuadrado de la concentración de un único
sustrato (reacción de dimerización): v = k [A]2
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Cinética bioquímica
• La cinética enzimática estudia la velocidad de las reacciones
catalizadas por enzimas. Estos estudios proporcionan
información directa acerca del mecanismo de la reacción
catalítica y de la especificidad de la enzima.
• La velocidad de una reacción catalizada por un enzima puede
medirse con relativa facilidad, ya que en muchos casos no es
necesario purificar o aislar el enzima.
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Mg. Ing. Edgar A. Marcelino Tarmeño
Cinética bioquímica
• La medida se realiza siempre en las condiciones
óptimas de pH, temperatura, presencia de
cofactores, etc, y se utilizan concentraciones
saturantes de sustrato.
• En estas condiciones, la velocidad de reacción
observada es la velocidad máxima (Vmax). La
velocidad puede determinarse bien midiendo la
aparición de los productos o la desaparición de los
reactivos.
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Cinética de Michaelis-Menten
• La cinética de Michaelis-Menten describe la velocidad de
reacción de muchas reacciones enzimáticas. Recibe este
nombre en honor a Leonor Michaelis y Maude Menten.
• Este modelo sólo es válido cuando la concentración del
sustrato es mayor que la concentración de la enzima, y para
condiciones de estado estacionario, es decir, cuando la
concentración del complejo enzima-sustrato es constante.
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Mg. Ing. Edgar A. Marcelino Tarmeño
Cinética de Michaelis-Menten
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Procesos metabólicos y fisiológicos de
contaminantes en suelos
Son el conjunto procesos de mayor magnitud o más
complejos que se dan juntos en un organismo
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Ingreso y destino de contaminantes
Los contaminantes que se encuentran en el suelo
pueden ser incorporados en los organismos vivos.
El Ingreso y destino, está dado por:
• Adquisición de contaminantes
• Absorción
• Destino del contaminante absorbido
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Adquisición de contaminantes
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Adquisición de contaminantes
• Ingestión
• Se da en organismos grandes del suelo
• Inhalación
• Mecanismo aplicable a animales.
• Una partícula que contiene algún químico de interés entra en los
pulmones
• Procesos simples de transferencia de materia
• Se da por contacto dérmico, o en plantas.
• Se da por fenómenos de transporte advectivo y de difusión.
• Como un mecanismo adicional existe la intercepción radicular,
cuando la raíz de las plantas encuentra una zona contaminante
en su búsqueda de nutrientes
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Absorción
Es el proceso de ingreso del contaminante u otra sustancia al
interior de la célula.
Mecanismos:
• General: El contaminante deberá atravesar al menos una
membrana celular
• Específicos: Pueden ser por canales proteicos
• Absorción activa
• Se da en contra del gradiente. Aplicación de energía de una fuente
externa
• Absorción pasiva
• Movimiento a favor del gradiente
• En contaminantes, el mecanismo pasivo es el de mayor importancia
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Absorción
Biodisponibilidad del contaminante en el suelo
Para determinar esta fracción, se usan conceptos de especiación
química.
Ejemplo:
• Especies gaseosas y fase líquida acuosa son altamente
disponibles.
• NAPL no es biodisponible
• Fases sólidas: Sólo será disponible aquella porción fácilmente
solubilizable
Las porciones fisisorbidas son más disponibles que las quimosorbidas
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Destino del contaminante absorbido
a) Bioacumulación
Proceso de acumulación de sustancias químicas en organismos
vivos de forma que estos alcanzan concentraciones más
elevadas que las concentraciones en el medio ambiente
b) Conservación del contaminante en el organismo
El organismo absorbe el contaminante y este queda retenido
durante el resto de su vida
c) Utilización en el metabolismo
Existe una concentración óptima y un nivel tóxico en el
organismo
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Destino del contaminante absorbido
d) Eliminación del contaminante del organismo vivo Se da por
dos mecanismos
Biotransformación
Alteración química o bioquímica de la sustancia contaminante
Pueden ser:
• No sintéticas: de alteración simple
• Sintéticas: La sustancia se coloca dentro de un
polímero
Excreción
Salida del organismo vivo por exudación (los animales a través
de la orina y las plantas a través de la evapotranspiración)
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Fijación biológica de N2
Proceso biológico de interés, el nitrógeno como
contaminante. Es un proceso de conversión de N2 en
nitrógeno orgánico en forma de grupos amina.
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Fijación biológica de N2
Fijación libre
Esta propiedad está restringida sólo a procariotas y se encuentra
muy repartida entre los diferentes grupos de bacterias y algunas
arqueobacterias.
Fijación simbiótica
Las más conocidas son las plantas de la familia de las leguminosas
(Fabaceae) como los tréboles, alfalfa, soja, alubias o porotos,
guisantes), que poseen en sus raíces nódulos con bacterias
simbióticas conocidas como rizobios, que producen compuestos
nitrogenados que ayudan a la planta a crecer y competir con otras
plantas. Cuando la planta muere, el nitrógeno ayuda a fertilizar el
suelo
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Procesos biológicos de contaminantes
en suelos
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Ciclo de vida de individuos de ciertas
especies
• Es la secuencia de procesos que ocurren desde el nacimiento
hasta la muerte del individuo.
• Involucra procesos de crecimiento, desarrollo y reproducción
del organismo.
• El ciclo de vida es específico para cada especie. Puede ser
simple (como en las bacterias, cuyo ciclo comienza con una
división celular, crecimiento, desarrollo y termina con otra
división o muerte) o más complejo (como en el caso de los
insectos, que comienza con el huevo, larva, crece, se desarrolla
y muere).
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Ciclo de vida de individuos de ciertas
especies
Existen requerimientos ambientales para los ciclos, los cuales son
específicos para el desarrollo:
• Temperatura
• O2
• Alimento
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Interacción con individuos de otras
especies
En el suelo existen muchas especies de organismos, y es lógico que se
den interacciones entre ellas.
Tipos de interacciones
• Neutralismo
• Comensalismo
• Sinergismo
• Mutualismo
• Competencia
• Amensalismo
• Depredación
• Parasitismo
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Neutralismo
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Comensalismo
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Simbiosis
• Dos o más especies viven en contacto íntimo y obtienen
beneficios mutuos de su interrelación, donde la simbiosis casi
siempre es de carácter obligatorio para que el simbionte realice
ciertas funciones vitales.
• Un ejemplo es la asociación de un alga o una cianobacteria con
un hongo, más conocida como líquenes, donde el hongo se
beneficia de los carbohidratos producidos por el alga y ésta a su
vez obtiene beneficios debido al incremento en la superficie de
absorción y el agua retenida en las hifas del hongo
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Mutualismo
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Competencia
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Amensalismo
• Es un tipo de relación entre los seres vivos o un tipo de interacción
biológica producido cuando un organismo se ve perjudicado en la
relación y el otro no experimenta ninguna alteración, es decir, la
relación le resulta neutra.
• Ejemplo la relación del eucalipto con sus competidores, el eucalipto
segrega una sustancia que evita o dificulta el desarrollo de las otras
plantas, debido al fenómeno llamado alelopatía.
• El hongo penicilium y las bacterias, el hongo segrega la penicilina
evitando el desarrollo de las bacterias
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Depredación
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Parasitismo
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Dinámica de poblaciones
La dinámica de las poblaciones se encarga del
estudio de los cambios que sufren las poblaciones
biológicas en cuanto a tamaño, dimensiones físicas
de sus miembros, estructura de edad y sexo y otros
parámetros, así mismo estudia los factores que
causan esos cambios y los mecanismos por los que
se producen.
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Mg. Ing. Edgar A. Marcelino Tarmeño
Propiedades de la dinámica de
poblaciones
Las poblaciones presentan características diversas, las que se
expresan de mejor manera como funciones estadísticas,
constituyen la única posesión del grupo y no son características
de los individuos en él. Alguna de estas son:
• Densidad
• Natalidad
• Mortalidad
• Distribución de edades
• Potencial biótico
• Dispersión
• Forma de desarrollo.
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Mg. Ing. Edgar A. Marcelino Tarmeño
Propiedades de la dinámica de
poblaciones
• Las poblaciones presentan asimismo características
genéticas relacionadas directamente con su
ecología, esto es:
• Adaptabilidad
• Capacidad reproductiva (darwiniana)
• Persistencia
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Densidad de población
• Es la magnitud de la población en relación con alguna
unidad de espacio. Se suele verificar y expresar como el
número de individuos, o la biomasa de población por
unidad de superficie o volumen.
• Por ejemplo: 400 árboles por hectárea.
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Natalidad
Es la propiedad de aumento inherente a una
población.
Mortalidad
Velocidad de muerte de individuos de la
población. La mortalidad puede expresarse
como el número de los individuos que mueren
en un periodo determinado (muertes divididas
por el tiempo).
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Mg. Ing. Edgar A. Marcelino Tarmeño
Distribución de edades
• Constituye una característica importante de la población, que
influye tanto sobre la natalidad, como sobre la mortalidad.
• La proporción de los diversos grupos de edades decide la
condición de una población por lo que se refiere a la
reproducción e indica lo que puede esperarse en el futuro.
• Una población en expansión rápida, comprenderá una gran
población de individuos jóvenes, y una población estable
comprenderá una distribución más uniforme de las clases, en
tanto que una población decadente contendrá una gran
proporción de individuos viejos.
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Dispersión espacial
• Los individuos de una población
pueden estar distribuidos según tres
grandes tipos:
• Al azar: Relativamente rara en la naturaleza, y
tiene lugar donde el medio es muy uniforme y
no existe tendencia alguna a agregarse
• Uniforme: Puede ocurrir donde la competición
entre organismos es activa o donde existe un
antagonismo positivo que provoca un
espaciamiento regular
• Amontonamiento: Es el tipo más corriente.
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Potencial biótico
• El potencial biótico se puede definir como la máxima
capacidad de reproducción que una población en
condiciones optimas manifestación del aumento
poblacional como consecuencia de los nacimientos que se
producirían si todos los organismos o todas las hembras,
según sea el caso se reprodujeran, sin que hubiera
procesos como muertes o desplazamientos ni carencias ni
presiones que pudieran alterar la natalidad de la
población, es decir cuando el medio provee agua,
alimentos, clima adecuado y ausencia de poblaciones con
efectos negativos.
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Modelos de dinámica de poblaciones
• Una gran parte de la ecología de poblaciones es
matemática, ya que buena parte de su esfuerzo se dirige a
construir modelos de la dinámica de poblaciones, los
cuales deben ser evaluados y refinados a través de la
observación en el terreno y el trabajo experimental. La
Ecología de poblaciones trabaja a través de muestreos y
censos para comprobar la estructura de la población (su
distribución en clases de edad y sexo) y estimar parámetros
como natalidad, mortalidad, tasa intrínseca de crecimiento
(r) o capacidad de carga del hábitat (K).
• Velocidad intrínseca de crecimiento poblacional
• Velocidad limitada por capacidad de carga
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Velocidad intrínseca de
crecimiento poblacional
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Velocidad intrínseca de
crecimiento poblacional
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Velocidad limitada por capacidad
de carga
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Consideraciones para biorremediación
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Biodegradación y transformaciones
apoyadas biológicamente
Reacciones metabólicas Reacciones metabólicas Secundarias
primarias (Fase I de Bio (Fase II de Bio transformación)
transformación)
transformación primaria.
Aumento de la solubilidad,
hidrólisis, oxidación ... etc.
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Biodegradación y transformaciones
apoyadas biológicamente
• Como se puede esperar, la activación de estas
reacciones requiere una alta demanda de energía, o al
menos una fuente de la catálisis, para asegurar su
avance.
• Esta catálisis se suministra en los organismos por
enzimas. Estas proteínas de alto peso molecular con
actividad catalítica permiten la activación de las
transformaciones biológicas de las sustancias en
fuentes energéticas o productos químicos fácilmente
eliminadas.
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Transformaciones enzimáticas. Enzimas,
tipos y modo de Acción
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Transformaciones enzimáticas
Hidrolasas Transferasas Oxidorreductasas
•Ayudan a la hidrólisis •Ayudan a transferir un •Transfieren hidrógeno o
determinado grupo a electrones entre dos
otro sustrato, no suele sustratos
ser agua
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Transformaciones enzimáticas
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Hidrolasas
• Forman alrededor de un tercio de las enzimas
conocidas y actúan principalmente en enlaces
peptídicos, ésteres, glicosídicos, amidas y similares.
• Catalizan la hidrólisis de sus sustratos y de acuerdo
con el tipo de enlace que puede ser atacado bajo
su sustento pueden clasificarse en:
• Hidrolasas C-N
• Hidrolasas C-O.
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Hidrolasas
Hidrolasas C-N
•De acuerdo con el enlace C-N que hidrolizan, pueden clasificarse en proteasas
y deaminasas.
• Proteasas: ayudan a degradar las proteínas por hidrólisis de los enlaces
peptídicos internos a lo largo de la cadena que une los aminoácidos
individuales en la molécula de proteína :
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Hidrolasas
Hidrolasas C-O
• Catalizan la hidrólisis de esteres naturales.
• Puedes clasificarse en:
• Lipasas
• Fosfatasas
• Sulfatasas
• Carbohidrasas un ejemplo es la celulasa, que
degrada celulosa y solo es encontrada en bacterias,
hongos y jugos digestivos de ciertos caracoles y
gusanos.
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Hidrolasas
Papel de las Hidrolasas en la degradación de pesticidas
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Transferasas
• Derivan sus nombres individuales de la del grupo transferido, ya
sea con el prefijo "trans" y el sufijo "-asa", o seguido de
"transferasa".
• Así se encuentran nombres como: trans-fosforil-asa, trans-acil- asa,
o dihidroxiacetona- transferasa.
• Los grupos son más importantes son:
• Trasnfosforilasas
• Transacilasas
• Transaminasas
• Transmetilasas
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GRACIAS
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A. Marcelino Tarmeño Tarmeño