Workshop Sequenciamento de 3ra Geração

S3G

A. Rhoads, K.F. Au, Genomics Proteomics Bioinformatics, 2015

19 de junho de 2019
Instituto de Biociências - IBUSP
Auditório da Botânica
09h00 – Apresentação Oxford Nanopore - via web 13h30 - Archaea / MinION
09h40 - Vertebrados, Serpentes / MinION
Resolvendo clusters genômicos de duplicações
gênicas com ultra long reads de MinION
Vincent Louis Viala, Instituto Butantan
10h30 - 10h45 >> Coffee Break
Auditório da Zoologia
Investigação da regulação de mRNAs codificadores de
transposase e da morfologia de transcritos utilizando a
plataforma MinION
Alan Péricles Rodrigues Lorenzetti, FMUSP Ribeirão Preto
14h20 – Planta / PacBio
Desafios para a montagem de genomas de árvores: o
caso da castanheira-da-Amazônia
Karina Martins, UFSCar

10h45 - Planta / PacBio + MinION 15h10 - 15h30 >> Coffee Break

Sobre ambientes e montagens inóspitos: os desafios
dos genomas de duas espécies da flora dos campos
rupestres
Isabel Rodrigues Gerhardt, Embrapa - CNPTIA
15h30 - Invertebrado / MinION + Illumina - via web
A hybrid approach for genome assembly of the
Hawaiian spider Tetragnatha quasimodo
Darko D.C. Viedma, California Academy of Sciences

16h20 – 17h00: Finalização e discussão aberta.

Apoio: Comissão de Pesquisa IB-USP e Diretoria IB-USP

Contato: maxmaronna@gmail.com / paula.turrini@gmail.com