UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS

Universidad del Perú. DECANA DE AMÉRICA.

FACULTAD DE FARMACIA Y BIOQUÍMICA
ESCUELA PROFESIONAL DE FARMACIA Y BIOQUÍMICA
Departamento Académico de Bioquímica

SÍLABO

I. DATOS GENERALES
1.1 Asignatura: GENÓMICA FUNCIONAL
1.2 Código: FB140443
1.3 Número de créditos: 4.0
1.4 Año de estudios: Cuarto
1.5 Requisitos: Bioquímica III
1.6 Semestre Académico: 2019-II
1.7 Número de horas: Semanal / Semestral
Teoría 02/32
Práctica 04/64

1.8 Fecha de inicio: 12 de agosto del 2019

Fecha de término: 07 de diciembre del 2019

1.9 Horario
Teoría: miércoles 8:00 – 10:00 h – Aula 1
Práctica: martes 10:00 – 13:20 h - Aula: Laboratorio de Bioquímica
jueves 15:00 – 18:20 h - Aula: Laboratorio de Bioquímica
viernes 10:00 – 13:20 h - Aula: Laboratorio de Bioquímica

1.10 Profesor responsable: Mg. Gloria Gordillo Rocha Principal TC 098655

1.11Profesor(es) colaborador(es):
Dr. Christian Solís Calero Principal TC 0A4528
Dra. Gabriela Solano Canchaya Auxiliar TC 0A4041
Mg. Oscar Acosta Conchucos Asociado TC 0A1914

------------------------------- -------------------------------- -----------------------------

Mg. Gloria Gordillo Rocha Dr. Víctor Izaguirre Pasquel Dr. Luis Miguel Félix Veliz
Directora Departamento Director E. P. Farmacia y Vicedecano Académico
Académico Bioquímica

--------------------------------
Dra. Luisa Negrón Ballarte
Decana

2019

1
II. SUMILLA

Asignatura de naturaleza teórico-práctica que pertenece al área de estudios de la especialidad. Al finalizar la asignatura, el estudiante será
capaz de explicar las bases de la genómica, transcriptómica y proteómica; utilizando la terminología apropiada, describiendo el polimorfismo
genético de dianas moleculares (enzimas, transportadores y receptores); y considerando la variabilidad de respuesta a los efectos de los fármacos
y sus aplicaciones en las ciencias de la salud y en particular en las ciencias farmacéuticas. Para lograr este resultado de aprendizaje, se
desarrollarán los siguientes contenidos: a) Genómica, b) Transcriptómica, c) proteómica y c) Aplicaciones de las ómicas en el campo de las
ciencias de la salud y en particular en el campo de la farmacia y bioquímica.

III. ARTICULACIÓN DE LA ASIGNATURA CON EL PERFIL DE EGRESO

COMPETENCIA(S) DESEMPEÑO(S) NIVEL(ES) DE LOGRO

Asistencial. Evalúa las características y propiedades de los
Relaciona la estructura química de sustancias (endógenas
productos farmacéuticos, dispositivos médicos, productos Relación estructura
y exógenas) con la actividad biológica a nivel molecular,
sanitarios, recursos y productos naturales, alimentos y el química – actividad
celular, tisular, órganos y sistemas; considerando los
manejo de tóxicos, para promover su uso adecuado, en biológica de
mecanismos de regulación, la variabilidad (intra e
beneficio de la mejora de la calidad de vida de las personas; moléculas endógenas
interindividual) y su importancia para el quehacer
considerando criterios de calidad, eficacia, seguridad y y exógenas
profesional del químico farmacéutico.
costo beneficio.
Lidera el trabajo en equipo; escuchando activamente las
Trabajo en equipo. Trabaja en equipo con una perspectiva
Saber trabajar en opiniones de los integrantes del equipo, previniendo y
transdisciplinar para comprender y transformar la realidad
equipo resolviendo los conflictos y generando las condiciones
compleja.
para el logro de los resultados esperados.
Comunicación. Gestiona la información y la difusión de
Aporta ideas relevantes durante el desarrollo de sus
conocimientos de su campo profesional, a través de la
Comunicación oral. actividades académicas; de manera clara, precisa y
comunicación oral y escrita, ejerciendo el derecho de
sustentada en información especializada.
libertad de pensamiento con responsabilidad.

IV. RESULTADO DE APRENDIZAJE GENERAL

Explica el polimorfismo genético de enzimas, transportadores y receptores, y las bases de la transcriptómica, proteómica e interactómica;
considerando la variabilidad de respuesta a los efectos de los fármacos y sus implicancias en las ciencias de la salud respectivamente.

2
V. RESULTADOS DE APRENDIZAJE ESPECÍFICOS (RAE)

INTRODUCCION Y PERSPECTIVAS DE LA GENÓMICA. Integra los fundamentos, las metodologías y

Resultado de aprendizaje
herramientas moleculares usadas en el campo de la genómica con perspectiva al uso en el campo de la
específico 1 – RAE1
salud.
RECURSOS INSTRUMENTOS PESO
CONTENIDOS (TEORÍA Y PRÁCTICA) CRITERIOS DE EVALUACIÓN
METODOLÓGICOS DE EVALUACIÓN (%)
Semana 1. 14/08/19 - Docente: Mg. Gloria Gordillo R Exposición del
Tema: Definición de genómica y genomas. Clasificación de los genomas. La docente.
genómica estructural, funcional y comparativa. Aplicaciones de la genómica. Explica la diversidad de los
Práctica N°1: Genética y Genómica en salud (Taller). Análisis y genomas basándose en su
discusión función, estructura, Rúbrica de
Semana 2. 21/08/19 - Docente: Mg. Gloria Gordillo Rocha /Dra. Gabriela grupal.
Solano. importancia de estudio y evaluación
aplicaciones. de prácticas
Tema: Genómica y polimorfismos. Polimorfismo de nucleótido simple. Exposición de
Práctica N°2: Polimorfismo de nucleótido simple (Taller). los estudiantes. Asocia la importancia de los Rúbrica de
Semana 3. 28/08/19 - Docente: Mg. Gloria Gordillo R polimorfismos de nucleótido evaluación
Planteamiento y 12.5
Tema: Epigenética bases biológicas. Farmacoepigenética. simple en la variabilidad de de wiki
solución de respuestas biológicas.
Práctica N°3: Farmacoepigenética (Taller). Problemas. Cuestionario.
N° de semanas: 3 (De la semana 1 a la semana 3) Reconoce las bases
biológicas de la epigenética Lista de
y su relación con la Verificación.
Producto 1: Wiki explicando las implicancias de la genómica en el área de la salud variabilidad en la respuesta
Fecha de entrega: Semana 3 a los medicamentos
Forma de entrega: Entrega vía la plataforma virtual.

3
Resultado de aprendizaje APLICACIONES DE LA PROTEÓMICA EN SALUD. Integra los fundamentos, las metodologías y herramientas
específico 2 – RAE2 moleculares usadas en la proteómica; considerando sus implicancias en las ciencias de la salud.
RECURSOS INSTRUMENTOS PESO
CONTENIDOS (TEORÍA Y PRÁCTICA) CRITERIOS DE EVALUACIÓN
METODOLÓGICOS DE EVALUACIÓN (%)
Semana 4. Fecha: 04/09/19 - Docente: Dra. Gabriela N. Solano C.
Tema: Introducción a la proteómica. Definición de proteoma y proteómica. Explica la variación de
Objetivos de la proteómica. Conceptos. Aplicaciones. los proteomas
Práctica № 7. Bases bioinformáticas para la interpretación de la espectrometría relacionándolos con la
de masas. estructura química de
las proteínas y sus
modificaciones
Semana 5. Fecha: 11/09/19 - Docente: Dra. Gabriela N. Solano C. Exposición del postraduccionales.
Tema: Modificaciones postraduccionales. Importancia, estudio e implicancia en docente. Rúbrica de
la salud. Interacciones proteína-proteína. Analiza los datos evaluación de
Práctica № 8. Estudio de PTMs en el campo de la salud (Taller). Análisis y proteómicos; prácticas
discusión considerando el uso de
grupal. herramientas Rúbrica de
Semana 6. Fecha: 18/08/19 - Docente: Dra. Gabriela N. Solano C. evaluación de
bioinformáticas
Tema: Proteómica high-througputh, diferencial y cuantitativa. Aplicaciones. seminario
Práctica № 9. Análisis bioinformático de datos proteómicos de gran escala. Exposición de Compara las estrategias
los estudiantes. 12.5
Análisis de redes y vías metabólicas. de estudio de los Rúbrica de
proteomas evaluación de
relacionándolos con la video
Semana 7. Fecha: 25/09/19 - Docente: Dra. Gabriela N. Solano C.
Tema: Aporte de la proteómica al estudio de enfermedades. estructura y función de
las proteínas. Cuestionario.
Seminario N° 1: Importancia del estudio de los proteomas y transcriptomas en
la evaluación, diagnóstico y desarrollo de enfermedades. Lista de
Asocia la importancia
del estudio de los verificación.
N° de semanas: 4 (De la semana 4 a la semana 7) proteomas con los
aportes de la
Producto 2: Video explicando los avances de la proteómica y su uso en el diagnóstico de proteómica en el estudio
y diagnóstico de
enfermedades
enfermedades.
Fecha de entrega: Semana 7
Forma de entrega: Entrega vía la plataforma virtual.

Semana 8: EXAMEN PARCIAL (Con suspensión de actividades lectivas). 2/10/2019

4
 APLICACIONES DE LA INTERACTÓMICA. Integra los conocimientos sobre genómica y proteómica en el
Resultado de aprendizaje contexto de la interacción de sus componentes genes y proteínas, dando los fundamentos matemáticos
específico 3 – RAE3 y físicos básicos, para describir y entender la complejidad de los sistemas bioquímicos y sus implicancias
en las ciencias de la salud.
RECURSOS INSTRUMENTOS DE PESO
CONTENIDOS (TEORÍA Y PRÁCTICA) CRITERIOS DE EVALUACIÓN
METODOLÓGICOS EVALUACIÓN (%)
Semana 9. Fecha: 09/10/19 - Docente: Dr. Christian Solís Calero.
Tema: Interactómica. Redes de proteínas y genes. Redes booleanas,
Grafos: conceptos básicos, conectividad, recorridos eulerianos y
hamiltonianos
Práctica N°6: Representación de sistemas bioquímicos usando grafos. Exposición del
Semana 10. Fecha: 16/10/19 - Docente: Dr. Christian Solís Calero. docente.
Tema: Teoría de la complejidad: Sistemas complejos, propiedades Representa la interacción de
emergentes. Sistemas biológicos. Enfoque basado en redes para entender Análisis y
genes y proteínas usando
el proceso salud-enfermedad. discusión
redes de interacción.
Práctica N°7: Modelaje matemático de vías metabólicas. grupal.
Rúbrica de
Semana 11. Fecha: 30/10/19 - Docente: Dr. Christian Solís Calero. Planteamiento y Modela fenómenos evaluación
Tema: Modelaje y análisis matemático de redes de expresión génica, solución de bioquímicos usando de prácticas
redes metabólicas y redes de señalización. problemas. ecuaciones diferenciales Problemas.
Práctica N°8: Modelaje matemático de redes de expresión génica. ordinarias. 12.5
Ficha de
Exposición de
Semana 12. Fecha: 06/11/19 - Docente: Dr. Christian Solís Calero. Explica la complejidad de los Evaluación.
los estudiantes.
Tema: Uso de redes de interacción: Farmacología de sistemas para el sistemas biológicos de escala
descubrimiento de nuevos fármacos. molecular usando criterios
Seminario N°2: Metabolómica; técnicas y aplicaciones. fisicoquímicos.

N° de semanas: 4 (De la semana 9 a la semana 12)

Producto 3: Solución de problemas y ejercicios relacionados a interactómica (Grupal)

Fecha de entrega: Semana 12
Forma de entrega: Entrega vía la plataforma virtual.

5
 APLICACIONES DE LA TRANSCRIPTÓMICA Y OTRAS ÓMICAS EN SALUD. Integra los fundamentos, las
Resultado de aprendizaje
metodologías y herramientas moleculares usadas en la transcriptómica; considerando sus implicancias
específico 4 – RAE4
en las ciencias de la salud.
RECURSOS INSTRUMENTOS DE PESO
CONTENIDOS (TEORÍA Y PRÁCTICA) CRITERIOS DE EVALUACIÓN
METODOLÓGICOS EVALUACIÓN (%)
Semana 13. Fecha: 13/11/19 - Docente: Mg. Oscar Acosta
Tema: Next generation sequencing (NGS), variantes génicas y
Bioinformática estructural. Metagenómica. De la secuencia a la
predicción funcional en sistemas con varios genomas.
Práctica № 10. Análisis de variantes génicas mediante reacción en Analiza las variantes génicas
cadena de la polimerasa (Laboratorio). Exposición del y los datos metagenómicos
Semana 14. Fecha: 20/11/19 - Docente: Mg. Oscar Acosta docente. considerando el uso de
Tema: Transcriptómica. RNA sequencing (RNAseq). Análisis de datos, herramientas
expresión y predicción funcional. Aplicaciones. Análisis y bioinformáticas.
Práctica № 11. Análisis bioinformático y estadístico de datos discusión Rúbrica de
transcriptómicos (Laboratorio). grupal. Analiza los datos evaluación de
Semana 15. Fecha: 27/11/19 - Docente: Mg. Oscar Acosta transcriptómicos prácticas
Tema: Farmacogenómica. Perfil genómico con Next generation Exposición de considerando el uso de Cuestionario. 12.5
sequencing (NGS). Aplicaciones en el diseño de fármacos, tratamiento y los estudiantes. herramientas
monitoreo. Epigenómica. Metilación, modificación de histonas y bioinformáticas. Ficha de
microRNAs en masa. Epifarmacogenómica. Evaluación.
Práctica № 12. Análisis bioinformático de datos farmacogenómicos, Analiza los datos en masa de
estructura y predicción del efecto de variantes génicas y de microRNAs farmacogenes, epigenes y
(Laboratorio). microRNAS considerando el
N° de semanas: 3 (De la semana 13 a la semana 15) uso de herramientas
bioinfomáticas.
Producto 4: Informe integrado de prácticas de laboratorio (Individual) de las
herramientas de bioinformática.
Fecha de entrega: Semana 15
Forma de entrega: Entrega vía la plataforma virtual.

Semana 16: EXAMEN FINAL (Con suspensión de actividades lectivas).

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VI. CÁLCULO DEL PROMEDIO FINAL
Marco normativo: Reglamento de Evaluación del Estudiante de la Facultad de Farmacia y
Bioquímica.
FECHA DE
ACTIVIDADES DE APRENDIZAJE EVALUADAS %
EVALUACIÓN
TEORÍA: 50%
Examen parcial (E) Semana 8 25
Examen final (EF) Semana 16 25
PRÁCTICA: 50%
Resultado de aprendizaje específico - RAE1: 12.5 %
Producto 1 Wiki explicando las implicancias de la genómica en el
Semana 3 4
área de la salud
Participación en clase (PAC 1) Permanente 4.5
Examen Práctico RAE1 4
Resultado de aprendizaje específico - RAE2: 12.5 %
Producto 2 Video explicando sobre avances de la proteómica y su
Semana 7 4
uso en el diagnóstico de enfermedades
Participación en clase (PAC 2) Permanente 4.5
Examen Práctico RAE2 4
Resultado de aprendizaje específico – RAE3: 12.5 %
Producto 3: Solución de problemas y ejercicios relacionados a
Semana 12 4
interactómica (Grupal)
Participación en clase (PAC 3) Permanente 4.5
Examen Práctico RAE3 4
Resultado de aprendizaje específico - RAE4: 12.5 %
Producto 4: Informe integrado de prácticas de laboratorio
Semana 15 4
(Individual) de las herramientas de bioinformática (P4).
Participación en clase (PAC 4) Permanente 4.5
Examen Práctico RAE4 4
Promedio de teoría (PT): (EP x 0.25+ EF x 0.25)
Promedio de práctica (PP): (RAE1 x 0.125 + RAE2 x 0.125 + RAE3 x 0.125 + RAE4 x 0.125)

PROMEDIO FINAL= PT + PP

7
VII. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS

REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS BÁSICAS

1. Alon U. An introduction to systems biology_ design principles of biological circuits-
Chapman & Hall_CRC, 2007.
2. Lesk AM. Introduction to Genomics-Oxford University Press, USA, 2012.
3. Lodish H, Berk A, Matsudaira P, Kaiser C, Krieger M, Scott M, Zipursky L, Darnell J.
Molecular cell biology 5ta ed, Freedman and Company, Nueva York, 2004.
4. McKee T, McKee JR, Bioquímica las bases moleculares de la vida. 5ta ed. Ed Mc Graw
Hill Education, México DF, 2014.
5. Nelson DL, Cox MM. Lehninger principios de bioquímica. 6ta ed. Ed. Omega S.A.
Barcelona-España, 2014.
6. Stryer L, Berg JM, Tymoczko JL. Bioquímica con aplicaciones clínicas. 7ma Ed. Reverté
S.A. Barcelona-España, 2013.

PUBLICACIONES DE LOS PROFESORES DE LA ASIGNATURA

1. Figueroa J, Acosta O, Guevara M, Huerta D, Sandoval J, Fujita R. Distribución del

polimorfismo -1639 G/A en el gen VKORC1 de respuesta a warfarina en muestras de Lima
y de Puno, Perú. BAG J Basic Appl Genet. Supplem 2016.
2. Gordillo GC, Negrón LP, Zúñiga TH, Flores E, Moreyra R, Fuertes C, Guerra GA,
Apesteguía A, Quintana AM. Efecto hipoglicemiante del extracto acuoso de las hojas de
Smallanthus sonchifolius (Yacón) en pacientes con diabetes mellitus tipo 2. Ciencia e
Investigación, 2012, 15(1):42-47.
3. Motta A, Solano L, Fujita R, Acosta O. New variants of Bartonella in areas with Carrion’s
disease in Peru and inferences for drug design. International Workshop on Drug Design
and Neglected Tropical Diseases. Argentina, 2016.
4. Obispo O, Acosta O. Polimorfismo C677T en el gen MTHFR y su relación con variables
antropométricas, bioquímicas y dietarias en una muestra de estudiantes peruanos. XXII
Curso de Verano en Genética. Facultad de Medicina Ribeirão Preto, Universidad de Sao
Paulo. Brasil, 2017.
5. Olivares L, Villanueva M, Yauri A, Aparicio E, Medina R, De la Sota N, Huerta D, Negrón
L, Guevara ML, Sandoval J, Fujita R, Acosta O. Polimorfismo Val/Met en el gen OCT1 de
respuesta a metformina en muestras de Lima y Puno. Enfoque farmacogenético de la
diabetes. Anal Fac Med 2017, 78(2): 11-17.
6. Solís-Calero C, Carvalho HF. Phylogenetic, molecular evolution and structural analyses
of the WFDC1/prostate stromal protein 20 (ps20). Gene. 2019; 686:125-140.
7. Solis-Calero C, Zanatta G, Pessoa CDÓ, Carvalho HF, Freire VN. Explaining urokinase
type plasminogen activator inhibition by amino-5-hydroxybenzimidazole and two
naphthamidine-based compounds through quantum biochemistry. Phys Chem Chem
Phys. 2018; 20(35):22818-22830.
8. Solís-Calero C, Augusto TM, Carvalho HF. G-quadruplex formation in androgen receptor
promoter of human, mouse and rat: A comparative structural dynamics study. J Steroid
Biochem Mol Biol. 2018; 182:95-105.
9. Solis-Calero C. Carvalho HF. KLK14 interactions with HAI-1 and HAI-2 serine protease
inhibitors: A molecular dynamics and relative free-energy calculations study. Cell Biol
Int. 2017; 41(11):1246-1264.
10. Solís-Calero C, Ortega-Castro J, Hernández-Laguna A, Frau J, Muñoz F. A DFT study of
the carboxymethyl-phosphatidylethanolamine formation from glyoxal and
phosphatidylethanolamine surface. Comparison with the formation of N (e)-
(carboxymethyl) lysine from glyoxal and L-lysine. Phys. Chem. Chem. Phys., 2015, 17
(12), 8210-22.
11. Solís-Calero C, Ortega-Castro J, Frau J, Muñoz F.. Nonenzymatic Reactions above
Phospholipid Surfaces of Biological Membranes: Reactivity of Phospholipids and Their
Oxidation Derivatives. Oxid. Med. Cell Longev., 2015, 1-22.

8
12. Solís-Calero C, Ortega-Castro J, Frau J, Muñoz F. Scavenger mechanism of
methylglyoxal by metformin. A DFT study. Theor Chem Acc. 2015, 134 (4), 1-14.
13. Solís-Calero C, Ortega-Castro J, Hernández-Laguna A, Muñoz F. DFT Study of the
Mechanism of the Reaction of Aminoguanidine with Methylglyoxal. J. Molec. Mod.. 2014,
20(4):2202.
14. Solís-Calero C, Farwer J, Gardiner EJ, Hunter CA, Mackey M, Scuderi S, Thompson S,
Vinter JG. Footprinting molecular electrostatic potential surfaces for calculation of
solvation energies. Phys Chem Chem Phys. 2013; 15(41):18262-73.
15. Solís-Calero C, Ortega-Castro J, Hernández-Laguna A, Muñoz F. A DFT Study of the
Amadori Rearrangement above a Phosphatidylethanolamine Surface: Comparison to
Reactions in Aqueous Environment. J Phys Chem C. 2013; 117(6):8299-8309.
16. Solís-Calero C, Ortega-Castro J, Hernández-Laguna A, Muñoz F. A comparative DFT
study of the Schiff base formation from acetaldehyde and butylamine, glycine and
phosphatidylethanolamine. Theor Chem Acc. 2012, 131:1263-2.
17. Solís-Calero C, Ortega-Castro J, Muñoz F. DFT Study on Amino-Phospholipids Surface-
Mediated Decomposition of Hydrogen Peroxide. J Phys Chem C. 2011; 115(46):22945-53.
18. Solís-Calero C, Ortega-Castro J, Muñoz F. Reactivity of a phospholipid monolayer model
under periodic boundary conditions: a density functional theory study of the Schiff base
formation between phosphatidylethanolamine and acetaldehyde. J Phys Chem B. 2010;
114(48):15879-85.

REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS COMPLEMENTARIAS

1. Castillo RV, Uranga RH, Zafra GR. Genética clínica. Manual moderno. México, 2012.
2. Turnpenny P, Ellard S. Elementos de genética médica. 13a ed. Elsevier, España
Barcelona, 2012.
3. Nowak MA. Evolutionary Dynamics_ Exploring the Equations of Life-Belknap Press of
Harvard University Press, 2006.
4. American Journal of Pharmacogenomics
5. International Journal of Genomics
6. Journal of Human Transcriptome
7. Journal of Molecular and Genetic Medicine
8. Journal of Pharmacogenomics and Pharmacoproteomics
9. Journal of Proteomics
10. Mollecular and Cellular Proteomics
11. Journal of Proteomics and Bioinformatics
12. The Pharmacogenomics Journal
13. NATURE journals