03/09/2019

Síntese de HEME

ENZIMAS
Deficiências
Proteínas que atuam como catalisadores biológicos
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Porfiria eritropoiética congênita ENZIMAS

proteínas com a função de catalisar reações biológicas

Uroporfirinogênio III Não-enzimático Acúmulo de Uroporfirinogênio I Características principais:

co-sintase • Urina vermelha
• atuam essencialmente em solução aquosa (a maioria em
• Dentes fluorescentes (sob luz UV)
pH e temperatura considerados amenos)
• Elevada fotossensibilidade
• atuam em reações específicas
• apresentam especificidade quanto às moléculas a serem
modificadas

Algumas enzimas possuem um grupo prostético essencial para atividade biológica

Exemplos de co-fatores de enzimas

Holoenzima: enzima completa, cataliticamente ativa
Apoenzima: corresponde a parte proteica da enzima
Grupo Prostético: corresponde a uma molécula (não proteica)
que é estritamente necessária para a atividade da
enzima.

apoenzima

holoenzima

Grupo prostético

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NOMENCLATURA & CLASSIFICAÇÃO

Exemplos de co-enzimas Nomenclatura mais usual:

Adição do sufixo “ase” ao nome do substrato ou a uma palavra ou frase que
indique a reação

E.C. 3.5.1.5

E.C. 3.6.1.31

E.C. 2.7.1.1

E.C. 3.5.1.5
Nomenclatura e classificação – Sistema Internacional
“Enzyme Commission number” – número EC 3. Hidrolases
3.5 Atuam em ligações C-N diferentes de ligação peptídica
E.C.□.□.□.□ 3.5.1 Em amidas lineares
3.5.1.5 urease

E.C. 3.6.1.31

3. Hidrolases
3.6 Atuam em anidridos ácidos
3.6.1 Em anidridos contendo fósforo
3.6.1.31 Fosforibosil-ATP-difosfatase

EC 2.7.1.1

2. Transferases
2.1 Transferência de grupos contendo fosfato
2.7.1 Fosfotransferases que utilizam alcool como aceptor
2.7.1.1 Hexoquinase

Compostos (ligantes) que se ligam à enzima Enzimas são usualmente maiores do que as moléculas que são modificadas
Substrato (S): molécula que será modificada
Produto (P): molécula resultante da transformação
Enzima
Efetor Alostérico (Modulador): composto que altera a atividade da enzima
quando associado, atuando como um regulador enzimático. Não é
transformado pela enzima.
Substrato

Local de ligação de compostos na enzima

Sítio de Ligação (na enzima):
Local na enzima aonde um composto (ligante) se associa. Essa associação envolve
algum grau de especificidade
 Sítio ativo (ou sítio catalítico):
Local na enzima aonde o substrato se ligará e aonde ocorrerá a reação
 Sítio Alostérico (ou sítio regulatório):
Local, diferente do sítio ativo, aonde uma molécula efetora (efetor) irá se ligar à
enzima

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Etapas da catálise enzimática

S→P

Uma enzima não altera parâmetros termodinâmicos

S + E → ES → EP → E + P Para que ocorra a catálise enzimática é

estritamente necessária a ligação do
substrato no sítio ativo da enzima

AJUSTE INDUZIDO
Quando a ligação enzima-substrato é formada, uma mudança conformacional
da enzima (e também no substrato) é usualmente observada

∆G´o

Observação:
A ligação enzima-substrato não é tão rígida quanto a interação chave-fechadura

Enzima
Modelo “chave-fechadura”

Modelo “ajuste induzido” Sítio Ativo

Sítio Ativo
+ Substrato

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A ligação do substrato ao sítio ativo de uma enzima ocorre através de diversas

interações fracas entre o substrato e aminoácidos que formam o sítio ativo
A ligação E-S leva a um posicionamento do substrato adequado para catálise

O primeiro aspecto da cinética enzimática é a formação do complexo ES

Quimotripsina (protease) hidrolisa a ligação peptídica
adjacente a fenilalanina

Complexo ES

Interações entre aminoácidos e o substrato e/ou produto (ou estado de transição)

são responsáveis pelo processo de catálise.

exemplo
Primeiro passo

chorismate
His57 His57

prephenate

Estado de transição (sítio ativo da enzima)

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Sítio ativo da Carboxipeptidase Após posicionamento do substrato no sítio ativo da enzima, aminoácidos
Carboxipeptidase: (protease) hidrólise de uma ligação peptídica a partir do C-terminal presentes no sítio ativo atuam na transformação S → P

Enzima Enzima-substrato
Carboxipeptidase
Mecanismo II

The active site of the digestive enzyme carboxypeptidase. (a) The enzyme without substrate. (b) The
enzyme with its substrate (gold) in position. Three crucial amino acids (red) have changed positions to
move closer to the substrate. Carboxypeptidase carves up proteins in the diet. (From W. N. Lipscomb,
Proceedings of the Robert A. Welch Foundation Conferences on Chemical Research 15, 1971, 140–141.)

Enolase Lisozima
hidrolise da ligação
glicosídica (1-4) entre os N-
acetilglucosamina (NAG) e
ácido N-acetilmurâmico
(NAM).

Influência do pH na atividade da Lisozima

Efeito do pH sobre a atividade enzimática

pH ótimo pH ótimo da lisozima = 5,2

pH ótimo

Aminoácidos normalmente envolvidos pKa

HA H + + A-

lembrando:
• pH = pKa  [HA] = [A-]
• pH > pka  [A-] > [HA]
• pH < pka  [HA] > [A-] pKa (Glu35) = 5,9 pKa (Asp52) = 4,5
(valores de pKa no sítio ativo da enzima)

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PEPSINA – aspartil-peptidase
Hidrolisa ligação peptídica preferencialmente no C-terminal de Tyr, Phe e Trp Efeito da temperatura sobre a atividade enzimática

Temperatura ótima

Atividade enzimática
Enzima na
conformação
Aminoácidos importantes para catálise
nativa
Desnaturação
Asp32 (pKa=1,5) e Asp125 (pKa=4,5) da enzima
pelo calor

temperatura