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a) Calcule la actividad en U/mg. b) Si las concentraciones de los sustratos fueran subsaturantes, ¿el
valor de la actividad sería mayor o menor al obtenido en a)? c) Si la pureza de la muestra de la LDH
fuera del 50%, ¿qué valor de actividad esperaría?
3. La actividad de la enzima malato deshidrogenasa (MDH) purificada de maíz fue medida por un
método discontinuo. La enzima cataliza la siguiente reacción:
Oxaloacetato + NADH Malato + NAD+
La reacción se llevó a cabo en 1 ml de medio de reacción que contenía 50 mM Tris-HCl pH 8;
concentración saturante de NADH, 10 mM de oxaloacetato (OAA) y 10 µl de la preparación
enzimática (0,1 mg/ml de proteína). Luego de 1 min de incubación a 37°C, se agregaron 5 ml de un
reactivo de color que se utiliza para dosar OAA, obteniéndose luego de 10 min una absorbancia de 0,2
una vez restado el blanco. Como testigo se utilizó una alícuota de 1 ml de OAA 4,6 mM, al que se le
adicionaron 5 ml de reactivo de color, registrándose una absorbancia (ya restado el blanco) de 0,095
luego de 10 min. a) Calcule las U/ml de enzima que posee la preparación. b) Proponga un método
continuo de medida de actividad para esta enzima.
Luego de varios pasos de purificación se midió actividad enzimática de la preparación, para lo cual se
contaba con dos métodos alternativos.
0
a) El primer método de medida acopla una segunda reacción catalizada por la enzima Lactato
deshidrogenasa (LDH): Piruvato + NADH + H+ Lactato + NAD+, midiéndose la disminución de la
absorbancia a 340 nm ( NADH = 6,22 mM-1 cm-1). Se incubaron 200 µl de la preparación enzimática en
un volumen final de 1 ml que contenía -cetoglutarato, Ala, NADH y LDH. La disminución de la
absorbancia obtenida fue de 0,62 por minuto. Calcule las UI/ml de la preparación enzimática; b) Por el
otro método alternativo de medida se incubaron 100 µl de la preparación enzimática en un volumen
final de 1 ml con -cetoglutarato y Ala. A los 10 minutos, la reacción se detuvo con el agregado de
0,5 ml de 2,4 dinitrofenilhidrazina y además se agregaron 5 ml de NaOH 0,2 N, obteniéndose una
velocidad de 0,32 U/ml. Sabiendo que 1 ml de testigo de piruvato 1 mM presenta con el mismo
método de medida una absorbancia de 0,2, calcule la absorbancia que obtendría en este caso; c)
Describa las razones por las cuales los valores de velocidad obtenidos difieren entre los dos métodos
utilizados.
1
Se partió de 200 g de hígado de bovino obteniéndose un extracto inicial de 1200 ml, que tenía una
concentración de proteína de 10 mg/ml. Para medir actividad enzimática se incubó una alícuota de
50 µl con el sustrato a 30°C en 1 ml de medio. La reacción se cortó directamente a los 10 min por el
agregado de 2 ml de reactivo de color para fosfato. La reacción de color se lee a 740 nm en una cubeta
de 1 cm de camino óptico. La Abs740 fue de 0,49 con un blanco de medida de 0,12. El coeficiente de
extinción del producto de la reacción de color es de 3700 M-1.cm-1.
Se realiza luego un corte con (NH4)2SO4 al 50 % rescatándose la fosfatasa en el precipitado, el que fue
redisuelto en 80 ml, recuperándose 1680 mg de proteína con una actividad total de 504 U.
Posteriormente, se realizó una cromatografía en Sephadex G-25 recogiéndose 10 tubos de 12 ml cada
uno con actividad enzimática. La concentración de proteína en el conjunto fue de 10,8 mg/ml con un
rendimiento, respecto del paso anterior del 80%. Como último paso se efectuó una cromatografía de
afinidad y se obtuvieron 144 U de enzima con actividad específica de 3,6 U/mg en un volumen de
20 ml.
En base a estos datos a) Construya la Tabla de Purificación. b) ¿Cuál es la purificación y el
rendimiento total alcanzados? c) ¿Cuál es la etapa individual que dio mayor purificación y cuál la de
mayor rendimiento? d) Describa el fundamento del último paso de purificación empleado. e) Señale si
todas las etapas empleadas se justifican. Fundamente su respuesta
Durante la purificación de la DHDPSasa se obtuvieron 200 ml de extracto crudo, que contenían 0,5 g
de proteína. La actividad se ensayó midiendo piruvato remanente. La reacción se llevó a cabo en 3 ml
de medio de reacción, conteniendo 30 µl de enzima, Tris-HCl 100 mM pH 8, 40 mM de piruvato
sódico y concentración saturante de ASA. Luego de 10 minutos a 30°C, la reacción enzimática se
detuvo por el agregado de 0,5 ml de DNFH (reactivo de color). Después de 15 minutos se adicionaron
1,5 ml de NaOH 0,4 N y se determinó la absorbancia de la hidrazona a 505 nm, en una cubeta de 1 cm
de paso óptico. La absorbancia obtenida fue de 0,8. Como testigo se utilizó una alícuota de 100 µl de
una solución de concentración 31,55 mg/ml de piruvato a la que se le realizó el mismo tratamiento que
a la muestra, obteniéndose una absorbancia A 505 nm de 0,25. PM Piruvato = 88.
A este extracto se le realizó un corte con (NH4)2SO4, precipitando la enzima entre el 30 y 60 % de
saturación. El precipitado se redisolvió y luego de desalado se obtuvo un volumen final de 150 ml, con
una concentración de proteína de 2 mg/ml, y un rendimiento de 80 %. La muestra anterior se separó en
dos fracciones. El 60 % se sembró en una columna de DEAE-celulosa obteniéndose 50 ml de muestra
conteniendo 75 mg de proteína, y un rendimiento con respecto al paso anterior del 45%. El 40%
restante se sembró en una columna de afinidad, obteniéndose 25 ml de muestra que contiene 20 mg de
proteína, purificándose 5 veces con respecto al paso anterior.
En base a los datos: a) Realice la tabla de purificación, b) Indique rendimiento y purificación totales,
c) Justifique cuál de las etapas alternativas elegiría.
Se parte de 500 g de hojas de espinaca, obteniéndose 1.500 ml de un extracto crudo con una
concentración de proteína de 20 mg/ml. La medida de actividad se determinó con una alícuota de 30 µl
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por un método continuo, midiéndose la aparición de NADPH (NADPH = 6200 M-1.cm-1) en una cubeta
de 3 ml y 1 cm de camino óptico, obteniéndose un A/10 min= 1,24.
Se realizó luego una cromatografía en DEAE-celulosa, recogiéndose 180 ml que contenían 1800 U de
actividad enzimática y 2250 mg de proteína. El volumen total de este paso (180 ml) fue dividido en
dos volúmenes iguales. I) Una de las fracciones fue sometida a cromatografía de adsorción
(hidroxilapatita), recogiéndose 5 tubos de 4 ml cada uno, con actividad deshidrogenasa. La
concentración de proteína en el conjunto fue de 0,94 mg/ml, con un rendimiento respecto al paso
anterior del 50%. II) La otra fracción de la columna de DEAE-celulosa fue sometida a una
cromatografía de afinidad; en la que se recuperaron 800 U de enzima y 4 mg de proteína en un
volumen de 15 ml.
a) Calcule el rendimiento y la purificación para cada uno de los procedimientos alternativos empleados
b) La electroforesis en gel de poliacrilamida mostró que la enzima proveniente de uno de los
procedimientos migraba como una única banda de proteína (Rf = 0,33), mientras que la proveniente
del otro procedimiento mostraba la presencia de tres bandas proteicas (Rf = 0,25; Rf = 0,325 y Rf =
0,65). En base a la tabla de purificación podría adjudicar a qué procedimiento de purificación
corresponde cada electroforesis obtenida. Justifique su respuesta.
10. Dos grupos de trabajo presentan independientemente protocolos para la purificación de una
enzima desde un mismo tejido de plantas. Para medir la actividad enzimática se incuba una alícuota de
30 l de enzima con el sustrato en 1 ml de medio de reacción. La reacción se corta a los 5 minutos por
el agregado de 2 ml de reactivo de color específico para el producto de la reacción ( =3700 M-1 cm-1)
Se utiliza una cubeta de 1 cm de camino óptico. La medida del blanco de reacción da un valor = 0,1.
Los volúmenes indicados se refieren a la cantidad recuperada en cada paso.
Protocolo 1: I) Extracto Crudo: 200 ml, Abs=0,56, [proteína]= 50 mg/ml; II) Fraccionamiento con
PEG: 300 ml. Se purifica 10 veces la enzima, con un rendimiento de 80%; III) Cromatografía en
DEAE-celulosa: 280 ml, Act Específica = 5 y 280 U de enzima; IV) Cromatografía en columna de
Hidroxilapatita: 25 ml, 84 U de enzima y 8,4 mg de proteínas.
Protocolo 2: I) Extracto Crudo: 400 ml 2,5 U/ml y una Act Específica = 0,05; II) Columna de
Sephadex: 500 ml Se purifica 2 veces la enzima, con un rendimiento del 50%; III) Precipitación con
(NH4)2SO4 y desalado: 200 ml, 1 U/ml y 0,3 U/mg; IV) Cromatografía en Affigel Blue: 30 ml.
Purificación parcial de 10 veces, y un rendimiento parcial del 80%
11. Durante la purificación de la enzima ureasa (Urea + H2O 2 NH4+ + CO2) se obtuvo 900 ml de
Extracto Crudo (EC) con una concentración de proteína de 3,33 mg/ml. Su actividad se midió
siguiendo la disminución de la Absorbancia a 340 nm utilizando la reacción acoplada NH4+ + KG +
NADH + H+ Glu + NAD+ ( NADH = 6200 M-1 cm-1). El agregado de 20 l de EC a 1 ml de la mezcla
de reacción produjo un A = - 0,800 en 4 minutos en una cubeta de 1 cm de camino óptico. Un corte
con (NH4+)2SO4 dio lugar a un precipitado que se redisolvió con buffer hasta 150 ml de volumen final.
De esta manera la ureasa se purificó 10 veces con un rendimiento del 82,8 %. Luego de pasados por
una columna de Sephadex G-25 se recolectaron 80 ml con 45 mg de proteína, purificándose 50 veces
respecto del EC con un rendimiento del 90 % respecto del paso anterior. Su actividad se determinó por
el método discontinuo (NH4+ + Fenol + Hipoclorito Azul de Indofenol) cuya curva de calibración
de NH4+ presentó una pendiente de 0,6557 UA/mol NH4+. Las condiciones de la colorimetría fueron
las mismas para la curva y la muestra. a) ¿Cuál fue la absorbancia al cabo de un minuto por este último
método para la muestra si se emplearon 40l de ureasa obtenida en la última etapa? Tenga en cuenta
3
que para la ureasa una unidad de actividad enzimática (1 UI) se define como la cantidad de enzima que
cataliza el consumo de 1 μmol de sustrato (urea) por minuto en las condiciones especificadas.
b) Construya la tabla de purificación.
12. La enzima málica cataliza la reacción: Malato + NADP+ Piruvato + CO2 + NADPH + H+. Se
intentó purificar esta enzima a partir de hojas de maíz. Para ello se realizaron distintas etapas que
incluyeron la preparación de un extracto crudo, precipitación con (NH4)2SO4, cromatografía de
exclusión molecular en Sephadex G-100 y cromatografía de intercambio iónico en DEAE-celulosa. La
medición de proteínas se realizó por el método de Gornall. Para ello, alícuotas de 20 µl de la
preparación enzimática se incubaron con 2 ml del reactivo de Biuret durante 15 min a 37°C. El testigo
de ovoalbúmina (10 mg/ml) procesado de la misma manera produjo un valor de absorbancia de 0,650
medido a 545 nm. La actividad enzimática se determinó en 1 ml de medio de reacción que contenía
50 mM Tris-HCl pH 8,0, cantidades saturantes de los sustratos y 10 µl de la preparación enzimática. A
los 10 min de incubación a 30°C, la reacción se detuvo por el agregado de 2 ml de
dinitrofenilhidracina. Como testigo se utilizó 1 ml de piruvato (PM=88) de 0,5 mg/ml que produjo un
valor de absorbancia de 0,040 medido a 505 nm. En base a los datos suministrados, a) Construya la
tabla de purificación calculando el rendimiento y la pureza total alcanzados; b) Proponga otro método
de medida de la actividad enzimática.
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PARÁMETROS CINÉTICOS: CÁLCULOS Y APLICACIONES
1. Un investigador purifica una enzima de una bacteria Gram-positiva (I) y de hígado de ratón (II).
Decide realizar la caracterización de la misma de ambas fuentes y realiza los siguientes estudios: a)
Determinación de la masa molecular en columna de exclusión molecular en condiciones nativas: I=
200 kDa; II= 200 kDa; b) Determinación de la masa molecular en SDS-PAGE: I= 50 kDa; II= 50
kDa; c) Medición de la velocidad de reacción a concentraciones saturantes del
sustrato (S): I=10 U/mg; II= 10 U/mg; d) Determinación de la concentración de S que da una
velocidad de 5 U/mg: I= 1 mM; II= 1 mM. Cuando estudia la cinética de la reacción obtiene los
siguientes resultados mostrados en las tablas. a) ¿Qué puede decir sobre la cinética seguida por cada
enzima? b) Sabiendo que la enzima tiene un solo sitio de unión del sustrato por subunidad, ¿qué puede
decir acerca de las interacciones de los sitios activos en cada caso? c) ¿Qué gráfico realizaría para
avalar su propuesta? d) ¿Encuentra alguna diferencia sobre la regulación que cada enzima podría
presentar in vivo por la concentración de sustrato? Explique.
Enzima I Enzima II
[S] (mM) V (U/mg) S (mM) V (U/mg)
0,1 0,9 0 0
0,5 3,3 0,5 0,5
1 5 1 5
2 6,6 2 9,5
4 8 4 10
10 9,1 10 10
1,4
2. Caracterice a las enzimas A (círculos vacíos) 1,2
1,0
y B (círculos llenos) lo mejor posible indicando
0,8
log (Vmax-v)/v
log [S]
3. Las beta-lactamasas son enzimas que hidrolizan antibióticos de la familia de los beta-lactámicos,
ampliamente utilizados para combatir infecciones bacterianas. El estudio de estas enzimas tiene como
objetivo entender las bases de la resistencia de algunos patógenos frente a estos antibióticos y el diseño
de estrategias eficaces para combatirlos. En base a los datos mostrados en la tabla indique a) ¿cual
antibiótico es más eficazmente hidrolizado por EBR-1? b) ¿Considera que el uso de bencilpenicilina
podría ser efectivo en el tratamiento de una infección con Chryseobacterium indologenes? c) GOB-1 y
BlaB son beta-lactamasas de dos aislados de Chryseobacterium meningosepticum, ¿alguna de las dos
enzimas tiene mayor eficiencia frente a antibióticos beta-lactámicos?
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4. Teniendo en cuenta la ecuación de Michaelis y Menten, indique si las siguientes afirmaciones
son verdaderas o falsas:
a) La constante de Michaelis, Km
* Varía con la velocidad de la reacción enzimática
* Es constante para una enzima determinada sea cual fuera el sustrato usado.
* Es la constante de velocidad para la descomposición del complejo ES.
* Es la concentración de sustrato a la cual se obtiene una velocidad igual a la máxima.
Teniendo en cuenta que el peso molecular de la proteína es 300.000: a) Calcule los valores de Km,
Vmax. b) Exprese el valor de velocidad máxima en Katal/mg. c) Calcule el número de recambio y
explique el significado del mismo.
6
6. Dos estudiantes (A y B) aislaron independientemente la enzima uresa de semillas de soja. Esta
enzima cataliza la siguiente reacción:
Una vez obtenida una solución concentrada de enzima, midieron actividad (µmol/min.mg proteína) en
presencia de distintas concentraciones de urea obteniendo los siguientes datos:
a) Sin graficar, estime aproximadamente Km y Vmax. Justifique. b) Proponga una explicación para la
discrepancia observada entre los parámetros cinéticos estimados por A y B. c) ¿Qué variables
graficaría para obtener Km y Vmax? Justifique.
7. En base a los datos del ejercicio 3 de la guía anterior y considerando que el valor de Km para el
OAA de la enzima es 10 μM, el peso molecular es 200.000 y que la enzima posee 4 sitios activos por
molécula, calcule el índice de recambio.
9. Una enzima cataliza la reacción S P. Con los siguientes datos estime el valor de Km para dicha
enzima: I) Índice de recambio: 3800 min-1, II) PM de la enzima: 62 kDa. III) Número de sitios activos
por molécula de enzima: 3 IV) concentración de enzima de 1,5 mg/ml y V) la actividad enzimática,
ensayada en un medio de reacción de 1,5 ml que contenía 10 µl de una solución del sustrato 200 mM
dio un valor de 12 UI/ml de la preparación enzimática.
10. En mamíferos existen 4 isoenzimas hexoquinasa (HK): glucosa + ATP glucosa6P + ADP,
cada una de ellas con diferentes propiedades estructurales, cinéticas y regulatorias. La HK-I se localiza
en el citosol de células del cerebro, donde se estructura como un heterodímero de subunidades de 50
kDa, con una subunidad cumpliendo un rol regulatorio. Por otra parte, las HK-II y HK-IV se localizan
en músculo e hígado, respectivamente, y se estructuran como homodímeros de subunidades de 50 kDa.
Dos de estas isoformas de la HK cumplen el rol de proveer un suministro constante de glucosa6P al
órgano, independientemente de las fluctuaciones en los niveles sanguíneos de glucosa. La otra enzima
es la responsable de que la concentración de glucosa en sangre no exceda los 5 mM con el objetivo de
7
evitar un shock hiperglicémico luego de las comidas. La siguiente tabla resume los parámetros
cinéticos de la HK-I, HK-II y HK-IV.
a) Considerando que los valores sanguíneos de glucosa varían en el rango de 0,5 (entre comidas) a 5
mM (pos-ingesta), indique para cuales de las isoformas la actividad enzimática será dependiente de
la [glucosa]. b) En función de los parámetros cinéticos asigne el rol de cada isoforma. Justifique. c)
Como explica que HK-I y HK-II presenten igual kcat pero difieran en su valor de Vmax?
11. La enzima fumarasa (FUM) cataliza la hidratación reversible del fumarato a malato:
Actividad FH
+ H2O
Actividad MD
La reacción directa (actividad fumarato hidratasa o FH) e inversa (actividad malato deshidratasa o
MD) pueden ser seguidas espectrofométricamente cuantificando la desaparición o formación,
respectivamente, del doble enlace del fumarato a 240 nm (= 2,34 mM-1 cm-1; b= 1cm). a) Con los
datos de la siguiente tabla calcule kcat, estime Km y determine la eficiencia catalítica para las actividades
FH y MD de la FUM, considerando que la enzima se ensambla como un homotetrámero de subunidades
de 50 kDa con 4 sitios activos por estructura cuaternaria. b) Bajo qué condiciones deben realizarse las
terminaciones de las actividades FH y MD? c) Comparando las eficiencias catalíticas, que conclusión
puede sacar acerca del rol fisiológico de la FUM?.
8
INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
9
Piruvato (mM)
0 0,4
Glucosa (mM) Actividad (U/mg)
0,1 9,98 7,14
0,2 15,02 10,72
0,3 17,89 12,86
0,4 20,05 14,28
4. Sobre una enzima que cataliza la reacción S P se prueba el efecto de dos inhibidores X e Y,
obteniéndose los siguientes datos de velocidad. a) Determine la naturaleza de cada inhibidor haciendo
un esquema de la inhibición. b) Calcule Km, Vmax y Ki.
Velocidad (U/ml)
[S] (mM) Sin agregado + 12 µM X + 60 µM Y
2,00 50,00 40,00 22,22
2,50 55,56 45,45 25,00
3,33 62,47 52,63 28,56
4,00 66,67 57,14 30,77
5,00 71,42 62,50 33,33
5. Cuando la reacción enzimática catalizada por la LDH (lactato deshidrogenasa) se lleva a cabo en
presencia de una concentración 0,3 mM de un inhibidor X, tanto Km como Vmax disminuyen a un
tercio del valor obtenido en ausencia del inhibidor. Responda el siguiente cuestionario: a) ¿Qué tipo de
inhibición presenta X sobre el sistema enzimático? b) ¿Cómo es la afinidad aparente de la enzima por
su sustrato en presencia del inhibidor, comparada con la afinidad real que se observa en ausencia del
inhibidor? ¿Por qué se produce ese cambio en la afinidad? c) Estime Ki del inhibidor X lo más
exactamente que pueda con los datos disponibles. Si usted necesitase calcular Ki con una exactitud
mayor ¿qué experimentos realizaría?
se obtuvieron los valores de A340 nm/min que figuran en la tabla. La actividad enzimática se midió con
10 µl de la MDH en una cubeta de 1 ml y 1 cm de camino óptico y concentraciones saturantes de
Oxaloacetato. En base a la misma: a) Indique qué tipo de inhibidor es GMP con respecto a NADPH. b)
Calcule Ki mendiante gráficos secundarios y de Dixon c) Calcule Km para NADPH y Vmax de la
enzima (U/ml). (0= 6200 M-1. cm-1).
10
4,0 0,127 0,230 0,289 0,388
5,0 0,109 0,200 0,254 0,344
11
EFECTO DEL pH Y LA TEMPERATURA
1. El gráfico adjunto muestra el efecto de la temperatura sobre la actividad máxima de una enzima.
a) Indique las causas por las que varía la actividad enzimática en función de la temperatura
estableciendo efectos directos y efectos indirectos. b) ¿Qué experimento le permitiría distinguir entre
efectos reversibles e irreversibles? c) Indique que zona del gráfico utilizaría para obtener la energía de
activación (Ea) de la reacción y como la calcularía. Defina Q10. ¿Cuál metodología considera más
apropiada para el cálculo de la Ea?
40
Actividad (mol/min.mg)
30
Vmax
20
10
0
0 10 20 30 40 50 60 70 80
Temperatura (ºC)
0.50 3.0
LDH (8°C) LDH (8°C)
0.45
2.5
LDH (25°C) LDH (25°C)
0.40
Km piruvato (mM)
kcat (seg-1*1000)
2.0
0.35
1.5
0.30
0.25 1.0
0.20
0.5
0.15
0.0
0.10
5 10 15 20 25 30 35 40 45 5 10 15 20 25 30 35 40 45
o o
Temperatura ( C) Temperatura ( C)
12
3. Al ensayar la actividad de una enzima a diferentes temperaturas se obtuvieron los datos
mostrados en la línea A. Cuando la enzima se preincubó a distintas temperaturas durante 15 min y
luego se determinó actividad a temperatura óptima, se obtuvieron los datos de la línea B. Ambos
experimentos se realizaron a concentraciones de sustratos iguales a 100 veces los valores de Km.
T (°C) 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50 55 60
Act. (U/mg)
A 1,1 2 4 10 15 22 30 25 20 12 6 2
B 2,5 2,5 5 30 30 30 30 20 10 7,5 2,5 1,5
En base a estos datos: a) Indique la T óptima de la enzima. b) ¿Por qué la actividad enzimática cuando
se ensayó a la temperatura óptima no fue constante para todas las muestras previamente incubadas a
las distintas temperaturas? c) Calcule el Q10 y la energía de activación.
Vmáx preincubación
E3 150 ±14 178 ±15 175 ±10 177 ±10 174 ±11 176 ±12
E1 = E2
0,0056
6. El gráfico adjunto muestra el efecto del pH sobre la actividad de una enzima medida a
concentraciones de sustrato constante y subsaturante. a) Enumere las causas por las que la actividad
enzimática puede variar en función del pH. b) Plantee un diseño experimental para distinguir entre los
posibles efectos del pH. c) De acuerdo al gráfico ¿a qué pH trabajaría para realizar los estudios
cinéticos de esta reacción enzimática? d) Si la enzima es estable y el sustrato no sufre cambios de
ionización en el rango de pH estudiados, ¿a qué corresponderían los puntos de inflexión de la curva
(pH 4 y 8)?
7. Indique si los gráficos que se muestran sugieren ionización de la enzima libre o ionización del
complejo enzima-sustrato. Suponga que en ese rango de pH no hay desnaturalización de la enzima,
como así tampoco del sustrato. Justifique brevemente.
2.2 3.0
A 2.7
2.0
2.4
Log Vmax
1.8 2.1
pKm
1.6 1.8
1.4 1.5
1.2
1.2 0.9
1.0 0.6
2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
pH pH
2.5 2.5
B
2.0 2.0
Log Vmax
1.5 1.5
pKm
1.0 1.0
0.5 0.5
0.0 0.0
-0.5
2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
pH pH
8. Un investigador purifica a homogeneidad la enzima malato deshidrogenasa y realiza un estudio
de la actividad de la enzima en función del pH utilizando una concentración de sustrato subsaturante.
14
Obtiene la gráfica A. Sin embargo cuando preincuba la enzima a distintos valores de pH entre 2 y 10 y
luego mide la actividad a pH óptimo observa que la enzima presenta actividad máxima entre pH 4.0 y
8.0. Con el fin de determinar qué aminoácidos estaban implicados en la catálisis determina la actividad
de la enzima a concentraciones variables de sustrato y a tres valores de pH, obteniendo el gráfico B.
Teniendo en cuenta que el sustrato no sufre cambios de protonación en el rango de pH estudiado,
indique: a) El rango de estabilidad de la malato deshidrogenasa, el pH óptimo de la enzima. b)
Proponga un modelo (con un esquema) que explique los resultados obtenidos en la gráfica B.
c) Cuando el investigador grafica los distintos valores de Km a distintos valores de pH, obtiene que un
grupo con un pKa de 6,2 está implicado en la catálisis. Sin embargo, al estudiar la secuencia primaria
de la enzima y compararla con otras secuencias encuentra que, de todos los residuos ionizables, sólo
un residuo de Glu está conservado (pKa COO-=4,0). ¿Podría ser dicho grupo el responsable de los
cambios de la actividad de la enzima? ¿Por qué podría presentar ese valor de pKa?
12
1/Actividad (U/mg)-1
10 A B pH 4.0
-1
Actividad (U/mg)
9 pH 6.0
8
6
6 pH 8.0
3
4
actividad (U/mg)
0
1/actividad (U/mg)
2 4 6 8 10 12
0 1 2 3 4
pH
pH
1/[S] (mM)-1
120
100 MDH mitocondrial A MDH mitocondrial B
MDH glioxisomal MDH glioxisomal
100
Actividad (%)
Actividad (%)
80
80
60
60
40 40
20 20
0
0
3 4 5 6 7 8 9 10 11
3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
pH
pH
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CINÉTICA DE DOS SUSTRATOS
1. Describa tres modelos cinéticos para una reacción enzimática en la que participan dos sustratos.
Describa también métodos de diagnóstico para determinar el modelo cinético seguido por una reacción
enzimática que involucre dos sustratos.
Por otra parte, el aspartato se comportó como un inhibidor competitivo respecto del glutamato, cuando
se agregó oxaloacetato en concentraciones saturantes. Proponga en forma esquemática un modelo
cinético que sea compatible con estas observaciones experimentales.
[S2] (mM) 1 2 4 6 10
[S1] (mM) Velocidad (µmoles/min.mg)
5 4 6,7 10 12 14,3
10 7,7 12,5 18,2 21,4 25
S1 Variable S2 Variable
S2 Subsat. S2 Sat. S1 Subsat. S1 Sat.
P1 NC --- C C
P2 NC NC NC AC
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a) Indique si la reacción sigue un mecanismo secuencial o ping-pong. Justifique brevemente. b) En
caso que corresponda indique el orden de adición de sustratos y de salida de los productos.
Esquematice el modelo de reacción.
Experimento V (U/mg)
+ 0,1 mM Acetil-CoA 0,67 1,10 1,45 1,65 1,85 2,2
+ 0,2 mM Acetil-CoA 2,00 3,35 4,15 5,00 5,55 6,65
Por otra parte, el citrato se comportó como un inhibidor competitivo tanto respecto a oxaloacetato
como respecto a acetil-CoA, y otro tanto ocurrió con la Coenzima A. Proponga en forma esquemática
un modelo cinético que sea compatible con estas observaciones experimentales.
5. Un estudiante purifica una quinasa de un sustrato A (A + ATP A-P + ADP) y decide estudiar
su mecanismo de reacción. Así, incuba la enzima con ATP marcado con 32P. Al cabo de 1 h precipita
la enzima, observando que la radiactividad inicial en el sobrenadante ha disminuido un 50%,
detectándose también ADP no marcado. a) Plantee un mecanismo de reacción posible de esta quinasa.
b) Indique qué tipo de gráficos esperaría obtener al graficar 1/v vs 1/[A] a distintas concentraciones de
ATP. c) ¿Esperaría obtener radiactividad en la fracción proteica? Explique su respuesta.
6. Una vez purificada la enzima L-Aspartato aminotransferasa, enzima que cataliza la reacción:
aspartato + oxoglutarato glutamato + oxaloacetato
Se procedió a estudiar el efecto de la concentración de aspartato a concentraciones constantes de
Oxoglutarato sobre la velocidad inicial. Los valores de velocidad inicial obtenidos (µmol/min.mg) se
transcriben a continuación:
a) Determine gráficamente los valores de Vmax y Km para el aspartato. Indique el valor de Vmax en
UI/mg y en katal/mg. b) ¿Cuál es el índice de recambio, asumiendo que la enzima posee un PM de
50 kDa y que posee 2 sitios activos por molécula. c) Indique el mecanismo de reacción de esta enzima.
Fundamente brevemente.
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7. En un sistema enzimático multisustrato del siguiente tipo:
A + B P + Q
Para caracterizar el mecanismo de reacción y el sitio activo de la enzima se llevaron a cabo dos
experimentos. En el 1° experimento se estudió el efecto de los productos de la reacción sobre la
actividad enzimática a concentraciones subsaturantes de malato obteniéndose los datos que figuran en
la Tabla 1. En el 2° experimento, 150 µg de enzima preincubada durante 30 min en presencia de los
productos de la reacción o en ausencia de los mismos fueron tratadas 2 hs con N-etilmaleimida (agente
modificador de residuos de cisteína) obteniéndose los datos de la Tabla 2. El control de la enzima sin
tratar con etilmaleimida dio un valor de actividad de 100U/ml. En base a los resultados: a) indique el
posible mecanismo de reacción de la enzima, justifique; b) ¿Qué puede concluir acerca de los
aminoácidos involucrados en el sitio catalítico?
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