Parcial 1 parte II: Espectroscopı́a.

Marcelo J. Molinatti S.
29 de agosto de 2019

1. Motivación.
La biologı́a cuántica se refiere a las aplicaciones de la mecánica cuántica y la quı́mica teórica a los objetos y problemas
biológicos. Muchos procesos biológicos implican la conversión de energı́a en formas que son utilizables por transformaciones
quı́micas, y son de naturaleza cuántica. Dichos procesos implican reacciones quı́micas, absorción de luz, formación de estados
electrónicos excitados, transferencia de energı́a de excitación y transferencia de electrones y protones (iones de hidrógeno) en
procesos quı́micos, como la fotosı́ntesis, el olfato y la respiración celular. La biologı́a cuántica puede usar cálculos para modelar
interacciones biológicas a la luz de los efectos de la mecánica cuántica. La biologı́a cuántica tiene que ver con la influencia de
los fenómenos cuánticos no triviales, que pueden explicarse reduciendo el proceso biológico a la fı́sica fundamental, aunque
estos efectos son difı́ciles de estudiar y pueden ser especulativos.
Las teorı́as tradicionales de la catálisis enzimática sostienen que las proteı́nas aceleran las reacciones al disminuir la energı́a
de activación. Pero algunos investigadores argumentan que un truco cuántico conocido como tunelado también juega un
papel, y que la estructura de los sitios activos de las enzimas podrı́a haber evolucionado para aprovechar este fenómeno. Una
indicación de que se está llevando a cabo una transferencia de protones mediante tunelado es que un diagrama de Arrhenius
se desvı́a de una lı́nea recta a bajas temperaturas y la velocidad de reacción es más alta de lo que cabrı́a esperar por la
extrapolación a temperatura ambiente.
Los efectos cuánticos podrı́an ayudar a maximizar la eficiencia de la transferencia de energı́a fotosintética. Durante la
reacción de recolección de luz en plantas y algunos microbios, los fotones excitan los electrones contenidos en las moléculas de
clorofila para crear entidades llamadas excitones. Estos excitones luego se transfieren de molécula de clorofila a molécula de
clorofila hasta que alcanzan el centro de reacción, un grupo de proteı́nas donde se puede capturar y almacenar su energı́a. Los
excitones pueden perder energı́a a medida que se transfieren, lo que significa que cuanto más indirectas sean sus rutas entre
las moléculas de clorofila, menos energı́a llegará al centro de reacción. Los fı́sicos sugirieron hace décadas que este derroche
podrı́a evitarse si el proceso de transferencia fuera cuánticamente coherente. Es decir, si los excitones pudieran viajar como
ondas en lugar de partı́culas, podrı́an probar simultáneamente todos los caminos hacia el centro de reacción y tomar solo la
ruta más eficiente (ver figura 1).
Se ha propuesto que las reacciones en la proteı́na criptocromo generan un par de radicales, moléculas que tienen un
electrón solitario. El comportamiento de esos electrones, que pueden entrelazarse cuánticamente entre sı́, es sensible a la

Figura 1: Modelo de transferencia de excitones entre moléculas de clorofila hasta el centro de reacción: a) modelo clási-
co de transferencia en el cual el excitón viaja por una ruta dada hasta el centro de reacción, y b) modelo cuántico de
coherencia en el que el excitón prueba todas las rutas a la vez (obtenida de: https://www.the-scientist.com/features/
quantum-biology-may-help-solve-some-of-lifes-greatest-mysteries-65873).

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alineación de campos magnéticos débiles como el de la Tierra. Los cambios en la alineación de este par en relación con el
campo magnético en teorı́a podrı́an desencadenar reacciones quı́micas más abajo, permitiendo que la información se transmita
de alguna manera al cerebro. Se necesita más trabajo para determinar si la magnetorecepción aviar realmente funciona de
esta manera, y para revelar si es importante el entrelazamiento entre los electrones del par radical. Los cientı́ficos tampoco
entienden completamente cómo el criptocromo podrı́a comunicar información del campo magnético al cerebro.
Otro sentido misterioso que los investigadores esperan desentrañar es el olfato. La teorı́a tradicional, que las moléculas
de olor se ajustan a los receptores de proteı́nas en las neuronas olfativas para provocar olores, enfrenta el desafı́o de que
algunas moléculas con formas casi idénticas tienen olores completamente diferentes, mientras que otras con estereoquı́mica
diferente huelen igual. Los receptores olfativos pueden ser sensibles no solo a la forma, sino también a las frecuencias de los
enlaces vibratorios en las moléculas de olor. Cuando una molécula se une a un receptor, si sus enlaces vibran a una frecuencia
determinada, pueden facilitar el tunelado cuántico de los electrones dentro de ese receptor. Esta transferencia de electrones
desencadena una cascada de señalización en la neurona olfatoria que finalmente envı́a un impulso al cerebro.
Quizás la extensión más extrema de la fı́sica cuántica al reino animal es la idea de que los efectos cuánticos extraños
podrı́an desempeñar un papel en el cerebro humano. Se ha argumentado que las neuronas poseen maquinaria molecular
capaz de comportarse como una computadora cuántica, que en lugar de usar bits de 0s o 1s opera con qubits, unidades de
información que pueden tener estados de 0 y 1 simultáneamente. Los qubits del cerebro, están codificados en los estados de
iones de fosfato dentro de las moléculas de Posner, grupos de fosfato y calcio que se encuentran en los huesos y posiblemente
dentro de las mitocondrias de ciertas células. El trabajo teórico reciente argumenta que los estados de iones de fosfato en
diferentes moléculas de Posner podrı́an enredarse entre sı́ durante horas o incluso dı́as y, por lo tanto, podrı́an realizar cálculos
rápidos y complejos.
La mayorı́a de las ideas en biologı́a cuántica aún están impulsadas más por la teorı́a que por el apoyo experimental,
pero varios investigadores ahora están tratando de cerrar la brecha. La idea de la siguiente investigación es que usted logre
comprender como esta estructurada la materia y cual es el comportamiento de la misma a una escala atómica.

2. Investigar.
Los siguientes incisos corresponden a fundamentos básicos que se requieren para entender la conceptualización que corres-
ponde al comportamiento de partı́culas a escala atómica. La idea es que usted se familiarice con el marco conceptual que
reviste la mecánica cuántica y un abre boca a lo que son los formalismos operacionales que se requieren para su tratamiento
matemático
a) La mecánica clásica (las abstracciones y formalismos usados hasta ahora en los cursos básicos de fı́sica que usted ya
cursó) supone que toda partı́cula de interés viaja en una trayectoria bien definida (donde trayectoria tiene el significado especial
de ser una ruta con posición y momento lineal precisamente definidos en cada instante). Además, supone que cualquier tipo
de movimiento puede pasar a otro estado de energı́a arbitraria y distingue muy bien los conceptos de onda y partı́culas como
entidades fı́sicas distintas con propiedades caracterı́sticas que las definen, pero no a la otra (por ejemplo, las ondas tienen
longitud de onda y frecuencias, pero no masa, esta ultima es una propiedad de las partı́culas).
La mecánica cuántica contrasta con esta visión de la fı́sica en dos caracterı́sticas fundamentales: a cuantización de la
energı́a, y la dualidad onda-partı́cula. Discuta de forma breve a que refieren estas dos propiedades.
b) Investigue acerca de la conceptualización de la función de onda. ¿Qué es y cómo se escribe matemáticamente?¿Cuál es
la interpretación usual dada a esta de acuerdo al postulado de Born?
c) Investigue de que trata el principio de correspondencia.
d) Investigue a que refieren los siguientes formalismos:
1. Series infinitas, series de potencias y expansión de funciones en series de potencias (expansión de Taylor).
2. Operadores y álgebra de operadores. Operadores de posición y momento lineal. Construcción de operadores.
3. Eigenfunciones y eigenvalores. Dependencia e independencia lineal. Combinación lineal.
4. Conmutatividad y no conmutatividad de operadores. Importancia en la especificación simultanea de propiedades. Iden-
tidades de conmutadores.
5. Integral sobre operadores. Normalización. Condición de ortonormalidad.
6. Notación de Dirac.
7. Operadores hermitianos.

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 e) Enumere y describa los postulados de la mecánica cuántica.
f ) Investigue, y discuta las bases fisicoquı́micas de las siguientes técnicas espectrométricas, ası́ como, sus aplicaciones y
perspectivas en biologı́a. Cite ejemplos.

1. Espectroscopia de Fluorescencia
2. Espectroscopia Infrarrojo y UV-Visible
3. Espectroscopia de Resonancia Magnética Nuclear (RMN)

4. Difracción de Rayos X